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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
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1481 | 2025-10-05 |
A modular toolkit for environmental Rhodococcus, Gordonia, and Nocardia enables complex metabolic manipulation
2024-08-21, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00340-24
PMID:39082821
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研究论文 | 开发了一套适用于环境放线菌的模块化质粒组装工具包,用于复杂代谢操作 | 首次为先前基因难操作的革兰氏阳性环境分离株C208开发模块化质粒组装框架,并在11种其他环境分离株中验证功能 | 工具包主要针对特定放线菌属,在其他微生物中的适用性需要进一步验证 | 建立环境放线菌的遗传操作工具,促进这些物种在生物技术中的应用 | 土壤放线菌中的Rhodococcus、Gordonia和Nocardia属环境分离株 | NA | NA | 模块化质粒组装、遗传工程 | NA | NA | 12种环境分离株(包括C208和11种其他分离株) | 模块化质粒组装框架 | Rhodococcus、Gordonia、Nocardia环境分离株 | 类胡萝卜素生物合成途径工程、四环素诱导系统、荧光报告基因 | 环境、工业生物技术、可持续生物制造 |
1482 | 2025-10-05 |
Technologies for studying phase-separated biomolecular condensates
2024-Mar-07, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-024-00020-0
PMID:39883284
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综述 | 概述用于研究生物分子凝聚物(无膜细胞器)的主流技术方法 | 系统梳理了研究生物分子凝聚物这一新兴领域的技术体系,并探讨其在合成生物学等领域的应用前景 | NA | 总结生物分子凝聚物的研究技术现状与发展趋势 | 通过液-液相分离形成的生物分子凝聚物(无膜细胞器) | 合成生物学 | NA | 液-液相分离技术、组分鉴定技术、时空调控分析技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
1483 | 2025-10-05 |
Spontaneous Emergence of Lipid Vesicles in a Coacervate-Based Compartmentalized System
2025-Jan-27, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202414372
PMID:39656166
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研究论文 | 本研究展示了凝聚微滴能够创建区室化环境,促进脂质分子自发组装成脂质囊泡 | 发现凝聚微滴可在无进化生物机制条件下促进脂质囊泡自发形成并持续释放,类似'原始酶'工厂装配线 | NA | 探索脂质囊泡在无生物机制条件下的自发形成机制及其对生命起源的意义 | 凝聚微滴与脂质分子的相互作用 | 合成生物学 | NA | 凝聚微滴系统 | NA | 实验观察数据 | NA | NA | NA | 脂质囊泡自发组装系统 | 基础研究 |
1484 | 2025-10-05 |
Cell-to-Cell Natural Transformation Mediated Efficient Plasmid Transfer Between Bacillus Species
2025-Jan-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26020621
PMID:39859334
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研究论文 | 本研究开发了一种名为细胞间天然转化质粒转移(CTCNT-P)的新方法,可在芽孢杆菌物种间高效转移质粒 | 首次报道了通过细胞间天然转化实现质粒在天然感受态芽孢杆菌菌株间高效转移的新方法 | NA | 开发一种高效的质粒转移方法,用于芽孢杆菌物种间的基因转移 | 芽孢杆菌物种,包括天然环境分离的野生菌株及其他芽孢杆菌物种 | 合成生物学 | NA | 细胞间天然转化质粒转移(CTCNT-P) | NA | NA | NA | NA | Bacillus species | NA | 工业生物技术, 合成生物学, 生物防治 |
1485 | 2025-01-31 |
Microbial biotechnology: from synthetic biology to synthetic ecology
2025-Jan-03, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-024-00054-4
PMID:39883269
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1486 | 2025-10-05 |
Rapid Multi-Well Evaluation of Assorted Materials for Hydrogel-Assisted Giant Unilamellar Vesicle Production: Empowering Bottom-Up Synthetic Biology
2025-Jan-02, Gels (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/gels11010029
PMID:39852000
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研究论文 | 开发了一种快速评估多种水凝胶材料用于辅助生产巨型单层囊泡的高通量方法 | 用可控滴铸法替代手动涂布试剂,可在多孔板中同时筛选96种GUV生产配方,并开发了水凝胶回收利用方法和新型PLE-GUVs标记技术 | 未明确说明筛选的水凝胶材料数量上限及长期稳定性数据 | 开发改进巨型单层囊泡生产方法的高通量筛选平台 | 多种水凝胶材料(PEG-DA、交联透明质酸、基质胶、交联DNA等)和巨型单层囊泡 | 合成生物学 | NA | 水凝胶辅助GUV生产、可控滴铸法、酶封装技术 | NA | 实验数据 | 最多96种GUV生产配方同时筛选 | NA | NA | NA | 生物医学,环境 |
1487 | 2025-10-05 |
MoCloro: an extension of the Chlamydomonas reinhardtii modular cloning toolkit for microalgal chloroplast engineering
2025 Jan-Feb, Physiologia plantarum
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/ppl.70088
PMID:39871102
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研究论文 | 本文开发了用于微藻叶绿体工程的模块化克隆工具包MoCloro,扩展了现有MoClo系统 | 创建了首个基于Golden Gate组装的叶绿体基因组工程标准化工具包,支持多基因组合构建 | 目前主要针对莱茵衣藻叶绿体工程,在其他微藻中的适用性有待验证 | 开发标准化叶绿体工程工具以促进微藻合成生物学应用 | 莱茵衣藻叶绿体基因组 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, BioBrick | Chlamydomonas reinhardtii | 多基因表达盒,叶绿体整合系统 | 工业生物技术, 能源, 环境 |
1488 | 2024-12-17 |
Hypoxia as challenge and opportunity: From cells to crops, to synthetic biology
2024-Dec-24, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiae640
PMID:39657271
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1489 | 2025-10-06 |
When synthetic biology meets medicine
2024-Feb, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae010
PMID:39872399
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综述 | 本文全面概述了合成生物学在医学领域的最新应用进展 | 系统总结了合成生物学在药物开发、疾病诊疗等医学应用中的革命性潜力 | NA | 探索合成生物学在生物医药和生物治疗领域的应用前景 | 传染病(COVID-19、寨卡、埃博拉)和非传染性疾病(糖尿病、心脏病、癌症) | NA | 传染病, 糖尿病, 心脏病, 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
1490 | 2025-10-05 |
Functional diversity and metabolic engineering of plant-specialized metabolites
2022-Oct, Life metabolism
DOI:10.1093/lifemeta/loac019
PMID:39872355
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综述 | 本文综述植物特异性代谢物的功能多样性及其在微生物宿主中的代谢工程策略 | 系统整合多组学工具与合成生物学方法,优化植物特异性代谢物在微生物宿主中的异源生物合成途径 | NA | 阐明植物特异性代谢物的生物合成途径及其在微生物宿主中的异源重构 | 植物特异性代谢物 | 合成生物学 | NA | 多组学分析、相关性分析、遗传图谱、生物合成基因簇预测 | NA | NA | NA | 合成生物学策略 | 微生物宿主 | 植物特异性代谢途径的异源重构 | 医药, 食品, 农业 |
1491 | 2025-10-06 |
Deciphering the biosynthetic pathway of triterpene saponins in Prunella vulgaris
2025-Jan, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.17220
PMID:39868644
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研究论文 | 本研究通过综合筛选方法鉴定了夏枯草中三萜皂苷生物合成途径的关键基因 | 首次在夏枯草中精确鉴定出参与三萜皂苷生物合成的9个候选基因,并揭示了这些基因源于全基因组复制事件 | NA | 解析夏枯草中三萜皂苷的生物合成途径 | 夏枯草(Prunella vulgaris)及其三萜皂苷代谢物 | 合成生物学 | NA | 系统发育分析、基因表达评估、代谢组-转录组关联分析、共表达分析、异源表达、酶活性测定 | NA | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据 | NA | 异源表达 | NA | 三萜皂苷生物合成途径 | 医药、工业生物技术 |
1492 | 2025-10-06 |
Spectral Algal Fingerprinting and Long Sequencing in Synthetic Algal-Microbial Communities
2024-09-14, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13181552
PMID:39329735
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研究论文 | 本研究利用全光谱流式细胞术分析合成藻类-微生物群落,实现快速物种鉴定和计数 | 开发基于全光谱流式细胞术的光谱虚拟过滤系统,实现藻类群落的高通量多维分析和精确种群分离 | 需要建立标准化光谱库以提升藻类群落表征能力 | 推进合成生物学和浮游植物生态学研究 | 合成藻类-微生物群落 | 合成生物学 | NA | 全光谱流式细胞术 | NA | 光谱数据 | NA | NA | 藻类-微生物群落 | NA | 环境 |
1493 | 2025-10-06 |
A cell-free strategy for host-specific profiling of intracellular antibiotic sensitivity and resistance
2023-Dec-18, npj antimicrobials and resistance
DOI:10.1038/s44259-023-00018-z
PMID:39843793
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研究论文 | 开发了一种基于肺炎克雷伯菌的无细胞基因表达系统,用于分析抗生素敏感性和耐药性 | 首次建立了肺炎克雷伯菌的无细胞基因表达系统,能够进行宿主特异性抗生素敏感性分析 | 初始提取物处理需要生物安全二级实验室,但后续可在生物安全一级实验室进行 | 开发宿主特异性工具研究抗生素敏感性和耐药性 | 肺炎克雷伯菌实验室和临床分离株 | 合成生物学 | 传染病 | 无细胞基因表达(CFE)、蛋白质组学 | NA | 蛋白质组数据、抗生素敏感性数据 | 实验室和临床分离的肺炎克雷伯菌株 | 无细胞基因表达系统 | 肺炎克雷伯菌, 大肠杆菌MG1655 | 抗生素敏感性分析生物传感器 | 医学 |
1494 | 2025-10-06 |
Long oligos: direct chemical synthesis of genes with up to 1728 nucleotides
2025-Jan-22, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc06958g
PMID:39759933
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研究论文 | 开发了直接化学合成长达1728个核苷酸基因的新方法 | 在光滑表面进行合成而非传统多孔载体,结合捕获聚合纯化方法,突破200个核苷酸的合成限制 | NA | 实现长链寡核苷酸的高效化学合成 | 绿色荧光蛋白基因(800-mer)和29 DNA聚合酶基因(1728-mer) | 合成生物学 | NA | 化学合成、捕获聚合纯化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学,基因编辑,蛋白质工程 |
1495 | 2025-10-06 |
Synthetic Cell Lines for Inducible Packaging of Influenza A Virus
2024-02-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00526
PMID:38259154
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法开发了可诱导包装甲型流感病毒的人工细胞系 | 首次创建了用于生产细胞病变性负链RNA病毒的包装细胞系,并揭示了病毒RNA合成效率低和宿主抗病毒反应上调是潜在限制因素 | 病毒RNA合成效率不足和宿主抗病毒反应可能限制生产效率 | 开发新型甲型流感病毒疫苗生产方法 | 甲型流感病毒(IAV)和工程化细胞系 | 合成生物学 | 流感 | RNA-Seq转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | 合成生物学方法 | HEK293细胞 | 可诱导病毒包装系统,可产生除血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)外的所有病毒组分 | 医学 |
1496 | 2025-10-06 |
A Comprehensive Review of the Diversity of Fungal Secondary Metabolites and Their Emerging Applications in Healthcare and Environment
2024, Mycobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.1080/12298093.2024.2416736
PMID:39845176
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综述 | 全面分析真菌次级代谢产物的多样性及其在医疗保健、农业、环境可持续性和营养保健品中的新兴应用 | 系统整合了基因工程、代谢途径操纵和合成生物学在提高真菌次级代谢产物产量方面的最新进展,并强调了组学技术在理解次级代谢产物生物合成调控中的重要性 | NA | 分析真菌次级代谢产物的多样性及其在医疗保健、环境和生物技术领域的应用潜力 | 真菌次级代谢产物及其生物合成途径 | 生物技术 | NA | 基因工程、代谢途径操纵、合成生物学、组学技术、发酵技术、生物加工、共培养方法 | NA | NA | NA | NA | 真菌 | NA | 医疗保健, 农业, 环境, 营养保健品, 工业生物技术 |
1497 | 2025-10-06 |
Bacterial carrier-mediated drug delivery systems: a promising strategy in cancer therapy
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1526612
PMID:39845371
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综述 | 本文总结了细菌载体在癌症治疗中的药物递送应用及其临床转化前景 | 系统阐述细菌载体通过趋化性靶向肿瘤组织并激活抗肿瘤免疫反应的新型药物递送策略 | NA | 探讨细菌载体递送系统在癌症治疗中的潜力与临床应用前景 | 细菌载体递送的抗癌药物及其递送系统 | NA | 癌症 | 纳米医学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
1498 | 2025-10-06 |
RecJ 5' Exonuclease Digestion of Oligonucleotide Failure Strands: A "Green" Method of Trityl-On Purification
2017-05-09, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.7b00010
PMID:28459543
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研究论文 | 开发了一种使用RecJ 5'核酸外切酶纯化寡核苷酸的绿色环保方法 | 首次利用RecJ酶特异性消化未封闭的失败链,结合SSBP蛋白增强酶活性,实现低成本、环保的寡核苷酸纯化 | 仅针对5'羟基化单链DNA的消化效率进行了定量分析,未与其他纯化方法进行系统比较 | 解决合成生物学中寡核苷酸纯化的瓶颈问题 | 寡核苷酸合成中的失败链 | 合成生物学 | NA | 酶消化法、RecJ 5'核酸外切酶消化 | NA | 实验数据 | 53 pmol 5'羟基化单链DNA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
1499 | 2025-10-06 |
Exchange, promiscuity, and orthogonality in de novo designed coiled-coil peptide assemblies
2025-Jan-22, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc06329e
PMID:39720134
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研究论文 | 本研究探索从头设计的卷曲螺旋肽组装体的动态特性,重点关注不同寡聚态之间的肽交换行为 | 开发了荧光报告检测方法研究肽交换动力学,发现设计肽存在同型交换忠实性和异型交换混杂性,并提出两种提高正交性的设计策略 | NA | 研究从头设计卷曲螺旋肽组装体的动态交换特性 | 系列卷曲螺旋肽组装体(从二聚体到七聚体) | 合成生物学 | NA | 荧光报告检测、肽设计 | NA | 荧光数据、动力学数据 | NA | NA | NA | 卷曲螺旋肽组装体 | 化学生物学, 合成生物学 |
1500 | 2025-10-06 |
Environment signal dependent biocontainment systems for engineered organisms: Leveraging triggered responses and combinatorial systems
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.12.005
PMID:39830078
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综述 | 评估基于环境信号触发响应和组合系统的工程生物安全防护策略 | 系统分析多种环境触发因子(化学、光、温度、pH)与组合式生物防护系统的协同应用 | NA | 评估工程生物的环境信号依赖性生物防护系统 | 基因工程生物(GEOs)的生物防护系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境信号响应系统、组合式生物防护系统 | 环境, 工业生物技术 |