合成生物学相关文章
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当前共找到 3070 篇文献，本页显示第 1641 - 1660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1641 | 2024-08-07 |
Metabolic engineering of Bacillus subtilis for production of para-aminobenzoic acid - unexpected importance of carbon source is an advantage for space application
2019-07, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13403
PMID:30980511
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研究论文 | 本文通过代谢工程改造枯草芽孢杆菌，以生产对氨基苯甲酸（pABA），并探讨了碳源在太空应用中的意外重要性 | 开发了一种融合蛋白酶（pabABC）用于碳通量的调控，并利用适应性进化创建了能代谢木糖的生产菌株 | 产品的毒性，尤其是与pH值密切相关的毒性，成为主要的限制因素 | 研究在偏远地区如火星上通过生物生产获取高强度聚合物的方法 | 对氨基苯甲酸（pABA）的生产及其在太空技术中的应用 | 生物技术 | NA | 代谢工程 | NA | NA | 在摇瓶中达到的最高产量为3.22 g/l，碳产量为12.4% [C-mol/C-mol] 来自一种氨基糖 |
| 1642 | 2024-08-07 |
Stereoselective semi-synthesis of the neuroprotective natural product, serofendic acid
2019-Jun-01, MedChemComm
DOI:10.1039/c9md00145j
PMID:31303993
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研究论文 | 本文探讨了通过合成生物学方法半合成神经保护性天然产物serofendic酸的改进方法 | 通过使用替代还原剂、立体化学导向剂、反应顺序和产物回收，提高了C15和C16立体选择性的关键步骤 | NA | 改进serofendic酸的总合成方法 | serofendic酸的立体选择性合成 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 1643 | 2024-08-07 |
Leveraging synthetic biology for producing bioactive polyketides and non-ribosomal peptides in bacterial heterologous hosts
2019-May-01, MedChemComm
DOI:10.1039/c9md00055k
PMID:31191858
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综述 | 本文综述了利用合成生物学在细菌异源宿主中生产生物活性聚酮和非核糖体肽的研究进展 | 探讨了使用合成生物学在异源宿主中生产未鉴定天然产物的新策略 | 缺乏用于优化基因簇表达和产物滴度的良好表征的遗传工具 | 探讨在异源宿主中表达天然产物基因簇的动机、理想宿主的特性、可用工具及近期进展 | 聚酮和非核糖体肽的生物活性天然产物 | 合成生物学 | NA | 下一代测序技术 | NA | 基因组序列 | NA |
| 1644 | 2024-08-07 |
Systems and Synthetic Biology of Forest Trees: A Bioengineering Paradigm for Woody Biomass Feedstocks
2019, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2019.00775
PMID:31281326
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研究论文 | 本文探讨了利用系统生物学和合成生物学方法，对快速生长的森林种植园进行生物工程改造，以开发新一代木质生物质能源作物 | 本文提出了基于深入理解和合理设计生物部件、设备和集成系统的合成生物学和基因组编辑技术的新型生物工程方法 | 生物学的复杂性和相互作用的组件需要在大数据信息学、机器学习和直观可视化方面进行投资，以充分探索多维模式并识别生物系统的涌现属性 | 开发新一代木质生物质能源作物 | 快速生长的森林种植园及其生物化学生产平台和生物炼制厂 | 合成生物学 | NA | 多组学分析、系统建模、合成生物学、基因组编辑 | 系统遗传学模型 | 多组学数据 | 遗传变异丰富的分离树种群 |
| 1645 | 2024-08-07 |
Building a minimal and generalizable model of transcription factor-based biosensors: Showcasing flavonoids
2018-09, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.26726
PMID:29733444
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研究论文 | 本文开发了一种新型生物传感器，用于检测pinocembrin，基于转录调节因子FdeR与荧光报告蛋白的结合，并通过组合库改变其质粒拷贝数和生物传感器TF的浓度，记录并建模了不同的响应 | 首次明确考虑质粒拷贝数对生物传感器灵敏度的影响，使用基于Hill的正式方法，能够解释未表征系统的响应，无需对TF的属性有广泛了解 | NA | 开发一种新型转录因子基生物传感器，并建立其与被感知分子之间的定量关系模型 | 转录因子FdeR与pinocembrin的相互作用 | 合成生物学 | NA | 转录因子基生物传感器 | Hill-based formalism | 生物传感器响应数据 | 通过组合库改变质粒拷贝数和生物传感器TF的浓度，记录不同的响应 |
| 1646 | 2024-08-07 |
Reconstitution of a minimal machinery capable of assembling periplasmic type IV pili
2017-06-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1618539114
PMID:28588140
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research paper | 研究通过合成生物学方法，在非原生异源宿主中重建了能够组装周质IV型菌毛的最小机制 | 研究展示了八个合成基因足以促进菌毛组装，并发现相应的蛋白质在细胞质膜上形成了一个大分子复合物 | NA | 提高对IV型菌毛组装分子机制的理解 | IV型菌毛及其组装机制 | NA | NA | 合成生物学 | NA | 蛋白质复合物 | NA |
| 1647 | 2024-08-07 |
Toward biomanufacturing of next-generation bacterial nanocellulose (BNC)-based materials with tailored properties: A review on genetic engineering approaches
2024-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108390
PMID:38823654
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综述 | 本文综述了通过遗传工程方法制造具有定制特性的下一代细菌纳米纤维素（BNC）基材料的进展 | 介绍了通过基因过表达、敲除以及合成生物学和CRISPR/Cas技术调控BNC生物合成的创新方法 | BNC的大规模生产受限于其低产率、微生物菌株的不稳定性及成本问题 | 探讨如何通过遗传工程提高BNC的生产效率和定制其材料特性 | 细菌纳米纤维素（BNC）及其基材料 | 生物技术 | NA | 遗传工程、合成生物学、CRISPR/Cas技术 | NA | NA | NA |
| 1648 | 2024-08-07 |
The bioproduction of astaxanthin: A comprehensive review on the microbial synthesis and downstream extraction
2024-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108392
PMID:38825214
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综述 | 本文全面综述了虾青素的微生物合成及其下游提取方法 | 介绍了通过合成生物学构建的多种重组微生物宿主用于虾青素生产，以及近年来报道的高效绿色提取方法 | NA | 旨在全面介绍虾青素生产和提取的进展 | 虾青素的微生物合成及提取方法 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 1649 | 2024-08-07 |
Cordyceps militaris: A novel mushroom platform for metabolic engineering
2024-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108396
PMID:38906495
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综述 | 本文综述了利用冬虫夏草作为细胞工厂生产高价值化学品和营养素的潜力 | 探讨了冬虫夏草作为新型底盘细胞的深入研究和开发的具体和有前景的机会 | 讨论了在计算生物学、现有DNA元件和基因组编辑方法等领域进一步研究冬虫夏草的挑战和障碍 | 探索冬虫夏草作为细胞工厂生产高价值化学品和营养素的潜力 | 冬虫夏草及其生物活性化合物 | NA | NA | 基因组编辑 | NA | NA | NA |
| 1650 | 2024-08-07 |
Advancing microbial production through artificial intelligence-aided biology
2024-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108399
PMID:38925317
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综述 | 本文综述了人工智能辅助微生物生产的主要组成部分和最新进展 | 利用人工智能处理、学习和预测大量生物数据，将传统的DBT循环转变为多维的DBTLP工作流程 | 讨论了将新型人工智能技术整合到生物学中的挑战 | 探讨人工智能在微生物生产中的应用及其对合成生物学的影响 | 微生物细胞工厂和合成生物学中的遗传装置 | 机器学习 | NA | 人工智能 | 大型语言模型 | 生物数据 | NA |
| 1651 | 2024-08-07 |
Machine learning for the advancement of genome-scale metabolic modeling
2024-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108400
PMID:38944218
|
综述 | 本文综述了机器学习（ML）和深度学习（DL）在基因组尺度代谢模型（GEM）构建中的应用及其对生物医学和生物工程领域的潜在影响 | 探讨了多学科工具和策略（如合成生物学、约束基模型、多组学和机器学习）的集成潜力，以超越传统生物学教条探索生化现象 | 多学科方法框架的发展主要独立进行，限制了不同领域生物知识的串联 | 展示如何通过整合实验和计算策略，利用特定条件下的细胞信息推动生物系统知识的扩展，并提升机器学习基础的约束基模型在生物医学和生物工程领域的应用 | 基因组尺度代谢模型（GEM）的构建及其在生物医学和生物工程中的应用 | 系统生物学 | NA | 机器学习（ML），深度学习（DL） | NA | 多组学数据（转录组学、蛋白质组学等） | NA |
| 1652 | 2024-08-07 |
Correction: Zhantlessova et al. Advanced "Green" Prebiotic Composite of Bacterial Cellulose/Pullulan Based on Synthetic Biology-Powered Microbial Coculture Strategy. Polymers 2022, 14, 3224
2024-Jun-26, Polymers
IF:4.7Q1
DOI:10.3390/polym16131802
PMID:39000809
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1653 | 2024-08-07 |
Illuminating protein space with a programmable generative model
2023-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06728-8
PMID:37968394
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研究论文 | 介绍了一种名为Chroma的可编程生成模型，用于生成新的蛋白质结构和序列，并能够根据特定属性和功能进行条件生成 | 引入了尊重聚合物集合构象统计的扩散过程，以及用于分子系统的高效神经架构，支持长距离推理并具有次二次缩放特性 | NA | 加速蛋白质设计的编程，以造福人类健康、材料科学和合成生物学 | 蛋白质及其复合物的设计 | 生物信息学 | NA | 扩散模型 | 生成模型 | 蛋白质结构 | 310种蛋白质 |
| 1654 | 2024-08-07 |
Modulation of Higher-order Behaviour in Model Protocell Communities by Artificial Phagocytosis
2019-05-06, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.201901469
PMID:30861271
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研究论文 | 研究通过人工吞噬作用调节模型原细胞群落的高阶行为 | 探索了合成原细胞混合群体中的集体行为，利用人工吞噬过程调节生物无机原细胞混合群体的功能和高阶行为 | NA | 研究合成原细胞群落中的集体行为及其通过人工吞噬作用的调节机制 | 酶负载的二氧化硅胶体粒子和磁性皮克林乳液（MPE）滴 | 合成生物学 | NA | 人工吞噬作用 | NA | 胶体粒子、乳液滴 | 具体数量未提及 |
| 1655 | 2024-08-07 |
Adaptive Landscapes in the Age of Synthetic Biology
2019-05-01, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msz004
PMID:30657938
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研究论文 | 本文重新定义了适应性景观，将其从描述性现象学转变为基于生物过程的概念，并探讨了其在预测适应过程和适应性效应分布中的应用。 | 本文将适应性景观从比喻转变为科学框架，使其能够用于测试因果假设。 | NA | 重新定义适应性景观，并探讨其在生物进化中的应用。 | 适应性景观及其在生物进化中的机制和应用。 | 生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1656 | 2024-08-07 |
Prediction and large-scale analysis of primary operons in plastids reveals unique genetic features in the evolution of chloroplasts
2019-04-23, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz151
PMID:30828719
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研究论文 | 本文通过结合实验工具和预测模型，创建了一个针对叶绿体的操纵子数据库，并进行了大规模分析，揭示了叶绿体进化中的独特遗传特征 | 本文首次大规模分析了叶绿体中的操纵子，并利用随机森林分类器进行操纵子预测，准确率高达84% | NA | 研究叶绿体操纵子的基本特征，并利用这些特征进行操纵子预测，以促进叶绿体中的代谢工程和合成生物学 | 叶绿体中的操纵子 | 生物信息学 | NA | 逆转录聚合酶链反应（Reverse-Transcription-PCR） | 随机森林分类器 | 基因序列 | 213个基因对，来自四个进化上不同的叶绿体 |
| 1657 | 2024-08-07 |
Rational design of inducible CRISPR guide RNAs for de novo assembly of transcriptional programs
2017-Mar-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/ncomms14633
PMID:28256578
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研究论文 | 本文报道了一种模块化和多功能框架，用于在哺乳动物细胞中快速实现可诱导的CRISPR-TRs | 该策略依赖于在单引导RNA（sgRNA）的5'端设计间隔区阻断发夹（SBH）结构，通过替换SBH环与配体控制的RNA切割单元，实现了对静默sgRNA的条件激活 | NA | 开发一种新的方法，用于在哺乳动物细胞中快速实现可诱导的CRISPR-TRs，以促进对天然基因回路的理解和细胞治疗策略的设计 | CRISPR-TRs在哺乳动物细胞中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | RNA | NA |
| 1658 | 2024-08-07 |
Synthetic biology approaches to fluorinated polyketides
2015-03-17, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/ar500415c
PMID:25719427
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法开发新的氟化学，以扩大生物合成可及的有机氟化物多样性 | 利用合成生物学方法，通过工程化生物合成机制将氟化构建块选择性引入复杂天然产物中，以扩展生物合成有机氟化物的多样性 | 生物系统中氟化学的范围有限，已识别的有机氟天然产物不到20种 | 开发新的氟化学方法，以扩展生物合成有机氟化物的多样性 | 研究酶活性位点和代谢途径如何进化以管理和选择氟化化合物，并设计工程化的有机氟酶、途径和宿主 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | 研究了土壤微生物Streptomyces cattleya，一种已知的有机氟生物合成天然宿主 |
| 1659 | 2024-08-07 |
Expanding the fluorine chemistry of living systems using engineered polyketide synthase pathways
2013-09-06, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.1242345
PMID:24009388
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研究论文 | 本文展示了通过工程化的聚酮合成酶途径，利用氟乙酸作为氟化构建块，将氟引入天然产物骨架的方法 | 首次展示了通过工程化的聚酮合成酶途径，在体外和体内将氟选择性地引入聚酮骨架 | NA | 探索利用合成生物学生产复杂氟化天然产品的可能性 | 氟化天然产物 | NA | NA | 聚酮合成酶系统 | NA | NA | NA |
| 1660 | 2024-08-07 |
Synthetic biology. Fluorine-adding bacteria may transform natural product medicines
2013-Sep-06, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.341.6150.1052-a
PMID:24009367
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |