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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-03-21 |
Engineering plasmids with synthetic origins of replication
2026-02-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68907-1
PMID:41629321
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研究论文 | 本文通过重构天然pMB1复制起点,开发了具有可定制拷贝数的合成复制起点(SynORI)质粒,实现了独立拷贝控制和环境信号响应 | 首次创建了基于合成RNA调节器的兼容复制起点,实现了质粒拷贝数的独立调控和模块化信号响应 | NA | 开发可调谐、兼容且模块化的合成质粒复制起点,以克服天然复制机制的限制 | 质粒复制起点和合成RNA调节器 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工程 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, BioBrick | E. coli | 合成复制起点(SynORI),包括可调拷贝数机制、基于RNA的独立拷贝控制逻辑门和信号响应生物传感器 | 工业生物技术 |
| 142 | 2026-03-21 |
The Cross-Species Implantable ATP Battery Inspired by Photosynthesis for Application in Diseases
2026, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S569114
PMID:41858590
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综述 | 本文探讨了一种受光合作用启发的跨物种可植入ATP电池技术,旨在通过光能驱动在受损人体细胞内自主再生ATP,以治疗多种疾病 | 提出了一种模仿自然光合作用的人工光合系统,能够在细胞水平上实现光驱动的持续ATP合成,并将合成生物学、材料科学和靶向递送策略整合到一个治疗平台中 | NA | 探索跨物种可植入ATP电池在疾病治疗中的应用潜力,旨在通过恢复细胞生物能量学来治疗疾病 | 人工光合系统及其在缺氧肿瘤微环境、代谢受损组织再生和能量缺陷神经元等病理环境中的应用 | NA | 多种疾病(包括肿瘤、组织损伤、神经元疾病等) | 人工光合作用技术 | NA | NA | NA | NA | 人体细胞 | 人工光合系统,包括光氧化模块(将光能转化为电化学质子梯度)、光磷酸化模块(利用梯度驱动ATP合成)和封装系统(用于空间组织、功能完整性和靶向细胞递送) | 医学 |
| 143 | 2026-03-20 |
Structure-coevolution dual-guided engineering of C-glycosyltransferase enables high-level biosynthesis of vitexin in Yarrowia lipolytica
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.02.011
PMID:41852688
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研究论文 | 本研究通过结构-共进化双引导工程策略改造C-糖基转移酶,显著提升了其催化活性和热稳定性,并在Yarrowia lipolytica中实现了杜荆素的高效生物合成 | 提出了结构-共进化双引导的协同框架来指导C-糖基转移酶工程,通过改造底物结合腔和优化相互作用,大幅提升了酶活性和热稳定性,并构建了高效的微生物细胞工厂 | 未明确说明该工程策略在其他C-糖基转移酶或宿主系统中的普适性,也未详细讨论大规模工业化生产可能面临的其他技术挑战 | 开发高效的C-糖基转移酶工程策略,实现黄酮类C-糖苷的高效生物合成 | 来自T. cuspidata的C-糖基转移酶TcCGT1及其工程变体,以及Yarrowia lipolytica宿主系统 | 合成生物学 | NA | 结构-共进化双引导工程策略、分子动力学模拟、结构分析、代谢工程、补料分批发酵 | NA | NA | NA | 代谢工程 | Yarrowia lipolytica | 杜荆素合成途径 | 医药、工业生物技术 |
| 144 | 2026-03-20 |
Versatile 2-Oxoglutarate-Dependent Dioxygenases Catalyze Radical-Mediated Multifunctional Skeleton Reconstructions and Oxidation Modifications of Taxoids
2026-Mar-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c01169
PMID:41746272
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研究论文 | 本文表征了两种新型2-氧戊二酸依赖性双加氧酶TcOGD1和TcOGD2,它们催化紫杉烷类化合物的骨架重构和氧化修饰,揭示了紫杉烷结构多样性的形成机制 | 首次报道了具有催化多功能性的2-氧戊二酸依赖性双加氧酶,能够介导从6/8/6到5/7/6、-5/7/6和6/12框架的骨架重构,以及多种氧化修饰,通过自由基介导的C-C键断裂构建新骨架 | NA | 探索5/7/6紫杉烷类化合物的化学多样性和生物合成途径 | 紫杉烷二萜类化合物,特别是5/7/6框架的紫杉烷如taxuspine J | NA | NA | 酶促反应、NMR光谱学、酶工程 | NA | NA | NA | 酶工程、合成生物学 | NA | NA | 医药 |
| 145 | 2026-03-20 |
Artificial intelligence revolutionizes cellular metabolic pathway reconstruction
2026-Mar-17, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2026.01.003
PMID:41850996
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综述 | 本文提出一个整合逆合成规划与生物约束的概念框架,以革新细胞代谢途径重建 | 通过结合逆合成规划和生物约束,实现个体与系统层面的建模,并利用大语言模型驱动代谢网络的理解、设计、评估和优化 | NA | 革新合成生物学中的细胞代谢途径重建方法 | 细胞代谢网络 | 合成生物学 | NA | 逆合成规划、大语言模型 | 大语言模型 | 代谢网络数据 | NA | NA | NA | 代谢途径重建 | 工业生物技术 |
| 146 | 2026-03-20 |
Exogenous biostimulants: mechanisms and innovations for enhancing seed germination and resilience under abiotic stress
2026-Mar-12, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.03.023
PMID:41831683
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综述 | 本文综述了外源生物刺激剂在缓解非生物胁迫(如干旱、盐分和极端温度)对种子萌发抑制的生理生化机制,并探讨了利用纳米材料、植物激素、代谢物等外源物质增强种子耐受性的潜力与挑战 | 提出了一个整合合成生物学、可生物降解纳米材料和刺激响应型纳米递送系统的多学科策略路线图,旨在实现活性成分的靶向、按需释放,以跨越实验室研究与田间应用的鸿沟 | 从实验室成果到田间应用仍面临成本效益、环境安全性和作用周期短等重大障碍 | 增强种子在非生物胁迫下的萌发能力和恢复力,以应对气候变化对作物建植和粮食安全的威胁 | 种子萌发过程及其对干旱、盐分、极端温度等非生物胁迫的响应 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 农业 |
| 147 | 2026-03-20 |
Unlocking Ectoine's Postbiotic Therapeutic Promise: Mechanisms, Applications, and Future Directions
2026-Jan, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-025-10506-5
PMID:40072821
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综述 | 本文全面综述了细菌来源的胞外保护剂Ectoine作为后生元疗法的机制、应用及未来发展方向 | 系统阐述了Ectoine在神经退行性疾病、自身免疫病和代谢综合征等新治疗领域的潜力,并探讨了纳米载体、水凝胶等先进递送系统与植物化学物的协同增效策略 | Ectoine在真核细胞中生物利用度低、工业化生产可扩展性受限、合成生物学方法成本高昂 | 评估Ectoine作为后生元治疗剂的潜力,探索其在多种疾病治疗中的应用前景 | Ectoine(一种细菌来源的胞外保护化合物) | NA | 鼻窦炎、特应性皮炎、过敏性鼻炎、阿尔茨海默病、自身免疫病、代谢综合征 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 148 | 2026-03-20 |
Microbial Systems Ecology to Understand Cross-Feeding in Microbiomes
2021, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2021.780469
PMID:34987488
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综述 | 本文是一篇关于微生物系统生态学(MSE)框架如何帮助理解微生物组中交叉喂养的迷你综述 | 提出了一个结合自上而下和自下而上方法的微生物系统生态学框架,用于解析微生物群落组装的确定性过程,特别适用于合成生物学和微生物组工程 | NA | 探讨微生物系统生态学框架在理解微生物交叉喂养和群落组装机制方面的应用 | 微生物群落及其交叉喂养相互作用 | 微生物生态学 | NA | 基因组尺度代谢网络重建、整合组学数据 | 代谢建模 | 组学数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、微生物组工程 |
| 149 | 2026-03-19 |
Advances in detecting category A biothreat agents: Toward symptom-driven sensing strategies
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.02.002
PMID:41847150
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综述 | 本文综述了针对A类生物威胁剂的最新生物传感平台,并探讨了其诊断目标、优化方法及与临床症状的关联 | 提出建立传感技术与临床应用之间的系统性联系,支持针对生物恐怖、流行病和公共卫生的医疗资源分配研究 | NA | 开发针对A类生物威胁剂的传感技术,以应对生物恐怖和公共卫生威胁 | A类生物威胁剂 | NA | 生物恐怖相关疾病 | 生物传感平台 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 公共安全 |
| 150 | 2026-03-19 |
Inter-species horizontal transfer of biosynthetic gene clusters: an evolutionary driver for chemical diversity in bacterial communities
2026-Mar-18, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20250014
PMID:41847751
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综述 | 本文探讨了细菌间生物合成基因簇的水平转移机制及其对细菌群落化学多样性的进化驱动作用 | 挑战了传统以基因组为中心的次生代谢观点,提出模仿自然界模块化转移系统可为合成生物学提供可移植生物合成平台的设计灵感 | 未涉及具体实验验证数据,主要基于理论探讨和现有文献分析 | 研究生物合成基因簇在细菌种间水平转移的机制及其进化意义 | 细菌生物合成基因簇及其水平转移过程 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文献分析 | NA | NA | 细菌 | 可移植生物合成平台 | 工业生物技术 |
| 151 | 2026-03-19 |
Nanoparticle-Based Membranes on Coacervates: From Interfacial Assembly to Biomimetic Applications
2026-Mar-18, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202514620
PMID:41848017
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综述 | 本文综述了基于纳米颗粒膜包覆的凝聚层体系,重点介绍了其界面组装机制、理化性质改善及在仿生应用中的潜力 | 系统归纳了纳米颗粒膜包覆凝聚层的三种主要组装驱动力(界面能驱动、静电作用主导、多机制协同),并阐明该技术如何突破无膜结构的动态不稳定性限制 | 当前纳米颗粒包覆凝聚层微滴的设计与调控仍存在局限性,如膜结构的精确动态控制与功能集成度有待提升 | 通过纳米颗粒膜包覆技术增强凝聚层的结构稳定性和功能可编程性,推动其在合成生物学和仿生材料领域的应用 | 由液-液相分离形成的凝聚层及其纳米颗粒包覆复合体系 | 合成生物学 | NA | 界面自组装技术、纳米颗粒包覆技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 仿生功能模块(细胞代谢模拟、吞噬作用、运动性、信号转导) | 材料, 工业生物技术 |
| 152 | 2026-03-19 |
Context-aware synthetic promoter design using neural networks enables rewiring of eukaryotic transcriptional networks
2026-Mar-17, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00684-5
PMID:41844670
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研究论文 | 本文提出了一种基于神经网络的上下文感知合成启动子设计框架,用于在酿酒酵母中重编程转录网络 | 开发了首个用于启动子-转录因子结合位点重组的神经网络工具,实现了无需实验表征的高效启动子工程 | NA | 通过合成启动子设计实现真核生物转录网络的重编程 | 酿酒酵母的启动子和转录因子结合位点 | 合成生物学 | NA | 人工神经网络 | ANN | 启动子序列数据 | 6,011个天然酵母启动子 | NA | 酿酒酵母 | TetR和Mig1转录因子结合位点的启动子工程 | 工业生物技术 |
| 153 | 2026-03-19 |
Construct design for precise DNA insertion in plants
2026-Mar-17, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.01.005
PMID:41846181
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综述 | 本文深入综述了植物中构建体设计原则和靶向DNA插入(敲入)策略,为合成生物学、遗传学和作物改良提供实用指导 | 系统评估了当前敲入方法在短片段、大片段和多片段插入中的优缺点,并探讨了非植物先进技术在提高植物敲入效率和精度方面的潜力 | NA | 为促进敲入技术在作物遗传改良中的有效应用,减少脱靶效应 | 植物基因组中的DNA插入构建体设计 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 154 | 2026-03-19 |
Deep learning revolutionizes protein research: Advances in structure prediction, functional annotation, and engineered design
2026-Mar-14, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.03.012
PMID:41839238
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综述 | 本文综述了深度学习如何通过一个协同循环,从根本上改变了蛋白质研究,连接了结构预测、功能注释和理性设计 | 提出了一个统一的“预测-理解-创造”范式,将深度学习确立为蛋白质科学新时代的基石,将领域从描述性观察转变为有原则、可编程的生物分子功能工程 | 在数据稀缺性、模型可解释性和分布外泛化方面仍存在挑战 | 展示深度学习如何通过一个协同循环,连接蛋白质结构预测、功能注释和理性设计,从而加速药物开发和合成生物学领域的发现 | 蛋白质,特别是具有足够进化信息的单域、球状蛋白质 | 机器学习 | NA | 深度学习,生成式AI,逆折叠模型,冷冻电镜与AI集成 | 端到端深度学习模型(如AlphaFold2),多模态模型,生成式AI | 3D坐标,序列数据,相互作用数据 | NA | NA | NA | NA | 药物开发,合成生物学 |
| 155 | 2026-03-19 |
Biological reduction of Fenton sludge: Electron transfer mechanisms, regulatory strategies, and prospects
2026-Mar-13, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134424
PMID:41833913
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综述 | 本文综述了Fenton污泥生物还原中的电子转移机制、调控策略及未来展望,强调其在资源回收中的潜力 | 聚焦于电子转移网络框架的动态耦合机制,并详细阐述了调控策略如环境参数优化、基因工程和微生物电化学技术 | NA | 探讨Fenton污泥生物还原的资源回收策略及其电子转移机制 | Fenton污泥及铁还原细菌 | 环境生物技术 | NA | 生物还原、基因工程、微生物电化学技术 | NA | NA | NA | 基因工程 | 铁还原细菌 | NA | 环境 |
| 156 | 2026-03-19 |
Friedelane-type oxidosqualene cyclases in friedelin production: Advances in biosynthesis, functional characterization, structure-function relationships, and engineering strategies
2026-Mar-09, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151349
PMID:41812943
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综述 | 本文综述了friedelane型氧化鲨烯环化酶在friedelin生物合成中的研究进展,包括功能表征、结构-功能关系及工程策略 | 首次报道植物OSC的冷冻电镜结构,揭示了独特的“阳离子穿梭运行”机制,并整合多组学技术识别了18种friedelane型OSC酶 | 未明确提及具体实验数据或样本规模的限制,主要基于现有文献综述 | 探讨friedelin的生物合成、酶功能及工程化生产策略,以实现其可持续生物制造 | friedelane型氧化鲨烯环化酶(OSCs)及friedelin生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 多组学整合技术、冷冻电镜(cryo-EM)、代谢途径工程、蛋白质工程 | NA | NA | NA | 代谢途径工程、蛋白质工程、亚细胞区室化 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | friedelin生物合成途径的重建 | 医药、工业生物技术 |
| 157 | 2026-03-19 |
Improving the Skin-Conformability of Wearable Continuous Glucose Monitors With Synthetic Hydrogel Electrodes
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202517501
PMID:41572506
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研究论文 | 本文介绍了一种通过合成生物电子策略开发的酶水凝胶电极(GelZymes),旨在克服传统酶电极的机械和界面限制,提升可穿戴连续血糖监测设备的皮肤贴合性 | GelZymes提供了两个核心创新:一是采用单块可扩展的3D架构,统一了酶膜和电极,简化了制造过程并消除了界面不稳定性;二是实现了类似组织的粘弹性,结合了拉伸性和粘附性,这在刚性酶膜中很少能实现 | NA | 研究目的是开发一种改进的可穿戴连续血糖监测设备,通过合成生物电子策略提升其皮肤贴合性和生物电化学性能 | 研究对象是酶水凝胶电极(GelZymes),用于可穿戴生物传感器 | 生物电子学 | 糖尿病 | 合成生物电子策略、酶固定化技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 158 | 2026-03-19 |
Microbial melanin: biosynthesis, functional Insights, and emerging research challenges
2026-Jan-27, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04757-1
PMID:41591674
|
综述 | 本文综述了微生物黑色素在生物合成途径、生产优化策略、挑战及潜在应用方面的最新进展 | 重点强调了组学技术和基因工程在阐明生物合成机制和提高产量方面的关键作用,并提出了整合合成生物学、先进分析技术和全面安全性评估的未来研究方向 | NA | 为微生物黑色素这一快速发展的领域提供全面且具有批判性的参考 | 微生物黑色素 | NA | NA | 组学技术,基因工程 | NA | NA | NA | NA | 细菌,真菌 | NA | 生物技术 |
| 159 | 2026-03-19 |
Decoding signaling architectures: CAR versus TCR dynamics in solid tumor immunotherapy
2026-01-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025190
PMID:41132090
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综述 | 本文比较了T细胞受体(TCR)和嵌合抗原受体(CAR)在信号传导架构上的差异,并总结了针对实体瘤免疫治疗中CAR-T细胞功能提升的最新策略 | 系统性地解码了CAR与TCR在信号动力学上的差异,并强调了通过工程化优化CAR设计、增强免疫突触形成、调整ITAM数量/强度以及整合新型共刺激域等突破性策略,以缩小实体瘤与血液肿瘤疗效差距 | NA | 旨在改善CAR-T细胞在实体瘤免疫治疗中的疗效,通过理解信号传导机制并开发创新策略来克服现有障碍 | T细胞受体(TCR)、嵌合抗原受体(CAR)及其在实体瘤免疫治疗中的应用 | 免疫学 | 实体瘤 | 合成生物学工具、表观遗传重编程 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | T细胞 | 可调/逻辑门控的CAR激活 | 医学 |
| 160 | 2026-03-19 |
A modular single- and dual-gene expression toolkit for Kluyveromyces marxianus
2026-Jan-23, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04794-4
PMID:41571921
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研究论文 | 本研究为马克斯克鲁维酵母开发了一套模块化的单基因和双基因表达工具包,以促进其在合成生物学和工业蛋白质生产中的应用 | 开发了基于筛选元件(pENO启动子和pHTX双向启动子)的单基因和双基因表达系统,并首次在马克斯克鲁维酵母中实现了稳定的、受遗传元件组合、碳源和培养时间调控的表达,以及利用SV40核定位信号实现亚细胞靶向 | NA | 开发适用于马克斯克鲁维酵母的基因表达工具,以克服其表达工具有限的障碍,推动其作为微生物底盘在合成生物学和工业蛋白质生产中的应用 | 马克斯克鲁维酵母 | 合成生物学 | NA | 基因表达系统构建、荧光蛋白定位 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, BioBrick | Kluyveromyces marxianus (马克斯克鲁维酵母) | 单基因表达系统(含短基因间序列IGG用于双顺反子表达)、双基因表达系统(基于双向启动子pHTX)、核定位系统(利用SV40 NLS) | 工业生物技术 |