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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1561 | 2025-10-06 |
Synthetic biology for the food industry: advances and challenges
2025-Feb, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2340530
PMID:38797660
|
综述 | 本文综述了合成生物学在食品工业中的最新进展、应用及未来前景 | 系统总结了合成生物学在传统食品替代品、功能性食品和绿色食品三大领域的创新应用 | 作为综述文章,未涉及原始实验研究和具体技术细节 | 探讨合成生物学技术解决食品工业面临挑战的潜力 | 食品工业中的合成生物学应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 细胞工厂 | NA | 食品工业 |
| 1562 | 2025-10-06 |
Recent advances in genome mining and synthetic biology for discovery and biosynthesis of natural products
2025-Feb, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2383754
PMID:39134459
|
综述 | 本文综述了基因组挖掘和合成生物学在天然产物发现与生物合成中的最新进展 | 整合基因组挖掘与合成生物学技术解决天然产物多样性不足、效率低下和产量低的问题 | NA | 探索基因组挖掘和合成生物学在天然产物生产中的应用前景 | 天然产物的发现与生物合成 | 合成生物学 | NA | 基因组测序、生物信息学工具、大数据分析、基因工程、代谢工程、系统生物学 | NA | 基因组数据 | NA | 基因工程、代谢工程 | NA | NA | 医药、工业生物技术 |
| 1563 | 2025-10-06 |
Chemical and Biological Investigations of Antiviral Agents Against Plant Viruses Conducted in China in the 21st Century
2024-Dec-23, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15121654
PMID:39766921
|
综述 | 概述中国在21世纪针对植物病毒的抗病毒剂研究进展,包括作用靶点生物学特性、药物与靶点互作模式及未来研发方向 | 系统整合化学生物学、化学信息学与合成生物学等多学科方法,提出植物病毒药物研发与人类病毒药物开发的交叉借鉴视角 | NA | 促进作物抗病毒剂的深度研发,并为人类及兽用抗病毒药物开发提供参考 | 植物病毒及其抗病毒剂 | NA | 植物病毒病 | 化学生物学、化学信息学、生物信息学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业, 医药 |
| 1564 | 2025-10-06 |
Classical and Modern Models for Biofilm Studies: A Comprehensive Review
2024-Dec-18, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics13121228
PMID:39766618
|
综述 | 系统总结用于生物膜研究的实验室模型设计及其优缺点 | 整合传统与现代生物膜模型,并提出通过增材制造、合成生物学和生物工程技术改进模型的新思路 | 现有实验室模型存在多种局限性,无法完全模拟真实场景 | 开发更适合研究生物膜特性和耐药机制的实验室模型 | 生物膜微生物群落 | 生物工程 | NA | 增材制造、合成生物学、生物工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 1565 | 2025-10-06 |
An Upstream G-Quadruplex DNA Structure Can Stimulate Gene Transcription
2024-03-15, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.3c00775
PMID:38417105
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法证明基因启动子中的G-四链体结构能够增强基因转录 | 首次在染色体整合的合成启动子中直接证明G-四链体结构形成可刺激基因转录,且效应与序列组成无关 | 研究基于合成报告基因系统,在天然基因组环境中的普遍性需进一步验证 | 探究G-四链体结构对基因转录的调控作用 | 人类细胞中整合的合成报告基因启动子 | 合成生物学 | NA | 染色体整合、合成启动子工程 | NA | 基因表达数据 | NA | 合成生物学方法 | 人类细胞 | 含G-四链体形成序列的合成启动子 | 基础研究 |
| 1566 | 2025-10-06 |
Discovery, Biomanufacture, and Derivatization of Licorice Triterpenoids
2025-Jan-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c08110
PMID:39644261
|
综述 | 本文全面综述甘草三萜类化合物的结构、来源、药理活性、生物制造及结构修饰研究进展 | 首次系统总结甘草三萜类化合物整体特征(而非仅关注甘草酸和甘草次酸),并应用drugCIPHER算法预测其药理活性 | NA | 探索甘草三萜类化合物的发现、生物制造和结构修饰策略 | 甘草三萜类化合物(以甘草酸和甘草次酸为代表) | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法、drugCIPHER算法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 1567 | 2025-10-06 |
Golden Gate Cloning of Multigene Constructs Using the Modular Cloning System MoClo
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_2
PMID:39363064
|
研究论文 | 介绍使用模块化克隆系统MoClo进行多基因构建体组装的实验方案 | 利用类型IIS酶进行DNA组装的模块化克隆系统,通过一系列一锅法组装步骤实现多基因构建体的高效组装 | NA | 开发高效的多基因构建体组装方法 | 多基因构建体的组装策略和实验流程 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, MoClo | NA | 多基因构建体 | 生物研究, 合成生物学 |
| 1568 | 2025-10-06 |
Standardized Golden Gate Assembly Metadata Representation Using SBOL
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_6
PMID:39363068
|
研究论文 | 开发了一种用于创建SBOL表示构建计划的软件工具,以模拟IIS型介导的组装反应并存储相关元数据 | 首次实现了使用SBOL标准化表示Golden Gate组装元数据的软件工具 | NA | 为合成生物学领域提供标准化的DNA组装元数据表示方法 | DNA组装构建计划 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | 元数据 | NA | Golden Gate Assembly, SBOL | NA | DNA组装构建计划 | 工业生物技术 |
| 1569 | 2025-10-06 |
Golden Gate Cloning of MoClo Standard Parts
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_1
PMID:39363063
|
研究论文 | 本文详细介绍了MoClo系统标准部件的Golden Gate克隆方案 | 提供了标准部件克隆的详细步骤方案,包括大片段标准部件的中间构建策略 | NA | 开发合成生物学中DNA组装的高效方法 | MoClo系统的标准部件(level 0模块) | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆,PCR,DNA测序 | NA | DNA序列 | NA | Golden Gate Assembly | NA | 标准部件(启动子、编码序列、终止子等遗传元件) | 工业生物技术 |
| 1570 | 2025-10-06 |
Automation and Miniaturization of Golden Gate DNA Assembly Reactions Using Acoustic Dispensers
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_9
PMID:39363071
|
研究论文 | 本文提供了使用声波分配器在1μL总体积中执行和并行化Golden Gate克隆反应的逐步方案 | 首次将声波分配技术应用于Golden Gate DNA组装反应,实现反应体积从10-25μL缩小至1μL的微型化 | NA | 开发自动化和小型化的DNA组装方法 | Golden Gate DNA组装反应 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, 声波分配器 | NA | 模块化分层DNA片段组装 | 工业生物技术 |
| 1571 | 2025-10-06 |
Validation of Golden Gate Assemblies Using Highly Multiplexed Nanopore Amplicon Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_10
PMID:39363072
|
研究论文 | 本文提出了一种使用纳米孔测序平台进行高度多重双条形码扩增子测序的详细方案,用于验证Golden Gate组装结果 | 开发了名为DuBA.flow的完整工作流程,实现从单菌落到最终易解读测序报告的一站式解决方案 | NA | 为Golden Gate组装提供高效可靠的序列验证方法 | Golden Gate组装产物 | 合成生物学 | NA | 纳米孔测序, 双条形码扩增子测序, PCR | NA | DNA测序数据 | NA | Golden Gate Assembly | NA | 转录单元组装, 多基因构建体 | 工业生物技术 |
| 1572 | 2025-10-06 |
Biofoundry-Assisted Golden Gate Cloning with AssemblyTron
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_8
PMID:39363070
|
研究论文 | 介绍开源Python软件包AssemblyTron如何通过低成本开源机器人实现Golden Gate克隆的自动化 | 开发了AssemblyTron的升级功能,包括模块化克隆载体组装、易错PCR组合突变库组装和索引质粒库组装 | NA | 为合成生物学提供经济高效的Golden Gate组装自动化解决方案 | DNA构建体和组合文库 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装、易错PCR | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, OpenTrons OT-2 | NA | 模块化克隆系统、组合突变库、索引质粒库 | 工业生物技术 |
| 1573 | 2025-10-06 |
Golden Gate Cloning of Expression Plasmids for Synthetic Small RNAs in Bacteria
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_17
PMID:39363079
|
研究论文 | 介绍基于Golden Gate组装技术快速构建细菌合成小RNA表达质粒的方法和工具 | 开发了用于大肠杆菌的质粒系列和G-GArden工具,支持无疤痕组装策略的寡核苷酸设计 | NA | 建立合成小RNA表达质粒的快速高效构建方法 | 细菌小RNA和合成生物学构建模块 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, G-GArden | Escherichia coli | 合成小RNA表达系统 | 工业生物技术 |
| 1574 | 2025-10-06 |
Modular Golden Gate Assembly of Linear DNA Templates for Cell-Free Prototyping
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_11
PMID:39363073
|
研究论文 | 开发了一种基于Golden Gate组装的无克隆工作流程,用于快速生产线性DNA模板以用于无细胞转录翻译系统 | 通过Golden Gate组装和PCR扩增实现无细胞快速原型设计,无需耗时的大肠杆菌转化和克隆步骤 | NA | 加速合成生物学中设计-构建-测试-学习周期的新功能开发 | 线性DNA模板和遗传调控元件 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装、PCR、无细胞转录翻译(TXTL) | NA | 遗传元件功能数据 | NA | Golden Gate Assembly | 无细胞系统 | 转录单元组装,包括启动子、核糖体结合位点(RBS)、编码序列和终止子 | 工业生物技术 |
| 1575 | 2025-10-06 |
Golden Gate Cloning for the Standardized Assembly of Gene Elements with Modular Cloning in Chlamydomonas
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_25
PMID:39363087
|
研究论文 | 本文描述了利用Golden Gate组装和模块化克隆技术在莱茵衣藻中构建转基因表达遗传盒的方法 | 将模块化克隆技术应用于单细胞模型藻类莱茵衣藻的转基因表达 | NA | 开发快速高效的克隆策略用于合成生物学中转基因单元或通路的组装 | 莱茵衣藻中的转基因表达遗传盒 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, Modular Cloning | Chlamydomonas reinhardtii | 转基因表达遗传盒 | 工业生物技术 |
| 1576 | 2025-10-06 |
Biomimetic Materials to Fabricate Artificial Cells
2024-Dec-11, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00241
PMID:39591535
|
综述 | 本文综述了基于仿生材料构建人工细胞的研究进展,重点关注自下而上的构建策略 | 系统探讨了从简单细胞支架到多室系统、从功能模块构建到关键代谢行为模拟的人工细胞仿生策略 | 对该领域的瓶颈进行了初步分析 | 开发人工细胞构建技术并弥合材料工程与生命科学之间的鸿沟 | 人工细胞及其构建材料 | 合成生物学 | NA | 仿生技术、自下而上构建策略 | NA | NA | NA | NA | NA | 细胞支架、多室系统、功能模块、代谢行为模拟、通信网络仿生 | 医学, 工业生物技术 |
| 1577 | 2025-10-06 |
Cathelicidins in farm animals: Structural diversity, mechanisms of action, and therapeutic potential in the face of antimicrobial resistance
2025-Jan, Veterinary immunology and immunopathology
IF:1.4Q2
DOI:10.1016/j.vetimm.2024.110866
PMID:39708585
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综述 | 本文综述了农场动物中cathelicidins抗菌肽的结构多样性、作用机制及其在应对抗菌素耐药性中的治疗潜力 | 聚焦农场动物特异性cathelicidins,系统阐述其结构多样性、多重作用机制及作为抗生素替代品的临床前景 | NA | 探讨cathelicidins在农场动物中的免疫机制及其对抗菌素耐药性的治疗应用 | 农场动物中的cathelicidins抗菌肽家族 | NA | 感染性疾病 | NA | NA | 文献资料 | NA | 合成生物学 | 农场动物 | NA | 医药 |
| 1578 | 2025-10-06 |
A Linear Mixed Effects Model for Evaluating Synthetic Gene Circuits
2024-Dec-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.30.630778
PMID:39803539
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研究论文 | 提出使用线性混合效应模型来分析和量化合成基因布尔逻辑门性能 | 首次将线性混合效应模型应用于合成基因电路分析,提出固定效应β作为布尔逻辑门性能的统一描述符 | NA | 标准化合成基因电路性能评估的统计方法 | 合成基因布尔逻辑门 | 合成生物学 | NA | 线性混合效应模型, k-means聚类, 蒙特卡洛模拟 | 线性混合效应模型 | 基因电路性能数据 | 144个已发表的布尔逻辑门 | NA | NA | 布尔逻辑门(OR、AND等), 嵌套阻遏蛋白OR门 | 计算, 生物传感, 人类健康 |
| 1579 | 2025-10-06 |
Expression of Viral DNA Polymerase in Synthetic Recombinant Adeno-Associated Virus Producer Cell Line Enhances Full Particle Productivity
2025-Feb, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28885
PMID:39578398
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法在HEK293细胞系中整合HSV-1 DNA聚合酶基因,显著提高了重组腺相关病毒(rAAV)的完整病毒颗粒产量 | 首次在合成rAAV生产细胞系中整合HSV-1 DNA聚合酶复合体(UL30/UL42),通过增强AAV基因组扩增来提高完整病毒颗粒比例 | 研究仅验证了rAAV2和rAAV8两种血清型,未涉及其他血清型或大规模生产工艺验证 | 开发可扩展的rAAV生产技术以满足基因治疗临床需求 | 重组腺相关病毒(rAAV)生产细胞系 | 合成生物学 | 基因治疗 | 合成生物学、病毒载体技术 | NA | 病毒滴度检测数据 | GX6B细胞系及其改造克隆 | 基因整合、诱导表达系统 | HEK293细胞 | 诱导型启动子控制的HSV-1 DNA聚合酶表达系统 | 医药 |
| 1580 | 2025-10-06 |
Engineering Saccharomyces cerevisiae for medical applications
2025-Jan-09, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02625-5
PMID:39789534
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综述 | 本文综述了工程化酿酒酵母在医学领域的三大应用方向:作为药物和疫苗的细胞工厂、诊断用生物传感器以及肠道疾病活体治疗产品 | 系统梳理了酿酒酵母从食品工业到医学应用的身份转变,聚焦其在合成生物学推动下的创新医疗应用场景 | 该领域仍面临技术挑战和商业化障碍(文中未具体说明样本规模或实验数据局限) | 探讨工程化酿酒酵母在医学应用中的发展现状与前景 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的基因工程改造体 | 合成生物学 | 肠道疾病 | 基因工程技术 | NA | 文献资料 | NA | NA | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 生物传感器、活体治疗系统 | 医学 |