本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-11-25 |
Photo-excited extracellular electron transfer of electroactive microorganism triggers RAFT polymerization
2025-Nov-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65119-x
PMID:41271685
|
研究论文 | 本研究开发了一种利用电活性微生物触发RAFT聚合的新方法,通过希瓦氏菌分泌的黄素介导电子转移来持续产生自由基 | 首次实现了电活性微生物触发的无末端基团异质性聚合,将微生物胞外电子传递途径与光诱导电子转移相结合 | NA | 开发生物触发的高效可控聚合平台 | 希瓦氏菌及其分泌的黄素分子 | 合成生物学 | NA | RAFT聚合、光诱导电子转移、基因工程 | NA | 实验数据 | NA | 合成生物学工具 | Shewanella oneidensis | 增强黄素生物合成和运输的基因回路 | 材料科学, 工业生物技术 |
| 142 | 2025-11-25 |
Systems biology and microbiome innovations for personalized diabetic retinopathy management
2025-Nov-21, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-025-00607-w
PMID:41271801
|
综述 | 本文探讨利用系统生物学和微生物组创新技术开发糖尿病视网膜病变的个性化管理策略 | 提出通过工程化益生菌递送ACE2的创新疗法,并建立整合计算方法的个性化系统管理框架 | NA | 开发糖尿病视网膜病变的个性化管理系统 | 糖尿病视网膜病变及其与肠道微生物组的关联 | 系统生物学 | 糖尿病视网膜病变 | 合成生物学、计算技术 | NA | NA | NA | NA | 益生菌 | 递送血管紧张素转换酶2(ACE2)的工程化系统 | 医学 |
| 143 | 2025-11-25 |
Synthetic multicolor antigen-stabilizable nanobody platform for intersectional labelling and functional imaging
2025-Oct-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.27.684934
PMID:41278670
|
研究论文 | 开发了一种抗原稳定化多色纳米抗体平台,用于细胞内蛋白质的无背景可视化和功能成像 | 创建了覆盖整个可见光谱(450-660 nm)的抗原稳定化荧光纳米抗体工具包,首次实现多色检测、代谢物同步监测和比率功能成像 | NA | 开发用于蛋白质动态研究和细胞过程分析的高特异性合成生物学工具 | 纳米抗体、荧光蛋白、生物传感器、小鼠脑组织、斑马鱼胚胎 | 合成生物学 | NA | 荧光成像、生物传感器技术 | NA | 图像数据、荧光信号 | NA | 合成生物学方法 | NA | 抗原稳定化荧光纳米抗体设计,包含组成型、光活化和光切换荧光蛋白以及强度计量生物传感器 | 医学、基础研究 |
| 144 | 2025-11-25 |
Toehold-VISTA: A machine learning approach to decipher programmable RNA sensor-target interactions
2025-Aug-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.12.669990
PMID:40832290
|
研究论文 | 提出一种结合机器学习的RNA传感器设计框架Toehold-VISTA,用于快速设计高性能RNA传感器 | 整合RNA生物物理建模与机器学习(PLS-DA),通过高通量实验数据训练预测模型,实现RNA传感器性能关键决定因素的捕捉 | NA | 加速RNA传感器的设计与工程化应用 | RNA传感器与靶标RNA的相互作用 | 机器学习 | COVID-19 | 高通量实验测量、序列-结构特征提取 | PLS-DA(偏最小二乘判别分析) | RNA序列与结构数据 | NA | toehold switches | NA | RNA生物传感器 | 生物技术, 诊断 |
| 145 | 2025-11-24 |
Genetically Encoded Sensors for Monitoring Intracellular Redox Health of the Pathogenic Fungus Cryptococcus neoformans
2025-Nov-22, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.5c01883
PMID:41273792
|
研究论文 | 本研究开发了用于实时监测致病真菌新型隐球菌细胞内氧化还原状态的基因编码传感器 | 首次为担子菌门病原真菌开发了基因编码的氧化还原传感器,实现了对细胞内氧化还原状态的实时监测 | 该传感器系统目前仅适用于新型隐球菌,在其它真菌中的应用需要进一步验证 | 研究致病真菌在宿主免疫压力下的氧化还原调控机制 | 致病真菌新型隐球菌及其氧化还原调控系统 | 合成生物学 | 真菌感染 | 基因编码传感器、荧光监测技术 | NA | 荧光成像数据 | NA | 基因编码传感器 | Cryptococcus neoformans | 氧化还原生物传感器,与隐球菌氧化还原蛋白连接 | 医学 |
| 146 | 2025-11-24 |
Hierarchy of Hydrophobic and Electrostatic Interactions in DNA-Membrane Phase Selectivity
2025-Nov-19, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c13271
PMID:41217012
|
研究论文 | 本研究探讨疏水锚定和静电作用如何调控DNA在液相有序和液相无序脂质域中的分配行为 | 揭示了疏水锚定和静电作用在DNA-膜相选择性中的层级调控机制,建立了以疏水锚定控制相特异性、多价性调节结合强度、离子条件作为次级调控因子的设计层级 | 未涉及复杂生物膜环境中的验证 | 理解DNA-脂质界面在相分离膜中的设计原理 | DNA纳米结构与脂质膜的相互作用 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术、脂质膜相分离研究 | NA | 生物物理相互作用数据 | NA | DNA纳米结构功能化 | NA | 相选择性DNA-膜界面 | 药物递送,合成生物学,仿生DNA材料 |
| 147 | 2025-11-24 |
From the bench to the reactor: engineered filamentous fungi for biochemical and biomaterial production
2025-Nov-18, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-025-02712-8
PMID:41254789
|
综述 | 本文综述了工程化丝状真菌在生物化学品和生物材料生产中的应用进展与前景 | 重点介绍了CRISPR-Cas9介导的菌株改良等代谢工程和蛋白质工程最新进展,并探讨了真菌生物技术在循环经济和生物基经济中的整合潜力 | 丝状真菌的系统性合成生物学应用仍处于起步阶段,需要进一步发展基因工程和工艺设计 | 探讨工程化丝状真菌在生物化学品和生物材料生产中的工业应用潜力 | 丝状真菌及其工程化菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、蛋白质工程、CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 丝状真菌 | 代谢通路工程、蛋白质表达系统 | 工业生物技术, 材料, 食品, 环境 |
| 148 | 2025-11-24 |
Engineered natural killer cells for cancer therapy
2025-Nov-10, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.09.013
PMID:41135520
|
综述 | 本文总结了工程化自然杀伤细胞在癌症治疗中的临床应用进展及合成生物学改进策略 | 系统阐述通过精准基因编辑增强CAR-NK细胞效应功能、持久性和抗肿瘤微环境能力的新方法 | 主要基于早期临床试验数据,尚未涉及大规模验证 | 推动工程化NK细胞在实体瘤治疗中的应用发展 | 嵌合抗原受体自然杀伤细胞(CAR-NK) | 合成生物学 | 癌症 | 基因编辑、高通量筛选平台 | NA | 临床试验数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 自然杀伤细胞 | 嵌合抗原受体(CAR)设计、多基因工程改造 | 医学 |
| 149 | 2025-11-24 |
Multiscale metabolic engineering in biological lignin valorization
2025-Nov-03, Innovation (Cambridge (Mass.))
DOI:10.1016/j.xinn.2025.100993
PMID:41268496
|
综述 | 本文综述了合成生物学指导的多尺度代谢调控在木质素生物增值中的应用 | 提出合成生物学指导的多尺度代谢调控方法,协调木质素降解菌株的细胞内资源分配 | NA | 提高木质素生物转化效率,促进木质素基生物经济的可持续发展 | 木质素降解菌株及其代谢调控机制 | 合成生物学 | NA | 多尺度代谢调控、生物转化、基因组-表型分析、学习预测 | NA | NA | NA | NA | 木质素降解菌株 | 代谢通路网络、代谢通量平衡 | 能源, 工业生物技术, 环境 |
| 150 | 2025-11-24 |
Isolation, engineering and ecology of temperate phages from the human gut
2025-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09614-7
PMID:41094135
|
研究论文 | 本研究通过培养和诱导人类肠道细菌中的温和噬菌体,揭示了前噬菌体多样性及其与宿主相互作用的机制 | 首次大规模表征人类肠道来源的可诱导前噬菌体,构建合成微生物组模型,发现人类宿主细胞产物可作为诱导剂 | 仅18%计算预测的前噬菌体能在纯培养中被诱导,培养条件可能无法完全模拟体内环境 | 理解人类肠道中温和噬菌体的生物学特性和功能 | 人类肠道细菌中的前噬菌体 | 微生物组学 | NA | 宏基因组学、数据挖掘、培养组学、共培养技术 | NA | 基因组数据、实验数据 | 252株人类肠道细菌分离株,134个可诱导前噬菌体 | 合成生物学方法 | 人类肠道细菌 | 78成员合成微生物组 | 合成生物学, 生物技术, 微生物组 |
| 151 | 2025-11-24 |
Effect of Translation-Enhancing Nascent SKIK Peptide on the Arrest Peptides Containing Consecutive Proline
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00221
PMID:39573840
|
研究论文 | 本研究揭示了SKIK肽标签能有效缓解由连续脯氨酸残基组成的核糖体停滞肽引起的翻译停滞现象 | 首次发现SKIK肽标签与翻译延伸因子EF-P在缓解连续脯氨酸富集蛋白的核糖体停滞中具有协同促进作用 | 研究主要关注特定类型的停滞肽(WPPP和SecM AP),对其他类型停滞肽的适用性尚需验证 | 探究SKIK肽标签对核糖体翻译停滞的缓解机制及其在蛋白质生产优化中的应用 | 含有连续脯氨酸残基的核糖体停滞肽(WPPP和SecM AP)及其对翻译过程的影响 | 合成生物学 | NA | PURE无细胞蛋白质合成系统、体外翻译反应、动力学分析 | NA | 蛋白质产量数据、荧光信号数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 152 | 2025-11-23 |
Engineering sulfoxide synthases for efficient microbial production of ergothioneine: Mechanisms, strategies, and perspectives
2025-Dec-25, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2025.146618
PMID:41082819
|
综述 | 本文系统综述了硫氧化物合酶在微生物合成麦角硫因过程中的分子机制与工程策略 | 首次全面整合硫氧化物合酶的分子机制与工程策略,为含硫化合物生物合成提供通用框架 | 作为综述文章未涉及原始实验数据验证 | 提升麦角硫因微生物合成效率的酶工程策略研究 | 硫氧化物合酶及其催化机制 | 合成生物学 | NA | 酶工程、代谢工程 | NA | 文献数据 | NA | NA | 微生物 | 麦角硫因生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 153 | 2025-11-23 |
Site-Specific OaAEP1 Mediated Functional Proteins Immobilization on Magnetic Nanoparticles and the Recyclings
2025-Nov-21, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202502540
PMID:41273006
|
研究论文 | 开发基于OaAEP1肽连接酶的位点特异性蛋白质固定策略,实现功能蛋白在磁性纳米颗粒上的可控定向固定与循环利用 | 利用OaAEP1酶催化N端GL与C端NGL基序的特异性连接,实现蛋白质在纳米颗粒表面的定向固定和高效率固定 | NA | 开发精确稳定的蛋白质固定方法以推动生物催化、生物传感和合成生物学应用 | 荧光蛋白和催化活性酶(TEV蛋白酶和Taq聚合酶)在FeO和FeO@SiO磁性纳米颗粒上的固定 | 合成生物学 | NA | OaAEP1介导的肽连接技术 | NA | NA | NA | OaAEP1 | NA | 蛋白质-纳米颗粒功能界面构建 | 生物催化,生物传感,纳米生物技术,蛋白质工程 |
| 154 | 2025-11-23 |
Features and functional mechanisms of super-enhancers in cardiovascular disorders, cancer, autoimmune diseases and neurodegenerative disorders
2025-Nov-16, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112252
PMID:41253192
|
综述 | 本文系统阐述超级增强子在心血管疾病、癌症、自身免疫疾病和神经退行性疾病中的特征、功能机制及靶向治疗策略 | 聚焦液-液相分离驱动的生物分子凝聚体形成机制,并系统评估针对超级增强子的创新靶向策略 | NA | 解析超级增强子在疾病中的转录调控机制并探讨靶向治疗前景 | 超级增强子的结构层次、动态组装机制及其在疾病中的作用 | 表观遗传学 | 心血管疾病,癌症,自身免疫疾病,神经退行性疾病 | CRISPR, 合成生物学, 表观遗传调控 | NA | 基因组学数据 | NA | CRISPR, 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 155 | 2025-11-23 |
Potential biosafety risks of synthetic biology microorganism leakage in industry settings to drinking water: A review
2025-Nov-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.140169
PMID:41110321
|
综述 | 综述工业环境中合成生物学微生物泄漏对饮用水生物安全的潜在风险 | 首次系统分析工业用合成生物学微生物通过废水排放进入自然水体后,其增强的消毒剂抗性及在饮用水系统中利用有限碳源生产生物产物的双重风险 | 未提出具体的监管框架或量化风险评估模型 | 探讨合成生物学微生物在工业应用中的生物安全风险及其对饮用水安全的影响 | 合成生物学微生物(SynBioMs)及其在工业环境中的泄漏途径 | 合成生物学 | NA | 膜工程、应激反应工程、转录因子工程 | NA | 文献资料 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌 | 营养缺陷型设计、遗传回路 | 工业生物技术, 环境 |
| 156 | 2025-11-23 |
Next-generation perspectives on microbially synthesized siderophores: molecular engineering, multi-omics insights, and applications for smart climate-resilient crops
2025-Oct-16, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04575-5
PMID:41099996
|
综述 | 本文综述微生物合成铁载体的生物合成、调控机制及其在智能气候韧性作物中的应用前景 | 整合合成生物学与多组学技术揭示铁载体合成调控网络,开发纳米制剂和智能递送系统增强田间应用效果 | NA | 探讨微生物铁载体在可持续农业中的分子机制与应用策略 | 微生物铁载体及其合成基因簇,植物根际促生菌(PGPR) | 合成生物学 | NA | 多组学(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学),CRISPR/Cas基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物根际促生菌(PGPR) | 铁载体生物合成基因簇 | 农业 |
| 157 | 2025-11-23 |
Application progress and biosafety challenges of gene editing and synthetic biotechnology in diagnosis, treatment and prevention of infectious diseases
2025-Oct, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2025.09.002
PMID:41262458
|
综述 | 本文系统综述了基因编辑和合成生物技术在传染病防治中的应用进展与生物安全挑战 | 系统分析了2015-2025年间CRISPR诊断技术、合成疫苗和工程益生菌在传染病防治中的最新应用,并首次全面评估其生物安全风险 | 基于文献综述,缺乏原始实验数据验证;主要关注技术层面,社会接受度和经济可行性分析不足 | 评估合成生物技术在传染病诊断、治疗和预防中的应用进展及相关的生物安全挑战 | CRISPR诊断系统、合成疫苗平台和工程益生菌等合成生物技术产品 | 合成生物学 | 传染病 | CRISPR/Cas系统(DETECTR、SHERLOCK)、mRNA疫苗技术、病毒载体疫苗技术、工程益生菌技术 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9, Cas12a, Cas13a | 工程益生菌 | 病原体检测生物传感器、免疫调节回路 | 医学 |
| 158 | 2025-11-23 |
Beyond evolution: De novo designed protein toolkit rewriting the rules of synthetic biology
2025-Oct, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2025.09.004
PMID:41262455
|
综述 | 本文探讨人工智能驱动的蛋白质设计如何通过超越进化约束的全新蛋白质工具包革新合成生物学 | 提出超越已知结构模板和进化约束的全新蛋白质设计范式,建立从蛋白质设计到系统级实施的层次化框架 | 新型蛋白质在细胞系统中表达存在功能不可预测性,需要更完善的风险评估体系 | 系统分析AI驱动蛋白质设计的计算框架及其在合成生物学中的应用前景 | 从头设计的蛋白质工具包及其在合成生物学系统中的应用 | 合成生物学 | NA | 人工智能蛋白质设计、多组学分析 | NA | NA | NA | NA | NA | 结构导向的理性基因电路设计 | 工业生物技术 |
| 159 | 2025-11-22 |
Virus-like particles as versatile scaffolds for nanobiosensors and nanoreactors: Design, applications, and future perspectives
2026-Feb-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.118156
PMID:41172906
|
综述 | 系统探讨病毒样颗粒作为纳米支架在纳米生物传感器和纳米反应器中的设计、应用及未来发展方向 | 提出将人工智能、先进材料和刺激响应设计整合以开发下一代智能纳米器件 | 在可扩展性、功能精确性和体内兼容性方面仍存在挑战 | 研究病毒样颗粒在纳米生物传感器和纳米反应器中的应用潜力 | 病毒样颗粒的结构与理化特性 | NA | NA | 光学传感(荧光、化学发光、表面等离子共振)、电化学传感(伏安法、电位法、阻抗法)、场效应系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 多酶途径空间组织、级联反应 | 医学诊断、治疗、可持续催化、生物催化、合成生物学 |
| 160 | 2025-11-22 |
Dissecting native plasmid functions in Lactococcus lactis: Synergistic regulation of metabolism and industrially relevant traits
2025-Dec, Journal of dairy science
IF:3.7Q2
DOI:10.3168/jds.2025-27053
PMID:41130394
|
研究论文 | 本研究解析了乳酸乳球菌C20中3个天然质粒的功能及其对代谢和工业性状的协同调控作用 | 首次系统揭示了乳酸乳球菌C20中天然质粒的协同调控网络及其对工业性状的关键影响 | 研究仅针对C20菌株的3个质粒,未在其他乳酸乳球菌菌株中验证普适性 | 阐明乳酸乳球菌天然质粒的生物学功能及其在工业应用中的潜力 | 乳酸乳球菌C20菌株及其3个天然质粒(pLL1, pLL2, pLL3) | 合成生物学 | NA | 基因组分析、组合消除、功能表征 | NA | 基因组数据、代谢数据 | 乳酸乳球菌C20菌株及其质粒变异株 | 基因编辑、合成生物学 | 乳酸乳球菌 | 天然质粒调控网络 | 食品,制药,工业生物技术 |