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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1461 | 2025-10-05 |
Current and future techniques for detecting oxytocin: Focusing on genetically-encoded GPCR sensors
2022-01-15, Journal of neuroscience methods
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.jneumeth.2021.109407
PMID:34763021
|
综述 | 本文全面回顾了神经科学中检测催产素的现有方法,并讨论了未来催产素传感器的发展方向 | 系统比较了不同催产素检测技术的优缺点,并提出了下一代传感器的发展原则 | NA | 评估当前催产素检测技术并指导未来传感器开发 | 催产素检测方法和技术 | 神经科学 | NA | 基因编码GPCR传感器 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 1462 | 2025-10-05 |
Promoting the glycosylation of drug-like natural products in a Saccharomyces cerevisiae chassis by deletion of endogenous glycosidases
2025-Apr, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132258
PMID:39971105
|
研究论文 | 通过在酿酒酵母底盘细胞中删除内源性糖苷酶基因,提高药物样天然产物糖基化效率的研究 | 首次系统评估了删除EXG1和SPR1外切糖苷酶对天然产物糖基化效率和区域选择性的影响,并发现大环内酯糖缀合物对EXG1水解具有抗性 | 仅测试了18种糖苷配基中的13种显示出改善效果,未涵盖所有天然产物类型 | 提高天然产物及其类似物的糖基化效率和区域选择性 | 苯二酚内酯家族聚酮化合物和苯丙素类多酚 | 合成生物学 | NA | 糖基化工程、基因敲除、生物催化 | NA | 代谢产物分析数据 | 18种糖苷配基 | 基因敲除 | 酿酒酵母 | 糖基化途径工程 | 医药,营养保健品,作物保护 |
| 1463 | 2025-10-05 |
Synthetic evolution of Saccharomyces cerevisiae for biomanufacturing: Approaches and applications
2025-Feb, mLife
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mlf2.12167
PMID:40026576
|
综述 | 本文综述了合成生物学方法在酿酒酵母进化工程中的应用及其在生物制造领域的潜力 | 系统总结了合成生物学工具在酵母进化工程中的最新进展,特别关注转录调控、模板依赖和非模板方法的综合应用 | NA | 探讨合成生物学方法在设计和工程化酿酒酵母进化中的应用 | 酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、进化工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 酿酒酵母 | 转录调控电路、代谢途径工程、生物传感器 | 工业生物技术, 能源, 材料 |
| 1464 | 2025-10-05 |
Impact of sulfur substitution on biotin binding affinity to streptavidin
2024-09, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107600
PMID:38945086
|
研究论文 | 研究硫原子替换对生物素与链霉亲和素结合亲和力的影响 | 首次系统研究将生物素四氢噻吩环替换为氧杂环或氮杂环对其结合性能的影响,并发现氮杂生物素具有pH依赖性结合特性 | 仅研究了有限的几种类似物,未进行体内验证实验 | 开发适用于合成生物学体外和体内应用的替代亲和配体 | 生物素类似物(氧杂生物素、氮杂生物素、N-甲基氮杂生物素)与链霉亲和素的相互作用 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟、荧光滴定实验、晶体学分析 | NA | 分子模拟数据、荧光结合数据 | 三种生物素类似物 | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 1465 | 2025-10-05 |
Rethinking cancer targeting strategies in the era of smart cell therapeutics
2022-12, Nature reviews. Cancer
DOI:10.1038/s41568-022-00505-x
PMID:36175644
|
综述 | 探讨智能细胞疗法时代下癌症靶向策略的重新思考与未来发展方向 | 提出将合成生物学与机器学习相结合的新型癌症治疗范式,通过细胞编程实现多信号识别的智能靶向 | 新兴智能细胞工程技术尚未在临床完全实施 | 重构癌症靶向治疗策略以提高精准性和有效性 | 嵌合抗原受体T细胞等基于细胞的疗法 | 合成生物学 | 癌症 | 合成回路编程、机器学习基因组数据分析 | NA | 基因组数据 | NA | 合成生物学回路 | 免疫细胞 | 多信号识别程序(肿瘤细胞内在信号和微环境信号)、局部化治疗响应系统 | 医学 |
| 1466 | 2025-10-05 |
Combating Infectious Diseases with Synthetic Biology
2022-02-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00576
PMID:35077138
|
综述 | 本文探讨了合成生物学在传染病诊断和治疗中的最新应用进展 | 重点关注活体诊疗技术的最新发展及其在传染病防治中的潜力 | NA | 开发新型传染病诊断和治疗方法 | 传染病(寄生虫、真菌、细菌和病毒感染) | 合成生物学 | 传染病 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成系统和设备 | 医学 |
| 1467 | 2025-10-05 |
Machine learning for synthetic gene circuit engineering
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103263
PMID:39874719
|
综述 | 探讨机器学习在合成基因电路工程中的新兴作用及其与机理建模结合的潜力 | 提出机器学习与机理建模结合的混合方法,利用数据驱动模型的优势与基于机理模型的规范性能力 | 需要克服相关挑战才能充分发挥这些方法的潜力 | 提升合成基因电路工程从单个组件到电路层面的设计能力 | 合成基因电路及其与宿主细胞机器的相互作用 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | 能够执行操作、检测信号和调节细胞功能的工程生物电路 | 医学,能源,食品,环境 |
| 1468 | 2025-10-05 |
Next-generation biocontainment systems for engineered organisms
2018-06, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-018-0056-x
PMID:29769737
|
综述 | 本文讨论合成生物学中用于工程生物体的新一代生物防护系统的发展 | 聚焦于利用基因回路工程、基因组编辑和基因表达调控等新兴技术开发的新型生物防护系统 | NA | 解决工程生物体在工业、临床和环境应用中可能扩散到环境中的生物安全问题 | 工程生物体和转基因材料 | 合成生物学 | NA | 基因回路工程、基因组编辑、基因表达调控 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 工程生物体 | 生物防护系统 | 工业, 临床, 环境 |
| 1469 | 2025-03-01 |
Next-generation biotechnology inspired by extremes : The potential of extremophile organisms for synthetic biology and for more efficient and sustainable biotechnology
2025-Feb-27, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-025-00389-6
PMID:40016427
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1470 | 2025-10-05 |
Discovery of Cortinarius O-methyltransferases for the heterologous production of dermolutein and physcion
2025-Feb-25, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-025-02625-6
PMID:40001086
|
研究论文 | 本研究通过基因组学、转录组学和合成生物学方法揭示了Cortinarius蘑菇中蒽醌类化合物dermolutein和physcion的生物合成途径 | 发现了与子囊菌非直系同源的nrPKS和OMT酶,表明担子菌中该途径的平行进化起源 | NA | 开发异源生产Cortinarius蒽醌类色素的方法 | Cortinarius semisanguineus和C. sp. KIS-3蘑菇中的蒽醌生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 基因组学, 转录组学, 合成生物学 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 两种Cortinarius蘑菇物种 | NA | 酿酒酵母 | 蒽醌支架化合物emodin和endocrocin的生物合成及其甲基化途径 | 纺织, 涂料, 电子, 化妆品, 农业 |
| 1471 | 2025-10-05 |
Microbiome Engineering for Sustainable Rice Production: Strategies for Biofertilization, Stress Tolerance, and Climate Resilience
2025-Jan-22, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13020233
PMID:40005600
|
综述 | 本文综述了水稻微生物组的多样性、功能作用及微生物组工程策略,旨在通过微生物组工程实现可持续水稻生产 | 系统探讨微生物组工程从传统接种剂到合成生物学的发展,并提出通过微生物组塑造基因(M基因)培育抗病性状的新途径 | 微生物制剂的商业化成功受土壤特性、田间环境条件和植物基因型等多种因素限制,需要进一步探索 | 通过微生物组工程增强水稻的生物施肥、胁迫耐受性和气候适应性,实现可持续水稻生产 | 水稻微生物组(根际、叶际和内共生微生物)及其功能 | 农业生物技术 | NA | 分子生物学、合成生物学 | NA | 文献资料 | NA | NA | 水稻 | NA | 农业 |
| 1472 | 2025-10-05 |
Synonymous codon substitutions modulate transcription and translation of a divergent upstream gene by modulating antisense RNA production
2024-Sep-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2405510121
PMID:39190361
|
研究论文 | 本文揭示了同义密码子替换通过调控反义RNA产生影响上游基因转录和翻译的机制 | 首次发现编码序列内部的同义密码子替换可通过产生长链反义RNA影响邻近基因表达,且能绕过天然转录抑制机制 | 研究仅基于质粒系统,未在完整细菌基因组中验证;仅测试了9种重编码序列中的4种显示效应 | 探究同义密码子替换对邻近基因表达的跨基因调控作用 | 质粒编码的氯霉素乙酰转移酶基因和上游四环素抗性基因 | 分子生物学 | NA | 基因重编码、RNA转录分析、蛋白质表达检测 | NA | 基因表达数据、RNA测序数据、蛋白质定量数据 | 9种同义重编码的cat基因序列 | NA | 细菌 | NA | 合成生物学 |
| 1473 | 2025-10-05 |
Identification and Characterization of Two Se6OMTs from Stephania epigaea Offer Novel Insights into the Biosynthetic Pathway of Cepharanthine
2025-Feb-03, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo15020092
PMID:39997717
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研究论文 | 本研究从金线吊乌龟中鉴定并表征了两个参与头花千金藤素生物合成途径的6-O-甲基转移酶Se6OMT1和Se6OMT3 | 首次发现Se6OMT3对(R)和(S)构型的1-苄基异喹啉生物碱均具有C6、C7和C4'位点的催化活性,揭示了酶在立体异构体底物上的底物混杂性 | 未在体内验证这些酶的生物学功能,且对(R)立体异构体底物的研究仍较初步 | 阐明头花千金藤素生物合成途径中负责(R)和(S)立体异构体生产的O-甲基转移酶 | 金线吊乌龟中的三个O-甲基转移酶及其对九种(R)和(S)构型1-苄基异喹啉生物碱的催化活性 | 合成生物学 | NA | 基因克隆、酶功能表征 | NA | 生化实验数据 | 三个OMT基因,九种1-BIA底物 | 代谢工程 | 金线吊乌龟 | 头花千金藤素生物合成途径 | 医药 |
| 1474 | 2025-10-05 |
Harnessing Gut Microbiota for Biomimetic Innovations in Health and Biotechnology
2025-Jan-24, Biomimetics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/biomimetics10020073
PMID:39997096
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综述 | 探讨肠道微生物群作为仿生创新灵感来源在医疗和生物技术领域的应用潜力 | 系统阐述微生物群仿生学的创新潜力,包括个性化益生菌、人工微生物组和仿生生物传感器等应用 | 人工环境中微生物复杂性复制的困难、基因工程微生物的伦理问题以及先进疗法的公平获取 | 探索基于微生物群的仿生创新在医疗和生物技术领域的应用前景 | 肠道微生物群及其仿生应用 | 生物技术 | NA | 人工智能、生物工程、多组学方法、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医疗, 环境 |
| 1475 | 2025-10-05 |
DNAdesign: feature-aware in silico design of synthetic DNA through mutation
2025-02-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf052
PMID:39891349
|
研究论文 | 介绍了一个基于网络的DNA突变设计工具DNAdesign,可同时考虑DNA序列和形状特征进行突变设计 | 首次实现了同时考虑DNA序列和形状特征的突变设计,提供交互式可视化比较突变候选与野生型DNA分子 | NA | 开发能够同时考虑DNA序列和形状特征的突变设计工具 | DNA序列和形状特征 | 合成生物学 | NA | Deep DNAshape预测,扩展k-mers,物理化学编码 | NA | DNA序列数据 | NA | DNAdesign | NA | 合成增强子和转录因子结合位点设计 | 合成生物学,基因调控研究 |
| 1476 | 2025-10-05 |
Glucose 6-phosphate dehydrogenase variants increase NADPH pools for yeast isoprenoid production
2024-Mar, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.13755
PMID:38124687
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研究论文 | 通过改进葡萄糖6-磷酸脱氢酶变体提高酵母NADPH水平以增强类异戊二烯产量 | 首次采用基因融合策略将G6PD与下游酶6PGL或HMG-CoA还原酶融合,并通过理性诱变获得活性提高的G6PD突变体 | 融合酶活性略低于野生型酶 | 提高NADPH生成效率以增强酵母类异戊二烯生物合成 | 葡萄糖6-磷酸脱氢酶(G6PD)及其变体 | 合成生物学 | NA | 基因融合、理性诱变、遗传筛选 | NA | 酶活性数据、代谢产物产量数据 | 多种G6PD变体和融合酶构建体 | 基因融合 | 酵母 | 戊糖磷酸途径代谢工程 | 工业生物技术 |
| 1477 | 2025-10-05 |
Utilizing microbial metabolite in catalytic cascade synthesis of conjugated oligomers for In-Situ regulation of biological activity
2024-04, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107188
PMID:38377815
|
研究论文 | 结合微生物代谢途径与钯催化过程在活体生物中原位生成具有生物活性的共轭寡聚物 | 首次将微生物发酵过程与钯催化的Heck反应结合,实现生物代谢与化学催化在活体系统中的协同作用 | NA | 开发生物代谢与化学催化相结合的新方法,用于原位调控生物活性 | 工程化大肠杆菌代谢产物与共轭寡聚物的合成 | 合成生物学 | NA | 微生物发酵、Pd催化Heck反应 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 代谢途径工程,将葡萄糖转化为苯乙烯 | 医药, 工业生物技术 |
| 1478 | 2025-10-05 |
Chaos in synthetic microbial communities
2022-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010548
PMID:36215322
|
研究论文 | 本研究开发了一种探索小型微生物群落中混沌动力学潜力的方法 | 首次在合成微生物群落中研究混沌行为的存在 | NA | 探索合成微生物群落中混沌行为的可能性及其控制方法 | 受资源竞争、细胞间通讯和竞争性细菌素相互作用调控的小型微生物群落 | 合成生物学 | NA | 近似贝叶斯计算 | NA | NA | NA | NA | 微生物群落 | 资源竞争、细胞间通讯和竞争性细菌素相互作用网络 | 生物技术, 生物加工, 合成生物学 |
| 1479 | 2025-10-05 |
Information Transmission through Biotic-Abiotic Interfaces to Restore or Enhance Human Function
2024-06-17, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.4c00435
PMID:38729914
|
综述 | 本文提出了一个模块化框架,用于定义和描述生物-非生物界面的工程设计,以促进通过光或电实现信息传输,从而恢复或增强人类功能 | 开发了统一的模块化框架来系统描述生物-非生物界面工程,整合了合成生物学、材料科学和电子工程等多学科技术 | NA | 通过生物-非生物界面信息传输技术恢复或增强人类功能 | 神经元细胞、视网膜、脊髓损伤患者、神经系统 | 生物医学工程 | 脊髓损伤、视网膜盲症、神经系统疾病 | 合成生物学、电生理学、光遗传学、脑机接口 | NA | 电信号、光信号 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学工具 | 哺乳动物细胞 | 光敏感蛋白工程、神经信号控制电路、生物传感器 | 医学 |
| 1480 | 2025-10-05 |
Cell-free systems: A synthetic biology tool for rapid prototyping in metabolic engineering
2025 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108522
PMID:39863189
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综述 | 本文综述了无细胞系统作为合成生物学工具在代谢工程快速原型设计中的应用 | 强调无细胞系统通过体外区室化策略实现超高通量筛选,显著提高原型设计效率 | NA | 评估无细胞系统作为多功能原型设计平台的潜力 | 基因调控、酶和多酶反应系统 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统、体外区室化 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 基因回路、代谢途径、酶功能原型设计 | 工业生物技术、医药 |