合成生物学相关文章
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当前共找到 3069 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-04-24 |
Comparative Analysis of Codon Optimization Tools: Advancing toward a Multi-Criteria Framework for Synthetic Gene Design
2025-Apr-10, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2411.11066
PMID:40223268
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研究论文 | 本文对广泛使用的密码子优化工具进行了全面的比较分析，提出了一种多标准框架用于合成基因设计 | 揭示了不同密码子优化工具在序列设计和聚类模式上的显著差异，并提出了一个整合CAI、GC含量、mRNA折叠能量和密码子对考虑的多标准框架 | 研究仅评估了、和CHO细胞中的工业相关靶蛋白，可能不适用于其他宿主系统 | 比较不同密码子优化工具的性能，并推进合成基因设计的多标准框架 | 工业相关靶蛋白在、和CHO细胞中的表达 | 合成生物学 | NA | 密码子优化 | NA | 基因序列数据 | 多个工业相关靶蛋白在三种不同细胞系中的评估 |
| 122 | 2025-04-24 |
Engineering carbon assimilation in plants
2025-Apr, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13825
PMID:39783795
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review | 本文综述了植物碳同化工程的最新进展，包括合成生物学、基因工程、代谢途径优化和人工智能在提高光合效率中的应用 | 探讨了通过改进RuBisCO或引入替代途径来提高碳固定效率的创新方法 | RuBisCO的低动力学效率、低底物特异性和高温度敏感性限制了碳固定通量 | 优化植物碳同化过程以提高光合效率 | 植物、藻类和蓝细菌的碳同化机制 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、基因工程、代谢途径优化、人工智能 | NA | NA | NA |
| 123 | 2025-04-24 |
Synthetic Biology Strategies and Tools to Modulate Photosynthesis in Microbes
2025-Mar-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26073116
PMID:40243859
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综述 | 本文综述了利用合成生物学策略和工具调控微生物光合作用的最新进展 | 总结了通过合成生物学增强光能吸收、优化电子传递链和改善碳同化的策略，并提出了AI辅助代谢工程、合成微生物群落和下一代光生物反应器设计等潜在解决方案 | 需要进一步研究以完善遗传策略和开发可扩展的生产系统 | 提高光合微生物的光合效率以解决全球资源短缺和污染问题 | 蓝藻和微藻 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、AI辅助代谢工程 | NA | NA | NA |
| 124 | 2025-04-24 |
New strategies to study in depth the metabolic mechanism of astaxanthin biosynthesis in Phaffia rhodozyma
2025-Mar, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2344578
PMID:38797672
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综述 | 本文综述了虾青素在法夫酵母中生物合成的代谢机制及其提高产量的策略 | 提出了包括组学、基因组编辑、蛋白质结构活性分析和合成生物学在内的前沿方法，以深入理解虾青素合成机制并提高产量 | 当前对虾青素合成的复杂代谢调控机制理解仍不全面，关键基因的具体功能、双功能酶的作用机制以及代谢流的调控需要进一步研究 | 深入理解虾青素的生物合成代谢机制并探索提高其产量的新策略 | 法夫酵母中的虾青素生物合成 | 合成生物学 | NA | 组学、基因组编辑、蛋白质结构-活性分析、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 125 | 2025-04-24 |
Self-pigmenting textiles grown from cellulose-producing bacteria with engineered tyrosinase expression
2025-Mar, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02194-3
PMID:38565971
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research paper | 研究通过基因工程改造细菌生产自着色纤维素纺织品 | 通过基因工程使细菌表达酪氨酸酶，生产自着色纤维素纺织品，并结合光遗传学工具实现基因表达的模式化 | 未提及大规模生产的成本或效率问题 | 开发可持续的纺织品染色方法 | 细菌纤维素（BC）和基因工程改造的Komagataeibacter rhaeticus菌株 | 合成生物学 | NA | 基因工程、光遗传学 | NA | NA | NA |
| 126 | 2025-04-24 |
Antibacterial activity and biosynthetic potential of Streptomyces sp. PBR19, isolated from forest rhizosphere soil of Assam
2024-Dec, Brazilian journal of microbiology : [publication of the Brazilian Society for Microbiology]
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s42770-024-01454-3
PMID:38985434
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研究论文 | 研究从印度阿萨姆邦Pobitora野生动物保护区的森林根际土壤中分离出的Streptomyces sp. PBR19的抗菌活性和生物合成潜力 | 发现PBR19可能是一个新的分类单元，并展示了其对ESKAPE病原体的显著抗菌活性，以及含有与抗生素合成相关的PKS type II基因 | 研究仅针对有限的病原体进行了测试，且未进行体内实验验证抗菌效果 | 探索森林根际土壤中放线菌的抗菌潜力及其在药物开发中的应用 | Streptomyces sp. PBR19及其抗菌活性 | 微生物学 | 细菌感染 | 扫描电子显微镜(SEM)、基因测序 | NA | 微生物样本、基因数据 | 单一分离菌株PBR19 |
| 127 | 2025-04-24 |
Combining systems and synthetic biology for in vivo enzymology
2024-Nov, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00251-w
PMID:39322757
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研究论文 | 本文提出了一种结合合成生物学和系统生物学的方法，用于在体内测量酶学参数 | 开发了一种通用的体内酶学参数测量方法，克服了传统体外实验条件与生理条件不符的局限性 | 目前仅应用于酵母合成类胡萝卜素途径中的特定酶类 | 开发一种在真实细胞条件下测量酶动力学参数的新方法 | 酿酒酵母中的合成类胡萝卜素途径（重点关注植烯合酶和三种植烯去饱和酶） | 合成生物学 | NA | 代谢组学、通量组学和蛋白质组学 | NA | 多组学数据 | 一组经过基因改造的酵母菌株（通过操纵GGPP合酶表达来模拟底物浓度变化） |
| 128 | 2025-04-23 |
Making Cells as a "Nirvana Phoenix": Precise Coupling of Precursors Prior to ROS Bursts for Intracellular Synthesis of Quantum Dots
2025-Apr-21, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c02861
PMID:40259718
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research paper | 该研究开发了一种在活细胞内精确合成近红外量子点（QDs）的方法，通过控制前体耦合和抑制ROS爆发，显著提高了细胞存活率和荧光强度 | 提出了一种细胞适应性硒代胱氨酸（(Cys-Se)）还原为生物相容性低价硒前体的策略，并通过与Ag-谷胱甘肽（AgSG）的及时耦合，实现了细胞内近红外AgSe QDs的高效合成，同时抑制了细胞毒性Se物种和ROS的产生 | NA | 探索在活细胞内高效合成无机纳米晶体（如量子点）的方法，以用于细胞标记和生物成像 | 活细胞内的无机纳米晶体合成 | 合成生物学 | NA | 细胞内量子点合成技术 | NA | 荧光成像数据 | NA |
| 129 | 2025-04-23 |
Angle-controllable RNA tiles for programable array assembly and RNA sensing
2025-Apr-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58938-5
PMID:40253384
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research paper | 本文介绍了一种新型人工设计的RNA瓦片，通过整合反平行交叉和T型连接，实现了65度或90度的可控角度，并探索了22种不同的瓦片，显著扩展了人工设计多链RNA瓦片的集合 | 引入了一种新型RNA瓦片设计方法，通过整合反平行交叉和T型连接实现角度可控，并成功将split broccoli RNA适配体整合到多链单体瓦片中，实现了可编程RNA传感 | NA | 开发具有定制特性和功能性的RNA纳米结构生物材料 | 人工设计的RNA瓦片及其自组装阵列 | 分子工程 | NA | RNA纳米技术 | NA | NA | 22种不同的RNA瓦片 |
| 130 | 2025-04-23 |
Synthesis as an Expanding Resource in Human Milk Science
2021-08-04, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.1c05599
PMID:34296874
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research paper | 本文探讨了合成化学在人类母乳科学中的应用，特别是均质人乳寡糖（HMOs）的合成及其在动物研究中的规模化应用 | 提出了合成化学在解决HMOs获取难题中的创新方法，包括化学、化学酶法和合成生物学等多种途径 | 未提及具体的合成效率或成本问题，也未详细说明动物研究的具体结果 | 推动人类母乳科学中HMOs的合成研究，以支持更深入的生物学功能研究 | 人乳寡糖（HMOs）及其合成方法 | 合成化学 | NA | 化学合成、化学酶法、合成生物学 | NA | 化学结构数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 131 | 2025-04-23 |
Tetracycline-controllable artificial microRNA-HOTAIR + EZH2 suppressed the progression of bladder cancer cells
2017-Jul-25, Molecular bioSystems
DOI:10.1039/c7mb00202e
PMID:28671703
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research paper | 研究探讨了EZH2在膀胱癌细胞中的生物学功能，并构建了一种四环素可控的人工microRNA-HOTAIR + EZH2系统来抑制膀胱癌细胞的进展 | 构建了四环素可控的人工microRNA-HOTAIR + EZH2系统，能够以剂量依赖方式降低HOTAIR和EZH2的表达，并抑制膀胱癌细胞的增殖和迁移 | EZH2在膀胱癌组织中的表达与TNM分期和不良预后无关的具体机制未明确 | 探究EZH2在膀胱癌细胞中的生物学功能并开发新的治疗方法 | 膀胱癌细胞 | 合成生物学 | 膀胱癌 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 132 | 2025-04-23 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
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research paper | 该研究展示了通过可编程基因可用性定时在生物传感器电路中实现数字切换的新方法 | 利用位点特异性重组酶通过可编程定时控制基因可用性，显著提高了多基因电路的稳健性和动态范围 | NA | 改进合成生物学中基因电路的稳健性和性能 | 内源性microRNA的比例传感器和多基因电路 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 133 | 2025-04-22 |
Genome-wide exploration: Evolution, structural characterization, molecular docking, molecular dynamics simulation and expression analysis of sugar transporter (ST) gene family in potato (Solanum tuberosum)
2025-Aug, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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research paper | 该研究对马铃薯中的糖转运蛋白（ST）基因家族进行了全基因组探索，包括进化、结构特征、分子对接、分子动力学模拟和表达分析 | 首次在马铃薯中鉴定了61个StSTs基因，并进行了详细的分类、结构分析和表达模式研究，同时通过分子对接和动力学模拟验证了其功能 | 研究主要基于计算和体外实验，缺乏体内功能验证实验 | 探究马铃薯中糖转运蛋白基因家族的特征及其在糖转运和积累中的作用 | 马铃薯（Solanum tuberosum）中的糖转运蛋白（ST）基因家族 | 植物分子生物学 | NA | 分子对接、分子动力学模拟、RNA-seq分析 | 3D蛋白质建模 | 基因组数据、表达数据 | 61个StSTs基因 |
| 134 | 2025-04-22 |
RmZHD Surface-Displayed Escherichia coli for High Efficiency and Low-Cost Degradation of Zearalenone
2025-Apr-21, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.4c01994
PMID:40080174
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research paper | 该研究构建了一种表面展示RmZHD的工程化大肠杆菌，用于高效低成本降解玉米赤霉烯酮（ZEN）及其衍生物 | 利用合成生物学和表面展示方法构建的工程菌无需额外操作即可展示RmZHD，且生产成本低，能高效降解ZEN及其衍生物 | 未明确提及工程菌在实际工业环境中的长期稳定性及大规模应用时的潜在问题 | 开发一种环保且适用于工业规模处理ZEN污染的生物降解方法 | 玉米赤霉烯酮（ZEN）及其衍生物（如玉米赤霉酮、β-玉米赤霉醇等） | 合成生物学 | NA | 表面展示技术、合成生物学方法 | NA | NA | NA（未明确说明实验样本量） |
| 135 | 2025-04-22 |
Genome Reduction Improves Recombinant Benzoxazole Production in Myxococcus xanthus
2025-Apr-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00114
PMID:40257411
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研究论文 | 本研究探讨了基因组缩减对粘球菌生物技术性能的影响，特别是对重组苯并恶唑生产的影响 | 通过连续移除生物合成基因簇（BGCs）来优化重组天然产物的产量，并发现某些BGCs的组合消除是不可行的，而单独删除是可能的 | 研究仅针对粘球菌，未涉及其他生物体，且BGCs的组合消除耐受性机制尚不明确 | 研究基因组缩减对粘球菌生物技术性能的影响，以提高重组天然产物的产量 | 粘球菌（Myxococcus xanthus）及其生物合成基因簇（BGCs） | 合成生物学 | NA | 基因组缩减技术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 136 | 2025-04-22 |
Development and construction of a novel Bacillus subtilis autoinducible extracellular expression system based on a LuxI/R device
2025-Apr-19, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02719-8
PMID:40251612
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研究论文 | 开发了一种基于LuxI/R型群体感应系统的新型枯草芽孢杆菌自诱导胞外表达系统 | 首次通过改造感应模块启动子SPluxI序列和响应模块启动子RPluxIR6的lux盒拷贝数，增强了lux系统在枯草芽孢杆菌中的自诱导表达 | NA | 开发高效的枯草芽孢杆菌自诱导胞外表达系统，用于重组蛋白的工业生产 | 枯草芽孢杆菌和LuxI/R型群体感应系统 | 合成生物学 | NA | 群体感应系统（QS）、启动子工程、发酵 | NA | NA | 摇瓶和3-L发酵罐发酵 |
| 137 | 2025-04-22 |
Machine learning-led semi-automated medium optimization reveals salt as key for flaviolin production in Pseudomonas putida
2025-Apr-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08039-2
PMID:40251395
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研究论文 | 本文介绍了一种基于机器学习的半自动化培养基优化方法，显著提高了恶臭假单胞菌中黄酮醇的产量 | 提出了一种分子和宿主无关的主动学习过程，用于培养基优化，并通过可解释的人工智能技术发现盐是影响产量的关键因素 | 未明确说明该方法在其他微生物或化学物质生产中的适用性 | 优化培养基以提高恶臭假单胞菌中黄酮醇的产量 | 恶臭假单胞菌KT2440 | 合成生物学 | NA | 机器学习，半自动化流程 | 主动学习 | 实验数据 | 三个不同的黄酮醇生产实验 |
| 138 | 2025-04-21 |
Current application and future prospects of CRISPR-Cas in lactic acid Bacteria: A review
2025-May, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.116315
PMID:40253208
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综述 | 本文综述了CRISPR-Cas系统在乳酸菌工程中的当前应用及未来前景 | 探讨了CRISPR-Cas系统在乳酸菌基因组编辑、代谢工程和合成生物学中的革命性应用及其在食品科学中的创新潜力 | 当前基因组编辑工具耗时且劳动密集型，限制了乳酸菌作为发酵食品功能增强剂的潜力开发 | 利用CRISPR-Cas系统推动乳酸菌研究及食品科学创新 | 乳酸菌（LABs） | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA |
| 139 | 2025-04-21 |
Molecular and biochemical insights from natural and engineered photosynthetic endosymbiotic systems
2025-Apr-18, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2025.102598
PMID:40252292
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综述 | 本文综述了光合内共生系统的分子和生化特征，重点关注内共生体和宿主在进化过程中的分子变化 | 讨论了自然存在的光合内共生系统与现代叶绿体的共同特征，并探讨了实验室工程内共生的尝试及其意义 | 未提及具体实验数据的局限性，更多是理论探讨 | 探讨光合内共生系统的进化特征及其在合成生物学中的应用 | 线粒体、叶绿体等内共生体及其宿主细胞 | 进化生物学与合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2025-04-21 |
Engineering electrogenetic interfaces for mammalian cell control
2025-Apr-17, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2025.01.003
PMID:39879984
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研究论文 | 本文概述了设计直接电遗传接口以控制治疗工程哺乳动物细胞行为的努力 | 提出了电遗传学这一新兴概念，通过电子设备产生的电子编程活细胞内的电子响应生物单元 | 未提及具体实验数据或样本量，可能缺乏实证支持 | 探索如何设计电遗传接口以控制哺乳动物细胞行为，用于治疗工程 | 治疗工程哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 电遗传学 | NA | NA | NA |