合成生物学相关文章
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当前共找到 3043 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-04-10 |
Deep Neural Networks for Predicting Single-Cell Responses and Probability Landscapes
2023-08-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00203
PMID:37467372
|
研究论文 | 本文探讨了使用深度神经网络预测单细胞响应和概率景观的方法 | 提出了能够预测未来状态完整分布的更新网络架构，以准确预测双峰表达分布 | 初始方法在预测多模态动态时存在根本性不足 | 预测和控制生物电路，支持合成生物学应用 | 单细胞响应和概率景观 | 机器学习 | NA | 深度神经网络 | 深度神经网络 | 时间序列数据 | 计算模拟的单细胞响应数据 |
| 162 | 2025-04-09 |
A roadmap to understanding and anticipating microbial gene transfer in soil communities
2025-Apr-08, Microbiology and molecular biology reviews : MMBR
IF:8.0Q1
DOI:10.1128/mmbr.00225-24
PMID:40197024
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research paper | 本文探讨了土壤微生物群落中基因转移的预测和理解，以评估合成生物学技术大规模应用时工程DNA向环境微生物无意转移的频率 | 提出了填补土壤微生物组基因转移知识空白的策略，包括创建土壤标准集和使用新兴技术测量基因转移宿主范围 | 土壤的复杂性和异质性增加了预测基因转移过程的难度 | 提高对土壤微生物群落中基因转移的理解，以设计更安全的生物技术 | 土壤微生物群落和工程微生物 | 合成生物学 | NA | 合成DNA技术、新兴基因转移测量技术 | 社区规模、环境特异性模型 | 微生物基因转移数据 | 多种土壤类型 |
| 163 | 2025-04-09 |
Functional characterization and regioselectivity manipulation of two Benzylisoquinoline alkaloids O-methyltransferases from Stephania yunnanensis
2025-Apr, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2025.108238
PMID:39922041
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研究论文 | 该研究从云南地不容的转录组数据中鉴定并表征了两个功能相同但系统发育不同的BIA 7OMTs酶SyOMT4和SyOMT5，并通过蛋白质工程改造其底物结合微环境，成功改变了它们的催化区域选择性 | 通过定点突变成功将SyOMT4转化为高特异性的BIA 6OMT酶SyOMT4-WFE，并将SyOMT5意外改造为BIA NMTs酶SyOMT5-WFE和SyOMT5-WFD，拓展了BIA OMTs酶的功能多样性 | NA | 研究BIA O-甲基转移酶的功能表征与区域选择性调控机制 | 云南地不容中的两个BIA O-甲基转移酶SyOMT4和SyOMT5 | 合成生物学与代谢工程 | NA | 转录组分析、多序列比对、结构建模、定点突变 | NA | 序列数据、结构模型 | NA |
| 164 | 2025-04-09 |
Synthetic transcription factors establish the function of nine amino acid transactivation domains of Komagataella phaffii Mxr1
2025-Mar, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.108211
PMID:39855340
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研究论文 | 该研究通过合成转录因子验证了Komagataella phaffii Mxr1中九个氨基酸转录激活域（9aaTADs）的功能 | 首次全面表征了K. phaffii锌指转录因子中的9aaTADs，并揭示了其通过Gcn5介导的组蛋白乙酰化激活转录的机制 | 研究仅针对K. phaffii中的Mxr1转录因子，其他物种或转录因子中的9aaTADs功能尚未验证 | 探究K. phaffii Mxr1转录因子中多个9aaTADs的功能及其转录激活机制 | Komagataella phaffii Mxr1转录因子及其9aaTADs | 合成生物学 | NA | 合成转录因子构建、基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | 21个推定的9aaTADs（TAD B-V）及1个已知的TAD A |
| 165 | 2025-04-09 |
Advancing microbial engineering through synthetic biology
2025-Mar, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2503100
PMID:40195840
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 166 | 2025-04-09 |
Optimal network sizes for most robust Turing patterns
2025-01-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86854-7
PMID:39849094
|
research paper | 该研究通过随机矩阵理论分析较大网络的Jacobian矩阵，探讨了图灵模式在生物系统中的形成机制及其最优网络规模 | 揭示了图灵模式比以往认为的更可能偶然出现，并发现最稳健的图灵网络具有最优规模，仅由少数分子物种组成，从而显著提高了其在生物系统中的可识别性 | 研究主要基于理论分析，未涉及具体生物实验验证 | 探讨图灵模式在复杂生物基因调控网络中的形成机制及其最优网络规模 | 基因调控网络中的图灵模式 | systems biology | NA | random matrix theory | NA | theoretical analysis | NA |
| 167 | 2025-04-08 |
Super-robust synthetic microorganism can get chlorine resistance in advance and transfer their inserted DNA sequence in genome to indigenous bacteria in water
2025-Apr-02, Water research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.watres.2025.123594
PMID:40188791
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研究论文 | 本研究探讨了超级稳健合成微生物在水环境中的行为及其对氯的抵抗能力 | 发现超级稳健合成微生物能够将插入的DNA序列转移给土著细菌，并展示出比野生型细菌更强的氯抵抗能力 | 对于超级稳健合成微生物在环境中的长期影响和潜在健康风险了解有限 | 研究超级稳健合成微生物在水环境中的命运及其作为新兴生物污染物的环境风险 | 超级稳健合成微生物和土著细菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas基因编辑 | NA | 实验数据 | NA |
| 168 | 2025-04-08 |
A review of MicroRNAs and flavonoids: New insights into plant secondary metabolism
2025-Mar-27, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142518
PMID:40157676
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综述 | 本文综述了MicroRNAs和类黄酮在植物次生代谢中的新见解，探讨了miRNA调控类黄酮生物合成的分子机制及多学科技术在代谢工程中的应用 | 提出了'miRNA-多因素协同网络'概念，整合CRISPR/Cas13、合成生物学、多组学技术和人工智能等跨学科方法优化类黄酮代谢途径 | NA | 深入理解并改进类黄酮代谢，为植物育种、功能性食品生产和药物开发提供理论框架和技术路线 | 植物次生代谢物类黄酮及其调控网络 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas技术、合成生物学、多组学技术、人工智能 | NA | 组学数据 | NA |
| 169 | 2025-04-08 |
Cell-free expression and SMA copolymer encapsulation of a functional receptor tyrosine kinase disease variant, FGFR3-TACC3
2025-01-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86194-6
PMID:39848978
|
研究论文 | 该研究通过无细胞蛋白表达系统成功表达了功能性的FGFR3-TACC3融合蛋白，并利用SMA共聚物进行了重构 | 首次使用无细胞蛋白表达系统快速高效地表达了难以通过传统宿主细胞方法表达的FGFR3-TACC3融合蛋白，并验证了其功能性 | 目前尚未获得任何全长RTK的高分辨率结构，且该方法在其他难表达膜蛋白上的适用性有待验证 | 解决跨膜蛋白特别是受体酪氨酸激酶(RTKs)难以表达和提取的问题 | FGFR3-TACC3融合蛋白 | 合成生物学 | 癌症 | 无细胞蛋白表达(CFPE), SMA共聚物重构 | NA | 蛋白质 | 特定产量为300 µg/mL裂解液 |
| 170 | 2025-04-07 |
Development and application of an interbacterial DNA delivery system based on M13 bacteriophage
2025-Apr-05, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04309-z
PMID:40186660
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研究论文 | 开发并应用了一种基于M13噬菌体的细菌间DNA传递系统，用于研究细菌间的协同响应机制 | 利用M13噬菌体开发了一种新型的工程菌DNA传递系统，能够实现细菌间的DNA信息传递和协同响应 | 未提及在实际疾病治疗中的应用效果和潜在安全性问题 | 研究细菌间的信息传递机制，为多细菌联合调控提供基础 | 工程菌和M13噬菌体 | 合成生物学 | NA | 噬菌体介导的DNA传递系统 | NA | DNA | 未明确提及具体样本数量 |
| 171 | 2025-04-07 |
Bioprinting and synthetic biology approaches to engineer functional endocrine pancreatic constructs
2025-Apr-03, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.03.005
PMID:40185667
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review | 讨论生物打印和合成生物学在工程化功能性内分泌胰腺构建体中的最新进展 | 融合合成生物学、细胞工程与生物打印技术，为开发先进体外模型和可移植移植物开辟新途径 | NA | 探索利用生物打印和合成生物学技术开发功能性内分泌胰腺构建体，以治疗糖尿病 | 内分泌胰腺构建体 | 合成生物学 | 糖尿病 | 生物打印、合成生物学、细胞工程 | NA | NA | NA |
| 172 | 2025-04-07 |
Toward an integrated omics approach for plant biosynthetic pathway discovery in the age of AI
2025-Apr, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2025.01.010
PMID:40000312
|
综述 | 本文综述了利用多组学策略和人工智能技术发现植物生物合成途径的最新进展 | 提出了一种结合分子网络、反应对分析和基因表达模式的集成工作流程，并探讨了AI驱动的途径发现方法 | 未提及具体实施案例或验证结果 | 促进可持续生物经济发展，通过合成生物学获取复杂天然产物 | 植物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 多组学技术（基因组学、转录组学、代谢组学） | AI驱动方法 | 多组学数据 | NA |
| 173 | 2025-04-07 |
Rational design of terminal deoxynucleotidyl transferase for RNA primer elongation
2025-Mar-31, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142712
PMID:40174852
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研究论文 | 本文通过理性设计末端脱氧核苷酸转移酶（TdT）的引物识别位点，实现了RNA引物的高效延伸 | 通过工程化TdT的引物识别位点，将RNA延伸活性从20%提升至90%以上，并开发了两种可行的微量microRNA检测方法 | 未提及具体样本量或实验验证的广泛性 | 改进RNA引物的延伸效率，简化RNA序列分析流程 | 末端脱氧核苷酸转移酶（TdT）及RNA引物 | 合成生物学 | NA | 酶工程、RNA延伸技术 | NA | NA | NA |
| 174 | 2025-04-07 |
Towards the computational design of protein post-translational regulation
2015-Jun-15, Bioorganic & medicinal chemistry
IF:3.3Q1
DOI:10.1016/j.bmc.2015.04.056
PMID:25956846
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review | 本文综述了蛋白质翻译后修饰（PTMs）在细胞调控中的作用及其计算方法设计的最新进展 | 探讨了利用合成生物学方法设计蛋白质翻译后修饰调控的新机遇 | 尚未深入探讨具体设计方法的实验验证和应用限制 | 推动合成生物学在蛋白质翻译后修饰调控领域的应用 | 蛋白质翻译后修饰（PTMs）及其调控机制 | 合成生物学 | NA | 蛋白质组学 | NA | NA | NA |
| 175 | 2025-04-06 |
Introduction of human m6Am methyltransferase PCIF1 facilitates the biosynthesis of terpenoids in Saccharomyces cerevisiae
2025-Apr-02, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02701-4
PMID:40176045
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研究论文 | 本研究通过将人类m6Am甲基转移酶PCIF1引入酿酒酵母，显著促进了萜类化合物的生物合成 | 首次发现PCIF1能显著提升酿酒酵母中角鲨烯和长叶烯的产量，并揭示了其通过上调糖酵解和乙酰辅酶A生物合成途径相关基因以及激活细胞壁完整性MAPK途径来发挥作用 | 研究仅针对酿酒酵母中的萜类化合物生物合成，未在其他微生物或产物中进行验证 | 开发更高效的代谢途径优化策略以提高微生物细胞工厂的生产潜力 | 酿酒酵母中萜类化合物的生物合成 | 合成生物学 | NA | 代谢工程策略、转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 工程酵母菌株 |
| 176 | 2025-04-06 |
High-throughput optimisation of protein secretion in yeast via an engineered biosensor
2025-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.11.010
PMID:39674781
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research paper | 该研究通过工程化生物传感器优化酵母中蛋白质的高通量分泌 | 利用酵母G蛋白偶联受体生物传感器测量与目标蛋白质共分泌的肽标签浓度，实现分泌效率的高通量筛选 | NA | 优化异源蛋白质表达策略中的分泌效率 | 酵母中的蛋白质分泌系统 | 合成生物学 | NA | Combinatorial Golden Gate克隆 | NA | NA | 超过6000种启动子、信号肽和终止子的组合 |
| 177 | 2025-04-06 |
Using synthetic biology to express nitrogenase biosynthesis pathway in rice and to overcome barriers of nitrogenase instability in plant cytosol
2025-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.12.002
PMID:39818476
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研究论文 | 利用合成生物学在稻米中表达固氮酶生物合成途径，并克服植物细胞质中固氮酶不稳定的障碍 | 通过多基因载体转化和转基因稻米间的有性杂交，成功将包含13个基因的固氮酶生物合成途径引入稻米，并发现NifH-S18是导致蛋白降解的关键残基，获得了具有Fe蛋白活性和抗植物内切蛋白酶切割的NifH变体 | NifH在稻米细胞质中不稳定，仍需进一步优化以提高其稳定性 | 减少化学氮肥的使用，通过工程化手段在谷物中实现固氮 | 稻米 | 合成生物学 | NA | 多基因载体转化、有性杂交、基因组测序分析 | NA | 基因组数据、蛋白质数据 | 两个F杂交稻米品系L12-13和L8-17 |
| 178 | 2025-04-06 |
Microbial production of hyaluronic acid: The current advances, engineering strategies and trends
2025-Mar-26, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.03.015
PMID:40154620
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综述 | 本文综述了透明质酸（HA）的微生物生产方法，包括工程菌株的使用、代谢工程策略、工业规模生产及影响分子量的关键因素 | 探讨了利用基因和代谢工程以及合成生物学的最新进展解决透明质酸生产中分子量、粘度和副产物形成的挑战 | 需要进一步研究开发更高效、抗污染且能利用低成本底物的工程菌株 | 推进透明质酸的工业化生产并扩展其应用 | 透明质酸（HA）的微生物生产 | 合成生物学 | NA | 微生物发酵、基因和代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 179 | 2025-04-06 |
Synthetic Lipid Biology
2025-Feb-26, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00761
PMID:39805091
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review | 本文综述了合成脂质生物学这一新兴领域，探讨了脂质和生物膜的构建、操纵及分析方法 | 提出了‘合成脂质生物学’这一新概念，整合了化学、生物学、物理学和工程学等多学科方法研究脂质和生物膜 | 该领域尚处于起步阶段，许多技术和方法仍需进一步发展和验证 | 构建更清晰的脂质和生物膜特性、行为及功能描述 | 脂质和生物膜 | 合成生物学 | NA | 化学合成、化学酶法合成、光遗传学、蛋白质工程、生物正交化学 | NA | NA | NA |
| 180 | 2025-04-05 |
Editorial: Microbial co-cultures: a new era of synthetic biology and metabolic engineering, volume II
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1587450
PMID:40182290
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |