合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1361	2024-09-06	DNA-assisted selective electrofusion (DASE) of Escherichia coli and giant lipid vesicles 2022-Oct-06, Nanoscale IF:5.8Q1 DOI:10.1039/d2nr03105a PMID:36129323	研究论文	本文介绍了一种名为DNA辅助选择性电融合（DASE）的新技术，用于实现大肠杆菌和巨型脂质囊泡的选择性融合	DASE技术结合了标准电融合的高效性和融合纳米结构的选择性，通过膜锚定的DNA结构将目标物体聚集在一起，并通过电脉冲触发其融合	NA	开发一种新的方法来实现细胞和脂质囊泡的选择性融合	大肠杆菌和巨型脂质囊泡	合成生物学	NA	电融合	NA	细胞	NA
1362	2024-09-06	From peptides to proteins: coiled-coil tetramers to single-chain 4-helix bundles 2022-Oct-05, Chemical science IF:7.6Q1 DOI:10.1039/d2sc04479j PMID:36320580	研究论文	本文探讨了从肽到蛋白质的设计，特别是从卷曲螺旋四聚体到单链4-螺旋束的设计规则	本文通过分析已知的反平行4-螺旋卷曲螺旋结构，推导出设计规则，并应用于合成肽的理性设计，最终形成单链4-螺旋束蛋白质	尽管本文提出了设计规则，但蛋白质折叠、组装和稳定的序列-结构关系仍不完全清楚	确定设计反平行4-螺旋束的通用和稳健的序列背景	反平行4-螺旋束蛋白质的设计规则	蛋白质设计	NA	X射线晶体学	NA	蛋白质结构	NA
1363	2024-09-06	Engineering functional thermostable proteins using ancestral sequence reconstruction 2022-10, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2 DOI:10.1016/j.jbc.2022.102435 PMID:36041629	综述	本文综述了利用祖先序列重建工程化功能性耐热蛋白质的方法及其在工业化学、医学和合成生物学中的应用	利用生物信息学工具和序列数据，通过祖先序列重建生成高度稳定的折叠结构，为工业化学、医学和合成生物学中的新应用提供了可能性	理性设计方法需要结构信息，而即使使用先进的计算方法，也难以精确预测或参数化所有相关的结构因素	探讨通过祖先序列重建推断耐热蛋白质的成功因素及其对蛋白质稳定性决定因素的揭示	耐热蛋白质的工程化及其在工业、医学和合成生物学中的应用	生物工程	NA	祖先序列重建	NA	序列数据	NA
1364	2024-09-06	In vivo self-assembled siRNA as a modality for combination therapy of ulcerative colitis 2022-09-28, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-022-33436-0 PMID:36171212	研究论文	开发了一种合成生物学策略，利用小细胞外囊泡的自然循环系统与人工基因电路结合，使雄性小鼠肝脏自我组装多种siRNA并将其通过循环小细胞外囊泡进行体内递送，用于溃疡性结肠炎的联合治疗	首次利用小细胞外囊泡进行siRNA的体内递送，实现溃疡性结肠炎的多靶点联合治疗	仅在雄性小鼠模型中进行了验证，尚未在人类中进行临床试验	开发一种新的联合治疗策略，用于治疗溃疡性结肠炎	雄性小鼠的溃疡性结肠炎模型	合成生物学	溃疡性结肠炎	siRNA递送	NA	基因表达数据	雄性小鼠
1365	2024-09-06	Discrimination of RNA fiber structures using solid-state nanopores 2022-May-16, Nanoscale IF:5.8Q1 DOI:10.1039/d1nr08002d PMID:35441627	研究论文	本文利用固态纳米孔实验和布朗动力学模拟来表征和区分具有不同分支程度的RNA纤维结构	本文首次利用固态纳米孔技术来区分不同分支程度的RNA纤维结构，并发现分支更多的纤维在离子电流阻断方面表现出更长和更深的特征	本文仅在20-60°C的温度范围内进行了实验，未探讨更高或更低温度下的影响	开发新的实验工具来表征和区分不同RNA纤维结构	具有不同分支程度的RNA纤维结构	纳米生物技术	NA	固态纳米孔技术	布朗动力学模拟	离子电流阻断数据	多种RNA纤维结构
1366	2024-09-06	Catalysts for the Enzymatic Lipidation of Peptides 2022-05-03, Accounts of chemical research IF:16.4Q1 DOI:10.1021/acs.accounts.2c00108 PMID:35442036	综述	本文综述了F家族肽类前体转移酶在生物活性肽类药物中的应用及其结构功能特性	发现了不同类别的前体转移酶，具有多样化的受体残基特异性，扩展了酶促前体化肽底物的生物合成工具箱	NA	探讨F家族肽类前体转移酶的生物化学、结构功能和化学特性，以及其在合成生物学中的应用潜力	F家族肽类前体转移酶及其在生物活性肽类药物中的应用	生物化学	NA	晶体结构分析	NA	NA	NA
1367	2024-09-05	Engineering artificial cross-species promoters with different transcriptional strengths 2025, Synthetic and systems biotechnology IF:4.4Q1 DOI:10.1016/j.synbio.2024.08.003 PMID:39224149	research paper	本研究通过分析和验证自然内源启动子的基本结构，并通过策略性整合和合理修改启动子基序，开发了一系列在五种菌株（原核和真核）中具有转录活性的跨物种启动子	本研究提出了一种新的策略，即组合使用原核和真核启动子的关键元素，为未来的启动子工程提供了新的见解和方法	NA	扩大合成生物学启动子工具包的通用性，确保在各种微生物底盘细胞中的适应性和定制化	跨物种启动子的开发和验证	synthetic biology	NA	NA	NA	NA	五种菌株（原核和真核）
1368	2024-09-05	Single-molecule force spectroscopy of toehold-mediated strand displacement 2024-Aug-31, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-51813-9 PMID:39217165	研究论文	本文利用单分子力谱技术结合微流控增强的光阱和粗粒度模拟，研究了基于脚手架介导的链置换（TMSD）的动态DNA纳米技术中的单分子水平动力学。	首次在单分子水平上实时观察和调控TMSD过程，并分析了DNA和RNA入侵的动力学差异。	NA	探索脚手架介导的链置换过程在单分子水平上的动力学特性。	DNA和RNA的链置换过程。	DNA纳米技术	NA	单分子力谱技术	NA	NA	数千次正反入侵事件
1369	2024-09-01	Highly flexible cell membranes are the key to efficient production of lipophilic compounds 2024-Aug, Journal of lipid research IF:5.0Q1 DOI:10.1016/j.jlr.2024.100597 PMID:39029799	综述	本文综述了利用细胞膜工程技术提高微生物细胞工厂生产脂溶性化合物效率的策略	提出了通过构建高度灵活的细胞膜来突破脂溶性化合物生产上限的有效策略	目前主要通过构建人工储存隔间和改造细胞膜结构来促进产品流出，仍存在挑战	探讨如何通过细胞膜工程技术提高脂溶性化合物的生产效率	脂溶性化合物的生产	合成生物学	NA	细胞膜工程技术	NA	NA	NA
1370	2024-09-05	Computational tools for plant genomics and breeding 2024-Aug, Science China. Life sciences DOI:10.1007/s11427-024-2578-6 PMID:38676814	研究论文	本文综述了植物基因组学和作物育种中计算工具的应用	文章介绍了基因组装、基因组注释、表观基因组分析和转录组分析等领域的最新进展	NA	探讨计算工具在植物基因组学和作物育种中的应用	植物基因组学和作物育种	生物信息学	NA	高通量测序、分子生物学、数据科学	深度学习	基因组数据	NA
1371	2024-09-05	Hydrogels as promising platforms for engineered living bacteria-mediated therapeutic systems 2022-Dec, Materials today. Bio DOI:10.1016/j.mtbio.2022.100435 PMID:36164505	综述	本文综述了水凝胶作为工程化活细菌介导治疗系统的平台设计策略及其在典型疾病治疗中的应用	水凝胶因其可调节的物理化学性质、良好的生物活性和对脆弱有效载荷的优异保护能力，在活细菌治疗传递中显示出巨大潜力	讨论了当前水凝胶基活细菌介导治疗策略的挑战和未来展望	总结水凝胶设计策略用于活细菌介导治疗，并回顾水凝胶基活细菌治疗剂在典型疾病治疗中的最新进展	水凝胶设计策略及其在消化健康、皮肤真菌感染、伤口愈合、疫苗和癌症治疗中的应用	生物材料科学	NA	NA	NA	NA	NA
1372	2024-09-05	Efficient assembly of long DNA fragments and multiple genes with improved nickase-based cloning and Cre/loxP recombination 2022-10, Plant biotechnology journal IF:10.1Q1 DOI:10.1111/pbi.13882 PMID:35767383	研究论文	本文开发了一种基于独特核苷酸序列引导的核酸内切酶（UNiE）介导的DNA组装（UNiEDA）策略，用于高效克隆长DNA片段和多基因堆叠	UNiEDA方法简化了DNA组装过程，提高了效率，降低了成本	NA	开发高效工具以满足功能基因组学、合成生物学和代谢工程中对长DNA片段或多基因构建体的需求	长DNA片段和多基因构建体的克隆与组装	合成生物学	NA	核酸内切酶（nickases）和Cre/loxP重组	NA	DNA序列	涉及野生烟草（Nicotiana benthamiana）和转基因水稻（Oryza sativa）的生物合成验证
1373	2024-09-05	Implanted synthetic cells trigger tissue angiogenesis through de novo production of recombinant growth factors 2022-09-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2207525119 PMID:36095208	研究论文	研究报告了通过基因编码产生促血管生成因子的合成细胞（SCs）在小鼠体内触发新生血管化的生理过程	利用合成细胞自主生产生物药物，激活体内生理过程，为治疗提供新平台	NA	探索合成细胞在医学领域的应用，特别是其在促进组织血管化方面的潜力	合成细胞及其在促进小鼠新生血管化中的作用	合成生物学	NA	合成细胞技术	NA	蛋白质	小鼠
1374	2024-09-05	Biosynthesis of plant hemostatic dencichine in Escherichia coli 2022-09-19, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-022-33255-3 PMID:36123371	研究论文	本文通过逆向生物合成方法设计人工合成途径，在埃希氏菌中实现了植物止血药丹参素的从头合成	首次通过合成生物学方法在异源系统中实现了丹参素的可持续生产	NA	探索并实现丹参素的异源生物合成	丹参素及其前体物质的生物合成途径	合成生物学	NA	逆向生物合成	NA	NA	最终产量达到1.29 g/L，产率为0.28 g/g甘油
1375	2024-09-05	A Framework for the Systematic Selection of Biosensor Chassis for Environmental Synthetic Biology 2022-09-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.2c00079 PMID:35961652	研究论文	本文提出了一种概念框架，用于系统选择环境合成生物学中的生物传感器底盘	本文识别了底盘开发的生态、代谢和遗传限制，并提出了一个系统选择环境生物传感器底盘的概念框架	模型底盘生物在环境条件下的持久性较差，而适应环境的非模型生物则面临遗传不可操作性和部件不可用等挑战	旨在为环境合成生物学中的生物传感器底盘选择提供一个前进的方向	环境合成生物学中的生物传感器底盘	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
1376	2024-09-05	Method for reproducible automated bacterial cell culture and measurement 2022, Synthetic biology (Oxford, England) DOI:10.1093/synbio/ysac013 PMID:36101862	研究论文	本文介绍了一种使用实验室自动化系统进行可重复微生物培养的方法	该方法包括自动液体处理、自动板密封和解封、自动培养和生长测量	NA	旨在提高微生物细胞培养的可重复性	微生物细胞培养	合成生物学	NA	实验室自动化系统	NA	实验数据	150次自动微生物生长实验
1377	2024-09-05	Paeoniflorin in Paeoniaceae: Distribution, influencing factors, and biosynthesis 2022, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2022.980854 PMID:36119574	综述	本文综述了芍药苷在毛茛科植物中的分布、影响因素及其生物合成途径	提供了芍药苷生物合成后修饰途径的新见解，并为未来的进一步分析提出了方向	对芍药苷生物合成途径的了解有限，限制了通过合成生物学生产芍药苷	探讨如何更好地开发和利用毛茛科植物中的芍药苷	芍药苷在毛茛科植物中的分布及其影响因素	NA	NA	NA	NA	NA	NA
1378	2024-09-05	Harnessing synthetic biology for sustainable biomining with Fe/S-oxidizing microbes 2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2 DOI:10.3389/fbioe.2022.920639 PMID:36131722	综述	本文综述了利用合成生物学增强铁/硫氧化微生物在生物采矿中的应用及其未来研究方向	利用合成生物学技术改进铁/硫氧化微生物，以解决传统生物采矿过程中的长处理时间、低回收率和金属选择性问题	生物采矿存在处理时间长、回收率低和金属选择性差的问题	探索合成生物学在生物采矿中的应用，以提高其效率和商业应用潜力	铁/硫氧化微生物	生物技术	NA	合成生物学	NA	NA	NA
1379	2024-09-04	Synthetic biology toolkit of Ralstonia eutropha (Cupriavidus necator) 2024-Aug-29, Applied microbiology and biotechnology IF:3.9Q2 DOI:10.1007/s00253-024-13284-2 PMID:39207499	review	本文综述了用于改造和增强Ralstonia eutropha（Cupriavidus necator）生物生产能力的合成生物学技术	开发了一个合成生物学工具包，允许用户友好设计，赋予R. eutropha新能力，用于新颖应用	NA	旨在通过合成生物学技术增强R. eutropha的生物生产能力	Ralstonia eutropha（Cupriavidus necator）	NA	NA	合成生物学技术	NA	NA	NA
1380	2024-09-04	Wuhan Sequence-Based Recombinant Antigens Expressed in E. coli Elicit Antibodies Capable of Binding with Omicron S-Protein 2024-Aug-20, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms25169016 PMID:39201702	研究论文	本文研究了基于武汉序列的重组抗原在E. coli中表达，并能引发与Omicron S蛋白结合的抗体	首次证明这些重组抗原能诱导产生与Omicron变种S蛋白相互作用的抗体，并展示了合成生物学方法在开发高度交叉反应疫苗中的潜力	NA	开发交叉反应疫苗，以应对SARS-CoV-2的持续变异和新变种的出现	重组冠状病毒抗原及其免疫原性	疫苗学	冠状病毒感染	细菌表达系统	NA	蛋白质	小鼠