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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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121 | 2025-05-30 |
Multi-Layer Autocatalytic Feedback Enables Integral Control Amidst Resource Competition and Across Scales
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00575
PMID:40116396
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research paper | 该研究提出了一种多层自催化反馈策略,用于解决资源竞争和跨尺度环境下的积分控制问题 | 利用多层反馈策略实现群体水平的积分反馈和多细胞积分器,控制功能通过不同细胞群体间的协调互动实现 | 尚未在实际生物系统中全面验证其有效性 | 开发在资源竞争和复杂环境下实现稳健适应的控制策略 | 合成生物学中的基因表达调控和多细胞系统 | synthetic biology | NA | autocatalytic integral feedback controllers | multilayer feedback controller | NA | NA |
122 | 2025-05-30 |
Promiscuity of an Alcohol-Dependent Hemiterpene Pathway for the In Vivo Production of a Non-Natural Alkylated Tryptophan Derivative
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00865
PMID:40134314
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research paper | 该研究揭示了酒精依赖性半萜途径的广泛特异性,并展示了其在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物的能力 | 揭示了ADH模块第一个酶PhoN和下游芳香族异戊二烯基转移酶的广泛特异性,并展示了其在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物的能力 | NA | 探索和扩展异戊二烯生物合成的化学空间 | 酒精依赖性半萜途径及其酶 | 合成生物学 | NA | ADH途径 | NA | NA | NA |
123 | 2025-05-30 |
Development of a Transposon-Based Genome Engineering Toolkit for Efficient and Adaptable Genetic Modifications in Wolfiporia cocos
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00766
PMID:40173021
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research paper | 开发了一种基于转座子的基因组工程工具包,用于高效且适应性强的Wolfiporia cocos遗传修饰 | 该工具包显著提高了转化效率,支持多基因整合,并通过鸡尾酒式组装多个基因到转座子中,避免了复杂的遗传电路组装 | 研究仅限于Wolfiporia cocos,未在其他真菌菌株中验证其普适性 | 开发高效且适应性强的真菌基因组工程工具包 | Wolfiporia cocos真菌菌株 | 合成生物学 | NA | 转座子工程 | NA | 基因组数据 | NA |
124 | 2025-05-30 |
Fundamental Trade-Offs in the Robustness of Biological Systems with Feedback Regulation
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00704
PMID:40198741
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研究论文 | 本文研究了生物系统中反馈调控的稳健性及其基本性能权衡 | 提出了一个理论框架来量化生物反馈的准确性和稳健性,并使用多目标优化方法研究其性能权衡 | 仅研究了五种特定的生物反馈电路,可能无法涵盖所有生物反馈系统的复杂性 | 提高对生物反馈调控的理解,并为合成生物学中的稳健电路设计提供指导 | 五种生物反馈电路:正自调控、负自调控、双正反馈、正负反馈和双负反馈(切换开关) | 系统生物学 | NA | 多目标优化 | NA | NA | NA |
125 | 2025-05-30 |
Concentration-Dependent CsrA Regulation of the uxuB Transcript Leads to Development of a Post-Transcriptional Bandpass Filter
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00668
PMID:40202123
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研究论文 | 该研究利用新发现的转录后调控机制,设计了一种基于CsrA蛋白浓度的生物后转录带通滤波器 | 利用CsrA蛋白与mRNA 5' UTR + 100 nt CDS序列的异质性相互作用,实现了基于浓度的转录后调控,减少了合成电路组件的数量 | 需要进一步表征天然调控RNA-蛋白质系统以开发更复杂的RNP基电路 | 设计合成生物学中的转录后调控电路 | mRNA转录本和CsrA蛋白的相互作用 | 合成生物学 | NA | 转录后调控技术 | NA | NA | NA |
126 | 2025-05-30 |
Establishing a High-Yield Bacillus subtilis-Based Cell-Free Protein Synthesis System for In Vitro Prototyping and Natural Product Biosynthesis
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00021
PMID:40203238
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研究论文 | 本研究开发了一种基于工程化Bacillus subtilis 164T7P菌株的高产无细胞蛋白质合成系统,用于体外原型设计和天然产物生物合成 | 通过基因组整合T7 RNA聚合酶基因,开发了无需额外添加T7 RNA聚合酶的高产CFPS系统,并实现了半连续反应模式下超过1100 μg/mL的蛋白质产量 | NA | 开发高产无细胞蛋白质合成系统,用于合成生物学和生物技术应用 | Bacillus subtilis 164T7P菌株及其无细胞提取物 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成(CFPS) | NA | NA | NA |
127 | 2025-05-29 |
Generation of cell-sized liposomes using laser-induced microjets
2025-May-28, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00149h
PMID:40302460
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研究论文 | 本研究提出了一种利用激光诱导微射流穿透含脂油相来生成细胞大小脂质体的新方法 | 采用高速激光诱导微射流技术可靠且可重复地生成细胞大小脂质体,实现了按需生产 | NA | 开发一种新型的细胞大小脂质体生成方法,推动膜科学和合成生物学领域的发展 | 细胞大小脂质体 | 合成生物学 | NA | 激光诱导微射流技术、高速摄像技术、数值分析 | NA | 视频数据(高速摄像)、数值模拟数据 | NA |
128 | 2025-05-29 |
CRISPR/dCas-mediated counter-silencing: reprogramming dCas proteins into antagonists of xenogeneic silencers
2025-May-28, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00382-25
PMID:40434115
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研究论文 | 本研究开发了一种新型CRISPR/dCas介导的反沉默(CRISPRcosi)方法,通过使用无核酸酶活性的dCas酶来对抗Lsr2样异源沉默蛋白CgpS或Lsr2 | 提出CRISPRcosi方法,无需启动子工程即可有效反沉默异源沉默蛋白的靶启动子 | 在缺乏异源沉默蛋白CgpS的菌株中,反沉默效果因靶位点和链的不同而有所差异 | 研究如何通过CRISPR/dCas技术对抗异源沉默蛋白的抑制作用 | Lsr2样异源沉默蛋白CgpS和Lsr2 | 合成生物学 | NA | CRISPR/dCas | NA | 基因组数据 | NA |
129 | 2025-05-29 |
Metabolite-Responsive Control of Transcription by Phase Separation-Based Synthetic Organelles
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00633
PMID:39954260
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研究论文 | 本文通过基于液-液相分离的合成细胞器,将代谢信号转化为基因转录调控 | 利用液-液相分离技术构建合成细胞器,实现代谢信号对基因转录的可逆和剂量依赖性调控 | 未提及具体应用场景或体内实验验证 | 开发具有生命感知和适应能力的合成生物材料 | 基于液-液相分离的合成细胞器 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离技术 | NA | NA | NA |
130 | 2025-05-29 |
Engineering a New Generation of Gene Editors: Integrating Synthetic Biology and AI Innovations
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00686
PMID:39999982
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research paper | 该文章探讨了如何通过合成生物学和人工智能创新来设计新一代基因编辑器 | 整合AI和机器学习技术优化基因编辑酶的发现与设计,提高活性、特异性和免疫原性预测 | 未提及具体实验验证结果或临床转化时间表 | 开发更安全高效的基因组编辑工具并推动其临床转化 | CRISPR-Cas基因编辑系统及其衍生工具 | synthetic biology | NA | AI/ML, rational design, mutagenesis screens, directed evolution | machine learning models | biological sequence data | NA |
131 | 2025-05-29 |
Improving Bacillus subtilis as Biological Chassis Performance by the CRISPR Genetic Toolkit
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00844
PMID:40040244
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review | 本文讨论了利用CRISPR基因工具包提高枯草芽孢杆菌作为生物底盘性能的最新进展 | 介绍了CRISPR技术在枯草芽孢杆菌中的应用,包括基因编辑、转录调控和酶调节等方面的最新进展 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 提高枯草芽孢杆菌作为工业底盘菌的性能,使其能与传统工业微生物如大肠杆菌和酵母相媲美 | 枯草芽孢杆菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | NA |
132 | 2025-05-29 |
Synthetic Biology Strategies for the Production of Natural Colorants and Their Non-Natural Derivatives
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00799
PMID:40066730
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review | 本文综述了合成生物学策略在天然色素及其非天然衍生物生产中的应用 | 讨论了通过合成生物学方法提高天然色素产量及扩展其非天然衍生物颜色谱的策略 | 天然色素的稳定性、颜色谱有限以及从自然资源中提取的低产量问题尚未完全解决 | 探索利用合成生物学方法生产天然色素及其非天然衍生物的策略 | 天然色素及其非天然衍生物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
133 | 2025-05-29 |
A Nitrate/Nitrite Biosensor Designed with an Antiterminator for In Vivo Diagnosis of Colitis Based on Bacteroides thetaiotaomicron
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00602
PMID:39801064
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research paper | 本研究开发了一种基于Bacteroides thetaiotaomicron的抗终止微生物全细胞生物传感器,用于检测小鼠结肠炎 | 利用抗终止元件设计硝酸盐/亚硝酸盐诱导型启动子,优化了生物传感器对炎症环境中硝酸盐和亚硝酸盐的敏感性和特异性响应 | 研究仅在小鼠模型中进行初步评估,尚未在人体中进行验证 | 开发一种基于Bacteroides thetaiotaomicron的生物传感器,用于体内诊断结肠炎 | Bacteroides thetaiotaomicron和小鼠溃疡性结肠炎模型 | 合成生物学 | 结肠炎 | 合成生物学技术、微生物全细胞生物传感器 | 微生物全细胞生物传感器(MWCB) | 生物传感器响应数据 | 化学诱导的小鼠溃疡性结肠炎模型 |
134 | 2025-05-29 |
Construction and Characterization of MoClo-Compatible Vectors for Modular Protein Expression in E. coli
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00564
PMID:39801078
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研究论文 | 本研究构建并表征了与MoClo兼容的低拷贝和中拷贝载体,扩展了现有的MoClo工具包,用于在大肠杆菌中实现模块化蛋白质表达 | 扩展了现有的MoClo工具包,增加了低拷贝(p15A)和中拷贝(pBR322)载体,实现了蛋白质表达范围覆盖500倍的荧光输出差异 | 研究仅限于大肠杆菌系统,未在其他宿主中验证载体的适用性 | 开发兼容MoClo的载体系统,优化蛋白质表达水平 | 大肠杆菌中的蛋白质表达 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆, MoClo技术 | NA | DNA构建体, 荧光输出数据 | NA |
135 | 2025-05-29 |
Microbial Production of Ectoine: A Review
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00490
PMID:39834017
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review | 本文综述了微生物生产四氢嘧啶的策略,包括野生菌株筛选、突变育种和模型菌株的代谢工程 | 综述了利用合成生物学和代谢工程技术替代传统嗜盐细菌生产四氢嘧啶的方法,提高产量且环保 | NA | 探讨更经济高效的四氢嘧啶生产方法以满足市场需求 | 四氢嘧啶及其微生物生产 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
136 | 2025-05-29 |
Do the Shuffle: Expanding the Synthetic Biology Toolkit for Shufflon-like Recombination Systems
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00790
PMID:39869770
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研究论文 | 本文研究了天然DNA倒位系统在合成生物学中的应用,特别是Shufflon倒位酶(SI)的改进和扩展 | 鉴定了14个先前未经测试的SI基因及其位点,并开发了一种基于单分子测序的测定方法,以量化这些酶的倒位速率并确定正交SI/位点对 | 研究中仅使用了公开数据库中的SI基因,可能未涵盖所有潜在的SI基因 | 扩展合成生物学工具箱,改进Shufflon倒位酶的应用 | Shufflon倒位酶(SI)基因及其识别位点 | 合成生物学 | NA | 单分子测序 | NA | DNA序列数据 | 14个SI基因 |
137 | 2025-05-29 |
Cell-Free Systems to Mimic and Expand Metabolism
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00729
PMID:39878226
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research paper | 该文章探讨了无细胞合成生物学在代谢和遗传程序中的应用及其扩展潜力 | 将无细胞系统用于原型化代谢路径和设计新型反应网络,以探索非自然化学反应和替代代谢路径 | 目前仅探索了无细胞系统中代谢可能性的一小部分,且主要依赖模式生物的提取物 | 理解和工程化基于生物的化学转化 | 无细胞系统及其在代谢和遗传程序中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞合成生物学技术 | NA | NA | NA |
138 | 2025-05-29 |
Considerations for Domestication of Novel Strains of Filamentous Fungi
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00672
PMID:39883596
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综述 | 本文探讨了丝状真菌作为生物技术资源的潜力及其驯化新菌株的考虑因素 | 综述了利用合成生物学和系统生物学工具开发丝状真菌作为微生物细胞工厂的新方法 | 未提及具体实验数据或案例研究 | 探讨丝状真菌在生物技术应用中的潜力和挑战 | 丝状真菌 | 生物技术 | NA | 合成生物学、系统生物学 | NA | NA | NA |
139 | 2025-05-29 |
Characterization of Rationally Designed CRISPR/Cas9-Based DNA Methyltransferases with Distinct Methyltransferase and Gene Silencing Activities in Human Cell Lines and Primary Human T Cells
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00569
PMID:39898483
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研究论文 | 本文描述了通过合理设计CRISPR/Cas9基础的DNA甲基转移酶,在人类细胞系和原代人类T细胞中实现不同的甲基化和基因沉默活性 | 通过突变DNMT3A的催化核心,稳定了dCas9-DNMT3A/3L融合蛋白在Jurkat T细胞中的表达,同时保持了DNA甲基化和基因沉默性能 | 研究主要局限于细胞系和原代T细胞,可能限制了在其他细胞类型中的适用性 | 扩展表观遗传编辑工具包,为工程化dCas基础的DNMTs在原代哺乳动物细胞类型中的应用提供路线图 | 人类细胞系和原代人类T细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, DNA甲基化 | dCas9-DNMT3A/3L | 基因表达和DNA甲基化数据 | 多种人类细胞系和供体来源的人类T细胞 |
140 | 2025-05-29 |
DRIMS: A Synthetic Biology Platform that Enables Deletion, Replacement, Insertion, Mutagenesis, and Synthesis of DNA
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00649
PMID:39902634
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研究论文 | 介绍了一种名为DRIMS的合成生物学平台,该平台能够高效地进行DNA的删除、替换、插入、突变和合成 | DRIMS平台通过PCR技术实现DNA的多种修改和合成,无需依赖recA重组途径,且操作简单、成本低、速度快 | 未提及平台在大规模或复杂DNA序列处理中的表现 | 开发一种高效、简单、经济的DNA修改和合成平台,以加速合成生物学领域的发展及治疗策略的开发 | DNA序列 | 合成生物学 | 癌症 | PCR | NA | DNA序列数据 | 进行了多种DNA修改和合成实验,包括4次删除、64次替换、4次嵌合抗原受体组件替换、51次人工microRNA插入、5种点突变及8段DNA序列合成 |