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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
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1241 | 2025-10-05 |
Chloroplast Functionality at the Interface of Growth, Defense, and Genetic Innovation: A Multi-Omics and Technological Perspective
2025-Mar-20, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14060978
PMID:40265935
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综述 | 本文从多组学和技术视角全面探讨叶绿体在植物生长、防御和遗传创新中的多功能作用 | 独特整合叶绿体基因组学、转录调控和合成生物学最新进展,提出通过组学数据与纳米技术、合成生物学结合优化植物生长和胁迫耐受性的新视角 | NA | 探索叶绿体在协调植物生长与防御平衡中的核心作用,推动可持续农业发展 | 叶绿体及其在植物生长、防御机制中的功能 | 植物生物学 | NA | 多组学技术(基因组学、转录组学、蛋白质组学)、合成生物学、纳米技术 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
1242 | 2025-10-05 |
Engineering Plant Metabolism for Synthesizing Amino Acid Derivatives of Animal Origin Using a Synthetic Modular Approach
2024-Oct-16, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c05719
PMID:39356107
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研究论文 | 本研究利用植物代谢工程合成动物来源的氨基酸衍生物,通过合成模块化方法成功在植物中生产肌酸、肌肽和牛磺酸 | 开发了合成模块化框架,首次在植物中实现多种动物来源氨基酸衍生物的重定向合成,并发现模块整合可显著提高产量并减少对植物代谢的影响 | 牛磺酸模块的引入意外抑制了植物半胱氨酸生物合成,表明外源途径引入可能导致复杂的代谢调整 | 通过合成生物学方法增强植物性饮食的营养价值,实现动物来源必需营养素的可持续生产 | 肌酸、肌肽和牛磺酸等动物来源氨基酸衍生物 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达系统 | NA | 代谢产物定量数据 | NA | 合成模块化框架 | 植物 | 专门设计的合成代谢模块,包括肌酸模块、肌肽模块和牛磺酸模块,通过模块堆叠实现代谢通量重定向 | 农业,食品 |
1243 | 2025-10-05 |
A directed enolization strategy enables by-product-free construction of contiguous stereocentres en route to complex amino acids
2024-07, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-024-01473-5
PMID:38565976
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研究论文 | 开发了一种铱催化的定向烯醇化策略,用于高效合成具有连续立体中心的β-取代α-氨基酸 | 利用甘氨酸衍生物N-H单元的内源性导向能力实现铱催化的定向烯醇化,实现两个连续立体中心的高效构建 | NA | 开发合成具有β-立体中心的α-氨基酸的新方法 | β-取代α-氨基酸的合成 | 有机合成化学 | NA | 铱催化、定向烯醇化、交叉偶联 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物设计、手性催化剂合成、合成生物学 |
1244 | 2025-10-05 |
Artificial cell synthesis using biocatalytic polymerization-induced self-assembly
2024-04, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-023-01391-y
PMID:38049652
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研究论文 | 本研究开发了通过酶催化聚合诱导自组装合成能够表达蛋白质的聚合物人工细胞 | 首次利用肌红蛋白催化的原子转移自由基聚合诱导自组装技术合成具有蛋白质表达功能的人工细胞 | NA | 开发新型人工细胞合成方法并实现其生物学功能模拟 | 基于聚合物的人工细胞微结构 | 合成生物学 | NA | 原子转移自由基聚合诱导自组装 | NA | NA | NA | NA | NA | 蛋白质表达系统 | 分子系统工程, 合成生物学 |
1245 | 2025-10-05 |
An orthogonalized PYR1-based CID module with reprogrammable ligand-binding specificity
2024-01, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-023-01447-7
PMID:37872402
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研究论文 | 本研究开发了一种基于PYR1受体、具有可重编程配体结合特异性的正交化化学诱导二聚化模块 | 设计了带有二聚界面盐桥的正交化PYR1*模块,创建了对特定配体具有纳摩尔级敏感性的新型CID系统 | NA | 扩展PYR1化学诱导二聚化系统,开发可重编程配体结合特异性的正交化模块 | PYR1受体、HAB1磷酸酶及其正交化变体 | 合成生物学 | NA | X射线晶体学、生化分析、体内分析 | NA | 晶体结构数据、生化数据、体内功能数据 | NA | CID系统设计 | 拟南芥, 酿酒酵母 | 化学诱导二聚化模块、多输入/输出遗传电路、生物传感器 | 环境监测, 合成生物学 |
1246 | 2025-10-05 |
Designing microbial consortia with defined social interactions
2018-08, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-018-0091-7
PMID:29942078
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研究论文 | 通过社会相互作用工程开发具有可预测动态的合成微生物群落 | 结合模块化途径重构与模型创建,建立了六种独特相互作用模式的双菌群体系,并扩展至多菌群生态系统设计 | NA | 开发具有可预测动态的合成微生物群落 | 微生物群落及其社会相互作用 | 合成生物学 | NA | 社会相互作用工程、模块化途径重构 | 种群动态模型 | 微生物种群动态数据 | 六个双菌群体系,扩展至三菌群和四菌群生态系统 | NA | 微生物 | 六种社会相互作用模式:偏利共生、偏害共生、中性关系、合作、竞争和捕食 | 微生物组工程 |
1247 | 2025-10-05 |
Antibiotic conjugates: Using molecular Trojan Horses to overcome drug resistance
2025-May, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118007
PMID:40268370
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综述 | 本文综述了利用'特洛伊木马'策略开发抗生素偶联物以克服细菌耐药性的研究现状 | 系统总结了三种抗生素偶联物(单克隆抗体、抗菌肽和铁载体)的作用机制及临床前/临床证据 | 抗生素偶联物的临床转化仍面临多重障碍 | 开发新型抗菌疗法以应对多重耐药细菌感染 | 抗生素与生物活性成分(单克隆抗体、抗菌肽、铁载体)的偶联物 | NA | 细菌感染 | 基因工程、合成生物学、生物信息学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
1248 | 2025-05-07 |
Phosphorothioate-Modified Hairpin G-Triplex Reporter-Assisted Split CRISPR/Cas12a-Powered Biosensor for "Turn-On" Fluorescent Detection of Nucleic Acid and Non-Nucleic Acid Targets
2025-Apr-24, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00140
PMID:40270429
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research paper | 开发了一种基于CRISPR/Cas12a和硫代磷酸酯修饰的G-三链体报告基因的“开启”型荧光生物传感器,用于核酸和非核酸靶标的高灵敏度检测 | 首次探索了硫代磷酸酯修饰的G-四链体和G-三链体序列与硫黄素T结合在分裂CRISPR/Cas12a系统中产生“开启”荧光信号的新现象,并开发了相应的生物传感器 | 未提及在更复杂样本中的实际应用效果及可能的干扰因素 | 开发高灵敏度、低背景的“开启”型荧光生物传感器,用于核酸和非核酸靶标的检测 | 核酸靶标(miRNA-21)和非核酸靶标(卡那霉素) | 合成生物学传感技术 | NA | CRISPR/Cas12a系统,硫代磷酸酯修饰技术,荧光检测 | SCas12a/psHG3系统 | 荧光信号数据 | 未明确说明具体样本数量,但检测限达到100 fM(miRNA-21)和100 pM(卡那霉素) | NA | NA | NA | NA |
1249 | 2025-10-05 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis of Maize Embryo Development
2025-Apr-23, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.top108468
PMID:40268305
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学技术在玉米胚胎发育研究中的协同应用 | 首次将单细胞RNA测序与空间转录组学技术相结合研究玉米胚胎发育,实现基因表达模式在单细胞分辨率和空间背景下的协同分析 | 单细胞技术缺乏已知细胞标记物难以识别特定细胞簇,空间转录组学通常无法达到单细胞分辨率且检测到的转录本较少 | 研究玉米胚胎发育的基因表达模式和调控网络 | 玉米胚胎发育过程 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 玉米 | NA | 农业 |
1250 | 2025-10-05 |
Multi-Omics Analyses Reveal the Red and Far-Red Light Combination Enhancing Heterologous Protein and Metabolite Production in Nicotiana benthamiana
2025-Apr-23, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.15573
PMID:40269597
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了红与远红光组合能显著提高本氏烟草中异源蛋白和代谢物的产量 | 首次系统研究不同光质对本氏烟草瞬时表达效率的影响,发现红与远红光组合能显著提升异源蛋白和代谢物产量 | 研究仅针对本氏烟草和特定异源产物,未验证在其他植物或蛋白体系中的普适性 | 探究光质对植物瞬时表达系统效率的影响机制 | 本氏烟草植株及其表达的绿色荧光蛋白和紫杉二烯代谢物 | 植物合成生物学 | NA | 转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 分子生物学数据、组学数据 | 五种不同光质处理下的本氏烟草植株 | 农杆菌浸润 | 本氏烟草 | 异源蛋白表达和代谢物合成途径 | 工业生物技术 |
1251 | 2025-10-05 |
Combining diffusion and transformer models for enhanced promoter synthesis and strength prediction in deep learning
2025-Apr-22, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00183-25
PMID:40105319
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研究论文 | 本研究结合扩散模型和Transformer模型,开发了一种用于合成启动子设计和强度预测的深度学习平台 | 首次将扩散模型应用于启动子设计,并结合Transformer模型进行强度预测,相比传统方法能生成更接近天然启动子的合成序列 | NA | 开发高效的合成启动子设计和筛选方法,优化外源基因表达和代谢通路效率 | 合成启动子序列及其转录活性 | 合成生物学 | NA | 深度学习 | 扩散模型, Transformer, CNN, 变分自编码器 | 启动子序列数据 | NA | NA | 模型细菌, 蓝细菌 | 合成启动子设计 | 工业生物技术 |
1252 | 2025-10-05 |
Microalgae-based vaccines for aquaculture
2025-Apr-22, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.001
PMID:40268646
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综述 | 本文介绍基于微藻的口服疫苗在水产养殖中的应用及其免疫益处 | 提出微藻口服疫苗的合理化设计理念,结合合成生物学与鱼类免疫代谢研究推动疫苗创新 | NA | 探讨微藻疫苗在水产养殖中增强鱼类免疫力和控制疾病的作用 | 水产养殖鱼类 | 合成生物学 | 水产动物疾病 | 口服疫苗技术 | NA | NA | NA | NA | 微藻 | 疫苗抗原设计 | 农业 |
1253 | 2025-10-05 |
Electron transfer engineering of artificially designed cell factory for complete biosynthesis of steroids
2025-Apr-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58926-9
PMID:40258825
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研究论文 | 通过阐明NADPH依赖酶的电子传递机制,系统改造酿酒酵母细胞工厂实现胆固醇和孕烯醇酮的高效生物合成 | 首次系统阐明NADPH依赖酶的电子传递机制,并通过缩短和稳定电子传递链显著加速去质子化和质子耦合电子传递过程 | NA | 提高类固醇化合物的生物合成效率 | 酿酒酵母细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 电子传递工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 电子传递链工程、NADPH再生途径、碳流导向的电子传递组件 | 医药, 工业生物技术 |
1254 | 2025-10-05 |
Characterization of a 4'-O-rhamnosyltransferase and de novo biosynthesis of bioactive steroidal triglycosides from Paris polyphylla
2025-Apr-14, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101257
PMID:39844466
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研究论文 | 本研究从重楼中鉴定出4'-O-鼠李糖基转移酶UGT73DY2,阐明了甾体皂苷糖链生物合成机制,并通过合成生物学方法成功构建了地奥司宁生物合成系统 | 首次发现并表征了特异性催化甾体二糖苷4'-O-鼠李糖基化的UGT73DY2酶,通过半理性设计获得活性提升的突变体,并成功在烟草中重建了甾体三糖苷生物合成途径 | 未明确说明工程化系统的稳定性和规模化应用潜力 | 阐明重楼甾体皂苷糖链生物合成机制并开发替代生产方法 | 重楼(Paris polyphylla)中的甾体皂苷及其生物合成酶 | 合成生物学 | NA | 酶催化、分子动力学模拟、亚细胞定位分析、代谢工程 | NA | 酶学数据、分子模拟数据、代谢产物数据 | NA | 代谢工程,合成生物学 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 甾体三糖苷生物合成途径,包含14个生物合成基因的共表达系统 | 医药 |
1255 | 2025-10-05 |
Treatment of neurological pathology and inflammation in Machado-Joseph disease through in vivo self-assembled siRNA
2025-Mar-06, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awae304
PMID:39315766
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研究论文 | 本研究开发了一种通过体内自组装siRNA治疗马查多-约瑟夫病神经病理和炎症的新方法 | 利用合成生物学策略将宿主肝脏重编程为组织底盘,实现siRNA的体内自组装和靶向递送 | 研究仅在YACMJD84.2转基因小鼠模型中进行,尚未进行人体临床试验 | 开发针对SCA3疾病的有效治疗方法 | YACMJD84.2转基因小鼠模型 | 合成生物学 | 神经系统疾病 | siRNA技术、合成生物学 | NA | NA | YACMJD84.2转基因小鼠 | 合成生物学方法 | 小鼠 | 由巨细胞病毒启动子引导的合成构建体,编码神经元靶向的狂犬病毒糖蛋白标签和mATXN3-siRNA | 医学 |
1256 | 2025-10-05 |
Advancing CRISPR base editing technology through innovative strategies and ideas
2025-Mar, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2699-5
PMID:39231901
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综述 | 本文聚焦CRISPR平台系统中非DSB编辑器BE和PE的发展与创新,探讨了改进策略及其在基因编辑技术中的应用前景 | 系统阐述了“替换”、“组合”、“适应”和“调整”等创新策略在BE和PE开发中的应用,并总结了CRISPR技术创新的思维突破 | NA | 推动CRISPR碱基编辑技术的发展,实现理想化编辑器的开发 | CRISPR平台系统中的非DSB编辑器(BE和PE) | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因编辑技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学, 农业, 环境, 工业生物技术 |
1257 | 2025-10-05 |
Customizable gene sensing and response without altering endogenous coding sequences
2025-Mar, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01733-y
PMID:39266721
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研究论文 | 开发了一种在不改变内源基因编码序列的情况下整合遗传生物传感器的方法 | 通过将单导RNA插入基因终止子区域激活下游电路,避免了对内源基因编码序列的修改 | NA | 开发可定制的基因传感和响应系统 | CHO-K1细胞中的细胞应激传感器和效应器 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | 数学模型 | NA | NA | CRISPR-Cas9 | CHO-K1细胞 | 基因传感器和效应器平台,可条件性激活抗凋亡蛋白BCL-2 | 生物制造, 细胞命运控制, 细胞治疗 |
1258 | 2025-10-05 |
Bioengineering lipid-based synthetic cells for therapeutic protein delivery
2025-Feb, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.08.004
PMID:39209601
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综述 | 探讨基于脂质的合成细胞作为治疗性蛋白质递送平台的设计原理、功能特性及转化潜力 | 结合合成生物学与药物递送原理,利用脂质双层构建具有组织特异性靶向和免疫逃逸功能的刺激响应型合成细胞 | NA | 开发用于治疗性蛋白质递送的合成细胞平台 | 基于脂质的合成细胞 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 区室化蛋白质合成系统 | 医药 |
1259 | 2025-10-05 |
Temporal Loss of Genome-Wide and Immunogenetic Diversity in a Near-Extinct Parrot
2025-May, Molecular ecology
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/mec.17746
PMID:40130423
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研究论文 | 本研究通过基因组分析追踪极度濒危的橙腹鹦鹉在长期演化过程中基因组多样性和免疫基因多样性的丧失 | 结合高质量长读长参考基因组与古今样本(最早可追溯至1829年)进行全基因组比较分析,首次量化了该物种基因组多样性的时间性衰退 | 样本量有限(当代样本N=19,历史样本N=16),且仅关注了Toll样受体基因的等位基因变化 | 评估橙腹鹦鹉的基因组侵蚀和免疫遗传多样性下降状况,为保护该濒危物种提供科学依据 | 橙腹鹦鹉(Neophema chrysogaster)的古今基因组样本 | 保护基因组学 | 病毒、细菌和真菌感染性疾病 | 长读长测序、全基因组重测序 | NA | 基因组序列数据 | 35个样本(19个当代样本,16个历史样本) | 合成生物学 | NA | NA | 环境保护 |
1260 | 2025-10-05 |
Ultrasound-Energized OX40L-Expressing Biohybrid for Multidimensional Mobilization of Sustained T Cell-Mediated Antitumor Immunity and Potent Sono-Immunotherapy
2025-Apr-23, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c02025
PMID:40200836
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研究论文 | 开发一种超声激活的生物混合系统,通过合成生物学工程化细菌表达OX40L并集成声敏剂,实现多维激活T细胞介导的抗肿瘤免疫治疗 | 首次将超声激活的纳米佐剂与共刺激免疫增强剂整合于活体生物治疗平台,实现级联放大的多维免疫激活 | NA | 开发新型癌症声免疫治疗策略,实现持久抗肿瘤免疫应答 | 工程化细菌生物混合系统及其抗肿瘤免疫效应 | 合成生物学 | 肿瘤 | 合成生物学、超声技术 | NA | 实验数据 | NA | 合成生物学 | 细菌 | 表达OX40配体融合蛋白的生物传感器系统 | 医学 |