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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1521 | 2024-08-10 |
A Survey of Recent Practice of Artificial Life in Visual Art
2024-Feb-01, Artificial life
IF:1.6Q2
DOI:10.1162/artl_a_00433
PMID:38393968
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综述 | 本文综述了过去40年视觉艺术中人工生命的最新实践,特别是在计算和软件领域 | 提出了评价标准和分类法,并简要分析了不同类别的代表性艺术作品 | NA | 旨在提供一个系统性的概述,展示艺术家如何利用现代技术理解自然并创造新生命 | 视觉艺术中的人工生命作品 | 计算机视觉 | NA | 人工生命、人工智能、计算生物学和合成生物学 | NA | 艺术作品 | 过去40年的代表性艺术作品 |
1522 | 2024-08-10 |
A synthetic microbial consortium protects against obesity by regulating vitamin B6 metabolism
2024 Jan-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2024.2304901
PMID:38269591
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研究论文 | 本文通过构建合成微生物群落,研究其对肥胖的保护作用及对维生素B6代谢的调控 | 利用微流控技术分离出能利用工程菌BsS-RS06551代谢物的细菌,并发现其与JJ3菌株的共培养能显著缓解肥胖及相关疾病 | NA | 探索合成微生物群落在肥胖治疗中的应用 | 合成微生物群落、肥胖及相关疾病 | 合成生物学 | 肥胖 | 微流控技术 | NA | 微生物数据 | 小鼠模型 |
1523 | 2024-08-10 |
Quasi-robust control of biochemical reaction networks via stochastic morphing
2021-04, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2020.0985
PMID:33849334
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研究论文 | 本文提出了一种通过随机变形控制生物化学反应网络的准鲁棒控制器 | 该控制器能够在适当的时标分离下,将目标分子种类的概率分布变形为预定义的形式,实现多模态或多稳定性 | NA | 开发分子控制器,以操纵最多部分已知的生物化学网络的动力学 | 生物化学反应网络的控制 | 合成生物学 | NA | 随机变形控制 | NA | 概率分布 | NA |
1524 | 2024-08-10 |
Metabolic buffer analysis reveals the simultaneous, independent control of ATP and adenylate energy ratios
2021-04, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2020.0976
PMID:33906384
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研究论文 | 本文通过控制理论和新型缓冲分析研究了能量代谢中的缓冲作用 | 发现缓冲作用可以实现多个耦合输出的同时独立控制,并通过腺苷酸激酶和AMP脱氨酶在代谢中实现ATP和腺苷酸能量比的同时控制 | NA | 揭示生物调节的基本原理,理解生命原理,治疗复杂疾病,创造合成生物学 | 能量代谢中的缓冲作用及其在分子生物学中的协同作用 | 生物学 | NA | 控制理论,缓冲分析 | NA | 数据 | 人类肌肉和老鼠脂肪细胞数据 |
1525 | 2024-08-10 |
If you eat it, or secrete it, they will grow: the expanding list of nutrients utilized by human gut bacteria
2020-Nov-09, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/JB.00481-20
PMID:33168637
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综述 | 本文综述了人类肠道细菌如何适应并利用来自宿主、饮食和细菌来源的碳水化合物营养素,以及这些营养素对肠道微生物群的影响。 | 强调了先前未被充分研究的底物如单糖、核苷和美拉德反应产物对肠道微生物群的影响,并介绍了合成生物学领域在设计新型饮食控制营养利用途径方面的进展。 | NA | 探讨人类肠道细菌如何适应并利用不同来源的营养素,以及这些营养素对肠道微生物群的影响。 | 人类肠道细菌及其对不同营养素的利用机制。 | 微生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1526 | 2024-08-09 |
Intestinal Delivery of Probiotics: Materials, Strategies, and Applications
2024-Aug, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202310174
PMID:38245861
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综述 | 本文综述了益生菌肠道递送的材料、策略和应用 | 介绍了纳米技术和合成生物学在提高益生菌存活率和抵抗不良环境中的应用 | 益生菌在加工、口服摄入和肠道递送过程中的存活和定植问题仍待解决 | 探讨益生菌肠道递送的策略及其在临床治疗中的应用 | 益生菌及其递送策略 | NA | NA | 纳米技术 | NA | NA | NA |
1527 | 2024-08-09 |
Pseudomonas putida KT2440: the long journey of a soil-dweller to become a synthetic biology chassis
2024-07-25, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/jb.00136-24
PMID:38975763
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研究论文 | 本文总结了 Pseudomonas putida KT2440 从作为芳香化合物生物降解基础研究的系统,到成为代谢工程和合成生物学中首选底盘的逐步升级过程 | KT2440 因其历史偶然性和内在特性,成为适用于重组 DNA 技术的环境微生物原型,并能降解化学污染物 | KT2440 的分类学分类仍存在不确定性 | 探讨 Pseudomonas putida KT2440 在生物技术应用中的发展及其在代谢工程和合成生物学中的应用 | Pseudomonas putida KT2440 菌株及其在生物技术中的应用 | 合成生物学 | NA | 重组 DNA 技术 | NA | NA | NA |
1528 | 2024-08-09 |
Turn-on protein switches for controlling actin binding in cells
2024-Jul-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49934-2
PMID:38992021
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research paper | 本文介绍了一组可设计蛋白,即可控肌动蛋白结合开关工具(CASTs),这些蛋白的肌动蛋白结合行为可以通过外部刺激进行控制 | CASTs蛋白可以通过外部输入响应不同的外部刺激,提供开启动力学选项,并实现正交性和多路复用 | NA | 开发一种新的方法来控制细胞内肌动蛋白的结合,以实现合成生物学目的 | 肌动蛋白结合蛋白(ABPs)及其在细胞活动中的影响 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1529 | 2024-08-09 |
Bacteria-Based Cancer Immunotherapy
2021-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202003572
PMID:33854892
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research paper | 本文综述了基于细菌的癌症免疫疗法的最新进展,重点介绍了天然细菌、工程细菌和细菌成分在癌症免疫疗法中的应用 | 利用合成生物学和基因技术使细菌成为高效的免疫治疗剂生产者,以及细菌与纳米材料的结合为癌症免疫疗法提供了多功能性 | NA | 探讨基于细菌的癌症免疫疗法的最新进展及其未来研究方向 | 基于细菌的癌症免疫疗法 | NA | 癌症 | 基因技术 | NA | NA | NA |
1530 | 2024-08-09 |
Protein manipulation using single copies of short peptide tags in cultured cells and in Drosophila melanogaster
2021-03-16, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.191700
PMID:33593816
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研究论文 | 本文研究了使用短肽标签的单拷贝在培养细胞和果蝇中对蛋白质进行操纵的方法 | 开发了一种新的工具箱,利用特定的蛋白质结合剂和合成生物学的进展,实现对蛋白质的直接操纵 | NA | 探索在时间和空间上控制蛋白质相互作用的新方法,以及分析蛋白质在动态细胞过程中的作用 | 短肽标签的单拷贝在细胞内对蛋白质的结合和操纵 | 细胞生物学 | NA | 蛋白质结合剂 | NA | 细胞 | 培养细胞和果蝇 |
1531 | 2024-08-09 |
Engineering precision therapies: lessons and motivations from the clinic
2021, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaa024
PMID:33817342
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综述 | 本文讨论了过去十年中基因和细胞疗法的核心技术和治疗策略,并回顾了有望增强现有治疗策略或为新精准药物铺路的临床前研究 | NA | NA | 探讨基因和细胞疗法的核心技术和治疗策略,并评估其临床应用潜力 | 基因和细胞疗法的技术与策略 | 生物医学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1532 | 2024-08-09 |
Redefining fundamental concepts of transcription initiation in bacteria
2020-11, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-020-0254-8
PMID:32665585
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研究论文 | 本文重新定义了细菌转录起始的基本概念,以支持一个逻辑一致的细菌基因调控概念框架 | 提出了精确、更新的定义,这些概念可以通过本体论进行形式化,为改进的生物信息学工具、知识基础资源和科学交流奠定基础 | NA | 重新定义细菌转录起始的基本概念,以支持一个逻辑一致的细菌基因调控概念框架 | 细菌基因调控的基本概念 | 基因学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1533 | 2024-08-08 |
Parsing patterns: Emerging roles of tissue self-organization in health and disease
2024-Jun-20, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.05.016
PMID:38906093
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综述 | 本文综述了组织自组织在胚胎和成体组织中的模式形成原理和机制,并探讨了其在健康和疾病中的作用。 | 提出基于组织自组织模式的设计,可以用于合成生物学和复杂模式器官的生成。 | NA | 探讨组织自组织在健康和疾病中的作用及其在生物学和医学中的应用潜力。 | 胚胎和成体组织中的自组织模式及其在健康和疾病中的作用。 | 生物学 | 炎症性皮肤病,肿瘤 | NA | NA | NA | NA |
1534 | 2024-08-08 |
Expanding the capabilities of MuGENT for large-scale genetic engineering of the fastest-replicating species, Vibrio natriegens
2024-Jun-04, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03964-23
PMID:38667341
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研究论文 | 本文扩展了多重基因组编辑自然转化技术(MuGENT)在快速复制细菌Vibrio natriegens中的应用 | 识别了中性插入位点,展示了两个选择标记在此位点的交换,开发了消除诱导自然转化所需质粒的稳健方法,并展示了MuGENT在细菌中创建大规模删除的能力 | NA | 扩展MuGENT技术在Vibrio natriegens中的应用,提高其作为合成生物学模型生物的实用性 | Vibrio natriegens细菌 | 合成生物学 | NA | 多重基因组编辑自然转化技术(MuGENT) | NA | NA | NA |
1535 | 2024-08-08 |
A multiplexed, automated evolution pipeline enables scalable discovery and characterization of biosensors
2021-03-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21716-0
PMID:33664255
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DRIVER的多重自动化进化流程,用于大规模发现和表征生物传感器 | 使用aptamer-coupled ribozyme库和ribozyme再生方法,实现了RNA生物传感器的快速体外从头进化,并成功应用于小分子检测和基因表达调控 | NA | 开发一种可扩展的流程,用于从头设计和表征生物传感器,应用于生物制造、诊断、治疗和合成生物学 | 生物传感器及其在活细胞中的应用 | 合成生物学 | NA | DRIVER和CleaveSeq | NA | RNA | 六种小分子,包括五种之前未发现适配体的小分子 |
1536 | 2024-08-07 |
Splittable systems in biomedical applications
2024-Aug-06, Biomaterials science
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d4bm00709c
PMID:39012216
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综述 | 本文综述了可分割系统在生物医学应用中的设计原则、策略和应用 | 介绍了通过融合其他模式引入的几种结合对和正交分割片段,以开发更复杂和稳健的设计 | 文章提到了面临的挑战,如脱靶效应和过度激活,但未详细说明具体的解决方法 | 探讨可分割系统在生物医学领域的应用 | 可分割系统的设计和其在不同生物医学领域的应用 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
1537 | 2024-08-07 |
Microbial valorization of kraft black liquor for production of platform chemicals, biofuels, and value-added products: A critical review
2024-Aug, Journal of environmental management
IF:8.0Q1
DOI:10.1016/j.jenvman.2024.121631
PMID:38986370
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综述 | 本文综述了利用微生物技术将纸浆和造纸工业产生的硫酸盐黑液转化为平台化学品、生物燃料和其他高价值产品的潜力 | 介绍了利用合成生物学工具和分子技术,包括omics方法,来增强硫酸盐黑液的微生物增值 | 讨论了与毒性、杂质、低生产率和下游处理相关的挑战 | 探讨如何通过微生物增值技术实现纸浆和造纸工业的可持续发展,并贡献于联合国可持续发展目标 | 硫酸盐黑液的微生物增值及其在纸浆和造纸工业中的应用 | NA | NA | 合成生物学工具,分子技术,omics方法 | NA | NA | NA |
1538 | 2024-08-07 |
Biodiversity as a firewall to engineered microbiomes for restoration and conservation
2024-Jun, Royal Society open science
IF:2.9Q1
DOI:10.1098/rsos.231526
PMID:39100153
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研究论文 | 本文通过数学模型模拟了合成生物学干预对生态系统的影响,探讨了其对生物多样性和生态网络的潜在影响。 | 本文首次通过数学模型展示了合成生物学干预如何通过抑制共享资源的衰减来增加生物多样性,并成功地将合成生物融入生态网络。 | 本文主要基于数学模型进行模拟,实际应用中的效果和影响可能有所不同。 | 探讨合成生物学在生态恢复和保护中的应用及其对生物多样性的影响。 | 生态系统中的生物多样性和合成生物学干预的效果。 | 生态学 | NA | 数学模型 | NA | NA | NA |
1539 | 2024-08-07 |
Nanobody-mediated control of gene expression and epigenetic memory
2021-01-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20757-1
PMID:33483487
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研究论文 | 本文开发了一种使用小纳米抗体将内源性染色质调节因子招募到基因上以控制基因表达的策略 | 利用纳米抗体作为小型载体,有效结合并招募染色质调节因子,实现对特定基因的控制和表观遗传记忆的调节 | NA | 探索通过纳米抗体介导的染色质调节因子在特定基因位置的作用,以控制基因表达和表观遗传记忆 | 染色质调节因子、纳米抗体、基因表达和表观遗传记忆 | 合成生物学 | NA | 纳米抗体 | NA | 基因组 | NA |
1540 | 2024-08-07 |
Synergistic optimisation of expression, folding, and secretion improves E. coli AppA phytase production in Pichia pastoris
2021-Jan-07, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-020-01499-7
PMID:33494776
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研究论文 | 研究通过应用双向启动子(BDPs)及多种辅助蛋白优化Pichia pastoris中E. coli AppA植酸酶的表达、折叠和分泌 | 利用未在Pichia pastoris中表征的ERV2编码的黄素蛋白作为替代途径,显著提高了植酸酶的产量 | NA | 优化Pichia pastoris中异源蛋白的生产,特别是植酸酶的表达和分泌 | E. coli AppA植酸酶在Pichia pastoris中的表达、折叠和分泌 | 生物工程 | NA | 遗传工程 | NA | 蛋白质 | NA |