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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
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1301 | 2025-10-05 |
Semi-automated workflow for high-throughput Agrobacterium-mediated plant transformation
2025-Apr, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70118
PMID:40220013
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研究论文 | 开发了一种用于农杆菌介导植物转化的半自动化高通量工作流程 | 优化了农杆菌转化流程并简化了地钱稳定转基因株系获取协议,首次实现六孔板冻融转化方法并适配机器人自动化 | NA | 建立高效高通量植物转化体系以克服植物研究中世代时间长和成本高的障碍 | 模型植物地钱(Marchantia polymorpha) | 合成生物学 | NA | 农杆菌转化法 | NA | NA | 每月可测试约100个构建体 | Agrobacterium tumefaciens | Marchantia polymorpha | NA | 农业, 工业生物技术 |
1302 | 2025-10-05 |
Toward Sustainable Polyhydroxyalkanoates: A Next-Gen Biotechnology Approach
2025-Mar-22, Polymers
IF:4.7Q1
DOI:10.3390/polym17070853
PMID:40219244
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研究论文 | 本文探讨利用极端微生物和下一代生物技术生产可持续生物聚合物聚羟基脂肪酸酯(PHA)的方法 | 整合极端微生物与AI驱动发酵技术,利用CRISPR基因组编辑和替代原料优化PHA生产 | 未提及具体技术实施的经济性定量分析或大规模生产的实际障碍 | 开发可持续的PHA生物聚合物生产技术以替代石油基塑料 | 极端微生物(特别是嗜盐菌)及其代谢工程改造 | 工业生物技术 | NA | 代谢工程、合成生物学、CRISPR基因组编辑、AI驱动发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 嗜盐菌(Halophiles) | 代谢通路优化 | 材料, 环境 |
1303 | 2025-10-05 |
Current Approaches for Genetic Manipulation of Streptomyces spp.-Key Bacteria for Biotechnology and Environment
2025-Jan-02, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech14010003
PMID:39846552
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综述 | 本文综述了链霉菌遗传操作的最新方法与挑战,重点介绍了合成生物学策略在开发这类重要生物技术细菌中的应用 | 总结了DNA测序、分析和编辑技术进步带来的新策略,能够克服菌株和构建体特异性工程难题 | 现有方法仍存在菌株和设计依赖性的限制 | 探索、理解和操纵链霉菌作为生物技术关键细菌的能力 | 链霉菌属细菌 | 合成生物学 | NA | DNA测序、基因组挖掘、遗传构建体组装 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 链霉菌 | 生物传感器、代谢途径 | 工业生物技术, 医药, 农业, 环境 |
1304 | 2025-10-05 |
Harnessing hyperaccumulator plants to recover technology-critical metals: where are we at?
2025-May, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.20449
PMID:40066815
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综述 | 本文回顾了植物采矿技术三十多年来的发展历程,重点探讨了利用超富集植物回收镍及其他关键金属的现状与潜力 | 首次系统整合了超富集分子机制研究进展与商业化植物采矿实践,提出通过定向育种和合成生物学改进超富集植物的新路径 | 目前仅镍元素实现商业化规模应用,其他金属(钴、硒、铊)的植物采矿潜力尚未充分开发 | 推动利用超富集植物回收技术关键金属的植物采矿技术发展 | 超富集植物及其对镍、钴、硒、铊等金属的富集机制 | 环境生物技术 | NA | 定向育种、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 超富集植物 | NA | 环境, 工业生物技术 |
1305 | 2025-10-05 |
Innovations in Bacteriophage Genome Engineering for Combating Multidrug-Resistant Bacterial Infections
2025-Apr-11, Foodborne pathogens and disease
IF:1.9Q3
DOI:10.1089/fpd.2024.0194
PMID:40216545
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综述 | 本文综述了噬菌体基因组工程技术在对抗多重耐药细菌感染方面的创新进展 | 整合CRISPR/Cas9、同源重组等合成生物学技术改进噬菌体效能并扩大宿主范围 | 未提及具体临床转化时间表或大规模应用案例 | 开发针对多重耐药细菌感染的噬菌体治疗策略 | 噬菌体与细菌宿主的相互作用机制 | 合成生物学 | 细菌感染 | CRISPR/Cas9, 同源重组, 合成生物学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 噬菌体 | 受体结合蛋白修饰 | 医学 |
1306 | 2025-10-05 |
High throughput construction of species characterized bacterial biobank for functional bacteria screening: demonstration with GABA-producing bacteria
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1545877
PMID:40212379
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研究论文 | 开发了一种高通量细菌生物库构建和功能筛选平台,并成功筛选出高产GABA的功能菌株 | 采用双末端条形码策略实现数千个细菌分离株的混合纳米孔测序,开发了模块化荧光生物传感器系统用于代谢物检测 | 仅针对GABA产生能力进行了概念验证筛选,平台在其他代谢物检测中的适用性需要进一步验证 | 建立高效的功能细菌发现平台,推动工业生物技术发展 | 来自中国各地发酵食品和婴儿粪便的细菌分离株 | 合成生物学 | NA | 纳米孔测序, 全长16S rDNA测序, 桑格测序, 荧光生物传感 | NA | 基因组测序数据, 荧光信号数据 | 15,337个细菌分离株(生物库), 1,740个分离株(GABA筛选) | 双质粒系统 | 细菌 | 模块化生物传感器, 代谢物传感与信号报告解耦系统 | 工业生物技术, 益生菌开发 |
1307 | 2025-10-05 |
Determination of the genome-scale metabolic network of Bartonella quintana str. Toulouse to optimize growth for its use as chassis for synthetic biology
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1527084
PMID:40213639
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研究论文 | 本研究重建了Bartonella quintana str. Toulouse的基因组尺度代谢网络模型,以优化其作为合成生物学底盘细胞的生长条件 | 首次构建了Bartonella quintana的基因组尺度代谢模型,并通过实验验证确定了2-酮戊二酸等关键代谢物对其生长的必要性 | 模型准确性仍需进一步提高,某些补充条件下观察到意外的生存率下降现象 | 优化Bartonella quintana的生长条件,开发其作为合成生物学底盘细胞的潜力 | Bartonella quintana str. Toulouse菌株及其代谢网络 | 合成生物学 | NA | 基因组注释、代谢网络重建、通量平衡分析、蛋白质组学分析 | 基因组尺度代谢模型 | 基因组数据、代谢数据、蛋白质组数据 | NA | NA | Bartonella quintana | NA | 工业生物技术 |
1308 | 2025-10-05 |
Discovery of diverse and high-quality mRNA capping enzymes through a language model-enabled platform
2025-Apr-11, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt0402
PMID:40203090
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研究论文 | 开发基于大语言模型的基因挖掘平台SYMPLEX,用于发现高质量mRNA加帽酶 | 首次将大语言模型应用于基因挖掘领域,突破了传统基于序列同源性或专家知识的限制 | 未明确说明平台验证的规模限制和错误率 | 建立通用的基因挖掘平台以扩展合成生物学高质量遗传部件库 | mRNA加帽酶 | 合成生物学 | NA | 大语言模型,体外活性测试,体内交叉物种活性验证 | 大语言模型 | 生物医学文献和数据库文本数据 | 46个候选完整加帽酶进行实验测试 | NA | NA | NA | 生物技术,医药 |
1309 | 2025-10-05 |
Harnessing RNA base editing for diverse applications in RNA biology and RNA therapeutics
2025-Apr-08, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-025-00063-x
PMID:40198443
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综述 | 本文综述了RNA碱基编辑技术在RNA生物学和RNA治疗领域的多样化应用 | 系统阐述了RNA碱基编辑作为突破性技术的优势,包括可逆性、剂量依赖性效应,以及在转录组范围内绘制RNA结合蛋白互作图谱的能力 | NA | 探讨RNA碱基编辑技术在基础研究和转化应用中的潜力 | RNA碱基编辑技术及其应用 | 合成生物学 | NA | RNA碱基编辑(ADAR和APOBEC介导的A-to-I和C-to-U转换) | NA | NA | NA | NA | NA | RNA编辑传感器(响应特定RNA物种表达效应蛋白) | 医学, 合成生物学 |
1310 | 2025-10-05 |
Understanding the role of poly(3-hydroxybutyrate) depolymerases in waste management
2025-Apr, Journal of environmental management
IF:8.0Q1
DOI:10.1016/j.jenvman.2025.124925
PMID:40132380
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综述 | 本文综述了PHB解聚酶在生物塑料废物管理中的作用机制和应用前景 | 首次系统总结了胞外和胞内PHB解聚酶的结构特征、微生物来源及在PHB生物降解中的功能 | 主要基于文献综述,缺乏原始实验数据支持 | 探讨PHB解聚酶在生物可降解塑料废物处理中的应用潜力 | PHB解聚酶及其产生微生物 | 环境生物技术 | NA | 生物信息学、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | NA | Rhodobacter, Rhodospirillum, Ralstonia, Zoogloea, Pseudomonas, Sinorhizobium, Bacillus | NA | 环境 |
1311 | 2025-10-05 |
An inhibitor-free, versatile, fast, and cheap precipitation-based DNA purification method
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0317658
PMID:40198694
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研究论文 | 开发了一种无需抑制剂、快速廉价的新型DNA纯化方法 | 通过使用离液盐和醇/聚乙二醇实现蛋白质去除和DNA沉淀的单步操作,突破了传统方法需要多步骤的限制 | 未明确说明方法的适用范围和可能存在的其他限制因素 | 解决商业硅胶柱纯化方法中存在的酶反应抑制问题 | DNA纯化技术 | 合成生物学 | NA | DNA沉淀纯化技术 | NA | NA | NA | Gibson Assembly | E. coli | NA | 分子生物学, 合成生物学 |
1312 | 2025-10-05 |
Potential applications of engineered bacteria in disease diagnosis and treatment
2025, Microbiome research reports
DOI:10.20517/mrr.2024.57
PMID:40207274
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综述 | 探讨工程菌在疾病诊断与治疗中的潜在应用及其作用机制 | 系统阐述利用合成生物学技术改造益生菌作为药物递送系统、生物传感器和黏膜疫苗的创新方法 | 未提及具体临床转化障碍和监管挑战 | 评估工程菌在疾病管理中的应用潜力 | 经过基因编辑的工程菌 | 合成生物学 | 炎症性肠病, 代谢疾病, 癌症, 神经退行性疾病 | 基因编辑技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 益生菌 | 药物递送系统, 生物传感器, 黏膜疫苗 | 医学 |
1313 | 2025-10-05 |
Advances in engineered bacteria vaccines for enhancing anti-cancer immunity
2025, Microbiome research reports
DOI:10.20517/mrr.2024.75
PMID:40207284
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研究论文 | 本研究通过合成生物学技术改造大肠杆菌Nissle 1917,开发了一种能够递送肿瘤新抗原表位的活菌疫苗 | 利用活菌药物优势在最佳环境中递送肿瘤特异性新抗原表位阵列,为癌症免疫治疗提供新策略 | NA | 开发有效的持久性癌症免疫疗法 | 工程化细菌疫苗 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 肿瘤靶向递送系统 | 医学 |
1314 | 2025-10-05 |
CRISPR and the Rebirth of Synthetic Biology
2017-04, Science and engineering ethics
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s11948-016-9768-z
PMID:27325413
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综述 | 探讨CRISPR技术引发的合成生物学伦理监管问题及转化研究障碍 | 将CRISPR技术与合成生物学伦理框架结合分析,提出'尝试权'概念在非生殖系基因治疗中的应用 | 未提出具体解决方案,主要聚焦于现状分析和问题梳理 | 分析基因组工程技术的伦理监管挑战和转化研究障碍 | CRISPR技术相关的伦理规范、监管政策和临床转化路径 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因组编辑 | NA | 政策文献和伦理分析 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
1315 | 2025-10-05 |
Bioconversion of CO2 into valuable bioproducts via synthetic modular co-culture of engineered Chlamydomonas reinhardtii and Escherichia coli
2025-Jul, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.03.004
PMID:40057263
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研究论文 | 开发了一种由改造的莱茵衣藻和大肠杆菌组成的合成模块化共培养系统,用于将CO2转化为高价值生物产品 | 首次构建了GYD1缺陷型莱茵衣藻突变体与大肠杆菌的模块化共培养系统,通过光呼吸途径实现CO2到生物产品的转化 | NA | 开发可持续的生物转化系统,将CO2转化为有价值的生物产品 | 改造的莱茵衣藻GYD1突变体和大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | 代谢工程 | Chlamydomonas reinhardtii, Escherichia coli | 模块化共培养系统,利用光呼吸途径分泌乙醇酸,通过乙醛酸循环代谢 | 环境, 能源, 工业生物技术 |
1316 | 2025-10-05 |
Mechanism and engineering of endoplasmic reticulum-localized membrane protein folding in Saccharomyces cerevisiae
2025-Jul, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.03.006
PMID:40064436
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综述 | 本文综述了酿酒酵母内质网膜蛋白折叠机制及代谢工程策略 | 系统总结膜蛋白折叠四步骤及其影响因素,并提出增强异源膜蛋白正确折叠的多维度工程策略 | 现有策略仍存在局限性,需进一步研究解决关键问题 | 研究内质网膜蛋白折叠机制及优化策略 | 酿酒酵母中的内质网定位膜蛋白(如细胞色素P450) | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 酿酒酵母 | 膜蛋白工程、分子伴侣共表达、脂质工程 | 工业生物技术 |
1317 | 2025-10-05 |
Expanding the toolkit for ploidy manipulation in Chlamydomonas reinhardtii
2025-May, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70095
PMID:40116553
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研究论文 | 开发了一种在莱茵衣藻中操纵倍性水平的合成生物学策略 | 使用非干扰性抗生素选择标记工程化倍性,可应用于野外分离株而不仅限于特定营养缺陷型实验室菌株 | 新形成的三倍体和四倍体显示出快速非整倍体化的迹象 | 研究倍性变化对植物进化的影响 | 莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii) | 合成生物学 | NA | 流式细胞术 | NA | 基因组大小数据 | 北美野外分离株 | 抗生素选择标记 | 莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii) | 倍性操纵系统 | 基础研究,应用研究 |
1318 | 2025-10-05 |
Powering the Future: Unveiling the Secrets of Semiconductor Biointerfaces in Biohybrids for Semiartificial Photosynthesis
2025-Jan-23, Artificial photosynthesis (Washington, D.C.)
DOI:10.1021/aps.4c00008
PMID:40200990
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综述 | 本文综述了半人工光合作用中半导体-生物界面在生物混合系统中的作用机制与研究进展 | 系统揭示半导体与微生物之间电荷转移机制的研究空白,提出结合先进光谱学、显微镜学和合成生物学工具的研究路径 | 缺乏对光-半导体-微生物组合产化学品的明确机理理解,商业化应用仍面临基础挑战 | 通过研究半导体-微生物界面的电荷转移动力学,提高太阳能-化学能转换效率以实现工业应用 | 生物混合系统中的半导体-微生物界面 | 合成生物学 | NA | 先进光谱学、显微镜学、合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | 电活性微生物 | 半导体作为微生物的电子供体或受体的人工光合系统 | 能源, 环境 |
1319 | 2025-10-05 |
An innovative high-throughput genome releaser for rapid and efficient PCR screening
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1547909
PMID:40200958
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研究论文 | 开发了一种用于快速高效PCR筛选的高通量基因组释放器 | 采用压片法实现快速、经济高效的DNA提取,无需提取缓冲液,与标准液体处理机器人平台兼容 | NA | 解决当前高通量PCR筛选方法中DNA提取效率低、成本高和可扩展性限制等问题 | 真菌孢子及其他微生物和细胞类型 | 合成生物学 | NA | PCR筛选、DNA提取 | NA | 基因组DNA | 96孔板规格 | NA | 真菌、多种微生物和细胞类型 | NA | 生物制造 |
1320 | 2025-10-05 |
Translational activation by a synthetic PPR protein elucidates control of psbA translation in Arabidopsis chloroplasts
2024-Oct-03, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koae112
PMID:38593198
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研究论文 | 本研究通过合成PPR蛋白替代HCF173功能,揭示了拟南芥叶绿体中psbA翻译的光调控机制 | 首次证明合成PPR蛋白能够部分替代天然HCF173蛋白的功能激活psbA翻译,但无法实现光响应调控 | 合成PPR蛋白只能部分恢复HCF173功能,且无法实现光响应翻译调控 | 探究叶绿体psbA mRNA翻译的光调控分子机制 | 拟南芥叶绿体psbA mRNA及其翻译调控蛋白HCF173 | 合成生物学 | NA | 合成PPR蛋白设计、体内结合分析、翻译活性检测 | NA | 分子生物学实验数据 | NA | 合成PPR蛋白 | 拟南芥 | 翻译激活系统 | 合成生物学, 基础研究 |