合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
141	2025-05-31	Toward Practical Applications of Engineered Living Materials with Advanced Fabrication Techniques 2024-08-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00259 PMID:39002162	综述	本文综述了工程活材料(ELMs)的制备方法、特性及其在医疗、环境保护和制造等领域的应用	将合成生物学与材料科学相结合，创造出具有自修复、自复制和环境适应性的动态响应材料	NA	探讨ELMs的制备技术及其实际应用潜力	工程活材料(ELMs)	材料科学	NA	3D生物打印、电纺丝	NA	NA	NA
142	2025-05-31	Development of a Recombineering System for the Acetogen Eubacterium limosum with Cas9 Counterselection for Markerless Genome Engineering 2024-08-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00253 PMID:39033464	研究论文	开发了一种基于Cas9反选择的Recombineering系统，用于无标记基因组工程改造Eubacterium limosum	利用RecT重组酶开发了高效的寡核苷酸重组系统，结合Cas9反选择实现无疤痕和无标记的基因组点突变	NA	开发一种快速精确的基因组修饰系统，以促进Eubacterium limosum的合成生物学和代谢工程研究	Eubacterium limosum	合成生物学	NA	Recombineering, Cas9 counterselection	NA	基因组数据	NA
143	2025-05-31	Chloroplast Cell-Free Systems from Different Plant Species as a Rapid Prototyping Platform 2024-08-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00117 PMID:39028299	研究论文	本文介绍了一种从多种植物物种中提取高活性叶绿体无细胞基因表达(CFE)系统的通用协议，用于快速原型设计和基因表达调控序列的详细表征	开发了一种跨物种兼容的叶绿体无细胞基因表达系统，支持使用T7 RNA聚合酶和叶绿体内源聚合酶，实现了对调控序列在转录和翻译水平的详细表征	NA	开发快速原型设计工具以促进植物合成生物学发展，应对气候变化对农业的威胁	小麦(单子叶植物)、菠菜和杨树(双子叶植物)的叶绿体	合成生物学	NA	无细胞基因表达(CFE)系统	NA	基因表达数据	23个5'UTR、10个3'UTR和6个叶绿体启动子
144	2025-05-31	Engineering a Novel Probiotic Toolkit in Escherichia coli Nissle 1917 for Sensing and Mitigating Gut Inflammatory Diseases 2024-08-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00036 PMID:39115381	研究论文	本研究开发了一种基于工程化益生菌大肠杆菌Nissle 1917的系统，用于感知和缓解肠道炎症性疾病	开发了一个模块化系统，包含炎症生物标志物传感器、分泌系统和治疗性纳米抗体库，并首次在EcN中表征了所采用的分泌系统	系统对NO的敏感性有所降低	开发一种靶向特异性系统来潜在治疗炎症性肠病(IBD)	工程化益生菌大肠杆菌Nissle 1917 (EcN)	合成生物学	炎症性肠病(IBD)	酶联免疫吸附试验(ELISA)和体外试验	数学框架用于评估工程益生菌系统的关键参数	实验数据	NA
145	2025-05-31	Bioinformatic Prediction and High Throughput In Vivo Screening to Identify Cis-Regulatory Elements for the Development of Algal Synthetic Promoters 2024-07-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00199 PMID:38986010	研究论文	本研究通过生物信息学预测和高通量体内筛选，识别顺式调控元件以开发藻类合成启动子	结合POWRS、STREME和PhyloGibbs算法预测1511个CREs，并通过高通量方法评估4533种合成启动子的转基因表达能力	需要具有测序基因组和转录组数据的藻类物种才能应用该流程	开发先进的遗传工具以促进藻类生物技术的发展	六种不同藻类物种中高表达基因的启动子区域	合成生物学	NA	下一代测序、荧光激活细胞分选	NA	基因组和转录组数据	4533种合成启动子，数百个转基因株系
146	2025-05-31	Directed Evolution of Acoustic Reporter Genes Using High-Throughput Acoustic Screening 2024-07-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00283 PMID:38981096	研究论文	本文描述了通过定向进化技术改进声学报告基因（ARGs）的过程，以提高其在超声成像中的应用效果	首次将定向进化技术应用于声学报告基因的优化，开发了高通量声学筛选方法，显著增强了气体囊泡（GVs）的非线性超声散射信号	研究目前仅限于细菌培养体系中的筛选，尚未在哺乳动物细胞或活体动物中进行验证	开发更高效的声学报告基因，用于生物成像和合成生物学领域	气体囊泡（GVs）蛋白纳米结构及其声学特性	合成生物学	NA	高通量声学筛选、定向进化	NA	超声信号数据	细菌培养物中的突变体文库
147	2025-05-30	Biofabrication of microstructured bacterial ecosystems using chaotic bioprinting: advancingin vitroresearch for microbial engineering 2025-May-29, Biofabrication IF:8.2Q1 DOI:10.1088/1758-5090/add568 PMID:40334674	研究论文	本文介绍了一种利用混沌3D打印技术制造具有多层微结构的水凝胶构造物的方法，以模拟自然微生物生态系统中的部分隔离现象	使用混沌3D打印技术制造微结构化的细菌生态系统，模拟自然微生物群落的空间组织	研究仅使用了简化的肠道微生物群落模型，可能无法完全反映复杂自然生态系统的所有特性	开发一种能够精确控制微生物空间分布的技术，以更好地研究微生物相互作用	混合微生物群落，特别是人类肠道微生物群落的简化模型	微生物工程	NA	混沌3D打印、荧光显微镜、菌落计数、定量PCR	NA	图像、菌落计数数据、PCR数据	简化的细菌群落模型（具体菌株未明确说明数量）
148	2025-05-30	dTAT1: An Unnatural Nucleoside Exhibiting Low Photocytotoxicity for Genetic Code Expansion 2025-May-29, The journal of physical chemistry letters IF:4.8Q1 DOI:10.1021/acs.jpclett.5c00763 PMID:40401918	research paper	该研究探讨了非天然核苷dTAT1在遗传密码扩展中的光物理和细胞毒性行为	发现dTAT1在390 nm激发下占据三重态但细胞毒性极低，且产生的单线态氧量子产率仅为17%，三重态寿命比dTPT3短2.7倍	未明确说明实验所用细胞类型或具体实验条件	评估dTAT1在遗传密码扩展中的安全性和潜在治疗应用	非天然核苷dTAT1	合成生物学	NA	光物理分析、活性氧检测	NA	化学分析数据	NA
149	2025-05-30	Glyceollin biosynthesis in a plant chassis engineered for isoflavone production 2025-May-28, Nature chemical biology IF:12.9Q1 DOI:10.1038/s41589-025-01914-3 PMID:40437134	research paper	该研究通过代谢工程策略在烟草叶片中高效生产异黄酮前体，并鉴定了六种细胞色素P450单加氧酶作为glyceollin合成酶，完成了glyceollins的15步生物合成途径	首次在工程化植物底盘（Nicotiana benthamiana）中实现glyceollins的高产合成，并鉴定出6个关键P450酶完成其15步生物合成途径	研究仅在烟草叶片模型中进行验证，尚未在原始宿主大豆或其他作物中测试该代谢通路的适用性	解析glyceollins生物合成途径并建立植物底盘生产系统	大豆抗菌异黄酮phytoalexins（glyceollins）及其合成酶	合成生物学	植物病害（由Phytophthora sojae引起）	代谢工程、酶筛选鉴定、体外抗菌实验	植物代谢工程模型	生物化学数据	工程化烟草叶片（产量数据：daidzein 7.04 g/kg干重，glyceollins最高5.9 g/kg干重）
150	2025-05-30	Diverse lineages and adaptations of oxygen-adapted hydrogenases 2025-May-27, Trends in biochemical sciences IF:11.6Q1 DOI:10.1016/j.tibs.2025.04.006 PMID:40436686	research paper	本文探讨了微生物中适应氧气的氢化酶的多样谱系和适应性	揭示了[NiFe]-氢化酶通过多种独立进化策略适应有氧环境，包括通过独特的[4Fe3S]簇将结合的氧还原为水以及通过狭窄的气体通道和活性位点重排防止氧结合	NA	研究微生物中适应氧气的氢化酶的多样性和适应性	细菌和古菌中的[NiFe]-氢化酶	微生物学	NA	NA	NA	NA	NA
151	2025-05-30	Multi-Layer Autocatalytic Feedback Enables Integral Control Amidst Resource Competition and Across Scales 2025-04-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00575 PMID:40116396	research paper	该研究提出了一种多层自催化反馈策略，用于解决资源竞争和跨尺度环境下的积分控制问题	利用多层反馈策略实现群体水平的积分反馈和多细胞积分器，控制功能通过不同细胞群体间的协调互动实现	尚未在实际生物系统中全面验证其有效性	开发在资源竞争和复杂环境下实现稳健适应的控制策略	合成生物学中的基因表达调控和多细胞系统	synthetic biology	NA	autocatalytic integral feedback controllers	multilayer feedback controller	NA	NA
152	2025-05-30	Promiscuity of an Alcohol-Dependent Hemiterpene Pathway for the In Vivo Production of a Non-Natural Alkylated Tryptophan Derivative 2025-04-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00865 PMID:40134314	research paper	该研究揭示了酒精依赖性半萜途径的广泛特异性，并展示了其在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物的能力	揭示了ADH模块第一个酶PhoN和下游芳香族异戊二烯基转移酶的广泛特异性，并展示了其在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物的能力	NA	探索和扩展异戊二烯生物合成的化学空间	酒精依赖性半萜途径及其酶	合成生物学	NA	ADH途径	NA	NA	NA
153	2025-05-30	Development of a Transposon-Based Genome Engineering Toolkit for Efficient and Adaptable Genetic Modifications in Wolfiporia cocos 2025-04-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00766 PMID:40173021	research paper	开发了一种基于转座子的基因组工程工具包，用于高效且适应性强的Wolfiporia cocos遗传修饰	该工具包显著提高了转化效率，支持多基因整合，并通过鸡尾酒式组装多个基因到转座子中，避免了复杂的遗传电路组装	研究仅限于Wolfiporia cocos，未在其他真菌菌株中验证其普适性	开发高效且适应性强的真菌基因组工程工具包	Wolfiporia cocos真菌菌株	合成生物学	NA	转座子工程	NA	基因组数据	NA
154	2025-05-30	Fundamental Trade-Offs in the Robustness of Biological Systems with Feedback Regulation 2025-04-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00704 PMID:40198741	研究论文	本文研究了生物系统中反馈调控的稳健性及其基本性能权衡	提出了一个理论框架来量化生物反馈的准确性和稳健性，并使用多目标优化方法研究其性能权衡	仅研究了五种特定的生物反馈电路，可能无法涵盖所有生物反馈系统的复杂性	提高对生物反馈调控的理解，并为合成生物学中的稳健电路设计提供指导	五种生物反馈电路：正自调控、负自调控、双正反馈、正负反馈和双负反馈（切换开关）	系统生物学	NA	多目标优化	NA	NA	NA
155	2025-05-30	Concentration-Dependent CsrA Regulation of the uxuB Transcript Leads to Development of a Post-Transcriptional Bandpass Filter 2025-04-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00668 PMID:40202123	研究论文	该研究利用新发现的转录后调控机制，设计了一种基于CsrA蛋白浓度的生物后转录带通滤波器	利用CsrA蛋白与mRNA 5' UTR + 100 nt CDS序列的异质性相互作用，实现了基于浓度的转录后调控，减少了合成电路组件的数量	需要进一步表征天然调控RNA-蛋白质系统以开发更复杂的RNP基电路	设计合成生物学中的转录后调控电路	mRNA转录本和CsrA蛋白的相互作用	合成生物学	NA	转录后调控技术	NA	NA	NA
156	2025-05-30	Establishing a High-Yield Bacillus subtilis-Based Cell-Free Protein Synthesis System for In Vitro Prototyping and Natural Product Biosynthesis 2025-04-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00021 PMID:40203238	研究论文	本研究开发了一种基于工程化Bacillus subtilis 164T7P菌株的高产无细胞蛋白质合成系统，用于体外原型设计和天然产物生物合成	通过基因组整合T7 RNA聚合酶基因，开发了无需额外添加T7 RNA聚合酶的高产CFPS系统，并实现了半连续反应模式下超过1100 μg/mL的蛋白质产量	NA	开发高产无细胞蛋白质合成系统，用于合成生物学和生物技术应用	Bacillus subtilis 164T7P菌株及其无细胞提取物	合成生物学	NA	无细胞蛋白质合成(CFPS)	NA	NA	NA
157	2025-05-29	Generation of cell-sized liposomes using laser-induced microjets 2025-May-28, Lab on a chip IF:6.1Q2 DOI:10.1039/d5lc00149h PMID:40302460	研究论文	本研究提出了一种利用激光诱导微射流穿透含脂油相来生成细胞大小脂质体的新方法	采用高速激光诱导微射流技术可靠且可重复地生成细胞大小脂质体，实现了按需生产	NA	开发一种新型的细胞大小脂质体生成方法，推动膜科学和合成生物学领域的发展	细胞大小脂质体	合成生物学	NA	激光诱导微射流技术、高速摄像技术、数值分析	NA	视频数据（高速摄像）、数值模拟数据	NA
158	2025-05-29	CRISPR/dCas-mediated counter-silencing: reprogramming dCas proteins into antagonists of xenogeneic silencers 2025-May-28, mBio IF:5.1Q1 DOI:10.1128/mbio.00382-25 PMID:40434115	研究论文	本研究开发了一种新型CRISPR/dCas介导的反沉默（CRISPRcosi）方法，通过使用无核酸酶活性的dCas酶来对抗Lsr2样异源沉默蛋白CgpS或Lsr2	提出CRISPRcosi方法，无需启动子工程即可有效反沉默异源沉默蛋白的靶启动子	在缺乏异源沉默蛋白CgpS的菌株中，反沉默效果因靶位点和链的不同而有所差异	研究如何通过CRISPR/dCas技术对抗异源沉默蛋白的抑制作用	Lsr2样异源沉默蛋白CgpS和Lsr2	合成生物学	NA	CRISPR/dCas	NA	基因组数据	NA
159	2025-05-29	Metabolite-Responsive Control of Transcription by Phase Separation-Based Synthetic Organelles 2025-03-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00633 PMID:39954260	研究论文	本文通过基于液-液相分离的合成细胞器，将代谢信号转化为基因转录调控	利用液-液相分离技术构建合成细胞器，实现代谢信号对基因转录的可逆和剂量依赖性调控	未提及具体应用场景或体内实验验证	开发具有生命感知和适应能力的合成生物材料	基于液-液相分离的合成细胞器	合成生物学	NA	液-液相分离技术	NA	NA	NA
160	2025-05-29	Engineering a New Generation of Gene Editors: Integrating Synthetic Biology and AI Innovations 2025-03-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00686 PMID:39999982	research paper	该文章探讨了如何通过合成生物学和人工智能创新来设计新一代基因编辑器	整合AI和机器学习技术优化基因编辑酶的发现与设计，提高活性、特异性和免疫原性预测	未提及具体实验验证结果或临床转化时间表	开发更安全高效的基因组编辑工具并推动其临床转化	CRISPR-Cas基因编辑系统及其衍生工具	synthetic biology	NA	AI/ML, rational design, mutagenesis screens, directed evolution	machine learning models	biological sequence data	NA