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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1441 | 2026-04-13 |
Using the Droplet Transfer Method to Reliably Prepare Giant Unilamellar Vesicles
2025-09-19, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/68340
PMID:41052083
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研究论文 | 本文介绍了一种可靠制备巨型单层囊泡(GUVs)的液滴转移方法,并提供了详细的实验协议和关键参数分析 | 提出了针对GUV制备中关键参数的系统性指南,包括成本有效的氧气和湿度控制措施,以及一次性去除油相的简便方法 | 方法可能因不同磷脂和油的选择而需要调整,且对初学者可能存在学习曲线 | 优化GUVs的制备方法,以促进其在合成生物学和微机器人等领域的应用 | 巨型单层囊泡(GUVs)的制备过程 | 合成生物学 | NA | 液滴转移方法(倒置乳液法) | NA | 实验协议 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 微机器人 |
| 1442 | 2026-04-13 |
A Genetic Engineering Toolbox for the Lignocellulolytic Anaerobic Gut Fungus Neocallimastix frontalis
2023-04-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00502
PMID:36920337
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研究论文 | 本文开发了一种用于厌氧肠道真菌Neocallimastix frontalis的遗传工程工具箱,实现了其瞬时转化 | 首次发现厌氧真菌具有天然DNA摄取能力,并基于此开发了包含多种选择标记、报告蛋白、启动子、终止子和核定位标签的遗传工具箱 | 目前仅实现了瞬时转化,稳定转化体系尚未建立;遗传工具数量仍有限 | 开发厌氧真菌的遗传操作工具以促进其在生物技术中的应用 | 厌氧肠道真菌Neocallimastix frontalis | 合成生物学 | NA | 遗传转化、基因组学分析 | NA | 基因组数据、实验验证数据 | NA | CRISPR-Cas9(潜在应用,文中未明确使用),遗传转化体系 | Neocallimastix frontalis(厌氧真菌) | NA | 能源、环境、工业生物技术 |
| 1443 | 2026-04-13 |
Advances in the Computational Design of Small-Molecule-Controlled Protein-Based Circuits for Synthetic Biology
2022-May, Proceedings of the IEEE. Institute of Electrical and Electronics Engineers
DOI:10.1109/JPROC.2022.3157898
PMID:36531560
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综述 | 本文回顾了合成生物学中基于计算蛋白质设计的小分子控制蛋白质电路的最新进展,特别关注Rosetta软件套件的应用 | 利用计算蛋白质设计技术,特别是Rosetta软件,开发模块化和可调谐的传感器,以克服天然传感器库有限和与工程电路接口困难的限制 | NA | 设计可编程输入-输出行为的生物分子电路,以解决医疗和可持续性领域的全球挑战 | 蛋白质基传感器和小分子输入 | 合成生物学 | NA | 计算蛋白质设计 | NA | NA | NA | Rosetta | NA | 传感器模块与功能输出耦合的电路,包括蛋白质级电路或靶基因表达调控 | 生物医学, 代谢工程 |
| 1444 | 2026-04-12 |
Efficient Sampling of Genetically Encoded Biosensor Design Space Enabled with a Design of Experiments and Automation Workflow
2025-10-17, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/68448
PMID:41182995
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研究论文 | 本文提出了一种结合高通量自动化和计算方法的流程,用于高效采样基于变构转录因子的生物传感器设计空间,以生成具有数字和模拟剂量响应曲线的不同配置 | 采用实验设计算法和高通量自动化平台,实现生物传感器组合设计空间的高效统计映射和分数采样,优化筛选策略 | NA | 开发和优化生物传感器系统及遗传电路,为合成生物学社区提供调控工具包 | 基于变构转录因子的生物传感器设计空间 | 合成生物学 | NA | 实验设计算法、高通量自动化平台、效应物滴定分析 | NA | 表达数据、组合设计空间映射 | NA | 自动化平台 | 微生物(如用于酶优化、菌株开发) | 基于变构转录因子的生物传感器,包括启动子和核糖体结合位点库,具有数字和模拟剂量响应曲线 | 工业生物技术、酶优化、菌株开发、微生物过程控制 |
| 1445 | 2026-04-11 |
Engineering chaperone/usher pathway pili for surface display: Structural constraints, design principles, and biotechnological potential
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108865
PMID:41819295
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综述 | 本文系统分析了基于伴侣蛋白/菌毛组装蛋白(CU)途径菌毛的细菌表面展示平台的结构约束、设计原则及生物技术潜力 | 通过统一的结构框架重新解读先前的展示策略,提炼出定义工程可塑性的保守设计原则,并提出了将CU菌毛扩展为多功能可调表面展示平台的实用工程方法 | NA | 为评估可行性及指导CU菌毛展示系统的理性工程提供结构引导的框架 | 大肠杆菌、沙门氏菌和鼠疫耶尔森菌中结构特征明确的CU菌毛 | 合成生物学 | NA | 蛋白结构预测 | NA | 结构数据 | NA | NA | 革兰氏阴性细菌 | 细菌表面展示平台 | 生物技术 |
| 1446 | 2026-04-11 |
Engineering cis- and trans-acting RNA regulators for next-generation prokaryotic synthetic biology
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108882
PMID:41921585
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综述 | 本文综述了用于下一代原核合成生物学的顺式和反式RNA调控器,强调了它们在基因表达控制中的工程应用 | 提出了一个面向工程师的框架,围绕转录终止、翻译起始和mRNA稳定性三个可操作控制点,整合计算和AI辅助建模以提升可预测性和可移植性 | 主要基于大肠杆菌为中心的实施,可能在其他原核生物中的适用性有限 | 推动RNA调控成为下一代原核合成生物学中常规、可工程化的控制层 | 原核生物(如细菌)中的RNA调控器 | 合成生物学 | NA | RNA调控技术,包括5' UTR和RBS工程、核糖开关、核酶、合成小RNA和基于CRISPR的RNA靶向工具 | NA | NA | NA | CRISPR, 核糖开关, 核酶 | 大肠杆菌 | 顺式和反式RNA调控器,用于构建复杂和响应性细菌系统,如逻辑门和生物传感器 | 工业生物技术 |
| 1447 | 2026-04-11 |
Engineering synthetic biology sensors with artificial intelligence: From programmable circuits to next-generation biosensing
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108874
PMID:41881285
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综述 | 本文系统综述了人工智能如何推动合成生物学传感器从理性设计向AI驱动预测的转变,并提出了一个连接AI算法与DBTL周期的框架 | 首次建立了AI算法与DBTL周期的系统性框架,并提出了AI驱动工作流的三个核心前沿:AI引导的传感器元件设计、AI辅助的信号处理以及AI驱动的闭环优化 | 存在“现实差距”和“小数据困境”等未解决的障碍 | 探讨人工智能在合成生物学传感器设计与优化中的应用,推动其向稳健、可部署的智能传感系统发展 | 合成生物学传感器 | 合成生物学 | NA | 人工智能算法 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, BioBrick, iGEM | 哺乳动物细胞 | 生物传感器、逻辑门、振荡器 | 环境、医学、食品安全、工业生物技术 |
| 1448 | 2026-04-11 |
Analysis and engineering of quorum sensing-based communications between bacteria and fungi
2026-Apr-08, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03838-25
PMID:41801051
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综述 | 本文综述了基于群体感应的细菌与真菌间通讯机制,分析了其在微生物网络组装和生态系统功能中的作用,并探讨了通过合成生物学策略重新编程这些相互作用的工程化前景 | 首次系统性地总结和分析了细菌与真菌间基于群体感应的跨物种通讯机制,并对比了自然范式与合成生物学设计策略,为模块化控制微生物群落提供了蓝图 | 该领域现有认识仍较为零散,缺乏系统性总结,且对某些特定环境或物种组合的相互作用机制理解尚不深入 | 全面分析和工程化改造基于群体感应的细菌与真菌间通讯,以促进对复杂微生物相互作用的解析并增强工程化微生物群落的能力 | 细菌与真菌间的群体感应通讯系统及其介导的相互作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 启动子工程, 定向进化 | 细菌, 真菌 | 群体感应系统, 生物传感器 | 工业生物技术, 环境, 医药 |
| 1449 | 2026-04-11 |
Ion Signaling in Cell Motility and Development in Dictyostelium discoideum
2024-07-10, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14070830
PMID:39062545
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综述 | 本文综述了离子信号在盘基网柄菌细胞运动和发育中的作用 | 系统整合了离子信号与cAMP信号在盘基网柄菌多细胞形成过程中的协同作用机制 | NA | 探讨细胞间通讯和离子信号在生物体组织形成与分化中的基本生物学过程 | 盘基网柄菌 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 发育生物学、进化生物学、生物医学研究、合成生物学 |
| 1450 | 2026-04-10 |
Exploring Azotobacter: a nitrogen-fixing microorganism as a powerhouse for sustainable and green ammonia synthesis
2026-Apr-02, Journal of applied microbiology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jambio/lxag083
PMID:41880483
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综述 | 本文综述了利用固氮微生物Azotobacter vinelandii进行可持续绿色氨合成的潜力、机制及工程化策略 | 系统阐述了A. vinelandii在有氧条件下固氮的独特生理遗传适应机制,并探讨了通过合成生物学和代谢工程将其改造为工业级氨合成底盘生物的创新路径 | NA | 探索利用生物固氮技术替代高能耗Haber-Bosch工艺,实现可持续氨合成的可行性 | Azotobacter vinelandii及其固氮酶系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、光生物催化、生物电化学 | NA | NA | NA | NA | Azotobacter vinelandii | 固氮酶表达调控系统、氧保护机制工程化 | 农业, 能源, 工业生物技术 |
| 1451 | 2026-04-10 |
Cellular and viral RNA polymerases: evolutionary insights into eukaryotic origins
2026-Apr, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2025.11.008
PMID:41350153
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综述 | 本文综述了核质大DNA病毒(NCLDVs)编码的多亚基RNA聚合酶(msRNAPs)与真核生物RNA聚合酶的进化关系,探讨病毒在真核生物起源中的作用 | 通过系统发育和结构研究揭示NCLDV RNAP催化核心与真核生物RNAP的深层进化联系,提出病毒驱动RNAP进化的新假说,将病毒视为进化合作者 | NA | 探讨NCLDV RNA聚合酶与真核生物RNA聚合酶的进化关系,评估病毒在真核生物起源中的角色 | 核质大DNA病毒(NCLDVs)和真核生物的RNA聚合酶 | 进化生物学 | NA | 系统发育分析、结构研究 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1452 | 2026-04-10 |
Advancing the frontier of plant-based therapeutics: critical innovations in molecular farming and bioprocess Integration
2026-Mar-23, Biotechnology letters
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s10529-026-03723-7
PMID:41870756
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综述 | 本文综述了植物分子农业在生物制药和高价值生物分子生产中的最新进展,包括遗传转化、蛋白质表达、糖基工程和下游加工的创新方法 | 介绍了CRISPR/Cas9介导的途径编辑、优化蛋白质产量和质量的合成生物学框架,以及提高纯化效率的集成生物加工解决方案等新方法 | NA | 指导研究人员开发更有效和可扩展的植物分子农业应用 | 植物分子农业中的生物制药和高价值生物分子生产 | NA | NA | CRISPR/Cas9, 合成生物学, 集成生物加工 | NA | NA | NA | CRISPR/Cas9 | 植物系统 | 合成生物学框架 | 医药 |
| 1453 | 2026-04-10 |
Expression of nano-engineered RNA organelles in bacteria
2026-Feb-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69336-w
PMID:41688461
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研究论文 | 本文利用RNA纳米技术在E. coli中设计并表达非天然的无膜细胞器,通过分支RNA基序的共转录组装实现正交、非混合的凝聚体,并嵌入蛋白质结合适体实现选择性蛋白质招募 | 采用RNA纳米技术设计合成生物分子凝聚体,实现算法控制相互作用、客户亲和力及凝聚体微结构,相比基于肽构建块或重复RNA序列的现有方案更具创新性 | NA | 设计合成生物分子凝聚体以模拟天然无膜细胞器功能,并应用于细胞和代谢工程 | E. coli中的合成无膜细胞器 | 合成生物学 | NA | RNA纳米技术 | NA | NA | NA | NA | E. coli | 基于分支RNA基序通过碱基配对相互作用组装的无膜细胞器,具有蛋白质结合适体嵌入功能 | 工业生物技术 |
| 1454 | 2026-04-10 |
Chemistry and biology of imidazole, oxazole and thiazole alkaloids
2026, The Alkaloids. Chemistry and biology
DOI:10.1016/bs.alkal.2025.12.002
PMID:41951284
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综述 | 总结了含咪唑、噁唑和噻唑环的五元氮杂环天然产物的最新研究进展,包括其来源、分离、结构表征、生物活性、化学合成及合成生物学应用 | 系统性地将相关生物碱按共同结构特征或生物来源进行分类,并涵盖了最新的合成生物学研究进展 | NA | 综述含咪唑、噁唑和噻唑环的天然生物碱的化学与生物学研究 | 含咪唑、噁唑和噻唑环的天然生物碱 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物发现 |
| 1455 | 2026-04-10 |
Advancements and expanding applications of CAR-T cell therapy
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1802718
PMID:41953032
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综述 | 本文综述了CAR-T细胞疗法在肿瘤学及免疫介导疾病中的进展与应用,包括其机制基础、工程策略、安全控制系统及面临的挑战 | 探讨了CAR-T疗法从血液恶性肿瘤扩展到自身免疫疾病和慢性病毒感染的新应用领域,并分析了通用型、同种异体工程策略及新型基因递送平台等前沿技术 | 存在可扩展性、制造标准化和长期免疫持久性等转化障碍,以及生物学和物流方面的重大挑战 | 评估CAR-T细胞疗法在肿瘤学和免疫介导疾病中的进展、应用潜力及未来发展方向 | CAR-T细胞疗法,包括其工程策略、安全控制系统和基因递送平台 | NA | 血液恶性肿瘤,自身免疫疾病(如多发性硬化症、系统性红斑狼疮),慢性病毒感染(如HIV、乙型肝炎) | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | T细胞 | 逻辑门控和可诱导系统 | 医学 |
| 1456 | 2026-04-10 |
Decoding the Minimal Translation System of the Plasmodium falciparum Apicoplast: Essential tRNA-modifying Enzymes and Their Roles in Organelle Maintenance
2025-Aug-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169156
PMID:40335414
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研究论文 | 本研究通过鉴定恶性疟原虫顶质体必需的tRNA修饰酶,揭示了其最小翻译系统的组成与功能 | 首次系统鉴定了顶质体定位的tRNA修饰酶,并证明其中6个催化反密码子环修饰的酶对寄生虫生存和细胞器维持至关重要 | 有两个基因无法被敲除,其中一个可能具有顶质体外的必需功能,另一个的作用机制尚未完全阐明 | 阐明恶性疟原虫顶质体最小翻译系统中tRNA修饰酶的作用及其对细胞器维持的影响 | 恶性疟原虫顶质体中的tRNA修饰酶 | 合成生物学 | 疟疾 | 比较基因组学、蛋白质定位预测、基因敲除技术 | NA | 基因组数据、蛋白质定位数据 | NA | 基因敲除工具 | 恶性疟原虫 | NA | 医学 |
| 1457 | 2026-04-10 |
Genetic Engineering Approaches for the Microbial Production of Vanillin
2024-11-06, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14111413
PMID:39595589
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综述 | 本文综述了利用基因工程和合成生物学方法提高微生物生产香兰素的研究进展 | 总结了通过基因工程和合成生物学在微生物中增强或构建香兰素生物合成途径的创新策略 | NA | 开发生物技术方法以替代化学合成,满足对天然香兰素的需求 | 香兰素生物合成途径、相关基因与酶、微生物底盘 | 合成生物学 | NA | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 天然产香兰素微生物、微生物底盘 | 香兰素生物合成途径 | 食品、工业生物技术 |
| 1458 | 2026-04-10 |
Identification, Design, and Application of Noncoding Cis-Regulatory Elements
2024-08-05, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14080945
PMID:39199333
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综述 | 本文综述了非编码顺式调控元件的识别、设计与应用,强调了其在生物功能调控中的核心作用及技术进展 | 整合了ENCODE项目、高通量检测技术(如大规模并行报告基因分析)和深度学习算法(特别是大型语言模型),用于顺式调控元件的预测与从头设计 | NA | 探讨顺式调控元件的识别、功能解析及其在基因治疗、育种和合成生物学中的应用 | 顺式调控元件及其与转录因子、RNA结合蛋白和非编码RNA的相互作用 | 计算生物学 | NA | 大规模并行报告基因分析、深度学习算法、大型语言模型 | 大型语言模型 | 功能基因组数据、核苷酸序列 | NA | NA | NA | NA | 医学、农业、工业生物技术 |
| 1459 | 2026-04-10 |
Utilizing Plant Synthetic Biology to Improve Human Health and Wellness
2021, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2021.691462
PMID:34504505
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综述 | 本文综述了植物合成生物学在改善人类健康和福祉方面的潜力,包括生产药物、营养素和营养保健品,并讨论了相关技术挑战 | 利用植物合成生物学工具将代谢途径转移到更易培养的植物中,以增强复杂药物的生产能力,并强化作物的营养和营养保健品含量 | 存在技术挑战,阻碍了植物生产促进健康的小分子化合物的能力 | 探讨植物合成生物学如何通过生成生产药物、营养素和营养保健品的植物来改善人类健康 | 植物及其代谢途径,用于生产生物活性化学品 | 合成生物学 | NA | 植物合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 代谢途径转移 | 医学, 农业 |
| 1460 | 2026-04-09 |
CO2-driven biosurfactant synthesis by bacteria within CCUS
2026-Feb-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13761-w
PMID:41741775
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综述 | 本文综述了微生物在CCUS框架内通过CO2捕获驱动生物表面活性剂合成的代谢与工程方面,探讨了其工业应用及合成生物学进展 | 整合了CO2利用、生物技术和数字创新,提出了通过合成生物学将碳固定模块与生物表面活性剂途径连接的新策略 | 面临技术和经济挑战,具体实施细节和规模化可行性未详细讨论 | 探讨微生物CO2捕获与生物表面活性剂生产相结合的策略,以实现温室气体减排和可持续生物制造 | 微生物(细菌)在CCUS系统中的代谢过程及生物表面活性剂合成 | 合成生物学 | NA | 基因工程、合成生物学、系统级建模、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 细菌(具体种类未指定) | 碳固定模块与生物表面活性剂生物合成途径的连接 | 环境, 工业生物技术 |