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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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121 | 2025-04-15 |
The bacterial symbionts of Entomopathogenic nematodes and their role in symbiosis and pathogenesis
2025-Mar-01, Journal of invertebrate pathology
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.jip.2025.108295
PMID:40032241
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综述 | 本文总结了昆虫病原线虫与其细菌共生体之间的共生关系,以及它们在成功侵入和利用昆虫宿主中的作用 | 强调了共生体在自然产物研究中的模型系统作用,以及合成生物学方法在发现具有改进生物活性的非天然衍生物中的应用 | NA | 研究昆虫病原线虫与其细菌共生体之间的共生关系及其在昆虫宿主中的致病机制 | 昆虫病原线虫(Steinernema和Heterorhabditis)及其细菌共生体(Xenorhabdus和Photorhabdus) | 生态学与进化生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
122 | 2025-04-15 |
Rational Design of Dual-Targeted Nanomedicines for Enhanced Vascular Permeability in Low-Permeability Tumors
2025-01-28, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c12808
PMID:39797815
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研究论文 | 本文提出了一种基于合成生物学的双靶向纳米药物设计方法,用于增强低渗透性肿瘤中的血管通透性 | 利用基因工程逻辑门控策略,设计了具有可调比例RGD靶向和固有TfR1靶向配体的双靶向铁蛋白纳米笼(Dt-FTn),并通过机器学习单血管分析揭示了双受体表达谱在决定双靶向纳米药物在低渗透性肿瘤中血管转运中的关键作用 | 研究仅针对结肠癌模型,未在其他类型肿瘤中验证 | 设计双靶向纳米药物以增强肿瘤递送效率 | 低渗透性肿瘤中的血管内皮细胞 | 纳米医学 | 结肠癌 | 合成生物学、基因工程、机器学习 | 机器学习单血管分析 | 实验数据 | 患者来源的结肠癌模型 |
123 | 2025-04-15 |
Current Approaches for Genetic Manipulation of Streptomyces spp.-Key Bacteria for Biotechnology and Environment
2025-Jan-02, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech14010003
PMID:39846552
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综述 | 本文综述了链霉菌属细菌的遗传操作方法和合成生物学策略,强调了其在生物技术和环境应用中的重要性 | 总结了最新的合成生物学工具和基因组挖掘方法在链霉菌工程中的应用 | 现有方法仍存在菌株依赖性和设计依赖性的限制 | 探索和开发链霉菌属细菌的遗传操作工具以提高其天然产物生产能力 | 链霉菌属细菌 | 合成生物学 | NA | DNA测序、基因组编辑、基因组挖掘 | NA | 基因组数据 | NA |
124 | 2025-04-13 |
Harnessing hyperaccumulator plants to recover technology-critical metals: where are we at?
2025-May, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.20449
PMID:40066815
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review | 本文回顾了植物采矿技术(phytomining)的发展现状,特别是其在镍回收方面的商业化应用,并探讨了其他技术关键金属(如钴、硒和铊)的潜在回收机会 | 文章强调了通过分子机制研究、驯化和农艺发展来改进超富集植物(hyperaccumulators)的新方法,包括定向育种和合成生物学技术 | 文章未提及植物采矿技术在实际应用中可能遇到的具体挑战或限制条件 | 探讨植物采矿技术在回收技术关键金属方面的现状和未来发展潜力 | 超富集植物及其在金属回收中的应用 | 环境生物技术 | NA | 定向育种,合成生物学 | NA | NA | NA |
125 | 2025-04-13 |
Innovations in Bacteriophage Genome Engineering for Combating Multidrug-Resistant Bacterial Infections
2025-Apr-11, Foodborne pathogens and disease
IF:1.9Q3
DOI:10.1089/fpd.2024.0194
PMID:40216545
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研究论文 | 本文探讨了利用噬菌体基因组工程技术对抗多重耐药细菌感染的创新方法 | 介绍了CRISPR/Cas9、同源重组等合成生物学技术在噬菌体改造中的应用,以增强其针对多重耐药菌的效果 | 长期噬菌体治疗可能导致抗噬菌体抗体的产生,可能干扰治疗效果 | 开发更有效的噬菌体疗法以应对多重耐药细菌感染 | 噬菌体及其与细菌宿主的相互作用 | 合成生物学 | 细菌感染 | CRISPR/Cas9, 同源重组, 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
126 | 2025-04-13 |
High throughput construction of species characterized bacterial biobank for functional bacteria screening: demonstration with GABA-producing bacteria
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1545877
PMID:40212379
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研究论文 | 本研究开发了一种高通量、低成本的细菌生物库构建和功能筛选平台,用于筛选功能性细菌 | 采用双端条形码策略和Nanopore测序技术,显著提高了细菌生物库构建和筛选的效率和准确性 | 研究仅针对GABA产生细菌进行了概念验证,未涵盖其他功能性代谢产物 | 开发高效细菌生物库构建和功能筛选平台,促进工业生物技术发展 | 来自中国发酵食品和婴儿粪便的细菌分离株 | 合成生物学 | NA | Nanopore测序、双端条形码策略、荧光生物传感器系统 | NA | DNA序列数据、荧光信号数据 | 15,337个细菌分离株,其中1,740个用于GABA产生能力筛选 |
127 | 2025-04-13 |
Determination of the genome-scale metabolic network of Bartonella quintana str. Toulouse to optimize growth for its use as chassis for synthetic biology
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1527084
PMID:40213639
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research paper | 本研究通过基因组尺度代谢网络模型(GEMs)重建与分析,优化了Bartonella quintana str. Toulouse的生长条件,为其在合成生物学中的应用提供基础 | 首次重建了Bartonella quintana str. Toulouse的基因组尺度代谢网络模型,并通过实验验证了关键代谢物2-氧戊二酸对其生长的重要性 | 模型预测与实验结果在某些补充条件下存在不一致,需要进一步优化模型准确性 | 优化Bartonella quintana str. Toulouse的生长条件,以支持其在合成生物学中的应用 | Bartonella quintana str. Toulouse(一种兼性细胞内寄生虫) | 合成生物学 | NA | 基因组注释工具(RAST和ModelSEED)、通量平衡分析(FBA)、蛋白质组学分析 | 基因组尺度代谢模型(GEMs) | 基因组数据、蛋白质组数据 | NA |
128 | 2025-04-12 |
Discovery of diverse and high-quality mRNA capping enzymes through a language model-enabled platform
2025-Apr-11, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt0402
PMID:40203090
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研究论文 | 本文提出了一种基于大型语言模型的通用基因挖掘平台SYMPLEX,用于发现高质量的mRNA加帽酶 | 利用大型语言模型构建基因挖掘平台SYMPLEX,突破了传统依赖序列同源性和专家知识的限制 | 实验验证的候选酶数量有限(46个),需要进一步扩大验证规模 | 开发新型基因挖掘平台以支持合成生物学和生物工程研究 | mRNA加帽酶 | 合成生物学 | NA | 大型语言模型 | NA | 生物医学文献和数据库数据 | 46个候选酶进行实验验证 |
129 | 2025-04-12 |
A Portable Arsenic Sensor Integrating Bacillus megaterium with CMOS Technology
2025-Apr-11, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00895
PMID:40211918
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research paper | 该研究开发了一种便携式砷传感器,通过合成生物学改造巨大芽孢杆菌并与CMOS技术集成,用于实时检测环境中的砷含量 | 结合合成生物学和CMOS技术,开发出可在资源有限环境中部署的便携式砷传感器,检测限低于EPA推荐的饮用水标准 | 巨大芽孢杆菌的合成生物学工具包尚不完善,且研究仅为概念验证阶段 | 开发一种便携式砷传感器,用于实时检测环境和食品中的砷含量 | 砷污染检测 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、CMOS技术 | NA | 生物传感器数据 | 概念验证阶段,未明确样本量 |
130 | 2025-04-12 |
Innovations, Challenges and Future Directions of T7RNA Polymerase in Microbial Cell Factories
2025-Apr-10, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00139
PMID:40209062
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review | 本文全面探讨了T7RNA聚合酶在微生物细胞工厂中的创新应用、挑战及未来发展方向 | 扩展了T7RNA聚合酶的研究范围,不仅涵盖分子结构和功能动态,还强调了其在合成生物学应用中的基础原理和精细电路设计 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 优化微生物细胞工厂中的转录系统,提升可持续生物生产性能 | T7RNA聚合酶及其变体 | 合成生物学 | NA | 工程化T7RNA聚合酶技术 | NA | NA | NA |
131 | 2025-04-12 |
Elucidation and de novo Reconstitution of Glyceollin Biosynthesis
2025-Apr-10, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.04.003
PMID:40211535
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研究论文 | 本研究阐明了glyceollins的完整生物合成途径,并通过合成生物学和代谢工程实现了在酵母中从简单碳源生产glyceollins | 鉴定了glyceollin生物合成中未表征的还原酶基因和五个P450酶,首次实现了在酵母中从头合成glyceollins | NA | 阐明glyceollins的生物合成途径并实现其可持续生产 | 大豆中的glyceollins生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达、体外酶表征、酵母喂养研究 | NA | NA | NA |
132 | 2025-04-12 |
Harnessing RNA base editing for diverse applications in RNA biology and RNA therapeutics
2025-Apr-08, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-025-00063-x
PMID:40198443
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review | 本文综述了RNA碱基编辑技术在RNA生物学和RNA治疗中的多样化应用 | RNA碱基编辑技术作为一种突破性进展,提供了可逆、剂量依赖性的位点定向编辑,与DNA编辑的永久性或遗传性变化形成对比 | NA | 探讨RNA碱基编辑技术在基础研究和转化应用中的潜力 | RNA分子及其在生物学研究和治疗中的应用 | RNA生物学 | NA | RNA碱基编辑(ADAR和APOBEC酶介导的A-to-I和C-to-U转换) | NA | RNA序列 | NA |
133 | 2025-04-12 |
Understanding the role of poly(3-hydroxybutyrate) depolymerases in waste management
2025-Apr, Journal of environmental management
IF:8.0Q1
DOI:10.1016/j.jenvman.2025.124925
PMID:40132380
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review | 本文综述了聚(3-羟基丁酸酯)解聚酶(PHBDs)在废物管理中的作用及其研究进展 | 提供了关于PHBDs的全面更新,包括酶的胞外和胞内形式,以及通过生物信息学和合成生物学方法探索未研究微生物中的PHBDs | 未提及具体实验数据或案例研究,主要基于文献综述 | 探讨PHBDs在生物降解聚(3-羟基丁酸酯)(PHB)废物中的潜在应用 | 聚(3-羟基丁酸酯)解聚酶(PHBDs)及其产生微生物 | 生物技术 | NA | 生物信息学、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA |
134 | 2025-04-12 |
Engineering scutellarin biosynthesis in Artemisia annua
2025-Mar-21, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-025-03471-4
PMID:40116969
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研究论文 | 通过在青蒿中补充缺失的酶并优化黄酮6羟化酶,成功实现了黄芩苷的异源合成 | 在野生型青蒿植物中鉴定出黄芩苷的两个关键前体,并通过共表达来自原宿主短葶飞蓬的三个关键基因,成功实现了黄芩苷的异源合成 | NA | 通过合成生物学方法在青蒿中生产稀缺药物 | 青蒿植物及其代谢产物 | 合成生物学 | 脑血管疾病和心血管疾病 | 基因工程和代谢工程 | NA | NA | NA |
135 | 2025-04-12 |
An inhibitor-free, versatile, fast, and cheap precipitation-based DNA purification method
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0317658
PMID:40198694
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research paper | 开发了一种无需抑制剂、多功能、快速且经济的基于沉淀的DNA纯化方法 | 该方法通过应用离液盐和酒精/聚乙二醇,实现了蛋白质去除和DNA沉淀的同步进行,相比传统方法步骤更少 | 未明确提及方法的适用范围或可能的不适用情况 | 解决商业硅胶柱纯化DNA时存在的抑制后续酶反应的问题 | DNA纯化技术 | 分子生物学 | NA | 沉淀法DNA纯化 | NA | NA | NA |
136 | 2025-04-12 |
Exploring the diversity and antimicrobial potential of actinomycetes isolated from different environments in Saudi Arabia: a systematic review
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1568899
PMID:40207161
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综述 | 本文系统综述了沙特阿拉伯不同环境中放线菌的多样性及其抗菌潜力 | 探讨了沙特阿拉伯独特生态系统(包括陆地、水生、极端环境等)中放线菌的多样性及其抗菌潜力,并介绍了基因组挖掘、AI驱动的生物信息学等最新技术 | 研究中存在培养稀有菌株困难、基因组特征有限和生产成本高等挑战 | 探索新型抗菌剂以应对日益严重的抗菌素耐药性问题 | 沙特阿拉伯不同环境中的放线菌 | 微生物学 | 抗菌素耐药性 | 基因组挖掘、宏基因组学、AI驱动的生物信息学、CRISPR基因激活、质谱分析、液相色谱、核磁共振波谱 | NA | NA | NA |
137 | 2025-04-12 |
Potential applications of engineered bacteria in disease diagnosis and treatment
2025, Microbiome research reports
DOI:10.20517/mrr.2024.57
PMID:40207274
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综述 | 本文探讨了工程菌在疾病诊断和治疗中的潜在应用 | 综述了利用合成生物学和基因编辑技术开发工程菌的方法及其在医疗领域的初步应用 | 讨论了工程菌在疾病管理中的优势和局限性 | 探索工程菌在疾病管理中的潜在应用 | 工程菌及其在疾病诊断和治疗中的应用 | 合成生物学 | 炎症性肠病、代谢紊乱、癌症、神经退行性疾病 | 基因编辑技术 | NA | NA | NA |
138 | 2025-04-12 |
Advances in engineered bacteria vaccines for enhancing anti-cancer immunity
2025, Microbiome research reports
DOI:10.20517/mrr.2024.75
PMID:40207284
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学在开发肿瘤靶向活菌疗法中的进展,特别是通过改造Nissle 1917细菌(EcNc nAg)来递送肿瘤特异性新抗原表位 | 利用改造的Nissle 1917细菌(EcNc nAg)递送肿瘤特异性新抗原表位,为开发有效且持久的癌症免疫疗法提供了新策略 | NA | 开发新型癌症免疫疗法 | 肿瘤靶向活菌疗法 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
139 | 2025-04-12 |
CRISPR and the Rebirth of Synthetic Biology
2017-04, Science and engineering ethics
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s11948-016-9768-z
PMID:27325413
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review | 本文探讨了CRISPR等基因组工程技术在合成生物学中的伦理问题和转化研究障碍 | 讨论了CRISPR技术在合成生物学中的伦理和转化研究问题,提出了对现行监管框架的批评 | 未提出具体的解决方案,主要集中在对现有问题的描述和分析 | 探讨基因组工程技术的伦理问题和转化研究障碍 | CRISPR技术和合成生物学的伦理与监管 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | NA |
140 | 2025-04-11 |
Bioconversion of CO2 into valuable bioproducts via synthetic modular co-culture of engineered Chlamydomonas reinhardtii and Escherichia coli
2025-Jul, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.03.004
PMID:40057263
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研究论文 | 研究通过合成模块化共培养系统,利用工程化的莱茵衣藻和大肠杆菌将CO2转化为有价值的生物产品 | 开发了一种新型的模块化共培养系统,结合了莱茵衣藻的光合作用能力和大肠杆菌的代谢工程优势,实现了CO2的高效转化和生物产品生产 | 研究可能面临规模化生产中的稳定性和效率问题,且未详细讨论长期运行对系统性能的影响 | 探索通过生物转化CO2生产高价值生物产品的可持续方法 | 工程化的莱茵衣藻(GYD1缺陷型突变体)和大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具、模块化共培养系统 | NA | NA | NA |