合成生物学相关文章
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当前共找到 5109 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-06-04 |
Development of cell-free transcription translation
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.003
PMID:41581991
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综述 | 综述了无细胞转录翻译系统的开发历程、现状及未来发展方向 | 详细阐述了无细胞系统从最初的大肠杆菌提取物发展到涵盖多种生物来源的综合平台，并指出其在快速高效合成蛋白质、增强化学抗性和简化标记等方面的独特优势 | 存在成本高、蛋白质产量有限、缺乏复杂翻译后修饰以及提取物不稳定等挑战 | 介绍无细胞转录翻译系统的开发进展及其在合成生物学和生物制药中的应用潜力 | 无细胞转录翻译系统（TXTL） | 合成生物学 | NA | 无细胞转录翻译 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 酵母, 真核细胞 | NA | 合成生物学, 生物制药 |
| 142 | 2026-06-04 |
Advances in protein engineering
2026, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2025.11.002
PMID:42191275
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综述 | 综述蛋白质工程在医学、食品和环境等领域的最新进展，重点关注人类疾病治疗和生物医学科学 | 系统总结了蛋白质工程在CRISPR/Cas系统、高通量数据和合成生物学中的关键成就，涵盖进化、理性设计、半理性设计和混合方法等创新技术 | 讨论了蛋白质工程应用的当前挑战和伦理考量 | 回顾蛋白质工程的最新发展，强调其在人类疾病特别是癌症治疗中的变革潜力 | 蛋白质工程相关技术及其在治疗性蛋白质、抗体工程、酶合成中的应用 | 蛋白质工程 | 癌症 | 蛋白质工程、CRISPR/Cas、高通量数据 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | 医学、食品、环境、工业生物技术 |
| 143 | 2026-06-04 |
The synergy of foundation technologies and computer sciences advances microbial expression systems in biomedical genetic engineering
2026, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2025.11.007
PMID:42191273
|
综述 | 基础技术与计算机科学的协同作用推动了生物医学基因工程中微生物表达系统的发展 | 系统阐述了合成生物学、CRISPR-Cas9等基因组编辑工具、下一代测序与组学技术、人工智能以及系统生物学与代谢建模等多学科技术的协同潜力，并提出克服当前障碍的策略 | 仍存在脱靶效应、代谢负担和放大生产限制等挑战 | 探讨基础生物技术与计算科学如何协同推进生物医学基因工程中微生物表达系统的进步 | 微生物表达系统 | 机器学习 | NA | 下一代测序, 组学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | NA | 医学 |
| 144 | 2026-06-04 |
Protein Design Enters the Artificial Intelligence Era: Foundations, Tools, and Emerging Paradigms
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0105
PMID:42231905
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综述 | 本文综述了人工智能在蛋白质设计领域的应用，涵盖深度学习、蛋白质语言模型和知识图谱等技术，以及它们在序列-结构-功能关系解析中的进展 | 系统总结了AI在蛋白质设计中的新范式，包括AlphaFold2的结构预测精度和Transformer模型从头序列设计，突出了计算与实验整合的趋势 | 模型可解释性不足、训练数据存在偏差以及实验验证率较低仍是主要挑战 | 分析人工智能驱动蛋白质设计的计算方法、基准指标及机器学习与实验管线的整合 | 蛋白质序列、结构和功能关系，以及相关计算工具和模型 | 机器学习 | NA | 深度学习, 蛋白质语言模型, 知识图谱, AlphaFold2, Transformer | 深度学习模型, 蛋白质语言模型, Transformer | 蛋白质序列数据, 结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医疗保健, 工业生物技术, 合成生物学 |
| 145 | 2026-06-04 |
Intratumoral microbiota: synergistic reshaping of lung cancer microenvironment via inflammation and immunity
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1653727
PMID:41613126
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综述 | 探讨瘤内微生物群通过炎症和免疫机制重塑肺癌微环境，并展望基于合成生物学的工程菌和纳米抗生素在免疫治疗中的应用 | 首次系统阐述瘤内微生物群在肺癌微环境中通过分泌代谢物、激活信号通路、招募免疫抑制细胞及上调免疫检查点分子表达来主动诱导慢性炎症并促进肿瘤进展，并评估了基于合成生物学的工程菌和靶向纳米抗生素重塑免疫微环境的潜力 | 肺组织低生物量导致测序数据易受试剂污染和批次效应影响，且常忽视真菌和病毒等非细菌成分在肿瘤生态系统中的协同作用 | 阐明瘤内微生物群影响肺癌细胞和肿瘤微环境的机制，并探索其临床转化潜力 | 瘤内微生物群及其在肺癌微环境中的作用 | 微生物组学 | 肺癌 | 高通量测序, 多组学技术 | NA | 测序数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 146 | 2026-06-03 |
Liquid-liquid phase separation in metabolic engineering: Mechanistic insights, emerging applications, and future challenges
2026-Jun-02, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108931
PMID:42225537
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综述 | 系统总结了液-液相分离在代谢工程中的设计原理、分子决定因素和调控策略，并探讨了人工智能与深度学习如何推动该领域的理性设计 | 首次将人工智能和深度学习应用于内在无序区数据库构建和数据驱动的合成IDR理性设计，建立了定量序列-相行为关系，推动经验设计向预测性工程框架转变 | 冷凝物的老化和与宿主细胞环境的兼容性仍是关键挑战 | 为合成生物学和代谢工程领域提供液-液相分离的集成理论框架和前瞻性视角，以开发下一代稳定、可编程的基于LLPS的微生物细胞工厂平台 | 液-液相分离形成的人工冷凝物及其在代谢通道、基因表达控制和复杂可编程细胞功能模块中的应用 | 合成生物学, 代谢工程 | NA | 液-液相分离, 人工智能, 深度学习 | 深度学习 | 内在无序区序列数据 | NA | NA | 微生物细胞 | 人工冷凝物（代谢通道、基因表达控制、可编程细胞功能模块） | 工业生物技术 |
| 147 | 2026-06-03 |
Essential Proteins Prediction Using Features Synergy Model and GO Pure Centrality
2026-Jun-01, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3698655
PMID:42224331
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研究论文 | 提出一种基于特征协同模型和GO纯中心性的必需蛋白预测方法FSM，以提升识别率 | 创新性地融合特征协同模型与GO纯中心性，构建纯PPI网络并设计新中心性度量GPC，有效降低PPI数据噪声并增强特征关系整合 | 方法依赖GO注释和基因表达数据质量，可能在不同物种或数据稀疏场景下性能受限 | 提高必需蛋白预测的准确率，推动合成生物学和疾病治疗发展 | 酵母数据集中的必需蛋白 | 机器学习 | NA | 基因表达分析、GO注释分析 | 特征协同模型 | 蛋白质相互作用数据、基因表达数据、GO注释数据、亚细胞定位和直系同源蛋白数据 | 三个不同的酵母数据集 | NA | 酿酒酵母 | NA | 合成生物学、医学 |
| 148 | 2026-06-03 |
From fragmented workflows to integrated pipelines: Bridging enzymatic DNA synthesis, assembly, and MutS-based error correction
2026-May-31, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108941
PMID:42225240
|
综述 | 本文讨论了如何将酶促DNA合成、组装和基于MutS的纠错整合为一个连续自动化工作流程，以解决当前基因构建中碎片化问题 | 提出通过理解合成、组装与保真度控制之间的依赖关系来实现真正集成的工作流程，并强调酶促DNA合成作为水性过程为整合提供新机遇 | 未提供具体的实验验证或定量比较，仅基于文献分析和理论推理 | 探索将酶促DNA合成、碎片组装和MutS纠错集成到一个自动化流程中，以提高基因构建的保真度、通量和可扩展性 | 基因构建管道中的步骤：寡核苷酸合成、片段组装和纠错 | 合成生物学 | NA | 酶促DNA合成、MutS纠错、层次化组装 | NA | NA | NA | MutS | NA | NA | 合成生物学 |
| 149 | 2026-06-03 |
Decoding Cdk1 control: from mitotic thresholds to meiotic specificity
2026-03-12, Chromosome research : an international journal on the molecular, supramolecular and evolutionary aspects of chromosome biology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s10577-026-09796-4
PMID:41817770
|
综述 | 本文综述了通过化学遗传学、合成生物学和磷酸化蛋白质组学等方法对Cdk1在细胞周期控制中定量与定性作用的研究进展 | 系统整合了Cdk1抑制剂的开发、底物鉴定及在减数分裂中的应用，突出从有丝分裂到减数分裂的调控特异性 | 主要依赖于单Cdk的酵母模型，对高等真核生物中多重Cdk的复杂性讨论有限 | 阐明Cdk1活性阈值与细胞周期事件有序性的调控机制 | 芽殖酵母和裂殖酵母中的Cdk1蛋白及其在细胞周期和减数分裂中的作用 | 分子生物学 | NA | 化学遗传学、磷酸化蛋白质组学、质谱 | NA | 质谱数据 | NA | NA | 芽殖酵母、裂殖酵母 | NA | 基础生物学 |
| 150 | 2026-06-03 |
Multilayer Host Engineering of Saccharomyces cerevisiae to Enhance Cricket Paralysis Virus (CrPV) Internal Ribosome Entry Site Mediated Translation
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00744
PMID:41546634
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研究论文 | 通过多层次的宿主工程改造酿酒酵母，增强蟋蟀麻痹病毒内部核糖体进入位点介导的翻译活性 | 首次结合翻译起始、tRNA修饰和mRNA稳定性三个机制层面的宿主改造，实现了CrPV IRES介导翻译活性数量级的提升 | 仅建立了概念验证框架，未具体量化各改造步骤对翻译效率的独立贡献，且可能存在工程菌株生长适应性代价 | 通过宿主工程策略提高CrPV IRES在酿酒酵母中的翻译效率，以扩展其在合成生物学中的RNA调控应用 | 酿酒酵母宿主菌株及CrPV IRES报告系统 | 合成生物学 | NA | 报告基因筛选、基因工程改造 | NA | 报告基因表达数据 | 多个改造菌株（具体数量未明示） | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | CrPV IRES介导的非经典翻译调控元件 | 合成生物学 |
| 151 | 2026-06-03 |
Phage-mediated delivery of CRISPR payloads
2026-Feb, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102704
PMID:41547318
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综述 | 综述利用噬菌体递送CRISPR有效载荷以工程改造微生物群落的最新进展 | 系统总结了利用噬菌体递送各种CRISPR-Cas效应器进行精准基因组编辑和原位扰动的方法 | 部署的系统发育广度仍存在挑战 | 讨论利用噬菌体递送CRISPR有效载荷以工程改造微生物群落 | 微生物群落和噬菌体 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas, 噬菌体递送 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas, 噬菌体工程 | 细菌, 宿主环境 | CRISPR有效载荷, 精准基因组编辑 | 医学, 食品, 农业 |
| 152 | 2026-06-03 |
Copper biosorption by Serratia plymuthica: crucial role of tightly bound extracellular polymeric substances in planktonic and biofilm systems
2026-Jan-16, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-026-10245-6
PMID:41545695
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研究论文 | 探究普城沙雷氏菌胞外聚合物在浮游和生物膜系统中对铜离子吸附的关键作用 | 首次揭示普城沙雷氏菌As3-5a(5)菌株中紧密结合型胞外聚合物的蛋白组分对铜离子高效吸附的贡献，并定量比较浮游细胞与生物膜系统的吸附效率 | 未通过合成生物学方法优化铜离子固定能力，且系统在真实工业废水条件下的技术成熟度尚需提升 | 阐明细菌胞外聚合物在铜离子生物吸附中的核心机制并开发工业废水处理应用 | 普城沙雷氏菌As3-5a(5)菌株的浮游细胞和生物膜系统 | 环境生物技术 | NA | 生物吸附 | NA | 浓度数据 | 铜离子初始浓度3.14 mM（实验室体系）和40 mM（电镀废水） | NA | 普城沙雷氏菌 | NA | 环境, 工业生物技术 |
| 153 | 2026-06-03 |
Engineering Trichoderma-mediated plant defense against bacterial phytopathogens: Micro-and nanobiotechnological strategies
2026, AIMS microbiology
IF:2.7Q3
DOI:10.3934/microbiol.2026002
PMID:41938783
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综述 | 该文章综述了利用木霉介导的植物防御对抗细菌性植物病原体的微生物与纳米生物技术策略 | 将纳米技术与CRISPR基因编辑和合成生物学相结合，构建木霉作为下一代精准作物保护平台 | 田间转化、生物安全性和监管方面仍存在挑战 | 综述木霉在防控细菌性植物病害中的微生物与纳米生物技术策略 | 木霉属真菌及细菌性植物病原体（如XXX、XXX等） | NA | 细菌性植物病害 | CRISPR基因编辑、合成生物学、纳米技术、多组学分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 木霉 | 工程化生物防治菌株 | 农业 |
| 154 | 2026-06-03 |
Engineering the holobiont: Synthetic biology strategies for reversing bioenergetic collapse in radiation enteritis
2026, AIMS microbiology
IF:2.7Q3
DOI:10.3934/microbiol.2026003
PMID:41938784
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综述 | 本文综述了利用合成生物学策略工程化肠道微生物组，以逆转放射场肠炎中生物能量崩溃的方法 | 提出从经验性益生菌补充转向理性微生物组工程，包括热力学工程、遗传驯化和布尔逻辑门生物计算机设计，以解决当前治疗的局限性 | 目前仍处于概念性路线图阶段，缺乏大规模人体临床验证和安全性评估的具体数据 | 通过合成生物学方法重建肠道稳态，实现放射场肠炎的治疗并改善癌症长期生存率 | 肠道微生物组，特别是工程化共生菌和宿主-微生物互作网络 | 合成生物学 | 放射场肠炎 | 合成生物学，基因编辑，微生物工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 工程化共生菌（如大肠杆菌），肠道微生物组 | 布尔逻辑门，热力学工程，遗传驯化（如磺酸酶删除），生物计算机，STALEMATE生物防护系统 | 医学，肿瘤放疗 |
| 155 | 2026-06-02 |
Eukaryotic cell-free protein synthesis: Chassis diversification, system engineering, and emerging applications
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.04.022
PMID:42221684
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综述 | 从系统工程角度全面综述和分析真核无细胞蛋白质合成系统的最新进展，涵盖底盘多样化、系统设计和新兴应用 | 从系统工程视角综合分析底盘多样化、核心反应组件理性设计，并探讨人工智能和合成生物学工具在突破标准化和成本瓶颈中的应用潜力 | 当前标准化和成本瓶颈仍阻碍工业化进程，需通过人工智能和合成生物学工具进一步优化 | 为构建经济、高通量的真核无细胞生物制造平台提供理论参考和实践指导 | 真核无细胞蛋白质合成系统 | NA | NA | 无细胞蛋白质合成 | NA | NA | NA | NA | 真核生物底盘 | NA | 人工细胞构建、生物电子接口开发、微阵列芯片设计 |
| 156 | 2026-06-02 |
Employing synthetic biology to modulate metabolic flux: Current strategies and applications
2026-Aug, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2026.03.012
PMID:42020273
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综述 | 本综述总结了代谢工程中用于调控代谢流的最新基因调控工具和策略及应用 | 根据中心法则的分子调控水平对工具进行分类，并讨论了尚未充分开发的潜在工具 | 未提供具体实验数据或比较分析，仅基于文献综述 | 总结代谢工程中的基因调控工具和策略，以促进可持续生物制造 | 细菌、古菌和真核生物中的多酶途径基因调控工具 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌, 古菌, 真核生物 | 代谢调控回路，包括基因开关、振荡器、逻辑门、生物传感器、代谢途径 | 工业生物技术, 医药, 农业, 环境, 能源, 材料, 食品 |
| 157 | 2026-06-02 |
Enhanced tRNA array method version 2 for simultaneous in vitro synthesis of 21 tRNAs
2026-Aug, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2026.03.014
PMID:42025521
|
研究论文 | 开发了改进版tRNA阵列方法，实现21种tRNA的同步体外合成 | 通过序列修饰和引入前导序列，解决了原tRNA阵列方法中特定tRNA组限制翻译活性的问题 | NA | 提高tRNA阵列方法的翻译活性，使之与单独制备tRNA的性能相当 | tRNA阵列方法及翻译活性受限的tRNA组 | 合成生物学 | NA | 体外转录与翻译，序列修饰 | NA | NA | NA | NA | NA | tRNA阵列，包含前导序列的基因表达系统 | 合成生物学，生物技术 |
| 158 | 2026-06-02 |
Tailored base editing toolkits for functional genomics and metabolic engineering in the halophile Salinivibrio
2026-Aug, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.04.012
PMID:42031218
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研究论文 | 开发了适用于嗜盐菌Salinivibrio的碱基编辑工具包，用于功能基因组学和代谢工程 | 首次在非模式嗜盐菌中开发高效的碱基编辑平台，实现单、双、三位点替换，以及新型融合蛋白实现协同双碱基编辑 | 未提及在更广泛嗜盐菌中的适用性或长期稳定性 | 开发高效遗传工具以促进嗜盐菌的工业应用 | 嗜盐菌Salinivibrio sp. TGB4 | 合成生物学 | NA | 碱基编辑 | NA | NA | NA | ABE, CBE, PmCDA-TadA8e-nCas9-UGI | Salinivibrio sp. TGB4 | 碱基编辑工具，包括腺嘌呤和胞嘧啶碱基编辑器及协同双碱基编辑器 | 工业生物技术 |
| 159 | 2026-06-02 |
Engineering AraC L9K for inducer-independent pBAD activation in Salmonella Gallinarum
2026-Aug, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.04.019
PMID:42061758
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研究论文 | 通过在肠炎沙门氏菌血清型鸡伤寒沙门氏菌中结合宿主基因组修饰和定点诱变，生成不依赖诱导剂的AraC变体L9K，实现pBAD启动子的组成型高表达 | 首次在沙门氏菌中通过L9K单点突变获得不依赖阿拉伯糖的AraC组成型激活变体，且与常用pBAD载体兼容，避免了代谢负担 | NA | 开发不依赖外源诱导剂的AraC-pBAD表达系统，用于微生物制造和合成生物学应用 | 肠炎沙门氏菌血清型鸡伤寒沙门氏菌 | 合成生物学 | NA | 定点诱变，基因敲除，结构建模 | NA | NA | NA | 靶向诱变 | 肠炎沙门氏菌血清型鸡伤寒沙门氏菌 | 不依赖诱导剂的组成型基因表达系统 | 工业生物技术，医学，合成生物学 |
| 160 | 2026-06-02 |
Synthetic biology-driven innovations in triple-negative breast cancer: Integrating engineering design with targeted therapeutics
2026-Aug, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.04.017
PMID:42082082
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综述 | 综述合成生物学驱动的三阴性乳腺癌精准诊疗工程化策略 | 系统整合合成生物学与工程化设计原理，涵盖细胞工程、微生物工程和核酸工程三大类策略，并提出联合免疫肿瘤学与精准医学克服肿瘤异质性和耐药性的协同潜力 | 未提及具体临床转化障碍或体内验证数据，理论框架多于实验证据 | 总结合成生物学方法在三阴性乳腺癌中的最新进展，探索下一代自适应个性化治疗方案 | 三阴性乳腺癌（TNBC） | 合成生物学 | 三阴性乳腺癌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 基因回路 | 医学 |