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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1301 | 2024-09-13 |
An expanded molecular and systems toolbox for imaging, mapping, and controlling local translation
2024-Oct, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2024.102523
PMID:39226865
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综述 | 本文综述了用于成像、映射和控制局部翻译的扩展分子和系统工具箱 | 本文介绍了用于可视化和映射生物分子组件及翻译过程的新技术,这些技术具有更好的空间和时间分辨率,且伪影更少 | NA | 探讨如何通过新技术更好地可视化和控制细胞内局部蛋白质翻译过程 | 细胞内局部蛋白质翻译过程及其相关生物分子组件 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
1302 | 2024-09-13 |
PhysioFit: a software to quantify cell growth parameters and extracellular fluxes
2024-08-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae488
PMID:39073885
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研究论文 | 介绍了一种名为PhysioFit的开源软件,用于量化细胞生长参数和胞外通量 | PhysioFit可以与任何生长模型兼容,并且设计为可互操作,支持多种常见生长模型,并允许高级用户实现额外的模型 | NA | 开发一种能够量化生长参数和胞外通量的通用工具 | 细胞生长参数和胞外通量 | 生物信息学 | NA | Python编程 | NA | 时间序列数据 | NA |
1303 | 2024-09-13 |
Robustness and evolvability: Revisited, redefined and applied
2024-Aug-02, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2024.105281
PMID:39098381
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研究论文 | 本文重新定义并应用了系统的鲁棒性和可进化性,提出了新的形式化定义和相应的度量方法,并使用进化算法在BNK模型系统中寻找不同类型的完美振荡器 | 本文提出了新的鲁棒性和可进化性的形式化定义和度量方法,比Wagner最初提出的度量方法更通用和更具代表性。此外,本文还提出了一种受NK系统启发的BNK数字建模方法,并应用于进化算法中 | NA | 重新定义和应用系统的鲁棒性和可进化性 | 系统的鲁棒性和可进化性,以及DNA合成噪声对DNA基生物传感器功能的影响和不同类型核酶的可进化性 | 合成生物学 | NA | 进化算法 | BNK模型 | NA | NA |
1304 | 2024-09-13 |
Enabling technology and core theory of synthetic biology
2023-08, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-022-2214-2
PMID:36753021
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综述 | 本文讨论了合成生物学领域的各种原理和技术进展 | 介绍了合成生物学的使能技术和核心理论的发展,包括基因组合成与组装、DNA存储、基因编辑等 | NA | 探讨合成生物学的使能技术和核心理论的进展 | 合成生物学的使能技术和核心理论 | 合成生物学 | NA | 基因组合成与组装、DNA存储、基因编辑、分子进化、功能蛋白从头设计、细胞和基因电路工程、无细胞合成生物学、人工智能辅助合成生物学 | NA | NA | NA |
1305 | 2024-09-13 |
Call for biotechnological approach to degrade plastic in the era of COVID-19 pandemic
2023-Mar, Saudi journal of biological sciences
DOI:10.1016/j.sjbs.2023.103583
PMID:36748033
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review | 本文综述了在COVID-19大流行背景下,利用生物技术方法降解塑料的潜力和挑战 | 本文提出了利用合成生物学、代谢工程和生物信息学方法来增强微生物降解塑料的能力 | 目前对基因、酶和细菌与塑料相互作用的研究不足 | 探讨如何利用现代生物技术增强微生物降解塑料的能力 | 研究对象包括塑料污染、微生物降解塑料的机制以及相关的生物技术方法 | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、生物信息学 | NA | NA | NA |
1306 | 2024-09-13 |
Elucidation of the (R)-enantiospecific benzylisoquinoline alkaloid biosynthetic pathways in sacred lotus (Nelumbo nucifera)
2023-02-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-29415-0
PMID:36805479
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研究论文 | 研究揭示了神圣莲花中(R)-手性苯基异喹啉生物碱的生物合成途径 | 首次探索了神圣莲花中独特的苯基异喹啉生物碱生物合成途径,并鉴定了负责R-手性形成的酶 | 研究主要集中在酶的鉴定和初步功能验证,未深入探讨整个生物合成网络的调控机制 | 阐明神圣莲花中(R)-手性苯基异喹啉生物碱的生物合成途径 | 神圣莲花中的苯基异喹啉生物碱及其生物合成酶 | NA | NA | 酶标记实验、体外重组酶和植物蛋白提取物分析 | NA | NA | NA |
1307 | 2024-09-13 |
Bacterial Form II Rubisco can support wild-type growth and productivity in Solanum tuberosum cv. Desiree (potato) under elevated CO2
2023-Feb, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgac305
PMID:36743474
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研究论文 | 本文描述了通过叶绿体转化技术将马铃薯中的天然Rubisco替换为细菌来源的Rubisco,以提高其光合作用效率 | 首次在作物中通过叶绿体转化技术替换Rubisco,并展示了在不同CO2浓度下马铃薯的产量和叶生物化学特性 | 研究仅限于特定品种的马铃薯和特定的CO2浓度,未探讨其他环境因素的影响 | 通过叶绿体转化技术改善作物光合作用,提高产量 | 马铃薯品种Desiree | NA | NA | 叶绿体转化技术 | NA | NA | 涉及不同CO2浓度的马铃薯植株 |
1308 | 2024-09-13 |
Current Landscape of Methods to Evaluate Antimicrobial Activity of Natural Extracts
2023-Jan-20, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules28031068
PMID:36770734
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综述 | 本文综述了评估天然提取物抗菌活性的传统和现代方法 | 本文介绍了新技术在提高分析能力、时间效率、灵敏度和可重复性方面的应用 | NA | 分析和比较评估天然提取物抗菌活性的传统和现代方法 | 天然提取物的抗菌活性 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1309 | 2024-09-13 |
Recent Advances in CRISPR-Cas Technologies for Synthetic Biology
2023-Jan, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.1007/s12275-022-00005-5
PMID:36723794
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综述 | 本文综述了CRISPR-Cas技术在合成生物学中的最新进展 | 介绍了CRISPR-Cas技术在基因组编辑、分子诊断和代谢生物技术中的应用 | NA | 总结CRISPR技术在合成生物学中的应用现状,并讨论其在微生物学中的发展 | CRISPR-Cas技术及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas技术 | NA | NA | NA |
1310 | 2024-09-13 |
PLATERO: A calibration protocol for plate reader green fluorescence measurements
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1104445
PMID:36741754
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PLATERO的校准协议,用于将板式读取器绿色荧光测量结果转换为参考荧光素的浓度单位 | PLATERO协议消除了测量设备的增益对数据的影响,并将荧光强度值转换为浓度单位,提供了一个单一的数学表达式,返回标准化、增益无关且可比较的数据 | NA | 开发一种校准协议,以标准化板式读取器荧光测量结果,并消除设备增益的影响 | 板式读取器绿色荧光测量数据 | 合成生物学 | NA | 荧光测量 | 校准模型 | 荧光数据 | NA |
1311 | 2024-09-13 |
Transcription factor-based biosensors for screening and dynamic regulation
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1118702
PMID:36814719
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综述 | 本文综述了基于转录因子的生物传感器在筛选和动态调控中的应用 | 讨论了实验和计算方法在改进和优化基于转录因子的生物传感器中的应用 | 目前基于转录因子的生物传感器在广泛应用中仍面临挑战 | 总结当前基于转录因子的生物传感器的知识,并提出未来研究方向 | 基于转录因子的生物传感器及其在生物生产筛选和遗传电路动态调控中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1312 | 2024-09-11 |
Systematic metabolic engineering enables highly efficient production of vitamin A in Saccharomyces cerevisiae
2025, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.08.004
PMID:39247801
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研究论文 | 本文通过系统代谢工程在酿酒酵母中高效生产维生素A | 首次通过挖掘不同来源的β-胡萝卜素15,15'-单(双)加氧酶,并结合表达两种具有不同催化机制但催化性能相当的同工酶,显著提高了维生素A的产量 | NA | 研究在酿酒酵母中高效生产维生素A的方法 | 维生素A的生产 | 代谢工程 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
1313 | 2024-09-11 |
Engineered transcription activator-like effector dimer proteins confer DNA loop-dependent gene repression comparable to Lac repressor
2024-Sep-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae656
PMID:39077947
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研究论文 | 本文设计了基于目标序列可编程的转录激活因子样效应物二聚体(TALED)蛋白的抑制系统,并展示了其在DNA环依赖的细菌启动子抑制中的应用 | 本文首次展示了通过共价结合的TALED蛋白实现强效的DNA环依赖的细菌启动子抑制,并验证了DNA环结构显著增强启动子抑制效果 | 本文主要集中在E. coli中的实验验证,未来需进一步研究其在其他生物系统中的适用性 | 设计并验证一种新型的DNA环依赖的基因抑制系统,为合成生物学和治疗应用提供新工具 | 转录激活因子样效应物二聚体(TALED)蛋白及其在DNA环依赖的基因抑制中的应用 | 合成生物学 | NA | DNA环结构分析 | NA | DNA序列 | E. coli菌株 |
1314 | 2024-09-11 |
Induction of bacterial expression at the mRNA level by light
2024-Sep-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae678
PMID:39126322
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研究论文 | 本文利用光敏受体NmPAL在mRNA水平上诱导细菌表达,通过蓝光触发NmPAL结合破坏cis-抑制的mRNA状态,从而解除翻译起始的阻碍,上调基因表达 | 本文开发了一种名为riboptoregulator的光遗传学电路,能够在mRNA水平上进行基因表达调控,并能与现有基因调控电路结合,实现更精细和严格的基因表达控制 | NA | 开发一种在mRNA水平上进行光遗传学调控的新方法,以提高细菌基因表达的效率和精确性 | 细菌基因表达的调控机制 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | mRNA | NA |
1315 | 2024-09-10 |
Advances in the Structures, Pharmacological Activities, and Biosynthesis of Plant Diterpenoids
2024-Aug-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2402.02014
PMID:39081244
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综述 | 本文综述了植物二萜类化合物的结构、药理活性和生物合成途径 | 利用合成生物学将微生物工程化为“细胞工厂”以生产所需化合物 | NA | 探讨植物二萜类化合物的生物合成机制及其在微生物中的异源生产 | 植物二萜类化合物及其生物合成途径 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1316 | 2024-09-11 |
Synthetic biology-inspired cell engineering in diagnosis, treatment, and drug development
2023-03-11, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-023-01375-x
PMID:36906608
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综述 | 本文综述了合成生物学在细胞工程领域的最新进展及其在诊断、治疗和药物开发中的应用 | 介绍了合成生物学提供的遗传工具,用于重新编程和工程化细胞以提高性能、赋予新功能和多样化的应用 | 讨论了在临床实践中应用基因工程细胞的局限性和挑战 | 更新合成生物学在生物医学应用中的最新进展,并探讨未来的优化方向 | 合成生物学驱动的细胞工程在诊断、治疗和药物开发中的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1317 | 2024-09-11 |
Exploring a chemical scaffold for rapid and selective photoaffinity labelling of non-ribosomal peptide synthetases in living bacterial cells
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0026
PMID:36633280
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研究论文 | 本文介绍了一种用于快速和选择性光亲和标记非核糖体肽合成酶(NRPSs)的化学支架,适用于纯化系统、粗生物样本和活细菌细胞 | 开发了一种基于三氟甲基苯基重氮的新型光亲和标记探针,能够在较短的紫外线照射时间内实现高选择性和敏感性的标记 | NA | 研究非核糖体肽合成酶(NRPSs)在细菌细胞中的生物学功能 | 非核糖体肽合成酶(NRPSs)及其在细菌细胞中的活性 | 化学合成生物学 | NA | 光亲和标记 | NA | 蛋白质 | NA |
1318 | 2024-09-11 |
Discovery, implications and initial use of semi-synthetic organisms with an expanded genetic alphabet/code
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0030
PMID:36633274
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综述 | 本文综述了通过扩展遗传字母表创建半合成生物体以生产下一代蛋白质疗法的发现、意义和初步应用 | 介绍了通过合成核苷酸形成非天然碱基对,并将其整合到DNA中以稳定维持、转录和翻译蛋白质的创新方法 | NA | 探讨扩展遗传字母表以生产具有不同功能的蛋白质的潜力 | 半合成生物体及其在生产下一代蛋白质疗法中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成核苷酸 | NA | NA | NA |
1319 | 2024-09-11 |
Orthoester formation in fungal meroterpenoid austalide F biosynthesis
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0037
PMID:36633279
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研究论文 | 研究揭示了真菌倍半萜austalide F的生物合成途径,特别是orthoester的形成机制 | 首次阐明了α-酮戊二酸依赖性加氧酶AstB和甲基转移酶AstL在orthoester形成中的作用 | NA | 揭示真菌倍半萜austalide F的生物合成途径 | 真菌倍半萜austalide F及其生物合成机制 | NA | NA | 异源基因表达 | NA | NA | NA |
1320 | 2024-09-11 |
Genome mining of cryptic bisabolenes that were biosynthesized by intramembrane terpene synthases from Antrodia cinnamomea
2023-02-27, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2022.0033
PMID:36633275
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研究论文 | 本文通过基因组挖掘方法,发现了一种来自Antrodia cinnamomea的真菌中的非典型UbiA型萜烯合酶,能够合成(+)-(,)-α-bisabolene,并揭示了其生物合成途径 | 首次发现真菌中的非典型UbiA型萜烯合酶能够合成bisabolene,并鉴定了相关的修饰酶 | NA | 揭示真菌中bisabolene的生物合成途径及其酶学机制 | Antrodia cinnamomea中的萜烯合酶及其生物合成途径 | 生物化学 | NA | 基因组挖掘 | NA | 基因组数据 | NA |