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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1601 | 2024-08-21 |
Blue light-mediated gene expression as a promising strategy to reduce antibiotic resistance in Escherichia coli
2024-May, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202400023
PMID:38719589
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研究论文 | 本文研究了利用蓝光调控基因表达系统来减少大肠杆菌对抗生素的耐药性 | 首次成功应用蓝光调控基因表达系统,有效降低了工程化大肠杆菌对氨苄西林和链霉素的耐药性 | NA | 开发新兴的非传统技术以应对抗生素耐药性的挑战 | 大肠杆菌的抗生素耐药性 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 基因表达数据 | 工程化大肠杆菌细胞 |
1602 | 2024-08-21 |
Re-considering and designing microbiomes for future waste biorefinery
2024-01, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14395
PMID:38206186
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评论 | 本文重新考虑并设计微生物组,以支持未来废物生物精炼厂的可持续发展需求 | 提出了'可持续合成微生物组'的概念,结合自下而上和自上而下的微生物组构建方法,以从低价值废物中提供人类所需产品 | 目前微生物组设计在处理复杂废物方面面临困境 | 探讨如何将科学原理与技术和工程相结合,以实现未来废物生物精炼厂的目标导向设计 | 微生物组的设计及其在废物生物精炼厂中的应用 | 环境工程 | NA | NA | NA | NA | NA |
1603 | 2024-08-21 |
Expanding the genetic programmability of Lactiplantibacillus plantarum
2024-01, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14335
PMID:37638848
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综述 | 本文综述了增强和控制乳酸菌能力的方法,特别是通过工程化遗传模块和电路来提升Lactiplantibacillus plantarum的应用性。 | 提出了针对L. plantarum的遗传工具包的改进策略,包括实时调控基因表达和增强生物安全性的方法。 | 目前用于提升L. plantarum应用性的遗传工具包仍然不足。 | 探讨如何通过遗传工程增强乳酸菌的功能,特别是在食品工业和医疗保健领域的应用。 | 主要研究对象是Lactiplantibacillus plantarum,一种广泛用于合成生物学应用的微生物底盘。 | 合成生物学 | NA | 遗传工程 | NA | 遗传数据 | NA |
1604 | 2024-08-21 |
Bacterial tolerance and detoxification of cyanide, arsenic and heavy metals: Holistic approaches applied to bioremediation of industrial complex wastes
2024-01, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14399
PMID:38206076
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研究论文 | 本文总结了细菌减轻氰化物、砷和重金属影响的策略,并分析了这些有毒化学物质之间的相互作用 | 本文探讨了系统生物学和合成生物学在复杂工业废物和共污染场地生物修复策略开发中的作用,并强调了元基因组学研究的重要性和进展 | 本文主要集中在微生物对每种环境危害的单独响应的表征上,对共污染废物对微生物代谢的影响讨论较少 | 开发针对工业复杂废物生物修复的策略 | 氰化物、砷和重金属的代谢过程及其对微生物的影响 | 环境科学 | NA | 系统生物学、合成生物学 | NA | NA | NA |
1605 | 2024-08-21 |
Insect pest management in the age of synthetic biology
2022-01, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.13685
PMID:34416790
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综述 | 本文综述了合成生物学和生物技术在害虫管理中的新应用 | 探讨了合成生物学和生物技术在害虫控制中的新兴技术,如工程抗性作物和昆虫种群以及生物制造的新进展 | NA | 探讨合成生物学和生物技术在害虫管理中的新选项 | 农业害虫及其管理方法 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1606 | 2024-08-21 |
Mandipropamid as a chemical inducer of proximity for in vivo applications
2022-01, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-021-00922-3
PMID:34934192
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研究论文 | 本文介绍了使用农业化学品mandipropamid(Mandi)作为高效的化学诱导接近剂(CIP)在细胞培养系统和活体生物中的应用 | Mandi能特异性地诱导植物激素受体PYR1的六倍突变体与脱落酸不敏感蛋白(ABI)之间的复合物形成,且与其他基于植物激素的CIP和雷帕霉素基CIP系统正交 | NA | 探索化学诱导蛋白接近在细胞和合成生物学以及治疗应用中的潜力 | 研究Mandi在细胞培养系统和活体生物中的效率和应用 | 细胞生物学 | NA | 化学诱导接近 | NA | 细胞 | 哺乳动物细胞和斑马鱼胚胎 |
1607 | 2024-08-21 |
Microbial Systems Ecology to Understand Cross-Feeding in Microbiomes
2021, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2021.780469
PMID:34987488
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综述 | 本文综述了微生物系统生态学(MSE)如何帮助理解微生物群落中的交叉喂养现象 | 提出了微生物系统生态学框架,结合系统生物学和整合组学数据,用于解析微生物群落中的相互作用 | 主要依赖于代谢网络重建,可能忽略了其他类型的微生物相互作用 | 探讨微生物系统生态学在微生物研究中的应用,特别是如何通过代谢建模来解析微生物共存机制 | 微生物群落中的交叉喂养现象及其对微生物群落组成的影响 | 微生物学 | NA | 代谢建模 | NA | 组学数据 | NA |
1608 | 2024-08-20 |
Screening of broad-host expression promoters for shuttle expression vectors in non-conventional yeasts and bacteria
2024-Aug-16, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02506-x
PMID:39152436
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研究论文 | 本研究选择了五种Yarrowia lipolytica和五种Kluyveromyces marxianus的组成型启动子,构建了启动子-报告载体,并在多种微生物宿主中系统地表征了这些启动子的强度 | 发现五种K. marxianus启动子能在Y. lipolytica中表达基因,五种Y. lipolytica启动子也能在K. marxianus中表达基因,且yl.TEF1和km.TEF1启动子在多种微生物宿主中表现出适应性 | NA | 开发具有广泛宿主适用性的非传统酵母启动子,以增强目标生物产品的合成 | Yarrowia lipolytica和Kluyveromyces marxianus的组成型启动子 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因表达 | 涉及Y. lipolytica、K. marxianus、Pichia pastoris、Escherichia coli和Corynebacterium glutamicum等多种微生物宿主 |
1609 | 2024-08-20 |
Design and construction of light-regulated gene transcription and protein translation systems in yeast P. Pastoris
2024-Aug-06, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.08.008
PMID:39117107
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研究论文 | 本文设计并构建了在酵母P. pastoris中受光调控的基因转录和蛋白质翻译系统 | 开发了新的光调控转录和翻译系统,通过光感应元件和内源性启动子的嵌合设计,以及通过“稀有密码子刹车”设计的光抑制翻译系统 | NA | 解决传统诱导型启动子在发酵安全或表达能力上的缺陷,并优化细胞能量分布 | 酵母P. pastoris中的基因转录和蛋白质翻译 | 合成生物学 | NA | 光感应元件设计,稀有密码子刹车设计 | NA | 基因转录和蛋白质翻译数据 | 多种配置的转录因子/光响应元件对,以及不同的光响应元件位置和拷贝数 |
1610 | 2024-08-20 |
Artificial Self-assembling Nanocompartment for Organizing Metabolic Pathways in Yeast
2021-12-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00045
PMID:34591448
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研究论文 | 本文介绍了一种用于在酵母中组织代谢途径的人工自组装纳米隔室,利用病毒样颗粒(MPyV VLPs)进行内部分隔 | 首次在酵母中展示了能够参与代谢途径的人工生物催化隔室,并确立了MPyV平台作为酵母工程的有前景的合成生物学工具 | NA | 开发一种新的工具用于在酵母中组织代谢途径,以提高特定代谢产物的产量 | 酵母细胞中的代谢途径和特定酶的活性 | 合成生物学 | NA | 病毒样颗粒(MPyV VLPs) | NA | 生物分子 | NA |
1611 | 2024-08-20 |
Modulation of Phototropin Signalosome with Artificial Illumination Holds Great Potential in the Development of Climate-Smart Crops
2021-Oct-18, Current genomics
IF:1.8Q3
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综述 | 本文综述了光敏蛋白信号复合体在人工光照调节下的作用及其在开发气候智能型作物中的应用 | 探讨了人工光照对植物生长、产量和次级代谢物产生的影响,以及在藻类中提高生物修复效率的应用 | NA | 旨在探讨光敏蛋白信号复合体和基于人工光照的 photobiotechnological 方法在开发气候智能型作物中的应用 | 光敏蛋白(PHOT)及其在植物中的功能,以及人工光照对作物和藻类的影响 | NA | NA | 基因靶向和合成生物学方法 | NA | NA | NA |
1612 | 2024-08-19 |
Specifications of standards in systems and synthetic biology: status and developments in 2021
2021-Oct-22, Journal of integrative bioinformatics
IF:1.5Q3
DOI:10.1515/jib-2021-0026
PMID:34674411
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综述 | 本文介绍了2021年系统与合成生物学中COMBINE标准的最新规范 | 提供了四个标准的更新版本:Synthetic Biology Open Language Visual Version 2.3、Synthetic Biology Open Language Visual Version 3.0、Simulation Experiment Description Markup Language Level 1 Version 4和OMEX Metadata specification Version 1.2 | NA | 更新和介绍系统与合成生物学中的标准规范 | 系统与合成生物学中的COMBINE标准 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA |
1613 | 2024-08-19 |
Molecular engineering of nonmetallic biosensors for CEST MRI
2015-May-15, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/cb500923v
PMID:25730583
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研究论文 | 本文探讨了利用分子工程和合成生物学开发非金属生物传感器用于化学交换饱和转移(CEST)磁共振成像(MRI)的新方法 | 引入了一种新的化学交换饱和转移(CEST)对比机制,使得可以合理设计非金属生物传感器用于MRI | NA | 开发新的非金属生物传感器,用于监测复杂的生物过程并通过非侵入性成像技术进行MRI | 非金属生物传感器的设计与优化 | 生物技术 | NA | 化学交换饱和转移(CEST)MRI | NA | 生物分子 | NA |
1614 | 2024-08-17 |
Synthetic microbial communities: A gateway to understanding resistance, resilience, and functionality in spontaneously fermented food microbiomes
2024-Sep, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2024.114780
PMID:39147468
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综述 | 本文综述了自发发酵食品微生物群落的复杂特性,这些特性有助于抵抗性、恢复力和功能性驱动因素 | 合成微生物群落(SMCs)作为机制洞察和微生物群落战略性重编程的门户,为发酵食品微生物群落提供了细致的理解和控制 | 在实现SMCs的稳定性和可重复性方面存在挑战,主要源于非标准化方法 | 探讨合成微生物群落在自发发酵食品微生物群落中的应用及其优化食品加工的潜力 | 自发发酵食品的微生物群落及其在食品加工中的应用 | 微生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 微生物群落数据 | NA |
1615 | 2024-08-17 |
Identification of the cytochrome P450s responsible for the biosynthesis of two types of aporphine alkaloids and their de novo biosynthesis in yeast
2024-Aug, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13724
PMID:38953746
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研究论文 | 本研究识别了两种细胞色素P450酶(CYP80G6和CYP80Q5),它们分别作用于(S)-配置和(R)-配置的底物,揭示了两种类型阿朴啡生物碱的生物合成机制和立体化学特征。此外,还鉴定了两种CYP719C酶(CYP719C3和CYP719C4),它们催化形成甲基二氧桥,这是阿朴啡生物碱中的关键药效团。利用这些关键酶的功能特性,我们在酵母中重建了两种类型阿朴啡生物碱的生物合成途径,实现了如(R)-glaziovine、(S)-glaziovine和magnoflorine等化合物的从头合成。 | 本研究首次识别了特定细胞色素P450酶在阿朴啡生物碱生物合成中的作用,并成功在酵母中重建了这些生物碱的生物合成途径,为通过合成生物学生产这些有价值的化合物奠定了基础。 | NA | 揭示阿朴啡生物碱的生物合成机制和立体化学特征,并在酵母中实现这些生物碱的从头合成。 | 阿朴啡生物碱的生物合成途径和相关酶的功能特性。 | NA | NA | 细胞色素P450酶的功能鉴定 | NA | 酶活性数据 | NA |
1616 | 2024-08-17 |
Editorial: Plant chassis for synthetic biology and its application in biomanufacturing
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1460378
PMID:39148620
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1617 | 2024-08-16 |
Engineered Bacteria as Living Biosensors in Dermal Tattoos
2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309509
PMID:38884139
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研究论文 | 本文展示了将工程化细菌作为活体分析工具集成到皮肤纹身中,用于实时监测生物标志物 | 利用合成生物学技术,将工程化细菌作为活体分析工具,具有更广泛的生物标志物检测范围和先进的处理及感应/响应功能 | NA | 探索将工程化细菌作为活体分析工具集成到皮肤纹身中,用于实时监测生物标志物 | 工程化细菌、皮肤纹身、生物标志物监测 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | RNA温度计 | 荧光读数 | NA |
1618 | 2024-08-16 |
Genome Engineering for Next-Generation Cellular Immunotherapies
2023-12-19, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.2c00340
PMID:35930700
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研究论文 | 本文探讨了通过基因组工程技术改进下一代细胞免疫疗法的策略 | 利用CRISPR-Cas系统和合成生物学方法,开发具有更高效力和精细模块控制的细胞疗法,并提供同种异体疗法开发的工具包 | 目前尚未提及具体限制 | 克服现有细胞免疫疗法中的挑战,如抗原逃逸、肿瘤微环境中的免疫抑制、毒性和靶向非肿瘤效应 | CAR-T、TCR-T、NK细胞疗法及其他免疫细胞类型 | 基因组学 | 癌症 | CRISPR-Cas系统 | NA | 基因数据 | 未具体说明样本数量 |
1619 | 2024-08-16 |
Plant Metabolic Gene Clusters: Evolution, Organization, and Their Applications in Synthetic Biology
2021, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2021.697318
PMID:34490002
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综述 | 本文综述了植物代谢基因簇的进化、组织结构及其在合成生物学中的应用 | 探讨了基因簇通过基因重复和新功能化进化而来的机制,并强调了其在代谢工程和合成生物学策略中的重要性 | NA | 总结基因簇的进化,讨论其在特化代谢物生物合成中的组织和重要性,并强调其在未来代谢工程或合成生物学策略中的应用 | 植物代谢基因簇及其在特化代谢物生物合成中的作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因簇 | 超过20个基因簇 |
1620 | 2024-08-15 |
Expanding the synthetic biology repertoire of a fast-growing cyanobacterium Synechococcus elongatus PCC 11801
2024-Sep, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28740
PMID:38773863
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研究论文 | 研究通过全局转录组分析,鉴定了Synechococcus elongatus PCC 11801中的48个高转录数基因的天然启动子,并利用荧光报告系统对其进行了特性分析。同时,通过基因组数据和蛋白质组分析,识别了534个操纵子,并系统地鉴定了15个表现出下游基因高蛋白表达的基因间区域,用于识别核糖体结合位点(RBSs)。 | 本研究扩展了Synechococcus elongatus PCC 11801的合成生物学工具箱,包括启动子元件和核糖体结合位点,为加速PCC 11801的生物工程提供了多样化的启动子和RBS序列库。 | NA | 扩展Synechococcus elongatus PCC 11801的合成生物学工具箱,以促进其作为潜在细胞工厂的应用。 | Synechococcus elongatus PCC 11801的天然启动子和核糖体结合位点。 | 合成生物学 | NA | 全局转录组分析,荧光报告系统 | NA | 基因组数据,蛋白质组数据 | 48个天然启动子,534个操纵子,15个基因间区域 |