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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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121 | 2025-06-04 |
Developing a multi-modular assembled prime editing (mPE) system improved precise multi-base insertion efficiency in dicots
2025-May, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.06.021
PMID:38942381
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研究论文 | 本研究开发了一种多模块组装的prime editing (mPE)系统,显著提高了双子叶植物中多碱基插入的精确编辑效率 | 提出多模块组装的mPE系统,相比原始PE2系统,在多个基因位点上实现了1.3至1288.5倍的编辑效率提升,尤其擅长多碱基插入(平均提升197.9倍) | 研究仅针对双子叶模式植物拟南芥和本氏烟草,尚未验证在其他植物中的适用性 | 解决prime editing在双子叶植物中效率低下的问题,开发系统性优化方案 | 拟南芥(Arabidopsis thaliana)和本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 植物合成生物学 | NA | 农杆菌介导转化、深度扩增子测序(20-50万clean reads) | 多模块组装prime editing系统(mPE) | 基因组测序数据 | 大规模转化实验(具体数量未明确说明) |
122 | 2025-06-04 |
Exploring potential biosafety implications in DNA information storage
2025-Apr, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2025.03.006
PMID:40453469
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research paper | 该研究评估了五种代表性DNA存储编码方法在生物安全性方面的风险,分析了它们与自然生物DNA的序列相似性 | 首次系统评估了DNA信息存储技术中人工合成DNA序列的生物安全风险,并提出了随机化策略以降低潜在风险 | 研究仅评估了五种编码方法,可能无法涵盖所有DNA存储技术的生物安全风险 | 探索DNA信息存储技术的生物安全影响 | 五种DNA存储编码方法(Church、Goldman、DNA Fountain、Grass和MT编码) | 合成生物学 | NA | Kraken2分类、BLASTn比对分析 | NA | DNA序列数据 | 五种代表性DNA存储编码方法产生的序列 |
123 | 2025-06-03 |
A cell-free biosensor signal amplification circuit with polymerase strand recycling
2025-Jun, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01816-w
PMID:39806069
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研究论文 | 本文介绍了一种名为聚合酶链回收(PSR)的无细胞生物传感器信号放大电路,该电路利用T7 RNA聚合酶的脱靶转录在DNA链置换电路中回收核酸输入 | 开发了PSR电路,通过T7 RNA聚合酶的脱靶转录实现核酸输入的回收,提高了生物传感器的灵敏度 | 未提及具体局限性 | 扩展无细胞生物传感技术的能力,提高生物传感器的灵敏度 | 无细胞系统中的基因电路和生物传感器 | 合成生物学 | NA | 聚合酶链回收(PSR),DNA链置换电路 | NA | 核酸 | NA |
124 | 2025-06-03 |
Synthetic Biocatalysis in Erythrocyte Microreactors for Gasotransmitter H2S Production and Vessel Vasodilation
2025-Jun-01, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202502208
PMID:40451735
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研究论文 | 该研究开发了一种能够长时间产生硫化氢(H₂S)用于治疗性血管舒张的红细胞微反应器 | 通过将PLP-PLys复合物封装到红细胞中,创建了一种新型的合成生物催化微反应器系统,实现了持续可控的H₂S生成 | 仅进行了体外实验验证,尚未进行体内研究 | 开发用于心血管治疗的气体递质递送平台 | 红细胞微反应器及其在血管舒张中的应用 | 合成生物学与生物工程 | 心血管疾病 | 低渗膨胀法封装技术 | NA | 生物化学数据、荧光成像数据 | 体外实验使用分离的胸主动脉环 |
125 | 2025-06-03 |
Integrated study on the genome, transcriptome, and metabolome of Gelsemium elegans and mining of related enzyme genes involved in koumine biosynthesis
2025-May-24, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110069
PMID:40450816
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研究论文 | 本文对钩吻的基因组、转录组和代谢组进行了综合研究,并挖掘了与钩吻碱生物合成相关的酶基因 | 首次对钩吻的基因组进行测序和组装,并构建了全面的转录组cDNA文库,鉴定了29种生物碱,并验证了两个候选基因在钩吻碱生物合成中的功能 | 钩吻碱的生物合成途径研究较少,理解不足,限制了通过育种或合成生物学提高钩吻碱产量的能力 | 研究钩吻中钩吻碱的生物合成途径 | 钩吻(Gelsemium elegans) | 合成生物学 | NA | PacBio测序、液相色谱-质谱技术 | NA | 基因组、转录组、代谢组数据 | 不同组织和激素处理的钩吻样本 |
126 | 2025-06-03 |
Light-Responsive DNA Droplets for Controlling Enzyme Cascade Pathways by Dynamic Phase Separation
2025-May-23, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202505316
PMID:40410127
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研究论文 | 本研究提出了一种利用光响应DNA液滴通过动态相分离控制酶级联途径的新方法 | 设计了带有偶氮苯修饰粘性末端的Y-motif序列,形成光响应DNA液滴,实现了对酶级联途径的动态调控 | 仅测试了两种酶级联系统,需要更多系统验证方法的普适性 | 开发一种调控酶级联途径的新方法 | 光响应DNA液滴和酶级联系统 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离技术 | NA | NA | 测试了两种酶级联系统(GOx/HRP/CAT和GAO/MPO/CAT) |
127 | 2025-06-03 |
Regulatory Components for Bacterial Cell-Free Systems Engineering
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00574
PMID:39509282
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review | 本文综述了细菌无细胞系统中的天然和工程调控组件及其应用 | 全面概述了无细胞系统中调控组件的使用,包括天然和工程化的组件 | NA | 探讨无细胞系统中调控组件的应用及其在合成生物学中的重要性 | 细菌无细胞系统中的调控组件 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
128 | 2025-06-03 |
Modulating Microbial Materials - Engineering Bacterial Cellulose with Synthetic Biology
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00615
PMID:39509658
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research paper | 探讨合成生物学如何影响细菌纤维素(BC)基生物材料的现状及其在工程活性材料(ELMs)中的应用 | 结合合成生物学与材料科学,开发具有编程生物功能的可持续材料,并探索3D生物打印在BC基ELMs中的潜在应用 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 研究合成生物学如何推动细菌纤维素基材料的创新及其在生物医学等领域的应用 | 细菌纤维素(BC)及其衍生的工程活性材料(ELMs) | 合成生物学与材料科学 | NA | 3D生物打印 | NA | NA | NA |
129 | 2025-06-03 |
Engineering an αCD206-synNotch Receptor: Insights into the Development of Novel Synthetic Receptors
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00149
PMID:39555579
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研究论文 | 本文开发了一种新型的αCD206-synNotch受体,用于研究肿瘤微环境中巨噬细胞与癌细胞之间的瞬时相互作用 | 开发了针对CD206巨噬细胞的αCD206-synNotch受体,这是一种新型的合成受体,可用于监测和理解巨噬细胞与癌细胞之间的相互作用对转移建立的影响 | 研究中发现了关于其应用的一些意外注意事项,具体细节未明确说明 | 开发新型合成受体以研究肿瘤微环境中巨噬细胞与癌细胞的相互作用 | CD206巨噬细胞和癌细胞 | 合成生物学 | 癌症 | synNotch受体工程 | 小鼠转移模型 | NA | NA |
130 | 2025-06-03 |
Red Light Responsive Cre Recombinase for Bacterial Optogenetics
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00388
PMID:39558834
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research paper | 本研究介绍了一种红光诱导的Cre重组酶系统OptoCre-REDMAP,用于细菌光遗传学应用 | 开发了首个红光诱导的Cre重组酶系统,解决了现有光遗传工具主要响应蓝光的限制,并展示了红光在密集培养穿透性和低毒性方面的优势 | NA | 开发适用于细菌的多色光遗传控制系统 | 细菌基因表达和DNA切除的光控系统 | 合成生物学 | NA | 光遗传学技术 | OptoCre-REDMAP系统(基于PhyA和FHY1植物光感受器与分裂Cre重组酶) | NA | NA |
131 | 2025-06-03 |
Effect of Translation-Enhancing Nascent SKIK Peptide on the Arrest Peptides Containing Consecutive Proline
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00221
PMID:39573840
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research paper | 研究SKIK肽标签如何缓解由连续脯氨酸残基引起的翻译停滞,并揭示其与EF-P协同促进翻译的机制 | 发现SKIK肽标签能有效缓解WPPP引起的翻译停滞,并揭示其与EF-P的协同作用 | 研究主要基于体外翻译反应和体内蛋白质生产系统,未涉及更复杂的生物环境 | 优化蛋白质生产过程以推动合成生物学应用 | 核糖体停滞肽(RAPs)如SecM AP和WPPP | 合成生物学 | NA | PURE无细胞蛋白质合成和体内蛋白质生产系统 | NA | 蛋白质序列和翻译效率数据 | 未明确提及具体样本数量 |
132 | 2025-06-03 |
Genetically Modifying the Protein Matrix of Macroscopic Living Materials to Control Their Structure and Rheological Properties
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00336
PMID:39601053
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研究论文 | 本文探讨了通过基因修饰宏观活体材料的蛋白质基质来控制其结构和流变学特性的方法 | 研究了弹性蛋白样多肽(ELP)长度变化对活体材料微观结构和粘弹性行为的影响,揭示了序列-结构-特性之间的关系 | 研究结果与其它生物复合材料模型的相似性较少,复杂性较高 | 探索活体工程材料(ELMs)的序列、结构和流变学特性之间的关系 | 弹性蛋白样多肽(ELP)修饰的宏观活体材料 | 生物材料工程 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
133 | 2025-06-03 |
Engineered Stop and Go T7 RNA Polymerases
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00627
PMID:39610115
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研究论文 | 该研究开发了一种由吲哚激活的T7 RNA聚合酶变体,用于合成生物学中的精确基因表达调控 | 首次实现了全长单亚基T7 RNA聚合酶通过生理浓度吲哚的化学诱导激活,创建了新型配体激活核酸聚合酶(LARPs)平台 | EC50值为344 μM的激活效率可能在某些应用中需要优化 | 开发化学诱导的基因表达调控系统用于合成生物学应用 | T7 RNA聚合酶变体及其在细菌中的调控应用 | 合成生物学 | NA | 理性设计、定向进化 | NA | NA | NA |
134 | 2025-06-03 |
Biosynthesis of Antimicrobial Ornithine-Containing Lacticin 481 Analogues by Use of a Combinatorial Biosynthetic Pathway in Escherichia coli
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00650
PMID:39660664
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研究论文 | 本研究通过在大肠杆菌中使用组合生物合成途径,合成了含有鸟氨酸的抗菌乳酸素481类似物 | 利用具有宽松底物特异性的SyncM酶催化活性乳酸素481的产生,并成功将鸟氨酸和(甲基)羊毛硫氨酸整合到肽中 | 在乳酸素481特定位点,先前的羊毛硫氨酸和甲基羊毛硫氨酸形成可能阻碍鸟氨酸的掺入 | 探索抗菌肽的生物合成途径及其功能多样性 | 乳酸素481及其含有鸟氨酸的类似物 | 合成生物学 | NA | 组合生物合成途径 | NA | NA | NA |
135 | 2025-06-03 |
De Novo Production of the Bioactive Phenylpropanoid Artepillin C Using Membrane-Bound Prenyltransferase in Komagataella phaffii
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00472
PMID:39530514
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研究论文 | 本研究利用膜结合异戊二烯基转移酶在Komagataella phaffii中实现了生物活性苯丙素类化合物Artepillin C的从头合成 | 通过增强异戊二烯二磷酸供应途径,显著提高了Artepillin C的产量,并实现了最高报道水平的从头合成量 | 研究中发现对香豆酸(-CA)的供应成为工程菌株中Artepillin C生产的瓶颈 | 开发稳定的Artepillin C生物合成方法 | Artepillin C生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 基因工程、分批培养 | NA | NA | NA |
136 | 2025-06-03 |
Fabrication of cyborg bacterial cells as living cell-material hybrids using intracellular hydrogelation
2024-Dec, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01035-6
PMID:39174659
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研究论文 | 本文描述了一种在细菌细胞内组装合成聚合物网络的协议,使其无法进行细胞分裂并抵抗环境压力 | 提出了一种将细菌转化为单寿命设备的新方法,结合了合成材料的工程简单性和天然细胞的功能性 | 协议的实施需要微生物学技术、水凝胶化学、荧光显微镜和流式细胞术的专业知识,进一步功能化需要从合成遗传电路工程到水凝胶聚合化学的技能 | 开发一种新的细胞底盘,结合合成材料的工程简单性和天然细胞的功能性,用于生物技术、生物医学工程和活体治疗 | 细菌细胞 | 合成生物学 | NA | 水凝胶化学、荧光显微镜、流式细胞术 | NA | NA | NA |
137 | 2025-06-03 |
Macroscopic Assembly of Materials with Engineered Bacterial Spores via Coiled-Coil Interaction
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00468
PMID:39393788
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research paper | 研究报道了通过工程化细菌孢子组装形成的宏观材料 | 利用合成生物学设计宏观材料,并揭示了卷曲螺旋相互作用在不同长度尺度上的影响 | 机械性能在pH变化时保持恒定,但侵蚀稳定性与工程化表面蛋白的pH依赖性相互作用一致 | 设计宏观材料并研究卷曲螺旋相互作用的影响 | 工程化细菌孢子 | 合成生物学 | NA | T7驱动表达系统 | NA | NA | NA |
138 | 2025-06-03 |
Engineering Cyborg Pathogens through Intracellular Hydrogelation
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00420
PMID:39413025
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研究论文 | 该研究通过细胞内水凝胶化技术,将非复制但代谢活跃的Cyborg细菌方法扩展到病原菌,探索其在生物医学应用中的潜力 | 将Cyborg细胞方法从实验室菌株扩展到病原菌,并验证其在巨噬细胞中的摄取和表型响应 | 仅研究了特定菌株的病原菌,未涵盖所有可能的病原菌类型 | 探索病原菌通过细胞内水凝胶化技术改造后的生物医学应用潜力 | 不同菌株的病原菌 | 合成生物学 | NA | 细胞内水凝胶化技术、共聚焦显微镜、实时PCR | NA | 实验数据 | 未明确提及具体样本数量,但涉及多种病原菌菌株 |
139 | 2025-06-03 |
Dual-Plasmid Mini-Tn5 System to Stably Integrate Multicopy of Target Genes in Escherichia coli
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00140
PMID:39418641
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research paper | 介绍了一种使用双质粒mini-Tn5系统在大肠杆菌中稳定整合多拷贝目标基因的方法 | 开发了一种新型双质粒mini-Tn5系统,实现了目标基因在大肠杆菌染色体中的稳定多拷贝整合 | 未提及具体的应用限制或潜在问题 | 开发一种稳定且可控的基因表达方法,以提高工程微生物中有价值代谢物的生产效率 | 大肠杆菌(Escherichia coli) | 合成生物学 | NA | 双质粒mini-Tn5系统 | NA | NA | 使用了大肠杆菌MG1655和XL1-Blue MRF'菌株进行实验 |
140 | 2025-06-03 |
Engineering Yarrowia lipolytica to Produce l-Malic Acid from Glycerol
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00445
PMID:39444231
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研究论文 | 本研究通过代谢工程和实验室进化技术,首次在Yarrowia lipolytica中成功生产L-苹果酸 | 首次在Yarrowia lipolytica中结合代谢工程和实验室进化技术生产L-苹果酸,并通过优化培养基和扩大生产规模显著提高了产量 | 研究未涉及生产成本和工业化生产的可行性分析 | 探索Yarrowia lipolytica生产L-苹果酸的潜力,并优化其生产流程 | Yarrowia lipolytica真菌 | 合成生物学与代谢工程 | NA | 代谢工程、实验室进化、生物反应器放大 | NA | NA | 实验涉及摇瓶和5L生物反应器规模的培养 |