合成生物学相关文章

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当前共找到 4825 篇文献,本页显示第 141 - 160 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
141 2026-04-15
Leveraging a synthetic biology approach to enhance BCG-mediated expansion of Vγ9Vδ2 T cells
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究利用合成生物学方法改造BCG疫苗,使其过量产生HMBPP以增强Vγ9Vδ2 T细胞的扩增,从而提升抗结核免疫效果 首次通过改造BCG的MEP途径过量产生HMBPP,利用宿主对细菌异戊二烯途径中间产物的自我-非我识别机制激活Vγ9Vδ2 T细胞 研究目前仅进行体外实验,尚未在动物模型或人体中验证效果 开发更有效的抗结核疫苗 BCG疫苗菌株和人类Vγ9Vδ2 T细胞 合成生物学 结核病 合成生物学工程、同线性分析、体外刺激实验 NA 基因组数据、体外细胞实验数据 超过63种分枝杆菌物种的356个基因组 合成生物学方法 BCG(牛分枝杆菌减毒株) 合成MEP途径基因座,过表达HMBPP合成酶GcpE以积累HMBPP 医学
142 2026-04-15
Systems biology can provide guidance to synthetic biology in the pursuit of new drug targets
2026, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
观点文章 本文通过案例研究展示了系统生物学分析在指导药物靶点发现中的力量,强调动态建模作为合成生物学中药物干预设计的探索工具 利用系统生物学分析简化生理电路,揭示直觉可能误导药物靶点选择,并展示动态建模如何克服这一挑战,为合成生物学提供指导 案例研究基于简化的线性代谢通路模型,可能未完全反映真实生物系统的复杂性 探索系统生物学如何指导合成生物学在寻找新药物靶点方面的应用 涉及NQO1酶和β-拉帕醌的癌症相关氧化还原电路,作为生理反馈机制的案例 系统生物学与合成生物学 癌症 动态建模 NA NA NA NA NA 涉及NQO1酶的正反馈回路,模拟生理和病理中观察到的电路类型 医学
143 2026-04-15
Programmable saponin biosynthesis from gene networks to predictive biomanufacturing
2026, Frontiers in plant science IF:4.1Q1
综述 本文综述了皂苷生物合成从基因网络到预测性生物制造的最新进展,包括合成生物学工具和AI辅助设计在优化生产平台中的应用 将皂苷研究从描述性途径阐明转向预测性和可编程的生物制造,通过合成生物学和AI技术实现精确控制与优化 NA 探讨皂苷生物合成的可编程和预测性生物制造策略 皂苷生物合成途径、基因网络和工业生物制造平台 合成生物学 NA CRISPR-based transcriptional modulation, synthetic promoters, transcription factor rewiring, structure-guided enzyme engineering, AI-assisted protein design NA 基因组、多组学数据、代谢基因簇分析 NA CRISPR-Cas9 engineered microbes, plant suspension cells, hairy roots, adventitious root systems biosynthetic networks, metabolic pathways medicine, industrial biotechnology
144 2026-04-15
Leveraging a synthetic biology approach to enhance BCG-mediated expansion of Vγ9Vδ2 T cells
2025-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用合成生物学方法改造BCG疫苗,使其产生更多HMBPP以增强Vγ9Vδ2 T细胞的扩增,旨在提高抗结核疫苗的免疫原性 首次尝试通过改造BCG中的MEP途径来提升疫苗效力,并利用HMBPP感知机制触发宿主自我-非我识别,这是一种新的策略 虽然过表达GcpE能有效诱导Vγ9Vδ2 T细胞扩增,但开发更有效的疫苗仍需大量后续工作,且合成MEP基因座未能增强T细胞扩增,表明多基因异位表达可能导致反馈抑制 测试提高BCG的免疫原性能否在保持其安全性的同时改善疫苗效果 BCG疫苗菌株、Vγ9Vδ2 T细胞、HMBPP磷酸抗原 合成生物学 结核病 合成生物学工程、同线性分析、重组菌株构建、刺激试验 NA 基因组数据、实验数据 超过63种分枝杆菌物种的356个基因组 合成生物学方法 BCG(牛分枝杆菌) 设计合成MEP基因座以特异性过量生产HMBPP,并测试过表达限速基因GcpE 医学
145 2026-04-14
Evolutionary insights and guidelines to achieve effective and high-yield non-ribosomal peptide and polyketide engineering
2026-Apr-11, Current opinion in microbiology IF:5.9Q1
综述 本文综述了基于进化原理的非核糖体肽和聚酮工程的有效策略,以提升新型抗生素的生物合成产量 从单纯依赖结构数据转向结合进化原则和数据集指导工程策略,优化重组边界选择并平衡高通量与准确性 重组组装线普遍存在产量降低问题,且尚无单一工程策略能显著最小化产量损失 实现高效高产的非核糖体肽和聚酮工程,以生产新型抗生素和其他生物活性分子 非核糖体肽合成酶(NRPS)和聚酮合酶(PKS)组装线 合成生物学 NA 进化分析、重组工程、高通量方法 NA 结构数据、进化数据集 NA NA NA NA 医药
146 2026-04-14
Incoherent feedforward loop dominates the robustness and tunability of necroptosis biphasic, emergent, and coexistent dynamics
2026-Mar, Fundamental research IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过建模分析,揭示了坏死性凋亡信号通路中RIP1-RIP3-Caspase-8非相干前馈环作为核心拓扑结构,主导双相、涌现和共存动力学的鲁棒性与可调性 首次引入潜在景观和香农熵量化坏死性凋亡共存动力学的不确定性,并系统筛选出实现BEC动力学的最小电路拓扑,确认非相干前馈环的核心作用 研究基于电路建模和理论分析,实验验证可能有限,且主要关注三节点电路,可能未涵盖更复杂网络 探究坏死性凋亡信号通路中双相、涌现和共存动力学的电路结构基础与调控机制 坏死性凋亡信号通路中的RIP1、RIP3和Caspase-8蛋白及其相互作用网络 合成生物学 细胞死亡相关疾病 电路建模、网络拓扑分析、随机电路分析、潜在景观和香农熵计算 NA 理论模型数据 NA NA NA 非相干前馈环嵌入RIP3对RIP1的正反馈,以及RIP3自磷酸化的钟形调节 医学
147 2026-04-14
Advancements in the Application of Ribosomally Synthesized and Post-Translationally Modified Peptides (RiPPs)
2024-04-15, Biomolecules IF:4.8Q1
综述 本文综述了核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPPs)在新型治疗应用方面的最新进展 系统总结了利用合成生物学和生物信息学新方法(如异源表达、遗传重构和利用修饰酶的底物耐受性)生产与工程化RiPPs,以及采用mRNA展示、表面展示和双杂交系统等前沿筛选技术加速具有药物潜力的RiPPs的发现 NA 探讨RiPPs作为新型治疗药物的潜力及其相关生产与工程化技术 核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPPs) NA NA 异源表达、遗传重构、mRNA展示、表面展示、双杂交系统 NA NA NA 合成生物学、基因工程 NA NA 医药
148 2026-04-14
The AP2/ERF Transcription Factor PgERF120 Regulates Ginsenoside Biosynthesis in Ginseng
2024-03-13, Biomolecules IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过鉴定并功能验证AP2/ERF转录因子PgERF120在人参皂苷生物合成中的调控作用 首次在人参中报道AP2/ERF转录因子家族对人参皂苷合成的调控作用,并发现PgERF120基因对乙烯处理最为敏感 研究仍处于初步验证阶段,具体调控机制和下游靶基因尚未完全阐明 探究AP2/ERF转录因子在人参皂苷生物合成中的调控功能 人参毛状根及其中PgERF120基因 合成生物学 NA 荧光定量PCR、基因克隆、农杆菌介导转化 NA 基因表达数据、代谢物含量数据 转基因人参毛状根系 农杆菌介导转化 人参 人参皂苷生物合成途径调控 医药
149 2026-04-13
A synthetic angiotensin II/ACE2-based hormone shunt controlling experimental hypertension
2026-Apr-11, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文设计了一种基于合成生物学的抗高血压基因回路ARCH,用于监测和控制血管紧张素II依赖的高血压 创新点在于开发了一种完全人源化的、可逆且闭环的基因回路,通过合成启动子协调表达工程化可溶性ACE2,以降解血管紧张素II并恢复正常血压 研究仅在雄性高血压小鼠模型中进行,未涉及雌性动物或长期安全性评估 研究目的是开发一种自主调节慢性高血压的合成生物学方法,以精确控制RAS驱动的高血压 研究对象是血管紧张素II依赖的高血压,使用转基因人细胞植入小鼠模型 合成生物学 心血管疾病 合成生物学工程方法,包括基因回路设计和细胞微囊化 NA NA 涉及雄性高血压小鼠模型,具体样本数量未在摘要中说明 合成生物学工程方法,包括基因回路设计和细胞工程 转基因人细胞 设计了一种名为ARCH的基因回路,包括ATR受体监测Ang-II水平,并通过合成启动子协调表达工程化可溶性ACE2,以降解Ang-II并恢复血压 医学
150 2026-04-13
INVITED REVIEW: Turning Dairy Food Waste into Valuable Products via Yeast Bioproduction
2026-Apr-09, Journal of dairy science IF:3.7Q2
综述 本综述探讨了如何通过酵母生物生产将乳制品食物废物转化为高价值产品 强调了利用酵母发酵,特别是乳糖发酵酵母和酿酒酵母,将乳制品废物转化为增值产品的策略,并讨论了新兴的菌株工程和合成生物学方法 面临工业优选酵母无法天然代谢乳糖、废物成分多变、微生物污染以及经济、物流和监管障碍等挑战 旨在减少乳制品食物废物,回收营养物质,降低温室气体排放,并支持乳制品行业的循环经济 乳制品食物废物,特别是奶酪乳清及其衍生物 NA NA 酵母发酵,菌株工程,适应性进化,合成生物学 NA NA NA 合成生物学 酵母,包括乳糖发酵酵母物种和酿酒酵母 NA 农业,环境,工业生物技术
151 2026-04-13
Beyond the Sequence: Chemical and Topological Design and Innovations in mRNA Therapeutics
2026-Apr-08, Chemical reviews IF:51.4Q1
综述 本文综述了mRNA治疗中化学和拓扑工程的最新进展,包括修饰方法、合成策略、结构-活性关系及对下一代治疗的影响 引入了拓扑工程作为mRNA设计的新维度,如环状RNA、分支结构和合成套索架构,以调控稳定性、免疫原性和翻译效率 NA 探索mRNA的化学和拓扑工程,以优化其治疗应用 mRNA分子,包括其化学修饰和拓扑结构 合成生物学 传染病、肿瘤、遗传病 化学合成、合成生物学、RNA结构设计 NA NA NA NA NA NA 医学
152 2026-04-13
Bacterial conjugation and its deployment for diverse biotechnology applications
2026-Apr-07, Biotechnology advances IF:12.1Q1
综述 本文综述了细菌接合在合成生物学中的应用,包括其作为工具递送遗传电路和代谢途径,以及在不同生物技术领域如微生物底盘识别、联合体监测、生物修复和选择性杀灭中的扩展应用 通过整合接合与合成生物学策略,扩展了研究空间,提出了实用指南,以促进研究人员利用接合转移 NA 探讨细菌接合在合成生物学中的部署,以促进多样化的生物技术应用 细菌接合系统、遗传电路、代谢途径、微生物群落 合成生物学 NA 细菌接合 NA NA NA CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌, 哺乳动物细胞, 植物 切换开关, 振荡器, 逻辑门, 生物传感器, 代谢途径 医学, 农业, 环境, 能源, 材料, 食品, 工业生物技术
153 2026-04-13
Synthetic biology development of microbial strains for liquid biofuel production
2026-Apr-06, Biotechnology advances IF:12.1Q1
综述 本文综述了利用合成生物学方法开发用于生产液体生物燃料的微生物菌株的最新进展 从底盘菌株选择、合成生物学工具开发及菌株代谢调控工具三个角度系统总结了合成生物学在生物燃料生产中的应用进展,并展示了重要生物燃料菌株开发的实例 NA 为生物燃料生产菌株的开发提供有价值的参考,促进生物燃料技术的进一步发展和应用 用于生产液体生物燃料的微生物菌株 合成生物学 NA 合成生物学技术 NA NA NA CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌 代谢通路优化 能源, 工业生物技术
154 2026-04-13
Ultrasound-Responsive Engineered Bacteria for Targeted Cancer Therapy: Strategies, Mechanisms, and Applications
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
综述 本文综述了超声响应型工程菌在靶向癌症治疗中的策略、机制与应用进展 聚焦于将外源性响应调控因子(如超声)与微生物疗法相结合,为肿瘤治疗提供更智能、精准和有前景的策略 NA 总结工程菌在肿瘤治疗中的核心修饰方法、作用机制、主要应用策略,并重点阐述超声与工程菌结合的形式及相互作用机制 工程菌及其与超声结合的系统 合成生物学 癌症 生物与物理化学方法的功能修饰与工程化 NA NA NA NA 多种来源的细菌 超声响应型智能药物递送系统 医学
155 2026-04-13
Data storage and retrieval with unnatural proteins expressed via E. coli
2026-Feb-28, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过将数字数据编码为氨基酸序列并整合到胶原样蛋白模板中,利用大肠杆菌表达非天然蛋白质进行数据存储,并通过胰蛋白酶消化和LC-MS/MS分析实现数据检索 开发了一种基于非天然蛋白质的数据存储和检索框架,利用胶原样蛋白模板和选择性氨基酸与精氨酸间隔实现高稳定性数据存储,并支持随机访问和加密数据保护 未提及具体的数据存储容量限制或表达效率的量化分析 建立基于蛋白质的数据存储和检索系统 非天然蛋白质和数据存储技术 合成生物学 NA LC-MS/MS分析、胰蛋白酶消化 NA 数字数据编码的氨基酸序列 NA 大肠杆菌表达系统 大肠杆菌 胶原样蛋白模板用于数据编码 数据存储、合成生物学、蛋白质工程
156 2026-04-13
Using the Droplet Transfer Method to Reliably Prepare Giant Unilamellar Vesicles
2025-09-19, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文介绍了一种可靠制备巨型单层囊泡(GUVs)的液滴转移方法,并提供了详细的实验协议和关键参数分析 提出了针对GUV制备中关键参数的系统性指南,包括成本有效的氧气和湿度控制措施,以及一次性去除油相的简便方法 方法可能因不同磷脂和油的选择而需要调整,且对初学者可能存在学习曲线 优化GUVs的制备方法,以促进其在合成生物学和微机器人等领域的应用 巨型单层囊泡(GUVs)的制备过程 合成生物学 NA 液滴转移方法(倒置乳液法) NA 实验协议 NA NA NA NA 合成生物学, 微机器人
157 2026-04-13
Bacterial Metallostasis: Metal Sensing, Metalloproteome Remodeling, and Metal Trafficking
2024-Dec-25, Chemical reviews IF:51.4Q1
综述 本文综述了细菌金属稳态的机制,包括金属感应、金属蛋白质组重塑和金属运输过程 提供了金属感应蛋白和金属感应核糖开关多样性的综合视角,并探讨了其在合成生物学和生物技术应用中的选择性利用 作者指出在金属稳态理解方面仍存在知识空白,需要更多研究来填补 探讨细菌如何维持金属稳态以确保金属蛋白质组的功能完整性和适应性 细菌的金属感应机制、金属蛋白质组和金属运输系统 NA NA NA NA NA NA NA 细菌 NA 合成生物学, 生物技术
158 2026-04-13
A Genetic Engineering Toolbox for the Lignocellulolytic Anaerobic Gut Fungus Neocallimastix frontalis
2023-04-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
研究论文 本文开发了一种用于厌氧肠道真菌Neocallimastix frontalis的遗传工程工具箱,实现了其瞬时转化 首次发现厌氧真菌具有天然DNA摄取能力,并基于此开发了包含多种选择标记、报告蛋白、启动子、终止子和核定位标签的遗传工具箱 目前仅实现了瞬时转化,稳定转化体系尚未建立;遗传工具数量仍有限 开发厌氧真菌的遗传操作工具以促进其在生物技术中的应用 厌氧肠道真菌Neocallimastix frontalis 合成生物学 NA 遗传转化、基因组学分析 NA 基因组数据、实验验证数据 NA CRISPR-Cas9(潜在应用,文中未明确使用),遗传转化体系 Neocallimastix frontalis(厌氧真菌) NA 能源、环境、工业生物技术
159 2026-04-13
Advances in the Computational Design of Small-Molecule-Controlled Protein-Based Circuits for Synthetic Biology
2022-May, Proceedings of the IEEE. Institute of Electrical and Electronics Engineers
综述 本文回顾了合成生物学中基于计算蛋白质设计的小分子控制蛋白质电路的最新进展,特别关注Rosetta软件套件的应用 利用计算蛋白质设计技术,特别是Rosetta软件,开发模块化和可调谐的传感器,以克服天然传感器库有限和与工程电路接口困难的限制 NA 设计可编程输入-输出行为的生物分子电路,以解决医疗和可持续性领域的全球挑战 蛋白质基传感器和小分子输入 合成生物学 NA 计算蛋白质设计 NA NA NA Rosetta NA 传感器模块与功能输出耦合的电路,包括蛋白质级电路或靶基因表达调控 生物医学, 代谢工程
160 2026-04-12
Gallium in liquid state shows nuclease-mimicking activity
2026-Apr-10, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文发现液态镓具有类似核酸酶的活性,能够选择性切割DNA,其机制涉及核苷酸偏向性吸附和羟基自由基辅助的磷酸二酯水解 液态镓首次被证明可作为无配体和辅因子的仿生核酸酶平台,其独特的氧化物层用于底物吸附,金属核心提供电子作为切割活性中心,活性可通过合成参数和外部刺激调控 NA 探索非生物材料模拟酶活性的最小化方法,以扩展仿生酶系统的设计空间 液态镓及其模拟的核酸酶活性 合成生物学 NA NA NA NA NA NA NA NA 医学, 合成生物学, 生物材料
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