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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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161 | 2025-05-09 |
Directed evolution of hydroxylase XcP4H for enhanced 5-HTP production in engineered probiotics to treat depression
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142250
PMID:40113000
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研究论文 | 通过定向进化技术增强工程益生菌中羟化酶XcP4H的活性,以促进5-HTP的生产,用于治疗抑郁症 | 采用基于遗传密码扩展的高通量筛选方法对XcP4H进行定向进化,显著提高了5-HTP的产量,并通过分子动力学模拟揭示了其机制 | 研究主要在小鼠模型中进行,尚未进行人体临床试验 | 解决5-HTP的药代动力学限制,开发一种新型的抑郁症治疗方法 | 羟化酶XcP4H和工程益生菌Escherichia coli Nissle 1917 (EcN) | 合成生物学 | 抑郁症 | 定向进化、分子动态模拟、高通量筛选 | NA | NA | 小鼠模型 |
162 | 2025-05-09 |
Revolutionizing immunotherapy: The next frontier in CAR T-cell engineering
2025-Apr-28, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.104751
PMID:40306469
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review | 本文综述了嵌合抗原受体(CAR)T细胞疗法的发展历程及其在癌症治疗中的应用 | 探讨了从第一代到第五代CAR T细胞的设计进展及其在增强T细胞激活、持久性和疗效方面的关键改进 | 在实体瘤治疗中仍面临免疫抑制性肿瘤微环境和抗原异质性的挑战 | 探索CAR T细胞疗法在癌症治疗中的潜力及其未来发展方向 | CAR T细胞疗法及其在癌症治疗中的应用 | 免疫疗法 | 癌症 | CAR T细胞工程 | NA | NA | NA |
163 | 2025-05-09 |
A novel NAC36-MYB18-TAT2 model regulates the synthesis of phenolic acid in Salvia miltiorrhiza Bunge
2025-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.140987
PMID:39952526
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研究论文 | 本文揭示了丹参中酚酸合成的NAC36-MYB18-TAT2分子模型调控机制 | 首次报道了SmTAT2在丹参酚酸代谢途径中的生物学功能及调控机制,并揭示了NAC36-MYB18-TAT2分子模型的作用 | NA | 研究丹参中酚酸合成的分子调控机制 | 丹参(Salvia miltiorrhiza Bunge)中的酚酸代谢途径 | 合成生物学 | NA | 转基因实验(过表达和CRISPR/Cas9)、分子互作技术(酵母单杂交、双荧光素酶报告基因检测和EMSA) | NAC36-MYB18-TAT2分子模型 | 分子生物学数据 | NA |
164 | 2025-05-09 |
Metabolite-Responsive Control of Transcription by Phase Separation-Based Synthetic Organelles
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00633
PMID:39954260
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research paper | 该研究通过基于液-液相分离的合成细胞器,将代谢信号转化为基因转录调控 | 利用液-液相分离技术构建合成细胞器,实现代谢信号对基因转录的可逆和剂量依赖性调控 | 研究仅针对丙酮酸代谢信号,未验证其他代谢物的适用性 | 开发具有生命感知和适应能力的合成生物材料 | 基于PdhR阻遏蛋白和液-液相分离的合成细胞器系统 | synthetic biology | NA | liquid-liquid phase separation, genetic engineering | NA | NA | NA |
165 | 2025-05-09 |
Advancing cellulose utilization and engineering consolidated bioprocessing yeasts: current state and perspectives
2025-Feb-13, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-025-13426-0
PMID:39939397
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综述 | 本文综述了利用酿酒酵母进行纤维素酶表达的策略,以及通过现代合成生物学工具优化CBP酵母菌株的最新进展 | 总结了纤维素酶在酵母中表达的策略,并探讨了如何通过现代合成生物学工具优化CBP酵母菌株 | 目前报道的一步法纤维素底物转化为乙醇的滴度和生产率远低于工业要求 | 探讨如何通过工程化酵母菌株实现木质纤维素生物质的高效生物转化 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 纤维素酶表达系统、合成生物学工具 | NA | NA | NA |
166 | 2025-05-09 |
Analysis of the Alkaline Resistance Mechanism of Halomonas alkalicola CICC 11012 s by Proteomics and Metabolomics
2025-Feb-13, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-024-04056-2
PMID:39945829
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研究论文 | 通过蛋白质组学和代谢组学分析嗜碱菌Halomonas alkalicola CICC 11012s的耐碱机制 | 首次结合蛋白质组学和代谢组学技术研究嗜碱菌的耐碱分子机制,并利用CRISPR技术构建突变体验证tonb基因在耐碱机制中的重要作用 | 研究仅针对Halomonas alkalicola CICC 11012s菌株,未涉及其他嗜碱菌的比较分析 | 探索嗜碱菌对碱性胁迫的响应分子机制 | 嗜碱菌Halomonas alkalicola CICC 11012s及其CRISPR突变体 | 合成生物学 | NA | 蛋白质组学, 代谢组学, CRISPR | NA | 蛋白质组数据, 代谢组数据 | 野生型菌株和CRISPR突变体菌株 |
167 | 2025-05-09 |
Oligonucleotide subsets selection by single nucleotide resolution barcode identification
2025-Feb-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56856-0
PMID:39939320
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研究论文 | 介绍了一种利用序列特异性循环核苷酸合成和模板寡核苷酸阻断的寡核苷酸子集选择方法 | 无需引物进行选择性杂交,能够用少于五个核苷酸的条形码长度编码和选择数百个子集 | NA | 解决复杂寡核苷酸库中子集选择的问题 | 寡核苷酸库 | 合成生物学 | NA | 序列特异性循环核苷酸合成 | NA | NA | NA |
168 | 2025-05-09 |
A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules
2025-Feb-12, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2025.01.002
PMID:39947133
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meta-analysis | 通过对炎症性肠病(IBD)患者肠道微生物组中小分子生物合成基因簇(BGCs)的荟萃分析,发现了与克罗恩病(CD)显著相关的两个梭菌来源的BGCs,并鉴定了六种脂肪酸酰胺作为这些BGCs的产物 | 首次鉴定了与克罗恩病相关的微生物组来源小分子,并揭示了这些分子通过破坏肠道通透性加剧疾病的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本中的验证仍需进一步研究 | 探索肠道微生物组在炎症性肠病发病机制中的作用 | 炎症性肠病患者的肠道微生物组 | 微生物组学 | 炎症性肠病 | 宏基因组测序,合成生物学 | NA | 宏基因组数据 | IBD患者和健康对照的肠道微生物组样本 |
169 | 2025-05-09 |
Efficient Site-Directed Mutagenesis Mediated by Primer Pairs with 3'-Overhangs
2025-Feb, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70104
PMID:39945594
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研究论文 | 提出了一种优化的定点诱变方案,利用具有3'端突出部分的引物对提高诱变效率和降低错误率 | 通过部分互补的引物对设计显著提高诱变效率,平均效率达到约50%,部分情况下接近100%的理想阈值 | 未明确说明该方法在不同基因长度或复杂结构区域的适用性 | 开发更高效可靠的定点诱变方法 | 质粒DNA | 分子生物学 | NA | 定点诱变技术 | NA | NA | 每次诱变反应仅需分析3个菌落 |
170 | 2025-05-09 |
The Establishment of Artificial RNA Cascade Circuits for Gene Regulation Based on Doxycycline-Induced Pre-mRNA Alternative Splicing
2025-Jan-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26031163
PMID:39940931
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研究论文 | 本研究开发了一种基于多西环素诱导的前mRNA选择性剪接的人工RNA级联电路,用于基因调控 | 通过改变开关中的适配体2碱基对,意外获得了具有完全相反调控功能的'开启开关'CTM和'关闭开关'C2ITetR>4A,并将其与L7Ae/k-turn模块整合,创建了内含子剪接的双开关RNA级联系统 | NA | 为哺乳动物合成生物学提供有价值的工具,实现基因表达的精确预测和动态调控 | 人工嵌合内含子模块、RNA核糖开关、TetR适配体 | 合成生物学 | NA | 前mRNA选择性剪接 | NA | NA | NA |
171 | 2025-05-09 |
Colored Proteins Act as Biocolorants in Escherichia coli
2025-Jan-21, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules30030432
PMID:39942539
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research paper | 该研究探讨了多种彩色蛋白质作为生物着色剂在大肠杆菌中的应用,特别关注了GfasPurple的稳定性和耐受性 | 研究发现GfasPurple在高温、乙醇、酸碱等恶劣条件下表现出优异的稳定性,并通过诱变创造了更多颜色的变体,扩展了色蛋白库 | 研究主要集中在大肠杆菌系统,未在其他生物系统中验证GfasPurple的应用效果 | 评估彩色蛋白质作为生物着色剂的性能和应用潜力 | 多种彩色蛋白质(包括荧光蛋白和色蛋白)及其在大肠杆菌中的表现 | 合成生物学 | NA | 吸收光谱分析、诱变技术 | NA | 光谱数据、视觉观察数据 | 多种彩色蛋白质(eGFP、sfGFP、mKate2、GfasPurple、AmilCP、AeBlue) |
172 | 2025-05-09 |
Challenges and limitations in using bacterial metabolites as immunomodulators
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1535394
PMID:39944722
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综述 | 探讨利用细菌代谢物作为免疫调节剂面临的挑战与限制 | 强调了个性化方法的重要性,并探讨了克服限制的潜在技术进步 | 细菌代谢物的生物利用度有限,存在脱靶效应,以及微生物组与代谢物之间复杂的相互作用 | 研究细菌代谢物作为免疫调节剂的临床应用潜力 | 细菌代谢物及其与免疫系统的相互作用 | 免疫学 | 免疫相关疾病 | 宏基因组学、代谢组学、合成生物学、靶向递送系统 | NA | NA | NA |
173 | 2025-05-09 |
Enhancing active ingredient biosynthesis in Chinese herbal medicine: biotechnological strategies and molecular mechanisms
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18914
PMID:39950047
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综述 | 本文综述了现代生物技术在增强中草药活性成分生物合成中的应用及其分子机制 | 整合了生物合成、分子调控、提取方法和合成生物学的多角度分析,提出了增强中草药活性成分生产的策略 | 未提及具体实验验证或案例研究,可能缺乏实际应用的详细指导 | 探索现代生物技术在中草药活性成分生物合成中的应用潜力 | 中草药的活性成分及其生物合成途径 | 生物技术 | NA | 代谢工程、合成生物学工具 | NA | NA | NA |
174 | 2025-05-09 |
A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules
2024-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.07.579278
PMID:38370680
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meta-analysis | 通过多队列分析肠道微生物组中的小分子生物合成基因簇(BGCs),研究了炎症性肠病(IBD)患者与健康对照之间的差异 | 发现了一组与IBD显著相关的梭菌衍生BGCs,并通过合成生物学方法鉴定出六种脂肪酸酰胺作为这些BGCs的产物 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本的验证可能不足 | 探索肠道微生物组中小分子在IBD发病机制中的作用 | 炎症性肠病(IBD)患者和健康对照的肠道微生物组 | 微生物组学 | 炎症性肠病 | 宏基因组测序、合成生物学 | NA | 宏基因组数据 | 5,306个肠道微生物组样本(来自2,033名IBD患者和833名健康对照) |
175 | 2025-05-09 |
Concepts of a synthetic minimal cell: Information molecules, metabolic pathways, and vesicle reproduction
2024, Biophysics and physicobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.2142/biophysico.bppb-v21.0002
PMID:38803330
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review | 本文回顾了合成最小细胞系统的概念,包括信息分子、代谢途径和囊泡繁殖,并与生物细胞进行了比较 | 提出了合成最小细胞系统,展示了递归生长和分裂周期,避免了使用生物细胞的复杂分子机制 | NA | 探索生命系统如何从非生命分子组装中产生,以及支持这一过程的物理和化学原理 | 合成最小细胞系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
176 | 2025-05-09 |
A simeprevir-inducible molecular switch for the control of cell and gene therapies
2023-11-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43484-9
PMID:38012128
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research paper | 本文介绍了一种基于simeprevir的新型化学诱导二聚化(CID)模块,用于控制细胞和基因治疗中的生物过程 | 开发了一种基于已获批口服小分子simeprevir的新型CID模块,可用于控制基因表达和细胞凋亡,并在异种移植小鼠模型中展示了其诱导肿瘤细胞凋亡的能力 | 研究主要集中于体外和小鼠模型,尚未在人体中进行验证 | 开发可用于临床环境的新型分子开关系统 | 化学诱导二聚化(CID)模块及其在细胞和基因治疗中的应用 | 合成生物学 | 肿瘤 | 化学诱导二聚化技术 | 异种移植小鼠模型 | 实验数据 | 体外细胞实验和异种移植小鼠模型 |
177 | 2025-05-08 |
Making Cells as a "Nirvana Phoenix": Precise Coupling of Precursors Prior to ROS Bursts for Intracellular Synthesis of Quantum Dots
2025-May-07, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c02861
PMID:40259718
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research paper | 该研究开发了一种在活细胞内精确合成近红外量子点(QDs)的方法,通过控制前体的耦合和反应条件,显著提高了细胞存活率和荧光强度 | 利用细胞适应性硒代胱氨酸((Cys-Se))作为前体,结合Ag-谷胱甘肽(AgSG),在细胞内合成近红外AgSe量子点,同时抑制细胞毒性物质和ROS的爆发 | 研究未涉及大规模生产或临床应用的具体细节 | 开发一种在活细胞内高效、低毒合成荧光量子点的方法,用于细胞标记和生物成像 | 活细胞内的无机纳米晶体合成 | 合成生物学 | NA | 细胞内量子点合成技术 | NA | 荧光成像数据 | NA |
178 | 2025-05-08 |
Mapping the Edges of Mass Spectral Prediction: Evaluation of Machine Learning EIMS Prediction for Xeno Amino Acids
2025-May-07, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00286
PMID:40329886
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research paper | 评估NEIMS光谱预测算法在单取代α-氨基酸上的准确性,以解决依赖实验确定签名的问题 | 评估了NEIMS算法在预测超出训练数据范围的氨基酸光谱时的准确性,并指出其不准确性无法通过物理化学差异或氨基酸的衍生化状态来解释 | 预测光谱对于超出算法训练数据的氨基酸不准确,且这些不准确性无法通过物理化学差异或衍生化状态来解释 | 评估机器学习EIMS预测算法在单取代α-氨基酸上的准确性,以扩展未知生物分子的检测能力 | 单取代α-氨基酸 | machine learning | NA | mass spectrometry | NEIMS | mass spectral data | NA |
179 | 2025-05-08 |
Responses of natural plastisphere community and zooplankton to microplastic pollution: a review on novel remediation strategies
2025-May-07, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04334-y
PMID:40332619
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综述 | 本文综述了微塑料污染对自然塑球群落和浮游动物的影响,并探讨了基于自然群落水平的新型修复策略 | 重点讨论了塑球群落的适应性反应、浮游动物对微塑料的摄取和表面修饰,以及基于微生物降解和生态功能的生物修复策略 | 需要进一步研究开发先进的微塑料去除技术,并更深入了解微塑料对海洋生态系统的毒性影响 | 探讨微塑料污染的修复策略及其对环境的影响 | 自然塑球群落和浮游动物 | 环境科学 | NA | DNA元条形码 | NA | 文献数据 | NA |
180 | 2025-05-08 |
Coacervates as enzymatic microreactors
2025-May-06, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs01203h
PMID:40084439
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综述 | 本文综述了基于凝聚层的酶微反应器的最新进展,重点讨论了凝聚层加速酶反应的机制及其在生物催化、合成生物学和纳米技术中的潜在应用 | 探讨了凝聚层作为酶微反应器的创新应用,包括增强底物和酶浓度、稳定中间产物以及提供分子拥挤环境 | 讨论了在凝聚层内监测反应的挑战,以及当前可用的技术如荧光技术、色谱和核磁共振光谱的局限性 | 研究凝聚层微反应器的设计及其在生物催化、合成生物学和纳米技术中的应用 | 合成聚合物、肽和核酸为基础的凝聚层系统 | 合成生物学 | NA | 荧光技术、色谱、NMR光谱 | NA | NA | NA |