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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-01-08 |
Exploring the computing power of microbes that shapes the environment
2026-Jan-05, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102700
PMID:41494508
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综述 | 本文综述了微生物如何通过遗传和代谢机制处理信息并影响环境,并探讨了合成生物学在构建遗传电路以模拟和增强微生物计算能力方面的进展 | 首次系统性地比较了自然微生物的计算能力与合成生物学中人工设计的遗传电路,并提出了弥合两者复杂性差距的新思路 | 主要聚焦于细菌,未全面涵盖其他微生物类群(如古菌、真菌)的计算特性 | 探讨微生物的计算能力及其对环境的影响,并研究如何通过合成生物学工具提升人工遗传电路的计算性能 | 自然微生物的计算机制与合成生物学中设计的遗传电路 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, BioBrick, iGEM | 细菌 | 布尔逻辑门、组合输入处理电路、时序逻辑、基于记忆的系统、模拟电路、细胞群体分布式计算 | 环境 |
| 162 | 2026-01-08 |
Microbiome-driven resistance in cervical cancer therapy: from mechanistic dissection to clinical translation
2025-Dec-29, Expert reviews in molecular medicine
IF:4.5Q2
DOI:10.1017/erm.2025.10029
PMID:41457383
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综述 | 本文综述了微生物组在宫颈癌治疗耐药性中的作用机制及临床转化前景 | 提出微生物组是宫颈癌治疗疗效的关键调节因子,并系统阐述了其通过乳酸代谢重编程、免疫检查点稳定和药物代谢改变驱动耐药性的机制,同时探讨了基于微生物组的干预策略和合成生物学驱动的精准疗法 | NA | 探讨微生物组在宫颈癌治疗耐药性中的作用,并评估基于微生物组的干预策略的临床转化潜力 | 宫颈癌患者及其相关的阴道微生物组 | NA | 宫颈癌 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 工程菌 | NA | 医学 |
| 163 | 2026-01-07 |
Gene silencing regulated by aggregates of Corn aptamer at 3' UTR of mRNA
2026-Jan-05, Nanoscale horizons
IF:8.0Q1
DOI:10.1039/d5nh00510h
PMID:41148632
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研究论文 | 本研究开发了一种通过在mRNA的3'非翻译区引入核酸自组装模块来实现基因沉默的策略,该模块通过形成RNA聚集体在真核细胞中展现出显著的基因沉默效果 | 创新点在于将核酸自组装模块整合到mRNA的3' UTR中,通过形成高阶RNA结构来调控翻译效率,并可与经典5' UTR元素结合构建多维转录后调控网络 | NA | 研究目的是开发一种简单有效的基因沉默策略,并探索其在合成生物学中的应用潜力 | 研究对象是mRNA的3'非翻译区及其调控机制,以及真核细胞中的基因表达 | 合成生物学 | NA | 基因沉默技术,包括CRISPR-Cas9和核酸自组装模块 | NA | mRNA和蛋白质表达水平的定量数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 真核细胞 | 通过3' UTR中的核酸自组装模块形成RNA聚集体,构建多维转录后调控网络,包括与TOP序列等5' UTR元素的整合 | 医学,合成生物学 |
| 164 | 2026-01-07 |
Programmable cell-cell adhesion in synthetic yeast communities for improved bioproduction
2026-Jan-05, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-025-02081-1
PMID:41491832
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研究论文 | 本研究开发了一个用于模块化细胞间粘附和共培养的酵母合成工具箱,旨在克服现有方法缺乏遗传特异性和控制的局限性 | 创建了具有七个主要絮凝和凝集基因缺失的模型酵母菌株007Δ,建立了三种不同的粘附配对系统,并成功展示了利用合成共培养结合细胞粘附系统增强高价值食品抗氧化剂白藜芦醇的生物生产 | NA | 开发用于合成酵母群落的可编程细胞间粘附系统,以改进生物生产 | 酵母细胞 | 合成生物学 | NA | 酵母表面展示系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酵母 | 细胞间粘附系统,包括酵母絮凝和凝集蛋白质以及酵母表面展示系统 | 工业生物技术 |
| 165 | 2026-01-07 |
Natural products as modulators of ferroptosis: Therapeutic implications and molecular mechanisms in disease treatment
2026-Jan-03, The Journal of nutritional biochemistry
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jnutbio.2026.110259
PMID:41490559
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综述 | 本文综述了天然产物作为铁死亡调节剂在疾病治疗中的治疗意义和分子机制 | 系统性地基于结构类别和作用机制对天然产物(如萜类、黄酮类、生物碱等)进行分类,并强调纳米递送系统和合成生物学作为克服其应用限制的前景策略 | 天然产物的应用受到来源有限、成分复杂和不稳定的药代动力学特征的限制 | 探讨天然产物作为铁死亡调节剂在疾病治疗中的潜力 | 天然产物(萜类、黄酮类、生物碱、皂苷、多酚等) | NA | 癌症、神经退行性疾病、糖尿病、心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 166 | 2026-01-07 |
Probiotic-Based Materials as Living Therapeutics
2026-Jan, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202508500
PMID:40999775
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综述 | 本文综述了基于基因工程益生菌与基质结合的益生菌活性材料(PLMs)作为活体治疗平台在生物医学应用中的潜力、进展与挑战 | 提出了“益生菌活性材料(PLMs)”这一新概念,以区别于传统的活体生物治疗产品(LBPs),并系统阐述了其在多种疾病治疗中的靶向和动态治疗潜力 | PLMs在临床转化中面临多重挑战,包括缺乏稳健的益生菌基因工程工具包、生物安全性担忧(如水平基因转移)、临床前结果向人体转化的困难以及缺乏明确的临床使用监管指南 | 探讨工程化活体材料(ELMs)在生物医学领域的应用,特别是益生菌活性材料(PLMs)作为靶向治疗平台的设计、应用与监管挑战 | 基于基因工程益生菌与基质结合的益生菌活性材料(PLMs) | 合成生物学 | 感染、骨修复、伤口愈合、阴道失衡、肠道相关疾病、癌症 | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 益生菌 | 生物传感器、治疗性代谢通路 | 医学 |
| 167 | 2026-01-07 |
Expanding frontiers: harnessing plant biology for space exploration and planetary sustainability
2026-Jan, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70662
PMID:41295882
|
观点文章 | 本文提出了一个集体愿景,概述了利用植物科学支持人类太空探索新前沿的优先事项 | 引入了一种新的作物生物再生生命支持系统准备水平框架,扩展了现有的作物准备水平,以帮助建立有弹性和可持续的作物生产 | NA | 利用植物生物学支持太空探索和地球的可持续性 | 植物 | NA | NA | 预测建模、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 太空探索、农业、环境 |
| 168 | 2026-01-07 |
Harnessing microalgae for bioproducts: innovations in synthetic biology
2025-Dec-08, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04727-7
PMID:41359128
|
综述 | 本文综述了合成生物学在微藻工程中的应用,以促进可持续生物燃料和高价值生物产品的生产 | 整合CRISPR/Cas基因组编辑、模块化克隆系统、合成启动子库和动态环境响应调控电路等最新合成生物学工具,提升微藻代谢途径的精确重编程能力 | 菌株鲁棒性和生物过程转化方面仍存在挑战 | 推动微藻作为可持续生物制造平台的发展,以支持低碳生物经济 | 微藻 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑、模块化克隆系统、合成启动子库、动态调控电路 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 模块化克隆系统 | 微藻 | 动态环境响应调控电路,用于控制脂质和色素生物合成 | 能源, 工业生物技术 |
| 169 | 2026-01-07 |
Exploiting Salmonella typhimurium as a novel cancer therapeutic agent: from tumor colonization to metabolic engineering
2025-Nov-27, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04716-w
PMID:41307628
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综述 | 本文综述了利用鼠伤寒沙门氏菌作为新型癌症治疗剂的机制、代谢工程进展及临床转化挑战 | 首次系统整合鼠伤寒沙门氏菌的多重抗癌机制(凋亡诱导、自噬诱导、免疫调节等),并从代谢工程与合成生物学角度提出增强治疗特异性的统一视角 | 细菌介导的癌症疗法仅能作为现有癌症治疗的补充手段,无法完全替代传统疗法,且存在生物安全性与临床转化挑战 | 探讨利用细菌天然靶向肿瘤特性开发新型癌症治疗策略 | 鼠伤寒沙门氏菌及其代谢工程改造菌株 | NA | 癌症 | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 鼠伤寒沙门氏菌 | NA | 医学 |
| 170 | 2026-01-07 |
Ensemble techniques for predictive modeling of leishmanial activity via molecular fingerprints
2025-Oct-14, BMC medical informatics and decision making
IF:3.3Q2
DOI:10.1186/s12911-025-03041-4
PMID:41088199
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研究论文 | 本研究提出了一种结合机器学习和化学信息学的新方法,利用分子指纹预测化合物对利什曼原虫前鞭毛体的活性,以加速抗利什曼病药物的发现 | 首次将Avalon、MACCS Key和Pharmacophore三种分子指纹算法与随机森林、多层感知器、梯度提升和决策树等多种机器学习算法结合,并引入了集成模型,用于针对利什曼病的化合物活性预测 | 研究仅针对利什曼原虫的前鞭毛体阶段进行活性预测,未涵盖无鞭毛体阶段;模型性能仍有提升空间(最高准确率83.65%) | 开发一种高效的计算方法来预测和筛选具有抗利什曼病活性的化合物,以应对现有疗法副作用大和耐药性上升的挑战 | 来自PubChem数据库的65,057个化合物分子,针对利什曼原虫前鞭毛体 | 机器学习 | 利什曼病 | 化学信息学、分子指纹编码(基于SMILES)、Alamar Blue检测法 | 随机森林、多层感知器、梯度提升、决策树、集成模型 | 化学结构数据(分子指纹) | 65,057个化合物分子 | NA | NA | NA | 医学 |
| 171 | 2026-01-06 |
Beyond Tanacetum cinerariifolium: Advances in Pyrethrins Biosynthesis and Prospects for Engineered Cell Factories
2026-Jan-04, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-025-01549-8
PMID:41485148
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综述 | 本文综述了除虫菊酯生物合成的研究进展,并探讨了利用合成生物学和代谢工程构建工程细胞工厂以实现规模化、可持续生产的潜力 | 提出了从传统花卉种植转向工程细胞工厂的新生产策略,以解决除虫菊酯农业生产的限制 | NA | 探讨除虫菊酯生物合成途径及利用合成生物学实现可持续生产的可能性 | 除虫菊酯的生物合成途径、关键酶及其异源合成 | 合成生物学 | NA | 异源合成、代谢工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 农业 |
| 172 | 2026-01-06 |
Advances in tailoring camelina and pennycress oilseeds for specialty metabolites
2026-Jan-03, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103422
PMID:41485390
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和基因组编辑技术改造亚麻荠和遏蓝菜油料作物,以生产特种代谢物的最新进展 | 通过基因组编辑重编程内源脂质代谢以消除竞争途径,并结合生物勘探筛选更高效的酶,显著提高了目标产物的产量 | 仍面临实现细胞类型特异性表达和开发可扩展的途径基因表达控制策略等挑战 | 开发油料作物作为生产下一代生物产品的多功能平台 | 亚麻荠和遏蓝菜油料作物 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、生物勘探 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Camelina sativa, Thlaspi arvense | 外源途径扩展油脂多样性、内源脂质代谢重编程 | 农业, 工业生物技术 |
| 173 | 2026-01-06 |
Model-guided design of regulatable promoters for synthetic biology
2026-Jan-03, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102701
PMID:41485423
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综述 | 本文综述了在大肠杆菌中通过模型引导设计可调控启动子的方法,结合简单实验与热力学框架来优化启动子功能 | 提出了一种基于转录因子的上下文最小化、测量优先的方法,通过序列占用和功能概念来设计可调控启动子 | NA | 设计具有特定功能输出的可调控启动子,以应用于合成生物学 | 大肠杆菌中的启动子序列设计 | 合成生物学 | NA | 热力学框架、简单实验 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 可调控启动子设计,涉及动态范围、泄漏性和敏感性等特征 | 工业生物技术 |
| 174 | 2026-01-06 |
Long noncoding RNA regulation of immunity
2026-Jan, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02355-9
PMID:41482550
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综述 | 本文综述了长链非编码RNA(lncRNA)在哺乳动物免疫系统中的调控作用,包括其在免疫细胞分化、功能及疾病关联中的机制 | 文章强调了lncRNA在代谢途径、细胞表面糖基化非编码RNA及抗原性细胞外核糖核蛋白复合物中的新型调控机制,并特别关注了女性特异性lncRNA XIST在自身免疫性疾病中的性别偏向作用 | NA | 探讨lncRNA在免疫系统调控中的角色及其在免疫相关疾病中的影响 | 长链非编码RNA(lncRNA)及其在免疫细胞和免疫反应中的功能 | 自然语言处理 | 自身免疫性疾病 | 高通量功能基因组学、人类遗传学、分子互作图谱、人工智能、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 175 | 2026-01-06 |
Structure-Guided Engineering of 2-Oxoglutarate-Dependent Oxygenases: Principles, Case Studies, and Emerging Opportunities
2026, Chemical & pharmaceutical bulletin
IF:1.5Q3
DOI:10.1248/cpb.c25-00652
PMID:41485885
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综述 | 本文综述了2-酮戊二酸依赖性非血红素铁加氧酶(2OGX)的结构引导工程原理、案例研究及新兴机遇 | 系统总结了基于2OGX保守结构基序(如CLip、CLid、SL、DL及β-折叠框架)进行理性重编程以改变反应性的策略,展示了将羟化酶转化为卤化酶、重定向真菌酶构建非天然萜类支架等创新案例 | NA | 探讨如何通过结构引导的蛋白质工程策略,理性改造2OGX酶的功能,拓展其在生物催化中的应用 | 2-酮戊二酸依赖性非血红素铁加氧酶(2OGX)及其结构-功能关系 | 合成生物学 | NA | 结构生物学、计算设计、蛋白质工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、天然产物发现、药物开发 |
| 176 | 2026-01-06 |
Dietary Saponins as Antiaging Agents: A Systematic Review of Molecular Mechanisms, Nutritional Intervention, and Product Development
2025-Dec-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12207
PMID:41288460
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综述 | 本文系统综述了膳食皂苷作为抗衰老剂的分子机制、营养干预及产品开发 | 系统总结了膳食皂苷通过多种信号通路(如Nrf2/HO-1、PI3K/Akt等)实现抗衰老的分子机制、构效关系及产品开发,并提出了未来研究方向 | NA | 探讨膳食皂苷的抗衰老作用及其应用潜力 | 膳食皂苷 | NA | 衰老相关疾病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医药, 食品 |
| 177 | 2026-01-06 |
Pseudomonas spp. and antimicrobial resistance: unlocking new horizons with 1-hydroxyphenazine
2025-Dec, Folia microbiologica
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12223-025-01355-4
PMID:41045408
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综述 | 本文综述了1-羟基吩嗪(1-HP)作为应对抗菌素耐药性(AMR)的新型抗菌策略的潜力,涵盖其历史、作用机制、生物合成及在农业、生物技术和医学中的应用前景 | 系统整合了1-HP作为毒力因子和治疗支架的双重角色,并强调通过合成生物学、代谢工程和纳米载体递送系统实现规模化生产与毒性降低的创新策略 | NA | 探索应对抗菌素耐药性的新型抗菌策略,重点关注吩嗪类化合物特别是1-HP的潜力 | 1-羟基吩嗪(1-HP)及其作为抗菌剂和抗癌先导化合物的特性 | NA | NA | 合成生物学,代谢工程,纳米载体递送系统,结构修饰(如卤化) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业,生物技术,医学 |
| 178 | 2026-01-05 |
The role of gut microbiome in aging-associated diseases: where do we stand now and how technology will transform the future
2026-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2607076
PMID:41454672
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综述 | 本文综述了肠道微生物组在衰老相关疾病中的作用,并探讨了新兴技术如何推动该领域的研究和干预措施开发 | 提出了整合微生物组科学、衰老生物学和新兴技术的PRIME框架,为推进精准医学和促进健康老龄化提供了全面蓝图 | NA | 探讨肠道微生物组在衰老相关疾病中的作用,以及如何利用技术推动相关研究和临床干预 | 肠道微生物组及其与衰老相关疾病的关联 | NA | 衰老相关疾病(包括感染性疾病、自身免疫病、神经退行性疾病、精神疾病、癌症、代谢性疾病、肾脏疾病、心血管疾病、骨骼和肌肉疾病等) | 功能多组学、合成生物学、人工智能驱动分析、生物样本库、自体粪便微生物群移植 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 179 | 2026-01-05 |
Enhancing delta-tocotrienol production in Saccharomyces cerevisiae via metabolic engineering strategies in conjunction with the mutagenesis of tocopherol cyclase
2026-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.11.013
PMID:41480008
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研究论文 | 本研究通过代谢工程和酶工程策略,成功提高了酿酒酵母中δ-生育三烯酚的产量 | 结合酶融合构建底物通道、优化转运蛋白表达以及通过半理性蛋白质设计突变关键限速酶,显著提升了δ-生育三烯酚的微生物异源生产 | NA | 构建高效的微生物细胞工厂以生产δ-生育三烯酚,补充或替代维生素E供应链 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、酶工程、半理性蛋白质设计、发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 通过PaCrtE和SyHPT酶的顺序融合构建底物通道,优化MGGBQ前体供应;表达转运蛋白PDR1以增强产物外排 | 食品、化妆品、制药 |
| 180 | 2026-01-05 |
Pheromone-mediated quorum sensing enables dynamic regulation of cordycepin biosynthesis in Cordyceps militaris
2025-Dec-30, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133915
PMID:41478417
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研究论文 | 本研究在蛹虫草中重构了信息素介导的群体感应系统,实现了虫草素生物合成的信号响应式动态调控 | 首次在蛹虫草中构建了基于信息素群体感应的动态调控系统,实现了细胞密度依赖的虫草素合成精准控制 | 未在更广泛的药用真菌中验证该系统的普适性,且未进行大规模发酵验证 | 开发虫草素高效生物合成的动态调控策略 | 蛹虫草(Cordyceps militaris)及其虫草素生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 系统发育分析、保守结构域分析、合成生物学电路构建 | NA | NA | NA | 2A肽介导的多基因共表达 | 蛹虫草(Cordyceps militaris) | 信息素响应型启动子控制的α-信息素(mfα1)表达系统,结合色氨酸响应型启动子实现细胞密度依赖的动态调控 | 医药 |