合成生物学相关文章
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当前共找到 4700 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-03-22 |
In-Depth Computational Analysis of Natural and Artificial Carbon Fixation Pathways
2021, Biodesign research
DOI:10.34133/2021/9898316
PMID:37849946
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研究论文 | 本文通过计算分析比较了天然和人工碳固定途径的性能，包括特定活性和产率 | 提出了两个全新的碳固定循环（还原性柠檬酰辅酶A循环和2-羟基戊二酸反向三羧酸循环），并采用综合动力学数据集和参数平衡算法进行预测 | 计算模型可能受限于数据可用性和假设，实际应用需实验验证 | 评估和比较天然与人工碳固定途径的性能，以优化工业生物技术和合成生物学应用 | 碳固定途径，包括天然和人工循环，如CBB循环、CETCH循环等 | NA | NA | 计算分析、参数平衡算法、酶成本最小化算法 | NA | 动力学和热力学数据 | NA | NA | NA | 碳固定代谢途径，包括还原性甘氨酸途径、CETCH循环等 | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 142 | 2026-03-21 |
Growth factor applications and clinical translation: advances and challenges
2026-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2026.2642893
PMID:41837883
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综述 | 本文系统综述了生长因子的分类、基础研究进展、临床应用现状，并深入分析了其在临床转化中面临的挑战及相应解决方案 | 全面整合了生长因子在神经退行性疾病、骨再生和代谢疾病中的应用现状，并系统总结了通过蛋白质工程、智能递送系统和多因子序贯释放技术等解决临床转化瓶颈的策略 | 本文为综述性文章，未提供原始实验数据，且指出生长因子疗法仍面临体内微环境复杂、大规模生产成本高和精准递送困难等固有挑战 | 旨在为加速下一代生长因子疗法的开发提供全面的路线图和技术参考 | 生长因子及其在再生医学、肿瘤学和代谢调节等领域的应用 | NA | 神经退行性疾病、骨再生、代谢疾病 | 蛋白质工程、化学修饰、细胞外囊泡平台、多因子序贯释放技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 143 | 2026-03-21 |
Biosynthesis of L-Pipecolic Acid and Its Hydroxylated Derivatives: Enzyme, Engineering, and Synthesis Method
2026-Apr, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70156
PMID:41532523
|
综述 | 本文综述了L-哌啶酸及其羟基化衍生物的生物合成进展，重点介绍了酶工程和合成生物学在可持续高效生产这些化合物中的应用 | 强调了通过酶工程和合成生物学方法实现L-哌啶酸及其羟基化衍生物的可持续生产，包括代谢工程策略、酶级联反应和脯氨酸羟化酶的蛋白质工程 | NA | 促进L-哌啶酸及其羟基化衍生物的生物合成生产，以替代传统化学合成方法 | L-哌啶酸及其羟基化衍生物（羟基哌啶酸） | 合成生物学 | NA | 酶工程、代谢工程、蛋白质工程、酶级联反应、固定化酶策略 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 医药、抗生素、天然产物 |
| 144 | 2026-03-21 |
Golgi-localized mannanases sustain hemicellulose biosynthesis
2026-Apr, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70875
PMID:41555794
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研究论文 | 本文探讨了拟南芥中MAN2和MAN5酶在维持半纤维素生物合成中的作用，通过酵母合成生物学揭示了它们与CSLA的功能互作 | 发现MAN2和MAN5酶在细胞内通过切割不溶性β-甘露聚糖为亲水性对应物，从而维持高尔基体中的半纤维素生产，这揭示了之前未知的生物合成调控机制 | 研究主要基于拟南芥模型，可能需要在其他植物或作物中进行验证以确认普遍性 | 研究β-甘露聚糖生物合成的代谢瓶颈和潜在生物合成参与者，以增强植物中β-甘露聚糖含量 | 拟南芥（Arabidopsis）的MAN2和MAN5酶，以及CSLA基因 | 植物生物学 | NA | 酵母合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 农业 |
| 145 | 2026-03-21 |
Engineered E. coli Nissle 1917 Depletes Branched-Chain Amino Acids to Suppress Colorectal Tumorigenesis
2026-Mar-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00804
PMID:41712535
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研究论文 | 本文通过工程化改造大肠杆菌Nissle 1917菌株，消耗肠道中的支链氨基酸，从而抑制结直肠癌的发生和发展 | 利用合成生物学方法改造益生菌，靶向支链氨基酸代谢，为癌症治疗提供了一种新的策略 | 研究基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证，且具体机制仍需进一步探索 | 探究工程化益生菌通过消耗支链氨基酸来抑制结直肠肿瘤发生的效果 | 结直肠癌小鼠模型及工程化大肠杆菌Nissle 1917菌株 | 合成生物学 | 结直肠癌 | 工程化菌株构建、AOM/DSS诱导的CRC小鼠模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 基因工程 | 大肠杆菌Nissle 1917 | 支链氨基酸降解或转运途径的工程化改造 | 医学 |
| 146 | 2026-03-21 |
Metabolic Engineering and Synthetic Biology-Driven Strategies to Harness Microbial Production of Adipic Acid: Current Status and Future Direction
2026-Mar-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00869
PMID:41790735
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综述 | 本文综述了利用代谢工程和合成生物学策略驱动微生物生产己二酸的现状与未来方向 | 系统梳理了己二酸生物合成的当前进展，重点讨论了提高细胞工厂转化效率的先进代谢工程策略与工具，并识别了关键挑战与知识缺口 | 工业上可行的己二酸生物合成技术仍受限于原料利用不完全、菌株转化效率低、发酵过程复杂及下游分离成本高等挑战 | 开发可持续的己二酸生物合成技术，以应对市场需求增长及传统生产带来的环境问题 | 己二酸的生物合成途径、代谢工程策略、细胞工厂构建及发酵与下游分离技术 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 生物合成途径 | 工业生物技术, 材料 |
| 147 | 2026-03-21 |
Research Progress and Prospects of Open-Chain Flavonoid Biosynthesis
2026-Mar-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00926
PMID:41810537
|
综述 | 本文综述了开链黄酮类化合物的结构特征、生物合成途径、代谢工程及微生物生产策略的研究进展与前景 | 系统总结了开链黄酮类化合物这一结构独特亚类的最新研究进展，并整合了代谢组学、结构酶学和合成生物学等多学科交叉成果 | NA | 阐明开链黄酮类化合物的生物合成逻辑、催化机制及调控特征，并展望其未来研究与生物技术应用 | 开链黄酮类化合物及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢组学、结构酶学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、生物技术 |
| 148 | 2026-03-21 |
Refactoring two-component systems for tunable gene expression regulation and upgraded bacterial sensing
2026-Mar-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101504
PMID:41653915
|
研究论文 | 本文通过重构双组分系统（TCSs），系统性地探索了响应调节器（RR）和组氨酸激酶（HK）作为浓度依赖性激活剂和抑制剂的功能特性，以优化基因表达调控和细菌传感性能 | 通过解耦HK表达与原生反馈回路，设计了具有可调检测阈值的超灵敏TCS传感器；利用RR作为转导器，结合单组分系统（OCS）和TCS创建了具有低检测限和高动态范围的协同传感系统（SSS）；并证明RR可作为生物低噪声放大器（LNA），显著提升多种基因编码生物传感器的性能 | 未明确提及具体限制，但暗示TCS的可编程性先前未充分探索，可能限制了合成生物学中的广泛应用 | 探索TCS的可塑性和可编程性，以定制合成电路中的基因表达调控，并提供生物传感器优化的模块化工具包 | 双组分系统（TCSs），包括响应调节器（RR）和组氨酸激酶（HK），以及单组分系统（OCS） | 合成生物学 | NA | 基因工程、生物传感技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 细菌（如大肠杆菌） | 双组分系统传感器、协同传感系统（SSS）、生物低噪声放大器（LNA） | 工业生物技术、环境监测 |
| 149 | 2026-03-21 |
Functional organization and regulatory logic of the ped gene cluster in Pseudomonas species
2026-Mar-18, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00046-26
PMID:41705821
|
综述 | 本文综述了假单胞菌属中ped基因簇的功能组织、酶学功能和多层次调控机制，重点以恶臭假单胞菌KT2440和铜绿假单胞菌PAO1为例 | 整合了ped基因簇的功能与调控特征，提出了将其作为应用微生物学模块化平台的参考框架，并通过跨属比较揭示了基因簇的保守性与适应性差异 | 部分开放阅读框（如PP_2683、PP_2684、PP_2685）功能尚未明确，调控网络细节仍需进一步机制研究验证 | 阐明假单胞菌属中ped基因簇的遗传组织、酶学功能及调控逻辑，为酒精氧化研究提供基础 | 假单胞菌属（重点为恶臭假单胞菌KT2440和铜绿假单胞菌PAO1）的ped基因簇及其编码的PQQ依赖性脱氢酶 | 合成生物学 | NA | 比较基因组分析 | NA | 基因组数据与文献资料 | 假单胞菌属多个物种（以KT2440和PAO1为代表） | NA | Pseudomonas species（包括P. putida KT2440和P. aeruginosa PAO1） | 酒精氧化代谢通路（含PQQ依赖性脱氢酶、电子传递链及调控组件如YiaY脱氢酶和PP_2683组氨酸激酶） | 环境微生物学, 生物修复, 生物生产, 工业生物技术 |
| 150 | 2026-03-21 |
Biofilm engineering through c-di-GMP tuning boosts bioleaching efficiency and arsenic tolerance in Acidithiobacillus ferrooxidans
2026-Mar-18, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.02288-25
PMID:41705824
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研究论文 | 通过调控Acidithiobacillus ferrooxidans中的c-di-GMP信号增强生物膜形成、生物浸出效率和砷耐受性 | 通过靶向调控全局调控分子c-di-GMP，同时提升生物浸出效率和重金属抗性，克服了传统基因工程单次仅修饰单一性状的限制 | NA | 提高生物浸出效率和砷耐受性，以促进可持续金属生产 | Acidithiobacillus ferrooxidans（一种模型生物浸出微生物） | 合成生物学 | NA | 基因工程、转录组分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Acidithiobacillus ferrooxidans | 通过过表达diguanylate cyclase基因（如S-222、S-306、S-651）调控c-di-GMP水平，以编程生物膜基质组成 | 环境、工业生物技术 |
| 151 | 2026-03-21 |
Engineering sensor-based antithetic integral controllers for enhanced dynamic performance and noise attenuation
2026-Mar-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101512
PMID:41763220
|
研究论文 | 本文开发并分析了一种基于传感器的反义积分反馈控制器，通过将比例和积分作用嵌入最小化遗传架构中，实现了增强的动态性能和噪声衰减 | 在经典反义控制基序的基础上进行单一修改，使该架构无需额外电路即可固有地整合比例反馈，从而加快系统动态响应并抑制纯积分反馈典型的噪声放大 | NA | 开发高性能生物控制器设计原则，以维持细胞稳态并减轻环境波动 | 基于传感器的反义积分反馈控制器及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 内含肽介导的剪接 | NA | NA | NA | 内含肽介导的剪接 | 大肠杆菌 | 基于传感器的反义积分反馈控制器，整合比例和积分反馈作用 | 合成生物学、代谢工程、细胞疗法 |
| 152 | 2026-03-21 |
Dynamics of genetic circuits in Pseudomonas protegens
2026-Mar-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101513
PMID:41763221
|
研究论文 | 本研究开发了一种实验-理论结合的流程，用于评估土壤细菌 Pseudomonas protegens Pf-5 中的 NOT 逻辑电路，并探索其作为合成生物学新宿主的潜力 | 首次在 Pseudomonas protegens Pf-5 中评估 NOT 逻辑电路，利用数学模型推断动态原理，并设计验证了串联兼容逆变器以实现 YES 逻辑响应 | 研究主要聚焦于 NOT 逻辑电路，可能未全面评估其他电路类型或更复杂系统在 Pf-5 中的表现 | 扩展合成生物学宿主选择，评估 Pseudomonas protegens Pf-5 作为环境合成生物学新宿主的适用性 | 土壤细菌 Pseudomonas protegens Pf-5 及其中的 NOT 逻辑电路（逆变器） | 合成生物学 | NA | 遗传电路工程、数学建模 | 数学模型 | 实验数据、模型参数 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | Pseudomonas protegens Pf-5 | NOT 逻辑电路（逆变器）、串联兼容逆变器以实现 YES 逻辑响应 | 环境 |
| 153 | 2026-03-21 |
The BAHD Acyltransferase Gene Family: Evolutionary Dynamics, Biochemical Mechanisms, and Roles in Plant Stress Adaptation
2026-Mar-11, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70597
PMID:41810805
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综述 | 本文综述了BAHD酰基转移酶基因家族的进化动态、生化机制及其在植物胁迫适应中的作用 | 整合了进化、结构和调控方面的见解，突出了BAHD酰基转移酶在植物适应中的核心作用及其在可持续农业和生物技术中的转化机遇 | 讨论了功能冗余、底物混杂性和生物安全性考虑相关的挑战 | 探讨BAHD酰基转移酶基因家族的进化、功能及其在植物胁迫适应和生物技术中的应用 | BAHD酰基转移酶基因家族 | NA | NA | 比较基因组分析、结构研究、生化研究、组学调查 | NA | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | 植物 | NA | 农业、生物技术 |
| 154 | 2026-03-21 |
Engineering Plant-Based Platforms for Saccharide Biosynthesis: Progress and Prospects
2026-Mar-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c14582
PMID:41805344
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综述 | 本文综述了利用植物底盘系统进行糖类生物合成的关键技术进展、研究现状、技术挑战及优化策略 | 系统总结了植物底盘在糖类合成生物学中的独特优势，即结合光合固碳与天然糖类生物合成代谢，为可持续大规模生产提供新平台 | NA | 为合成生物学发展提供见解，并挖掘植物底盘在糖类生物合成中的商业潜力 | 植物底盘系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 植物系统 | 糖类生物合成与代谢途径 | 工业生物技术, 能源, 材料 |
| 155 | 2026-03-21 |
Combining model-based and data-driven models: An application to synthetic biology resource competition
2026-Mar-04, Mathematical biosciences
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.mbs.2026.109649
PMID:41791590
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研究论文 | 本研究提出了一种结合机制模型与机器学习的方法，用于解决合成生物学中资源竞争导致的基因电路意外行为问题 | 提出了部分不确定模型结构（PUMS）概念和嵌入式物理信息神经网络（ePINNs），通过共享损失的双神经网络架构实现机制模型与机器学习的无缝融合 | 未明确说明模型在更复杂生物系统或实际实验数据中的验证程度 | 开发能够同时保持物理一致性和数据驱动优势的混合建模方法 | 合成生物学中受资源竞争影响的基因网络模型 | 机器学习 | NA | 物理信息神经网络（PINNs） | 神经网络（ePINNs） | 模拟数据 | NA | NA | 活细胞 | 基因网络（受资源竞争影响） | 工业生物技术 |
| 156 | 2026-03-21 |
Engineering and Evaluation of Sinorhizobium meliloti Nodulation (nod) Gene Reporter Systems in Rhizobia and Non-Rhizobia
2026-Mar, Environmental microbiology
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/1462-2920.70284
PMID:41858307
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研究论文 | 本研究开发了基于Sinorhizobium meliloti nod基因的报告系统，用于筛选能表达nod基因的根瘤菌和非根瘤菌，以促进非豆科植物的生物固氮 | 开发了包含可诱导nod box启动子、植物信号依赖性激活因子和组成型标记的nod基因报告系统，首次实现在根瘤菌和非根瘤菌中高通量筛选能识别豆科植物信号分子的细菌 | NA | 增强非豆科植物的生物固氮能力，减少对合成肥料的依赖 | 根瘤菌和非根瘤菌微生物 | 合成生物学 | NA | 基因报告系统构建、体外和植物内诱导实验 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | Sinorhizobium meliloti, 根瘤菌, 非根瘤菌 | nod基因报告系统，包含PnodA启动子控制的超折叠GFP报告基因、nodD1和nodD2激活因子以及组成型mScarlet-I标记 | 农业, 环境 |
| 157 | 2026-03-21 |
Engineering plasmids with synthetic origins of replication
2026-02-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68907-1
PMID:41629321
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研究论文 | 本文通过重构天然pMB1复制起点，开发了具有可定制拷贝数的合成复制起点（SynORI）质粒，实现了独立拷贝控制和环境信号响应 | 首次创建了基于合成RNA调节器的兼容复制起点，实现了质粒拷贝数的独立调控和模块化信号响应 | NA | 开发可调谐、兼容且模块化的合成质粒复制起点，以克服天然复制机制的限制 | 质粒复制起点和合成RNA调节器 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工程 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, BioBrick | E. coli | 合成复制起点（SynORI），包括可调拷贝数机制、基于RNA的独立拷贝控制逻辑门和信号响应生物传感器 | 工业生物技术 |
| 158 | 2026-03-21 |
The Cross-Species Implantable ATP Battery Inspired by Photosynthesis for Application in Diseases
2026, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S569114
PMID:41858590
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综述 | 本文探讨了一种受光合作用启发的跨物种可植入ATP电池技术，旨在通过光能驱动在受损人体细胞内自主再生ATP，以治疗多种疾病 | 提出了一种模仿自然光合作用的人工光合系统，能够在细胞水平上实现光驱动的持续ATP合成，并将合成生物学、材料科学和靶向递送策略整合到一个治疗平台中 | NA | 探索跨物种可植入ATP电池在疾病治疗中的应用潜力，旨在通过恢复细胞生物能量学来治疗疾病 | 人工光合系统及其在缺氧肿瘤微环境、代谢受损组织再生和能量缺陷神经元等病理环境中的应用 | NA | 多种疾病（包括肿瘤、组织损伤、神经元疾病等） | 人工光合作用技术 | NA | NA | NA | NA | 人体细胞 | 人工光合系统，包括光氧化模块（将光能转化为电化学质子梯度）、光磷酸化模块（利用梯度驱动ATP合成）和封装系统（用于空间组织、功能完整性和靶向细胞递送） | 医学 |
| 159 | 2026-03-20 |
Structure-coevolution dual-guided engineering of C-glycosyltransferase enables high-level biosynthesis of vitexin in Yarrowia lipolytica
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.02.011
PMID:41852688
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研究论文 | 本研究通过结构-共进化双引导工程策略改造C-糖基转移酶，显著提升了其催化活性和热稳定性，并在Yarrowia lipolytica中实现了杜荆素的高效生物合成 | 提出了结构-共进化双引导的协同框架来指导C-糖基转移酶工程，通过改造底物结合腔和优化相互作用，大幅提升了酶活性和热稳定性，并构建了高效的微生物细胞工厂 | 未明确说明该工程策略在其他C-糖基转移酶或宿主系统中的普适性，也未详细讨论大规模工业化生产可能面临的其他技术挑战 | 开发高效的C-糖基转移酶工程策略，实现黄酮类C-糖苷的高效生物合成 | 来自T. cuspidata的C-糖基转移酶TcCGT1及其工程变体，以及Yarrowia lipolytica宿主系统 | 合成生物学 | NA | 结构-共进化双引导工程策略、分子动力学模拟、结构分析、代谢工程、补料分批发酵 | NA | NA | NA | 代谢工程 | Yarrowia lipolytica | 杜荆素合成途径 | 医药、工业生物技术 |
| 160 | 2026-03-20 |
Versatile 2-Oxoglutarate-Dependent Dioxygenases Catalyze Radical-Mediated Multifunctional Skeleton Reconstructions and Oxidation Modifications of Taxoids
2026-Mar-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c01169
PMID:41746272
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研究论文 | 本文表征了两种新型2-氧戊二酸依赖性双加氧酶TcOGD1和TcOGD2，它们催化紫杉烷类化合物的骨架重构和氧化修饰，揭示了紫杉烷结构多样性的形成机制 | 首次报道了具有催化多功能性的2-氧戊二酸依赖性双加氧酶，能够介导从6/8/6到5/7/6、-5/7/6和6/12框架的骨架重构，以及多种氧化修饰，通过自由基介导的C-C键断裂构建新骨架 | NA | 探索5/7/6紫杉烷类化合物的化学多样性和生物合成途径 | 紫杉烷二萜类化合物，特别是5/7/6框架的紫杉烷如taxuspine J | NA | NA | 酶促反应、NMR光谱学、酶工程 | NA | NA | NA | 酶工程、合成生物学 | NA | NA | 医药 |