合成生物学相关文章
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当前共找到 3070 篇文献，本页显示第 1321 - 1340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1321 | 2024-09-07 |
Construction of an rAAV Producer Cell Line through Synthetic Biology
2022-10-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00207
PMID:36219557
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法构建了一种无需转染和辅助病毒的rAAV生产细胞系 | 首次通过合成生物学方法构建了无需转染和辅助病毒的rAAV生产细胞系，实现了对病毒载体质量的调控 | NA | 开发一种无需转染和辅助病毒的rAAV生产细胞系，以提高基因治疗应用中病毒载体的生产效率 | rAAV生产细胞系 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 细胞系 | HEK293细胞 |
| 1322 | 2024-09-07 |
Stimuli-responsive vesicles as distributed artificial organelles for bacterial activation
2022-10-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2206563119
PMID:36223394
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研究论文 | 本文报道了两种基于远程控制的囊泡型人工细胞器，能够将物理输入转化为化学信号，从而激活细菌 | 本文提出了一种分布式方法，通过人工细胞而非细菌细胞本身来设计刺激响应性细菌，与现有方法不同 | NA | 研究人工细胞与活细胞之间的通信，探索其在生物医学和生物技术中的应用 | 刺激响应性囊泡型人工细胞器及其对细菌的激活作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1323 | 2024-09-07 |
Genetically engineered bacterium: Principles, practices, and prospects
2022, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2022.997587
PMID:36312915
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综述 | 本文综述了基因工程细菌（GEB）的发展及其在疾病管理中的应用 | 介绍了GEB在疾病治疗中的创新应用，如作为肠道或其他组织中的小型“机器工厂”，持续产生异源蛋白质或分子化合物，用于诊断或治疗疾病 | GEB在实际应用中的实施仍然是一个重大挑战，尤其是在初期阶段 | 探讨GEB在疾病管理中的应用及其潜在的临床前景 | 基因工程细菌及其在癌症和代谢疾病治疗中的应用 | NA | 癌症, 代谢疾病 | 合成生物学, 微生物遗传技术 | NA | NA | NA |
| 1324 | 2024-09-06 |
Optimizing Promoters and Subcellular Localization for Constitutive Transgene Expression in Marchantia polymorpha
2024-Sep-03, Plant & cell physiology
DOI:10.1093/pcp/pcae063
PMID:38822700
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研究论文 | 研究优化了苔藓植物Marchantia polymorpha中的启动子和亚细胞定位，以实现持续的转基因表达 | 发现了新的启动子，这些启动子在所有组织中都能驱动高水平的基因表达，且不会对生长造成负担，并证明了细胞质是异源蛋白表达的最佳亚细胞定位 | NA | 优化Marchantia polymorpha中的启动子和亚细胞定位，以实现持续的转基因表达 | Marchantia polymorpha中的启动子和亚细胞定位 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1325 | 2024-09-06 |
Zero-shot prediction of mutation effects with multimodal deep representation learning guides protein engineering
2024-Sep, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-024-00989-2
PMID:38969803
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ProMEP的多模态深度表示学习方法，用于零样本预测蛋白质突变效应，并指导蛋白质工程 | ProMEP通过多模态深度学习模型，从约1.6亿个蛋白质中全面学习序列和结构上下文，实现了突变效应的零样本预测，显著提高了预测速度和准确性 | NA | 开发一种能够准确预测蛋白质突变效应并指导蛋白质工程的方法 | 蛋白质突变效应的预测和基因编辑酶TnpB和TadA的工程化 | 生物信息学 | NA | 多模态深度表示学习 | 多模态深度学习模型 | 蛋白质序列和结构数据 | 约1.6亿个蛋白质 |
| 1326 | 2024-09-06 |
Cell reprogramming design by transfer learning of functional transcriptional networks
2024-Mar-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2312942121
PMID:38437548
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研究论文 | 本文开发了一种基于转录组数据的迁移学习方法，用于控制细胞行为，并生成可转移到特定重编程目标的网络动力学模型 | 通过预训练的适应性模型，创新性地改进了现有方法，能够针对特定的重编程转换进行调整 | 需要进一步验证和优化以应对复杂的细胞网络和组合干预的挑战 | 利用合成生物学、下一代测序和机器学习的最新进展，合理设计基于基因扰动和药物反应的新疾病治疗方法 | 人类细胞命运相关的转录组数据，以及微阵列和RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 下一代测序 (NGS), RNA测序 (RNA-seq) | 迁移学习模型 | 转录组数据 | 超过9,000个微阵列数据和超过10,000个RNA测序数据，涵盖54种细胞类型和227种独特扰动 |
| 1327 | 2024-09-06 |
Assembly of plant virus agroinfectious clones using biological material or DNA synthesis
2022-12-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101716
PMID:36149792
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研究论文 | 本文描述了利用生物材料或DNA合成技术组装植物病毒感染性克隆的流程 | 本文结合了合成生物学进展，详细介绍了基于同源重组的生物材料克隆和使用IIS型限制酶及化学合成DNA片段的SynViP组装方法 | NA | 开发和优化植物病毒感染性克隆的组装技术 | 植物病毒感染性克隆的组装 | NA | NA | 同源重组克隆、IIS型限制酶、化学合成DNA片段 | NA | DNA | NA |
| 1328 | 2024-09-06 |
Glycosyltransferase engineering and multi-glycosylation routes development facilitating synthesis of high-intensity sweetener mogrosides
2022-Oct-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105222
PMID:36248741
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研究论文 | 本文报道了通过UDP-糖基转移酶（UGTs）工程和多糖基化途径开发，成功合成高强度甜味剂罗汉果苷V | 通过活性序列保守分析工程策略，将分支糖基化的催化效率提高了74-400倍，并提供了区域和键可控的多糖基化途径 | NA | 解决罗汉果苷V生物合成中多糖基化过程低效和不稳定的问题 | 罗汉果苷V的生物合成 | 代谢工程 | NA | UDP-糖基转移酶（UGTs）工程 | NA | NA | NA |
| 1329 | 2024-09-06 |
Heterologous Assembly of the Type VI Secretion System Empowers Laboratory Escherichia coli with Antimicrobial and Cell Penetration Capabilities
2022-10-11, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01305-22
PMID:36154120
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研究论文 | 本文通过异源组装Aeromonas dhakensis的T6SS系统，赋予实验室常用的大肠杆菌BL21(DE3)抗菌和细胞穿透能力 | 首次在非致病性宿主大肠杆菌中成功组装并展示了T6SS系统的功能，实现了蛋白质从细胞质到细胞质的传递 | T6SS系统的复杂结构和基因调控使其在非致病性宿主中的重建并非易事 | 研究T6SS系统在非致病性宿主中的组装及其功能 | Aeromonas dhakensis的T6SS系统和大肠杆菌BL21(DE3) | 合成生物学 | NA | 荧光显微镜和生化分析 | NA | NA | 一系列携带T6SS结构和效应基因的质粒(pT6S) |
| 1330 | 2024-09-06 |
DNA-assisted selective electrofusion (DASE) of Escherichia coli and giant lipid vesicles
2022-Oct-06, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d2nr03105a
PMID:36129323
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DNA辅助选择性电融合（DASE）的新技术，用于实现大肠杆菌和巨型脂质囊泡的选择性融合 | DASE技术结合了标准电融合的高效性和融合纳米结构的选择性，通过膜锚定的DNA结构将目标物体聚集在一起，并通过电脉冲触发其融合 | NA | 开发一种新的方法来实现细胞和脂质囊泡的选择性融合 | 大肠杆菌和巨型脂质囊泡 | 合成生物学 | NA | 电融合 | NA | 细胞 | NA |
| 1331 | 2024-09-06 |
From peptides to proteins: coiled-coil tetramers to single-chain 4-helix bundles
2022-Oct-05, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d2sc04479j
PMID:36320580
|
研究论文 | 本文探讨了从肽到蛋白质的设计，特别是从卷曲螺旋四聚体到单链4-螺旋束的设计规则 | 本文通过分析已知的反平行4-螺旋卷曲螺旋结构，推导出设计规则，并应用于合成肽的理性设计，最终形成单链4-螺旋束蛋白质 | 尽管本文提出了设计规则，但蛋白质折叠、组装和稳定的序列-结构关系仍不完全清楚 | 确定设计反平行4-螺旋束的通用和稳健的序列背景 | 反平行4-螺旋束蛋白质的设计规则 | 蛋白质设计 | NA | X射线晶体学 | NA | 蛋白质结构 | NA |
| 1332 | 2024-09-06 |
Engineering functional thermostable proteins using ancestral sequence reconstruction
2022-10, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2022.102435
PMID:36041629
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综述 | 本文综述了利用祖先序列重建工程化功能性耐热蛋白质的方法及其在工业化学、医学和合成生物学中的应用 | 利用生物信息学工具和序列数据，通过祖先序列重建生成高度稳定的折叠结构，为工业化学、医学和合成生物学中的新应用提供了可能性 | 理性设计方法需要结构信息，而即使使用先进的计算方法，也难以精确预测或参数化所有相关的结构因素 | 探讨通过祖先序列重建推断耐热蛋白质的成功因素及其对蛋白质稳定性决定因素的揭示 | 耐热蛋白质的工程化及其在工业、医学和合成生物学中的应用 | 生物工程 | NA | 祖先序列重建 | NA | 序列数据 | NA |
| 1333 | 2024-09-06 |
In vivo self-assembled siRNA as a modality for combination therapy of ulcerative colitis
2022-09-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33436-0
PMID:36171212
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研究论文 | 开发了一种合成生物学策略，利用小细胞外囊泡的自然循环系统与人工基因电路结合，使雄性小鼠肝脏自我组装多种siRNA并将其通过循环小细胞外囊泡进行体内递送，用于溃疡性结肠炎的联合治疗 | 首次利用小细胞外囊泡进行siRNA的体内递送，实现溃疡性结肠炎的多靶点联合治疗 | 仅在雄性小鼠模型中进行了验证，尚未在人类中进行临床试验 | 开发一种新的联合治疗策略，用于治疗溃疡性结肠炎 | 雄性小鼠的溃疡性结肠炎模型 | 合成生物学 | 溃疡性结肠炎 | siRNA递送 | NA | 基因表达数据 | 雄性小鼠 |
| 1334 | 2024-09-06 |
Discrimination of RNA fiber structures using solid-state nanopores
2022-May-16, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d1nr08002d
PMID:35441627
|
研究论文 | 本文利用固态纳米孔实验和布朗动力学模拟来表征和区分具有不同分支程度的RNA纤维结构 | 本文首次利用固态纳米孔技术来区分不同分支程度的RNA纤维结构，并发现分支更多的纤维在离子电流阻断方面表现出更长和更深的特征 | 本文仅在20-60°C的温度范围内进行了实验，未探讨更高或更低温度下的影响 | 开发新的实验工具来表征和区分不同RNA纤维结构 | 具有不同分支程度的RNA纤维结构 | 纳米生物技术 | NA | 固态纳米孔技术 | 布朗动力学模拟 | 离子电流阻断数据 | 多种RNA纤维结构 |
| 1335 | 2024-09-06 |
Catalysts for the Enzymatic Lipidation of Peptides
2022-05-03, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.2c00108
PMID:35442036
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综述 | 本文综述了F家族肽类前体转移酶在生物活性肽类药物中的应用及其结构功能特性 | 发现了不同类别的前体转移酶，具有多样化的受体残基特异性，扩展了酶促前体化肽底物的生物合成工具箱 | NA | 探讨F家族肽类前体转移酶的生物化学、结构功能和化学特性，以及其在合成生物学中的应用潜力 | F家族肽类前体转移酶及其在生物活性肽类药物中的应用 | 生物化学 | NA | 晶体结构分析 | NA | NA | NA |
| 1336 | 2024-09-05 |
Engineering artificial cross-species promoters with different transcriptional strengths
2025, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.08.003
PMID:39224149
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research paper | 本研究通过分析和验证自然内源启动子的基本结构，并通过策略性整合和合理修改启动子基序，开发了一系列在五种菌株（原核和真核）中具有转录活性的跨物种启动子 | 本研究提出了一种新的策略，即组合使用原核和真核启动子的关键元素，为未来的启动子工程提供了新的见解和方法 | NA | 扩大合成生物学启动子工具包的通用性，确保在各种微生物底盘细胞中的适应性和定制化 | 跨物种启动子的开发和验证 | synthetic biology | NA | NA | NA | NA | 五种菌株（原核和真核） |
| 1337 | 2024-09-05 |
Single-molecule force spectroscopy of toehold-mediated strand displacement
2024-Aug-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51813-9
PMID:39217165
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研究论文 | 本文利用单分子力谱技术结合微流控增强的光阱和粗粒度模拟，研究了基于脚手架介导的链置换（TMSD）的动态DNA纳米技术中的单分子水平动力学。 | 首次在单分子水平上实时观察和调控TMSD过程，并分析了DNA和RNA入侵的动力学差异。 | NA | 探索脚手架介导的链置换过程在单分子水平上的动力学特性。 | DNA和RNA的链置换过程。 | DNA纳米技术 | NA | 单分子力谱技术 | NA | NA | 数千次正反入侵事件 |
| 1338 | 2024-09-01 |
Highly flexible cell membranes are the key to efficient production of lipophilic compounds
2024-Aug, Journal of lipid research
IF:5.0Q1
DOI:10.1016/j.jlr.2024.100597
PMID:39029799
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综述 | 本文综述了利用细胞膜工程技术提高微生物细胞工厂生产脂溶性化合物效率的策略 | 提出了通过构建高度灵活的细胞膜来突破脂溶性化合物生产上限的有效策略 | 目前主要通过构建人工储存隔间和改造细胞膜结构来促进产品流出，仍存在挑战 | 探讨如何通过细胞膜工程技术提高脂溶性化合物的生产效率 | 脂溶性化合物的生产 | 合成生物学 | NA | 细胞膜工程技术 | NA | NA | NA |
| 1339 | 2024-09-05 |
Computational tools for plant genomics and breeding
2024-Aug, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2578-6
PMID:38676814
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研究论文 | 本文综述了植物基因组学和作物育种中计算工具的应用 | 文章介绍了基因组装、基因组注释、表观基因组分析和转录组分析等领域的最新进展 | NA | 探讨计算工具在植物基因组学和作物育种中的应用 | 植物基因组学和作物育种 | 生物信息学 | NA | 高通量测序、分子生物学、数据科学 | 深度学习 | 基因组数据 | NA |
| 1340 | 2024-09-05 |
Hydrogels as promising platforms for engineered living bacteria-mediated therapeutic systems
2022-Dec, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2022.100435
PMID:36164505
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综述 | 本文综述了水凝胶作为工程化活细菌介导治疗系统的平台设计策略及其在典型疾病治疗中的应用 | 水凝胶因其可调节的物理化学性质、良好的生物活性和对脆弱有效载荷的优异保护能力，在活细菌治疗传递中显示出巨大潜力 | 讨论了当前水凝胶基活细菌介导治疗策略的挑战和未来展望 | 总结水凝胶设计策略用于活细菌介导治疗，并回顾水凝胶基活细菌治疗剂在典型疾病治疗中的最新进展 | 水凝胶设计策略及其在消化健康、皮肤真菌感染、伤口愈合、疫苗和癌症治疗中的应用 | 生物材料科学 | NA | NA | NA | NA | NA |