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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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121 | 2025-09-15 |
Rational Modulation of Plant Root Development Using Engineered Cytokinin Regulators
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00051
PMID:40737362
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研究论文 | 利用工程化细胞分裂素调节因子理性调控植物根系发育 | 通过理性设计B型响应调节因子,实现对细胞分裂素依赖性状的可预测调控,并降低其对细胞分裂素的敏感性 | NA | 开发合成生物学工具以精确控制植物定量发育表型 | 植物根系发育(侧根数量) | 合成生物学 | NA | 组织特异性启动子、转录因子工程化 | NA | NA | NA |
122 | 2025-09-15 |
Critical Analysis of Preprints and Inquiry-Based Lessons Improve the Synthetic Biology Learning Experience
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00014
PMID:40814254
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研究论文 | 本文开发了结合预印本批判性分析和探究式实验的主动学习工作流,以提升合成生物学的教学效果 | 利用预印本与最终发表论文的对比分析作为教学资源,并设计CRISPRi基因电路实践环节,使学生完整参与设计-构建-测试-学习循环 | NA | 改进合成生物学教学方法,提升学生的批判性分析能力和跨学科知识掌握 | 大学生 | 合成生物学 | NA | CRISPRi基因电路技术 | NA | 文本数据(预印本与论文)、实验数据 | 学生群体(具体数量未明确),90%报告批判分析技能提升,80%认为掌握了广泛概念 |
123 | 2025-09-15 |
Toehold-VISTA: A machine learning approach to decipher programmable RNA sensor-target interactions
2025-Aug-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.12.669990
PMID:40832290
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研究论文 | 提出一种机器学习引导的框架Toehold-VISTA,用于快速设计高性能RNA传感器 | 整合生物物理建模与机器学习(PLS-DA),通过序列-结构特征提取预测RNA传感器性能 | NA | 加速RNA传感器的设计与筛选过程,提升其对特定RNA靶标的响应性能 | RNA传感器(特别是toehold开关)与靶标RNA(如SARS-CoV-2 RNA)的相互作用 | 机器学习 | 传染病(如COVID-19) | 高通量实验测量、序列-结构特征提取、PLS-DA机器学习 | PLS-DA(偏最小二乘判别分析) | RNA序列与结构数据 | NA |
124 | 2025-09-15 |
Protein structure prediction and design for high-throughput computing
2025-Jul-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.18.665594
PMID:40777508
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研究论文 | 本文开发了针对蛋白质结构预测与设计工具的容器化解决方案,以提升计算效率和部署便捷性 | 提出了跨多种计算架构优化的容器化方案及OmniFold包装平台,支持多工具并行运行并自动生成质控报告 | 未明确说明容器性能的具体提升指标或在不同硬件环境下的兼容性测试范围 | 降低高性能蛋白质结构预测与设计工具的计算部署门槛,促进科研可重复性和可及性 | 蛋白质结构预测工具(AlphaFold3、Chai-1、Boltz-2)和设计平台(RFdiffusion) | 计算生物学 | NA | 容器化技术(如Docker/Singularity)、GPU优化计算 | NA | 蛋白质结构数据、分子相互作用数据 | NA |
125 | 2025-09-15 |
Pepper RNA variants reveal decoupling of HBC530 binding thermodynamics and fluorescence activation
2025-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.660466
PMID:40667133
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研究论文 | 本研究通过分析Pepper RNA变体,揭示了HBC530结合热力学与荧光激活之间的解耦现象 | 发现配体识别与荧光强度之间存在解耦,并证明远端结构元件对结合热力学和荧光强度有显著影响 | NA | 定量评估单个核苷酸对HBC530结合亲和力、镁结合亲和力和荧光强度的贡献 | Pepper RNA适配体及其53种变体 | 合成生物学 | NA | RNA变体库构建与定量分析 | NA | 生化测定数据 | 53种Pepper变体 |
126 | 2025-09-15 |
Application and research progress of MultiBac: A review
2024-Sep-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000039333
PMID:39252306
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综述 | 本文回顾了MultiBac技术的发展过程、特点及其在生物技术和制药领域的应用 | 引入了一种相对较新的MultiBac方法,用于高效生产重组蛋白和研究复杂蛋白质复合物 | MultiBac技术存在一些缺点,研究人员在选择表达系统时需考虑其局限性 | 介绍MultiBac技术的发展和应用,为基础研究人员提供新方法 | 蛋白质表达系统,特别是MultiBac技术在真核细胞中的应用 | 生物技术 | NA | MultiBac技术,合成生物学技术 | NA | NA | NA |
127 | 2025-09-14 |
Development and Recent Advances in SLIPT-PM: A Chemogenetic Platform for Manipulating Signaling at the Plasma Membrane
2025-Sep-12, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500327
PMID:40400158
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概念文章 | 本文回顾了SLIPT-PM化学遗传学平台的开发、特性、应用及未来挑战,该平台用于在活细胞中操纵质膜信号传导 | 开发了基于自定位配体的蛋白质易位技术,实现快速、可逆且可重复的胞质至质膜蛋白质招募 | NA | 剖析细胞信号网络并工程化细胞功能 | 哺乳动物细胞中的信号蛋白和脂质 | 合成生物学 | NA | SLIPT(自定位配体诱导蛋白质易位) | NA | NA | NA |
128 | 2025-09-14 |
Engineering Proteinosomes with Cellular-Like Functionalities
2025-Sep-12, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500448
PMID:40810682
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综述 | 本文综述了蛋白质体(proteinosomes)的构建与功能化策略,重点探讨其作为人工细胞模型的潜力和应用 | 整合界面自组装、聚合物膜模板和混合脂质-聚合物系统,实现可调控渗透性、机械稳定性和刺激响应行为,并强调其在构建原型组织及多室结构中的创新 | NA | 总结蛋白质体的构建方法、功能化策略及其在人工细胞和生物材料中的应用前景 | 蛋白质体及其仿生结构 | 合成生物学 | NA | 界面自组装、聚合物膜模板、混合脂质-聚合物系统 | NA | NA | NA |
129 | 2025-09-14 |
Genetically engineered Escherichia coli: The new recyclers of PET plastic waste
2025-Sep-09, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108713
PMID:40934993
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综述 | 本文综述了基因工程改造的大肠杆菌作为PET塑料生物降解与转化平台的新兴应用 | 利用合成生物学策略构建多酶级联反应和表面展示系统,提升催化效率并实现PET降解产物向高附加值生物产品的转化 | NA | 探讨工程化微生物平台在PET塑料生物降解与资源化回收中的潜力 | 基因工程改造的大肠杆菌及其表达的PET水解酶 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA |
130 | 2025-09-14 |
Peptide Coacervates Can Protect Sequestered Oligonucleotides from Nucleases and Release Them for Transcription and Translation
2025-Sep-08, Biomacromolecules
IF:5.5Q1
DOI:10.1021/acs.biomac.5c00600
PMID:40802871
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研究论文 | 本文展示了肽共凝聚物通过液-液相分离形成无膜细胞器,能够有效隔离并保护短DNA报告基因和功能性荧光素酶基因免受多种核酸酶的降解 | 发现基于聚组氨酸肽与ATP静电相互作用的缔合型共凝聚物能高效抑制核酸酶降解,并可通过外部刺激实现可控释放 | 基于sticker-and-spacer模型肽的简单共凝聚物仅表现出有限的保护作用 | 开发能够保护和可控释放功能性遗传材料的生物相容性递送系统 | 短DNA报告基因和功能性荧光素酶基因 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录翻译系统 | NA | 生物分子数据 | NA |
131 | 2025-09-14 |
Engineered microbial production of carotenoids and their cleavage products: Recent advances and prospects
2025-Sep-06, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108708
PMID:40921259
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综述 | 本文总结了类胡萝卜素及其裂解产物微生物合成的最新进展与前景 | 聚焦代谢工程和合成生物学策略提升微生物异源合成效率 | NA | 开发高效可持续的类胡萝卜素及apocarotenoids生物合成方法 | 类胡萝卜素及其裂解产物(apocarotenoids) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、异源生物合成 | NA | NA | NA |
132 | 2025-09-14 |
Expanding Immunotherapy Beyond CAR T Cells: Engineering Diverse Immune Cells to Target Solid Tumors
2025-Sep-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172917
PMID:40941014
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综述 | 本文综述了除CAR T细胞外,多种免疫细胞(如NK细胞、巨噬细胞等)在实体瘤治疗中的工程化应用进展 | 探索γδ T细胞、NKT细胞、病毒特异性T细胞、NK细胞及髓系效应细胞等作为CAR平台的新方向,并整合药理学、合成生物学和人工智能技术优化设计 | NA | 扩展细胞免疫治疗范围,解决实体瘤中抗原异质性、免疫抑制微环境及细胞迁移持久性差等问题 | 多种免疫细胞(γδ T细胞、NKT细胞、NK细胞、巨噬细胞、树突状细胞等) | 免疫治疗 | 实体瘤 | 合成生物学、人工智能、CAR工程化 | NA | NA | NA |
133 | 2025-09-14 |
Synthetic biology meets diagnostics: Engineering biosensing platforms for rapid and accurate pathogen and viral detection
2025-Sep-02, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.117946
PMID:40939269
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综述 | 本文综述了合成生物学与生物传感技术结合在病原体和病毒快速精准检测中的进展与应用 | 整合CRISPR系统、Argonaute蛋白和模块化遗传电路等工具,并融合人工智能与纳米技术开发自动化、低成本、高通量诊断平台 | NA | 推动病原体检测和体外诊断技术的发展 | 病原体与病毒 | 合成生物学 | 传染病 | CRISPR-based系统、Argonaute蛋白、模块化遗传电路、无细胞系统、纳米材料增强平台 | NA | 生物分子数据 | NA |
134 | 2025-09-14 |
Glycyrrhiza, a commonly used medicinal herb: Review of species classification, pharmacology, active ingredient biosynthesis, and synthetic biology
2025-Sep, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.11.019
PMID:39551128
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综述 | 本文全面回顾了甘草属植物的物种分类、药理活性、活性成分生物合成及合成生物学研究进展 | 整合多学科知识提供甘草属的独特全面视角,强调合成生物学和代谢工程在资源保护中的创新应用 | 野生甘草资源过度开发导致种质资源退化,现有储备难以满足化学提取和临床应用需求 | 系统梳理甘草属研究现状,为分子育种和合成生物学领域提供理论基础 | 甘草属植物(主要聚焦根和根茎部位)及其活性成分(三萜类、黄酮类、多糖等) | 药用植物学/合成生物学 | NA | 多组学研究(omics)、代谢工程、微生物绿色生产 | NA | 文献数据、组学数据 | NA(文献综述类研究) |
135 | 2025-09-14 |
One-pot cloning and protein expression platform for genetic engineering
2025-Aug-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.28.672974
PMID:40909620
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研究论文 | 开发了一种集成突变、质粒组装和功能蛋白测试的一锅法克隆与蛋白表达平台 | 将Golden Gate克隆与无细胞转录翻译结合,无需中间纯化或细菌扩增即可高效生成和筛选遗传变异 | NA | 为合成生物学提供高通量克隆和蛋白质工程的可推广和自动化方法 | 荧光蛋白、荧光素酶、抗生素转化酶和紫色素生物合成途径 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆、无细胞转录翻译 | NA | NA | NA |
136 | 2025-09-14 |
Molecular Mechanisms of Herbicide Resistance in Rapeseed: Current Status and Future Prospects for Resistant Germplasm Development
2025-Aug-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178292
PMID:40943213
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综述 | 本文系统总结了油菜除草剂抗性的分子机制、抗性种质开发进展及未来精准育种策略 | 首次系统整合非靶标抗性机制、多组学与AI技术在抗除草剂油菜育种中的潜在应用,并涵盖基因流风险管理策略 | NA | 阐明油菜除草剂抗性机制并指导抗性种质安全创新开发 | 油菜(芸薹属油料作物) | 植物育种与合成生物学 | NA | 基因编辑、人工诱变、外源基因导入、定向蛋白进化 | NA | 多组学数据 | NA |
137 | 2025-09-14 |
Unlocking Casein Bioactivity: Lactic Acid Bacteria and Molecular Strategies for Peptide Release
2025-Aug-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178119
PMID:40943047
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和分子生物技术增强β-酪蛋白源生物活性肽靶向发现与生产的策略 | 整合CRISPR/Cas基因组编辑、诱导表达平台、无细胞系统及多组学方法优化乳酸菌肽释放策略 | NA | 提升β-酪蛋白源生物活性肽的靶向生产效率和产量 | 牛β-酪蛋白及其加密的生物活性肽 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas系统、多组学(基因组/转录组/蛋白质组/代谢组)分析 | NA | 分子生物数据 | NA |
138 | 2025-09-14 |
Microbial Biosensor for Sensing and Treatment of Intestinal Inflammation
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504364
PMID:40323169
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研究论文 | 开发了一种基于合成生物学的微生物生物传感器,用于检测和治疗肠道炎症 | 利用锌摄取调节器(Zur)控制的启动子与记忆电路结合,首次实现了对临床验证的生物标志物钙卫蛋白的检测与治疗双重功能 | 研究目前仅限于小鼠模型,尚未进行人体试验 | 开发具有诊断和治疗功能的肠道炎症生物传感器 | 肠道炎症(特别是结肠炎) | 合成生物学 | 肠道炎症疾病 | 合成生物学技术、生物传感器设计 | NA | 生物分子数据 | 两个独立的小鼠结肠炎模型 |
139 | 2025-09-14 |
A quantitative analysis of biosafety and biosecurity using attack trees in low-to-moderate risk scenarios: Evidence from iGEM
2025-06, Risk analysis : an official publication of the Society for Risk Analysis
IF:3.0Q1
DOI:10.1111/risa.17678
PMID:39552172
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研究论文 | 本研究通过攻击树方法对iGEM竞赛中的生物安全与生物安保风险进行定量分析 | 将传统定性风险社会理论扩展为定量分析,并针对合成生物学团队构建攻击树模型 | NA | 评估低至中等风险场景下的生物安全与生物安保问题 | 2022年iGEM竞赛项目 | 合成生物学 | NA | 攻击树分析 | NA | 风险场景数据 | 2022年iGEM项目风险点 |
140 | 2025-09-13 |
Utilizing the SacB-mediated gene editing system in Komagataeibacter xylinus to explore the function of bacterial cellulose synthase
2025-Nov, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.08.003
PMID:40774389
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研究论文 | 本研究开发了一种基于SacB的基因编辑系统,用于高效无痕编辑Komagataeibacter xylinus中的细菌纤维素合成酶基因 | 开发了pK18mobsacB系统,实现高达83.33%的无标记基因编辑效率,并首次系统探索了bcs操纵子在细菌纤维素合成中的作用 | NA | 提高细菌纤维素生产菌株的基因编辑效率并探索纤维素合成酶功能 | Komagataeibacter xylinus CGMCC 2955菌株及其细菌纤维素合成酶基因 | 合成生物学 | NA | SacB介导的基因编辑系统 | NA | 基因序列数据、纤维素物理特性数据 | 使用Komagataeibacter xylinus CGMCC 2955菌株进行基因操作实验 |