合成生物学相关文章

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当前共找到 4711 篇文献,本页显示第 1721 - 1740 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
1721 2025-10-05
A roadmap to understanding and anticipating microbial gene transfer in soil communities
2025-Jun-25, Microbiology and molecular biology reviews : MMBR IF:8.0Q1
综述 提出理解土壤微生物群落中基因转移过程的路线图,以评估合成生物学技术应用时的生物安全风险 首次系统阐述土壤微生物基因转移的知识缺口,提出建立土壤标准体系和利用新兴技术测量基因转移宿主范围的新策略 目前无法预测土壤中基因转移频率,土壤复杂异质性增加了评估难度 提高对土壤微生物群落基因转移过程的理解,设计更安全的生物技术 土壤微生物群落和工程微生物 合成生物学 NA 基因转移测量技术 群落尺度环境特异性模型 NA 多种土壤类型 合成DNA 环境微生物 生物防护措施 环境, 农业, 能源
1722 2025-10-05
FoldMark: Safeguarding Protein Structure Generative Models with Distributional and Evolutionary Watermarking
2025-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出一种名为FoldMark的蛋白质结构生成模型水印策略,用于保护AI驱动的蛋白质研究安全 首个利用分布和进化原理的蛋白质生成模型水印策略,平衡水印容量和结构质量 NA 开发蛋白质生成模型的安全保护方法,防止恶意使用 蛋白质结构生成模型 计算生物学 NA 分布和进化水印技术 AlphaFold3, ESMFold, RFDiffusion, RFDiffusionAA 蛋白质结构数据 NA CRISPR-Cas13 NA NA 生物安全, 药物发现, 合成生物学
1723 2025-10-05
Emerging ultrafast technologies in biotechnology
2025-May, 3 Biotech IF:2.6Q3
综述 本综述探讨超快技术在生物技术中的变革性应用,重点关注其实时可视化和精确操控生物分子过程的能力 整合飞秒激光与阿秒光谱技术实现基因编辑精确定位和电子动力学观测,结合人工智能与纳米技术推动诊断和合成生物学发展 存在光损伤风险、与复杂生物系统整合困难及伦理考量等挑战 探索超快技术在生物分子过程研究和医疗应用中的潜力 生物分子过程(蛋白质折叠、酶催化、能量转移)、细胞动力学、基因编辑系统 生物技术 错误折叠疾病 飞秒激光、超快光谱、阿秒光谱、泵浦-探测显微镜、相干反斯托克斯拉曼散射 NA 光谱数据、显微图像 NA CRISPR NA NA 医学、合成生物学
1724 2025-10-05
Prevention of ribozyme catalysis through cDNA synthesis enables accurate RT-qPCR measurements of context-dependent ribozyme activity
2025-Apr-16, RNA (New York, N.Y.)
研究论文 开发了一种通过抑制核酶催化作用来准确测量环境依赖性核酶活性的RT-qPCR方法 在样品制备流程中引入寡核苷酸抑制剂来防止RNA提取和逆转录过程中的核酶切割,从而恢复RT-qPCR测量的准确性 方法主要针对已知体外环境依赖性切割的自切割RNA进行验证,在其他核酶类型中的适用性需进一步验证 开发能够准确测量不同环境中核酶活性的方法 自切割核酶 合成生物学 NA RT-qPCR, RNA提取, 逆转录 NA RNA, DNA NA NA NA 自切割核酶 合成生物学, 生物制造, 核酸治疗
1725 2025-10-05
Examining interactions of animal cells with chloroplasts and their light-induced responses in in vitro cell culture systems
2025-04-12, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过体外实验系统探究动物细胞与叶绿体的相互作用及其光诱导反应 首次系统比较人类癌细胞、小鼠巨噬细胞和天然含叶绿体海蛞蝓细胞与叶绿体的相互作用模式 仅使用特定细胞系进行研究,未涵盖更广泛的动物细胞类型 探究动物细胞与叶绿体相互作用的机制及光诱导反应 人类宫颈癌HeLa细胞、小鼠巨噬样J774.1细胞和Elysia marginata海蛞蝓分离细胞 合成生物学 NA 体外细胞培养、叶绿体共孵育、光照射实验 NA 细胞行为观察、细胞死亡率、活性氧检测 三种不同类型细胞系(HeLa、J774.1、E. marginata分离细胞) NA 人类细胞, 小鼠细胞, 海蛞蝓细胞 NA 医学, 基础研究
1726 2025-10-05
Designing biological network motif-based controllers by reverse engineering Hill function-type models from linear models
2025-Apr, Journal of the Royal Society, Interface
研究论文 提出一种从线性模型反推非线性Hill函数型模型的反向工程方法,用于设计实现完美适应的生物网络基序控制器 将线性系统理论与非线性建模相结合的反向工程方法,解决了非线性模型理论分析困难而线性模型无法捕捉基因表达系统非线性动态的问题 仅通过仿真验证方法有效性,缺乏实验验证 设计能够实现完美适应能力的生物控制器 生物网络基序控制器和基因回路 合成生物学 NA 反向工程方法,Hill函数建模 线性模型,非线性Hill函数模型 仿真数据 三个生物网络基序控制器 NA NA 生物网络基序控制器,完美适应基因回路 合成生物学,系统生物学
1727 2025-10-05
Designing with Printed Responsive Biomaterials: A Review
2025-Apr, 3D printing and additive manufacturing IF:2.3Q3
综述 探讨跨学科增材制造策略在响应性生物材料设计中的应用及其在日常物品和建筑中的整合前景 提出将印刷响应性生物材料整合到日常物品和建筑中以增强环境和人类健康的创新愿景 NA 综述响应性生物材料的增材制造策略及其在环境和人类健康领域的应用潜力 生物基环境交互材料、生物聚合物复合材料、电化学和电阻器件、活性分子、生物传感器、活细胞、孢子或无细胞位点 生物材料科学 NA 增材制造 NA NA NA NA NA NA 环境, 医疗, 建筑, 能源
1728 2025-10-05
Scaling Up Postbiotics Production: A Prospective Review of Processes and Health Benefits
2025-Jul-07, Probiotics and antimicrobial proteins IF:4.4Q2
综述 本文综述了后生元的生产工艺优化工具及其健康益处,重点关注工业化放大面临的挑战 系统总结了后生元工业化生产的关键优化工具和合成生物学技术,指出高细胞密度与产量关联性的研究空白 后生元作用机制尚未完全阐明,工业化生产在稳定性、质量、产量和一致性方面仍存在挑战 探索后生元生产工艺优化和工业化放大策略 后生元(包括消化酶、短链脂肪酸、细胞壁成分等生物活性化合物) 工业生物技术 心血管疾病 Plackett-Burman设计、响应面方法、田口方法、中心复合设计、基因工程、代谢工程 NA NA NA CRISPR-Cas9 益生菌 NA 医药,食品
1729 2025-10-05
Regulation of the tagatose catabolic gene cluster and development of a tagatose-inducible expression system in the probiotic Escherichia coli Nissle 1917
2025-Jul-04, Microbial cell factories IF:4.3Q1
研究论文 在益生菌大肠杆菌Nissle 1917中开发了一种基于D-塔格糖的可诱导基因表达系统 首次在EcN中发现并利用塔格糖代谢基因簇的调控机制,开发了具有剂量依赖性响应和分解代谢物阻遏自诱导功能的新型表达系统 NA 开发可靠的可诱导基因表达系统以扩展益生菌大肠杆菌Nissle 1917的应用潜力 益生菌大肠杆菌Nissle 1917的塔格糖代谢基因簇及其调控机制 合成生物学 NA 差异RNA测序、序列分析 NA 基因序列数据、表达数据 NA iGEM 大肠杆菌Nissle 1917 塔格糖诱导型表达系统、分解代谢物阻遏自诱导策略 医药, 工业生物技术
1730 2025-10-05
Harnessing oleaginous protist Schizochytrium for docosahexaenoic acid: Current technologies in sustainable production and food applications
2025-Mar, Food research international (Ottawa, Ont.)
综述 本文综述了利用产油原生生物裂殖壶菌生产二十二碳六烯酸(DHA)的当前生物技术,涵盖菌株改良、发酵优化、产品提取和安全应用等方面 系统总结了裂殖壶菌DHA生产的多方面技术挑战,并提出整合多种育种技术、人工智能优化发酵、纳米颗粒包装改善稳定性等创新解决方案 NA 探索提高裂殖壶菌DHA生产效率和产品质量的技术方法,推动其在食品和健康领域的应用发展 产油海洋原生生物裂殖壶菌及其生产的二十二碳六烯酸(DHA) 工业生物技术 NA 发酵技术、合成生物学、纳米颗粒包装技术 NA NA NA 合成生物学 裂殖壶菌 DHA合成途径、结构化脂质构建 食品,医药
1731 2025-10-05
Integrating incompatible tandem photobiocatalysis in artificial cells enables metabolic modulation of natural cells
2025-Jul-04, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究开发了具有光生物催化功能的人工细胞,通过空间分离不相容的催化模块实现对肝细胞代谢的调控 设计了包含纳米细胞器的光生物催化人工细胞,通过空间隔离光催化辅因子再生和生物催化酒精代谢这两个不相容模块 NA 开发能够持续供应辅因子并调控天然细胞代谢的人工细胞系统 光生物催化人工细胞和肝细胞 合成生物学 酒精性氧化应激 光催化、生物催化 NA NA NA NA 人工细胞、肝细胞 包含两个空间隔离模块的纳米细胞器:光催化辅因子再生模块和生物催化酒精代谢模块,其中酒精脱氢酶和醛脱氢酶共定位在同一纳米细胞器中 医学, 合成生物学, 生物医学
1732 2025-10-05
Design and construction of light-regulated gene transcription and protein translation systems in yeast P. Pastoris
2025-Jul, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究在毕赤酵母中设计和构建了光调控基因转录和蛋白质翻译系统 开发了新型光调控转录系统(光诱导/抑制启动子)和首创的光抑制翻译系统(稀有密码子刹车设计) NA 解决传统诱导系统在发酵安全性和表达能力方面的缺陷,构建光控基因表达系统 毕赤酵母(Pichia pastoris)中的基因转录和蛋白质翻译调控系统 合成生物学 NA 光遗传学、合成生物学设计 NA NA NA CRISPR-Cas9, Gibson Assembly 毕赤酵母(Pichia pastoris) 光调控转录系统(光诱导启动子4pLRE-cPAOX1、光抑制启动子PGAP-pLRE)、光抑制翻译系统(稀有密码子刹车设计、pLRE-tRNA调控) 工业生物技术
1733 2025-10-05
Engineering biology approaches to modulate bacterial biofilms
2025-Jul, Trends in biotechnology IF:14.3Q1
综述 探讨利用工程生物学方法控制和改造细菌生物膜的最新进展 将合成生物学的最新成果应用于细菌生物膜的功能化调控 NA 开发具有新功能的细菌生物膜调控技术 细菌生物膜 合成生物学 NA 工程生物学方法 NA NA NA NA 细菌 NA 工业生物技术, 环境
1734 2025-10-05
Minimal shuttle vectors for Saccharomyces cerevisiae
2025, Synthetic biology (Oxford, England)
研究论文 开发并验证了六种用于酿酒酵母的最小整合型或着丝粒型穿梭载体 构建了目前已知最小的酵母穿梭载体(2.6-3.5 kb),释放了约30个限制性酶切位点 NA 解决复杂基因工程任务中载体骨架限制性酶切位点不足和连接效率低的问题 酿酒酵母穿梭载体 合成生物学 NA 基因合成 NA NA 六种载体构建 Gibson Assembly Saccharomyces cerevisiae, E. coli 穿梭载体设计包含酵母选择标记、细菌选择标记、复制起点和多克隆位点 工业生物技术
1735 2025-10-05
Optimizing Plant Alkaloid Biosynthesis under Drought Stress: Regulatory Mechanisms and Biotechnological Strategies
2025-Aug, Journal of plant physiology IF:4.0Q1
综述 探讨干旱胁迫下植物生物碱生物合成的调控机制及优化策略 整合干旱胁迫信号通路与生物碱合成调控机制,提出结合人工智能的跨学科生物技术策略 需平衡植物生长与代谢物生产的关系,实验室策略的田间适用性有待验证 优化干旱胁迫条件下植物生物碱的生物合成 植物生物碱及其合成调控机制 合成生物学 NA 遗传工程、合成生物学、人工智能 NA NA NA 遗传工程, 合成生物学 植物 生物碱生物合成通路 农业, 制药业
1736 2025-10-05
Development of Dipeptide-Based Liquid Droplets and Fibrils as Enzyme-Mimics
2025-Jul, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
研究论文 开发基于二肽的液滴和纤维作为酶模拟物 设计出能够自凝聚形成液滴的极简二肽结构,并发现其在不同pH下可形成具有催化功能的纤维形态 NA 开发具有酶催化功能的极简肽类超分子材料 由疏水残基和极性组氨酸残基组成的二肽分子 合成生物学 NA 液-液相分离(LLPS) NA NA NA NA NA NA 酶学, 合成生物学
1737 2025-10-05
Merging the computational design of chimeric type I polyketide synthases with enzymatic pathways for chemical biosynthesis
2025-Jul-01, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 开发了BioPKS自动化逆向生物合成流程,结合I型聚酮合酶和单功能酶进行化学物质生物合成设计 首次将计算设计的嵌合I型聚酮合酶与酶催化途径相结合,创建了自动化逆向生物合成工具BioPKS NA 开发自动化生物合成途径设计工具以扩展生物制造化学品的可及空间 I型聚酮合酶(PKSs)和单功能酶的组合系统 合成生物学 NA 逆向生物合成,计算设计 NA 化学结构数据,酶催化反应数据 155种生物制造候选化合物 BioPKS, RetroTide, DORAnet NA 嵌合I型聚酮合酶与单功能酶的组合生物合成途径 工业生物技术, 医药
1738 2025-10-05
Abstraction hierarchy to define biofoundry workflows and operations for interoperable synthetic biology research and applications
2025-Jul-01, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出一种抽象层次结构来定义生物铸造厂工作流程和操作,以促进可互操作的合成生物学研究与应用 首次提出将生物铸造厂活动组织为项目、服务/能力、工作流程和单元操作四个互操作层次的抽象框架 NA 解决生物铸造厂标准化不足问题,提高合成生物学研究的可扩展性和效率 生物铸造厂工作流程和操作 合成生物学 NA 抽象层次框架 NA NA NA NA NA NA 工业生物技术
1739 2025-10-05
Transient infrared nanoscopy resolves the millisecond photoswitching dynamics of single lipid vesicles in water
2025-Jul-01, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究开发了一种无标记瞬态红外纳米显微镜技术,用于解析单个光开关脂质体在水中的毫秒级动态变化 首次结合散射型扫描近场光学显微镜的化学识别和高时空分辨率,实现了对单个光开关脂质体的无标记中红外成像和光谱分析 方法尚未在更复杂的生物环境中验证,采样时间虽快但仍可能错过某些超快动力学过程 开发非破坏性无标记技术研究纳米载体的生物物理化学性质 偶氮苯基光开关脂质体形成的单个脂质体 纳米光学成像 NA 散射型扫描近场光学显微镜,中红外成像和光谱 NA 红外光谱图像,动态时间序列数据 单个脂质体样品 NA NA NA 医学,药物递送,纳米诊疗,合成生物学
1740 2025-10-05
Comprehensive datasets for RNA design, machine learning, and beyond
2025-Jul-01, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究创建了一个包含超过32万实验验证实例的综合性RNA数据集,为RNA设计和建模算法建立了新的社区基准 提供了首个来自实验验证来源的大规模标准化RNA设计基准数据集,包含许多对现有RNA逆向折叠工具具有挑战性的结构 NA 解决RNA二级结构预测和序列设计中的挑战,推动计算生物学在医学、合成生物学和生物技术领域的应用 RNA分子及其二级结构 计算生物学 NA 机器学习 NA RNA序列和结构数据 超过320,000个实验验证实例 NA NA NA 医学,合成生物学,生物技术
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