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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1501 | 2024-08-23 |
Chloroplast Cell-Free Systems from Different Plant Species as a Rapid Prototyping Platform
2024-Aug-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00117
PMID:39028299
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研究论文 | 本文介绍了一种从不同植物物种中提取的叶绿体无细胞基因表达系统,用于快速原型设计和基因表达分析 | 开发了一种多功能的叶绿体无细胞基因表达系统,适用于多种植物物种,并能使用传统和内源性叶绿体聚合酶进行基因表达分析 | NA | 解决气候变化对全球农业的威胁,通过叶绿体工程提供创新解决方案 | 叶绿体无细胞基因表达系统在不同植物物种中的应用 | 植物合成生物学 | NA | 叶绿体无细胞基因表达 | NA | 基因表达数据 | 分析了23个5'UTR、10个3'UTR和6个叶绿体启动子 |
1502 | 2024-08-23 |
Engineering a Novel Probiotic Toolkit in Escherichia coli Nissle 1917 for Sensing and Mitigating Gut Inflammatory Diseases
2024-Aug-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00036
PMID:39115381
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研究论文 | 本研究开发了一种针对炎症性肠病(IBD)的靶向治疗系统,通过工程化改造益生菌大肠杆菌Nissle 1917(EcN),构建了一个包含转录因子基传感器、I型溶血素分泌系统和治疗性纳米抗体库的模块化系统。 | 本研究首次在EcN中验证了纳米抗体库的治疗潜力,并首次在EcN中表征了分泌系统,为筛选和纯化感兴趣的蛋白质提供了一个平台。此外,提供了评估益生菌系统关键参数的数学框架。 | 尽管系统对一氧化氮(NO)的响应是浓度依赖性的,但灵敏度有所降低。 | 开发一种针对炎症性肠病(IBD)的靶向治疗系统。 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917(EcN)及其在肠道炎症疾病治疗中的应用。 | NA | 炎症性肠病 | 转录因子基传感器(NorR)、I型溶血素分泌系统、酶联免疫吸附测定 | NA | NA | NA |
1503 | 2024-08-23 |
Peptide-Dependent Growth in Yeast via Fine-Tuned Peptide/GPCR-Activated Essential Gene Expression
2022-02-01, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.1c00661
PMID:35023728
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研究论文 | 本文研究了通过精细调节肽/GPCR激活关键基因表达来实现酵母中肽依赖性生长的方法 | 开发了一种基于真菌交配GPCR及其分泌肽配体的可扩展细胞间通信语言,允许工程酵母菌株组装成多细胞通信网络,并通过肽信号使它们相互依赖 | NA | 实现多细胞微生物群落的细胞间通信,并执行编程功能 | 酵母细胞的肽依赖性生长 | 合成生物学 | NA | G蛋白偶联受体(GPCR)激活技术 | NA | NA | NA |
1504 | 2024-08-22 |
Single-round QuikChange PCR for engineering multiple site-directed mutations in plasmid DNA
2024-Nov, Analytical biochemistry
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.ab.2024.115621
PMID:39019205
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研究论文 | 本研究开发了一种简单且节省时间的方法,通过使用质粒作为模板和兼容的寡核苷酸引物,按照QuikChange策略,在一次聚合酶链反应中引入多个核苷酸插入、删除和替换 | 该方法能够在一次聚合酶链反应中实现多个位点的突变,提高了基因工程的效率 | 通常需要筛选5个克隆才能找到所有期望突变的成功克隆 | 开发一种新的突变研究方法,以促进蛋白质生物化学、正向遗传学和合成生物学的研究 | 质粒DNA中的多个位点定向突变 | 生物化学 | NA | 聚合酶链反应 | NA | DNA | 通常筛选5个克隆 |
1505 | 2024-08-22 |
Therapeutic applications of synthetic gene/genetic circuits: a patent review
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1425529
PMID:39161351
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综述 | 本文综述了合成基因/遗传电路在治疗应用中的专利情况,展示了其在精确控制基因表达和细胞行为方面的潜力 | 合成基因电路能够定制精确控制治疗干预,实现个性化治疗,提高治疗效果并减少副作用 | 该技术面临商业盈利挑战,设计需针对特定应用调整,可能存在多重调控的毒性、同源重组、上下文依赖性、资源过度使用和环境变异性等缺点 | 探讨合成基因/遗传电路在治疗应用中的潜力和挑战 | 合成基因/遗传电路及其在治疗领域的应用 | 合成生物学 | NA | 合成基因/遗传电路 | NA | 专利 | 38项专利,15个最频繁的国际分类 |
1506 | 2024-08-22 |
Turing pattern design principles and their robustness
2021-Dec-27, Philosophical transactions. Series A, Mathematical, physical, and engineering sciences
DOI:10.1098/rsta.2020.0272
PMID:34743598
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综述 | 本文回顾了近期大规模数学分析尝试缩小潜在设计原则范围的研究,并探讨了这些模型的不同方面的鲁棒性 | 本文提出了鲁棒性视角在寻找合成图灵模式系统中的重要性 | NA | 探讨图灵模式设计原则及其鲁棒性 | 图灵模式在合成生物学中的应用 | 生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1507 | 2024-08-21 |
Production of pyrimidine nucleosides in microbial systems via metabolic engineering: Theoretical analysis research and prospects
2024-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108419
PMID:39053562
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研究论文 | 本研究探讨通过代谢工程和合成生物学策略在微生物系统中生产嘧啶核苷的方法 | 利用微生物发酵合成嘧啶核苷,提供了一种更可持续的生产替代方案 | 微生物生产嘧啶核苷的复杂且严格调控的生物合成途径是一个重大挑战 | 旨在通过代谢工程和合成生物学策略提高嘧啶核苷的生产效率 | 嘧啶核苷的生产 | 代谢工程 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
1508 | 2024-08-21 |
Blue light-mediated gene expression as a promising strategy to reduce antibiotic resistance in Escherichia coli
2024-May, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202400023
PMID:38719589
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研究论文 | 本文研究了利用蓝光调控基因表达系统来减少大肠杆菌对抗生素的耐药性 | 首次成功应用蓝光调控基因表达系统,有效降低了工程化大肠杆菌对氨苄西林和链霉素的耐药性 | NA | 开发新兴的非传统技术以应对抗生素耐药性的挑战 | 大肠杆菌的抗生素耐药性 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 基因表达数据 | 工程化大肠杆菌细胞 |
1509 | 2024-08-21 |
Re-considering and designing microbiomes for future waste biorefinery
2024-01, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14395
PMID:38206186
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评论 | 本文重新考虑并设计微生物组,以支持未来废物生物精炼厂的可持续发展需求 | 提出了'可持续合成微生物组'的概念,结合自下而上和自上而下的微生物组构建方法,以从低价值废物中提供人类所需产品 | 目前微生物组设计在处理复杂废物方面面临困境 | 探讨如何将科学原理与技术和工程相结合,以实现未来废物生物精炼厂的目标导向设计 | 微生物组的设计及其在废物生物精炼厂中的应用 | 环境工程 | NA | NA | NA | NA | NA |
1510 | 2024-08-21 |
Expanding the genetic programmability of Lactiplantibacillus plantarum
2024-01, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14335
PMID:37638848
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综述 | 本文综述了增强和控制乳酸菌能力的方法,特别是通过工程化遗传模块和电路来提升Lactiplantibacillus plantarum的应用性。 | 提出了针对L. plantarum的遗传工具包的改进策略,包括实时调控基因表达和增强生物安全性的方法。 | 目前用于提升L. plantarum应用性的遗传工具包仍然不足。 | 探讨如何通过遗传工程增强乳酸菌的功能,特别是在食品工业和医疗保健领域的应用。 | 主要研究对象是Lactiplantibacillus plantarum,一种广泛用于合成生物学应用的微生物底盘。 | 合成生物学 | NA | 遗传工程 | NA | 遗传数据 | NA |
1511 | 2024-08-21 |
Bacterial tolerance and detoxification of cyanide, arsenic and heavy metals: Holistic approaches applied to bioremediation of industrial complex wastes
2024-01, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14399
PMID:38206076
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研究论文 | 本文总结了细菌减轻氰化物、砷和重金属影响的策略,并分析了这些有毒化学物质之间的相互作用 | 本文探讨了系统生物学和合成生物学在复杂工业废物和共污染场地生物修复策略开发中的作用,并强调了元基因组学研究的重要性和进展 | 本文主要集中在微生物对每种环境危害的单独响应的表征上,对共污染废物对微生物代谢的影响讨论较少 | 开发针对工业复杂废物生物修复的策略 | 氰化物、砷和重金属的代谢过程及其对微生物的影响 | 环境科学 | NA | 系统生物学、合成生物学 | NA | NA | NA |
1512 | 2024-08-21 |
Insect pest management in the age of synthetic biology
2022-01, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.13685
PMID:34416790
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综述 | 本文综述了合成生物学和生物技术在害虫管理中的新应用 | 探讨了合成生物学和生物技术在害虫控制中的新兴技术,如工程抗性作物和昆虫种群以及生物制造的新进展 | NA | 探讨合成生物学和生物技术在害虫管理中的新选项 | 农业害虫及其管理方法 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1513 | 2024-08-21 |
Mandipropamid as a chemical inducer of proximity for in vivo applications
2022-01, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-021-00922-3
PMID:34934192
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研究论文 | 本文介绍了使用农业化学品mandipropamid(Mandi)作为高效的化学诱导接近剂(CIP)在细胞培养系统和活体生物中的应用 | Mandi能特异性地诱导植物激素受体PYR1的六倍突变体与脱落酸不敏感蛋白(ABI)之间的复合物形成,且与其他基于植物激素的CIP和雷帕霉素基CIP系统正交 | NA | 探索化学诱导蛋白接近在细胞和合成生物学以及治疗应用中的潜力 | 研究Mandi在细胞培养系统和活体生物中的效率和应用 | 细胞生物学 | NA | 化学诱导接近 | NA | 细胞 | 哺乳动物细胞和斑马鱼胚胎 |
1514 | 2024-08-21 |
Microbial Systems Ecology to Understand Cross-Feeding in Microbiomes
2021, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2021.780469
PMID:34987488
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综述 | 本文综述了微生物系统生态学(MSE)如何帮助理解微生物群落中的交叉喂养现象 | 提出了微生物系统生态学框架,结合系统生物学和整合组学数据,用于解析微生物群落中的相互作用 | 主要依赖于代谢网络重建,可能忽略了其他类型的微生物相互作用 | 探讨微生物系统生态学在微生物研究中的应用,特别是如何通过代谢建模来解析微生物共存机制 | 微生物群落中的交叉喂养现象及其对微生物群落组成的影响 | 微生物学 | NA | 代谢建模 | NA | 组学数据 | NA |
1515 | 2024-08-20 |
Screening of broad-host expression promoters for shuttle expression vectors in non-conventional yeasts and bacteria
2024-Aug-16, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02506-x
PMID:39152436
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研究论文 | 本研究选择了五种Yarrowia lipolytica和五种Kluyveromyces marxianus的组成型启动子,构建了启动子-报告载体,并在多种微生物宿主中系统地表征了这些启动子的强度 | 发现五种K. marxianus启动子能在Y. lipolytica中表达基因,五种Y. lipolytica启动子也能在K. marxianus中表达基因,且yl.TEF1和km.TEF1启动子在多种微生物宿主中表现出适应性 | NA | 开发具有广泛宿主适用性的非传统酵母启动子,以增强目标生物产品的合成 | Yarrowia lipolytica和Kluyveromyces marxianus的组成型启动子 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因表达 | 涉及Y. lipolytica、K. marxianus、Pichia pastoris、Escherichia coli和Corynebacterium glutamicum等多种微生物宿主 |
1516 | 2024-08-20 |
Design and construction of light-regulated gene transcription and protein translation systems in yeast P. Pastoris
2024-Aug-06, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.08.008
PMID:39117107
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研究论文 | 本文设计并构建了在酵母P. pastoris中受光调控的基因转录和蛋白质翻译系统 | 开发了新的光调控转录和翻译系统,通过光感应元件和内源性启动子的嵌合设计,以及通过“稀有密码子刹车”设计的光抑制翻译系统 | NA | 解决传统诱导型启动子在发酵安全或表达能力上的缺陷,并优化细胞能量分布 | 酵母P. pastoris中的基因转录和蛋白质翻译 | 合成生物学 | NA | 光感应元件设计,稀有密码子刹车设计 | NA | 基因转录和蛋白质翻译数据 | 多种配置的转录因子/光响应元件对,以及不同的光响应元件位置和拷贝数 |
1517 | 2024-08-20 |
Artificial Self-assembling Nanocompartment for Organizing Metabolic Pathways in Yeast
2021-12-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00045
PMID:34591448
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研究论文 | 本文介绍了一种用于在酵母中组织代谢途径的人工自组装纳米隔室,利用病毒样颗粒(MPyV VLPs)进行内部分隔 | 首次在酵母中展示了能够参与代谢途径的人工生物催化隔室,并确立了MPyV平台作为酵母工程的有前景的合成生物学工具 | NA | 开发一种新的工具用于在酵母中组织代谢途径,以提高特定代谢产物的产量 | 酵母细胞中的代谢途径和特定酶的活性 | 合成生物学 | NA | 病毒样颗粒(MPyV VLPs) | NA | 生物分子 | NA |
1518 | 2024-08-20 |
Modulation of Phototropin Signalosome with Artificial Illumination Holds Great Potential in the Development of Climate-Smart Crops
2021-Oct-18, Current genomics
IF:1.8Q3
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综述 | 本文综述了光敏蛋白信号复合体在人工光照调节下的作用及其在开发气候智能型作物中的应用 | 探讨了人工光照对植物生长、产量和次级代谢物产生的影响,以及在藻类中提高生物修复效率的应用 | NA | 旨在探讨光敏蛋白信号复合体和基于人工光照的 photobiotechnological 方法在开发气候智能型作物中的应用 | 光敏蛋白(PHOT)及其在植物中的功能,以及人工光照对作物和藻类的影响 | NA | NA | 基因靶向和合成生物学方法 | NA | NA | NA |
1519 | 2024-08-19 |
Specifications of standards in systems and synthetic biology: status and developments in 2021
2021-Oct-22, Journal of integrative bioinformatics
IF:1.5Q3
DOI:10.1515/jib-2021-0026
PMID:34674411
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综述 | 本文介绍了2021年系统与合成生物学中COMBINE标准的最新规范 | 提供了四个标准的更新版本:Synthetic Biology Open Language Visual Version 2.3、Synthetic Biology Open Language Visual Version 3.0、Simulation Experiment Description Markup Language Level 1 Version 4和OMEX Metadata specification Version 1.2 | NA | 更新和介绍系统与合成生物学中的标准规范 | 系统与合成生物学中的COMBINE标准 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA |
1520 | 2024-08-19 |
Molecular engineering of nonmetallic biosensors for CEST MRI
2015-May-15, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/cb500923v
PMID:25730583
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研究论文 | 本文探讨了利用分子工程和合成生物学开发非金属生物传感器用于化学交换饱和转移(CEST)磁共振成像(MRI)的新方法 | 引入了一种新的化学交换饱和转移(CEST)对比机制,使得可以合理设计非金属生物传感器用于MRI | NA | 开发新的非金属生物传感器,用于监测复杂的生物过程并通过非侵入性成像技术进行MRI | 非金属生物传感器的设计与优化 | 生物技术 | NA | 化学交换饱和转移(CEST)MRI | NA | 生物分子 | NA |