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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1541 | 2025-10-06 |
Spectral Algal Fingerprinting and Long Sequencing in Synthetic Algal-Microbial Communities
2024-09-14, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13181552
PMID:39329735
|
研究论文 | 本研究利用全光谱流式细胞术分析合成藻类-微生物群落,实现快速物种鉴定和计数 | 开发基于全光谱流式细胞术的光谱虚拟过滤系统,实现藻类群落的高通量多维分析和精确种群分离 | 需要建立标准化光谱库以提升藻类群落表征能力 | 推进合成生物学和浮游植物生态学研究 | 合成藻类-微生物群落 | 合成生物学 | NA | 全光谱流式细胞术 | NA | 光谱数据 | NA | NA | 藻类-微生物群落 | NA | 环境 |
| 1542 | 2025-10-06 |
A cell-free strategy for host-specific profiling of intracellular antibiotic sensitivity and resistance
2023-Dec-18, npj antimicrobials and resistance
DOI:10.1038/s44259-023-00018-z
PMID:39843793
|
研究论文 | 开发了一种基于肺炎克雷伯菌的无细胞基因表达系统,用于分析抗生素敏感性和耐药性 | 首次建立了肺炎克雷伯菌的无细胞基因表达系统,能够进行宿主特异性抗生素敏感性分析 | 初始提取物处理需要生物安全二级实验室,但后续可在生物安全一级实验室进行 | 开发宿主特异性工具研究抗生素敏感性和耐药性 | 肺炎克雷伯菌实验室和临床分离株 | 合成生物学 | 传染病 | 无细胞基因表达(CFE)、蛋白质组学 | NA | 蛋白质组数据、抗生素敏感性数据 | 实验室和临床分离的肺炎克雷伯菌株 | 无细胞基因表达系统 | 肺炎克雷伯菌, 大肠杆菌MG1655 | 抗生素敏感性分析生物传感器 | 医学 |
| 1543 | 2025-10-06 |
Long oligos: direct chemical synthesis of genes with up to 1728 nucleotides
2025-Jan-22, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc06958g
PMID:39759933
|
研究论文 | 开发了直接化学合成长达1728个核苷酸基因的新方法 | 在光滑表面进行合成而非传统多孔载体,结合捕获聚合纯化方法,突破200个核苷酸的合成限制 | NA | 实现长链寡核苷酸的高效化学合成 | 绿色荧光蛋白基因(800-mer)和29 DNA聚合酶基因(1728-mer) | 合成生物学 | NA | 化学合成、捕获聚合纯化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学,基因编辑,蛋白质工程 |
| 1544 | 2025-10-06 |
Synthetic Cell Lines for Inducible Packaging of Influenza A Virus
2024-02-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00526
PMID:38259154
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法开发了可诱导包装甲型流感病毒的人工细胞系 | 首次创建了用于生产细胞病变性负链RNA病毒的包装细胞系,并揭示了病毒RNA合成效率低和宿主抗病毒反应上调是潜在限制因素 | 病毒RNA合成效率不足和宿主抗病毒反应可能限制生产效率 | 开发新型甲型流感病毒疫苗生产方法 | 甲型流感病毒(IAV)和工程化细胞系 | 合成生物学 | 流感 | RNA-Seq转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | 合成生物学方法 | HEK293细胞 | 可诱导病毒包装系统,可产生除血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)外的所有病毒组分 | 医学 |
| 1545 | 2025-10-06 |
A Comprehensive Review of the Diversity of Fungal Secondary Metabolites and Their Emerging Applications in Healthcare and Environment
2024, Mycobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.1080/12298093.2024.2416736
PMID:39845176
|
综述 | 全面分析真菌次级代谢产物的多样性及其在医疗保健、农业、环境可持续性和营养保健品中的新兴应用 | 系统整合了基因工程、代谢途径操纵和合成生物学在提高真菌次级代谢产物产量方面的最新进展,并强调了组学技术在理解次级代谢产物生物合成调控中的重要性 | NA | 分析真菌次级代谢产物的多样性及其在医疗保健、环境和生物技术领域的应用潜力 | 真菌次级代谢产物及其生物合成途径 | 生物技术 | NA | 基因工程、代谢途径操纵、合成生物学、组学技术、发酵技术、生物加工、共培养方法 | NA | NA | NA | NA | 真菌 | NA | 医疗保健, 农业, 环境, 营养保健品, 工业生物技术 |
| 1546 | 2025-10-06 |
Bacterial carrier-mediated drug delivery systems: a promising strategy in cancer therapy
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1526612
PMID:39845371
|
综述 | 本文总结了细菌载体在癌症治疗中的药物递送应用及其临床转化前景 | 系统阐述细菌载体通过趋化性靶向肿瘤组织并激活抗肿瘤免疫反应的新型药物递送策略 | NA | 探讨细菌载体递送系统在癌症治疗中的潜力与临床应用前景 | 细菌载体递送的抗癌药物及其递送系统 | NA | 癌症 | 纳米医学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 1547 | 2025-10-06 |
RecJ 5' Exonuclease Digestion of Oligonucleotide Failure Strands: A "Green" Method of Trityl-On Purification
2017-05-09, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.7b00010
PMID:28459543
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研究论文 | 开发了一种使用RecJ 5'核酸外切酶纯化寡核苷酸的绿色环保方法 | 首次利用RecJ酶特异性消化未封闭的失败链,结合SSBP蛋白增强酶活性,实现低成本、环保的寡核苷酸纯化 | 仅针对5'羟基化单链DNA的消化效率进行了定量分析,未与其他纯化方法进行系统比较 | 解决合成生物学中寡核苷酸纯化的瓶颈问题 | 寡核苷酸合成中的失败链 | 合成生物学 | NA | 酶消化法、RecJ 5'核酸外切酶消化 | NA | 实验数据 | 53 pmol 5'羟基化单链DNA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 1548 | 2025-10-06 |
Exchange, promiscuity, and orthogonality in de novo designed coiled-coil peptide assemblies
2025-Jan-22, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc06329e
PMID:39720134
|
研究论文 | 本研究探索从头设计的卷曲螺旋肽组装体的动态特性,重点关注不同寡聚态之间的肽交换行为 | 开发了荧光报告检测方法研究肽交换动力学,发现设计肽存在同型交换忠实性和异型交换混杂性,并提出两种提高正交性的设计策略 | NA | 研究从头设计卷曲螺旋肽组装体的动态交换特性 | 系列卷曲螺旋肽组装体(从二聚体到七聚体) | 合成生物学 | NA | 荧光报告检测、肽设计 | NA | 荧光数据、动力学数据 | NA | NA | NA | 卷曲螺旋肽组装体 | 化学生物学, 合成生物学 |
| 1549 | 2025-10-06 |
Environment signal dependent biocontainment systems for engineered organisms: Leveraging triggered responses and combinatorial systems
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.12.005
PMID:39830078
|
综述 | 评估基于环境信号触发响应和组合系统的工程生物安全防护策略 | 系统分析多种环境触发因子(化学、光、温度、pH)与组合式生物防护系统的协同应用 | NA | 评估工程生物的环境信号依赖性生物防护系统 | 基因工程生物(GEOs)的生物防护系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境信号响应系统、组合式生物防护系统 | 环境, 工业生物技术 |
| 1550 | 2025-10-06 |
A Rapid and Reversible Molecular "Switch" Regulating Protein Expression in Chlamydomonas reinhardtii
2025-Jan-22, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.15360
PMID:39838873
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研究论文 | 本研究利用DD/Shield-1系统在莱茵衣藻中实现了外源蛋白表达的快速、可逆调控 | 首次将哺乳动物来源的DD/Shield-1系统成功应用于微藻系统,实现了外源基因的快速可逆调控 | 未明确说明该系统在不同外源蛋白中的普适性及长期稳定性 | 开发莱茵衣藻中外源基因表达调控的新方法 | 莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii) | 合成生物学 | NA | DD/Shield-1系统、基因编辑 | NA | 分子生物学数据 | NA | CRISPR-Cas12a | 莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii) | 分子开关系统,基于配体依赖的蛋白稳定性调控 | 工业生物技术 |
| 1551 | 2025-10-06 |
Constructing mechanosensitive signalling pathways de novo in synthetic cells
2025-Jan-21, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20231285
PMID:39838922
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综述 | 本文讨论在合成细胞中构建从头开始的机械敏感信号通路的研究进展 | 将机械敏感通道整合到合成细胞中创建全新的机械敏感信号通路 | NA | 通过合成生物学方法研究机械转导机制并开发新型生物技术 | 合成细胞和机械敏感信号通路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成细胞 | 机械敏感信号通路 | 医学诊断, 微反应器, 治疗 |
| 1552 | 2025-10-06 |
A parallel bioreactor strategy to rapidly determine growth-coupling relationships for bioproduction: a mevalonate case study
2025-Jan-17, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02599-x
PMID:39825460
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研究论文 | 本研究开发了一种利用平行生物反应器快速确定生物生产过程中生长-产物耦合关系的方法,并以甲羟戊酸生产为例进行验证 | 采用平行生物反应器策略快速绘制产物形成速率、底物利用速率与生长速率之间的耦合关系,并通过基因编辑消除有毒副产物乙酸盐的形成 | 研究仅以甲羟戊酸为例进行验证,方法在其他生物生产系统中的普适性需要进一步验证 | 开发快速评估生物生产过程中生长-产物耦合关系的方法,提高生物制造的经济可行性 | 甲羟戊酸生物生产过程中的生长-产物耦合关系 | 合成生物学 | NA | 平行生物反应器技术、基因编辑 | NA | 生物过程数据、代谢产物数据 | 使用大肠杆菌BW25113菌株及其基因编辑变体 | 基因编辑 | 大肠杆菌 | 通过敲除ackA-pta操纵子和poxB基因重构代谢通路 | 工业生物技术,能源,材料 |
| 1553 | 2025-10-06 |
Salmonella-based therapeutic strategies: improving tumor microenvironment and bringing new hope for cancer immunotherapy
2024-Dec-12, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-024-02578-0
PMID:39666238
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综述 | 本文系统阐述了沙门氏菌通过调控肿瘤微环境增强癌症免疫治疗效果的最新策略与进展 | 聚焦沙门氏菌重塑免疫抑制性肿瘤微环境的多重机制及其合成生物学改造策略 | NA | 探讨基于沙门氏菌的癌症免疫治疗新策略 | 沙门氏菌及其工程化改造株 | 合成生物学与免疫治疗 | 癌症 | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 遗传编程 | 沙门氏菌 | 肿瘤靶向系统、免疫调节回路 | 医药 |
| 1554 | 2025-10-06 |
Engineered Platforms for Maturing Pluripotent Stem Cell-Derived Liver Cells for Disease Modeling
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2023.01.013
PMID:36738860
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综述 | 本文综述了用于促进多能干细胞来源肝细胞成熟的工程平台技术及其在疾病建模中的应用 | 系统总结了多种先进技术平台(蛋白质微图案化、3D生物打印、微流控设备等)在改善干细胞来源肝细胞成熟度方面的创新应用 | NA | 开发能够促进多能干细胞来源肝细胞成熟的工程平台,用于肝脏疾病建模和药物开发 | 人多能干细胞(诱导多能干细胞和胚胎干细胞)分化的肝细胞样细胞 | 组织工程 | 肝脏疾病 | 蛋白质微图案化、3D生物打印、微流控技术、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 人类细胞 | NA | 医学 |
| 1555 | 2025-10-06 |
Directed evolution of an orthogonal transcription engine for programmable gene expression in eukaryotes
2025-Jan-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111541
PMID:39811667
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研究论文 | 本研究通过定向进化开发了一种适用于真核生物的正交转录引擎,用于程序化基因表达控制 | 将T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒单亚基加帽酶融合,并通过定向进化获得高活性变体,解决了T7 RNAP在真核系统中缺乏5'甲基鸟苷帽的局限性 | NA | 开发适用于真核生物的正交基因调控系统 | T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒加帽酶的融合酶 | 合成生物学 | NA | 定向进化 | NA | NA | NA | 定向进化 | 酵母, 哺乳动物细胞 | T7 RNAP-based遗传电路 | 工业生物技术 |
| 1556 | 2025-10-06 |
Directed evolution of an orthogonal transcription engine for programmable gene expression in eukaryotes
2024-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.25.614978
PMID:39386662
|
研究论文 | 本研究通过定向进化开发了一种适用于真核生物的正交转录引擎,显著提高了基因表达效率 | 将T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒单亚基加帽酶融合,通过定向进化获得活性提高两个数量级的变体 | NA | 开发适用于真核生物的正交基因表达调控系统 | T7 RNA聚合酶与加帽酶的融合酶 | 合成生物学 | NA | 定向进化 | NA | NA | NA | 定向进化 | 酵母, 哺乳动物细胞 | T7 RNAP为基础的遗传电路 | 医学, 工业生物技术 |
| 1557 | 2025-10-06 |
Continuous Fluorescence Assay for In Vitro Translation Compatible with Noncanonical Amino Acids
2024-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00353
PMID:38194520
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研究论文 | 开发了一种基于亲和钳蛋白检测短肽标签的连续荧光测定方法,用于非经典氨基酸的体外翻译检测 | 首次创建了与ncAAs兼容的连续荧光检测方法,克服了传统放射性终点测定和荧光蛋白方法的局限性 | NA | 开发适用于非经典氨基酸的高通量体外翻译检测方法 | 体外翻译系统、非经典氨基酸、tRNA密码子特异性 | 合成生物学 | NA | 连续荧光测定、mRNA展示、质谱分析 | NA | 荧光数据 | NA | NA | NA | NA | 药物发现, 合成生物学 |
| 1558 | 2025-10-06 |
RDBSB: a database for catalytic bioparts with experimental evidence
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae844
PMID:39360609
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研究论文 | 开发了一个包含实验证据的催化生物元件数据库RDBSB | 整合了83,193个经过人工整理的催化生物元件,提供详细的定性和定量催化信息及分析工具 | NA | 为合成生物学中的代谢途径设计提供全面的催化生物元件资源 | 催化生物元件及其功能特性 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 生物元件功能数据 | 83,193个催化生物元件,其中超过1000个通过社区提交系统贡献 | NA | NA | 代谢途径设计工具 | 工业生物技术 |
| 1559 | 2025-10-06 |
A model-driven approach to upcycling recalcitrant feedstocks in Pseudomonas putida by decoupling PHA production from nutrient limitation
2024-04-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113979
PMID:38517887
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研究论文 | 本研究通过模型驱动方法在恶臭假单胞菌中实现生长阶段PHA生产,解决了传统营养限制条件下PHA生产的限制 | 采用合成生物学方法解除PHA生产与营养限制的耦合关系,首次在生长阶段实现高效PHA生产 | NA | 开发新型PHA生产策略以克服传统生物工艺的复杂性 | 恶臭假单胞菌工程菌株及其PHA生产能力 | 合成生物学 | NA | 合成生物学,模型驱动方法,生长耦合策略 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 恶臭假单胞菌 | 碳流重定向和调控约束解除的代谢工程策略 | 工业生物技术,环境 |
| 1560 | 2025-10-06 |
Synthetic Biology Meets Ca2+ Release-Activated Ca2+ Channel-Dependent Immunomodulation
2024-03-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13060468
PMID:38534312
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综述 | 本文总结了合成生物学工具在精确调控CRAC通道及其免疫相关下游信号通路中的应用 | 首次系统整合合成生物学方法与CRAC通道免疫调节的交叉研究 | 仅涵盖现有研究工具总结,未提出新的实验方案或技术突破 | 探讨合成生物学工具对CRAC通道信号通路的精确调控 | CRAC通道分子组件(STIM/Orai)及其免疫调节功能 | 合成生物学 | 免疫相关疾病 | 分子工程、细胞工程 | NA | 文献资料 | NA | NA | 免疫细胞 | CRAC通道信号通路调控 | 医学 |