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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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121 | 2025-06-06 |
Catalytic mechanism and engineering of aromatic prenyltransferase: A review
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144214
PMID:40379159
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review | 本文系统总结了芳香族异戊二烯基转移酶的催化机制及其工程化改造的最新进展 | 提出了整合人工智能和深度学习的创新工程方法,以开发高性能生物催化剂 | 当前面临的挑战包括催化活性不足、底物特异性狭窄以及多酶级联系统和固定化技术的限制 | 指导芳香族异戊二烯基转移酶在合成生物学和药物创新中的工程化与规模化应用 | 芳香族异戊二烯基转移酶及其工程化改造 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、人工智能、深度学习 | NA | NA | NA |
122 | 2025-06-06 |
A path to perpetual chemical synthesis via photocatalytic cofactor regeneration
2025-May-23, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d5sc02770e
PMID:40453794
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Perspective | 本文探讨了通过光催化辅因子再生实现可持续化学合成的路径 | 结合光催化和生物催化的独特能力,通过辅因子穿梭实现精细化学品的持续生产 | 讨论了集成系统的现有限制以及缓解这些限制的努力 | 探索利用太阳能进行可持续化学合成的方法 | 光催化辅因子再生与自然酶循环的整合 | 化学合成 | NA | 光催化、生物催化 | NA | NA | NA |
123 | 2025-06-06 |
Protocol for the generation and purification of minicells from Lactiplantibacillus plantarum
2025-May, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2412002
PMID:40468658
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研究论文 | 本文介绍了一种从植物乳杆菌中生成和纯化微型细胞的方案 | 开发了在植物乳杆菌中生成微型细胞的新方法,扩展了微型细胞平台的应用范围 | 目前仅在植物乳杆菌中进行了验证,尚未在其他益生菌中测试 | 开发一种安全有效的微型细胞生产平台用于生物技术应用 | 植物乳杆菌(Lactiplantibacillus plantarum)及其微型细胞 | 合成生物学 | NA | 质粒介导的同源重组、差异离心和过滤、DAPI染色 | NA | 显微镜图像和流式细胞术数据 | NA |
124 | 2025-06-06 |
[Advances in the regulation of microbial cell metabolism and environmental adaptation]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240937
PMID:40170316
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综述 | 本文从三个角度全面综述了细胞代谢和环境适应的调控机制及其在合成生物学中的应用 | 系统性地总结了细胞感知代谢和环境变化的机制及其应用,为合成生物学领域的创新提供了理论基础 | 缺乏对细胞代谢和环境适应调控机制的系统性综述 | 探讨细胞代谢和环境适应的调控机制及其在合成生物学中的应用 | 细胞的代谢和环境适应机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
125 | 2025-06-06 |
Plant-based secondary metabolites as natural remedies: a comprehensive review on terpenes and their therapeutic applications
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1587215
PMID:40458805
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综述 | 本文全面综述了植物次生代谢产物萜类化合物的生物化学特性、植物化学性质及其在代谢紊乱中的药理活性 | 详细阐述了萜类化合物的多样性和广泛生物活性,以及其在现代医学、制药、营养品和化妆品等领域的高价值应用 | 对特定生物活性物质的作用或作用模式理解不全面,且许多化合物在自然界中含量极低 | 阐明萜类化合物在代谢紊乱中的生物化学特性、植物化学性质和药理活性 | 萜类化合物 | NA | 代谢紊乱 | 代谢工程和合成生物学 | NA | NA | NA |
126 | 2025-06-06 |
Application of bifidobacterium in tumor therapy
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1551924
PMID:40469191
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review | 本文综述了双歧杆菌在肿瘤成像和治疗中的最新进展,探讨了其作用机制、工程策略和临床应用 | 利用双歧杆菌的厌氧特性选择性定植于肿瘤缺氧微环境,并通过合成生物学和细菌工程改造为微型机器人,用于分子成像和药物/基因递送 | 双歧杆菌的临床转化仍面临功能设计优化、治疗效果和安全性提升等挑战 | 探索双歧杆菌作为肿瘤靶向治疗载体的潜力 | 双歧杆菌(Bifidobacterium, BBM) | 肿瘤治疗 | 肿瘤 | 合成生物学、细菌工程 | NA | NA | NA |
127 | 2025-06-06 |
Rewiring native post-transcriptional global regulators to achieve designer, multi-layered genetic circuits
2024-10-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52976-1
PMID:39384772
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研究论文 | 本文开发了一种通过重编程大肠杆菌的碳储存调控网络(Csr Network)来实现复杂转录后控制的方法 | 利用Csr Network的天然相互作用建立转录后逻辑门,实现复杂的细菌调控,并构建了12种BUFFER Gates和Csr调控的NOT Gate | NA | 开发可编程的转录后调控工具,用于合成生物学 | 大肠杆菌的碳储存调控网络(Csr Network) | 合成生物学 | NA | RNA-蛋白质相互作用工程 | BUFFER Gates, NOT Gate | NA | NA |
128 | 2025-06-06 |
A single mutation in the core domain of the lac repressor reduces leakiness
2013-Jul-08, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/1475-2859-12-67
PMID:23834731
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research paper | 该研究通过单点突变降低lac阻遏蛋白的泄漏表达,优化其在蛋白质过表达和合成生物学中的应用 | 发现色氨酸220突变为苯丙氨酸可显著降低lac阻遏蛋白的泄漏表达,同时保持对IPTG的响应性 | 研究仅针对单一突变位点,未全面探索其他可能影响泄漏表达的突变 | 优化lac阻遏蛋白的调控性能,减少其在异源蛋白表达中的泄漏表达 | lac阻遏蛋白及其突变体 | 分子生物学 | NA | 饱和诱变、GFP表达检测、热位移分析 | NA | 蛋白质表达数据 | 未明确说明具体样本数量 |
129 | 2025-06-05 |
Crucial roles of intracellular cyclic di-GMP in impacting the genes important for extracellular electron transfer by Geobacter metallireducens
2025-Jun-04, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00727-25
PMID:40464557
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研究论文 | 研究细胞内c-di-GMP在Geobacter metallireducens细菌胞外电子传递(EET)中的作用 | 揭示了细胞内c-di-GMP对细菌胞外电子传递过程中多个基因表达的调控作用,包括细胞色素和菌毛蛋白PilA-N的基因 | c-di-GMP如何影响这些基因表达的具体机制尚不清楚 | 探究细胞内c-di-GMP在细菌胞外电子传递中的调控作用 | Geobacter metallireducens细菌 | 微生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 基因表达数据 | 3种不同c-di-GMP水平的菌株(Gme-H, Gme-C, Gme-L) |
130 | 2025-06-03 |
Correction to "Synthetic Biology-Based Bacterial Extracellular Vesicles Displaying BMP-2 and CXCR4 to Ameliorate Osteoporosis"
2025-Jun, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70095
PMID:40452467
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
131 | 2025-06-04 |
Super-robust synthetic microorganism can get chlorine resistance in advance and transfer their inserted DNA sequence in genome to indigenous bacteria in water
2025-Aug-01, Water research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.watres.2025.123594
PMID:40188791
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研究论文 | 研究探讨了超级稳健合成微生物在水环境中的DNA序列转移能力及其对氯的抵抗机制 | 首次发现超级稳健合成微生物能够将插入的DNA序列转移给土著细菌,并展示出比野生型细菌更强的氯抵抗能力 | 研究未全面评估超级稳健合成微生物在更复杂环境中的长期生态影响 | 探究超级稳健合成微生物在水环境中的行为及其对人类健康的潜在风险 | 超级稳健合成微生物及其与土著细菌的相互作用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas基因编辑 | NA | 实验数据 | 未明确说明样本数量,但涉及超级稳健合成微生物和野生型细菌的比较研究 |
132 | 2025-06-04 |
Bridging chemistry and biology for light-driven new-to-nature enantioselective photoenzymatic catalysis
2025-Jun-03, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs00561a
PMID:40351234
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教程综述 | 本文综述了光驱动酶催化领域的基本原理和策略,旨在介绍这一新兴的跨学科研究方向 | 结合光激发的高反应性与生物催化的高选择性,探索新型对映选择性光酶催化系统 | 未提及具体实验数据或案例研究的局限性 | 推动可持续不对称合成的发展 | 光酶催化系统 | 合成生物学 | NA | 光催化与酶催化协同 | NA | NA | NA |
133 | 2025-06-04 |
Biochemical and structural characterization of chlorite dismutase enzyme from Pseudomonas aeruginosa
2025-Jun-03, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70151
PMID:40458033
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研究论文 | 本研究对铜绿假单胞菌中的氯酸歧化酶进行了生化和结构表征 | 首次报道了铜绿假单胞菌中二聚体氯酸歧化酶的高分辨率晶体结构及其催化机制 | 未探讨该酶在实际环境修复应用中的效果 | 研究氯酸歧化酶在环境污染物降解中的应用 | 铜绿假单胞菌中的氯酸歧化酶 | 生物化学 | NA | X射线晶体学 | NA | 蛋白质结构数据 | NA |
134 | 2025-06-04 |
Guns 'N Roses: Fungal Volatile Warfare in Postharvest Disease Control
2025-Jun-02, Annual review of phytopathology
IF:9.1Q1
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review | 该文章综述了真菌挥发性有机化合物在采后病害控制中的作用及其应用 | 探讨了挥发性有机化合物(VOCs)在生物防治中的关键作用,以及通过定向诱变和合成生物学增强VOC生产剂的潜力 | 未提及具体实验数据或案例研究来支持理论观点 | 研究采后病害的生物防治方法,减少对合成杀菌剂的依赖 | 真菌挥发性有机化合物及其在采后病害控制中的应用 | 生物防治 | 采后病害 | 定向诱变、合成生物学、人工智能在分析化学中的应用 | NA | NA | NA |
135 | 2025-06-04 |
Fusions of Catalytically Inactive RusA to FokI Nuclease Coupled with PNA Enable Programmable Site-Specific Double-Stranded DNA Breaks
2025-May-27, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c11282
PMID:40454070
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research paper | 本研究开发了一种名为PC-FIRA的系统,结合了肽核酸(PNA)的序列特异性结合能力和FokI核酸酶与结构引导的失活RusA解离酶的融合体,实现了精确的双链DNA断裂 | PC-FIRA系统无需现有位点特异性核酸酶和结构引导核酸酶的限制,实现了高靶标特异性和切割效率 | 需要精确的反应条件和适用性验证 | 开发一种新型的位点特异性双链DNA断裂系统,用于基因组编辑 | 双链DNA | 基因组编辑 | NA | PNA耦合技术 | NA | DNA序列 | 多种DNA结构(如Holliday连接体、线性和环状DNA) |
136 | 2025-06-04 |
Developing a multi-modular assembled prime editing (mPE) system improved precise multi-base insertion efficiency in dicots
2025-May, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.06.021
PMID:38942381
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研究论文 | 本研究开发了一种多模块组装的prime editing (mPE)系统,显著提高了双子叶植物中多碱基插入的精确编辑效率 | 提出多模块组装的mPE系统,相比原始PE2系统,在多个基因位点上实现了1.3至1288.5倍的编辑效率提升,尤其擅长多碱基插入(平均提升197.9倍) | 研究仅针对双子叶模式植物拟南芥和本氏烟草,尚未验证在其他植物中的适用性 | 解决prime editing在双子叶植物中效率低下的问题,开发系统性优化方案 | 拟南芥(Arabidopsis thaliana)和本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 植物合成生物学 | NA | 农杆菌介导转化、深度扩增子测序(20-50万clean reads) | 多模块组装prime editing系统(mPE) | 基因组测序数据 | 大规模转化实验(具体数量未明确说明) |
137 | 2025-06-04 |
Exploring potential biosafety implications in DNA information storage
2025-Apr, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2025.03.006
PMID:40453469
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research paper | 该研究评估了五种代表性DNA存储编码方法在生物安全性方面的风险,分析了它们与自然生物DNA的序列相似性 | 首次系统评估了DNA信息存储技术中人工合成DNA序列的生物安全风险,并提出了随机化策略以降低潜在风险 | 研究仅评估了五种编码方法,可能无法涵盖所有DNA存储技术的生物安全风险 | 探索DNA信息存储技术的生物安全影响 | 五种DNA存储编码方法(Church、Goldman、DNA Fountain、Grass和MT编码) | 合成生物学 | NA | Kraken2分类、BLASTn比对分析 | NA | DNA序列数据 | 五种代表性DNA存储编码方法产生的序列 |
138 | 2025-06-03 |
A cell-free biosensor signal amplification circuit with polymerase strand recycling
2025-Jun, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01816-w
PMID:39806069
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研究论文 | 本文介绍了一种名为聚合酶链回收(PSR)的无细胞生物传感器信号放大电路,该电路利用T7 RNA聚合酶的脱靶转录在DNA链置换电路中回收核酸输入 | 开发了PSR电路,通过T7 RNA聚合酶的脱靶转录实现核酸输入的回收,提高了生物传感器的灵敏度 | 未提及具体局限性 | 扩展无细胞生物传感技术的能力,提高生物传感器的灵敏度 | 无细胞系统中的基因电路和生物传感器 | 合成生物学 | NA | 聚合酶链回收(PSR),DNA链置换电路 | NA | 核酸 | NA |
139 | 2025-06-03 |
Synthetic Biocatalysis in Erythrocyte Microreactors for Gasotransmitter H2S Production and Vessel Vasodilation
2025-Jun-01, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202502208
PMID:40451735
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研究论文 | 该研究开发了一种能够长时间产生硫化氢(H₂S)用于治疗性血管舒张的红细胞微反应器 | 通过将PLP-PLys复合物封装到红细胞中,创建了一种新型的合成生物催化微反应器系统,实现了持续可控的H₂S生成 | 仅进行了体外实验验证,尚未进行体内研究 | 开发用于心血管治疗的气体递质递送平台 | 红细胞微反应器及其在血管舒张中的应用 | 合成生物学与生物工程 | 心血管疾病 | 低渗膨胀法封装技术 | NA | 生物化学数据、荧光成像数据 | 体外实验使用分离的胸主动脉环 |
140 | 2025-06-03 |
Integrated study on the genome, transcriptome, and metabolome of Gelsemium elegans and mining of related enzyme genes involved in koumine biosynthesis
2025-May-24, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110069
PMID:40450816
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研究论文 | 本文对钩吻的基因组、转录组和代谢组进行了综合研究,并挖掘了与钩吻碱生物合成相关的酶基因 | 首次对钩吻的基因组进行测序和组装,并构建了全面的转录组cDNA文库,鉴定了29种生物碱,并验证了两个候选基因在钩吻碱生物合成中的功能 | 钩吻碱的生物合成途径研究较少,理解不足,限制了通过育种或合成生物学提高钩吻碱产量的能力 | 研究钩吻中钩吻碱的生物合成途径 | 钩吻(Gelsemium elegans) | 合成生物学 | NA | PacBio测序、液相色谱-质谱技术 | NA | 基因组、转录组、代谢组数据 | 不同组织和激素处理的钩吻样本 |