合成生物学相关文章
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当前共找到 3070 篇文献，本页显示第 1621 - 1640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1621 | 2024-08-07 |
Design and Characterization of a Generalist Biosensor for Indole Derivatives
2024-Jul-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00736
PMID:38875315
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研究论文 | 本文设计并表征了一种基于IclR家族抑制因子TtgV的吲哚衍生物生物传感器 | 发现了TtgV的新型生理相关配体，如粪臭素，并展示了其广泛的特异性，为定向进化和蛋白质工程提供了新的目标 | NA | 优化生物传感器的设计并扩展对TtgV的研究 | 基于TtgV的吲哚衍生物生物传感器及其在生物技术中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1622 | 2024-08-07 |
Graded-CRISPRi, a Tool for Tuning the Strengths of CRISPRi-Mediated Knockdowns in Vibrio natriegens Using gRNA Libraries
2024-Jul-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00056
PMID:38916455
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研究论文 | 本文介绍了一种名为graded-CRISPRi的工具，用于在Vibrio natriegens中通过gRNA库调节CRISPRi介导的敲降强度 | 开发了一种新的graded-CRISPRi系统，利用gRNA变体实现不同程度的抑制强度 | NA | 开发一种有效的工具，逐步降低原生基因的表达水平 | Vibrio natriegens中的基因表达调控 | 合成生物学 | NA | CRISPRi | NA | 基因序列 | 涉及四个不同的报告基因 |
| 1623 | 2024-08-07 |
Engineering cyanobacteria as a new platform for producing taxol precursors directly from carbon dioxide
2024-Jul-16, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02555-9
PMID:39014505
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研究论文 | 本文通过工程化改造蓝细菌Synechocystis sp. PCC 6803，构建了模块化代谢途径，实现了从二氧化碳直接生产紫杉醇前体taxadiene-5α-ol | 首次在蓝细菌中通过光合作用生产taxadiene-5α-ol，展示了工程化蓝细菌作为生物太阳能电池工厂生产有价值萜类化合物的广阔前景 | NA | 开发一种新的平台，利用工程化蓝细菌直接从二氧化碳生产紫杉醇前体 | 蓝细菌Synechocystis sp. PCC 6803及其代谢途径 | 合成生物学 | 多种恶性肿瘤 | 代谢工程 | NA | 转录组数据 | 最佳菌株DIGT-P560生产了高达17.43 mg/L的氧化紫杉烷和4.32 mg/L的T5α-ol |
| 1624 | 2024-08-07 |
Bioenergetic stress potentiates antimicrobial resistance and persistence
2024-Jul-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.12.603336
PMID:39026737
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法研究生物能量应激对抗生素疗效的直接影响 | 首次探讨了生物能量应激如何通过增强ROS产生、突变断裂修复和转录偶联修复来促进抗微生物耐药性的发展，并提出了一个统一模型解释抗生素诱导的抗微生物耐药性和持久性 | NA | 更好地理解抗微生物耐药性机制 | 生物能量应激对抗生素疗效的影响 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 1625 | 2024-08-07 |
Bacteriophage-Based Bioanalysis
2024-Jul, Annual review of analytical chemistry (Palo Alto, Calif.)
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综述 | 本文综述了基于噬菌体的生物传感器的发展及其在噬菌体生物学和工程领域的最新进展 | 介绍了噬菌体生物传感器在合成生物学、机器学习和遗传工程等邻近领域的应用，以及采用自下而上的设计合成定制噬菌体的新方法 | NA | 探讨噬菌体生物传感器的发展及其在生物传感领域的应用潜力 | 噬菌体生物传感器及其在生物传感领域的应用 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1626 | 2024-08-07 |
Engineering Native Biological Complexity from the Inside-out and Outside-in
2024-Jan, Nature chemical engineering
DOI:10.1038/s44286-023-00013-1
PMID:39015819
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研究论文 | 本文探讨了在组织发育和再生中，通过'由外而内'和'由内而外'信号的平衡来控制细胞功能和命运的工程化方法 | 强调了新兴策略，如生物材料设计和合成生物学，以影响这一微妙的平衡并微调细胞反应 | NA | 研究如何通过工程化方法控制细胞功能和命运 | 细胞功能和命运的控制 | 合成生物学 | NA | 生物材料设计，合成生物学 | NA | NA | NA |
| 1627 | 2024-08-07 |
Systematic identification of transcriptional activator domains from non-transcription factor proteins in plants and yeast
2023-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.12.557247
PMID:37745555
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研究论文 | 本研究利用激活域预测工具PADDLE，对两种模式真核生物的整个蛋白质组进行挖掘，系统识别非转录因子蛋白中的转录激活域 | 首次大规模识别非转录因子蛋白中的转录激活域，并验证其在酵母中的转录激活能力 | NA | 探索非转录因子蛋白中的转录激活域及其在转录调控中的作用 | 植物和酵母中的非转录因子蛋白 | 生物信息学 | NA | PADDLE激活域预测工具 | NA | 蛋白质序列 | 18,000个片段，覆盖>800个非转录因子基因 |
| 1628 | 2024-08-07 |
Engineered calprotectin-sensing probiotics for IBD surveillance in humans
2023-08-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2221121120
PMID:37523538
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研究论文 | 本文介绍了一种能够检测炎症性肠病（IBD）生物标志物——钙卫蛋白的工程化益生菌 | 利用合成生物学技术，开发了一种能够在IBD患者中特异性检测钙卫蛋白的工程化益生菌 | 目前仅在啮齿动物模型和患者粪便样本中进行了测试，需要进一步的人体临床试验验证 | 开发一种非侵入性的方法来监测IBD患者的疾病活动 | 工程化益生菌在IBD患者中的应用 | 生物技术 | 炎症性肠病 | 合成生物学 | NA | 粪便样本 | 啮齿动物模型和人类患者粪便样本 |
| 1629 | 2024-08-07 |
De novo design of bioactive protein switches
2019-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1432-8
PMID:31341284
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研究论文 | 本文探讨了从头设计可切换蛋白质系统的可能性，通过调节分子间和分子内相互作用来实现 | 本文设计了一种静态的五螺旋'笼'结构，具有单一界面，可以与终端'闩锁'螺旋或肽'钥匙'进行分子内或分子间相互作用，实现了功能性蛋白质开关的设计 | NA | 探索从头设计可切换蛋白质系统的可能性，并开发新的合成生物学和细胞工程方法 | 蛋白质功能的全局调控 | 生物工程 | NA | 蛋白质设计 | NA | 蛋白质结构 | NA |
| 1630 | 2024-08-07 |
Design Principles for Perfect Adaptation in Biological Networks with Nonlinear Dynamics
2024-Jul-03, Bulletin of mathematical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s11538-024-01318-9
PMID:38958824
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研究论文 | 本文提出了一种基于非线性系统理论的框架，用于识别针对任意幅度外部扰动的完美适应的设计原则 | 本文通过非线性系统理论推导出完美适应的数学条件，并将其转化为网络结构的具体必要要求，提出了两种能够提供全局适应性的网络架构 | 本文的方法不假设任何关于底层速率动力学的明确知识，仅有一些最小的假设 | 建立生物网络结构与涌现生物特性之间的映射关系 | 生物网络中的完美适应性 | 系统生物学 | NA | 非线性系统理论 | NA | NA | NA |
| 1631 | 2024-08-07 |
Light-Oxygen-Voltage (LOV)-sensing Domains: Activation Mechanism and Optogenetic Stimulation
2024-03-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2023.168356
PMID:37944792
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研究论文 | 本文探讨了光氧电压（LOV）传感域的激活机制及其在光遗传学刺激中的应用 | LOV域作为多功能的光感受器，能够非侵入性地感知和控制细胞内过程，具有高时空精度，适用于光遗传学领域 | NA | 研究LOV域的激活机制及其在光遗传学中的应用，推动生物系统研究和新型治疗策略的发展 | LOV域及其在光遗传学中的应用 | 生物技术 | NA | 结构生物学、光谱学、计算方法和合成生物学 | NA | NA | NA |
| 1632 | 2024-08-07 |
Fungal-bacterial consortia: A promising strategy for the removal of petroleum hydrocarbons
2024-Jul-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.116543
PMID:38833981
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综述 | 本文综述了利用真菌-细菌共生体系去除石油烃污染的研究进展 | 介绍了真菌和细菌混合微生物群落通过多种协同机制降解复杂烃类污染物的新策略 | 存在微生物竞争等拮抗作用以及抑制剂或毒素的产生，且需要优化环境因素以提高共生体系性能 | 探讨利用真菌-细菌共生体系进行生物修复的方法和挑战 | 石油烃污染物 | NA | NA | 合成生物学和基因编辑工具 | NA | NA | NA |
| 1633 | 2024-08-07 |
Organ-Specific Gene Expression Control Using DNA Origami-Based Nanodevices
2024-Jul-10, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.4c02104
PMID:38920331
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研究论文 | 研究利用DNA折纸技术构建纳米装置，实现特定器官的基因表达控制 | 开发了坚韧的DNA折纸结构，并将其封装在脂质纳米颗粒(LNPs)中，以在恶劣条件下(低pH)实现器官特异性基因递送 | 目前仍面临DNA纳米结构的脆弱性和低靶向能力的挑战 | 探索利用DNA折纸纳米装置进行特定器官基因表达控制的可能性 | DNA折纸纳米装置及其在特定器官中的基因递送效果 | 合成生物学 | NA | DNA折纸技术，脂质纳米颗粒(LNPs)，低温电子显微镜(Cryo-EM) | NA | 基因(mRNA和siRNA) | 小鼠器官 |
| 1634 | 2024-08-07 |
Engineering Microorganisms for Cancer Immunotherapy
2024-Jul, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202304649
PMID:38598792
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综述 | 本文综述了利用工程化微生物进行癌症免疫治疗的方法，包括通过合成生物学和遗传工程技术设计改造细菌和病毒，以靶向癌细胞并调节免疫系统 | 工程化微生物作为一种新兴的癌症免疫治疗策略，具有提供个性化创新治疗方案的巨大潜力 | NA | 探讨基于微生物的癌症免疫治疗方法，同时考虑安全性和伦理问题 | 工程化微生物在癌症免疫治疗中的应用 | NA | 癌症 | 合成生物学和遗传工程技术 | NA | NA | NA |
| 1635 | 2024-08-07 |
Systematic engineering for production of anti-aging sunscreen compound in Pseudomonas putida
2024-Jul, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2024.06.001
PMID:38839037
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研究论文 | 本研究旨在通过系统工程方法提高Pseudomonas putida生产具有抗衰老特性的防晒化合物shinorine的效率 | 本研究结合了代谢通量分析的元分析、基因组规模代谢模型、合成生物学、CRISPRi介导的基因下调和组学分析，以提高shinorine的生产效率 | NA | 建立一个高效的微生物平台，用于生产具有抗衰老特性的UV光吸收化合物shinorine | shinorine的生产效率和其生物合成途径的优化 | 合成生物学 | NA | CRISPRi, 组学分析 | 基因组规模代谢模型 | 代谢通量分布数据, 蛋白质组数据 | NA |
| 1636 | 2024-08-07 |
Fitness Landscapes and Evolution of Catalytic RNA
2024-Jul, Annual review of biophysics
IF:10.4Q1
|
研究论文 | 本文探讨了催化RNA在适应性景观研究中的关系及其在合成生物学中的应用 | 结合体外筛选和高通量测序技术，提供了完整的和局部RNA适应性景观的实证图 | 序列空间的巨大规模限制了纯实验研究的深入 | 理解RNA适应性景观，特别是在原细胞和机器表示RNA方面的进展 | 催化RNA及其在适应性景观中的表现 | 合成生物学 | NA | 高通量测序 | 机器学习 | 序列数据 | NA |
| 1637 | 2024-08-07 |
Synthetic biology for Monascus: From strain breeding to industrial production
2024-Jul, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202400180
PMID:39014924
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研究论文 | 本文综述了合成生物学技术在Monascus菌株改良和工业化生产中的应用及其挑战 | 结合合成生物学和过程强化，探讨了自动化固态发酵制造的前景，以推动Monascus在多个行业的应用 | 目前缺乏先进的Monascus制造技术，限制了其规模化生产 | 探讨如何利用合成生物学技术实现Monascus的工业化生产 | Monascus菌株及其代谢产物 | NA | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 1638 | 2024-08-07 |
Technologies for the discovery of G protein-coupled receptor-targeting biologics
2024-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103138
PMID:38728825
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综述 | 本文综述了针对G蛋白偶联受体（GPCRs）的生物制剂工程技术及其应用前景 | 介绍了利用廉价DNA合成技术生成计算预设计的库，以及合成生物学在提高功能性GPCR检测通量方面的进展 | NA | 探讨和评估用于发现GPCR靶向生物制剂的先进技术 | G蛋白偶联受体（GPCRs）及其相关的生物制剂 | NA | 代谢性疾病、神经性疾病、心血管疾病 | DNA合成、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 1639 | 2024-08-07 |
Engineering Whole-Cell Biosensors for Enhanced Detection of Environmental Antibiotics Using a Synthetic Biology Approach
2024-Jun, Indian journal of microbiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s12088-024-01259-w
PMID:39010990
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法，通过细菌的两种成分调节系统（TCSs）来设计用于增强环境抗生素检测的细胞生物传感器 | 探讨了利用EMeRALD（通过配体诱导二聚激活的工程化模块化受体）基于生物传感器的合成生物学方法，重新利用微生物TCSs中的传感模块 | NA | 探索和利用细菌的两种成分调节系统来监测环境中的抗生素 | 细菌的两种成分调节系统及其在环境抗生素检测中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 1640 | 2024-08-07 |
Engineered cell-to-cell signalling within growing bacterial cellulose pellicles
2019-07, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13340
PMID:30461206
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研究论文 | 本文介绍了一种在细菌纤维素生产菌株中引入工程化细胞间通信的方法，以实现不同细胞在生长材料中检测其接近度并触发差异基因表达 | 首次在细菌纤维素生产菌株中引入工程化细胞间通信，为合成细胞间通信和工程化活体材料中的图案形成奠定了基础 | NA | 开发一种使细菌纤维素生产菌株能够响应不同位置的工具，以生长更复杂的结构化材料 | 细菌纤维素生产菌株Komagataeibacter rhaeticus | 生物技术 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA |