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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1401 | 2025-10-05 |
dTSR enables efficient improvement of heterologous production of spinosad in Saccharopolyspora erythraea
2025-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.003
PMID:40337009
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研究论文 | 开发了一种名为dTSR的双重转座和位点特异性重组方法,用于提高多杀菌素在Saccharopolyspora erythraea中的异源产量 | 首次开发dTSR方法实现细菌附着位点和两个拷贝的多杀菌素生物合成基因簇在染色体不同位置的随机整合 | 研究主要针对多杀菌素在稀有放线菌中的生产,方法在其他系统中的适用性尚未验证 | 提高多杀菌素在异源宿主中的产量 | 多杀菌素生物合成基因簇和Saccharopolyspora erythraea宿主菌 | 合成生物学 | NA | 双重转座和位点特异性重组(dTSR) | NA | 发酵产量数据 | 多轮TSR育种产生的多个工程菌株 | 位点特异性重组 | Saccharopolyspora erythraea | 多杀菌素生物合成基因簇的异源表达 | 农业 |
| 1402 | 2025-10-05 |
Advances in innovative extraction techniques for polysaccharides, peptides, and polyphenols from distillery by-products: Common extraction techniques, emerging technologies, and AI-driven optimization
2025-Jun-01, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2025.143326
PMID:39986087
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综述 | 本文综述了从酿酒副产物中提取多糖、肽和多酚的创新提取技术进展,包括传统方法、新兴技术及人工智能优化策略 | 系统比较了酶法、超声辅助、微波辅助等新兴提取技术,并首次探讨了合成生物学和人工智能在提取工艺优化中的应用潜力 | 未提供具体实验数据验证不同提取技术的实际效果比较 | 促进酿酒行业可持续发展,实现副产物高值化利用 | 酿酒副产物(酒糟、酒精废液、葡萄酒渣)中的生物活性物质(多糖、肽、多酚) | 工业生物技术 | NA | 酶法提取、超声辅助提取、微波辅助提取、超临界流体萃取、加压液体萃取、脉冲电场、合成生物学 | 机器学习、人工智能 | 工艺参数数据 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 工业 biotechnology, 食品, 环境 |
| 1403 | 2025-10-05 |
Engineering advanced bacterial therapy for tumor and inflammatory diseases
2025-May-15, International journal of pharmaceutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.ijpharm.2025.125585
PMID:40216039
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综述 | 本文系统总结了工程化细菌疗法在肿瘤和炎症疾病治疗中的优势、工程策略及应用前景 | 探索口服工程菌在胃肠道肿瘤和炎症疾病治疗中的潜力与前景 | 讨论了当前工程化细菌疗法存在的局限性和挑战 | 总结工程化细菌疗法在疾病治疗中的优势和应用策略 | 工程化细菌疗法 | 合成生物学 | 肿瘤, 炎症疾病 | 遗传重编程, 表面化学修饰 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 功能重组, 时空精准控制 | 医学 |
| 1404 | 2025-10-05 |
Biosynthesis and bioactivities of triterpenoids from Centella asiatica: Challenges and opportunities
2025 May-Jun, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108541
PMID:39978422
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综述 | 本文综述了积雪草中三萜类化合物的生物合成途径、生物活性及生物技术生产策略 | 系统总结了积雪草三萜类化合物的生物合成途径,并提出基于合成生物学和微生物细胞工厂的可持续生产指南 | NA | 探讨积雪草三萜类化合物的生物技术生产策略及未来发展方向 | 积雪草中的三萜类化合物(积雪草酸、羟基积雪草酸、积雪草苷、羟基积雪草苷) | 合成生物学 | NA | 植物组织培养、微生物细胞工厂构建 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物细胞 | 三萜类化合物生物合成途径 | 医药 |
| 1405 | 2025-10-05 |
Emerging biotechnological strategies advancing biological lignin valorization towards polyhydroxyalkanoates
2025-May, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132278
PMID:39986625
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综述 | 本文探讨了通过微生物将木质素转化为聚羟基脂肪酸酯(PHA)的生物技术策略 | 整合微生物PHA合成与木质素生物转化,促进木质素高值化和PHA可持续生产 | 木质素的顽固性和异质性对微生物降解和高值化利用构成重大挑战 | 推动木质素生物高值化转化为聚羟基脂肪酸酯 | 木质素和聚羟基脂肪酸酯(PHA) | 工业生物技术 | NA | 合成生物学技术,代谢调控策略 | NA | NA | NA | NA | 多种微生物 | NA | 能源, 材料, 环境 |
| 1406 | 2025-10-05 |
A review of MicroRNAs and flavonoids: New insights into plant secondary metabolism
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142518
PMID:40157676
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综述 | 系统探讨microRNAs与类黄酮代谢的调控关系及其在代谢工程中的应用前景 | 提出“miRNA-多因子协同网络”概念,整合CRISPR/Cas13、合成生物学与人工智能等跨学科技术优化类黄酮代谢 | NA | 深入理解植物次生代谢调控机制并提升类黄酮工业化生产能力 | 植物microRNAs与类黄酮代谢途径 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas技术、多组学技术、人工智能 | NA | 组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR/Cas13 | 植物 | 类黄酮代谢通路工程 | 医药, 农业, 工业生物技术, 食品 |
| 1407 | 2025-10-05 |
Rational design of terminal deoxynucleotidyl transferase for RNA primer elongation
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142712
PMID:40174852
|
研究论文 | 通过理性设计末端脱氧核苷酸转移酶的引物识别位点,实现RNA引物的高效延伸 | 首次成功改造TdT酶的引物识别位点,将RNA引物延伸效率从20%提升至90%以上 | 未提及大规模生产应用验证 | 开发能够高效延伸RNA引物的工程化酶工具 | 末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)及其突变体 | 合成生物学 | NA | 理性设计、酶工程、反应动力学评估 | NA | 酶活性数据、反应动力学数据 | 多种RNA引物集合 | 理性设计 | NA | RNA编辑酶设计 | 医学,合成生物学 |
| 1408 | 2025-10-05 |
Silaffins as functional biomacromolecules in regulating frustule morphogenesis and biosilica properties
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143105
PMID:40222518
|
研究论文 | 本研究通过基因过表达和CRISPR/Cas9介导的敲除方法,揭示了硅藻中silaffin蛋白TpSil1和TpSil3在硅质细胞壁形态发生和生物硅特性调控中的具体功能 | 首次系统阐明不同silaffin蛋白在硅藻细胞壁形态发生中的特异性功能,并发现其对硅藻生理和硅质材料物理化学性质的调控作用 | 由于TpSil1和TpSil2序列高度同源,无法单独敲除TpSil1;TpSil3完全敲除可能导致致死性,无法获得双等位基因敲除突变体 | 探究silaffin蛋白在硅藻硅质细胞壁形态发生和生物硅特性调控中的具体功能 | 模型生物假微型海链藻(Thalassiosira pseudonana)及其silaffin蛋白TpSil1和TpSil3 | 合成生物学 | NA | 基因过表达、CRISPR/Cas9介导的基因敲除、形态学分析 | NA | 形态学数据、生理学数据、材料特性数据 | 假微型海链藻野生型和基因工程改造菌株 | CRISPR-Cas9 | 假微型海链藻 | 基因过表达和敲除系统 | 材料,医药,能源,工业生物技术 |
| 1409 | 2025-10-05 |
The CpG Landscape of Protein Coding DNA in Vertebrates
2025-May, Evolutionary applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/eva.70101
PMID:40330995
|
研究论文 | 通过理论分析和六种脊椎动物的全基因组数据,研究蛋白质编码DNA中CpG含量的形成机制和进化意义 | 首次系统揭示蛋白质编码序列中CpG含量显著高于非编码区,并发现CpG位点在调控功能和应激反应基因中富集 | 研究仅涵盖六种脊椎动物物种,可能无法完全代表所有脊椎动物的多样性 | 探究脊椎动物蛋白质编码基因中CpG含量的形成和维持机制 | 人类、小鼠、鸡、大山雀、青蛙和刺鱼六种脊椎动物的基因组数据 | 基因组学 | NA | 全基因组分析、DNA甲基化分析 | NA | 基因组序列数据 | 六种脊椎动物物种的全基因组数据 | NA | NA | NA | 进化生物学、育种学、合成生物学 |
| 1410 | 2025-10-05 |
The structure of the Vibrio natriegens 70S ribosome in complex with the proline-rich antimicrobial peptide Bac5(1-17)
2025-Apr-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf324
PMID:40331629
|
研究论文 | 通过冷冻电镜解析了富含脯氨酸的抗菌肽Bac5与Vibrio natriegens细菌70S核糖体的复合物结构 | 首次揭示了Bac5与核糖体的结合模式,发现其与同类肽Bac7具有完全不同的核糖体出口隧道相互作用方式 | NA | 阐明富含脯氨酸抗菌肽Bac5抑制细菌蛋白质合成的分子机制 | Vibrio natriegens细菌的70S核糖体与Bac5抗菌肽复合物 | 结构生物学 | 细菌感染 | 冷冻电镜 | NA | 结构数据 | NA | NA | Vibrio natriegens | NA | 医学 |
| 1411 | 2025-10-05 |
Recombinant human collagen XVII protects skin basement membrane integrity by inhibiting the MAPK and Wnt signaling pathways
2025-Apr, Molecular medicine reports
IF:3.4Q2
DOI:10.3892/mmr.2025.13465
PMID:39981899
|
研究论文 | 本研究探讨重组人胶原XVII通过抑制MAPK和Wnt信号通路保护皮肤基底膜完整性的机制 | 首次阐明重组人胶原XVII通过调控MAPK和Wnt信号通路保护皮肤基底膜完整性的分子机制 | 研究仅使用HaCaT角质形成细胞系,缺乏体内实验验证 | 阐明重组人胶原XVII保护皮肤基底膜完整性的功效和作用机制 | 人HaCaT角质形成细胞 | 合成生物学 | 皮肤损伤 | UVB照射、伤口愈合实验、HE染色、RT-qPCR、Western blotting、磷酸化抗体芯片 | NA | 基因表达数据、蛋白表达数据、细胞功能数据 | 人HaCaT角质形成细胞系 | 重组DNA技术 | NA | NA | 医学, 化妆品 |
| 1412 | 2025-10-05 |
MultiCRISPR-EGA: Optimizing Guide RNA Array Design for Multiplexed CRISPR Using the Elitist Genetic Algorithm
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00860
PMID:39976310
|
研究论文 | 开发基于精英遗传算法的图形界面工具MultiCRISPR-EGA,用于优化多路CRISPR引导RNA阵列设计 | 首次将精英遗传算法应用于多路gRNA阵列优化设计,通过最小自由能特征筛选更稳定的gRNA | 仅通过计算实验验证,缺乏体内实验验证 | 优化多路CRISPR引导RNA阵列设计流程,提高基因组编辑效率 | 多路引导RNA阵列 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统,CRISPR干扰(CRISPRi) | 精英遗传算法(EGA) | 基因组序列数据 | NA | CRISPR-Cas | NA | 单启动子驱动的多路gRNA阵列 | 工业生物技术 |
| 1413 | 2025-10-05 |
Intracellular protein ligation and polyprotein synthesis using an asparaginyl endopeptidase core
2025-Mar-11, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d4cc06617k
PMID:39981834
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研究论文 | 开发基于AEP1核心结构域的细胞内蛋白质连接系统,实现无需酶激活和外部连接的实时多蛋白合成 | 利用截短型AEP1核心结构域在细胞内直接连接和聚合Ig结构域,实现实时多蛋白合成 | NA | 开发新型细胞内蛋白质连接技术 | AEP1酶核心结构域和Ig结构域 | 合成生物学 | NA | 蛋白质连接技术 | NA | NA | NA | AEP1 | NA | 蛋白质连接和多聚化系统 | 生物材料,合成生物学 |
| 1414 | 2025-10-05 |
Use and dual use of synthetic biology
2025-03-07, Comptes rendus biologies
IF:0.7Q4
DOI:10.5802/crbiol.173
PMID:40052950
|
综述 | 本文回顾了合成生物学领域的历史,并分析了其双重用途风险 | 指出合成生物学的新颖性印象源于对其创建历史的快速遗忘,并强调程序(合成DNA)而非机器(底盘)是大多数工作的焦点和风险所在 | 未提出具体的风险管理方案或解决双重用途问题的具体措施 | 分析合成生物学的历史发展和双重用途风险 | 合成生物学领域及其安全风险 | 合成生物学 | NA | DNA合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1415 | 2025-10-05 |
Peptide-mediated liquid-liquid phase separation and biomolecular condensates
2025-Mar-05, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d4sm01477d
PMID:39964249
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综述 | 本文探讨肽介导的液液相分离在生物分子凝聚物形成中的分子机制及其在生物技术和医学中的应用 | 系统阐述肽介导相分离的分子机制及其可调控特性,突出肽凝聚物在生物工程领域的转化潜力 | NA | 探讨肽介导液液相分离的分子机制及其在生物技术和医学中的应用前景 | 肽介导的液液相分离过程及生物分子凝聚物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物技术 |
| 1416 | 2025-10-05 |
Innovative applications and research advances of bacterial biosensors in medicine
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1507491
PMID:40336836
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综述 | 本文综述了细菌生物传感器在医学领域的应用进展与挑战 | 系统总结了合成生物学和基因工程在细菌生物传感器设计中的突破性进展 | 讨论了细菌生物传感器在研究和应用中仍存在的挑战与障碍 | 探讨细菌生物传感器在医学诊断和治疗监测中的应用 | 细菌生物传感器 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, BioBrick | 细菌 | 生物传感器,基因表达调控回路 | 医学 |
| 1417 | 2025-10-05 |
Simultaneous selection of nanobodies for accessible epitopes on immune cells in the tumor microenvironment
2023-11-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43038-z
PMID:37978291
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研究论文 | 本研究开发了INSPIRE-seq方法,利用纳米抗体库和二代测序技术从肿瘤微环境中筛选免疫细胞结合纳米抗体 | 开发了INSPIRE-seq这一无偏倚方法,能够并行富集穿透肿瘤微环境的免疫细胞结合纳米抗体 | NA | 开发用于发现治疗性生物制剂靶向分子的技术 | 肿瘤微环境中的免疫细胞(树突状细胞等) | 合成生物学 | 肿瘤 | 二代测序,单细胞RNA测序,免疫荧光,结构建模与对接研究 | NA | 测序数据,图像数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 1418 | 2025-10-05 |
Elucidation and de novo reconstitution of glyceollin biosynthesis
2025-May-05, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.04.003
PMID:40211535
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研究论文 | 本研究阐明了大豆抗毒素甘氨酸素的完整生物合成途径,并通过合成生物学方法在酵母中实现了从头合成 | 发现了甘氨酸素生物合成中未表征的还原酶基因和五个介导氧化环化的P450酶,首次实现了甘氨酸素在酵母中的从头合成 | NA | 阐明甘氨酸素的完整生物合成途径并实现其可持续生产 | 甘氨酸素生物合成途径及相关酶基因 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达、体外酶表征、酵母喂养研究 | NA | NA | NA | 代谢工程 | 本氏烟草, 酿酒酵母 | 甘氨酸素生物合成途径 | 农业, 生物学 |
| 1419 | 2025-10-05 |
Engineering a newly identified alcohol dehydrogenase from Sphingobium Sp. for efficient utilization of nicotinamide cofactors biomimetics
2025-May-05, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-025-00870-z
PMID:40325297
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研究论文 | 本研究鉴定并改造了鞘氨醇菌来源的醇脱氢酶SpADH2,使其能高效利用烟酰胺辅因子仿生物作为辅因子 | 首次发现能利用全合成烟酰胺辅因子仿生物(tsNCBs)的天然醇脱氢酶,并通过半理性工程显著提升其催化效率和辅因子特异性 | NA | 开发能够高效利用低成本烟酰胺辅因子仿生物的醇脱氢酶 | 鞘氨醇菌来源的醇脱氢酶SpADH2及其突变体 | 合成生物学 | NA | 酶工程、半理性设计、酶催化表征 | NA | 酶活性数据、相互作用分析 | 野生型SpADH2及三个关键突变体(H43L、A290I、H43L/A290I) | 酶工程 | Sphingobium sp. SYK-6 | NA | 工业生物技术 |
| 1420 | 2025-10-05 |
Directed evolution of hydroxylase XcP4H for enhanced 5-HTP production in engineered probiotics to treat depression
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142250
PMID:40113000
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研究论文 | 通过定向进化羟化酶XcP4H并改造大肠杆菌Nissle 1917,开发能生物合成5-HTP的工程益生菌用于治疗抑郁症 | 首次将基于遗传密码扩展的高通量筛选方法应用于XcP4H的定向进化,创建了5-HTP产量提高22倍的酶变体,并构建了能同时改善肠道和大脑功能的活体治疗剂 | 研究目前仅在小鼠模型中验证效果,尚未进行人体临床试验 | 开发能有效生产5-HTP的工程益生菌,克服5-HTP药代动力学差的限制,为抑郁症治疗提供新策略 | 羟化酶XcP4H、大肠杆菌Nissle 1917、抑郁症小鼠模型 | 合成生物学 | 抑郁症 | 酶定向进化、分子动力学模拟、基因编辑、高通量筛选 | NA | 生物化学数据、行为学数据、微生物组数据 | 小鼠模型 | CRISPR-Cas9, 基因编辑 | 大肠杆菌 | 5-HTP生物合成途径 | 医药 |