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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1621 | 2024-08-07 |
Engineering the "Missing Link" in Biosynthetic (-)-Menthol Production: Bacterial Isopulegone Isomerase
2018-Mar-02, ACS catalysis
IF:11.3Q1
DOI:10.1021/acscatal.7b04115
PMID:29750129
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研究论文 | 研究通过合成生物学方法,利用细菌Δ5-3-酮甾体异构酶(KSI)作为异戊基异戊二烯异构酶(IPGI),在微生物中生产(-)-薄荷醇 | 首次证明KSI可以作为IPGI,并通过半理性设计策略优化其活性,提高了4.3倍 | NA | 实现微生物中(-)-薄荷醇的生物合成 | 异戊基异戊二烯异构酶(IPGI)的基因鉴定及其在生物合成途径中的应用 | 合成生物学 | NA | 晶体结构生成,分子建模 | NA | 蛋白质结构 | 四种KSI变体 |
1622 | 2024-08-07 |
Living Synthelectronics: A New Era for Bioelectronics Powered by Synthetic Biology
2024-Jun, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202400110
PMID:38494761
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观点 | 本文综述了生物电子学领域中利用合成生物学改造的活细胞和病毒作为核心组件的新型混合电子设备——“活体合成电子学”的最新进展 | 引入合成生物学改造的活细胞和病毒作为生物电子设备的核心组件,增强了与人体组织在信息和物质交换层面的界面潜力 | 提出了活体合成电子学面临的挑战 | 探讨活体合成电子学如何促进生物电子学与人体组织的真正整合 | 活体合成电子学设备的设计和制造策略 | 生物电子学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1623 | 2024-08-07 |
Bioengineering tools for the production of pharmaceuticals: current perspective and future outlook
2019-12, Bioengineered
IF:4.2Q2
DOI:10.1080/21655979.2019.1682108
PMID:31656120
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综述 | 本文综述了生物工程工具在制药生物产品生产中的应用现状及未来展望 | 探讨了系统生物学和合成生物学以及转录组、蛋白质组、代谢组和纳米生物工程工具等先进技术在制药生物产品开发中的潜在影响 | NA | 旨在通过生物工程工具提高制药生产的成本效益 | 植物、动物和微生物生物工程工具及其在制药生产中的应用 | 生物工程 | NA | 转录组、蛋白质组、代谢组和纳米生物工程工具 | NA | NA | NA |
1624 | 2024-08-07 |
Group A, B, C, and G Streptococcus Lancefield antigen biosynthesis is initiated by a conserved α-d-GlcNAc-β-1,4-l-rhamnosyltransferase
2019-10-18, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1074/jbc.RA119.009894
PMID:31506299
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研究论文 | 本研究通过分子生物学和合成生物学方法,结合生物化学、放射性标记技术以及NMR和MS分析,探讨了GacB在GAC生物合成途径中的作用,揭示了其在GAC致病因子生物合成中的关键作用及其在不同链球菌属中的保守性 | 首次鉴定出GacB作为α-d-GlcNAc-β-1,4-l-rhamnosyltransferase,在GAC生物合成途径中起关键作用,并发现其在不同链球菌属中的保守性 | NA | 探讨GacB在GAC生物合成途径中的作用及其在不同链球菌属中的保守性 | GacB在GAC生物合成途径中的作用及其在不同链球菌属中的保守性 | 生物化学 | NA | NMR, MS | NA | 生物分子 | 超过40种病原性链球菌属物种 |
1625 | 2024-08-07 |
Advances in block copolymer-phospholipid hybrid vesicles: from physical-chemical properties to applications
2024-Jul-17, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc01444h
PMID:39027291
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综述 | 本文综述了由脂质和两亲性嵌段共聚物制成的混合囊泡的设计及其物理化学性质,并探讨了其在合成生物学中的应用 | 混合囊泡因其多样的性质,能够构建模拟细胞结构的复杂膜,而受到越来越多的关注 | NA | 旨在提供设计指南,特别是关于组成,以实现这些混合囊泡的预期应用 | 混合囊泡的设计及其物理化学性质 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1626 | 2024-08-07 |
Genetically encoded Boolean logic operators to sense and integrate phenylpropanoid metabolite levels in plants
2024-Jul, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.19823
PMID:38752334
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研究论文 | 本文利用细菌的别构转录因子(aTFs)在植物中精确调控代谢途径,设计了能够执行布尔逻辑运算的合成遗传电路,并展示了这些电路在检测和整合植物中苯丙烷类代谢物水平的能力。 | 首次在植物中实现基于苯丙烷类代谢物的布尔逻辑运算,展示了植物作为合成生物学平台的潜力。 | NA | 开发在植物中精确操控代谢途径的工具,促进生物产品的生产。 | 细菌别构转录因子及其在植物中的应用,以及基于这些因子的合成遗传电路。 | 合成生物学 | NA | 别构转录因子(aTFs) | NA | 代谢物 | 三种aTFs(CouR, FapR, TtgR)在植物中的应用 |
1627 | 2024-08-07 |
Expression of microbial lipase in filamentous fungus Aspergillus niger: a review
2024-Jul, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-024-03998-5
PMID:38841267
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综述 | 本文综述了微生物脂酶在丝状真菌黑曲霉中的表达,并讨论了相关技术和策略。 | 介绍了合成生物学和系统生物学的发展如何为理解细胞工厂的高效运作机制以及创建和优化高效细胞工厂提供了新的技术体系。 | NA | 旨在提高脂酶在黑曲霉中的表达效率。 | 微生物脂酶酶源及其一般性质,以及影响脂酶表达的生物技术和因素。 | 生物技术 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA |
1628 | 2024-08-07 |
Microbial Nanotechnology for Precision Nanobiosynthesis: Innovations, Current Opportunities and Future Perspectives for Industrial Sustainability
2024-Jul-01, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-024-03772-z
PMID:38954017
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综述 | 本文综述了微生物纳米技术在精准纳米生物合成中的应用,重点讨论了微生物合成的纳米颗粒及其在农业和植物科学中的应用 | 本文介绍了利用微生物进行纳米颗粒的绿色生产方法,并探讨了其在多个前沿技术领域的潜力 | NA | 探讨微生物纳米技术在工业可持续发展中的创新、当前机遇和未来展望 | 微生物合成的纳米颗粒及其在农业和植物科学中的应用 | 生物技术 | NA | 微生物纳米技术 | NA | NA | NA |
1629 | 2024-08-07 |
Unlocking the formate utilization of wild-type Yarrowia lipolytica through adaptive laboratory evolution
2024-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202400290
PMID:38900053
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研究论文 | 本研究通过使用碱基编辑工具促进适应性进化,成功提高了Yarrowia lipolytica对甲酸盐的耐受性和利用能力 | 本研究揭示了Yarrowia lipolytica中自然存在的甲酸盐代谢途径,并展示了其通过适应性进化增强甲酸盐利用的潜力 | NA | 探索和优化Yarrowia lipolytica对甲酸盐的利用,以促进全球净负碳经济的发展 | Yarrowia lipolytica的甲酸盐耐受性和利用能力 | 合成生物学 | NA | 碱基编辑 | NA | 转录组数据 | 两个突变株M25-70和M25-14 |
1630 | 2024-08-07 |
Drug Resistance and the Prevention Strategies in Food Borne Bacteria: An Update Review
2019-Aug, Advanced pharmaceutical bulletin
IF:3.1Q2
DOI:10.15171/apb.2019.041
PMID:31592430
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综述 | 本文综述了食品源性细菌的抗药性及其预防策略 | 探讨了多种替代传统抗生素的方法,如使用农业实践、天然抗生素、纳米抗生素、乳酸菌、细菌素、环肽、噬菌体、合成生物学和捕食性细菌 | NA | 探讨和更新食品源性细菌抗药性的预防策略 | 食品源性细菌的抗药性问题 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1631 | 2024-08-07 |
Specifications of Standards in Systems and Synthetic Biology: Status and Developments in 2019
2019-Jul-13, Journal of integrative bioinformatics
IF:1.5Q3
DOI:10.1515/jib-2019-0035
PMID:31301675
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review | 本文概述了COMBINE标准及其最新规范,涵盖了合成生物学和系统生物学中的计算模型表示格式 | 更新了SBGN、SBML、SBOL及其视觉版本的最新规范 | NA | 介绍合成生物学和系统生物学中标准规范的最新进展 | COMBINE标准及其在合成生物学和系统生物学中的应用 | systems biology | NA | NA | NA | NA | NA |
1632 | 2024-08-07 |
PARAGEN 1.0: A Standardized Synthetic Gene Library for Fast Cell-Free Bacteriocin Synthesis
2019, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2019.00213
PMID:31552239
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研究论文 | 本文介绍了PARAGEN 1.0,一个标准化的合成基因库,用于快速的无细胞 bacteriocin 合成 | PARAGEN 1.0是首个物理集合的bacteriocin库,允许对不同应用进行测试和比较 | NA | 开发一个用于快速无细胞bacteriocin合成的标准化合成基因库 | bacteriocin的合成及其抗菌活性 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成技术 | NA | 基因序列 | 164种不同的bacteriocin |
1633 | 2024-08-07 |
Design and Characterization of a Generalist Biosensor for Indole Derivatives
2024-Jul-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00736
PMID:38875315
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研究论文 | 本文设计并表征了一种基于IclR家族抑制因子TtgV的吲哚衍生物生物传感器 | 发现了TtgV的新型生理相关配体,如粪臭素,并展示了其广泛的特异性,为定向进化和蛋白质工程提供了新的目标 | NA | 优化生物传感器的设计并扩展对TtgV的研究 | 基于TtgV的吲哚衍生物生物传感器及其在生物技术中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1634 | 2024-08-07 |
Graded-CRISPRi, a Tool for Tuning the Strengths of CRISPRi-Mediated Knockdowns in Vibrio natriegens Using gRNA Libraries
2024-Jul-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00056
PMID:38916455
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研究论文 | 本文介绍了一种名为graded-CRISPRi的工具,用于在Vibrio natriegens中通过gRNA库调节CRISPRi介导的敲降强度 | 开发了一种新的graded-CRISPRi系统,利用gRNA变体实现不同程度的抑制强度 | NA | 开发一种有效的工具,逐步降低原生基因的表达水平 | Vibrio natriegens中的基因表达调控 | 合成生物学 | NA | CRISPRi | NA | 基因序列 | 涉及四个不同的报告基因 |
1635 | 2024-08-07 |
Engineering cyanobacteria as a new platform for producing taxol precursors directly from carbon dioxide
2024-Jul-16, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02555-9
PMID:39014505
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研究论文 | 本文通过工程化改造蓝细菌Synechocystis sp. PCC 6803,构建了模块化代谢途径,实现了从二氧化碳直接生产紫杉醇前体taxadiene-5α-ol | 首次在蓝细菌中通过光合作用生产taxadiene-5α-ol,展示了工程化蓝细菌作为生物太阳能电池工厂生产有价值萜类化合物的广阔前景 | NA | 开发一种新的平台,利用工程化蓝细菌直接从二氧化碳生产紫杉醇前体 | 蓝细菌Synechocystis sp. PCC 6803及其代谢途径 | 合成生物学 | 多种恶性肿瘤 | 代谢工程 | NA | 转录组数据 | 最佳菌株DIGT-P560生产了高达17.43 mg/L的氧化紫杉烷和4.32 mg/L的T5α-ol |
1636 | 2024-08-07 |
Bioenergetic stress potentiates antimicrobial resistance and persistence
2024-Jul-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.12.603336
PMID:39026737
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法研究生物能量应激对抗生素疗效的直接影响 | 首次探讨了生物能量应激如何通过增强ROS产生、突变断裂修复和转录偶联修复来促进抗微生物耐药性的发展,并提出了一个统一模型解释抗生素诱导的抗微生物耐药性和持久性 | NA | 更好地理解抗微生物耐药性机制 | 生物能量应激对抗生素疗效的影响 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1637 | 2024-08-07 |
Bacteriophage-Based Bioanalysis
2024-Jul, Annual review of analytical chemistry (Palo Alto, Calif.)
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综述 | 本文综述了基于噬菌体的生物传感器的发展及其在噬菌体生物学和工程领域的最新进展 | 介绍了噬菌体生物传感器在合成生物学、机器学习和遗传工程等邻近领域的应用,以及采用自下而上的设计合成定制噬菌体的新方法 | NA | 探讨噬菌体生物传感器的发展及其在生物传感领域的应用潜力 | 噬菌体生物传感器及其在生物传感领域的应用 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA |
1638 | 2024-08-07 |
Engineering Native Biological Complexity from the Inside-out and Outside-in
2024-Jan, Nature chemical engineering
DOI:10.1038/s44286-023-00013-1
PMID:39015819
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研究论文 | 本文探讨了在组织发育和再生中,通过'由外而内'和'由内而外'信号的平衡来控制细胞功能和命运的工程化方法 | 强调了新兴策略,如生物材料设计和合成生物学,以影响这一微妙的平衡并微调细胞反应 | NA | 研究如何通过工程化方法控制细胞功能和命运 | 细胞功能和命运的控制 | 合成生物学 | NA | 生物材料设计,合成生物学 | NA | NA | NA |
1639 | 2024-08-07 |
Systematic identification of transcriptional activator domains from non-transcription factor proteins in plants and yeast
2023-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.12.557247
PMID:37745555
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研究论文 | 本研究利用激活域预测工具PADDLE,对两种模式真核生物的整个蛋白质组进行挖掘,系统识别非转录因子蛋白中的转录激活域 | 首次大规模识别非转录因子蛋白中的转录激活域,并验证其在酵母中的转录激活能力 | NA | 探索非转录因子蛋白中的转录激活域及其在转录调控中的作用 | 植物和酵母中的非转录因子蛋白 | 生物信息学 | NA | PADDLE激活域预测工具 | NA | 蛋白质序列 | 18,000个片段,覆盖>800个非转录因子基因 |
1640 | 2024-08-07 |
Engineered calprotectin-sensing probiotics for IBD surveillance in humans
2023-08-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2221121120
PMID:37523538
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研究论文 | 本文介绍了一种能够检测炎症性肠病(IBD)生物标志物——钙卫蛋白的工程化益生菌 | 利用合成生物学技术,开发了一种能够在IBD患者中特异性检测钙卫蛋白的工程化益生菌 | 目前仅在啮齿动物模型和患者粪便样本中进行了测试,需要进一步的人体临床试验验证 | 开发一种非侵入性的方法来监测IBD患者的疾病活动 | 工程化益生菌在IBD患者中的应用 | 生物技术 | 炎症性肠病 | 合成生物学 | NA | 粪便样本 | 啮齿动物模型和人类患者粪便样本 |