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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1501 | 2024-08-13 |
Pleiotropy, a feature or a bug? Toward co-ordinating plant growth, development, and environmental responses through engineering plant hormone signaling
2024-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103151
PMID:38823314
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综述 | 本文探讨了如何利用系统生物学和单细胞测序技术来识别协调植物生长和发育的候选基因 | 结合系统生物学和单细胞测序技术,以及合成生物学方法来测试假设和定义基因型-表型关系 | 识别候选基因仍然是一个挑战,由于复杂的基因网络和通路以及多效性现象 | 探索如何通过工程化植物激素信号来协调植物生长、发育和环境响应 | 植物生长和发育的候选基因及其在特定时间和组织背景下的功能 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因序列 | NA |
1502 | 2024-08-13 |
AI-Assisted Rational Design and Activity Prediction of Biological Elements for Optimizing Transcription-Factor-Based Biosensors
2024-Jul-26, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules29153512
PMID:39124917
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综述 | 本文综述了人工智能算法在合成生物学中生物元素的合理设计、活性预测及转录因子基生物传感器响应性能调控中的应用 | 探讨了人工智能算法在分析生物数据中的强大潜力,并提出了针对该领域挑战的创新解决方案 | NA | 探索人工智能在合成生物学中的应用,以推动学术研究和生物技术的实际应用 | 生物元素的合理设计、活性预测及转录因子基生物传感器的调控 | 合成生物学 | NA | 机器学习、深度学习 | AI算法 | 生物数据 | NA |
1503 | 2024-08-13 |
Proton gradients from light-harvesting E. coli control DNA assemblies for synthetic cells
2021-06-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24103-x
PMID:34172734
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研究论文 | 本文通过基因工程改造大肠杆菌,使其过量表达光驱动的向内质子泵,并将其封装在人工细胞大小的隔室中,利用光暗循环实现pH值的可逆调节,进而触发DNA结构与隔室边缘的附着 | 本文创新地将自下而上和自上而下的合成生物学方法结合,利用光驱动质子泵实现对合成细胞系统的控制 | NA | 实现光转化为质子梯度,用于驱动合成细胞系统的动作 | 大肠杆菌、人工细胞大小的隔室、DNA结构 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | 生物分子 | NA |
1504 | 2024-08-13 |
Refactoring biosynthetic gene clusters for heterologous production of microbial natural products
2021-06, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2020.12.011
PMID:33476936
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综述 | 本文综述了微生物天然产物异源生产的最新进展,重点介绍了下一代转录调控模块、新型BGC重构技术和优化的异源宿主 | 介绍了下一代转录调控模块、新型BGC重构技术和优化的异源宿主,为微生物天然产物的发现、产量优化和组合生物合成研究提供了新的合成生物学方法 | NA | 总结微生物天然产物异源生产的最新进展 | 微生物天然产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | BGC重构技术 | NA | NA | NA |
1505 | 2024-08-12 |
Functional modification of gut bacteria for disease diagnosis and treatment
2024-Aug-09, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2024.06.003
PMID:38964334
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研究论文 | 本文讨论了通过功能性修饰肠道细菌用于疾病诊断和治疗的方法,包括包装材料、生物医学应用及未来发展 | 利用合成生物学和光遗传学技术改进细菌的定殖和控制释放,将肠道细菌转化为药物化学合成的细胞工厂 | 口服使用肠道细菌治疗受限于胃液的高酸性和免疫系统对外来细菌的攻击 | 探索通过功能性修饰肠道细菌以实现疾病诊断和治疗的新方法 | 肠道细菌及其在疾病治疗中的应用 | NA | NA | 合成生物学、光遗传学 | NA | NA | NA |
1506 | 2024-08-12 |
LIM-domain-only 4 (LMO4) enhances CD8+ T-cell stemness and tumor rejection by boosting IL-21-STAT3 signaling
2024-Aug-09, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01915-z
PMID:39117617
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研究论文 | 本研究通过CRISPR激活筛选识别能够增强CD8 T细胞干细胞样行为的转录调节因子,发现LMO4通过增强IL-21-STAT3信号传导促进CD8+ T细胞的干细胞特性及肿瘤排斥 | 首次发现LMO4通过结合JAK1并增强STAT3信号传导,促进CD8 T细胞的干细胞样特性,从而增强肿瘤免疫治疗效果 | 研究主要集中在体外和动物模型中,尚未在临床试验中验证LMO4的疗效 | 探索增强CD8 T细胞干细胞样行为的新策略,以提高基于T细胞的免疫治疗效果 | CD8+ T细胞的干细胞样行为及肿瘤免疫治疗 | 免疫学 | 肿瘤 | CRISPR/Cas9 | NA | 细胞 | 涉及多种细胞培养和小鼠肿瘤模型 |
1507 | 2024-08-12 |
Thermo-responsive aqueous two-phase system for two-level compartmentalization
2024-Aug-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51043-z
PMID:39117632
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研究论文 | 本文报道了一种基于热响应性水两相系统(TR-ATPS)的双级分隔方法,该系统由聚(N-异丙基丙烯酰胺)(PNIPAM)和葡聚糖(DEX)组成 | TR-ATPS能够通过温度变化实现生物分子的时空富集,加速生物化学反应效率 | NA | 探索在合成系统中实现类似生物细胞内外的环境响应性分隔 | 热响应性水两相系统及其在生物分子存储和酶空间分布编程中的应用 | 生物化学工程 | NA | 水两相系统(ATPS) | NA | 溶液 | NA |
1508 | 2024-08-12 |
Advances in yeast synthetic biology for human G protein-coupled receptor biology and pharmacology
2024-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103176
PMID:39079313
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综述 | 本文综述了酵母合成生物学在人类G蛋白偶联受体生物学和药理学领域的最新进展 | 介绍了酵母合成生物学在GPCR研究中的新概念和技术突破 | NA | 探讨GPCR在医学和生物技术中的应用 | G蛋白偶联受体及其在细胞过程中的作用 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1509 | 2024-08-12 |
Plant synthetic biology as a tool to help eliminate hidden hunger
2024-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103168
PMID:38964080
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综述 | 本文综述了利用合成生物学技术提高植物营养成分以对抗因缺乏负担得起的健康食品而导致的隐性饥饿的最新生物技术方法 | 介绍了在植物中生产通常在动物性饮食中发现的化合物,如维生素D或Omega-3脂肪酸的最新进展 | NA | 探讨利用合成生物学技术改善植物营养成分,以解决因食品不足导致的隐性饥饿问题 | 植物营养成分的改善,特别是维生素、矿物质和其他代谢物的增加 | 合成生物学 | 营养不良相关疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1510 | 2024-08-12 |
Engineering plant-microbe communication for plant nutrient use efficiency
2024-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103150
PMID:38810302
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研究论文 | 研究通过工程化植物与微生物之间的交流,提高植物对养分的利用效率 | 利用植物工程和合成生物技术,开发能够通过根分泌物选择性富集有益微生物的植物,以及能够改善植物养分可用性和吸收的微生物 | NA | 通过工程化植物与微生物的交流,优化植物对养分的利用效率 | 植物与根际微生物的交流 | NA | NA | 植物工程和合成生物技术 | NA | NA | NA |
1511 | 2024-08-12 |
CAPE: a deep learning framework with Chaos-Attention net for Promoter Evolution
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae398
PMID:39120645
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CAPE的深度学习框架,该框架采用混沌注意力网络用于启动子进化,旨在预测启动子强度并指导其定向进化 | CAPE模型通过综合提取启动子内的进化信息,并使用改进的DenseNet和Transformer结构处理整体信息,实现了对原核生物启动子强度预测的最新成果 | NA | 预测启动子强度并指导其定向进化,以降低传统启动子工程中的实验成本 | 原核生物启动子 | 机器学习 | NA | 深度学习 | DenseNet, Transformer | 启动子序列信息 | NA |
1512 | 2024-08-11 |
Reduction-to-synthesis: the dominant approach to genome-scale synthetic biology
2024-Aug, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.02.008
PMID:38423803
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综述 | 本文综述了系统生物学和合成生物学领域的最新进展,重点介绍了通过自上而下的减少和自下而上的合成两种策略构建简化基因组的方法 | 探讨了简化基因组在生物技术应用中的潜力,并提出了未来可能的研究方向 | NA | 探讨简化基因组在生物技术应用中的可能用途及未来研究方向 | 简化细菌基因组的构建及其在生物技术中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1513 | 2024-08-11 |
Insights into the synthesis, engineering, and functions of microbial pigments in Deinococcus bacteria
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1447785
PMID:39119139
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综述 | 本文综述了Deinococcus细菌中微生物色素的合成、工程化及其功能 | 探讨了通过代谢工程和合成生物学提高色素产量和扩展其应用前景的策略 | NA | 探讨微生物色素的生产优化及其在多个领域的应用前景 | Deinococcus细菌中的微生物色素及其相关酶和基因 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA |
1514 | 2024-08-11 |
Some remarks on the argument appealing to nature against synthetic biology
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1428832
PMID:39119275
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评论 | 本文主要分析了以自然为名反对合成生物学的论点,并通过展示自然概念的模糊性、否认自然与非自然之间道德上显著的界限,以及反驳该论点对合成生物学的指控,提出了反驳 | 本文通过分析自然概念的模糊性和否认自然与非自然之间的道德界限,提出了对以自然为名反对合成生物学论点的反驳 | NA | 分析并反驳以自然为名反对合成生物学的论点 | 合成生物学及其相关论点 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1515 | 2024-08-10 |
Biomedical engineering utilizing living photosynthetic cyanobacteria and microalgae: Current status and future prospects
2024-Aug, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2024.101154
PMID:39113912
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综述 | 本文综述了利用光合蓝细菌和微藻进行生物医学工程的现状与未来展望 | 探讨了合成生物技术在利用活体/工程蓝细菌进行生物医学应用中的潜力 | NA | 旨在讨论基于蓝细菌的生物医学工程的现状与未来展望 | 蓝细菌及其在生物医学应用中的特性 | 生物医学工程 | NA | 合成生物技术 | NA | NA | NA |
1516 | 2024-08-10 |
A Survey of Recent Practice of Artificial Life in Visual Art
2024-Feb-01, Artificial life
IF:1.6Q2
DOI:10.1162/artl_a_00433
PMID:38393968
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综述 | 本文综述了过去40年视觉艺术中人工生命的最新实践,特别是在计算和软件领域 | 提出了评价标准和分类法,并简要分析了不同类别的代表性艺术作品 | NA | 旨在提供一个系统性的概述,展示艺术家如何利用现代技术理解自然并创造新生命 | 视觉艺术中的人工生命作品 | 计算机视觉 | NA | 人工生命、人工智能、计算生物学和合成生物学 | NA | 艺术作品 | 过去40年的代表性艺术作品 |
1517 | 2024-08-10 |
A synthetic microbial consortium protects against obesity by regulating vitamin B6 metabolism
2024 Jan-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2024.2304901
PMID:38269591
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研究论文 | 本文通过构建合成微生物群落,研究其对肥胖的保护作用及对维生素B6代谢的调控 | 利用微流控技术分离出能利用工程菌BsS-RS06551代谢物的细菌,并发现其与JJ3菌株的共培养能显著缓解肥胖及相关疾病 | NA | 探索合成微生物群落在肥胖治疗中的应用 | 合成微生物群落、肥胖及相关疾病 | 合成生物学 | 肥胖 | 微流控技术 | NA | 微生物数据 | 小鼠模型 |
1518 | 2024-08-10 |
Quasi-robust control of biochemical reaction networks via stochastic morphing
2021-04, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2020.0985
PMID:33849334
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研究论文 | 本文提出了一种通过随机变形控制生物化学反应网络的准鲁棒控制器 | 该控制器能够在适当的时标分离下,将目标分子种类的概率分布变形为预定义的形式,实现多模态或多稳定性 | NA | 开发分子控制器,以操纵最多部分已知的生物化学网络的动力学 | 生物化学反应网络的控制 | 合成生物学 | NA | 随机变形控制 | NA | 概率分布 | NA |
1519 | 2024-08-10 |
Metabolic buffer analysis reveals the simultaneous, independent control of ATP and adenylate energy ratios
2021-04, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2020.0976
PMID:33906384
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研究论文 | 本文通过控制理论和新型缓冲分析研究了能量代谢中的缓冲作用 | 发现缓冲作用可以实现多个耦合输出的同时独立控制,并通过腺苷酸激酶和AMP脱氨酶在代谢中实现ATP和腺苷酸能量比的同时控制 | NA | 揭示生物调节的基本原理,理解生命原理,治疗复杂疾病,创造合成生物学 | 能量代谢中的缓冲作用及其在分子生物学中的协同作用 | 生物学 | NA | 控制理论,缓冲分析 | NA | 数据 | 人类肌肉和老鼠脂肪细胞数据 |
1520 | 2024-08-10 |
If you eat it, or secrete it, they will grow: the expanding list of nutrients utilized by human gut bacteria
2020-Nov-09, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/JB.00481-20
PMID:33168637
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综述 | 本文综述了人类肠道细菌如何适应并利用来自宿主、饮食和细菌来源的碳水化合物营养素,以及这些营养素对肠道微生物群的影响。 | 强调了先前未被充分研究的底物如单糖、核苷和美拉德反应产物对肠道微生物群的影响,并介绍了合成生物学领域在设计新型饮食控制营养利用途径方面的进展。 | NA | 探讨人类肠道细菌如何适应并利用不同来源的营养素,以及这些营养素对肠道微生物群的影响。 | 人类肠道细菌及其对不同营养素的利用机制。 | 微生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |