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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
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1501 | 2025-10-06 |
A Rapid and Reversible Molecular "Switch" Regulating Protein Expression in Chlamydomonas reinhardtii
2025-Jan-22, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.15360
PMID:39838873
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研究论文 | 本研究利用DD/Shield-1系统在莱茵衣藻中实现了外源蛋白表达的快速、可逆调控 | 首次将哺乳动物来源的DD/Shield-1系统成功应用于微藻系统,实现了外源基因的快速可逆调控 | 未明确说明该系统在不同外源蛋白中的普适性及长期稳定性 | 开发莱茵衣藻中外源基因表达调控的新方法 | 莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii) | 合成生物学 | NA | DD/Shield-1系统、基因编辑 | NA | 分子生物学数据 | NA | CRISPR-Cas12a | 莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii) | 分子开关系统,基于配体依赖的蛋白稳定性调控 | 工业生物技术 |
1502 | 2025-10-06 |
Constructing mechanosensitive signalling pathways de novo in synthetic cells
2025-Jan-21, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20231285
PMID:39838922
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综述 | 本文讨论在合成细胞中构建从头开始的机械敏感信号通路的研究进展 | 将机械敏感通道整合到合成细胞中创建全新的机械敏感信号通路 | NA | 通过合成生物学方法研究机械转导机制并开发新型生物技术 | 合成细胞和机械敏感信号通路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成细胞 | 机械敏感信号通路 | 医学诊断, 微反应器, 治疗 |
1503 | 2025-10-06 |
A parallel bioreactor strategy to rapidly determine growth-coupling relationships for bioproduction: a mevalonate case study
2025-Jan-17, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02599-x
PMID:39825460
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研究论文 | 本研究开发了一种利用平行生物反应器快速确定生物生产过程中生长-产物耦合关系的方法,并以甲羟戊酸生产为例进行验证 | 采用平行生物反应器策略快速绘制产物形成速率、底物利用速率与生长速率之间的耦合关系,并通过基因编辑消除有毒副产物乙酸盐的形成 | 研究仅以甲羟戊酸为例进行验证,方法在其他生物生产系统中的普适性需要进一步验证 | 开发快速评估生物生产过程中生长-产物耦合关系的方法,提高生物制造的经济可行性 | 甲羟戊酸生物生产过程中的生长-产物耦合关系 | 合成生物学 | NA | 平行生物反应器技术、基因编辑 | NA | 生物过程数据、代谢产物数据 | 使用大肠杆菌BW25113菌株及其基因编辑变体 | 基因编辑 | 大肠杆菌 | 通过敲除ackA-pta操纵子和poxB基因重构代谢通路 | 工业生物技术,能源,材料 |
1504 | 2025-10-06 |
Salmonella-based therapeutic strategies: improving tumor microenvironment and bringing new hope for cancer immunotherapy
2024-Dec-12, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-024-02578-0
PMID:39666238
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综述 | 本文系统阐述了沙门氏菌通过调控肿瘤微环境增强癌症免疫治疗效果的最新策略与进展 | 聚焦沙门氏菌重塑免疫抑制性肿瘤微环境的多重机制及其合成生物学改造策略 | NA | 探讨基于沙门氏菌的癌症免疫治疗新策略 | 沙门氏菌及其工程化改造株 | 合成生物学与免疫治疗 | 癌症 | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 遗传编程 | 沙门氏菌 | 肿瘤靶向系统、免疫调节回路 | 医药 |
1505 | 2025-10-06 |
Engineered Platforms for Maturing Pluripotent Stem Cell-Derived Liver Cells for Disease Modeling
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2023.01.013
PMID:36738860
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综述 | 本文综述了用于促进多能干细胞来源肝细胞成熟的工程平台技术及其在疾病建模中的应用 | 系统总结了多种先进技术平台(蛋白质微图案化、3D生物打印、微流控设备等)在改善干细胞来源肝细胞成熟度方面的创新应用 | NA | 开发能够促进多能干细胞来源肝细胞成熟的工程平台,用于肝脏疾病建模和药物开发 | 人多能干细胞(诱导多能干细胞和胚胎干细胞)分化的肝细胞样细胞 | 组织工程 | 肝脏疾病 | 蛋白质微图案化、3D生物打印、微流控技术、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 人类细胞 | NA | 医学 |
1506 | 2025-10-06 |
Directed evolution of an orthogonal transcription engine for programmable gene expression in eukaryotes
2025-Jan-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111541
PMID:39811667
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研究论文 | 本研究通过定向进化开发了一种适用于真核生物的正交转录引擎,用于程序化基因表达控制 | 将T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒单亚基加帽酶融合,并通过定向进化获得高活性变体,解决了T7 RNAP在真核系统中缺乏5'甲基鸟苷帽的局限性 | NA | 开发适用于真核生物的正交基因调控系统 | T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒加帽酶的融合酶 | 合成生物学 | NA | 定向进化 | NA | NA | NA | 定向进化 | 酵母, 哺乳动物细胞 | T7 RNAP-based遗传电路 | 工业生物技术 |
1507 | 2025-10-06 |
Directed evolution of an orthogonal transcription engine for programmable gene expression in eukaryotes
2024-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.25.614978
PMID:39386662
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研究论文 | 本研究通过定向进化开发了一种适用于真核生物的正交转录引擎,显著提高了基因表达效率 | 将T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒单亚基加帽酶融合,通过定向进化获得活性提高两个数量级的变体 | NA | 开发适用于真核生物的正交基因表达调控系统 | T7 RNA聚合酶与加帽酶的融合酶 | 合成生物学 | NA | 定向进化 | NA | NA | NA | 定向进化 | 酵母, 哺乳动物细胞 | T7 RNAP为基础的遗传电路 | 医学, 工业生物技术 |
1508 | 2025-10-06 |
Continuous Fluorescence Assay for In Vitro Translation Compatible with Noncanonical Amino Acids
2024-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00353
PMID:38194520
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研究论文 | 开发了一种基于亲和钳蛋白检测短肽标签的连续荧光测定方法,用于非经典氨基酸的体外翻译检测 | 首次创建了与ncAAs兼容的连续荧光检测方法,克服了传统放射性终点测定和荧光蛋白方法的局限性 | NA | 开发适用于非经典氨基酸的高通量体外翻译检测方法 | 体外翻译系统、非经典氨基酸、tRNA密码子特异性 | 合成生物学 | NA | 连续荧光测定、mRNA展示、质谱分析 | NA | 荧光数据 | NA | NA | NA | NA | 药物发现, 合成生物学 |
1509 | 2025-10-06 |
RDBSB: a database for catalytic bioparts with experimental evidence
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae844
PMID:39360609
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研究论文 | 开发了一个包含实验证据的催化生物元件数据库RDBSB | 整合了83,193个经过人工整理的催化生物元件,提供详细的定性和定量催化信息及分析工具 | NA | 为合成生物学中的代谢途径设计提供全面的催化生物元件资源 | 催化生物元件及其功能特性 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 生物元件功能数据 | 83,193个催化生物元件,其中超过1000个通过社区提交系统贡献 | NA | NA | 代谢途径设计工具 | 工业生物技术 |
1510 | 2025-10-06 |
A model-driven approach to upcycling recalcitrant feedstocks in Pseudomonas putida by decoupling PHA production from nutrient limitation
2024-04-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113979
PMID:38517887
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研究论文 | 本研究通过模型驱动方法在恶臭假单胞菌中实现生长阶段PHA生产,解决了传统营养限制条件下PHA生产的限制 | 采用合成生物学方法解除PHA生产与营养限制的耦合关系,首次在生长阶段实现高效PHA生产 | NA | 开发新型PHA生产策略以克服传统生物工艺的复杂性 | 恶臭假单胞菌工程菌株及其PHA生产能力 | 合成生物学 | NA | 合成生物学,模型驱动方法,生长耦合策略 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 恶臭假单胞菌 | 碳流重定向和调控约束解除的代谢工程策略 | 工业生物技术,环境 |
1511 | 2025-10-06 |
Synthetic Biology Meets Ca2+ Release-Activated Ca2+ Channel-Dependent Immunomodulation
2024-03-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13060468
PMID:38534312
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综述 | 本文总结了合成生物学工具在精确调控CRAC通道及其免疫相关下游信号通路中的应用 | 首次系统整合合成生物学方法与CRAC通道免疫调节的交叉研究 | 仅涵盖现有研究工具总结,未提出新的实验方案或技术突破 | 探讨合成生物学工具对CRAC通道信号通路的精确调控 | CRAC通道分子组件(STIM/Orai)及其免疫调节功能 | 合成生物学 | 免疫相关疾病 | 分子工程、细胞工程 | NA | 文献资料 | NA | NA | 免疫细胞 | CRAC通道信号通路调控 | 医学 |
1512 | 2025-10-06 |
Synthetic biology for the food industry: advances and challenges
2025-Feb, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2340530
PMID:38797660
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综述 | 本文综述了合成生物学在食品工业中的最新进展、应用及未来前景 | 系统总结了合成生物学在传统食品替代品、功能性食品和绿色食品三大领域的创新应用 | 作为综述文章,未涉及原始实验研究和具体技术细节 | 探讨合成生物学技术解决食品工业面临挑战的潜力 | 食品工业中的合成生物学应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 细胞工厂 | NA | 食品工业 |
1513 | 2025-10-06 |
Recent advances in genome mining and synthetic biology for discovery and biosynthesis of natural products
2025-Feb, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2383754
PMID:39134459
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综述 | 本文综述了基因组挖掘和合成生物学在天然产物发现与生物合成中的最新进展 | 整合基因组挖掘与合成生物学技术解决天然产物多样性不足、效率低下和产量低的问题 | NA | 探索基因组挖掘和合成生物学在天然产物生产中的应用前景 | 天然产物的发现与生物合成 | 合成生物学 | NA | 基因组测序、生物信息学工具、大数据分析、基因工程、代谢工程、系统生物学 | NA | 基因组数据 | NA | 基因工程、代谢工程 | NA | NA | 医药、工业生物技术 |
1514 | 2025-10-06 |
Chemical and Biological Investigations of Antiviral Agents Against Plant Viruses Conducted in China in the 21st Century
2024-Dec-23, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15121654
PMID:39766921
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综述 | 概述中国在21世纪针对植物病毒的抗病毒剂研究进展,包括作用靶点生物学特性、药物与靶点互作模式及未来研发方向 | 系统整合化学生物学、化学信息学与合成生物学等多学科方法,提出植物病毒药物研发与人类病毒药物开发的交叉借鉴视角 | NA | 促进作物抗病毒剂的深度研发,并为人类及兽用抗病毒药物开发提供参考 | 植物病毒及其抗病毒剂 | NA | 植物病毒病 | 化学生物学、化学信息学、生物信息学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业, 医药 |
1515 | 2025-10-06 |
Classical and Modern Models for Biofilm Studies: A Comprehensive Review
2024-Dec-18, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics13121228
PMID:39766618
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综述 | 系统总结用于生物膜研究的实验室模型设计及其优缺点 | 整合传统与现代生物膜模型,并提出通过增材制造、合成生物学和生物工程技术改进模型的新思路 | 现有实验室模型存在多种局限性,无法完全模拟真实场景 | 开发更适合研究生物膜特性和耐药机制的实验室模型 | 生物膜微生物群落 | 生物工程 | NA | 增材制造、合成生物学、生物工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
1516 | 2025-10-06 |
An Upstream G-Quadruplex DNA Structure Can Stimulate Gene Transcription
2024-03-15, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.3c00775
PMID:38417105
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法证明基因启动子中的G-四链体结构能够增强基因转录 | 首次在染色体整合的合成启动子中直接证明G-四链体结构形成可刺激基因转录,且效应与序列组成无关 | 研究基于合成报告基因系统,在天然基因组环境中的普遍性需进一步验证 | 探究G-四链体结构对基因转录的调控作用 | 人类细胞中整合的合成报告基因启动子 | 合成生物学 | NA | 染色体整合、合成启动子工程 | NA | 基因表达数据 | NA | 合成生物学方法 | 人类细胞 | 含G-四链体形成序列的合成启动子 | 基础研究 |
1517 | 2025-10-06 |
Discovery, Biomanufacture, and Derivatization of Licorice Triterpenoids
2025-Jan-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c08110
PMID:39644261
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综述 | 本文全面综述甘草三萜类化合物的结构、来源、药理活性、生物制造及结构修饰研究进展 | 首次系统总结甘草三萜类化合物整体特征(而非仅关注甘草酸和甘草次酸),并应用drugCIPHER算法预测其药理活性 | NA | 探索甘草三萜类化合物的发现、生物制造和结构修饰策略 | 甘草三萜类化合物(以甘草酸和甘草次酸为代表) | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法、drugCIPHER算法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
1518 | 2025-10-06 |
Golden Gate Cloning of Multigene Constructs Using the Modular Cloning System MoClo
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_2
PMID:39363064
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研究论文 | 介绍使用模块化克隆系统MoClo进行多基因构建体组装的实验方案 | 利用类型IIS酶进行DNA组装的模块化克隆系统,通过一系列一锅法组装步骤实现多基因构建体的高效组装 | NA | 开发高效的多基因构建体组装方法 | 多基因构建体的组装策略和实验流程 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, MoClo | NA | 多基因构建体 | 生物研究, 合成生物学 |
1519 | 2025-10-06 |
Standardized Golden Gate Assembly Metadata Representation Using SBOL
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_6
PMID:39363068
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研究论文 | 开发了一种用于创建SBOL表示构建计划的软件工具,以模拟IIS型介导的组装反应并存储相关元数据 | 首次实现了使用SBOL标准化表示Golden Gate组装元数据的软件工具 | NA | 为合成生物学领域提供标准化的DNA组装元数据表示方法 | DNA组装构建计划 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | 元数据 | NA | Golden Gate Assembly, SBOL | NA | DNA组装构建计划 | 工业生物技术 |
1520 | 2025-10-06 |
Golden Gate Cloning of MoClo Standard Parts
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_1
PMID:39363063
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研究论文 | 本文详细介绍了MoClo系统标准部件的Golden Gate克隆方案 | 提供了标准部件克隆的详细步骤方案,包括大片段标准部件的中间构建策略 | NA | 开发合成生物学中DNA组装的高效方法 | MoClo系统的标准部件(level 0模块) | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆,PCR,DNA测序 | NA | DNA序列 | NA | Golden Gate Assembly | NA | 标准部件(启动子、编码序列、终止子等遗传元件) | 工业生物技术 |