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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1401 | 2024-09-02 |
From Biomass-Derived p-Hydroxycinnamic Acids to Novel Sustainable and Non-Toxic Phenolics-Based UV-Filters: A Multidisciplinary Journey
2022, Frontiers in chemistry
IF:3.8Q2
DOI:10.3389/fchem.2022.886367
PMID:35864863
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综述 | 本文综述了从生物质中提取的p-羟基肉桂酸衍生物到新型可持续且无毒的酚类紫外线过滤剂的开发过程 | 采用多学科方法,结合生物技术、绿色化学、下游工艺和光化学,将生物质特别是木质素转化为高附加值的创新紫外线过滤剂 | NA | 寻找可持续且无毒的紫外线过滤剂,以解决现有有机紫外线过滤剂的化石来源和毒性问题 | 从生物质中提取的酚类化合物及其作为紫外线过滤剂的应用 | 绿色化学 | NA | 合成生物学/发酵/在线产品回收 | NA | 生物质 | NA |
1402 | 2024-09-01 |
Engineering immune-evasive allogeneic cellular immunotherapies
2024-Sep, Nature reviews. Immunology
DOI:10.1038/s41577-024-01022-8
PMID:38658708
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研究论文 | 本文讨论了如何通过赋予同种异体T细胞和自然杀伤(NK)细胞内在的免疫逃避特性,来防止或延迟它们的免疫排斥,从而扩大治疗窗口 | 探讨了利用基因编辑和合成生物学设计基于细胞的精准免疫疗法的前景,超越了编程靶向特异性,需要仔细考虑受体中的先天和适应性反应 | NA | 旨在改善现成的同种异体细胞疗法的持久性,并设计基于细胞的精准免疫疗法 | 同种异体T细胞和NK细胞 | 免疫疗法 | 癌症 | 基因编辑和合成生物学 | NA | NA | NA |
1403 | 2024-09-01 |
Cultivation optimization promotes ginsenoside and universal triterpenoid production by engineered yeast
2024-Aug-22, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2024.08.505
PMID:39181198
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research paper | 本文通过实验设计优化发酵条件,提高了工程酵母生产人参皂苷和通用三萜类化合物的产量 | 利用合成生物学、微生物工程和配方研究,实现了可持续生产高价值化合物,如三萜类合成 | NA | 优化发酵条件以提高工程酵母生产人参皂苷和三萜类化合物的产量 | 人参皂苷和三萜类化合物 | NA | NA | 发酵 | NA | NA | NA |
1404 | 2024-09-01 |
Phase Separation in Biology and Disease; Current Perspectives and Open Questions
2023-03-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2023.167971
PMID:36690068
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综述 | 本文综述了生物分子凝聚物(biomolecular condensates)的存在、形成、生物功能及其与疾病关联的研究进展,并探讨了该领域的关键问题和未来方向 | 生物分子凝聚物通过相分离形成,这一发现革新了我们对细胞内生物分子空间和时间组织方式的理解 | 尽管在某些情况下,生物分子凝聚物的形成与生物功能之间的联系得到了严格证据的支持,但在许多其他情况下,这种联系的支持不够充分,导致了对相分离在生物学和疾病中普遍作用的合理审查 | 探讨生物分子凝聚物在多种生物过程和系统中的作用,以及其在正常和疾病细胞状态中的应用,并评估其作为治疗靶点的潜力 | 生物分子凝聚物及其在生物学和疾病中的作用 | 生物学 | 神经退行性疾病,癌症 | NA | NA | NA | NA |
1405 | 2024-09-01 |
New destination vectors facilitate Modular Cloning for Chlamydomonas
2022-Aug, Current genetics
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s00294-022-01239-x
PMID:35429260
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研究论文 | 本文介绍了通过构建新的目的载体,简化Chlamydomonas reinhardtii中Modular Cloning(MoClo)策略的基因组装步骤 | 开发了五个新的目的载体,这些载体包含抗常用抗生素的基因和一个直接组装基本遗传部件的位点,使用红色/白色颜色选择,无需昂贵的化合物如X-gal和IPTG | NA | 旨在简化Chlamydomonas reinhardtii中MoClo策略的基因组装步骤 | Chlamydomonas reinhardtii中的基因组装 | 合成生物学 | NA | Modular Cloning (MoClo) | NA | 基因 | 五个新的目的载体 |
1406 | 2024-09-01 |
Ecological firewalls for synthetic biology
2022-Jul-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104658
PMID:35832885
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研究论文 | 本文探讨了利用工程微生物菌株作为生态防火墙,保护生态系统免受不良临界点和生物多样性丧失的影响 | 提出了一种基于生态网络模式非线性吸引子动态的替代观点,设计生态防火墙执行新功能(如塑料去除),并在当地社区内实现 containment | NA | 研究如何利用工程微生物菌株保护生态系统 | 工程微生物菌株及其在生态系统中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1407 | 2024-09-01 |
Low-cost anti-mycobacterial drug discovery using engineered E. coli
2022-07-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31570-3
PMID:35798732
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research paper | 本文介绍了一种合成生物学框架,用于在工程改造的大肠杆菌中检测结核分枝杆菌(Mtb)的药物靶点,通过构建目标必需替代大肠杆菌(TESEC)模型,成功发现了一种针对Mtb丙氨酸消旋酶(Alr)的抑制剂——贝那普利。 | 本文创新性地利用工程改造的大肠杆菌作为筛选平台,替代直接使用结核分枝杆菌进行药物筛选,提高了筛选效率和安全性。 | 尽管在体外生物化学实验中验证了贝那普利的抑制机制,但尚未在临床环境中进行全面评估。 | 开发一种高效且低成本的抗结核分枝杆菌药物筛选方法。 | 结核分枝杆菌的药物靶点和潜在抑制剂。 | 合成生物学 | 结核病 | NA | 目标必需替代大肠杆菌(TESEC)模型 | NA | 涉及四种额外的目标靶点 |
1408 | 2024-09-01 |
Engineering consortia by polymeric microbial swarmbots
2022-07-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31467-1
PMID:35790722
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研究论文 | 本文展示了一种通过聚合物微胶囊封装微生物亚群来构建稳定微生物共生体的方法 | 提出了一种工程化的空间隔离方法,能够灵活精确地组装稳定的共生体 | NA | 探索合成生物学中新型的微生物共生体构建方法 | 微生物共生体的稳定性和功能性 | 合成生物学 | NA | 聚合物微胶囊技术 | NA | NA | NA |
1409 | 2024-09-01 |
Reprogramming Microbial CO2-Metabolizing Chassis With CRISPR-Cas Systems
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.897204
PMID:35814004
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综述 | 本文综述了CRISPR-Cas系统在微生物CO2代谢底盘中的应用及其在碳负性生物技术中的革命性作用 | 介绍了CRISPR-Cas系统在蓝藻、醋酸菌和甲烷菌中的最新进展,并展望了未来基于CRISPR-Cas系统的创新技术,如碱基编辑、前导编辑和转座子介导的基因组编辑 | NA | 探讨如何利用合成生物学工具,特别是CRISPR-Cas系统,开发和应用微生物CO2代谢底盘,以实现碳中和和碳负性生物技术,从而应对全球变暖问题 | 微生物CO2代谢底盘,包括蓝藻、醋酸菌和甲烷菌 | 生物技术 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA |
1410 | 2024-09-01 |
Molecular Advancements Establishing Chlamydomonas as a Host for Biotechnological Exploitation
2022, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2022.911483
PMID:35845675
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综述 | 本文综述了近期在利用莱茵衣藻作为生物技术平台的进展,包括核转基因表达的改进、MoClo合成生物学策略的应用、转基因设计和表达的优化以及CRISPR/Cas9基因编辑技术的进步。 | 文章介绍了莱茵衣藻作为生物技术平台的多个创新点,包括核转基因表达的稳定性和效率提升、MoClo合成生物学策略的发展、转基因设计的系统性改进以及CRISPR/Cas9技术的应用。 | NA | 探讨莱茵衣藻作为生物技术平台的潜力和应用前景。 | 莱茵衣藻的生物技术应用和合成生物学潜力。 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA |
1411 | 2024-08-31 |
Lipid-Based Catalysis Demonstrated by Bilayer-Enabled Ester Hydrolysis
2024-Jul-30, Membranes
IF:3.3Q2
DOI:10.3390/membranes14080168
PMID:39195420
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研究论文 | 本文展示了脂质双层膜的疏水区域为催化反应提供适宜环境的能力,并通过酯水解反应验证了这一概念 | 首次展示了脂质双层膜在生物系统中作为催化剂的可能性 | 催化反应速度比酶催化慢,催化转化数在10-7到10-8 s之间 | 探索脂质及其聚集体在生物化学、药理学和合成生物学中的催化作用 | 脂质双层膜的催化能力及其在酯水解反应中的应用 | NA | NA | H-NMR | NA | 荧光 | NA |
1412 | 2024-08-31 |
Bifurcation drives the evolution of assembly-line biosynthesis
2022-06-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-30950-z
PMID:35715397
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研究论文 | 本文探讨了生物合成装配线的重编程及其在抗生素结构进化中的作用 | 揭示了基因重复和新功能化如何导致生物合成途径的分支,以及这种分支如何促进抗生素结构的进化 | NA | 深入了解生物合成装配线的设计过程及其进化机制 | 抗结核药物wollamides的生物合成途径 | 生物技术 | 结核病 | 基因重复和新功能化 | NA | 基因组数据 | NA |
1413 | 2024-08-31 |
Chemical Communication in Artificial Cells: Basic Concepts, Design and Challenges
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.880525
PMID:35720123
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综述 | 本文综述了人工细胞间分子通信的基本概念、设计及挑战 | 强调了人工细胞间通信的重要性,并分类讨论了不同通信模式,如自分泌、邻分泌、旁分泌和内分泌信号 | NA | 探讨人工细胞间通信的设计及其在生物技术、高级胶体材料和再生医学中的应用潜力 | 人工细胞间的分子通信 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1414 | 2024-08-30 |
Multi-modal deep learning enables efficient and accurate annotation of enzymatic active sites
2024-Aug-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51511-6
PMID:39187482
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研究论文 | 介绍了一种名为EasIFA的酶活性位点注释算法,该算法结合了蛋白质语言模型和3D结构编码器的潜在酶表示,并通过多模态交叉注意力框架将蛋白质级信息与酶反应知识对齐 | EasIFA算法在速度和准确性上均优于现有算法,实现了10倍的加速和显著的性能提升 | NA | 开发一种高效且准确的酶活性位点注释算法,以推动药物发现、疾病研究、酶工程和合成生物学等多个领域的发展 | 酶活性位点的自动注释 | 机器学习 | NA | 多模态深度学习 | 多模态交叉注意力框架 | 蛋白质结构数据 | NA |
1415 | 2024-08-30 |
Synthetic spatial patterning in bacteria: advances based on novel diffusible signals
2022-06, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13979
PMID:34843638
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综述 | 本文综述了细菌中合成空间模式化的进展,特别是基于新型可扩散信号的研究 | 介绍了新的潜在候选小分子信号,这些信号可以调节大肠杆菌中的基因表达,有助于合成生物学家设计更复杂、稳健和可调的空间结构 | NA | 探讨工程化多细胞模式化在理解模式形成基本规律中的作用,并可能对发育生物学领域做出贡献 | 细菌中的合成空间模式化 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1416 | 2024-08-30 |
Phylogeny-Informed Synthetic Biology Reveals Unprecedented Structural Novelty in Type V Glycopeptide Antibiotics
2022-May-25, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.1c01389
PMID:35647273
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研究论文 | 本文通过结合系统发育引导的基因组挖掘策略和异源生产技术,利用GPAHex合成生物学平台,发现了五种新型V型糖肽抗生素,并对其结构和生物活性进行了表征 | 本文发现了具有前所未有结构新颖性的V型糖肽抗生素,包括rimomycin和misaugamycin,后者具有独特的N-C交叉连接和N-端酰化 | NA | 旨在发现能够克服糖肽抗生素抗性的新型糖肽抗生素 | 五种新型V型糖肽抗生素:rimomycin-A/B/C和misaugamycin-A/B | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘策略,异源生产技术 | GPAHex合成生物学平台 | 糖肽抗生素结构 | 五种新型V型糖肽抗生素 |
1417 | 2024-08-29 |
Posttranscriptional tuning of gene expression over a large dynamic range in synthetic tobacco chloroplast operons
2024-Sep, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16930
PMID:39031552
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研究论文 | 本研究探讨了烟草叶绿体中gfp报告基因的表达,通过使用叶绿体atpH 5' UTR的变体,揭示了内源性烟草PPR10在不同设计背景下与烟草和玉米atpH 5' UTR结合时对报告基因激活的不同水平 | 研究发现了PPR10通过一种独立于其稳定单顺反子转录本的机制激活翻译,并且引入tRNA上游的UTR几乎消除了gfp mRNA和GFP蛋白,这表明tRNA促进了RNA切割和5'外切核酸酶降解,导致PPR10没有足够时间结合和保护gfp RNA | NA | 探索在合成烟草叶绿体操纵子中实现基因表达的转录后调控 | gfp报告基因在烟草叶绿体中的表达 | 合成生物学 | NA | NA | NA | RNA | 不同设计的烟草和玉米atpH 5' UTR变体 |
1418 | 2024-08-29 |
A Self-Assembling γPFD-SpyCatcher Hydrogel Scaffold for the Coimmobilization of SpyTag-Enzymes to Facilitate the Catalysis of Regulated Enzymes
2024-Aug-28, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c03403
PMID:39194331
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研究论文 | 本研究建立了一种能够自发组装的γPFD-SpyCatcher水凝胶支架,用于共固定化SpyTag-酶,以促进受调控酶的催化作用 | 该研究展示了γPFD-SpyCatcher水凝胶在提高酶的热稳定性和pH稳定性的同时,还能快速提供纯酶,并在体外实验中显著提高了酶的活性 | NA | 探索γPFD-SpyCatcher水凝胶在共固定化酶中的应用,以提高酶的稳定性和活性 | γPFD-SpyCatcher水凝胶、SpyTag-酶(如SpyTag-己糖激酶、SpyTag-磷酸果糖激酶和SpyTag-丙酮酸激酶) | 生物技术 | NA | 水凝胶技术 | NA | 酶活性数据 | NA |
1419 | 2024-08-28 |
Over the rainbow: structural characterization of the chromoproteins gfasPurple, amilCP, spisPink and eforRed
2022-May-01, Acta crystallographica. Section D, Structural biology
DOI:10.1107/S2059798322002625
PMID:35503208
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研究论文 | 本文介绍了四种开放源代码的色蛋白gfasPurple、amilCP、spisPink和eforRed的高分辨率X射线晶体结构 | 首次提供了这四种色蛋白的高分辨率结构信息,有助于蛋白质工程和合成生物学应用 | 色蛋白在合成生物学中的应用不如相关荧光蛋白广泛,部分原因是缺乏结构表征 | 研究色蛋白的结构特性,以促进其在蛋白质工程和合成生物学中的应用 | gfasPurple、amilCP、spisPink和eforRed四种色蛋白 | 合成生物学 | NA | X射线晶体学 | NA | 蛋白质结构 | 四种色蛋白 |
1420 | 2024-08-28 |
Engineering Light-Control in Biology
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.901300
PMID:35573251
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综述 | 本文综述了在生物学中利用工程技术创建和优化光调控蛋白的方法 | 探讨了通过蛋白质工程和合成生物学方法开发新型光遗传蛋白的创新策略 | 并非对光敏感调节剂的百科全书式总结,而是通过选定实例讨论光调控蛋白工程的重要方面 | 旨在讨论通过选定实例进行光调控蛋白工程的重要方面 | 光遗传蛋白的开发和优化 | 生物工程 | NA | 光遗传学 | NA | 蛋白质 | NA |