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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-01-10 |
Engineered Lactobacillus expressing tumor-killing cytokines: a novel biotherapeutic
2026-Jan, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000004400
PMID:41497134
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研究论文 | 本文探讨了工程化乳酸菌表达肿瘤杀伤细胞因子作为新型生物治疗策略,用于治疗实体瘤 | 利用工程化乳酸菌局部表达细胞因子,结合微生物安全性和精准免疫激活,避免了全身性细胞因子治疗的严重毒性 | 研究基于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证,且工程菌的生物安全性和长期控制需进一步优化 | 开发一种低毒性、局部作用的抗肿瘤生物治疗方法,以替代传统全身性细胞因子治疗 | 工程化乳酸菌及其表达的肿瘤杀伤细胞因子(如IL-12、IL-15、TRAIL) | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学工具(如诱导型启动子、生物安全杀死开关) | NA | 实验数据 | 小鼠模型 | 合成生物学工具 | 乳酸菌 | 设计表达肿瘤杀伤细胞因子(如IL-12、IL-15、TRAIL)的合成生物电路 | 医学 |
| 142 | 2026-01-10 |
Green Drug Discovery: Leveraging Biodiversity for Sustainable Pharmaceutical Solutions
2026-Jan, Chemistry & biodiversity
IF:2.3Q3
DOI:10.1002/cbdv.202500733
PMID:41504102
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综述 | 本文探讨了绿色药物发现如何利用生物多样性、绿色化学、生物技术和人工智能实现可持续制药转型 | 整合生物多样性、绿色化学、生物技术和人工智能,推动制药行业向可持续方向转型 | 面临生物勘探伦理、资源保护及公平利益分享等挑战 | 探索绿色制药在减少环境危害同时促进药物创新的潜力 | 植物、微生物和海洋生物等生物多样性资源 | NA | NA | 合成生物学、CRISPR基因编辑、代谢工程、生物催化、超临界流体提取 | 人工智能、机器学习 | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医药 |
| 143 | 2026-01-10 |
Spatial engineering for biocatalytic cascade control through biomolecular compartmentalization
2025-Dec-29, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108786
PMID:41475588
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综述 | 本文系统评估了通过生物分子区室化实现生物催化级联控制的空间工程平台 | 建立了理解不同空间控制原理的框架,并展望了面向合成生物学和细胞工程的多功能空间组织工具和仿生平台的未来发展 | 当前在机制阐明、动态调控和跨系统兼容性方面存在局限 | 通过生物分子区室化实现生物催化过程的代谢通量调控 | 空间工程平台,包括支架化区室(脂质体、DNA折纸、聚合物囊泡和细菌微区室)和无支架组装体(无膜细胞器和凝聚层) | 合成生物学 | NA | 生物分子区室化 | NA | NA | NA | DNA折纸, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌, 哺乳动物细胞 | 代谢通路, 生物传感器 | 工业生物技术, 医药 |
| 144 | 2026-01-10 |
Development and application of synthetic biology tools for improved production of human breast milk components
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.08.002
PMID:41497495
|
综述 | 本文综述了合成生物学工具在提高人乳成分微生物发酵生产效率和构建细胞工厂方面的应用 | 系统总结了合成生物学工具在优化人乳成分生产中的潜在应用,并探讨了相关细胞工厂构建的挑战与机遇 | NA | 提高人乳成分的微生物发酵生产效率,以降低生产成本、简化制造过程并减少环境污染 | 人乳成分及其在微生物细胞工厂中的合成 | 合成生物学 | NA | 微生物发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌, 哺乳动物细胞 | 生物传感器, 代谢途径 | 医药, 食品, 工业生物技术 |
| 145 | 2026-01-10 |
Construction of microbial systems for polyethylene terephthalate degradation
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.07.013
PMID:41497499
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综述 | 本文综述了用于聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)降解的微生物系统的构建研究现状 | NA | NA | 探讨PET塑料微生物降解的研究现状与未来发展潜力 | 聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)塑料 | 合成生物学 | NA | 微生物降解、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 146 | 2026-01-10 |
[Research advances in biosynthetic pathways of monoterpenes]
2025-Oct, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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综述 | 本文系统梳理了单萜类化合物的已知生物合成途径,重点分析了各阶段调控酶的催化原理与特性,并讨论了单萜异源生产的影响因素 | 通过整合测序技术与合成生物学研究,为单萜生产提供绿色、高效、可持续的生物合成替代方案,并系统分析途径中的关键酶及其作用机制 | NA | 为更好地理解单萜生物合成途径的进化奠定基础,并为利用微生物高效生产高价值活性单萜化合物提供方向 | 单萜类化合物的生物合成途径及其调控酶 | 合成生物学 | NA | 测序技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 单萜生物合成途径 | 食品,化妆品,医药 |
| 147 | 2026-01-10 |
Active learning-guided optimization of cell-free biosensors for lead testing in drinking water
2025-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.20.671382
PMID:40894645
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于机器学习的多目标优化方法,用于设计和优化基于变构转录因子的无细胞生物传感器,以检测饮用水中的铅污染 | 提出了一种结合机器学习、定向标记和无细胞基因表达的多目标优化框架,可同时优化生物传感器的灵敏度和选择性,克服了传统定向进化的局限性 | NA | 开发用于饮用水铅检测的高性能无细胞生物传感器 | 基于变构转录因子PbrR的生物传感器 | 合成生物学 | NA | 机器学习、无细胞基因表达、定向进化 | 机器学习模型 | 序列到功能数据、配对数据集 | NA | NA | 无细胞系统 | 基于变构转录因子的生物传感器 | 环境监测 |
| 148 | 2026-01-10 |
Cnidarian toxins: omics approaches and recombinant proteins
2025, The journal of venomous animals and toxins including tropical diseases
IF:1.8Q3
|
综述 | 本文综述了利用组学技术和重组蛋白方法研究刺胞动物毒素的最新进展、局限性与未来前景 | 整合了组学技术、重组表达系统、合成生物学及人工智能计算工具在刺胞动物毒素研究中的协同应用,并展望了其在生物活性化合物开发中的潜力 | 复杂毒素的功能验证与生产仍具挑战性,尤其是需要复杂折叠或翻译后修饰的毒素;细胞游离蛋白合成系统等新技术的工业可扩展性仍有限 | 探索刺胞动物毒素的分子多样性、药理潜力及其作为生物活性化合物的来源 | 刺胞动物(如水母、海葵等)产生的毒素 | NA | NA | 基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、重组蛋白表达、细胞游离蛋白合成系统 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质数据、代谢物数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、生物技术 |
| 149 | 2026-01-09 |
Integrating synthetic biology and process engineering for enhanced isobutanol biosynthesis yield and sustainability
2026-Jan-08, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-025-02720-8
PMID:41501833
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综述 | 本文综述了异丁醇生物合成的最新进展,并从生物学和工程学角度探讨了提高产量的策略 | 整合合成生物学与过程工程,以提升异丁醇生物合成的产量和可持续性,强调酶途径优化、代谢工程和细胞工程的多学科方法 | 异丁醇的细胞毒性和挥发性导致生产过程中的损失,且酶和代谢途径的修改仍需进一步优化以提高效率和产量 | 提高异丁醇作为生物燃料和平台化学品的生物合成产量和可持续性 | 异丁醇生物合成过程,包括酶途径、代谢工程、细胞工程和发酵技术 | NA | NA | 代谢工程、细胞工程、高通量筛选技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌、酿酒酵母、枯草芽孢杆菌、哺乳动物细胞、植物 | 生物传感器、代谢途径、逻辑门、振荡器、切换开关 | 能源、医药、精细化学品、工业生物技术、环境 |
| 150 | 2026-01-09 |
Leveraging AI for cell biology discovery
2026-Jan-08, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20253023
PMID:41502213
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综述 | 本文综述了人工智能在细胞生物学中的多样化应用,包括显微镜成像、药物发现和合成生物学等领域 | 强调了AI在单细胞分辨率分析、细胞行为建模以及蛋白质结构预测方面的突破性进展 | 讨论了数据质量要求、模型可解释性以及AI工具普及化等关键挑战 | 探索人工智能如何推动细胞生物学的基础研究和治疗应用 | 细胞生物学中的复杂生物数据,如细胞图像、转录组学和蛋白质相互作用 | 机器学习 | NA | 深度学习 | NA | 图像、转录组数据、蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、基础研究 |
| 151 | 2026-01-09 |
Rapid evolution of a highly efficient RNA polymerase by homologous recombination
2026-Jan-07, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-025-02124-7
PMID:41501182
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研究论文 | 本文通过同源重组和定向进化,将高选择性DNA聚合酶转化为具有高效RNA合成活性的非天然同源物 | 利用单细胞液滴微流体选择策略,在短进化路径中成功开发出C28聚合酶,该酶能以约3 nt/s的速率合成高保真度RNA,并接受多种修饰RNA类似物 | 未明确提及具体限制,但可能涉及工程聚合酶在复杂生物环境中的稳定性和应用范围 | 将DNA聚合酶重编程为高效RNA合成酶,以推动生物技术和医学应用 | DNA聚合酶家族及其非天然同源物C28 | 合成生物学 | NA | 同源重组、定向进化、单细胞液滴微流体选择、PCR | NA | NA | NA | 同源重组 | NA | NA | 生物技术, 医学 |
| 152 | 2026-01-09 |
Synthetic bacterium-facilitated colonization of nitrogen-fixing bacteria for remodeling the rhizosphere microbiome and improving plant yield
2025-Nov-29, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-025-02189-5
PMID:41318663
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法,利用表达多糖结合蛋白的工程菌EcCMC,促进固氮细菌在豆科植物根部的定殖,从而改善根际微生物组、提高固氮效率和植物产量 | 首次设计并应用表达表面展示人工多糖识别蛋白Cmc的合成细菌EcCMC,以增强固氮细菌在植物根部的定殖能力,从而调控根际微生物组 | 研究仅针对两种豆科植物(紫云英和紫花苜蓿)进行了短期(28天)实验,样本量较小(n=3),且未评估长期效应或在不同环境条件下的适用性 | 通过合成生物学手段改善固氮细菌在植物根部的定殖效率,以增强生物固氮作用、提高土壤肥力和植物产量 | 豆科植物(紫云英和紫花苜蓿)及其根际微生物组,包括固氮细菌(如Sinorhizobium meliloti和Sphingomonas endophytica)和工程菌EcCMC | 合成生物学 | NA | 16S rRNA基因扩增子测序、代谢组学分析、氮酶活性测定 | NA | 微生物组测序数据、代谢物数据、生化指标数据 | 每组3个重复,共3个处理组(对照组、NFBs加EcM组、NFBs加EcCMC组) | 基因工程 | 大肠杆菌(E. coli) | 设计表达表面展示人工多糖识别蛋白Cmc的合成细菌EcCMC,用于结合植物根部多糖并促进固氮细菌定殖 | 农业 |
| 153 | 2026-01-09 |
Recent advances in nucleic acid nanotechnology-driven artificial transcriptional components
2025-Nov-27, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr03210e
PMID:41221719
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综述 | 本文综述了核酸纳米技术在转录调控中的应用,重点介绍了其在模块化设计、动态响应和逻辑信息处理方面的优势 | 利用核酸纳米技术的可编程性、时空精确性和分子级可控性,构建人工转录组件以实现精确的转录调控 | NA | 探讨核酸纳米技术在转录调控领域的应用潜力 | 人工转录组件及其在转录过程中的调控机制 | 合成生物学 | NA | 核酸纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 人工转录组件,包括模块化设计、动态响应和逻辑信息处理 | 生物计算、智能生物制造、生物传感 |
| 154 | 2026-01-09 |
Recent advances in the transformation of maleimides via annulation
2025-Jan-02, Organic & biomolecular chemistry
IF:2.9Q1
DOI:10.1039/d4ob01632g
PMID:39545834
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综述 | 本文综述了2019年至2024年间马来酰亚胺通过环化反应转化的最新研究进展,重点介绍了其在环化、苯环化、环加成和螺环化等反应中的应用 | 总结了光催化和电化学等新兴方法在马来酰亚胺环化反应中的应用,拓展了其合成复杂分子的可持续性和选择性途径 | 某些反应如基于环加成的环化、光环化和电化学转化在制药和化学工业中潜力巨大但尚未被充分探索 | 系统梳理马来酰亚胺环化策略的研究进展,探讨其在合成生物学和材料科学中的新应用方向 | 马来酰亚胺骨架及其环化反应 | 有机化学 | NA | 光催化、电化学方法、C-H活化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物化学、药物发现、材料科学 |
| 155 | 2026-01-09 |
Harnessing mass spectrometry-based proteomics for continuous directed evolution
2025, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaf017
PMID:41492657
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研究论文 | 本文探讨了如何利用基于质谱的蛋白质组学技术来支持连续定向进化过程,以AtMS1和AtMS2甲硫氨酸合酶的连续进化为例 | 首次将基于质谱的蛋白质组学(包括全蛋白质组分析和靶向蛋白质组学)系统性地应用于连续定向进化过程中,以监测目标酶丰度、识别群体构建缺陷、测量代谢适应并指导进化策略决策 | NA | 开发并展示一种利用蛋白质组学技术来增强连续定向进化效率和理解进化机制的方法 | 甲硫氨酸合酶AtMS1和AtMS2的连续定向进化过程 | 合成生物学 | NA | 基于质谱的蛋白质组学(全蛋白质组分析、靶向蛋白质组学) | NA | 蛋白质组数据 | NA | 连续定向进化 | 平台细胞(具体未指明) | NA | 工业生物技术 |
| 156 | 2026-01-09 |
Emerging trends in genome integration tools for precision engineering of diverse bacterial species
2025, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaf019
PMID:41492658
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综述 | 本文综述了用于多种细菌物种精确基因编辑的基因组整合工具的新兴趋势,重点关注自包含、便携式系统 | 强调CRISPR引导系统与整合酶结合的最新进展,以及面向非模式生物的工程化趋势 | 依赖宿主DNA修复机制的传统技术限制了在缺乏这些能力的生物中的应用 | 探索和推动细菌基因组精确整合工具的发展,以实现细胞表型的全面工程化和新生物技术的创建 | 细菌物种,特别是非模式生物 | 合成生物学 | NA | 同源重组、CRISPR引导系统、整合酶技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 重组工程技术 | 细菌 | NA | 工业生物技术, 环境, 能源, 材料 |
| 157 | 2026-01-08 |
The multifaceted significance of phosphoinositides in endocytic trafficking
2026-Jan-07, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70268
PMID:41496670
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综述 | 本文综述了磷酸肌醇作为细胞区室“脂质编码”在内存运输中的多种作用,并探讨了相关技术进展及其在人类疾病中的意义 | 系统整合了磷酸肌醇在内存运输各环节(内存作用、内体分选、降解与回收)的功能,并强调了新兴技术(如荧光生物传感器、超分辨率显微镜、光遗传学与合成生物学)在解析其动态中的作用 | NA | 阐明磷酸肌醇在内存运输中的功能及其与人类疾病的关联,探索潜在治疗靶点 | 磷酸肌醇及其代谢酶(激酶与磷酸酶)、内存运输过程 | NA | 癌症、神经退行性疾病 | 荧光生物传感器、超分辨率显微镜、光遗传学、合成生物学、系统生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 158 | 2026-01-08 |
Role of CRISPR in bioremediation of heavy metal(loid): a breakthrough in environmental biotechnology
2026-Jan-07, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04770-4
PMID:41498982
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综述 | 本文综述了CRISPR技术在重金属(类金属)生物修复中的应用,探讨了其在环境生物技术领域的突破性潜力 | 首次提出了将CRISPR编辑与多组学、合成生物学及新兴CRISPR生物传感器整合的统一路线图,用于指导下一代生物修复技术的发展 | 讨论了当前存在的生态风险、技术难题、法规问题及未来实地部署的挑战 | 探讨CRISPR技术如何提升生物修复的效率、特异性和可扩展性,以应对重金属污染 | 微生物和植物中的金属转运蛋白、解毒酶和应激反应通路 | 环境生物技术 | NA | CRISPR基因组工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物, 植物 | 生物传感系统 | 环境 |
| 159 | 2026-01-08 |
Intracellular biosensors by functional nanomaterial-integrated CRISPR technologies for real-time molecular sensing
2026-Jan-06, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d5cc05016b
PMID:41277417
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综述 | 本文综述了基于CRISPR技术和纳米材料集成的细胞内生物传感器的最新进展,用于实时分子传感 | 将CRISPR系统的可编程性和靶向特异性与纳米材料(如金纳米颗粒、量子点、DNA纳米结构)相结合,以增强细胞内递送效率、信号放大和传感器稳定性,并实现多模态传感和单细胞分辨率分析 | NA | 开发用于实时、动态监测细胞过程和分子事件的细胞内生物传感器 | 细胞内信号,包括核酸、非编码RNA和小分子代谢物 | 合成生物学 | NA | CRISPR技术(Cas9、Cas12、Cas13),纳米技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12, CRISPR-Cas13 | NA | 生物传感器 | 医学, 合成生物学 |
| 160 | 2026-01-08 |
Rewiring gene circuits to dissect oscillatory signaling dynamics
2026-Jan-05, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.353319.125
PMID:41162152
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法重构了DELTA-NOTCH信号通路,以研究脊椎动物胚胎体节分割时钟中的振荡性细胞间通讯 | 首次在DELTA缺陷的体节前中胚层类器官中整合合成DELTA-NOTCH通路,并利用光遗传学激活揭示配体呈现动力学对细胞通讯的关键作用 | 研究基于类器官模型,与完整胚胎环境存在差异;合成通路的长期稳定性未充分验证 | 探究振荡性细胞间信号在发育过程中的作用机制 | 脊椎动物胚胎的体节前中胚层类器官 | 合成生物学 | NA | 合成生物学重构、光遗传学激活 | NA | NA | NA | 合成生物学电路设计 | 脊椎动物胚胎类器官 | 合成DELTA-NOTCH信号通路,具备光遗传学可调控的配体呈现功能 | 基础发育生物学研究 |