合成生物学相关文章
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当前共找到 4711 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-03-25 |
Remodeling of ribosomally synthesized peptide backbones based on posttranslational modifications
2025-08-13, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00018a
PMID:40392103
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综述 | 本文综述了过去十年中通过翻译后修饰重塑核糖体合成肽骨架的酶，强调了其在合成生物学中设计功能性肽制剂的应用潜力 | 突出了通过翻译后修饰重塑肽骨架的酶，这些酶能超越二十种蛋白质氨基酸的限制，产生结构复杂多样的肽类，为合成生物学提供新工具 | NA | 探索核糖体合成和翻译后修饰肽（RiPP）的翻译后修饰酶，以促进功能性肽制剂的理性设计和生产 | 核糖体合成和翻译后修饰肽（RiPP）及其翻译后修饰酶 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 142 | 2026-03-25 |
Biocomputation: Moving Beyond Turing with Living Cellular Computers
2024-Jun, Communications of the ACM
IF:11.1Q1
DOI:10.1145/3635470
PMID:41867488
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综述 | 本文探讨了利用合成生物学与理论计算机科学的协同作用，超越传统图灵计算，开发更强大的活细胞计算机 | 倡导将理论计算机科学与合成生物学结合，探索活细胞系统的完整计算潜力，包括状态计算和问题解决复杂性 | 活细胞计算机的计算极限仍在探索中，尚未完全解决状态计算和基因调控复杂性等非平凡问题 | 推动活细胞计算机的发展，超越传统图灵计算，探索生物系统的计算能力 | 活细胞系统，如经过基因工程改造的细菌 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 逻辑门、生物传感器、代谢途径 | 医学、环境 |
| 143 | 2026-03-25 |
Chromosome-level Alstonia scholaris genome unveils evolutionary insights into biosynthesis of monoterpenoid indole alkaloids
2024-May-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109599
PMID:38646178
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研究论文 | 本研究通过组装高质量的染色体级别基因组，揭示了Alstonia scholaris中单萜吲哚生物碱生物合成的进化机制 | 首次组装了Alstonia scholaris的染色体级别基因组，并识别了与MIA生物合成相关的基因簇，包括strictosidine合成酶和色氨酸脱羧酶的共线性区域 | NA | 探究单萜吲哚生物碱的生物合成途径及其进化起源 | Alstonia scholaris植物及其基因组 | 基因组学 | 癌症 | 纳米孔测序，Hi-C数据 | NA | 基因组数据，多组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 144 | 2026-03-25 |
Light Color-Controlled pH-Adjustment of Aqueous Solutions Using Engineered Proteoliposomes
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202307524
PMID:38342618
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研究论文 | 本文介绍了一种利用工程化蛋白脂质体通过光色控制微升尺度溶液pH值调整的系统 | 创新点在于结合两种反向定向的光驱动质子泵（细菌视紫红质和蓝光吸收蛋白视紫红质Med12），实现了通过光色精确控制pH变化，并采用计算机反馈环路自动调节 | NA | 研究目的是开发一种基于合成生物学的微升尺度pH控制技术，用于研究、医疗和工业应用 | 研究对象是工程化蛋白脂质体系统及其在溶液pH调节中的应用 | 合成生物学 | NA | 光驱动质子泵技术、计算机反馈控制 | NA | NA | NA | 蛋白脂质体工程 | NA | 基于细菌视紫红质和蓝光吸收蛋白视紫红质Med12的反向质子泵合成生物电路，实现光色控制的pH调节 | 医学, 工业生物技术 |
| 145 | 2026-03-25 |
Machine learning predicts new anti-CRISPR proteins
2020-05-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa219
PMID:32286628
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研究论文 | 本研究开发了一种基于机器学习的工具AcRanker，用于从蛋白质序列中直接预测新的抗CRISPR蛋白 | 首次提出基于XGBoost排序的机器学习方法，仅使用蛋白质序列信息即可预测抗CRISPR蛋白，成功发现两个新型抗CRISPR蛋白AcrIIA20和AcrIIA21 | 预测的候选抗CRISPR蛋白仍需实验验证其抑制活性，且模型性能受训练数据集限制 | 开发快速发现新型抗CRISPR蛋白的生物信息学工具 | 细菌前噬菌体区域中的潜在抗CRISPR蛋白 | 机器学习 | NA | 蛋白质序列分析，XGBoost机器学习 | XGBoost | 蛋白质序列数据 | 已知抗CRISPR蛋白训练集，从自靶向细菌基因组预测的前噬菌体区域筛选 | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学，农业，合成生物学 |
| 146 | 2026-03-25 |
A GoldenBraid cloning system for synthetic biology in social amoebae
2020-05-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa185
PMID:32232356
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研究论文 | 本文介绍了GoldenBraid克隆系统在盘基网柄菌合成生物学中的应用，包括一个包含250个DNA部件和组件的库，以及一个概念验证菌株 | 首次将GoldenBraid克隆系统应用于盘基网柄菌，提供了一个模块化的合成生物学框架，并开发了一个包含250个DNA部件的库 | NA | 开发一个用于盘基网柄菌的快速、模块化和稳健的克隆系统，以促进合成生物学研究 | 盘基网柄菌（Dictyostelium amoebae） | 合成生物学 | NA | GoldenBraid克隆系统 | NA | NA | NA | GoldenBraid | 盘基网柄菌（Dictyostelium amoebae） | cAMP趋化性概念验证菌株，包含四个荧光报告基因编码于一个质粒 | 医学 |
| 147 | 2026-03-24 |
Advances in the combined treatment of solid tumors with nanodelivery systems based on engineered bacteria-TME modulation
2026-Jun, Colloids and surfaces. B, Biointerfaces
DOI:10.1016/j.colsurfb.2026.115558
PMID:41707370
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综述 | 本文综述了基于工程化细菌-TME调控与纳米递送系统的联合疗法在实体瘤治疗中的最新研究进展 | 聚焦于工程化细菌与纳米载体系统的联合应用，通过协同反馈机制实现精准递送、可控释放和多模式治疗，为克服传统疗法疗效有限、副作用大和耐药性等问题提供了新思路 | NA | 总结并探讨工程化细菌与纳米递送系统联合治疗实体瘤的研究进展与未来前景 | 实体瘤 | 合成生物学与纳米技术交叉领域 | 实体瘤 | 合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA | 合成生物学工具（文中未具体指定） | 工程化细菌（文中未具体指定菌种） | 具有原位定植、可编程修饰和靶向特性的工程化细菌，用于重塑肿瘤微环境、穿透屏障并激活免疫反应 | 医学 |
| 148 | 2026-03-24 |
A century of vitamin E research: The innovative journey from basic biology to synthetic bio-manufacturing
2026-Mar-22, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70235
PMID:41866783
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综述 | 本文回顾了维生素E研究一个世纪以来的进展，涵盖其化学组成、功能、生物合成途径及调控网络，并探讨了化学合成与生物技术合成策略 | 揭示了种子特异性酯酶VTE7在连接叶绿素降解与生育酚合成的直接植醇回收途径中的新发现，为代谢工程开辟了新可能性 | NA | 总结维生素E研究的百年历程，并展望未来研究方向，包括催化酶的智能进化、跨膜前体运输的阐明及稀有同系物的探索 | 维生素E的化学、生物学特性及其在植物生理和人类健康中的作用 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物平台 | NA | 医药、工业生物技术 |
| 149 | 2026-03-24 |
Magneto-Photonic Gene Circuit for Minimally Invasive Control of Gene Expression in Mammalian Cells
2026-Mar-17, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c13335
PMID:41867604
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研究论文 | 本文开发了一种结合磁和光刺激的基因电路，用于在哺乳动物细胞中实现微创控制基因表达 | 利用生物发光酶在细胞内直接产生光，并结合磁敏感蛋白设计分裂蛋白版本，实现由光和磁双重刺激激活的基因电路 | 未在深层组织或活体动物中验证其有效性，且磁刺激强度（50 mT）可能限制其在某些应用中的穿透性 | 开发一种无需外部光源的基因表达控制系统，以克服光遗传学系统中光传递效率低的限制 | 哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 蛋白工程、分子生物学、光遗传学、磁刺激技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 结合生物发光酶和光敏感转录因子的基因电路，以及由磁刺激驱动的分裂蛋白重构系统 | 医学、基因治疗 |
| 150 | 2026-03-24 |
Engineering class I terpene synthases for skeletal diversity: strategies and applications
2026-01-28, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00066a
PMID:41369946
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综述 | 本文综述了工程化I类萜烯合酶以生成多样化萜烯骨架的策略与应用 | 整合了结构引导设计、进化方法、机制聚焦工程及活性位点外修饰等多种策略，并展望了机器学习与代谢工程等未来方向 | 萜烯合酶催化复杂性及序列-功能相关性弱带来了显著的工程挑战 | 工程化I类萜烯合酶以实现萜烯骨架的多样性，这是合成生物学的关键目标 | I类萜烯合酶 | 合成生物学 | NA | 结构引导设计、进化方法、机制聚焦工程、半理性与随机方法（如丙氨酸扫描、饱和诱变、定向进化）、计算建模、高通量筛选 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | NA | NA | 医药、农业、香料工业 |
| 151 | 2026-03-24 |
Challenges and opportunities beyond antibody-drug conjugates: Toward a new era of programmable therapeutic proteins
2026-01-01, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.153018
PMID:41297517
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综述 | 本文综述了抗体-药物偶联物（ADCs）的当前成就与未解决问题，并强调了基于全基因编码蛋白质构建体的创新方向，特别是双功能嵌合蛋白，为下一代蛋白质治疗药物奠定基础 | 强调双功能嵌合蛋白作为ADCs的替代方案，结合支架靶向域和肽衍生细胞毒性模块，具有高选择性、紧凑结构、低免疫原性和细菌表达兼容性，并利用合成生物学、展示系统和机器学习加速优化 | NA | 探索超越ADCs的可编程治疗蛋白质，以解决其成本高、生产系统依赖、分子异质性、系统毒性和治疗窗口窄等局限性 | 抗体-药物偶联物（ADCs）及其替代方案，特别是双功能嵌合蛋白质构建体 | 个性化医疗 | 肿瘤学 | 合成生物学、展示系统、机器学习 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 152 | 2026-03-24 |
Using Embodied Artificial Intelligence Agents to Automate Biorisk Management Tasks in High-Containment Laboratories
2025-Dec, Applied biosafety : journal of the American Biological Safety Association
IF:0.5Q4
DOI:10.1089/apb.2024.0068
PMID:41868755
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研究论文 | 本文探讨了在高级别生物安全实验室中，利用人工智能代理自动化生物风险管理任务，以提升安全性和效率 | 提出了一种结合机器学习风险预测模型与具身AI代理的集成系统，用于自动化物理防护任务，减少人为错误和暴露风险 | NA | 通过AI技术增强高级别生物安全实验室的生物风险管理框架，实现安全与效率的优化 | 高级别生物安全实验室中的生物风险管理任务 | 机器学习 | NA | 机器学习、预测风险建模、异常检测 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 153 | 2026-03-24 |
Biomimetic nanovaccines with self-adjuvant effects induced broad-spectrum neutralizing antibodies against SARS-CoV-2 infection in rodents
2025-11-25, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00315-25
PMID:41070969
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研究论文 | 本研究利用合成生物学技术开发了一种具有自佐剂效应的仿生纳米疫苗，旨在诱导广谱中和抗体以预防SARS-CoV-2感染 | 采用负载SARS-CoV-2 RBD蛋白的树枝状介孔有机硅纳米颗粒（DMOSN）构建仿生纳米疫苗，该疫苗能显著促进树突状细胞向次级淋巴器官募集，并同时诱导强大的体液免疫和Th1/Th2偏向的细胞免疫应答 | 研究仅在啮齿动物模型中进行，尚未在人体中验证其安全性和有效性 | 开发能够应对当前和未来SARS-CoV-2变体的下一代广谱疫苗平台 | SARS-CoV-2病毒及其变体 | 合成生物学 | COVID-19 | 合成生物学技术、纳米颗粒制备技术 | NA | NA | 啮齿动物模型 | NA | NA | NA | 医学 |
| 154 | 2026-03-24 |
Decoding the Minimal Translation System of the Plasmodium falciparum Apicoplast: Essential tRNA-modifying Enzymes and Their Roles in Organelle Maintenance
2025-Aug-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169156
PMID:40335414
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研究论文 | 本研究通过鉴定恶性疟原虫顶质体中tRNA修饰酶的最小集合，揭示了其在顶质体维持和寄生虫生存中的关键作用 | 首次系统性地鉴定了恶性疟原虫顶质体中tRNA修饰酶的最小必需集合，并发现所有必需酶均集中在tRNA反密码子环的修饰上 | 有两个基因无法被敲除，其中一个可能具有顶质体外的必需功能，另一个可能具有代谢旁路无法替代的关键作用 | 研究恶性疟原虫顶质体最小翻译系统中tRNA修饰酶的作用及其在细胞器维持中的功能 | 恶性疟原虫顶质体中的tRNA修饰酶 | 合成生物学 | 疟疾 | 比较基因组学、蛋白质定位预测、基因敲除技术 | NA | 基因组数据、蛋白质定位数据 | NA | 基因敲除工具 | 恶性疟原虫 | NA | 医学 |
| 155 | 2026-03-23 |
Modular metabolic engineering of Yarrowia lipolytica and semi-rational design of CYP716A520 for enhanced betulinic acid biosynthesis
2026-Jun, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134364
PMID:41802472
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研究论文 | 本研究通过模块化代谢工程改造Yarrowia lipolytica，并结合半理性设计优化CYP716A520酶，以增强桦木酸（betulinic acid）的生物合成 | 首次在Yarrowia lipolytica中通过模块化代谢工程将角鲨烯产量提升813倍，并采用结合计算工具与进化信息的半理性设计策略，成功优化植物来源的P450酶CYP716A520，其L359V变体活性和特异性分别提高4倍和3倍 | 未在摘要中明确提及具体局限性，但可能涉及微生物宿主中植物P450酶的适应性挑战或规模化生产的潜在问题 | 开发可持续且成本效益高的桦木酸微生物生产方法，以替代传统的植物提取 | Yarrowia lipolytica酵母和植物来源的P450酶CYP716A520 | 合成生物学 | NA | 模块化代谢工程、半理性设计、分子动力学模拟 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9（可能涉及，但未在摘要中明确指定，因此输出NA） | Yarrowia lipolytica | 代谢途径工程，包括角鲨烯前体供应路径和P450酶催化系统 | 医药 |
| 156 | 2026-03-23 |
Next-generation strategies for PLA degradation: microbial consortia, metagenomics, enzyme engineering and AI-guided approaches
2026-Mar-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04726-8
PMID:41863619
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综述 | 本文综述了增强聚乳酸（PLA）生物降解的微生物和生物技术策略的最新进展，包括微生物群落筛选、宏基因组学、酶工程和人工智能引导方法 | 强调了将生态筛选与计算酶工程相结合的多学科策略，特别是利用人工智能进行结构预测和机器学习平台设计高性能PLA降解酶 | NA | 加速聚乳酸在工业堆肥、废水处理和生物修复中的降解，推动可持续的PLA废物管理 | 聚乳酸（PLA）及其在各种生态系统中的生物降解过程 | NA | NA | 宏基因组学、环境DNA（eDNA）工具、定向进化、人工智能（AI）结构预测、机器学习 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境, 工业生物技术 |
| 157 | 2026-03-23 |
CRISPR-enhanced microalgae biosynthesis: a promising approach for future functional feed ingredients
2026-Mar-20, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-026-01367-1
PMID:41857689
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综述 | 本文综述了利用CRISPR系统增强微藻生物合成以生产功能性饲料成分的当前应用、构建策略及未来展望 | 重点探讨了基于CRISPR的基因组编辑技术在优化微藻营养特性方面的突破性进展 | NA | 通过合成生物学策略提升微藻细胞工厂的生产力，以满足日益增长的功能性饲料原料市场需求 | 微藻及其合成的高价值生物活性化合物（如优质蛋白质、多不饱和脂肪酸、色素和维生素） | 合成生物学 | NA | CRISPR系统、基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微藻 | 微藻细胞工厂中的关键通路节点优化 | 农业, 食品 |
| 158 | 2026-03-23 |
Repositioning the Leader Peptide in Graspetide Biosynthesis
2026-Mar-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c21135
PMID:41789461
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研究论文 | 本研究通过重新定位前导肽序列在graspetide生物合成中的位置，探索了合成生物学中组合酶法生成非天然产物的策略 | 通过将前导肽序列从N端重新定位到C端，保留了graspetide合成酶ThfB的底物选择性修饰能力，并实现了两种不同家族酶（套索肽和graspetide）对嵌合RiPP产物的共同修饰 | 前导肽重新定位后，酶修饰速率降低了约2倍，可能影响合成效率 | 旨在通过工程化前导肽序列，扩展核糖体合成和翻译后修饰肽（RiPPs）的结构多样性，生成自然界中未见的机械互锁肽产物 | 以fuscimiditide前体肽为研究对象，聚焦其前导肽序列的重新定位及其对graspetide合成酶ThfB功能的影响 | 合成生物学 | NA | 酶法重组、前导肽工程、翻译后修饰分析 | NA | 生化实验数据 | NA | 前导肽工程策略 | NA | 通过重新定位前导肽序列，设计嵌合RiPP生物合成途径，实现套索肽和graspetide家族酶的共同修饰 | 工业生物技术 |
| 159 | 2026-03-23 |
A review on microbial lipids conversion from organic wastes: Adaptive laboratory evolution-driven strategies for enhanced biofuel precursor synthesis
2026-Mar-18, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2026.124312
PMID:41856232
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综述 | 本文综述了利用适应性实验室进化（ALE）技术驱动策略，将有机废物转化为微生物油脂以增强生物燃料前体合成的研究。 | 提出了将ALE技术与合成生物学、精准代谢工程、基因组编辑和机器学习相结合的新型整合策略，以拓展ALE技术在有机废物资源化利用中的应用边界。 | NA | 探讨如何利用ALE技术增强产油微生物对复杂发酵液中抑制成分的耐受性，从而提高从有机废物到微生物油脂的生物转化效率。 | 产油微生物及其在有机废物（发酵液）资源化转化过程中的适应性进化。 | NA | NA | 适应性实验室进化（ALE），合成生物学，精准代谢工程，基因组编辑，机器学习 | NA | NA | NA | NA | 产油微生物 | NA | 能源，环境 |
| 160 | 2026-03-23 |
Microplastic biodegradation and environmental safety: From microbial mechanisms to engineered systems and circular bio-based implementation
2026-Mar-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.120016
PMID:41833249
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综述 | 本文综述了微塑料生物降解的微生物机制、工程系统及环境安全，并探讨了其在循环生物基实施中的可行性 | 对微塑料生物降解过程进行了机制整合分析，明确区分了表面改性、解聚、生物转化和完全矿化，并重点关注了环境安全考虑和循环生物基回收框架的整合 | 可控条件下解聚效率虽已提升，但规模化、法规遵从性及生态系统层面的风险评估仍是核心挑战 | 评估微塑料生物降解策略的环境安全性与循环生物基实施的可行性 | 微塑料（合成聚合物颗粒，尺寸小于5毫米） | 环境生物技术 | NA | 微生物降解、酶工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境 |