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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1481 | 2025-11-23 |
Application progress and biosafety challenges of gene editing and synthetic biotechnology in diagnosis, treatment and prevention of infectious diseases
2025-Oct, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2025.09.002
PMID:41262458
|
综述 | 本文系统综述了基因编辑和合成生物技术在传染病防治中的应用进展与生物安全挑战 | 系统分析了2015-2025年间CRISPR诊断技术、合成疫苗和工程益生菌在传染病防治中的最新应用,并首次全面评估其生物安全风险 | 基于文献综述,缺乏原始实验数据验证;主要关注技术层面,社会接受度和经济可行性分析不足 | 评估合成生物技术在传染病诊断、治疗和预防中的应用进展及相关的生物安全挑战 | CRISPR诊断系统、合成疫苗平台和工程益生菌等合成生物技术产品 | 合成生物学 | 传染病 | CRISPR/Cas系统(DETECTR、SHERLOCK)、mRNA疫苗技术、病毒载体疫苗技术、工程益生菌技术 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9, Cas12a, Cas13a | 工程益生菌 | 病原体检测生物传感器、免疫调节回路 | 医学 |
| 1482 | 2025-11-23 |
Beyond evolution: De novo designed protein toolkit rewriting the rules of synthetic biology
2025-Oct, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2025.09.004
PMID:41262455
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综述 | 本文探讨人工智能驱动的蛋白质设计如何通过超越进化约束的全新蛋白质工具包革新合成生物学 | 提出超越已知结构模板和进化约束的全新蛋白质设计范式,建立从蛋白质设计到系统级实施的层次化框架 | 新型蛋白质在细胞系统中表达存在功能不可预测性,需要更完善的风险评估体系 | 系统分析AI驱动蛋白质设计的计算框架及其在合成生物学中的应用前景 | 从头设计的蛋白质工具包及其在合成生物学系统中的应用 | 合成生物学 | NA | 人工智能蛋白质设计、多组学分析 | NA | NA | NA | NA | NA | 结构导向的理性基因电路设计 | 工业生物技术 |
| 1483 | 2025-11-22 |
Virus-like particles as versatile scaffolds for nanobiosensors and nanoreactors: Design, applications, and future perspectives
2026-Feb-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.118156
PMID:41172906
|
综述 | 系统探讨病毒样颗粒作为纳米支架在纳米生物传感器和纳米反应器中的设计、应用及未来发展方向 | 提出将人工智能、先进材料和刺激响应设计整合以开发下一代智能纳米器件 | 在可扩展性、功能精确性和体内兼容性方面仍存在挑战 | 研究病毒样颗粒在纳米生物传感器和纳米反应器中的应用潜力 | 病毒样颗粒的结构与理化特性 | NA | NA | 光学传感(荧光、化学发光、表面等离子共振)、电化学传感(伏安法、电位法、阻抗法)、场效应系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 多酶途径空间组织、级联反应 | 医学诊断、治疗、可持续催化、生物催化、合成生物学 |
| 1484 | 2025-11-22 |
Dissecting native plasmid functions in Lactococcus lactis: Synergistic regulation of metabolism and industrially relevant traits
2025-Dec, Journal of dairy science
IF:3.7Q2
DOI:10.3168/jds.2025-27053
PMID:41130394
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研究论文 | 本研究解析了乳酸乳球菌C20中3个天然质粒的功能及其对代谢和工业性状的协同调控作用 | 首次系统揭示了乳酸乳球菌C20中天然质粒的协同调控网络及其对工业性状的关键影响 | 研究仅针对C20菌株的3个质粒,未在其他乳酸乳球菌菌株中验证普适性 | 阐明乳酸乳球菌天然质粒的生物学功能及其在工业应用中的潜力 | 乳酸乳球菌C20菌株及其3个天然质粒(pLL1, pLL2, pLL3) | 合成生物学 | NA | 基因组分析、组合消除、功能表征 | NA | 基因组数据、代谢数据 | 乳酸乳球菌C20菌株及其质粒变异株 | 基因编辑、合成生物学 | 乳酸乳球菌 | 天然质粒调控网络 | 食品,制药,工业生物技术 |
| 1485 | 2025-11-22 |
An efficient system for plastid transformation in an edible medicinal herb
2025-Nov-20, Transgenic research
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s11248-025-00469-2
PMID:41266676
|
研究论文 | 本文开发了一种针对药用植物龙葵的高效质体转化系统 | 首次为茄科重要药用植物龙葵建立了稳定可靠的质体转化体系,突破了质体转化技术主要局限于烟草等少数植物的限制 | NA | 开发适用于龙葵的质体转化技术,拓展质体工程在药用植物研究中的应用 | 龙葵(Solanum nigrum)植物叶片外植体 | 合成生物学 | NA | 质体转化、基因枪轰击、PCR、Southern印迹、共聚焦激光扫描显微镜 | NA | 分子生物学数据、荧光成像数据 | NA | 基因枪 | 龙葵 | 质体转化载体,包含壮观霉素抗性基因(aadA)和绿色荧光蛋白报告基因(gfp),整合于trnfM和trnG基因之间 | 医药、农业 |
| 1486 | 2025-11-22 |
Enhancing Escherichia coli production of material proteins using circular mRNAs
2025-Nov-19, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01579-25
PMID:41055377
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研究论文 | 本研究开发了一种环状mRNA表达系统,用于提高大肠杆菌中材料蛋白的产量 | 利用自切割核酶构建环状mRNA结构,结合绝缘RNA环提高蛋白翻译效率,显著增强重复序列蛋白的表达稳定性 | NA | 解决高分子量重复序列蛋白在微生物宿主中表达不稳定和产量低的问题 | 材料蛋白(包括蛛丝蛋白、肌联蛋白重复序列、贻贝足蛋白寡聚体和丝蛋白-淀粉样重复序列) | 合成生物学 | NA | 环状mRNA技术,逆转录DNA扩增测序 | NA | 蛋白质表达数据,质粒稳定性数据 | 多种材料蛋白(包括96-mer重复的牵引丝蛋白等) | 自切割核酶,绝缘RNA环 | 大肠杆菌 | 环状mRNA表达系统 | 工业生物技术,材料 |
| 1487 | 2025-11-22 |
Illuminating the dark majority: photobiology of nonphotosynthetic bacteria
2025-Nov, Photochemical & photobiological sciences : Official journal of the European Photochemistry Association and the European Society for Photobiology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s43630-025-00789-6
PMID:41114917
|
综述 | 综述非光合细菌的光生物学研究,揭示其通过光感受器介导的膜电位调节、应激反应和趋光性等生理过程 | 首次系统阐述非光合细菌利用光作为环境信号的分子机制,打破传统认为光仅与光合作用相关的认知局限 | 主要基于现有研究综述,缺乏原始实验数据支持 | 阐明非光合细菌的光感应机制及其生物学意义 | 非光合细菌及其光感受器系统 | 微生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 抗菌治疗, 合成生物学, 环境生物技术 |
| 1488 | 2025-11-22 |
A modular high-throughput approach for advancing synthetic biology in the chloroplast of Chlamydomonas
2025-Nov, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-02126-2
PMID:41184475
|
研究论文 | 本研究建立了莱茵衣藻作为叶绿体合成生物学的原型平台,开发了高通量自动化工作流程和标准化遗传元件 | 建立了首个叶绿体合成生物学高通量原型平台,开发了自动化工作流程可并行处理数千个转基因株系,并扩展了选择标记和调控元件的工具箱 | 研究主要基于模式生物莱茵衣藻,在高等植物中的直接应用仍需进一步验证 | 推进叶绿体合成生物学发展,克服叶绿体工程中遗传工具稀缺和通量低的限制 | 莱茵衣藻叶绿体 | 合成生物学 | NA | 分子克隆、自动化工作流程、转基因技术 | NA | 生物分子数据、表型数据 | 数千个转基因株系,140多个调控元件 | Gibson Assembly, 分子克隆标准 | Chlamydomonas reinhardtii(莱茵衣藻) | 合成光呼吸途径、启动子设计库、调控元件 | 农业, 能源, 环境 |
| 1489 | 2025-11-22 |
SpatialPPIv2: Enhancing protein-protein interaction prediction through graph neural networks with protein language models
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.01.022
PMID:41255828
|
研究论文 | 提出了一种基于图神经网络和蛋白质语言模型的蛋白质-蛋白质相互作用预测方法SpatialPPIv2 | 不再依赖蛋白质结构预测算法,能够独立预测蛋白质相互作用,结合大型语言模型和图注意力网络 | NA | 提高蛋白质-蛋白质相互作用预测的特异性和鲁棒性 | 蛋白质-蛋白质相互作用 | 生物信息学 | NA | 图神经网络,蛋白质语言模型 | 图注意力网络 | 蛋白质序列和结构数据 | PINDER数据集(包含RCSB PDB和AlphaFold数据库的相互作用数据) | NA | NA | NA | 药物发现,合成生物学 |
| 1490 | 2025-11-21 |
Engineering heterologous core promoters to optimize the SES expression system for Pichia pastoris
2026-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.10.005
PMID:41245009
|
研究论文 | 通过工程化异源核心启动子优化毕赤酵母SES表达系统 | 首次从解脂耶氏酵母中筛选214个候选启动子,成功构建41个性能提升达5.4倍的SES系统,并结合CRISPR/Cas9多拷贝整合策略 | 未在更广泛的工业应用场景中验证系统稳定性 | 优化毕赤酵母合成表达系统(SES)的转录调控能力 | 毕赤酵母表达系统及其异源核心启动子 | 合成生物学 | NA | RNA-seq, CRISPR/Cas9, 荧光筛选 | NA | 基因表达数据, 荧光强度数据 | 214个合成启动子,54个功能验证,41个性能提升系统 | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 毕赤酵母 | 合成表达系统(SES), 核心启动子工程 | 工业生物技术, 医药 |
| 1491 | 2025-11-21 |
Gene expression and protein abundance: Just how associated are these molecular traits?
2026 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108720
PMID:41038299
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综述 | 本文综述了基因表达与蛋白质丰度之间关系的研究进展,重点关注不同实验环境和细胞背景下两者的关联性 | 系统分类和比较了基于不同相关性度量方法的研究,并整合了单细胞分析等最新技术进展 | 主要依赖相关性分析,对因果关系的解释有限 | 探讨基因表达与蛋白质丰度之间的关联程度及其在生物技术中的应用潜力 | 基因表达与蛋白质丰度的关系研究 | 合成生物学 | NA | 转录组学、蛋白质组学、单细胞分析 | 统计模型、机制模型、机器学习、深度学习 | 组学数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术、代谢工程、合成生物学 |
| 1492 | 2025-11-21 |
Synthetic biology for scalable production of medical polyhydroxyalkanoates: Advances and applications
2026 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108722
PMID:41046988
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综述 | 本文综述了合成生物学在医用聚羟基脂肪酸酯规模化生产中的进展与应用 | 系统整合了CRISPR/Cas基因组编辑、启动子工程、核糖体结合位点优化等合成生物学技术,并引入嗜盐菌下一代工业生物技术提升生产经济性 | 未提供具体实验数据验证技术改进效果,主要基于现有研究进展的总结分析 | 探讨合成生物学技术促进医用聚羟基脂肪酸酯规模化生产的进展与前景 | 聚羟基脂肪酸酯及其生产工艺 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑, 启动子工程, 核糖体结合位点优化, 代谢通路优化, 形态工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 嗜盐菌 | 代谢通路优化 | 医药, 工业生物技术 |
| 1493 | 2025-11-21 |
Microbial Remediation of Agrochemical-Contaminated Soils: Enzymatic Mechanisms, Quorum Sensing, and Emerging Opportunities
2025-Nov-19, Integrated environmental assessment and management
IF:3.0Q2
DOI:10.1093/inteam/vjaf167
PMID:41259652
|
综述 | 本文综述了微生物修复农用化学品污染土壤的酶学机制、群体感应调控及新兴生物修复策略 | 系统整合了酶降解机制与群体感应调控网络,并探讨了合成生物学和人工智能在生物修复中的新兴应用 | 面临土壤异质性、QS信号非生物抑制、酶不稳定性、工程菌株生物安全风险等挑战 | 开发生态友好且可持续的农用化学品污染土壤生物修复方法 | 土壤微生物组及其酶系统 | 环境生物技术 | NA | 酶工程、合成生物学、人工智能建模 | NA | NA | NA | 合成QS电路 | 工程菌株 | 合成群体感应电路、QS生物传感器 | 环境 |
| 1494 | 2025-11-21 |
The role of extremophile microbiomes in terraforming Mars
2025-Nov-17, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08973-1
PMID:41249546
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综述 | 探讨极端微生物在火星地球化改造中的潜在作用及合成生物学应用 | 提出从单一物种研究转向复杂微生物群落协同作用的新视角,强调合成生物学在增强微生物适应性中的应用 | 缺乏对复杂微生物群落相互作用的系统研究,伦理和行星保护问题尚未完全解决 | 探索利用极端微生物实现火星地球化改造的生物策略 | 极端微生物及其群落 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 实验证据 | NA | NA | 极端微生物 | NA | 环境, 太空探索 |
| 1495 | 2025-11-21 |
Design and pharmacodynamic study of live biotherapeutic products with efficient degradation of branched-chain amino acids
2025-Nov, Bioengineering & translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/btm2.70075
PMID:41244347
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研究论文 | 本研究利用合成生物学方法设计两种能够高效代谢支链氨基酸的工程菌株,用于治疗支链氨基酸代谢相关疾病 | 成功构建了两种具有不同支链氨基酸代谢途径的工程菌株ECN-Deg和ECN-Tra,并验证了其在体内外的治疗效果 | NA | 开发能够降解或转化过量支链氨基酸的活体生物治疗产品 | 工程改造的大肠杆菌Nissle 1917菌株 | 合成生物学 | 枫糖尿症 | 合成生物学方法 | NA | 体内外实验数据 | 高支链氨基酸小鼠模型 | 代谢途径工程 | 大肠杆菌Nissle 1917 | 支链氨基酸降解代谢模块和转化代谢模块 | 医药 |
| 1496 | 2025-11-21 |
Before LUCA: unearthing the chemical roots of metabolism
2025-Oct-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0292
PMID:41035332
|
研究论文 | 探索从地球化学到生物化学过渡过程中原始代谢系统的演化,提出连接非生物化学与早期生命的潜在途径 | 将LUCA代谢反应规则映射到前生物反应,建立综合建模框架测试非生物化学与早期生命的连接假说 | 连接原始地球化学与LUCA复杂代谢能力仍存在挑战,模型需要进一步验证 | 研究生命起源过程中代谢系统的演化机制和化学根源 | 最后共同祖先(LUCA)的代谢系统、前生物化学反应 | 系统化学、计算生物学 | NA | 生成模型、计算建模 | 生成模型 | 化学反应数据、热力学数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 1497 | 2025-11-20 |
Engineered microbial sensors: providing a new paradigm for disease detection
2025-Nov-19, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d5tb01468a
PMID:41114525
|
综述 | 本文系统阐述了工程微生物传感器在疾病检测中的设计原理、研究进展和应用前景 | 提出了工程微生物传感器作为疾病检测新范式,总结了最新的封装策略和临床转化潜力 | 存在生物安全问题、信号稳定性问题以及缺乏标准化临床评估方案 | 探讨工程微生物传感器在疾病检测领域的设计原理和应用进展 | 工程微生物传感器及其封装策略 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, BioBrick, iGEM | 微生物 | 生物传感器、逻辑门 | 医学 |
| 1498 | 2025-11-20 |
Development of a modified RNA circularization system to improve circRNA-based protein expression in mammalian cells
2025-Nov-17, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080733.125
PMID:40935594
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研究论文 | 开发了一种改进的RNA环化系统,通过优化IRES与CMV启动子间距显著提高哺乳动物细胞中circRNA的蛋白表达效率 | 揭示了HRV-B3 IRES在哺乳动物细胞中的双重调控作用,并整合HIV-1 LTR截短体和WPRE元件增强转录效率 | 未明确说明改进系统对超大型RNA插入片段的环化效率提升程度 | 提高circRNA在哺乳动物细胞中的环化效率和蛋白表达水平 | circRNA环化系统和哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | RNA环化技术 | NA | 分子生物学数据 | NA | Tornado系统 | 哺乳动物细胞 | 改进的RNA环化系统,包含HRV-B3 IRES、HIV-1 LTR截短体和WPRE调控元件 | 医学 |
| 1499 | 2025-11-20 |
Engineering Bacteria as Living Therapeutics in Cancer Therapy
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202507820
PMID:40878391
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综述 | 本文综述了利用合成生物学技术改造细菌作为活体疗法在癌症治疗中的应用 | 将工程化细菌重新定位为能够靶向肿瘤、调节肿瘤微环境和释放抗癌药物的活体治疗剂 | NA | 探讨工程细菌在癌症治疗中的潜力和挑战 | 工程化细菌作为活体治疗剂 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 肿瘤靶向、肿瘤微环境调节和抗癌药物释放的遗传回路 | 医学 |
| 1500 | 2025-11-20 |
Synthetic biology, genetic circuits and machine learning: a new age of cancer therapy
2023-06, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.13420
PMID:37002698
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评论 | 探讨合成生物学、遗传电路和机器学习在癌症治疗中的新兴应用 | 结合非经典信号通路与合成基因电路增强工程化T细胞的抗肿瘤表型,并利用机器学习预测CAR-T细胞表型 | NA | 扩展未来基因电路的设计选择,开发能响应多重环境线索的细胞疗法 | 工程化T细胞、合成受体、信号传导通路 | 合成生物学 | 癌症 | 合成锌指工程、机器学习预测 | 机器学习 | NA | NA | CRISPR-Cas9 | T细胞 | 合成受体信号电路、可控转录调节电路 | 医学 |