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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1501 | 2025-10-05 |
Challenges in observing transcription-translation for bottom-up synthetic biology
2025, QRB discovery
DOI:10.1017/qrd.2024.27
PMID:39944880
|
综述 | 本文详细讨论了体外重构转录-翻译系统的挑战与方法,并展望了合成生物学的前景 | 系统评估PURE系统和细胞裂解液在重构转录-翻译过程中的应用,并提出解耦这两个系统的解决方案 | NA | 实现合成细胞的构建,深入理解细胞系统的重构与功能追踪 | 转录-翻译系统、PURE系统、细胞裂解液、GUVs(巨型单层囊泡) | 合成生物学 | NA | 荧光显微镜技术、探针标记 | NA | NA | NA | PURE系统 | NA | 转录-翻译系统重构 | 医学, 工业生物技术 |
| 1502 | 2025-10-05 |
Herbgenomics meets Papaveraceae: a promising -omics perspective on medicinal plant research
2024-Sep-27, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad050
PMID:37952099
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综述 | 本文综述了罂粟科药用植物的基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学研究进展,并探讨了组学技术在药物开发和农业生物技术中的应用潜力 | 将新兴的草药基因组学应用于罂粟科药用植物研究,整合多组学数据解析药用活性成分的生物合成途径 | NA | 通过组学技术揭示药用植物的遗传信息和调控网络,促进药用植物的定向育种和合成生物学应用 | 罂粟科药用植物,包括罂粟和白屈菜等含乳胶植物 | 生物信息学 | NA | 基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、CRISPR/Cas9、RNA干扰 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 罂粟科植物 | 次生代谢物生物合成途径 | 医药, 农业生物技术 |
| 1503 | 2025-10-05 |
Alternating Cellular Functions by Optogenetic Control of Organelles
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4047-0_13
PMID:39724352
|
研究论文 | 介绍通过光遗传学调控细胞器功能的方法,重点关注线粒体-溶酶体接触的光学调控 | 利用光遗传学技术实现对活细胞中细胞器功能的动态调控,为细胞工程提供创新范式 | NA | 开发通过光遗传学动态调控细胞器功能的技术方法 | 真核细胞中的细胞器,特别是线粒体和溶酶体 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | 光遗传学 | 真核细胞 | 线粒体-溶酶体接触调控系统 | 医学, 工业生物技术 |
| 1504 | 2025-10-05 |
Introducing carbon assimilation in yeasts using photosynthetic directed endosymbiosis
2024-Jul-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49585-3
PMID:39013857
|
研究论文 | 本研究通过定向内共生方法在酵母细胞内引入光合蓝细菌,构建能进行光合固碳的酵母/蓝细菌嵌合体 | 开发了定向内共生方法将光合固碳能力引入酵母,无需传统代谢工程和实验室进化 | NA | 将异养酵母转化为具有光合自养能力的生物 | 芽殖酵母和光合蓝细菌 | 合成生物学 | NA | 定向内共生 | NA | NA | NA | NA | 酵母, 蓝细菌 | 光合固碳和糖分泌系统 | 可持续生物技术, 工业生物技术 |
| 1505 | 2025-10-05 |
Genetic context effects can override canonical cis regulatory elements in Escherichia coli
2022-10-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac787
PMID:36134716
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研究论文 | 本研究证明在大肠杆菌中,基因的局部染色体背景效应可以超越经典顺式调控元件对转录的影响 | 发现低GC含量的侧翼合成序列能显著降低报告基因表达,且这种遗传背景效应独立于启动子等调控序列 | 未阐明染色体位置依赖性表达变异的根本原因 | 探究遗传背景对基因转录的影响机制 | 大肠杆菌中的报告基因表达 | 合成生物学 | NA | 基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | NA | 合成生物学构建 | 大肠杆菌 | 报告基因构建体,包含不同GC含量的侧翼序列 | 工业生物技术 |
| 1506 | 2025-10-05 |
Enhancing rufomycin production by CRISPR/Cas9-based genome editing and promoter engineering in Streptomyces sp. MJM3502
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.01.002
PMID:39925944
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研究论文 | 通过CRISPR/Cas9基因组编辑和启动子工程增强链霉菌MJM3502中rufomycin的产量 | 首次建立该菌株的遗传操作平台,并利用CRISPR/Cas9技术在rufomycin生物合成基因簇上游插入强启动子 | 对菌株基因组序列和生物合成途径的理解仍存在显著空白 | 提高rufomycin类抗结核先导化合物的产量 | 链霉菌MJM3502及其rufomycin生物合成基因簇 | 合成生物学 | 结核病 | CRISPR/Cas9基因组编辑,启动子工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Streptomyces sp. MJM3502 | 在rufomycin生物合成基因簇上游插入强启动子,在细胞色素P450酶编码基因上游插入启动子 | 医药 |
| 1507 | 2025-10-05 |
A versatile in situ cofactor enhancing system for meeting cellular demands for engineered metabolic pathways
2024-02, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2023.105598
PMID:38159859
|
研究论文 | 开发了一种通过增加细胞糖磷酸盐水平来增强工程代谢途径中辅因子供应的通用方法 | 利用木糖还原酶/乳糖系统在不显著干扰细胞代谢的情况下提高多种辅因子的生物合成前体水平 | 葡萄糖脱氢酶系统的产量提升效果不如木糖还原酶系统 | 解决代谢工程细胞中辅因子不平衡问题,提高工程代谢途径的生产效率 | 大肠杆菌代谢工程细胞系统 | 合成生物学 | NA | 非靶向代谢组学分析,转录组学分析 | NA | 代谢组数据,转录组数据 | 三种不同的代谢工程细胞系统(脂肪醇生物合成、生物发光光生成和烷烃生物合成) | NA | 大肠杆菌 | 辅因子生物合成途径工程,代谢途径工程 | 工业生物技术 |
| 1508 | 2025-10-05 |
Measuring XNA polymerase fidelity in a hydrogel particle format
2025-Jan-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf038
PMID:39878216
|
研究论文 | 开发了一种在氢凝胶颗粒中测量XNA聚合酶保真度的无纯化方法 | 通过在氢凝胶包被的磁性颗粒基质内完成XNA转录和逆转录步骤,无需传统凝胶电泳纯化过程 | NA | 开发更高效的XNA聚合酶保真度测量方法 | 人工遗传聚合物(XNAs)和XNA聚合酶 | 合成生物学 | NA | 氢凝胶颗粒技术,DNA扩增,克隆测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 1509 | 2025-10-05 |
Modeling ncRNA-Mediated Circuits in Cell Fate Decision: From Systems Biology to Synthetic Biology
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4290-0_6
PMID:39702707
|
综述 | 本章回顾了非编码RNA介导的细胞命运决策电路建模方法,从系统生物学延伸到合成生物学应用 | 整合数学建模与合成生物学方法揭示ncRNA介导的双稳态开关设计原理 | 主要基于理论框架和已有研究综述,缺乏原始实验数据验证 | 阐明ncRNA调控细胞命运决策的分子机制和设计原则 | 非编码RNA(miRNA、ceRNA)与转录因子构成的基因调控网络 | 系统生物学 | NA | 数学建模、合成生物学 | NA | 理论模型 | NA | NA | NA | 双稳态开关、正反馈回路、miRNA-mRNA互作调控网络 | 医学 |
| 1510 | 2025-10-05 |
The role of Micro-biome engineering in enhancing Food safety and quality
2025, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2025.01.001
PMID:39912062
|
综述 | 本文探讨微生物组工程如何通过调控微生物群落来提升食品安全与质量 | 整合合成生物学、人工智能和系统生物学等前沿技术来优化食品生产体系 | 需要进一步研究复杂食品系统中的微生物动力学并建立统一监管框架 | 探索微生物组工程在食品安全与质量提升中的应用潜力 | 食品生产系统中的微生物群落 | NA | NA | 合成生物学, 人工智能, 系统生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 农业 |
| 1511 | 2025-10-05 |
Development of robust constitutive synthetic promoter using genetic resources of plant pararetroviruses
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1515921
PMID:39911660
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研究论文 | 本研究利用植物副逆转录病毒遗传资源开发了一种高效的三元合成启动子MFH17,用于植物合成生物学中的基因表达调控 | 首次将三种副逆转录病毒来源的启动子元件(MMV、FMV、HRLV)通过理性设计和DNA改组技术组合成新型三元杂交启动子MFH17 | NA | 开发适用于高水平基因表达的高效合成启动子,丰富植物组成型启动子库 | 植物副逆转录病毒启动子元件及其合成变体 | 合成生物学 | NA | DNA改组技术、转基因技术 | NA | 基因表达数据 | 转基因拟南芥和烟草植物 | Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 拟南芥, 烟草 | 组成型启动子设计,包含as-1元件的合成启动子 | 农业, 工业生物技术 |
| 1512 | 2025-10-05 |
Closing the loop: establishing an autonomous test-learn cycle to optimize induction of bacterial systems using a robotic platform
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1528224
PMID:39911814
|
研究论文 | 开发了一个软件框架,使机器人平台能够自主调整测试参数,实现完全自动化的设计-构建-测试-学习循环 | 将静态机器人平台转变为动态平台,实现无需人工干预的自主测试-学习循环 | 仅使用绿色荧光蛋白作为目标产物进行评估,未涉及更复杂的生物系统 | 建立完全自动化的设计-构建-测试-学习循环来优化细菌系统的诱导条件 | 细菌系统中的诱导浓度优化和诱导剂与饲料释放的组合优化 | 合成生物学 | NA | 机器人平台自动化技术 | 探索与利用平衡的优化算法 | 测量数据 | NA | 机器人平台 | 细菌 | 诱导表达系统 | 工业生物技术 |
| 1513 | 2025-10-05 |
Public attitudes to genetic technology for invasive pest control and preferences for engagement and information: a segmentation analysis
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1388512
PMID:39911817
|
研究论文 | 通过调查分析公众对基因技术用于入侵害虫控制的态度、参与偏好和信息需求 | 首次将公众对基因技术的态度分为四个细分群体,并针对不同群体提出差异化的公众参与策略 | 样本仅来自澳大利亚,可能无法代表其他国家的公众态度 | 了解公众对基因技术用于入侵害虫控制的认知和态度,探索公众参与路径和信息需求 | 1149名澳大利亚公众 | NA | NA | 基因编辑技术 | NA | 调查问卷数据 | 1149名澳大利亚受访者 | NA | NA | NA | 环境 |
| 1514 | 2025-10-05 |
Next-generation chimeric antigen receptors for T- and natural killer-cell therapies against cancer
2023-11, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.13255
PMID:37548050
|
综述 | 本文综述了新一代嵌合抗原受体在T细胞和自然杀伤细胞癌症治疗中的应用进展 | 利用合成生物学和基因工程重编程免疫效应细胞,增强对肿瘤的选择性,减轻靶向非肿瘤不良反应 | NA | 改善CAR对肿瘤细胞的选择性,推动基于NK细胞的治疗策略临床转化 | 嵌合抗原受体T细胞和自然杀伤细胞 | NA | 癌症 | 合成生物学、基因工程 | NA | NA | NA | NA | T细胞、自然杀伤细胞 | 嵌合抗原受体 | 医学 |
| 1515 | 2025-10-05 |
A synthetic biology approach to engineering circuits in immune cells
2023-11, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.13244
PMID:37464881
|
综述 | 本文综述了合成生物学方法在免疫细胞工程中的应用,重点讨论了合成受体回路在癌症免疫治疗中的策略与应用 | 探讨了用于抗原密度感知的T细胞回路、控制T细胞分化的合成回路设计以及利用细胞通信和分工的合成多细胞回路概念 | NA | 增强免疫细胞功能以改善癌症免疫治疗 | 免疫细胞(特别是T细胞)中的合成生物学回路 | 合成生物学 | 癌症 | 基因组工程、蛋白质工程、细胞工程 | NA | NA | NA | NA | T细胞 | 合成受体回路、抗原密度感知回路、逻辑门回路、合成多细胞回路 | 医学 |
| 1516 | 2025-10-05 |
Eras of designer Tregs: Harnessing synthetic biology for immune suppression
2023-11, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.13254
PMID:37522861
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综述 | 本文回顾了设计性调节性T细胞的发展历程,重点介绍了通过合成生物学技术增强Tregs免疫抑制功能的三个发展阶段 | 首次将设计性Tregs的发展划分为三个时代:FOXP3工程时代、抗原特异性时代和先进基因组编辑时代,并系统总结了各阶段的技术突破 | NA | 探讨如何利用合成生物学技术改进调节性T细胞的治疗效果 | CD4 CD25 FOXP3调节性T细胞及其工程化改造 | 合成生物学 | 自身免疫性疾病 | 基因工程、转基因T细胞受体、嵌合抗原受体、基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 免疫调节回路、抗原特异性识别回路 | 医学 |
| 1517 | 2025-10-05 |
Recent trends in the elucidation of complex triterpene biosynthetic pathways in horticultural trees
2025-Jan, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhae254
PMID:39802733
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综述 | 本文综述了园艺树木中三萜类化合物的化学多样性、生物合成酶及DBTL管道在生物合成途径研究中的应用 | 聚焦园艺树木三萜生物合成途径研究空白,提出集成DBTL管道用于途径发现与优化 | 园艺树木三萜类化合物的生物学功能和机制尚未完全阐明,缺乏可扩展的生产系统 | 阐明园艺树木中复杂三萜类化合物的生物合成途径 | 园艺树木中的三萜类化合物及其生物合成酶 | 合成生物学 | NA | DBTL(设计-构建-测试-学习)管道 | NA | NA | NA | NA | 园艺树木 | 三萜类化合物生物合成途径 | 食品, 医药, 工业生物技术 |
| 1518 | 2025-10-05 |
Making Neurobots and Chimerical Ctenophores
2024-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.28.620631
PMID:39554129
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研究论文 | 利用栉水母作为模型构建嵌合动物和神经机器人 | 发现栉水母的自我识别特征和祖神经-免疫结构,首次实现三种栉水母物种的神经机器人和嵌合动物构建 | 未明确说明实验构建的神经机器人和嵌合动物的具体功能特性和长期存活能力 | 探索利用生物材料构建活体机器的可能性 | 栉水母(三种物种)的神经和免疫系统 | 合成生物学 | NA | 生物工程 | NA | 实验数据 | 三种栉水母物种 | NA | 栉水母 | 混合神经系统和完整动物的实验构建 | 生物医学 |
| 1519 | 2025-10-05 |
Advanced probiotics: bioengineering and their therapeutic application
2024-Feb-25, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-024-09309-8
PMID:38403783
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综述 | 本文综述了通过合成生物学技术改造益生菌的方法及其在治疗炎症性肠病、癌症等疾病中的应用 | 系统阐述基因编辑技术在益生菌工程化中的应用,开发具有增强耐受性和特定功能的新一代设计型益生菌 | NA | 概述改造益生菌的基因编辑技术方法及其治疗应用的科学原理 | 乳酸菌等益生菌 | 合成生物学 | 炎症性肠病, 癌症, 细菌感染, 代谢疾病 | 基因编辑技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 乳酸菌 | 生物传感器, 代谢通路 | 医药 |
| 1520 | 2025-10-05 |
Molecular switches in plant stress adaptation
2023-Dec-18, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-023-09051-7
PMID:38108912
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综述 | 本文综述了植物通过分子开关适应生物和非生物胁迫的调控机制及其在作物改良中的应用 | 揭示了单个分子开关可调控多个胁迫网络、多个开关可共同调控单一胁迫条件的新机制 | NA | 探讨植物分子开关在胁迫适应中的调控机制及其在作物改良中的应用前景 | 拟南芥等不同植物物种中的分子开关 | 植物分子生物学 | NA | 基因组学、生物技术、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学 | 拟南芥, 作物植物 | 分子开关网络、胁迫诱导通路 | 农业 |