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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1421 | 2025-10-05 |
Rational evolution for altering the ligand preference of estrogen receptor alpha
2024-Apr, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.4940
PMID:38511482
|
研究论文 | 通过理性蛋白质设计和定向进化开发了对它莫西芬响应的雌激素受体α变体TERRA | 结合理性蛋白质设计与多点位定向诱变,在酿酒酵母中通过定向进化成功改变了雌激素受体α的配体偏好性 | NA | 改变雌激素受体α的配体偏好性以扩展合成生物学工具的应用范围 | 雌激素受体α及其变体TERRA | 合成生物学 | 乳腺癌 | 理性蛋白质设计、多点位定向诱变、定向进化 | NA | NA | NA | 定向进化 | 酿酒酵母, 哺乳动物细胞, 小鼠 | 配体响应型受体设计 | 医学, 合成生物学 |
| 1422 | 2025-10-05 |
Between Centralization and Fragmentation: The Past, Present, and Future of Phage Collections
2024-Mar, PHAGE (New Rochelle, N.Y.)
DOI:10.1089/phage.2023.0043
PMID:40114810
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综述 | 回顾噬菌体保藏库的历史与现状,探讨集中化与碎片化之间的平衡及其未来发展 | 首次系统梳理噬菌体保藏库的演变历程,并提出在合成生物学和人工智能引发范式转变前建立可持续、互联、公平的噬菌体银行基础设施 | 仅提供非详尽的噬菌体保藏库概览,未涉及具体技术实施方案 | 分析噬菌体保藏库的发展困境并探索未来建设方向 | 噬菌体保藏库和微生物保藏库 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 1423 | 2025-10-05 |
Biosynthesis and metabolic engineering of natural sweeteners
2025-Mar-18, AMB Express
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s13568-025-01864-y
PMID:40100508
|
综述 | 本文总结了天然甜味剂的生物合成途径及相关酶,并重点介绍了利用合成生物学方法通过微生物细胞工厂生产天然甜味剂的研究进展 | 系统梳理了多种天然甜味剂的生物合成途径和酶学机制,并整合了合成生物学在天然甜味剂微生物生产中的最新应用 | NA | 为未来天然甜味剂的生产研究提供参考 | 莫诺苷、甜菊糖苷、甘草甜素、甘草次酸、根皮苷、三叶草苷、赤藓糖醇、山梨糖醇、甘露醇、索马甜、莫内林和布拉齐因等天然甜味剂 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | 微生物 | 天然甜味剂生物合成途径 | 食品, 工业生物技术 |
| 1424 | 2025-03-22 |
Preface to the special issue "Synthetic Biology and Bioproduction in Plants"
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1425 | 2025-10-05 |
Modulating ion channels with nanobodies
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.005
PMID:40103710
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综述 | 本文综述了纳米抗体在调控离子通道功能方面的最新研究进展和应用潜力 | 纳米抗体凭借其小尺寸、高特异性和识别隐蔽表位的能力,为离子通道研究提供了优于传统抗体的新工具 | NA | 探讨纳米抗体在离子通道结构功能研究和治疗干预中的潜在应用 | 离子通道和纳米抗体 | 合成生物学 | NA | 纳米抗体技术 | NA | NA | NA | NA | 骆驼科动物 | NA | 医学 |
| 1426 | 2025-10-05 |
Microalgae in health care and functional foods: β-glucan applications, innovations in drug delivery and synthetic biology
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1557298
PMID:40103595
|
综述 | 本文全面探讨微藻在医疗保健和功能性食品中的应用,重点关注β-葡聚糖治疗、药物递送创新和合成生物学技术 | 系统整合微藻来源的β-葡聚糖(如副淀粉)在免疫调节和抗癌治疗中的应用潜力,并强调合成生物学在增强微藻治疗价值方面的创新 | 需要进一步研究解决规模化生产、监管协调和消费者接受度等问题 | 探讨微藻在医疗保健和功能性食品领域的应用潜力与发展方向 | 微藻及其生物活性化合物(β-葡聚糖、omega-3脂肪酸、抗氧化剂) | 合成生物学 | NA | 合成生物学、生物过程工程 | NA | NA | NA | NA | 微藻 | NA | 医药, 食品 |
| 1427 | 2025-10-05 |
Structure-Based Engineering of a Sesquiterpene Cyclase to Generate an Alcohol Product: Conversion of epi-Isozizaene Synthase into α-Bisabolol Synthase
2024-03-19, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.3c00681
PMID:38420671
|
研究论文 | 通过结构引导的蛋白质工程将倍半萜环化酶改造为α-红没药醇合酶 | 通过双点突变(F95S-F198S)成功将epi-异缬草烯合酶重新设计为能够生成醇类产物的α-红没药醇合酶 | 产物保真度中等(65%-74%),需要进一步优化提高特异性 | 开发可用于合成生物学应用的设计型环化酶 | 倍半萜环化酶epi-异缬草烯合酶及其突变体 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、X射线晶体学、生化表征 | NA | 结构数据、生化数据 | NA | 定点突变 | NA | 活性位点重塑以稳定中间体并定位水分子进行羟基化反应 | 工业生物技术 |
| 1428 | 2025-10-05 |
Small RNAs Turn Over a New Leaf as Morphogens
2017-11-06, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2017.10.025
PMID:29112845
|
研究论文 | 本研究通过实验证明移动小RNA梯度可通过阈值读取机制创建基因表达的锐利边界 | 首次揭示小RNA作为形态发生素通过梯度阈值机制调控基因表达边界形成 | NA | 探索小RNA梯度在植物叶片上下轴模式形成中的调控机制 | 植物叶片模式形成相关的小RNA分子 | 发育生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1429 | 2025-10-05 |
Fused radical SAM and αKG-HExxH domain proteins contain a distinct structural fold and catalyse cyclophane formation and β-hydroxylation
2024-Nov, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-024-01596-9
PMID:39294420
|
研究论文 | 本研究揭示了一种融合了自由基SAM结构域和αKG-HExxH结构域的新型蛋白质,具有独特的结构折叠并催化环芳烃形成和β-羟基化反应 | 发现了一种新型融合蛋白结构,将自由基SAM酶结构域与α-酮戊二酸非血红素铁酶结构域结合,并定义了新的αKG-HExxH酶家族 | NA | 研究含有融合结构域的新型金属蛋白的结构与功能特性 | 含有N端自由基S-腺苷甲硫氨酸结构域和C端2-组氨酸-1-羧酸盐结构域的融合蛋白 | 结构生物学 | NA | X射线晶体学 | NA | 晶体结构数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、酶学 |
| 1430 | 2025-10-05 |
Modified Tn7 transposon vectors for controlled chromosomal gene expression
2024-Oct-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01556-24
PMID:39291982
|
研究论文 | 本研究开发了改良的mini-Tn7转座子载体,通过添加诱导型和组成型启动子实现染色体整合基因的差异表达控制 | 在mini-Tn7转座子载体中整合了诱导型(Pcum)和组成型(PcL和Ptac)启动子,首次实现了染色体整合基因的可调控表达 | 目前仅在大肠杆菌K-12菌株MG1655中验证,尚未在其他革兰氏阴性菌中测试 | 开发能够实现染色体整合基因可控表达的转座子载体系统 | 大肠杆菌K-12菌株MG1655及其染色体Tn7位点 | 合成生物学 | NA | Tn7转座子整合、基因克隆、荧光蛋白表达分析 | NA | 基因表达数据、荧光强度数据 | 大肠杆菌K-12菌株MG1655 | Tn7转座子 | 大肠杆菌 | 启动子调控的基因表达系统,包括组成型表达和诱导型表达回路 | 工业生物技术,医学 |
| 1431 | 2025-10-05 |
Development of CRISPR-Cas9-based genome editing tools for non-model microorganism Erwinia persicina
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.006
PMID:40092160
|
研究论文 | 本研究开发了基于CRISPR-Cas9的基因组编辑工具,用于非模式微生物桃色欧文氏菌的基因操作 | 成功将CRISPR-Cas9系统应用于桃色欧文氏菌,通过优化gRNA启动子和设计实现高效基因组编辑,并实现大片段删除和迭代敲除 | NA | 开发适用于非模式微生物桃色欧文氏菌的高效基因组编辑工具 | 桃色欧文氏菌(Erwinia persicina) | 合成生物学 | 植物病害 | CRISPR-Cas9基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Erwinia persicina | 单质粒系统(pRed_Cas9_Δ),双gRNA介导的大片段删除,筛选标记介导的迭代敲除 | 农业,工业生物技术 |
| 1432 | 2025-10-05 |
A dual light-controlled co-culture system enables the regulation of population composition
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.012
PMID:40092159
|
研究论文 | 本研究开发了一种双光控共培养系统,能够动态调控微生物种群比例 | 整合优化光遗传学系统和正交群体感应系统,首次实现双波长光照对共培养种群组成的动态调控 | NA | 建立能够动态调控种群比例的多菌株共培养系统 | 微生物共培养系统中的种群组成调控 | 合成生物学 | NA | 光遗传学调控、群体感应系统、毒素-抗毒素系统 | NA | NA | NA | CcaS/R系统, YF1-FixJ-PhlF系统 | 微生物 | 双光控共培养系统,包含光诱导模块、通讯模块和效应模块 | 代谢工程, 合成生物学 |
| 1433 | 2025-10-05 |
Magnetizing Biotech-Advances in (In Vivo) Magnetic Enzyme Immobilization
2025-Mar, Engineering in life sciences
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/elsc.70000
PMID:40083857
|
综述 | 概述了磁性酶固定化技术的现有方法和新兴进展,特别关注体内固定化解决方案 | 将传统固定化技术与新兴的体内生物固定化方法相结合,并整合磁性纳米材料实现改进的分离纯化过程 | NA | 改善工业生物催化中酶的稳定性和可重复使用性 | 酶固定化技术,特别是磁性蛋白固定化物 | 工业生物技术 | NA | 酶固定化技术,合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物催化,生物医学 |
| 1434 | 2025-10-05 |
Cyanobacterial type I CRISPR-Cas systems: distribution, mechanisms, and genome editing applications
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1552030
PMID:40084131
|
综述 | 深入分析蓝藻内源性CRISPR-Cas系统(重点关注分布最广的I型系统)及其在基因组编辑中的应用 | 首次系统总结蓝藻I型CRISPR-Cas系统的DNA防御机制及其在基因组编辑中的创新应用潜力 | NA | 探讨蓝藻内源性CRISPR-Cas系统在合成生物学中的基因组编辑应用 | 蓝藻内源性CRISPR-Cas系统(特别是I型系统) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas | 蓝藻 | NA | 工业生物技术 |
| 1435 | 2025-10-05 |
Current status and future perspectives of the diagnostic of plant bacterial pathogens
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1547974
PMID:40093602
|
综述 | 本文综述了植物细菌病原体诊断技术的发展现状与未来展望 | 重点介绍了微拉曼光谱技术在单细胞水平实现快速、无标记、非侵入式检测的创新应用 | 光谱学方法需要完善的光谱数据库,且无法检测未知病原体 | 探讨植物细菌病原体诊断技术的演进路径和发展方向 | 植物细菌病原体 | 植物病理学 | 植物细菌性疾病 | 微拉曼光谱、单细胞测序 | NA | 光谱数据、基因序列数据 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | 农业 |
| 1436 | 2025-10-05 |
Fungi: Pioneers of chemical creativity - Techniques and strategies to uncover fungal chemistry
2025, IMA fungus
IF:5.2Q1
DOI:10.3897/imafungus.16.142462
PMID:40093757
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综述 | 本文综述了真菌天然产物在药物开发中的成功应用,并系统介绍了从传统到现代的真菌化学物质发现技术框架与策略 | 整合了真菌生物学知识与合成生物学方法,提出系统性探索真菌基因组的合作研究框架 | NA | 挖掘真菌次生代谢产物的药物开发潜力并系统探索其化学多样性 | 真菌次生代谢产物及其化学特性 | 天然产物化学 | NA | 合成生物学、基因组学 | NA | 化学分析数据、基因组数据 | NA | NA | 真菌 | NA | 医药 |
| 1437 | 2025-10-05 |
Engineering a cell-free biosensor signal amplification circuit with polymerase strand recycling
2024-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.25.591074
PMID:38712145
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研究论文 | 本研究开发了一种基于聚合酶链回收(PSR)的无细胞生物传感器信号放大电路 | 利用T7 RNA聚合酶脱靶转录在DNA链置换电路中回收核酸输入,实现了高特异性等温信号放大 | NA | 扩展无细胞生物传感能力,开发高灵敏度生物传感器 | 核酸靶标和小分子检测 | 合成生物学 | NA | DNA链置换,等温扩增 | 双平衡模型 | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 无细胞系统 | 聚合酶链回收(PSR)信号放大电路,模块化生物传感器 | 生物技术 |
| 1438 | 2025-10-05 |
Microbial production of 5-epi-jinkoheremol, a plant-derived antifungal sesquiterpene
2024-Oct-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01191-24
PMID:39283105
|
研究论文 | 本研究构建了高效生产植物源抗真菌倍半萜5-表-jinkoheremol的微生物平台 | 首次构建了可持续生产该抗真菌倍半萜的高效微生物细胞工厂,通过代谢工程和蛋白质工程策略显著提高了产量 | 研究仅在摇瓶培养规模进行,尚未进行大规模发酵验证 | 开发高效生产植物源抗真菌倍半萜5-表-jinkoheremol的微生物平台 | 酿酒酵母工程菌株及其代谢途径 | 合成生物学 | 作物真菌病害 | 代谢工程、蛋白质工程、合成生物学 | NA | 代谢物产量数据、酶活性数据 | NA | 代谢工程,蛋白质工程 | 酿酒酵母 | 甲羟戊酸途径和甾醇生物合成途径优化,转录因子Hac1和mA writer Ime4调控策略 | 农业,医药 |
| 1439 | 2025-10-05 |
Global and gene-specific translational regulation in Escherichia coli across different conditions
2022-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010641
PMID:36264977
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研究论文 | 本研究通过量化大肠杆菌在12种不同条件下的转录组和相对翻译效率,揭示了基因特异性翻译调控与转录调控协同响应营养限制的机制 | 首次系统量化多条件下mRNA与翻译效率的相关性,发现翻译调控基因自身受翻译调控的反馈机制,并证明密码子使用可预测翻译效率的跨条件变异 | 研究仅关注碳、氮、磷三种营养限制条件,未涵盖其他环境因素;翻译效率为相对值而非绝对定量 | 探究不同环境下mRNA转录水平与蛋白质丰度之间的关联机制及翻译调控作用 | 大肠杆菌(Escherichia coli)的基因组范围基因表达 | 系统生物学 | NA | 转录组测序,翻译效率量化,随机森林模型 | 随机森林 | 基因组学数据,转录组数据 | 12种不同生长条件的大肠杆菌样本 | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学 |
| 1440 | 2025-10-05 |
Identification, Characterization, and Catalytic Mechanism of Regioselective UbiA Prenyltransferases in Morus Plants
2025-Mar-13, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202504190
PMID:40080387
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研究论文 | 本研究鉴定并表征了桑树中10个具有区域选择性的UbiA异戊烯基转移酶,揭示了其催化机制和底物诱导构象变化 | 首次系统研究桑树UbiA异戊烯基转移酶的区域选择性机制,通过结构导向理性突变成功改变位点偏好性 | 对异戊烯基供体诱导区域选择性反转的潜在机制仍需进一步验证 | 阐明植物UbiA异戊烯基转移酶的区域选择性催化机制 | 桑树中的UbiA异戊烯基转移酶及其底物moracin类化合物 | 合成生物学 | NA | 分子对接、动力学模拟、量子化学计算、结构导向突变 | NA | 酶学数据、计算模拟数据 | 10个MaPTs酶 | 结构导向理性突变 | NA | NA | 医药、工业生物技术 |