本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-06-21 |
Synergistic dual ring-cleavage pathways enable efficient degradation of chlorobenzenes by Pseudomonas putida BS-1 in groundwater
2026-Jun-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.142676
PMID:42320103
|
研究论文 | 发现恶臭假单胞菌BS-1中一种新型协同双环裂解途径,可有效降解地下水中的氯苯类污染物 | 首次揭示一种由质粒携带的tod-clc基因簇介导的邻位和间位裂解途径协同作用机制,能够快速解毒中间代谢产物氯代儿茶酚 | 研究主要基于单一菌株和实验室条件,未评估长期现场应用中的稳定性和生态影响 | 阐明氯苯类化合物生物降解过程中氯代儿茶酚解毒的新机制,并提供用于地下水修复的微生物资源 | 恶臭假单胞菌BS-1菌株及其降解对二氯苯、氯苯和苯的代谢途径 | 环境微生物学 | NA | 基因敲除、异源表达、代谢产物分析 | NA | 实验数据 | 单一菌株BS-1,以及实际受污染地下水样本(含p-DCB 6.83 mg·L⁻¹和o-DCB 13.31 mg·L⁻¹) | NA | 恶臭假单胞菌 | 由tod-clc基因簇编码的邻位和间位双环裂解途径 | 环境修复 |
| 162 | 2026-06-21 |
Recent advances in bioengineering and functional applications of microbial biocomposites: integrating bacterial cellulose, fungal mycelium and synthetic biology
2026-May-19, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05021-w
PMID:42154349
|
综述 | 该综述综合了2020-2026年微生物生物复合材料在制备、修饰及功能应用方面的最新进展,重点涉及细菌纤维素和真菌菌丝体 | 将微生物生物复合材料与合成生物学、3D打印和矿物功能化等新兴方法相结合,突出了跨学科协同创新的潜力 | 讨论了当前工业规模化、功能稳定性和批次间标准化方面的监管和技术挑战 | 为应用微生物学、材料科学和工业生物技术领域的研究人员和专业人士提供关键且全面的视角,强调微生物生物复合材料作为可持续性、功能创新和仿生设计交汇平台的潜力 | 微生物生物复合材料,重点包括细菌纤维素和真菌菌丝体 | 材料科学,应用微生物学 | NA | 3D打印,合成生物学,矿物功能化 | NA | NA | NA | NA | Komagataeibacter spp., Ganoderma spp. | NA | 医药,环境,工业生物技术 |
| 163 | 2026-06-20 |
Bacterial mRNA Vaccines: Programming Immunity Against Antimicrobial Resistance
2026-Aug, Drug development research
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/ddr.70335
PMID:42318873
|
综述 | 这篇综述概述了细菌mRNA疫苗在应对抗菌药物耐药性方面的最新进展,包括抗原设计、mRNA工程和递送平台优化 | 整合了人工智能引导的抗原发现、合成生物学和下一代递送系统以加速临床转化,强调克服现有障碍以建立mRNA疫苗作为对抗耐药感染的可行策略 | 细菌抗原结构的复杂性、实现有效黏膜和细胞递送的挑战、诱导平衡Th1/Th17主导免疫反应的困难以及免疫持久性问题 | 应对抗菌药物耐药性威胁,开发细菌mRNA疫苗 | 结核分枝杆菌、铜绿假单胞菌、肺炎链球菌等关键细菌病原体 | 合成生物学, 疫苗学 | 细菌感染性疾病, 抗菌药物耐药性 | mRNA工程, 脂质纳米颗粒递送, 人工智能引导的抗原发现, 合成生物学 | NA | NA | NA | 脂质纳米颗粒, 人工智能, 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 164 | 2026-06-20 |
Repurposing the Diatom Periplastidial Compartment for Heterologous Terpenoid Production
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00919
PMID:42101919
|
研究论文 | 通过系统分析硅藻中不同细胞区室的萜类合成能力,提出周质体腔(PPC)作为可工程化的细胞内空间用于异源萜类生产 | 首次系统评估硅藻周质体腔(PPC)作为工程化细胞区室的萜类合成潜力,揭示其与MVA和MEP途径的代谢交换界面 | 未提及大规模生产或工业应用验证,需进一步优化工程策略 | 探索硅藻周质体腔(PPC)用于异源萜类生产的可行性与工程化潜力 | 硅藻周质体腔(PPC)、细胞质、叶绿体中的萜类合酶靶向表达 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 代谢物定量数据 | 未明确样本数量 | NA | 硅藻 | 萜类合成代谢途径(包括半萜、单萜、倍半萜和四萜的合酶靶向表达) | 工业生物技术 |
| 165 | 2026-06-20 |
A Linear Mixed Effects Model for Evaluating Synthetic Gene Circuits
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00171
PMID:42112575
|
research paper | 提出了一种用于评估合成基因电路性能的线性混合效应模型 | 首次应用线性混合效应模型来统计评估布尔逻辑门性能,并提供可量化的固定效应点估计β̂作为门行为的统一描述符 | 对多输入多输出逻辑的扩展验证尚需更多实验数据支撑 | 标准化合成基因电路统计评估方法 | 合成基因电路中的布尔逻辑门 | 合成生物学 | NA | 线性混合效应模型, 蒙特卡洛模拟, k-means聚类 | 线性混合效应模型, k-means | 模拟数据与实验数据 | 144个已发表布尔逻辑门 | NA | NA | 布尔逻辑门(OR、AND等) | 合成生物学应用(计算、生物传感、人类健康) |
| 166 | 2026-06-20 |
Temporal Programming of Cell-Free Transcription Using Orthogonal Enzyme-Responsive DNA Blockers
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00147
PMID:42137991
|
研究论文 | 设计正交的酶驱动DNA转录定时器,实现无细胞转录的时间延迟精确编程 | 利用正交酶响应性DNA阻断链,通过选择性酶切实现多个转录模板的独立时间控制,并展示下游Cas12a活性的时序调控 | 未明确提及,但可能涉及阻断链设计与酶特异性的进一步优化 | 建立无细胞合成生物学中时间分辨转录和基因表达的通用框架 | 正交酶响应性DNA阻断链、RNase H、尿嘧啶DNA糖基化酶(UDG)和甲酰胺嘧啶DNA糖基化酶(Fpg)等酶 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录、酶切动力学调控 | NA | 转录时间曲线数据 | NA | DNA阻断链设计、酶驱动定时器 | 无细胞系统 | 基于DNA阻断链的转录定时器、Cas12a酶切活性调控回路 | 合成生物学、生物技术 |
| 167 | 2026-06-20 |
Streptomyces Autoregulator Biosensors from Natural Product Cluster-Situated Regulators
2026-Jun-19, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.6c00061
PMID:42117380
|
研究论文 | 开发了八种基于簇定位调节因子的自诱导物生物传感器,并探索其在合成生物学中的应用 | 首次将多个预测的群体感应自诱导物回路工程化为可诱导表达系统,并验证了生物传感器间的正交性和共培养能力 | 未提及 | 开发基于链霉菌自诱导物的生物传感器,用于天然产物调控机制研究和合成生物学应用 | 链霉菌中的簇定位调节因子及其自诱导物配体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 八种生物传感器,多种配体浓度测试 | NA | 链霉菌属 | 群体感应调控回路、正交信号系统、多输入遗传电路 | 工业生物技术 |
| 168 | 2026-06-20 |
Bottom-Up Creation of Virus-like Particles via Post-Insertion of Protein-Lipid Conjugates
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00172
PMID:42160665
|
研究论文 | 提出一种通过后插入蛋白-脂质偶联物自下而上构建病毒样颗粒的方法 | 创新性地利用SNAP-tag/BG生物正交反应将蛋白质共价偶联到脂质上,实现无需去垢剂的脂质体膜插入,解耦了蛋白质设计与脂质体设计,便于快速系统优化VLP | 未提及具体限制,但可能涉及蛋白质-脂质偶联效率、颗粒稳定性及体内应用时的免疫原性问题 | 开发一种模块化、可优化的病毒样颗粒构建策略,用于疫苗、药物递送和合成生物学应用 | GFP蛋白和SARS-CoV-2 Spike蛋白 | 合成生物学 | 新型冠状病毒病 | SNAP-tag/BG反应、流式细胞术、负染色透射电子显微镜、酶联免疫吸附测定 | NA | 图像(电子显微镜)、荧光信号(流式细胞术) | 研究所用样本包括GFP蛋白和Spike蛋白修饰的脂质体,具体数量未提及 | SNAP-tag/BG反应 | Expi293F细胞 | 蛋白-脂质偶联物构建及后插入脂质体形成病毒样颗粒 | 医学, 合成生物学 |
| 169 | 2026-06-20 |
Systematic Reprogramming of Rhodobacter sphaeroides for Efficient Biosynthesis of Coenzyme Q10 and Porphyrins
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00032
PMID:42186703
|
综述 | 系统综述了通过代谢工程和合成生物学方法改造光合细菌Rhodobacter sphaeroides以高效合成辅酶Q10和卟啉类化合物的研究进展 | 首次全面总结了利用Rhodobacter sphaeroides作为底盘生物生产辅酶Q10和卟啉的工程策略,包括前体供应增强、代谢路径优化、氧化还原和能量平衡调控、全局调控系统操纵及发酵控制 | 未提及具体实验数据或定量比较不同工程策略的效果,主要基于文献综述 | 梳理Rhodobacter sphaeroides的代谢特性、天然调控网络和工程方法,突出其作为合成生物学底盘生产辅酶Q10和卟啉类化合物的潜力 | Rhodobacter sphaeroides紫色非硫光合细菌 | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | Rhodobacter sphaeroides | 萜类和四吡咯生物合成途径的优化 | 工业生物技术, 医药 |
| 170 | 2026-06-20 |
Diterpene Synthases as Gatekeepers of Bioactive Diterpenoids: A Resource for Discovery and Engineering toward Efficient Synthesis
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00190
PMID:42215860
|
综述 | 该文章综述了二萜合酶在生物活性二萜类化合物合成中的关键作用,并建立了一个包含562个功能表征二萜合酶的数据库,为通过合成生物学和代谢工程高效生产二萜类化合物提供了资源 | 首次建立了一个包含562个功能表征二萜合酶的综合性功能数据库,并通过整合生物信息学分析阐明了不同功能类别二萜合酶的催化机制、产物多样性及系统发育分布,为二萜合酶作为合成生物学核心功能元件的开发提供了新方向 | 未提及具体局限性,但可能包括数据库的更新频率、部分二萜合酶功能验证的局限性以及实际工业生产中面临的产量和纯度挑战 | 总结代表性二萜类化合物的生物活性和应用,建立功能二萜合酶数据库,并探讨二萜合酶作为合成生物学核心功能元件的未来发展方向 | 二萜合酶和二萜类化合物 | 机器学习和数字病理学之外的合成生物学与代谢工程领域 | 不适用 | 合成生物学、代谢工程、生物信息学分析 | 不适用 | 序列和功能数据(562个功能表征的二萜合酶) | 562个功能表征的二萜合酶 | 不适用 | 微生物细胞工厂(具体未指定,如大肠杆菌、酿酒酵母等) | 二萜类化合物生物合成途径 | 医药、农业、化妆品、食品 |
| 171 | 2026-06-20 |
Evaluating DNA Function Understanding in Genomic Language Models Using Evolutionarily Implausible Sequences
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00024
PMID:42260904
|
研究论文 | 提出Nullsettes评估框架,测试基因组语言模型对合成表达盒中功能丧失突变的预测能力 | 通过进化上不可信的序列设计,区分模型对序列功能的理解与对天然基因组模式的记忆 | 未能检测到强功能丧失突变,预测准确性严重依赖进化模式匹配而非基因表达机制理解 | 评估基因组语言模型对DNA序列功能的理解程度 | 合成表达盒中的功能丧失突变序列 | 机器学习 | NA | 基因组语言模型 | Transformer | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 172 | 2026-06-20 |
Engineering Protein Stability with Small Molecules: A Review of the ecDHFR Destabilizing Domain System
2026-Jun-19, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.6c00466
PMID:42262317
|
综述 | 综述了大肠杆菌二氢叶酸还原酶去稳定域系统通过配体诱导稳定化实现条件性蛋白控制的机制与应用 | 从翻译后调控层面系统总结了ecDHFR-DD系统的机制、性能及跨物种优化,并提出了在害虫及媒介控制等应用生物学中的新方向 | 未提及具体实验验证或定量比较与其他系统的性能差异 | 综合评估ecDHFR-DD系统在条件性蛋白调控中的优势与局限,并展望其跨学科应用潜力 | ecDHFR去稳定域系统及其在酵母、无脊椎动物模型和哺乳动物细胞中的应用 | 合成生物学 | NA | ecDHFR-DD系统 | NA | NA | NA | Trimethoprim, 大肠杆菌二氢叶酸还原酶去稳定域 | 酵母、无脊椎动物、哺乳动物细胞 | 配体诱导稳定化的去稳定域电路 | 功能基因组学、合成生物学、生物医学研究、害虫及媒介管理 |
| 173 | 2026-06-20 |
Engineered Probiotics Protect against Pseudomonas aeruginosa Post Antibiotic Exposure
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00063
PMID:42267686
|
研究论文 | 开发基于工程化大肠杆菌Nissle 1917的模块化可编程益生菌策略,整合代谢物补充与抗原特异性黏膜免疫,在抗生素暴露后预防铜绿假单胞菌感染 | 首次将代谢物补充(丁酸)与抗原特异性黏膜免疫模块整合于同一益生菌平台,实现独立模块的灵活组合与协同保护 | 仅在抗生素暴露后的小鼠模型中验证,尚未评估在无菌动物或人类中的效果 | 开发一种抗生素暴露后恢复微生物稳态并激发黏膜免疫的益生菌策略,用于预防铜绿假单胞菌感染 | 抗生素暴露后的小鼠模型 | 合成生物学 | 铜绿假单胞菌感染 | NA | NA | NA | 小鼠模型(具体数量未说明) | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌Nissle 1917 (EcN) | 丁酸过量生产模块、外膜囊泡展示PcrV或OprL抗原模块 | 医学 |
| 174 | 2026-06-20 |
Special Issue on Mammalian Cell Synthetic Biology
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00447
PMID:42317055
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 175 | 2026-06-20 |
Breaking the photosynthetic monopoly on carbohydrate production through artificial synthesis
2026-Jun-16, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108952
PMID:42303061
|
综述 | 批判性审视超越光合作用限制的人工碳水化合物合成策略 | 提出超越光合作用3.5亿年进化垄断的人工合成策略,并首次整合电化学还原、酶级联反应与杂合生物人工系统,强调AI驱动催化剂设计与模块化合成生物学的融合 | 辅因子再生效率低、催化剂选择性权衡以及经济竞争力不足是当前实现实际部署的主要障碍 | 为建立经济可行的人工碳水化合物生产系统提供路径规划,推动分布式制造和循环碳经济 | 人工碳水化合物合成途径的设计与整合 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学平台 | NA | 人工碳水化合物合成途径(包括直接电化学CO2还原、合成酶级联反应和杂合生物人工系统) | 环境, 能源, 工业生物技术 |
| 176 | 2026-06-20 |
Targeting the phenolic A-ring unifies the toxicology and remediation of environmental estrogens in aquatic environments
2026-Jun-15, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2026.125044
PMID:42297271
|
综述 | 综述环境雌激素的结构特征、毒性机制及去除策略,提出以酚A环为靶点的统一处理思路 | 提出以酚A环结构特征统一环境雌激素的毒理学机制与去除策略,并讨论了合成生物学在靶向生物降解中的潜力 | 未提供具体的实验验证数据,且对复杂污染物混合物(如微塑料的“特洛伊木马”效应)的量化分析不足 | 总结环境雌激素的毒性机制,并探索基于结构特征的去除策略 | 环境雌激素及其在环境中的行为 | 环境科学 | NA | NA | NA | 综述数据 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境, 农业, 水产 |
| 177 | 2026-06-20 |
ROS-responsive bio-hybrid probiotics for synergistic acute lung injury therapy
2026-Jun-11, Colloids and surfaces. B, Biointerfaces
DOI:10.1016/j.colsurfb.2026.115903
PMID:42314510
|
研究论文 | 报道一种双功能工程化副干酪乳杆菌,通过合成生物学和响应性材料修饰,实现急性肺损伤的协同治疗 | 首次将细胞因子免疫调节与微环境响应性抗氧化功能结合于单一益生菌平台,并通过合成生物学与材料工程的协同设计提升治疗效果 | 尚缺乏长期安全性评估及在人源模型中的验证 | 开发一种针对急性肺损伤的工程益生菌治疗策略,实现靶向递送、免疫调节和氧化应激缓解 | 急性肺损伤小鼠模型及人肺相关细胞 | 合成生物学 | 急性肺损伤 | 合成生物学、材料表面修饰、代谢组学 | NA | 代谢组学数据 | LPS和铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤小鼠模型(具体数量未说明) | NA | 副干酪乳杆菌 | 分泌白细胞介素-4的基因回路,及ROS响应性表面修饰 | 医学 |
| 178 | 2026-06-20 |
T-cell engagers in cancer immunotherapy: mechanisms, challenges, and future perspectives
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1755512
PMID:42317371
|
综述 | 本文综述了T细胞衔接器在癌症免疫治疗中的机制、挑战和未来前景 | 系统比较了T细胞衔接器与CAR-T细胞疗法的疗效、安全性、毒性和成本,并探讨了提高特异性和降低毒性的新策略,如肿瘤选择性激活和CD3亲和力调节 | 实体瘤中仍面临抗原异质性和免疫抑制肿瘤微环境的挑战 | 总结T细胞衔接器平台的发展现状,分析其临床成功案例与挑战,并展望未来方向 | T细胞衔接器平台,包括双特异性(BiTE)和三特异性(TriTE)T细胞衔接器、双重亲和力重定向(DART)及其他新兴格式 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤,实体瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | 人类 | T细胞衔接器(包括双特异性和三特异性结构) | 医学 |
| 179 | 2026-06-20 |
Metabolic engineering strategies for optimized lignan production in plants
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1827862
PMID:42318117
|
综述 | 本文综述了植物中优化木脂素生产的代谢工程策略,提出了“推-拉-释放”框架,并探讨了合成生物学原理在植物系统中的应用 | 提出了“推-拉-释放”整合框架,系统组织转录调控、代谢流优化和CRISPR基因组编辑等多层策略,并讨论了空间时间调控和系统表型评估的需求 | 木脂素产量最大化需平衡植物结构完整性和抗病性之间的权衡,缺乏对实际应用效果的全面验证 | 总结现有木脂素代谢工程方法,提出未来整合策略以实现可持续生产的同时保持植物适应性 | 植物中木脂素(如芝麻素、鬼臼毒素、SDG)的生产优化 | 代谢工程 | NA | CRISPR基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物(如亚麻) | 推-拉-释放框架:推策略(增加前体供应)、拉策略(重定向代谢流)、释放策略(缓解途径抑制),以及模块化途径重建、多组分基因组编辑和时空调控 | 医药 |
| 180 | 2026-06-20 |
A Survey of Recent Practice of Artificial Life in Visual Art
2024-02-01, Artificial life
IF:1.6Q2
DOI:10.1162/artl_a_00433
PMID:38393968
|
综述 | 对过去40年视觉艺术中人工生命实践的文献综述,提出分类标准与分类体系 | 首次系统梳理视觉艺术领域中人工生命作品,建立分类标准与术语体系 | 仅关注计算与软件领域,未涵盖硬件艺术实现形式 | 系统性概述艺术家如何理解自然并用现代技术创造新生命 | 视觉艺术中的人工生命作品 | 计算机视觉 | NA | NA | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | 艺术 |