合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
141	2025-09-20	Pathway crosstalk enables degradation of aromatic compounds in marine Roseobacter clade bacteria 2025-Sep-17, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2 DOI:10.1128/aem.00978-25 PMID:40793766	研究论文	本研究揭示了海洋Roseobacter分支细菌通过途径串扰降解芳香化合物的完整代谢路径	发现了β-酮己二酸途径与β-氧化途径在最终硫解步骤的独特串扰机制，并建立了新型海洋平台用于系统生物学研究	NA	解析海洋细菌中芳香化合物的生物降解途径，推动生物修复和碳循环应用	海洋Roseobacter分支细菌及其芳香化合物降解代谢途径	合成生物学	NA	多组学分析、CRISPR-Cas基因组编辑	NA	基因组数据、代谢组数据	NA
142	2025-09-20	Secure biosystems design in Saccharomyces cerevisiae establishes effective biocontainment strategies and mechanisms of escape 2025-Sep-17, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2 DOI:10.1128/aem.00741-25 PMID:40801494	研究论文	本研究在酿酒酵母中开发并评估了一种基于RelE毒素的kill switch生物安全系统，旨在建立有效的生物封闭策略并解析逃逸机制	通过高分辨率分析平台系统评估了kill switch在不同菌株中的表现，首次揭示了cam-TA和RelE毒素突变驱动的逃逸机制及脱靶突变的影响	多拷贝整合虽显著降低逃逸频率但仍无法实现持续生物封闭，工业菌株与实验室菌株的差异响应尚未完全解析	开发安全可靠的基因工程微生物生物封闭策略，防止其逃逸到自然环境中	酿酒酵母实验室菌株和工业菌株	合成生物学	NA	CRISPR介导的基因整合、基因组重测序、遗传工程	NA	基因组测序数据、表型数据	多种实验室和工业酿酒酵母菌株（具体数量未明确说明）
143	2025-09-20	Bacteria-mediated cancer therapy (BMCT): Therapeutic applications, clinical insights, and the microbiome as an emerging hallmark of cancer 2025-Sep-17, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie DOI:10.1016/j.biopha.2025.118559 PMID:40967079	综述	本文探讨了宿主微生物群在癌症治疗中的多面作用，包括细菌介导的癌症疗法（BMCT）的机制、应用及临床转化潜力	提出微生物组作为癌症的新兴标志性特征，并系统总结工程化细菌在免疫调节和联合免疫检查点抑制剂中的协同作用	安全性、递送特异性及监管问题尚未完全解决	综述细菌介导癌症疗法的机制、临床应用及微生物组在癌症治疗中的角色	共生及工程化细菌（如梭菌属、双歧杆菌属、李斯特菌属等）及其与肿瘤微环境的相互作用	肿瘤免疫学	癌症	合成生物学、精准微生物组工程、粪便微生物移植	NA	临床实验数据、微生物组数据	NA（涉及多种临床试验，但未明确样本数量）
144	2025-09-20	Structure prediction and engineering of de novo proteins 2025-Sep-15, Biochimica et biophysica acta. Proteins and proteomics DOI:10.1016/j.bbapap.2025.141100 PMID:40962101	综述	本文综述了从头蛋白质的定义、历史、功能意义及研究方法，涵盖自然进化与人工设计两类	强调自然进化过程与理性蛋白质工程日益融合的趋势及其在生物发现与人类创新中的重要性	NA	概述从头蛋白质研究领域的定义、方法及挑战	自然进化与人工设计的从头蛋白质	合成生物学	NA	计算与实验方法	NA	NA	NA
145	2025-09-20	Probiotic Bacteria as Therapeutics and Biohybrid Drug Carriers: Advances, Design Strategies, and Future Outlook 2025-Sep-15, ACS applied bio materials IF:4.6Q2 DOI:10.1021/acsabm.5c00959 PMID:40888536	综述	本文综述了益生菌作为药物递送平台的多样化策略及其在精准医疗中的应用前景	探讨了将益生菌整合到纳米颗粒递送系统的策略，并强调合成生物学和生物杂交涂层等前沿技术优化治疗效果的潜力	NA	分析益生菌作为药物载体在靶向治疗中的应用进展和未来发展方向	益生菌及其衍生物（如细菌幽灵、外膜囊泡等）作为药物递送平台	生物医学工程	癌症、胃肠道疾病	纳米技术、基因工程（质粒表达、基因组整合）、合成生物学	NA	NA	NA
146	2025-09-20	Cephalotaxus-Derived Homoharringtonine: Biosynthesis, Mechanism of Action, and Role in Modern Cancer Therapy 2025-Sep, Biotechnology journal IF:3.2Q2 DOI:10.1002/biot.70122 PMID:40970823	综述	本文综述了三尖杉属植物来源的高三尖杉酯碱的生物合成、作用机制及其在现代癌症治疗中的应用	批判性评估了三尖杉生物碱在实体瘤中的未充分研究机制、转化障碍及创新策略，并探讨合成生物学和精准医学等未来方向	存在相关代谢物生物活性知识缺口，面临化学复杂性、监管障碍和毒性特征等挑战	评估三尖杉生物碱作为抗癌药物的潜力及其在精准肿瘤学中的应用	三尖杉属植物及其生物碱（如高三尖杉酯碱）	NA	白血病、癌症	合成生物学、先进药物递送系统	NA	NA	NA
147	2025-09-20	Compartmentalized Terpenoid Production in Plants Using Agrobacterium-Mediated Transient Expression 2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_2 PMID:38468080	研究论文	本文介绍了利用农杆菌介导的瞬时表达技术在植物中区室化生产萜类化合物的方法	采用合成生物学方法在亚细胞水平区室化萜类生物合成，包括质体、细胞质和脂滴表面	NA	快速开发和区室化萜类生物合成途径	本氏烟草(Nicotiana benthamiana)中的萜类化合物生产	合成生物学	NA	农杆菌介导的瞬时表达	NA	NA	NA
148	2025-09-19	Engineered implementations of spatial computation in biological systems 2025-Oct, Seminars in cell & developmental biology IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.semcdb.2025.103631 PMID:40712326	综述	探讨空间分布式和区室化框架在工程化生物计算中的应用，超越传统单细胞逻辑系统	通过模拟形态发生素梯度和细胞区室化等自然现象，实现可扩展性、鲁棒性和适应性的合成空间计算系统	NA	整合空间与自适应计算，解决超越传统计算架构的复杂计算挑战	工程化生物系统	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
149	2025-09-19	Using transcription and translation regulators to improve recombinant protein expression in CHO cells 2025-Sep-18, Acta biochimica et biophysica Sinica IF:3.3Q1 DOI:10.3724/abbs.2025160 PMID:40963405	综述	本文总结了通过转录和翻译调控因子提高CHO细胞中重组治疗蛋白表达的策略	整合合成生物学方法和基因组学进展，提出定制化转录因子及翻译因子的优化策略	NA	提高重组治疗蛋白在CHO细胞中的表达效率并降低生产成本	中国仓鼠卵巢（CHO）细胞	合成生物学	NA	转录因子工程、启动子设计、翻译调控	NA	基因组数据	NA
150	2025-09-19	Broad-Host-Range Synthetic Biology: Rethinking Microbial Chassis as a Design Variable 2025-Sep-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00308 PMID:40964802	观点文章	本文探讨了广宿主范围合成生物学如何将微生物宿主选择重新定义为设计变量，超越传统模式生物的限制	提出将宿主选择作为关键设计参数，通过资源分配、代谢互作和调控串扰影响工程遗传设备行为，拓展了合成生物学的设计空间	NA	推动合成生物学从有限宿主向广宿主范围发展，提升工程生物系统的功能多样性和应用潜力	微生物宿主系统及其在遗传设计中的角色	合成生物学	NA	模块化载体、宿主无关遗传设备	NA	NA	NA
151	2025-09-19	Insights into microalgal biotechnology: Current applications, key challenges, and future prospects 2025-Sep-16, Journal of environmental management IF:8.0Q1 DOI:10.1016/j.jenvman.2025.127263 PMID:40961787	综述	本文综述了微藻生物技术的当前应用、主要挑战和未来前景，强调其在碳捕获、可再生能源生产和环境修复等方面的多功能性	整合了生物絮凝、磁性分离、合成生物学和光生物反应器设计等最新进展，提出模块化生物精炼系统和智能过程控制等未来发展方向	大规模部署仍受技术经济障碍限制，特别是生物质收获和脱水的高成本	探讨微藻生物技术的潜力和实现可持续循环生物经济的关键策略	微藻及其在碳捕获、能源生产和环境修复中的应用	生物技术	NA	CRISPR/Cas基因组编辑、生物絮凝、磁性分离、太阳能辅助干燥	NA	NA	NA
152	2025-09-19	A highly biosimilar synthetic Calculus Bovis enhances cerebral blood flow and provides neuroprotection against ischemic stroke 2025-Sep-11, Journal of ethnopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.jep.2025.120602 PMID:40945882	研究论文	本研究评估了一种高仿生合成牛黄在缺血性脑卒中后减轻脑损伤和增强脑血流的效果	首次通过合成生物学方法制备高仿生合成牛黄，并证实其在4小时治疗时间窗内具有与天然牛黄相似的神经保护作用和改善脑血流机制	研究仅使用雄性小鼠模型，未涉及雌性动物或更复杂的临床前模型	评估高仿生合成牛黄治疗缺血性脑卒中的疗效和机制	C57BL/6J雄性小鼠（经tMCAO手术诱导缺血性脑卒中模型）	药理学	缺血性脑卒中	合成生物学、色谱指纹图谱、激光散斑对比成像、FJB染色、尼氏染色	动物模型（小鼠tMCAO模型）	生物化学数据、影像数据、行为学数据	使用不同剂量组（35.95, 71.9, 143.8 mg/kg）和多时间点给药的小鼠样本
153	2025-09-19	Design of strictly orthogonal biosensors for maximizing renewable biofuel overproduction 2025-Sep-10, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2025.09.015 PMID:40939890	研究论文	本研究开发了一种基于机器学习的模型BT，用于预测转录因子BmoR的关键残基区域，以实现严格配体正交性，并应用于生物燃料高产菌株筛选	首次提出BSH（BmoR-信号分子氢键）计数在TF-SM相互作用中的主导作用，并建立机器学习指导的TF进化框架	NA	实现转录因子BmoR的严格配体正交性设计，用于生物传感器构建和生物燃料高产筛选	转录因子BmoR及其突变体，信号分子复合物	合成生物学	NA	随机森林算法，Discovery Studio分子模拟，MicroScale Thermophoresis (MST) 亲和力测定	Random Forest	分子模拟数据，实验验证数据	245个TF-SM复合物实验验证，5,700个BmoR突变体与4种SMs的22,800个复合物模拟
154	2025-09-19	Developmental regulatory factors promote the efficiency of crop genetic transformation 2025-Sep, Yi chuan = Hereditas DOI:10.16288/j.yczz.24-345 PMID:40962472	综述	本文系统探讨了发育调控因子在提高作物遗传转化效率中的应用与前景	深入分析了发育调控因子在克服基因型依赖性和提升再生能力方面的创新应用	NA	提升作物遗传转化技术的效率并克服现有瓶颈	作物遗传转化方法与发育调控因子	农业生物技术	NA	农杆菌介导转化、基因枪技术	NA	NA	NA
155	2025-09-19	Modular design of synthetic receptors for programmed gene regulation in cell therapies 2022-04-14, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2022.03.023 PMID:35427499	研究论文	本研究开发了一种模块化设计的合成受体SNIPR，用于编程治疗性细胞的基因调控	采用临床驱动设计流程构建可调控膜内蛋白水解的合成受体，具备可调节感知和转录响应能力	NA	开发适用于细胞治疗的合成生物学工具，实现治疗性细胞的自主调控	人类原代T细胞	合成生物学	NA	调控膜内蛋白水解技术，模块化工程设计	NA	NA	NA
156	2025-09-18	De novo biosynthesis of Asperosaponin VI in Saccharomyces cerevisiae 2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology IF:4.4Q1 DOI:10.1016/j.synbio.2025.08.007 PMID:40951686	研究论文	本研究首次在酿酒酵母中实现了Asperosaponin VI的从头生物合成	首次在酿酒酵母中通过模块化合成生物学策略完整重建ASA VI生物合成途径	产量仍处于痕量水平（395 ng/L），下游糖基化步骤和UDP-Ara供应可能是主要限速因素	建立微生物底盘用于ASA VI及相关阿拉伯糖基化皂苷的可持续合成	Asperosaponin VI（ASA VI）生物活性化合物	合成生物学	NA	模块化合成生物学策略、LC-MS分析、异源表达	NA	代谢物分析数据	NA
157	2025-09-18	Microreactors derived from water-in-water pickering emulsions for Bacillus amyloliquefaciens proliferation and synthesis of 4-methyl-5-thiazoleethanol 2025-Dec, Bioresource technology IF:9.7Q1 DOI:10.1016/j.biortech.2025.133231 PMID:40882929	研究论文	开发了一种基于水包水Pickering乳液的微反应器，用于提高4-甲基-5-噻唑乙醇的生物合成产量并减少挥发性损失	结合合成生物学与胶体组装技术，构建新型微反应器平台，并通过酶工程改造关键突变体	NA	提高4-甲基-5-噻唑乙醇的生物合成效率并解决挥发性损失问题	解淀粉芽孢杆菌及其工程化突变体	合成生物学	NA	酶工程、水包水Pickering乳液、甲基纤维素/羟丙基甲基纤维素双水相分离	NA	实验数据	NA
158	2025-09-18	Integrated study on the genome, transcriptome, and metabolome of Gelsemium elegans and mining of related enzyme genes involved in koumine biosynthesis 2025-Oct, Plant physiology and biochemistry : PPB IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110069 PMID:40450816	研究论文	本研究对钩吻进行了基因组、转录组和代谢组的整合分析，挖掘了参与钩吻碱生物合成的相关酶基因	首次对钩吻进行全基因组测序和组装，结合多组学数据鉴定了20个钩吻碱生物合成候选基因，并初步验证了两个基因的功能	研究仅初步验证了两个候选基因的功能，尚未完全解析钩吻碱的生物合成通路	解析钩吻中钩吻碱的生物合成途径，为通过育种或合成生物学提高产量提供分子基础	钩吻植物（Gelsemium elegans）的不同组织和激素处理样本	合成生物学	NA	PacBio测序、液相色谱-质谱联用技术	NA	基因组序列、转录组数据、代谢组数据	331.82 Mb基因组数据，10.9 Gb亚读长转录组数据，29种生物碱鉴定
159	2025-09-18	Accurate prediction of thermoresponsive phase behavior of disordered proteins 2025-Oct, Protein science : a publication of the Protein Society IF:4.5Q1 DOI:10.1002/pro.70284 PMID:40944421	研究论文	开发了一种名为Mpipi-T的残基分辨率模型，用于预测蛋白质的热响应性LCST型相变行为	整合原子尺度溶剂化自由能数据与实验浊点测量，参数化短程非键相互作用以捕捉加热驱动的熵驱动相分离，并解析缩放长程静电相互作用作为温度函数	NA	定量预测蛋白质的LCST型相行为并探索其在热应激响应中的潜在机制	无序蛋白质，特别是hTau40、Pab1和ELF3三种关键蛋白质	计算生物学	阿尔茨海默病	原子尺度溶剂化自由能计算，实验浊点测量	Mpipi-T（残基分辨率模型）	蛋白质序列数据，热力学数据	三种关键蛋白质（hTau40、Pab1、ELF3）的分析
160	2025-09-18	Synthetic C1 metabolism in Pseudomonas putida enables strict formatotrophy and methylotrophy via the reductive glycine pathway 2025-Sep-10, mBio IF:5.1Q1 DOI:10.1128/mbio.01976-25 PMID:40824035	研究论文	通过合成生物学和适应性实验室进化改造恶臭假单胞菌，使其能够通过还原甘氨酸途径严格利用甲酸盐和甲醇作为唯一碳源和能源	首次在任何假单胞菌物种中实现严格的合成甲酸营养和甲醇营养，扩展了C1底物利用的细菌宿主范围	研究局限于实验室环境，尚未在工业规模验证其稳定性和效率	开发能够高效利用甲酸盐和甲醇作为唯一碳源的细菌宿主，用于生物技术应用	恶臭假单胞菌（Pseudomonas putida）	合成生物学	NA	适应性实验室进化（ALE）、代谢工程、基因编辑	NA	微生物生长数据、基因序列数据	工程化菌株（包括rG·F和rG·M突变株）