合成生物学相关文章
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当前共找到 3126 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-05-10 |
Silaffins as functional biomacromolecules in regulating frustule morphogenesis and biosilica properties
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143105
PMID:40222518
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研究论文 | 研究硅藻中硅蛋白（silaffins）在硅壳形态发生和生物硅特性调节中的功能 | 首次通过基因过表达和CRISPR/Cas9介导的敲除方法，揭示了TpSil1和TpSil3在硅藻硅壳形态发生中的具体作用 | 无法生成双等位TpSil3敲除突变体，可能因为TpSil3是必需基因，完全敲除会导致致死 | 探究硅蛋白在硅藻硅壳形态发生和生物硅特性中的功能 | 硅藻Thalassiosira pseudonana中的硅蛋白TpSil1和TpSil3 | 合成生物学 | NA | 基因过表达、CRISPR/Cas9敲除 | NA | 形态学分析、生理学数据 | NA |
| 142 | 2025-05-10 |
The CpG Landscape of Protein Coding DNA in Vertebrates
2025-May, Evolutionary applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/eva.70101
PMID:40330995
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研究论文 | 研究探讨了DNA甲基化对脊椎动物基因组进化中CpG二核苷酸含量的影响及其在蛋白质编码DNA中的特异性 | 揭示了蛋白质编码序列中CpG含量显著高于非编码区域，并发现CpG位点在调控功能和应激反应相关基因中富集 | 研究仅涉及六种脊椎动物，可能无法全面代表所有脊椎动物的CpG分布模式 | 探讨CpG偏倚对蛋白质编码DNA的具体影响及其在脊椎动物基因组进化中的作用 | 六种脊椎动物（人类、小鼠、鸡、大山雀、青蛙和刺鱼）的基因组 | 基因组学 | NA | 全基因组分析 | NA | 基因组数据 | 六种脊椎动物的基因组数据 |
| 143 | 2025-05-10 |
The structure of the Vibrio natriegens 70S ribosome in complex with the proline-rich antimicrobial peptide Bac5(1-17)
2025-Apr-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf324
PMID:40331629
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research paper | 该研究通过冷冻电镜技术解析了Vibrio natriegens 70S核糖体与富含脯氨酸的抗菌肽Bac5(1-17)复合物的结构 | 揭示了Bac5与核糖体出口通道的独特相互作用模式，不同于其他I型PrAMPs | 仅研究了Vibrio natriegens这一种细菌的核糖体结构 | 阐明Bac5抗菌肽与细菌核糖体的结合方式及其抑制蛋白质合成的分子机制 | Vibrio natriegens 70S核糖体与Bac5(1-17)抗菌肽复合物 | 结构生物学 | 细菌感染 | 冷冻电镜(cryo-EM) | NA | 冷冻电镜图像数据 | 单个复合物结构 |
| 144 | 2025-05-10 |
Recombinant human collagen XVII protects skin basement membrane integrity by inhibiting the MAPK and Wnt signaling pathways
2025-Apr, Molecular medicine reports
IF:3.4Q2
DOI:10.3892/mmr.2025.13465
PMID:39981899
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研究论文 | 研究重组人类胶原蛋白XVII（RHCXVII）在保护皮肤基底膜完整性方面的功效和作用机制 | 首次阐明RHCXVII通过抑制MAPK和Wnt信号通路保护皮肤基底膜完整性的机制 | 研究仅基于体外HaCaT细胞模型，未涉及体内实验或临床验证 | 探究RHCXVII在皮肤基底膜保护中的作用及其分子机制 | UVB照射的人HaCaT角质形成细胞 | 合成生物学 | 皮肤损伤 | 逆转录定量PCR、蛋白质印迹、磷酸化抗体阵列 | UVB诱导的皮肤损伤模型 | 分子生物学数据 | 体外培养的HaCaT细胞系 |
| 145 | 2025-05-10 |
MultiCRISPR-EGA: Optimizing Guide RNA Array Design for Multiplexed CRISPR Using the Elitist Genetic Algorithm
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00860
PMID:39976310
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研究论文 | 开发了一种基于Elitist Genetic Algorithm (EGA)的图形用户界面工具MultiCRISPR-EGA，用于优化多路CRISPR引导RNA阵列的设计 | 利用EGA算法优化多路gRNA阵列设计，提高了效率和特异性，并提供了实时设计进度控制的GUI界面 | 未提及实验验证结果或在实际生物系统中的性能表现 | 优化多路CRISPR引导RNA阵列设计，提高基因组编辑的效率和成本效益 | 多路CRISPR引导RNA阵列 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | Elitist Genetic Algorithm (EGA) | 基因组数据 | NA |
| 146 | 2025-05-10 |
Intracellular protein ligation and polyprotein synthesis using an asparaginyl endopeptidase core
2025-Mar-11, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d4cc06617k
PMID:39981834
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research paper | 开发了一种利用AEP1核心片段在细胞内进行蛋白质连接和聚合的系统，实现了无需酶激活和外部连接的实时多蛋白合成 | 利用AEP1核心片段实现细胞内蛋白质连接和聚合，扩展了AEP在合成生物学和生物材料中的应用 | NA | 开发一种新型的细胞内蛋白质连接和聚合系统 | Ig结构域 | 合成生物学 | NA | 蛋白质连接和聚合技术 | NA | NA | NA |
| 147 | 2025-05-10 |
Use and dual use of synthetic biology
2025-03-07, Comptes rendus biologies
IF:0.7Q4
DOI:10.5802/crbiol.173
PMID:40052950
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评论 | 本文回顾了合成生物学领域的历史，并讨论了其潜在的双重用途风险 | 指出了合成生物学领域记忆迅速丧失的现象，并强调了其潜在的双重用途风险 | 缺乏对实验室进行功能增益实验时意外风险的深入思考 | 探讨合成生物学的使用和双重用途风险 | 合成生物学领域及其相关技术 | 合成生物学 | NA | DNA合成 | NA | NA | NA |
| 148 | 2025-05-10 |
Peptide-mediated liquid-liquid phase separation and biomolecular condensates
2025-Mar-05, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d4sm01477d
PMID:39964249
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review | 本文综述了肽介导的液-液相分离（LLPS）的分子机制及其在生物分子凝聚物形成中的作用 | 强调了疏水效应、静电相互作用和π-π堆积等分子间相互作用在相分离中的角色，以及环境因素如pH、温度、离子强度和分子拥挤对肽凝聚物稳定性和动态的影响 | NA | 探讨肽介导的LLPS在生物技术和医学中的潜在应用 | 肽介导的液-液相分离和生物分子凝聚物 | 生物物理学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 149 | 2025-05-10 |
Interfacing bacterial microcompartment shell proteins with genetically encoded condensates
2025-Mar, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.70061
PMID:39969154
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研究论文 | 研究展示了细菌微区室壳蛋白与基因编码的凝聚体相互作用，形成涂层以控制液-液相分离隔室的性质 | 首次展示了细菌微区室壳蛋白与基因编码的凝聚体相互作用，形成稳定的涂层，并控制液-液相分离隔室的性质 | 涂层的形成依赖于pH和蛋白质浓度，且一旦形成后不与稀释相交换 | 探索细菌微区室壳蛋白与基因编码的凝聚体相互作用，以开发合成细胞和细胞器 | 细菌微区室壳蛋白（BMC-H）和由RGG-RGG结构域形成的蛋白质凝聚体 | 合成生物学 | NA | 基因工程和蛋白质工程 | NA | 蛋白质相互作用数据 | NA |
| 150 | 2025-05-10 |
Cleavable donor-assisted CRISPR/Cas9 system significantly improves the efficiency of large DNA insertion in Physcomitrium patens
2025-Feb, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70020
PMID:39981890
|
研究论文 | 开发了一种可切割供体辅助的CRISPR/Cas9系统，显著提高了在苔藓植物Physcomitrium patens中大片段DNA插入的效率 | 引入了体内可切割（IVC）供体设计，通过Cas9核酸酶识别位点释放线性模板，显著提高了大片段DNA的插入效率 | 目前仅在苔藓植物中验证，对其他作物的适用性需要进一步验证 | 提高CRISPR/Cas9系统在大片段DNA插入中的效率 | 苔藓植物Physcomitrium patens | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑技术 | NA | DNA序列数据 | 使用了两种不同的sgRNA和四种不同的DNA插入片段进行验证 |
| 151 | 2025-05-10 |
Innovative applications and research advances of bacterial biosensors in medicine
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1507491
PMID:40336836
|
综述 | 本文综述了细菌生物传感器在医学领域的应用和最新进展，并讨论了其研究和应用中存在的挑战和障碍 | 利用合成生物学和基因工程的突破性进展，定制具有卓越检测特性的细菌，为早期疾病诊断和治疗监测提供了强大的技术基础 | 讨论了细菌生物传感器在研究和应用中仍面临的挑战和障碍 | 探讨细菌生物传感器在医学领域的应用和研究进展 | 细菌生物传感器 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
| 152 | 2025-05-10 |
Simultaneous selection of nanobodies for accessible epitopes on immune cells in the tumor microenvironment
2023-11-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43038-z
PMID:37978291
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研究论文 | 介绍了一种名为INSPIRE-seq的新方法，用于在复杂环境中筛选纳米抗体 | 开发了INSPIRE-seq技术，能够并行富集穿透肿瘤微环境的免疫细胞结合纳米抗体 | 未提及具体样本量或实验验证的详细限制 | 开发筛选纳米抗体的新技术，用于治疗性生物制剂的靶向分子发现 | 肿瘤微环境中的免疫细胞 | 合成生物学 | 肿瘤 | NGS, 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 结构建模与对接研究 | NA | 测序数据, 图像数据 | NA |
| 153 | 2025-05-09 |
Engineered Bacteria Convert a 3-Bit Binary Code to a 3-Bit Gray Code by Multicellular Artificial-Neural-Network-Type Architecture
2025-May-07, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00145
PMID:40333022
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研究论文 | 利用基因工程细胞构建单层人工神经网络，实现3位二进制码到格雷码的转换 | 首次使用基因工程细胞构建人工神经网络实现二进制码到格雷码的转换 | 研究尚处于早期阶段，计算能力和应用范围有限 | 探索基因工程细胞在神经形态计算中的应用 | 基因工程细胞构建的人工神经网络 | 合成生物学 | NA | 基因工程技术 | ANN（人工神经网络） | 化学输入信号和荧光蛋白表达 | 五个工程细胞群体 |
| 154 | 2025-05-09 |
Biofabrication of microstructured bacterial ecosystems using chaotic bioprinting: advancing in vitro research for microbial engineering
2025-May-07, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/add568
PMID:40334674
|
research paper | 该研究利用混沌3D打印技术制造具有多层微结构的水凝胶构建体，以模拟自然微生物生态系统中的空间组织 | 采用混沌3D打印技术创建微结构化的细菌共培养体系，模拟自然微生物生态系统的部分隔离现象 | 研究仅使用了三种细菌作为简化模型，可能无法完全代表复杂的人类肠道微生物群 | 推进微生物工程领域的体外研究，特别是微生物相互作用的理解 | 由鼠李糖乳杆菌、双歧杆菌和大肠杆菌组成的细菌联合体，作为人类肠道微生物群的简化模型 | 微生物工程 | NA | 混沌3D打印、荧光显微镜、菌落计数、定量聚合酶链反应(qPCR) | NA | 微生物生长动态数据 | 三种细菌的共培养体系 |
| 155 | 2025-05-09 |
Bioremediation of complex organic pollutants by engineered Vibrio natriegens
2025-May-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08947-7
PMID:40335686
|
研究论文 | 本研究利用合成生物学技术改造Vibrio natriegens，使其能够在含盐废水和土壤中生物修复复杂的有机污染物 | 通过合成生物学方法改造Vibrio natriegens，使其具备在含盐环境中降解多种有机污染物的能力 | 研究仅针对五种有机污染物进行了测试，未涉及其他可能的污染物 | 开发一种能够在含盐环境中生物修复复杂有机污染物的微生物方法 | 工业废水、石油污染和塑料污染 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、基因组工程 | NA | NA | 工业废水样品（来自氯碱厂和石油炼油厂） |
| 156 | 2025-05-09 |
Molecular circuits for genomic recording of cellular events
2025-May-06, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2025.04.004
PMID:40335327
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review | 本文综述了基因组记录领域的最新进展，特别是关于构建分子电路以记录细胞事件的方法 | 探讨了新兴合成生物学工具在构建多样化传感器和分子电路中的应用，以实现细胞事件的基因组记录 | 目前直接记录和重建过去细胞事件的方法仍然有限，其揭示细胞命运决定新见解的潜力尚未实现 | 开发新的传感模块和遗传电路架构，以将过去的细胞状态忠实编码到基因组DNA记录中 | 细胞事件和细胞状态 | 合成生物学 | NA | CRISPR-based genome editing | NA | genomic DNA | NA |
| 157 | 2025-05-09 |
Decoding the Minimal Translation System of the Plasmodium falciparum Apicoplast: Essential tRNA-modifying Enzymes and Their Roles in Organelle Maintenance
2025-May-06, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169156
PMID:40335414
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研究论文 | 本研究通过比较基因组学和蛋白质定位预测工具，鉴定了疟原虫顶质体中16种tRNA修饰酶，并实验验证了其中14种的定位，揭示了顶质体翻译系统依赖于一组集中在反密码子环的最小tRNA修饰 | 首次系统地鉴定了疟原虫顶质体中tRNA修饰酶的最小集合，并确定了其中6种对寄生虫生存至关重要的酶 | 研究中两种基因无法被删除，其中一种可能具有顶质体外的必需功能，另一种可能在顶质体中扮演不可或缺的角色 | 研究疟原虫顶质体中最小翻译系统的tRNA修饰酶及其在细胞器维持中的作用 | 疟原虫顶质体中的tRNA修饰酶 | 分子生物学 | 疟疾 | 比较基因组学、蛋白质定位预测、基因敲除 | NA | 基因组数据、蛋白质定位数据 | 16种预测的tRNA修饰酶，其中14种被实验验证 |
| 158 | 2025-05-09 |
Elucidation and de novo reconstitution of glyceollin biosynthesis
2025-May-05, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.04.003
PMID:40211535
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研究论文 | 本研究揭示了glyceollins的完整生物合成途径，并通过合成生物学和代谢工程在酵母中实现了其从简单碳源的生产 | 发现了glyceollins生物合成途径中未表征的还原酶基因和五个P450酶，首次实现了glyceollins在微生物宿主中的从头合成 | NA | 阐明glyceollins的生物合成途径并实现其可持续生产 | 大豆中的glyceollins化合物 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达、体外酶表征、酵母喂养研究 | NA | NA | NA |
| 159 | 2025-05-09 |
Engineering a newly identified alcohol dehydrogenase from Sphingobium Sp. for efficient utilization of nicotinamide cofactors biomimetics
2025-May-05, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-025-00870-z
PMID:40325297
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研究论文 | 本研究鉴定了一种来自Sphingobium sp. SYK-6的醇脱氢酶(SpADH2)，并对其进行了半理性工程改造，以提高其对合成烟酰胺辅因子仿生物(NCBs)的利用效率 | 首次报道了一种能够利用全合成NCBs的天然ADH，并通过工程改造显著提高了其催化效率和辅因子特异性 | NA | 开发能够高效利用低成本NCBs的氧化还原酶 | 来自Sphingobium sp. SYK-6的醇脱氢酶(SpADH2) | 合成生物学 | NA | 半理性工程改造 | NA | 酶活性数据 | 野生型SpADH2及其变体(H43L, A290I, H43L/A290I) |
| 160 | 2025-05-09 |
Rewiring heme biosynthesis for improved pollutant degradation by Shewanella oneidensis
2025-May-03, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2025.121777
PMID:40324620
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研究论文 | 通过改造希瓦氏菌的血红素生物合成途径，提高其降解污染物的能力 | 采用模块化合成生物学方法，设计四个功能模块以重定向代谢途径，显著提高血红素水平，从而增强电子传递效率和污染物降解能力 | 研究仅针对希瓦氏菌，未在其他电活性微生物中验证 | 解决电活性微生物中细胞外电子传递速率慢的问题，提高生物电化学系统的应用潜力 | 希瓦氏菌 | 合成生物学 | NA | 模块化合成生物学方法 | NA | 实验数据 | NA |