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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
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1321 | 2025-10-05 |
Investigating the Effect of RNA Scaffolds on the Multicolor Fluorogenic Aptamer Pepper in Different Bacterial Species
2024-04-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00009
PMID:38593047
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研究论文 | 评估多色荧光适配体Pepper在不同细菌物种中的性能,并研究RNA支架对其荧光强度的影响 | 发现DF30-tRNA支架能使Pepper适配体荧光增强199倍,并实现活细胞中双色同时成像 | NA | 研究RNA支架对多色荧光适配体Pepper在不同细菌物种中荧光性能的影响 | 革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌和鼠伤寒沙门氏菌 | 合成生物学 | NA | 荧光成像 | NA | 荧光信号数据 | NA | RNA合成生物学工具 | 革兰氏阳性菌,革兰氏阴性菌,鼠伤寒沙门氏菌 | 多色荧光适配体Pepper, DF30-tRNA支架 | 工业生物技术,医学 |
1322 | 2025-10-05 |
Unraveling the potential of bioengineered microbiome-based strategies to enhance cancer immunotherapy
2025-Jul, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2025.128156
PMID:40158322
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综述 | 探讨生物工程化微生物组策略在增强癌症免疫治疗中的潜力 | 系统阐述通过合成生物学技术改造微生物组以增强免疫检查点抑制剂疗效的创新策略 | 存在遗传稳定性、肿瘤定植效率和安全控制等挑战 | 研究微生物组在癌症免疫治疗中的作用机制及工程化改造策略 | 胃肠道微生物组和肿瘤内细菌群体 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌Nissle 1917, 乳酸乳球菌, 双歧杆菌, 拟杆菌 | 生物传感器, 靶向递送系统 | 医学 |
1323 | 2025-10-05 |
Dynamic and Diverse Coacervate Architectures by Controlled Demembranization
2025-Apr-09, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c01526
PMID:40135632
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研究论文 | 本文提出了一种控制膜化凝聚体去膜化的策略,实现凝聚体结构的动态重构和功能调控 | 通过静电竞争机制实现凝聚体的可控去膜化,并创建具有双层和Janus-like不对称膜结构的凝聚体原细胞 | NA | 开发具有动态可重构膜结构的合成原细胞系统 | 膜化凝聚体液滴和去膜化凝聚体液滴 | 合成生物学 | NA | 去膜化技术、静电竞争机制 | NA | NA | NA | NA | NA | 膜化/去膜化动态重构系统、双层膜结构、Janus-like不对称膜结构 | 合成生物学, 系统生物学, 生物技术 |
1324 | 2025-10-05 |
Regulatory and Catalytic Domains of Poly(ADP-ribose) Polymerases Cross-Complement for DNA-Break-Dependent Allosteric Stimulation of Catalytic Activity
2025-03-21, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.4c00582
PMID:39935093
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研究论文 | 本研究探索了不同来源PARP酶的调控域和催化域之间的交叉互补功能 | 首次证明不同PARP同源物的调控域和催化域可形成功能性嵌合组装体 | 仅进行体外实验,尚未在活细胞中验证 | 研究PARP酶调控域和催化域的交叉互补机制 | 来自哺乳动物、植物和细菌的PARP酶结构域 | 合成生物学 | NA | 定性和定量酶活性测定、结合研究 | NA | 酶活性数据、结合亲和力数据 | 四种PARP酶(hPARP1、hPARP2、atPARP2、haPARP)的结构域 | 结构域组装 | NA | 嵌合PARP组装体 | 医学, 工业生物技术 |
1325 | 2025-10-05 |
Deep Neural Networks for Predicting Single-Cell Responses and Probability Landscapes
2023-08-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00203
PMID:37467372
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研究论文 | 开发基于深度神经网络的方法预测单细胞响应和概率景观 | 提出能够预测多模态动态的表达分布的网络架构,解决了传统方法对双稳态电路预测不准确的问题 | 基于计算模拟数据训练,需要更多实验验证;对级联电路需要更多历史数据 | 开发准确预测细胞响应的机器学习方法 | 单细胞基因表达动态和遗传电路 | 机器学习 | NA | 深度神经网络,计算模拟 | 深度神经网络 | 时间序列基因表达数据 | 计算模拟的单细胞响应数据 | NA | NA | 级联遗传电路,双稳态自激活电路 | 合成生物学 |
1326 | 2025-10-05 |
Functional characterization and regioselectivity manipulation of two Benzylisoquinoline alkaloids O-methyltransferases from Stephania yunnanensis
2025-Apr, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2025.108238
PMID:39922041
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研究论文 | 本研究从云南地不容中鉴定并表征了两个功能相同但系统发育不同的BIA 7OMTs,通过蛋白质工程成功调控了其区域选择性 | 通过定点突变操纵底物结合微环境,将SyOMT4转化为高特异性BIA 6OMT,将SyOMT5工程化为BIA NMTs | NA | 扩展BIA O-甲基转移酶的功能库,为药用重要BIAs的生产提供酶工具 | 云南地不容中的两个苯基异喹啉生物碱O-甲基转移酶SyOMT4和SyOMT5 | 合成生物学 | COVID-19 | 转录组分析、多序列比对、结构建模、定点诱变 | NA | 序列数据、结构数据 | NA | 定点诱变 | 植物 | 酶催化区域选择性调控 | 医药 |
1327 | 2025-10-05 |
Synthetic transcription factors establish the function of nine amino acid transactivation domains of Komagataella phaffii Mxr1
2025-Mar, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.108211
PMID:39855340
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研究论文 | 本研究通过构建合成转录因子系统性地表征了Komagataella phaffii酵母Mxr1转录因子中的9个氨基酸反式激活结构域的功能 | 首次在K. phaffii锌指转录因子中全面表征9aaTADs功能,发现其中10个具有活性并揭示其通过Gcn5介导的组蛋白乙酰化机制发挥作用 | 仅研究了Mxr1转录因子中的9aaTADs,其他类型转录因子的类似结构域功能尚未探索 | 阐明K. phaffii酵母Mxr1转录因子中多个9个氨基酸反式激活结构域的功能特性和作用机制 | Komagataella phaffii酵母Mxr1转录因子及其21个推测的9aaTADs | 合成生物学 | NA | 合成转录因子构建、基因敲除、功能互补实验 | NA | 基因表达数据、生长表型数据 | 21个推测的9aaTADs和1个已知TAD A | 合成转录因子设计 | Komagataella phaffii | 由Mxr1ZF DNA结合结构域与多个9aaTADs组合构成的合成转录因子系统 | 工业生物技术 |
1328 | 2025-04-09 |
Advancing microbial engineering through synthetic biology
2025-Mar, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2503100
PMID:40195840
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1329 | 2025-04-05 |
Editorial: Microbial co-cultures: a new era of synthetic biology and metabolic engineering, volume II
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1587450
PMID:40182290
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1330 | 2025-10-05 |
DNA Origami - Lipid Membrane Interactions Controlled by Nanoscale Sterics
2024-10, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202404720
PMID:39162223
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研究论文 | 本研究探讨了DNA纳米结构与脂质膜相互作用的立体效应控制机制 | 首次系统研究了DNA纳米结构锚点立体环境对膜相互作用的影响,揭示了局部纳米尺度形态比全局囊泡尺寸更关键的作用机制 | 研究仅针对四种特定立体环境,尚未涵盖所有可能的几何构型 | 阐明DNA纳米结构与双层膜相互作用的立体控制原理 | 具有不同立体环境膜锚点的3D DNA纳米结构和不同尺寸的膜囊泡 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术 | NA | 实验数据 | 四种不同立体环境的DNA纳米结构锚点 | DNA折纸技术 | NA | 膜相互作用控制系统 | 生物传感,诊断,合成生物学 |
1331 | 2025-10-05 |
Soft Synthetic Cells with Mobile Membrane Ligands for Ex Vivo Expansion of Therapy-Relevant T Cell Phenotypes
2024-09, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202401844
PMID:38751204
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研究论文 | 开发了一种基于液-液相分离液滴支撑脂质双层的软合成细胞技术,用于体外扩增治疗相关T细胞表型 | 首次将侧向配体流动性作为T细胞体外扩增技术设计的第三关键维度,并揭示了其在调节T细胞表型和激活中的重要作用 | NA | 开发更接近体内T细胞激活的体外扩增技术 | 治疗相关的T细胞表型,特别是调节性CD8 T细胞 | 合成生物学 | 免疫相关疾病 | 液-液相分离技术,脂质双分子层技术 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | 人工抗原呈递细胞设计 | 医学 |
1332 | 2025-10-05 |
Engineering Protocell Networks for Prototissue Development
2025-Apr-03, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202500376
PMID:40177794
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综述 | 探讨将原始细胞组装成原始组织的方法及其在模拟生物组织结构和功能方面的应用 | 系统总结了多种原始细胞模型的空间组织方法及其集体行为特征 | NA | 构建功能化原始组织系统以模拟生物组织的层次结构和复杂功能 | 脂质囊泡、聚合物囊泡、蛋白质体、无膜凝聚层和乳液滴等原始细胞模型 | 合成生物学 | NA | 化学和物理空间组织方法 | NA | NA | NA | NA | NA | 原始细胞网络 | 生物医学,再生医学 |
1333 | 2025-10-05 |
Polymerase-Based Signal Delay for Temporally Regulating DNA Involved Reactions, Programming Dynamic Molecular Systems, and Biomimetic Sensing
2024-08, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202400142
PMID:38676334
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研究论文 | 本研究开发了一种基于DNA聚合酶的信号延迟系统,用于调控DNA参与反应的时序行为 | 首次通过分子动力学模拟和荧光分析表征DNA聚合酶活性,开发了通过引物悬垂、抑制剂和模板长度调控信号延迟的新策略 | 信号延迟时间范围有限(10分钟至10分钟),在活细胞内的应用效果尚未验证 | 开发能够精确操控分子信号时序行为的仿生分子系统 | DNA聚合酶催化的引物延伸和DNA链置换反应 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟,荧光分析,等温DNA扩增 | NA | 分子模拟数据,荧光信号数据 | NA | DNA聚合酶,DNA模板设计 | 无细胞系统 | 信号延迟电路,动态分子信号系统,条形码检测系统 | 无细胞合成生物学,仿生传感 |
1334 | 2025-10-05 |
Synthetic Cells from Droplet-Based Microfluidics for Biosensing and Biomedical Applications
2024-08, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202400086
PMID:38563581
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综述 | 本文综述了基于液滴微流控技术制备合成细胞的方法及其在生物传感和生物医学领域的应用 | 系统整合微流控技术与自下而上合成生物学方法,实现从简单结构到高阶结构的可重复、可调控批量合成细胞构建 | NA | 探讨微流控技术在合成细胞制备及其生物医学应用中的研究进展 | 合成细胞(脂质体、聚合物囊泡、凝聚微滴和胶体体) | 合成生物学 | NA | 液滴微流控技术 | NA | NA | NA | 微流控芯片 | NA | 模拟天然细胞代谢、刺激响应、基因表达等功能的生物模拟系统 | 生物传感, 生物医学 |
1335 | 2025-10-05 |
Evolution and Impact of Imine Reductases (IREDs) Research: A Knowledge Mapping Approach
2025-Apr-02, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-025-01421-9
PMID:40172741
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研究论文 | 通过文献计量学和知识图谱方法分析亚胺还原酶(IREDs)研究的发展历程和研究格局 | 首次通过文献计量学方法对IREDs研究领域进行可视化分析,揭示该领域的发展轨迹和研究热点 | 仅基于Web of Science数据库的239篇文献进行分析,可能存在文献覆盖不全的局限 | 探索IREDs研究的整体格局和演进路径 | 2010-2024年间发表的239篇IREDs相关研究论文和综述 | 生物信息学 | NA | 文献计量分析、知识图谱构建 | NA | 文献数据 | 239篇研究论文和综述 | NA | NA | NA | 医药 |
1336 | 2025-10-05 |
[Preface for special issue on AI-driven biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250197
PMID:40170303
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前言 | 本期特刊聚焦人工智能驱动的生物制造领域,综述其发展机遇、挑战与现状,并展望未来发展趋势 | 探讨系统生物学与合成生物学快速发展背景下,生物大数据和信息技术与生物技术的深度融合 | NA | 把握人工智能驱动生物制造的创新发展,为促进该领域技术创新和产业发展提供参考 | 生物制造领域的技术方法和发展趋势 | 生物制造 | NA | 系统生物学、合成生物学、人工智能技术 | NA | 生物大数据 | NA | NA | NA | 生物部件、电路和人工细胞的智能设计与构建 | 工业生物技术 |
1337 | 2025-10-05 |
Engineering Material Properties of Transcription Factor Condensates to Control Gene Expression in Mammalian Cells and Mice
2024-09, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202311834
PMID:38573961
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研究论文 | 通过调控转录因子凝聚物的材料性质来控制哺乳动物细胞和小鼠中的基因表达 | 首次系统研究转录因子凝聚物材料性质对基因表达的影响,发现液态凝聚物增强基因表达而固态凝聚物抑制基因表达 | NA | 探索生物分子凝聚物材料性质对基因表达调控的影响机制 | 哺乳动物细胞和小鼠模型中的转录因子凝聚物 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 基因表达数据 | NA | 光遗传学 | 哺乳动物细胞, 小鼠 | 转录因子凝聚物调控系统 | 医学, 合成生物学 |
1338 | 2025-10-05 |
Poplar transformation with variable explant sources to maximize transformation efficiency
2025-01-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-81235-y
PMID:39779752
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研究论文 | 本研究通过比较杨树不同外植体来源的再生和转化效率,探索提高植物遗传转化效率的新途径 | 首次系统比较杨树地上和地下器官外植体的再生能力与转化效率,发现根外植体具有显著再生潜力,并通过转录组分析揭示了相关基因表达机制 | 研究仅针对杨树这一木本多年生生物能源作物,结果可能不适用于其他植物物种 | 提高植物遗传转化效率,最大化植物材料利用率 | 杨树的不同外植体类型(叶、茎、叶柄和根) | 合成生物学 | NA | 农杆菌介导的植物转化、转录组分析 | NA | 基因表达数据、转录组数据、形态观察数据 | 杨树的四种不同外植体类型 | 农杆菌介导转化 | 杨树 | NA | 能源, 工业生物技术 |
1339 | 2025-10-05 |
Scaling-up molecular logic to meso-systems via self-assembly
2025-Mar-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58379-0
PMID:40148329
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研究论文 | 通过自组装将分子逻辑计算扩展到介观系统,展示膜结构可作为Reset-Set触发器并集成其他逻辑元件 | 首次实现人工分子基介观系统本征执行逻辑运算,将分子逻辑计算扩展到连续尺寸范围 | NA | 开发能够在介观尺度执行逻辑运算的分子自组装系统 | 环芳烃八羧酸盐和阳离子表面活性剂的自组装系统 | 合成生物学 | NA | 自组装技术 | Reset-Set触发器,逻辑元件 | NA | NA | NA | NA | Reset-Set触发器集成7个逻辑元件 | 生物学,合成生物学 |
1340 | 2025-10-05 |
The Transformation Experiment of Frederick Griffith I: Its Narrowing and Potential for the Creation of Novel Microorganisms
2025-Mar-20, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering12030324
PMID:40150788
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研究论文 | 本文探讨了Frederick Griffith转化实验的演变过程及其在创造新型微生物方面的潜力 | 分析了经典转化实验设计从考虑结构和控制信息到仅关注蛋白质合成指导信息的演变过程 | 未提供具体的实验数据验证转化在创造新型微生物中的实际应用潜力 | 研究转化实验方法在合成生物学中创造新型微生物的潜力 | 肺炎球菌转化实验及其演变 | 合成生物学 | NA | 基因组转化技术 | NA | 文献分析 | NA | NA | 肺炎球菌 | NA | 工业生物技术 |