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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1381 | 2025-10-05 |
Synthetic transcription factors establish the function of nine amino acid transactivation domains of Komagataella phaffii Mxr1
2025-Mar, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.108211
PMID:39855340
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研究论文 | 本研究通过构建合成转录因子系统性地表征了Komagataella phaffii酵母Mxr1转录因子中的9个氨基酸反式激活结构域的功能 | 首次在K. phaffii锌指转录因子中全面表征9aaTADs功能,发现其中10个具有活性并揭示其通过Gcn5介导的组蛋白乙酰化机制发挥作用 | 仅研究了Mxr1转录因子中的9aaTADs,其他类型转录因子的类似结构域功能尚未探索 | 阐明K. phaffii酵母Mxr1转录因子中多个9个氨基酸反式激活结构域的功能特性和作用机制 | Komagataella phaffii酵母Mxr1转录因子及其21个推测的9aaTADs | 合成生物学 | NA | 合成转录因子构建、基因敲除、功能互补实验 | NA | 基因表达数据、生长表型数据 | 21个推测的9aaTADs和1个已知TAD A | 合成转录因子设计 | Komagataella phaffii | 由Mxr1ZF DNA结合结构域与多个9aaTADs组合构成的合成转录因子系统 | 工业生物技术 |
| 1382 | 2025-04-09 |
Advancing microbial engineering through synthetic biology
2025-Mar, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2503100
PMID:40195840
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1383 | 2025-04-05 |
Editorial: Microbial co-cultures: a new era of synthetic biology and metabolic engineering, volume II
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1587450
PMID:40182290
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1384 | 2025-10-05 |
DNA Origami - Lipid Membrane Interactions Controlled by Nanoscale Sterics
2024-10, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202404720
PMID:39162223
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研究论文 | 本研究探讨了DNA纳米结构与脂质膜相互作用的立体效应控制机制 | 首次系统研究了DNA纳米结构锚点立体环境对膜相互作用的影响,揭示了局部纳米尺度形态比全局囊泡尺寸更关键的作用机制 | 研究仅针对四种特定立体环境,尚未涵盖所有可能的几何构型 | 阐明DNA纳米结构与双层膜相互作用的立体控制原理 | 具有不同立体环境膜锚点的3D DNA纳米结构和不同尺寸的膜囊泡 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术 | NA | 实验数据 | 四种不同立体环境的DNA纳米结构锚点 | DNA折纸技术 | NA | 膜相互作用控制系统 | 生物传感,诊断,合成生物学 |
| 1385 | 2025-10-05 |
Soft Synthetic Cells with Mobile Membrane Ligands for Ex Vivo Expansion of Therapy-Relevant T Cell Phenotypes
2024-09, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202401844
PMID:38751204
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研究论文 | 开发了一种基于液-液相分离液滴支撑脂质双层的软合成细胞技术,用于体外扩增治疗相关T细胞表型 | 首次将侧向配体流动性作为T细胞体外扩增技术设计的第三关键维度,并揭示了其在调节T细胞表型和激活中的重要作用 | NA | 开发更接近体内T细胞激活的体外扩增技术 | 治疗相关的T细胞表型,特别是调节性CD8 T细胞 | 合成生物学 | 免疫相关疾病 | 液-液相分离技术,脂质双分子层技术 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | 人工抗原呈递细胞设计 | 医学 |
| 1386 | 2025-10-05 |
Engineering Protocell Networks for Prototissue Development
2025-Apr-03, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202500376
PMID:40177794
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综述 | 探讨将原始细胞组装成原始组织的方法及其在模拟生物组织结构和功能方面的应用 | 系统总结了多种原始细胞模型的空间组织方法及其集体行为特征 | NA | 构建功能化原始组织系统以模拟生物组织的层次结构和复杂功能 | 脂质囊泡、聚合物囊泡、蛋白质体、无膜凝聚层和乳液滴等原始细胞模型 | 合成生物学 | NA | 化学和物理空间组织方法 | NA | NA | NA | NA | NA | 原始细胞网络 | 生物医学,再生医学 |
| 1387 | 2025-10-05 |
Polymerase-Based Signal Delay for Temporally Regulating DNA Involved Reactions, Programming Dynamic Molecular Systems, and Biomimetic Sensing
2024-08, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202400142
PMID:38676334
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研究论文 | 本研究开发了一种基于DNA聚合酶的信号延迟系统,用于调控DNA参与反应的时序行为 | 首次通过分子动力学模拟和荧光分析表征DNA聚合酶活性,开发了通过引物悬垂、抑制剂和模板长度调控信号延迟的新策略 | 信号延迟时间范围有限(10分钟至10分钟),在活细胞内的应用效果尚未验证 | 开发能够精确操控分子信号时序行为的仿生分子系统 | DNA聚合酶催化的引物延伸和DNA链置换反应 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟,荧光分析,等温DNA扩增 | NA | 分子模拟数据,荧光信号数据 | NA | DNA聚合酶,DNA模板设计 | 无细胞系统 | 信号延迟电路,动态分子信号系统,条形码检测系统 | 无细胞合成生物学,仿生传感 |
| 1388 | 2025-10-05 |
Synthetic Cells from Droplet-Based Microfluidics for Biosensing and Biomedical Applications
2024-08, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202400086
PMID:38563581
|
综述 | 本文综述了基于液滴微流控技术制备合成细胞的方法及其在生物传感和生物医学领域的应用 | 系统整合微流控技术与自下而上合成生物学方法,实现从简单结构到高阶结构的可重复、可调控批量合成细胞构建 | NA | 探讨微流控技术在合成细胞制备及其生物医学应用中的研究进展 | 合成细胞(脂质体、聚合物囊泡、凝聚微滴和胶体体) | 合成生物学 | NA | 液滴微流控技术 | NA | NA | NA | 微流控芯片 | NA | 模拟天然细胞代谢、刺激响应、基因表达等功能的生物模拟系统 | 生物传感, 生物医学 |
| 1389 | 2025-10-05 |
Evolution and Impact of Imine Reductases (IREDs) Research: A Knowledge Mapping Approach
2025-Apr-02, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-025-01421-9
PMID:40172741
|
研究论文 | 通过文献计量学和知识图谱方法分析亚胺还原酶(IREDs)研究的发展历程和研究格局 | 首次通过文献计量学方法对IREDs研究领域进行可视化分析,揭示该领域的发展轨迹和研究热点 | 仅基于Web of Science数据库的239篇文献进行分析,可能存在文献覆盖不全的局限 | 探索IREDs研究的整体格局和演进路径 | 2010-2024年间发表的239篇IREDs相关研究论文和综述 | 生物信息学 | NA | 文献计量分析、知识图谱构建 | NA | 文献数据 | 239篇研究论文和综述 | NA | NA | NA | 医药 |
| 1390 | 2025-10-05 |
[Preface for special issue on AI-driven biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250197
PMID:40170303
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前言 | 本期特刊聚焦人工智能驱动的生物制造领域,综述其发展机遇、挑战与现状,并展望未来发展趋势 | 探讨系统生物学与合成生物学快速发展背景下,生物大数据和信息技术与生物技术的深度融合 | NA | 把握人工智能驱动生物制造的创新发展,为促进该领域技术创新和产业发展提供参考 | 生物制造领域的技术方法和发展趋势 | 生物制造 | NA | 系统生物学、合成生物学、人工智能技术 | NA | 生物大数据 | NA | NA | NA | 生物部件、电路和人工细胞的智能设计与构建 | 工业生物技术 |
| 1391 | 2025-10-05 |
Engineering Material Properties of Transcription Factor Condensates to Control Gene Expression in Mammalian Cells and Mice
2024-09, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202311834
PMID:38573961
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研究论文 | 通过调控转录因子凝聚物的材料性质来控制哺乳动物细胞和小鼠中的基因表达 | 首次系统研究转录因子凝聚物材料性质对基因表达的影响,发现液态凝聚物增强基因表达而固态凝聚物抑制基因表达 | NA | 探索生物分子凝聚物材料性质对基因表达调控的影响机制 | 哺乳动物细胞和小鼠模型中的转录因子凝聚物 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 基因表达数据 | NA | 光遗传学 | 哺乳动物细胞, 小鼠 | 转录因子凝聚物调控系统 | 医学, 合成生物学 |
| 1392 | 2025-10-05 |
Poplar transformation with variable explant sources to maximize transformation efficiency
2025-01-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-81235-y
PMID:39779752
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研究论文 | 本研究通过比较杨树不同外植体来源的再生和转化效率,探索提高植物遗传转化效率的新途径 | 首次系统比较杨树地上和地下器官外植体的再生能力与转化效率,发现根外植体具有显著再生潜力,并通过转录组分析揭示了相关基因表达机制 | 研究仅针对杨树这一木本多年生生物能源作物,结果可能不适用于其他植物物种 | 提高植物遗传转化效率,最大化植物材料利用率 | 杨树的不同外植体类型(叶、茎、叶柄和根) | 合成生物学 | NA | 农杆菌介导的植物转化、转录组分析 | NA | 基因表达数据、转录组数据、形态观察数据 | 杨树的四种不同外植体类型 | 农杆菌介导转化 | 杨树 | NA | 能源, 工业生物技术 |
| 1393 | 2025-10-05 |
Scaling-up molecular logic to meso-systems via self-assembly
2025-Mar-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58379-0
PMID:40148329
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研究论文 | 通过自组装将分子逻辑计算扩展到介观系统,展示膜结构可作为Reset-Set触发器并集成其他逻辑元件 | 首次实现人工分子基介观系统本征执行逻辑运算,将分子逻辑计算扩展到连续尺寸范围 | NA | 开发能够在介观尺度执行逻辑运算的分子自组装系统 | 环芳烃八羧酸盐和阳离子表面活性剂的自组装系统 | 合成生物学 | NA | 自组装技术 | Reset-Set触发器,逻辑元件 | NA | NA | NA | NA | Reset-Set触发器集成7个逻辑元件 | 生物学,合成生物学 |
| 1394 | 2025-10-05 |
The Transformation Experiment of Frederick Griffith I: Its Narrowing and Potential for the Creation of Novel Microorganisms
2025-Mar-20, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering12030324
PMID:40150788
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研究论文 | 本文探讨了Frederick Griffith转化实验的演变过程及其在创造新型微生物方面的潜力 | 分析了经典转化实验设计从考虑结构和控制信息到仅关注蛋白质合成指导信息的演变过程 | 未提供具体的实验数据验证转化在创造新型微生物中的实际应用潜力 | 研究转化实验方法在合成生物学中创造新型微生物的潜力 | 肺炎球菌转化实验及其演变 | 合成生物学 | NA | 基因组转化技术 | NA | 文献分析 | NA | NA | 肺炎球菌 | NA | 工业生物技术 |
| 1395 | 2025-10-05 |
Exploration and mutagenesis of the germacrene A synthase from Solidago canadensis to enhance germacrene A production in E. coli
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.015
PMID:40151792
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研究论文 | 通过探索和诱变加拿大一枝黄花中的germacrene A合酶,在大肠杆菌中提高germacrene A产量 | 结合分子对接和系统发育分析确定关键残基进行诱变,获得产量提高近10倍的Y376L突变体 | NA | 构建高产germacrene A的萜类化合物底盘细胞 | 加拿大一枝黄花中的germacrene A合酶(ScGAS) | 合成生物学 | 癌症 | 分子对接、系统发育分析、定点诱变 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 异源MVA途径、germacrene A生物合成途径 | 医药 |
| 1396 | 2025-10-05 |
Anti-Cancer Strategies Using Anaerobic Spore-Forming Bacteria Clostridium: Advances and Synergistic Approaches
2025-Mar-14, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life15030465
PMID:40141809
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综述 | 本文综述了利用厌氧孢子形成细菌梭菌的抗癌策略进展及其与现有疗法的协同作用 | 探讨了基于梭菌疗法在实体瘤缺氧微环境中的独特靶向优势,以及通过合成生物学手段进行基因改造增强其治疗潜力 | 尽管临床前和临床研究显示前景,但仍存在持续挑战需要解决 | 评估梭菌在癌症治疗中的潜力及与其他疗法的协同效应 | 厌氧孢子形成细菌梭菌及其在癌症治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因改造技术 | NA | NA | NA | NA | 梭菌 | 通过去除α毒素基因等遗传修饰增强治疗安全性 | 医学 |
| 1397 | 2025-10-05 |
Engineering Useful Microbial Species for Pharmaceutical Applications
2025-Mar-05, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13030599
PMID:40142492
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综述 | 本文全面探讨微生物工程在制药生物技术领域的最新进展,包括关键技术突破、监管挑战和未来发展前景 | 整合CRISPR-Cas系统、合成生物学与人工智能技术,系统优化微生物菌株用于药物生产 | 代谢通路优化效率不足、工业规模生产可持续性挑战、国际监管要求达标困难 | 通过微生物工程技术创新推动制药生物技术发展 | 工程化微生物菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统, 合成生物学, 人工智能, 机器学习 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 代谢通路优化, 合成生物学通路 | 医药 |
| 1398 | 2025-10-05 |
Where Biology Meets Engineering: Scaling Up Microbial Nutraceuticals to Bridge Nutrition, Therapeutics, and Global Impact
2025-Mar-02, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13030566
PMID:40142459
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综述 | 探讨微生物平台在营养保健品生产中的变革性作用及其对全球健康的影响 | 系统阐述微生物生物技术作为传统营养保健品可持续替代方案的创新潜力,整合CRISPR/Cas9基因组编辑与组学技术等前沿方法 | NA | 分析微生物营养保健品的规模化生产策略及其应对全球营养与慢性病挑战的潜力 | 微生物平台生产的营养保健品(如多不饱和脂肪酸、生物活性肽) | 合成生物学 | 肥胖, 糖尿病, 心血管疾病, 癌症 | 发酵技术, 合成生物学, 代谢工程, 基因组编辑, 组学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物细胞 | 代谢通路工程 | 医药, 食品 |
| 1399 | 2025-10-05 |
Alien Chromosome Serves as a Novel Platform for Multiple Gene Expression in Kluyveromyces marxianus
2025-Feb-25, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13030509
PMID:40142402
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研究论文 | 本研究探索利用外来染色体R1作为新型平台在马克斯克鲁维酵母中实现多基因稳定整合与表达 | 首次利用外来染色体作为多基因表达平台,通过删除必需基因并补充功能实现无选择压力下的稳定遗传 | NA | 开发马克斯克鲁维酵母中多基因表达的稳定平台 | 马克斯克鲁维酵母和外来染色体R1 | 合成生物学 | NA | 染色体工程、基因替换 | NA | 基因表达数据 | NA | 基因替换、染色体转移 | Kluyveromyces marxianus | 多基因表达平台、代谢通路工程 | 工业生物技术 |
| 1400 | 2025-10-05 |
Triblock Proteins with Weakly Dimerizing Terminal Blocks and an Intrinsically Disordered Region for Rational Design of Condensate Properties
2024-03, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202306817
PMID:37964343
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研究论文 | 本研究通过蛋白质工程构建具有可调末端二聚化能力的三嵌段蛋白质,用于理性设计生物凝聚体的性质 | 提出通过调控末端结构域的二聚化强度来调节凝聚体形成倾向的新设计原理,同时保持内在无序区域不变 | 末端结构域二聚化强度与扩散速率等物理性质无直接相关性,这些性质需从组成区块的特性和相互作用中理解 | 开发可预测和理性设计功能性生物凝聚体的蛋白质设计方法 | 三嵌段蛋白质结构(包含折叠蛋白质末端区块和内在无序中间区域) | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程 | NA | 蛋白质结构数据、解离常数测量数据 | 一组适合作为末端区块的蛋白质 | NA | NA | 三嵌段蛋白质结构设计,包含弱二聚化末端区块和内在无序区域 | 生物合成材料,合成生物学 |