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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-11-27 |
Methyltransferase Detection Based on Target-Responsive Transcription Amplification of Light-Up Aptamer
2025-Nov-26, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c05886
PMID:41296341
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研究论文 | 开发了一种基于靶标响应转录扩增的甲基转移酶检测新方法 | 利用光激活适配体的转录扩增技术实现甲基转移酶的高灵敏检测,并具备逻辑门控功能 | 未提及实际临床样本验证数据 | 开发高灵敏度和特异性的DNA甲基转移酶检测方法 | DNA甲基转移酶(Dam和M. SssI MTase) | 合成生物学 | NA | 转录扩增技术、光激活适配体检测 | NA | 荧光信号数据 | NA | NA | NA | 基于甲基化响应开关的转录调控电路,具备逻辑门功能 | 生物医学 |
| 122 | 2025-11-27 |
Dietary Saponins as Antiaging Agents: A Systematic Review of Molecular Mechanisms, Nutritional Intervention, and Product Development
2025-Nov-25, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12207
PMID:41288460
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综述 | 系统综述膳食皂苷通过分子机制、结构-活性关系和产品开发实现抗衰老作用的研究进展 | 首次系统总结膳食皂苷通过多种信号通路(Nrf2/HO-1、PI3K/Akt等)实现抗衰老的分子机制,并提出通过合成生物学和纳米封装技术优化生物活性结构的未来研究方向 | 未涉及具体临床实验数据,主要基于现有基础研究进行系统性总结 | 探讨膳食皂苷作为抗衰老剂的作用机制和产品开发 | 来源于多种植物的膳食皂苷 | 营养学与抗衰老研究 | 衰老及相关疾病 | 系统综述方法 | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医药,食品 |
| 123 | 2025-11-27 |
Cellulase secretion by engineered Pseudomonas putida enables growth on cellulose oligomers
2025-Nov-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-025-13617-9
PMID:41291027
|
研究论文 | 本研究通过工程化改造恶臭假单胞菌使其分泌纤维素酶,实现在纤维素寡聚物上的生长 | 首次在恶臭假单胞菌中实现非天然纤维素酶的功能性分泌,并鉴定了最优的双精氨酸转运酶分泌信号肽 | 仅测试了纤维素寡聚物(纤维三糖和纤维四糖)作为碳源,未验证对天然纤维素聚合物的完全降解能力 | 开发恶臭假单胞菌作为合成生物学平台,用于从低品位原料进行化学合成 | 恶臭假单胞菌及其工程改造菌株 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工程、酶分泌技术 | NA | 微生物生长数据、酶活性数据 | 工程化恶臭假单胞菌菌株 | 合成生物学工具 | 恶臭假单胞菌 | 纤维素酶分泌系统,包含双精氨酸转运酶分泌信号肽 | 工业生物技术,能源 |
| 124 | 2025-11-27 |
Engineering Artificial Mitochondria with Self-Amplifying Proton Generation for Autonomous Energy Supply and Metabolic Coupling in Artificial Cells
2025-Nov-24, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202514980
PMID:41030094
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研究论文 | 本研究开发了一种模拟线粒体功能的人工ATP纳米发电机,通过酶促级联反应实现自主能量供应 | 设计了具有自增强质子生成功能的人工线粒体,实现了跨膜质子梯度的稳定维持和高效ATP合成 | NA | 为人工细胞构建持续自主的能量供应系统 | 人工线粒体、人工细胞模型 | 合成生物学 | NA | 酶共区室化、纳米胶囊封装、脂质体构建 | NA | NA | NA | Gibson Assembly | NA | 自增强酶促级联回路:葡萄糖氧化酶-过氧化氢酶协同作用放大质子生成 | 合成生物学、生物能源 |
| 125 | 2025-11-27 |
A Chromosomally Integrated T7 RNA Polymerase Enables T7-Derived Expression in Salmonella enterica without Compromising Virulence
2025-11-18, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2509.09023
PMID:41260602
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研究论文 | 本研究通过染色体整合T7 RNA聚合酶,成功开发了可在鼠伤寒沙门氏菌中实现T7表达系统功能且不影响其毒力的工程菌株 | 首次在鼠伤寒沙门氏菌中实现染色体整合的T7 RNA聚合酶系统,解决了该病原菌无法使用T7表达工具的难题 | 研究仅针对鼠伤寒沙门氏菌特定菌株14028s,未验证在其他沙门氏菌株中的适用性 | 开发适用于沙门氏菌的T7兼容表达系统,用于病原菌研究和生物技术应用 | 鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella enterica serovar Typhimurium)菌株14028s | 合成生物学 | 细菌感染性疾病 | pGRG36转座子系统,染色体整合技术 | NA | 细菌生长数据,毒力实验数据 | 工程菌株与野生型菌株的比较研究 | pGRG36 transposon system | Salmonella enterica | lac启动子控制的T7 RNA聚合酶表达系统,IPTG诱导型异源蛋白表达 | 医学, 合成生物学 |
| 126 | 2025-11-27 |
A membrane-driven biochemical oscillator tunable by the volume to surface area ratio
2025-Nov-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.14.688573
PMID:41292784
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研究论文 | 提出并建模了一种基于膜磷脂浓度动态变化的质量守恒生化振荡器 | 利用膜反应维度缩减效应实现几何可调的生化振荡,无需转录翻译机制 | 计算模拟为主,需要实验验证;低V/A比时酶动力学设计规则较为严格 | 开发几何可编程的合成生物学定时模块 | 膜驱动的生化振荡系统 | 合成生物学 | NA | 质量作用反应动力学、反应扩散模拟 | 确定性振荡器模型、随机模拟 | 计算模拟数据 | NA | NA | 无细胞系统 | 膜定位振荡器、自组装三聚体耦合系统 | 合成生物学、生物工程 |
| 127 | 2025-11-27 |
Innovative insights into gut microbiota modulation in colorectal cancer: From microbial dysbiosis to therapeutic strategies
2025-Nov-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v17.i11.108747
PMID:41281485
|
综述 | 探讨肠道微生物群失调在结直肠癌发病机制和进展中的作用及相应治疗策略 | 系统阐述微生物代谢产物与宿主尿素循环等通路在肿瘤发生中的相互作用,并提出基于合成生物学的工程益生菌等创新疗法 | 未具体说明研究中涉及的样本规模和临床验证数据 | 解析肠道微生物群在结直肠癌中的作用机制并开发新型治疗策略 | 结直肠癌相关的肠道微生物群落及其代谢产物 | NA | 结直肠癌 | 微生物组分析、代谢组学 | NA | 微生物组数据、代谢物数据 | NA | 合成生物学 | 工程益生菌 | 微生物调控回路 | 医学 |
| 128 | 2025-11-27 |
NMR-guided rational exploration of co-factors in boosting the Pfu DNA polymerase
2025-Nov, Magnetic resonance letters
DOI:10.1016/j.mrl.2025.200218
PMID:41278258
|
研究论文 | 本研究利用NMR技术指导探索能够增强Pfu DNA聚合酶性能的辅助因子 | 开发了一种不依赖结构数据或生物信息学的NMR引导方法,利用酶活性位点作为探针筛选辅助因子 | 方法验证仅使用了Tween-20作为模型系统,需要进一步在不同酶系统中验证普适性 | 优化DNA聚合酶的热稳定性和持续性,提升其性能 | Pfu DNA聚合酶及其辅助因子 | 合成生物学 | NA | 核磁共振(NMR)光谱技术 | NA | 蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 129 | 2025-11-27 |
A pipeline for screening small molecule-enhanced protein stability in a bacterial orphan receptor
2025-Nov, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.70330
PMID:41074865
|
研究论文 | 本研究开发了一种筛选小分子增强细菌孤儿受体蛋白稳定性的流程,并以CU228转录因子为模型系统进行验证 | 建立了结合生物信息学分析、差示扫描荧光法、微流控调制光谱和饱和转移差示NMR的多技术联用流程,成功识别出三种能显著提高孤儿PAS蛋白稳定性的小分子配体 | 研究仅使用了约760种化合物的片段库,可能未覆盖所有潜在配体;配体亲和力处于微摩尔级别,属于片段水平结合 | 开发筛选小分子配体的方法,用于表征和工程化孤儿PAS蛋白 | 来自Candidatus Solibacter usitatus的CU228转录因子(PAS-HTH型) | 合成生物学 | NA | 差示扫描荧光法, 微流控调制光谱, 饱和转移差示NMR, 生物信息学分析 | NA | 蛋白质结构数据, 热稳定性数据, 光谱数据 | 约760种化合物片段库,鉴定出3种有效配体 | NA | NA | NA | 生物技术, 合成生物学 |
| 130 | 2025-11-27 |
Yohimban acetylation in Rauvolfia is mediated by a leaf-specific acetyltransferase in reserpine biosynthetic gene cluster
2025-Oct-30, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110714
PMID:41289712
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研究论文 | 本研究鉴定并表征了萝芙木中负责育亨宾乙酰化的叶片特异性乙酰转移酶YAT | 首次发现位于利血平生物合成基因簇中的叶片特异性乙酰转移酶YAT,揭示了育亨宾生物代谢中先前未知的分支点 | NA | 阐明萝芙木中单萜吲哚生物碱生物合成的酶学基础和进化动态 | 萝芙木中的育亨宾O-乙酰转移酶(YAT)及其在育亨宾生物碱代谢中的作用 | 合成生物学 | NA | 同源建模、底物对接实验 | NA | 基因表达数据、酶活性数据 | NA | NA | 萝芙木 | 利血平生物合成基因簇 | 医药 |
| 131 | 2025-11-27 |
Phenylpropanoid methyl esterase unlocks catabolism of aromatic biological nitrification inhibitors
2025-Jan-02, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wraf251
PMID:41230824
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研究论文 | 本研究发现了微生物降解芳香族硝化抑制剂苯丙烷类甲酯的新途径 | 鉴定了一种先前未知的苯丙烷类甲酯降解微生物途径,并发现两种新型酶包括新鉴定的苯丙烷甲酯酶 | 仅初步揭示了微生物降解途径,对土壤中抑制剂降解的整体理解仍需进一步研究 | 研究微生物对芳香族硝化抑制剂的降解机制 | 苯丙烷类甲酯(一类芳香族硝化抑制剂)及其降解微生物 | 合成生物学 | NA | 转录组学、高通量功能基因组学、遗传分析、生化分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、生化数据 | NA | 基因转移 | 细菌 | 苯丙烷类甲酯降解途径 | 农业、环境 |
| 132 | 2025-11-26 |
Spontaneous Formation of Oil-Rich Polymer-Only Droplet Interface Bilayers Assembled from PB-PEO Block Copolymers
2025-Nov-25, Langmuir : the ACS journal of surfaces and colloids
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acs.langmuir.5c03308
PMID:41223304
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研究论文 | 本研究报道了由PB-PEO嵌段共聚物自发形成的纯聚合物液滴界面双层膜(pDIBs)的制备与表征 | 首次实现了无需磷脂、外部偏压或共溶剂的纯聚合物液滴界面双层膜的自发形成,其膜电阻和疏水厚度显著优于传统脂质膜 | 研究仅针对PB-PEO嵌段共聚物和两种烃类油,尚未探索更广泛的聚合物和油相体系 | 开发新型聚合物膜系统以克服传统脂质膜的机械脆弱性和组成限制 | 聚丁二烯-聚环氧乙烷(PB-PEO)两亲性嵌段共聚物在烃油中形成的界面膜 | 合成生物学 | NA | 界面张力测定法、电生理学、成像技术 | NA | 物理化学测量数据、电生理记录、图像数据 | NA | NA | NA | 仿生离子传导膜系统 | 合成生物学, 仿生材料, 组织工程 |
| 133 | 2025-11-26 |
Advances in Producing Health-Promoting Punicic Acid: From Extraction Technologies to Cutting-Edge Biotechnology Innovations
2025-Nov-24, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12722
PMID:41284366
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综述 | 本文综述了从传统提取到生物技术创新生产石榴酸的进展,重点讨论了提高产量和纯度的策略 | 系统比较了微波、超声、酶法和超临界流体等新型提取技术,并介绍了通过合成生物学在植物和微生物中调控脂肪酸谱以促进石榴酸积累的前沿方法 | 未提供具体实验数据验证不同提取技术的效率比较,微生物生产优化的具体路径尚未详细阐述 | 探索提高石榴酸产量和纯度的生产技术,推动其在功能食品中的应用 | 石榴酸及其生产技术和生物合成途径 | 生物技术 | NA | 微波辅助提取、超声辅助提取、酶法提取、超临界流体提取、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物、微生物 | 脂肪酸谱调控通路 | 食品、工业生物技术 |
| 134 | 2025-11-26 |
Creating a novel halotolerant whole-cell biosensor for efficient degradation and precise quantification of p-nitrophenol-substituted organophosphate pesticides in hypersaline ecosystems
2025-Nov-24, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.118240
PMID:41285662
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研究论文 | 本研究开发了一种新型耐盐全细胞生物传感器,用于高盐生态系统中对硝基酚取代有机磷农药的高效降解和精确定量 | 首次构建了耐盐全细胞生物传感器,通过动态调控PobR表达水平显著降低背景荧光,并创建了兼具降解和检测功能的双功能生物传感器 | 仅对pNP取代的有机磷农药具有特异性,对非pNP取代的有机磷农药如毒死蜱无响应 | 开发适用于高盐环境的有机磷农药检测和降解技术 | 对硝基酚取代的有机磷农药(如甲基对硫磷和杀螟硫磷) | 合成生物学 | NA | 合成生物学、生物传感器构建、HPLC分析 | NA | 荧光信号、浓度检测数据 | 海水、高盐度河水和盐碱土壤样品 | 质粒构建、启动子工程 | Halomonas cupida J9 | pNP响应转录调节因子PobR及其同源启动子与GFP报告基因融合的生物传感电路 | 环境 |
| 135 | 2025-11-26 |
Light-controlled synthetic communication networks via paired connexon nanopores
2025-Nov-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66621-y
PMID:41274894
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研究论文 | 本研究通过工程化连接蛋白通道在脂质体合成细胞间建立了光控通信网络 | 首次设计出UV和近红外光响应的连接蛋白通道,实现合成细胞间正交信号分子的波长依赖性传输 | 仅验证了反应性信号分子的传输,尚未测试更复杂的生物分子或体内应用 | 在基于脂质体的合成细胞中模拟生物细胞间的通信网络 | 连接蛋白43和连接蛋白32工程化通道及脂质体合成细胞 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、脂质体组装、光控技术 | NA | 实验数据 | NA | 蛋白质工程 | 脂质体合成细胞 | 光控连接蛋白纳米孔通信网络,包含UV响应和近红外响应的正交通道 | 合成生物学、生物技术 |
| 136 | 2025-11-26 |
PIONEER: A Periplasmic Display Platform for Synthetic Biology-Based Screening of Genetically Encoded Protein Regulators
2025-Nov-20, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110967
PMID:41274507
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研究论文 | 开发了一种名为PIONEER的酵母周质展示平台,用于筛选和研究基因编码的蛋白质调控因子 | 通过优化分泌信号和展示支架,实现了稳定的配体保留和强大的自分泌信号传导,能够通过信号传导而非单纯结合来评估配体活性 | 虽然以GPCRs为例进行了演示,但平台对其他膜蛋白和可溶性蛋白靶标的适应性需要进一步验证 | 开发合成生物学筛选平台,用于研究基因编码的蛋白质调控因子 | 肽段、蛋白质、纳米抗体和人类G蛋白偶联受体 | 合成生物学 | NA | 周质展示技术、自分泌信号检测 | NA | 蛋白质活性数据、信号传导数据 | NA | 合成生物学平台 | 酿酒酵母 | 膜近端周质空间定位系统、信号传导检测系统 | 医学、工业生物技术 |
| 137 | 2025-11-26 |
Biofortified Bacteria: The Role of Selenium-Enriched Microorganisms in Enhancing Animal Selenium Uptake-A Review
2025-Nov, Journal of animal physiology and animal nutrition
IF:2.2Q1
DOI:10.1111/jpn.70001
PMID:40674621
|
综述 | 探讨富硒微生物作为新型有机硒补充策略在畜禽营养中的应用潜力 | 提出利用基因工程改造的富硒细菌作为可持续的有机硒补充新途径 | 菌株选择、发酵工艺、生物安全性、监管合规和长期饲喂试验效果验证等关键挑战尚未完全解决 | 研究富硒微生物在改善动物硒营养状况中的应用 | 家禽和反刍动物 | NA | NA | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 模块化遗传电路 | 细菌 | 硒响应生物传感器、可控生物转化途径 | 农业, 生物医学, 环境修复 |
| 138 | 2025-11-26 |
Light-Controlled Synthetic Communication Networks via Paired Connexon Nanopores
2025-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.11.648033
PMID:40291719
|
研究论文 | 本研究通过工程化连接蛋白通道在合成细胞间构建光控通信网络 | 开发了对UV和近红外光响应的连接蛋白通道,实现波长依赖的正交信号分子传递 | NA | 在脂质体合成细胞中模拟生物细胞间的通信网络 | 连接蛋白43和连接蛋白32通道 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、脂质体组装 | NA | NA | NA | 蛋白质工程 | 合成细胞(脂质体) | 光控连接蛋白通道网络,正交信号传递系统 | 合成生物学、生物技术 |
| 139 | 2025-11-25 |
Unveiling the landscape of prokaryotic global regulators through deep protein language models
2025-Nov-24, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00950-25
PMID:41283681
|
研究论文 | 利用深度蛋白质语言模型系统性地绘制了原核生物全局调控因子的全景图谱 | 开发了基于深度学习的大规模全局调控因子识别框架,能够发现传统方法无法检测的远程同源物和新型调控因子 | 研究中包含76,113个功能未知的蛋白质,其生物学意义有待进一步验证 | 系统探索原核生物全局调控因子的多样性和进化动态 | 14,800个细菌和古菌型菌株基因组中的全局调控因子 | 机器学习 | NA | 蛋白质语言模型、深度学习 | 深度学习模型 | 蛋白质序列、基因组数据 | 14,800个原核生物型菌株基因组,74,872个经过整理的全局调控因子序列 | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 140 | 2025-11-25 |
Development of new Thermus thermophilus-Escherichia coli shuttle vectors
2025-Nov-24, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.02102-25
PMID:41283684
|
研究论文 | 开发了基于温泉栖热菌新型质粒的Thermus thermophilus-Escherichia coli穿梭载体系统 | 发现了五种含新型复制蛋白的质粒,其中两个含毒素-抗毒素样模块可显著增强质粒稳定性 | NA | 开发适用于Thermus thermophilus的稳定穿梭载体系统 | Thermus thermophilus菌株及其质粒 | 合成生物学 | NA | 质粒构建、定量PCR、基因克隆 | NA | 基因组数据、质粒稳定性数据 | 从日本濑波温泉分离的Thermus thermophilus菌株中的五种质粒 | Gibson Assembly, 质粒克隆 | Therthermophilus, Escherichia coli | 木聚糖利用途径(13 kbp)分割重建 | 工业生物技术 |