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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1501 | 2025-10-05 |
A cross-species inducible system for enhanced protein expression and multiplexed metabolic pathway fine-tuning in bacteria
2025-Jan-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1315
PMID:39797735
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研究论文 | 本研究开发了一种跨物种诱导系统,用于增强细菌中的蛋白质表达和多通路代谢途径的精细调控 | 设计了可在三种不同模型微生物中工作的跨物种诱导系统,并开发了能够同时激活和抑制基因表达的单输入遗传电路 | NA | 开发适用于多种细菌的通用型诱导表达系统 | 大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和谷氨酸棒状杆菌三种模型微生物 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计、蛋白质表达分析 | NA | NA | NA | T7 RNA聚合酶,dCas12a | 大肠杆菌,枯草芽孢杆菌,谷氨酸棒状杆菌 | 2,4-二乙酰基间苯三酚诱导系统PphlF3R1、脱水四环素诱导系统Ptet2R2*、单输入遗传电路 | 工业生物技术 |
| 1502 | 2025-10-05 |
Engineered Bacteria for Disease Diagnosis and Treatment Using Synthetic Biology
2025-Jan, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70080
PMID:39801378
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综述 | 本文探讨了利用合成生物学技术改造细菌作为微型机器人用于疾病诊断和治疗的最新进展 | 重点介绍了微生物联合体的协同作用机制及其在提高诊断准确性和治疗效果方面的创新应用 | 存在细菌长期存活与安全性保障、非模式菌株基因编辑技术缺乏、潜在毒性控制及与宿主微生物组相互作用机制不明确等挑战 | 系统总结工程化细菌在疾病诊断与治疗领域的研究现状与发展前景 | 经过合成生物学改造的工程细菌及微生物联合体 | 合成生物学 | 癌症, 肠道疾病, 代谢疾病 | 合成生物学技术, 基因编辑 | NA | NA | NA | NA | 工程细菌 | 微生物联合体协同作用系统 | 医学 |
| 1503 | 2025-10-05 |
Mining metagenomes from extremophiles as a resource for novel glycoside hydrolases for industrial applications
2025, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2025.02.008
PMID:40288852
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综述 | 本文综述了从极端微生物宏基因组中挖掘新型糖苷水解酶及其工业应用潜力 | 利用宏基因组学技术直接从极端环境样本中挖掘新型糖苷水解酶,无需实验室培养极端微生物 | 极端微生物来源基因在常温宿主中表达困难、酶活性产量低以及规模化应用挑战 | 探索极端微生物宏基因组作为新型糖苷水解酶的来源,用于工业应用 | 极端微生物宏基因组中的糖苷水解酶基因 | 宏基因组学 | NA | 高通量测序, 生物信息学分析, 蛋白质工程 | 机器学习 | 环境DNA序列数据 | NA | 合成生物学工具 | 常温宿主 | NA | 工业生物技术 |
| 1504 | 2025-10-05 |
Biochemical evaluation of molecular parts for flavonoid production using plant synthetic biology
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1528122
PMID:40303856
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综述 | 本文系统总结了植物合成生物学中用于黄酮类化合物生产的分子元件的酶动力学特性 | 首次从不同植物物种来源系统比较天然和工程化分子元件的酶动力学特性,为黄酮类化合物生物合成途径优化提供新见解 | NA | 通过植物合成生物学方法实现黄酮类化合物的可持续生产 | 黄酮类化合物生物合成相关的分子元件和酶 | 合成生物学 | NA | 酶动力学分析、代谢工程 | NA | 酶动力学数据 | NA | NA | 植物、微生物 | 黄酮类化合物生物合成途径重构 | 制药、营养保健品、化妆品 |
| 1505 | 2025-10-05 |
Plasmid Stability Analysis with Open-Source Droplet Microfluidics
2024-Dec-27, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67659
PMID:39803963
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研究论文 | 本研究开发了一种基于开源硬件的微流控工作流程,用于分析质粒在无抗生素选择压力下的稳定性 | 采用开源硬件微流控技术,通过凝胶微滴培养单细胞并利用荧光显微镜定量分析微菌落,实现了对质粒稳定性的高通量并行分析 | 目前研究主要使用大肠杆菌作为实验模型,在其他生物系统中的适用性需要进一步验证 | 开发一种无需抗生素选择即可分析质粒稳定性的高通量方法 | 质粒在大肠杆菌中的稳定性 | 合成生物学 | NA | 微流控技术、荧光显微镜、荧光蛋白表达 | NA | 荧光图像数据 | 大量微滴和微菌落的并行分析 | NA | 大肠杆菌 | 质粒表达的荧光蛋白生物传感器 | 工业生物技术 |
| 1506 | 2025-10-05 |
[Cloning and application in synthetic biology of chalcone synthase gene from Lithocarpus litseifolius]
2024-Dec, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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研究论文 | 本研究从甜槠转录组中筛选并鉴定了两个查尔酮合酶基因,通过生物信息学分析和功能验证揭示了其在查尔酮生物合成中的作用 | 首次从甜槠中鉴定出两个CHS基因,并证明其在大肠杆菌中与外来基因共表达可催化合成根皮素 | 仅验证了两个CHS基因在体外系统中的功能,未在植物体内进行功能验证 | 探究甜槠查尔酮合酶基因家族在查尔酮合成中的功能 | 甜槠(Lithocarpus litseifolius)的查尔酮合酶基因LlCHS1和LlCHS2 | 合成生物学 | NA | 转录组分析、生物信息学分析、系统发育分析、异源表达 | NA | 转录组数据、蛋白质序列数据 | 两个CHS基因(LlCHS1和LlCHS2) | Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 代谢通路工程,将LlCHS1/LlCHS2与Aa4CL共表达构建根皮素合成途径 | 工业生物技术 |
| 1507 | 2025-10-05 |
Synthetic Engineering of Microbes for Production of Terpenoid Food Ingredients
2025-Apr-30, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c01724
PMID:40254844
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和代谢工程改造微生物生产萜类食品配料的方法与策略 | 提出通过多维度优化异源合成途径、整合合成调控电路和工程化长期遗传稳定性来提升萜类食品配料的生产效率 | NA | 开发高效的微生物细胞工厂以生产萜类食品配料 | 微生物细胞工厂和萜类化合物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌, 酿酒酵母 | 合成调控电路、代谢途径优化 | 食品, 工业生物技术 |
| 1508 | 2025-10-05 |
Structural dynamics of a designed peptide pore under an external electric field
2025-Mar, Biophysical chemistry
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.bpc.2024.107380
PMID:39752811
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研究论文 | 本研究通过分子动力学模拟结合实验验证,探究了外加电场对人工设计肽孔结构动力学的影响 | 在GENESIS分子动力学模拟软件中实现了均匀外加电场功能,用于研究从头设计肽孔的构象动力学 | NA | 研究膜电位对人工设计肽孔结构稳定性和动力学的影响 | 从头设计的肽孔 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟,单通道电流记录实验 | NA | 模拟数据,实验数据 | NA | NA | NA | 人工离子通道和孔设计 | 医学 |
| 1509 | 2025-10-05 |
Orthogonal RNA replication enables directed evolution and Darwinian adaptation in mammalian cells
2025-Mar, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01783-2
PMID:39753704
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研究论文 | 开发了一种在哺乳动物细胞中进行定向进化的正交RNA复制系统 | 创建了正交甲病毒RNA复制系统,实现RNA复制酶辅助的连续进化,克服了现有方法的宿主基因组干扰、文库规模小和不可控突变等瓶颈 | NA | 推进哺乳动物合成生物学和细胞工程应用 | RNA基器件、荧光蛋白、转录因子 | 合成生物学 | NA | 正交RNA复制系统、定向进化 | NA | NA | NA | 正交甲病毒RNA复制系统 | 哺乳动物细胞 | RNA复制酶辅助连续进化系统,通过复制酶限制模式和诱导突变实现RNA多样性 | 医学, 工业生物技术 |
| 1510 | 2025-10-05 |
Advances in bacterial glycoprotein engineering: A critical review of current technologies, emerging challenges, and future directions
2025 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108514
PMID:39755221
|
综述 | 本文系统评述了细菌糖蛋白工程领域的最新技术进展、挑战与未来发展方向 | 从合成生物学和代谢工程角度全面分析细菌蛋白糖基化系统,重点关注糖蛋白治疗剂和疫苗开发 | NA | 探讨利用细菌糖基化系统生产高价值糖蛋白的方法与策略 | 细菌糖基化系统及其在糖蛋白生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白糖链偶联技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 糖基化系统优化(糖基转移酶、载体蛋白、糖基供体、宿主细菌) | 医学, 诊断 |
| 1511 | 2025-10-05 |
New insights of advanced biotechnological engineering strategies for tanshinone biosynthesis in Salvia miltiorrhiza
2025-Mar, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2025.112384
PMID:39756484
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综述 | 本文总结了丹参中丹参酮生物活性的研究进展及提高其产量的生物技术策略 | 系统整合了丹参酮生物合成途径、转录调控网络、表观遗传修饰和合成生物学等多维度研究进展 | NA | 开发高质量的丹参资源并提高丹参酮产量 | 丹参及其活性成分丹参酮 | 合成生物学 | 心脑血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | 丹参 | 丹参酮生物合成途径 | 医药 |
| 1512 | 2025-10-05 |
Customized design of host-independent T7 expression system (HITES) for a broad host range
2025-Feb, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.12.012
PMID:39778814
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研究论文 | 开发了一种宿主非依赖性T7表达系统(HITES)的定制设计方法,用于在多种宿主中实现高效蛋白表达和目标化学品生产 | 发现EL值在T7表达系统构建中的关键作用,并提出基于EL值指导的宿主非依赖性T7表达系统定制设计方法 | NA | 开发适用于广泛宿主范围的通用蛋白表达系统 | T7表达系统在不同宿主菌株中的构建和优化 | 合成生物学 | NA | T7表达系统构建、蛋白表达分析 | NA | 酶活性测量数据、蛋白表达数据 | 13种宿主菌株 | T7表达系统 | 大肠杆菌DH5α, 其他12种宿主菌株 | 宿主非依赖性T7表达系统(HITES),包含T7 RNA聚合酶活性调控策略 | 工业生物技术 |
| 1513 | 2025-10-05 |
Genetic Code Expansion: Recent Developments and Emerging Applications
2025-Jan-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00216
PMID:39737807
|
综述 | 本文系统回顾了遗传密码扩展技术的最新进展及其在生物学和医学领域的应用 | 全面总结了遗传密码扩展技术在氨基酸酰基-tRNA合成酶/tRNA系统优化、翻译系统工程和非经典氨基酸生物合成方面的最新突破 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据和研究方法的具体细节 | 系统梳理遗传密码扩展技术的发展现状、挑战机遇及其在生物学和医学领域的应用前景 | 遗传密码扩展技术及其相关应用 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展技术 | NA | 文献资料 | NA | 氨基酸酰基-tRNA合成酶/tRNA系统 | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 1514 | 2025-10-05 |
A systematic study of regulating inorganic polyphosphates production in Saccharomyces cerevisiae
2025-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.04.004
PMID:40291979
|
研究论文 | 本研究系统性地探究了酿酒酵母中无机多聚磷酸盐合成的遗传调控机制,并通过基因工程策略成功构建了高产长链多聚磷酸盐的工程菌株 | 首次系统筛选了55个单基因敲除菌株对多聚磷酸盐代谢的影响,发现协同增强多聚磷酸盐合成和链长的双突变组合,并利用CRISPR/Cas9技术构建了高产工程菌株 | 研究仅限于酿酒酵母模型,未在其他微生物系统中验证;对多聚磷酸盐的具体生物学功能机制仍需进一步研究 | 阐明酿酒酵母中多聚磷酸盐代谢的遗传调控机制,并开发高产多聚磷酸盐的工程菌株 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)及其基因敲除突变株 | 合成生物学 | NA | 基因敲除筛选、CRISPR/Cas9基因编辑、qRT-PCR分析 | NA | 基因表达数据、代谢物定量数据 | 55个单基因敲除菌株库及组合突变株 | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 多聚磷酸盐生物合成途径调控,包括增强ATP供应和抑制多聚磷酸酶活性 | 工业生物技术 |
| 1515 | 2025-10-05 |
Synthetically Engineered Bacterial Extracellular Vesicles and IL-4-Encapsulated Hydrogels Sequentially Promote Osteoporotic Fracture Repair
2025-04-29, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c03106
PMID:40237831
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研究论文 | 开发了一种基于合成生物学细菌胞外囊泡和IL-4水凝胶的序贯治疗系统,用于促进骨质疏松性骨折修复 | 首次构建了负载pBMP-2-VEGF的工程化细菌胞外囊泡并与IL-4共同封装在GelMA水凝胶中,形成具有时序治疗功能的复合材料 | 目前仅在小鼠模型中验证疗效,尚未进行临床前大动物实验或临床试验 | 开发新型骨质疏松性骨折治疗策略 | 骨质疏松性骨折修复过程 | 合成生物学 | 骨质疏松症 | 细菌胞外囊泡工程、水凝胶封装技术 | NA | 实验数据 | 小鼠模型 | 合成生物学 | 细菌 | pBMP-2-VEGF基因负载系统 | 医学 |
| 1516 | 2025-10-05 |
New Insight into Microbial Exploitation to Produce Bioactive Molecules from Agrifood and By-Products' Fermentation
2025-Apr-21, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods14081439
PMID:40282840
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综述 | 探讨微生物通过发酵和合成生物学技术从农业食品及副产品中生产高价值生物活性分子的最新研究 | 系统关联微生物利用与特定高价值分子生产,强调合成生物学在食品营养领域的应用潜力 | NA | 研究微生物在食品工业中生产具有促进健康效应的生物活性分子 | 具有特定性状的选育微生物及农业食品副产品 | NA | NA | 发酵技术, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 选育微生物 | NA | 食品工业, 营养保健品 |
| 1517 | 2025-10-05 |
Effect of Local Heterogeneities on Single-Layer DNA-Directed Protein Lattices Through Non-Averaged Single-Molecule 3D Structure Determination
2025-Apr-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6095207/v1
PMID:40235486
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研究论文 | 通过非平均单分子3D结构确定研究局部异质性对单层DNA导向蛋白质晶格的影响 | 利用个体粒子冷冻电子断层扫描(IPET)分析每个单元细胞粒子的非平均3D结构,揭示DNA折纸二维晶格异质性的分子起源 | 研究仅针对特定DNA折纸八面体笼结构,未验证其他类型的蛋白质或DNA结构 | 研究局部异质性对DNA导向蛋白质二维晶格结构的影响 | DNA折纸八面体笼封装铁蛋白形成的二维晶格 | 结构生物学 | NA | 个体粒子冷冻电子断层扫描(IPET), 分子动力学模拟 | NA | 3D冷冻电镜图像 | 铁蛋白负载百分比为100%、70%和0%的DNA笼样品 | DNA折纸 | NA | DNA折纸八面体笼封装铁蛋白形成的二维晶格结构 | 合成生物学, 纳米催化, 生物器件 |
| 1518 | 2025-10-05 |
Unlocking lignin valorization and harnessing lignin-based raw materials for bio-manufacturing
2025-Apr, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2792-x
PMID:39704933
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综述 | 本文全面总结了木质素生物降解的前沿策略、酶系统、代谢途径及降解菌株,并探讨了木质素增值化的创新方法 | 系统整合生物催化与合成生物学策略,提出人工智能驱动技术突破木质素增值化瓶颈的创新路径 | NA | 开发木质素生物增值化技术,实现木质素资源的高效利用 | 木质素聚合物及其降解产物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 木质素降解菌株或菌群 | 三羧酸循环等代谢通路重定向 | 能源, 材料, 工业生物技术, 食品 |
| 1519 | 2025-10-05 |
A novel geminivirus-derived 3' flanking sequence of terminator mediates the gene expression enhancement
2025-Apr, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14561
PMID:39723813
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研究论文 | 本研究发现了甘薯曲叶病毒卫星DNA中的SBG51序列能显著增强基因表达,并鉴定出关键ATAAA/TTAAA重复元件 | 首次发现双生病毒卫星DNA的3'侧翼序列具有增强基因表达功能,并证明人工合成含ATAAA/TTAAA重复序列具有类似基质附着区的功能 | NA | 探索合成生物学中新型基因表达元件 | 病毒来源的DNA序列及其对基因表达的增强作用 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达分析、转基因技术 | NA | 基因表达数据、荧光成像数据 | 本氏烟叶片、拟南芥转基因植株、酵母 | 基因表达载体构建 | 本氏烟, 拟南芥, 酵母 | 基因表达增强元件,含ATAAA/TTAAA重复序列的人工合成序列 | 农业, 工业生物技术 |
| 1520 | 2025-10-05 |
Generalized Orthogonal de Bruijn and Kautz Sequences
2025-Mar-30, Entropy (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/e27040366
PMID:40282601
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研究论文 | 本文研究正交de Bruijn序列和Kautz序列的三种实用推广形式 | 提出了正交de Bruijn序列的三种推广形式,并给出了固定权重正交de Bruijn序列数量的上下界 | NA | 探索正交de Bruijn序列和Kautz序列的推广形式及其理论性质 | de Bruijn序列、正交de Bruijn序列、Kautz序列 | 编码理论 | NA | NA | NA | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |