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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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161 | 2025-07-20 |
Advances in Approaches to Study Chromatin-Mediated Epigenetic Memory
2022-01-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00394
PMID:34965084
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综述 | 本文综述了染色质介导的表观遗传记忆研究的最新进展,包括组蛋白修饰的建立与维持机制、亲本组蛋白伴侣的功能以及合成生物学方法在表观遗传研究中的应用 | 总结了亲本组蛋白回收过程对异染色质介导的转录沉默遗传的潜在影响,并介绍了用于分析表观遗传组分的新型合成生物学方法 | 主要基于真菌模型的研究发现,在哺乳动物系统中的验证可能有限 | 探讨染色质结构中介导的表观遗传记忆机制及其遗传方式 | 组蛋白翻译后修饰(PTMs)和亲本组蛋白回收过程 | 表观遗传学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
162 | 2025-07-20 |
Protein manipulation using single copies of short peptide tags in cultured cells and in Drosophila melanogaster
2021-03-16, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.191700
PMID:33593816
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研究论文 | 本文探讨了在培养细胞和果蝇中使用短肽标签单拷贝进行蛋白质操作的方法 | 开发了使用单拷贝短标签进行活细胞内蛋白质结合和操作的新工具 | NA | 开发更直接的蛋白质相互作用分析方法 | 培养细胞和果蝇中的蛋白质 | 合成生物学 | NA | 蛋白质结合技术 | NA | 蛋白质相互作用数据 | NA |
163 | 2025-07-19 |
Development and application of a highly specific whole-cell biosensor for supersulfide detection in environmental samples
2025-Nov-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.117731
PMID:40592263
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研究论文 | 开发并应用了一种高特异性的全细胞生物传感器,用于环境样品中超硫化物的检测 | 首次报道了使用Agrobacterium tumefaciens的超硫化物感应抑制子BigR(AtBigR)开发的全细胞生物传感器,具有对超硫化物的高选择性 | 未提及具体的技术限制或样本限制 | 开发一种高特异性、高灵敏度的超硫化物检测方法,以促进对超硫化物在生物学、环境和锂硫电池中作用的理解 | 超硫化物(如元素硫、无机多硫化物和有机多硫化物) | 合成生物学 | NA | 全细胞生物传感器技术 | NA | 环境样品数据(如海洋沉积物和锂硫电池电解质) | 多种海底地形的海洋沉积物样品和锂硫电池电解质样品 |
164 | 2025-07-19 |
Bioinformatics analysis and molecular cloning of squalene synthase from Simaroubaceae
2025-Oct, Protein expression and purification
IF:1.4Q4
DOI:10.1016/j.pep.2025.106751
PMID:40451315
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和分子克隆技术,研究了苦木科植物中角鲨烯合酶(SQS)的功能及其在苦木素生物合成途径中的作用 | 首次从苦木科植物的转录组数据中筛选并分析了多种SQS,克隆了AaSQS并鉴定了其功能及关键催化残基 | 研究仅针对苦木科植物中的SQS,未涉及其他植物家族中的SQS比较 | 研究苦木科植物中角鲨烯合酶的功能及其在苦木素生物合成途径中的作用 | 苦木科植物中的角鲨烯合酶(SQS) | 生物信息学 | NA | 转录组分析、分子克隆、分子对接、突变分析 | NA | 序列数据 | 6种苦木科植物的SQS(AaSQS, BjSQS, AeSQS, QaSQS, ElSQS, SaSQS) |
165 | 2025-07-19 |
An enzyme-based approach for highly efficient self-replication of DNA origami dimers
2025-Jul-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2500160122
PMID:40674426
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研究论文 | 本研究提出了一种基于酶的高效DNA origami二聚体自复制方法 | 使用耐热T4 DNA连接酶替代化学光交联步骤,实现了更快的循环时间和更高的扩增效率 | 未明确说明系统在复杂环境中的稳定性和长期运行效果 | 探索DNA origami二聚体的高效自复制系统及其在合成生物学和智能材料中的应用 | DNA origami二聚体 | 合成生物学 | NA | T4 DNA连接酶催化 | NA | 分子结构数据 | NA |
166 | 2025-07-19 |
Efficient De Novo Assembly of 100 kb-Scale Human Functional Immunoglobulin Heavy Variable (IGHV) Gene Fragments In Vitro
2025-Jul-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00011
PMID:40135783
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研究论文 | 该研究提出了一种高效的体外组装方法,用于构建功能性人类免疫球蛋白重链可变区(IGHV)基因片段 | 首次实现了百kb级别的人类功能性IGHV基因片段的体外无痕组装 | 仅针对IGHV基因片段,未验证其他复杂基因组区域的适用性 | 开发大规模人类基因组体外组装技术 | 人类免疫球蛋白重链可变区(IGHV)基因 | 合成生物学 | NA | Gibson等温组装 | NA | DNA序列 | NA |
167 | 2025-07-19 |
A Tn5 Transposase-Based System for High-Efficiency Genome-Wide Gene Activation in Escherichia coli
2025-Jul-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00170
PMID:40527878
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研究论文 | 开发了一种基于Tn5转座酶的系统,用于在大肠杆菌中高效实现全基因组基因激活 | 利用Tn5转座酶构建了一个高效的基因激活系统,能够实现近乎随机的全基因组插入,并通过四环素诱导启动子实现条件性基因激活 | 未提及系统的特异性或脱靶效应的详细评估 | 开发高效工具以进行细菌工程中的基因功能研究和表型优化 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | Tn5转座酶系统 | NA | 基因序列数据 | 未明确提及具体样本数量,但系统插入频率约为2.83×10 cfu/μg DNA |
168 | 2025-07-19 |
Establishment of a Visible Reporter System in Zymomonas mobilis through Random Mutagenesis and Rational Design of a Chromoprotein eforRed
2025-Jul-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00872
PMID:40590208
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研究论文 | 本研究通过随机诱变和理性设计,在非模式细菌Zymomonas mobilis中建立了一个可见的报告基因系统 | 通过随机诱变和理性设计增强eforRed色蛋白的光谱特性,成功在非模式细菌中建立了可见的报告基因系统 | 研究仅针对Zymomonas mobilis这一特定非模式细菌,可能不适用于其他微生物 | 开发适用于非模式微生物的可见报告基因系统,以促进生物制造和合成生物学的发展 | Zymomonas mobilis细菌和eforRed色蛋白 | 合成生物学 | NA | 随机错误倾向PCR和蛋白质理性设计 | NA | 蛋白质光学特性数据 | NA |
169 | 2025-07-19 |
Biofortified Bacteria: The Role of Selenium-Enriched Microorganisms in Enhancing Animal Selenium Uptake-A Review
2025-Jul-17, Journal of animal physiology and animal nutrition
IF:2.2Q1
DOI:10.1111/jpn.70001
PMID:40674621
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综述 | 本文综述了富硒微生物,特别是细菌,作为牲畜营养中有机硒补充的新颖和可持续策略的潜力 | 探讨了通过基因工程和合成生物学开发的工程细菌菌株,能够增强硒的吸收、转化和积累,并生物合成多种生物可利用的硒化合物 | 关键挑战包括优化菌株选择、发酵过程、生物安全性、法规遵从性,以及通过长期饲养试验在不同条件下证明其有效性 | 探索富硒细菌在动物农业、生物医学和环境修复中的潜在应用 | 牲畜(家禽和反刍动物) | 生物技术 | NA | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
170 | 2025-07-19 |
Metabolic Engineering of Yarrowia lipolytica with Massive Gene Assembly and Genomic Integration
2025-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00333
PMID:40676857
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研究论文 | 本文开发了一种在解脂耶氏酵母中进行大规模基因组装和基因组整合的策略,显著提高了基因操作和代谢工程的能力 | 实现了超过30 kb的十多个基因的稳定组装和整合,构建了含有35个外源基因(总计93.5 kb)的底盘细胞 | 未提及具体的技术限制或应用范围限制 | 提升解脂耶氏酵母的基因操作和代谢工程能力 | 解脂耶氏酵母 | 合成生物学 | NA | 大规模基因组装和基因组整合 | NA | NA | 构建了含有35个外源基因的底盘细胞,并在5 L生物反应器中进行了优化菌株的测试 |
171 | 2025-07-19 |
Synthetic biology-driven optoelectronic biosensor for rapid and highly sensitive norovirus detection in fecal samples
2025-Jul-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.117787
PMID:40674850
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研究论文 | 介绍了一种基于合成生物学的光电生物传感器,用于快速、高灵敏度检测临床粪便样本中的人类诺如病毒 | 整合了诺如病毒样颗粒和高亲和力单链可变片段抗体作为生物受体,实现了无需核酸扩增的多重分析,检测灵敏度比传统比色生物传感器提高了10至100倍 | 研究样本量较小(20份人类粪便样本),可能需要更大规模的临床验证 | 开发一种快速、高灵敏度的诺如病毒检测平台 | 人类诺如病毒 | 生物传感器 | 诺如病毒感染 | 合成生物学、噬菌体展示、光电传感 | NA | 生物分子数据 | 20份人类粪便样本 |
172 | 2025-07-19 |
Advances in production and application technologies of minicells: A review
2025-Jul-14, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108648
PMID:40669734
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review | 本文综述了微型细胞的生产和应用技术进展,包括其形成机制、分离方法、生产现状以及在合成生物学、农业和医学中的多样化应用 | 重点介绍了微型细胞在传统药物递送之外的四大功能:解毒与耐受、富集与微反应器、分子封装与递送以及原生结构表征 | 讨论了微型细胞在生物技术应用中面临的挑战和未来前景 | 综述微型细胞的生产技术及其在多个领域的应用 | 微型细胞 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
173 | 2025-07-19 |
Computational Strategies to Enhance Vitamin B12 Biosynthesis Potential of Microbes
2025-Jul-04, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-025-04325-8
PMID:40615742
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review | 本文综述了利用计算策略增强微生物维生素B12生物合成潜力的各种方法 | 讨论了CRISPR-Cas9基因组编辑、人工智能驱动的途径优化和多组学数据整合等最新进展 | 未提及具体实验验证或实际应用中的挑战 | 提高微生物维生素B12的生物合成以满足全球营养和治疗需求 | 微生物及其代谢途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、比较基因组学、分子对接、CRISPR-Cas9、人工智能 | NA | 多组学数据 | NA |
174 | 2025-07-19 |
Regulation and induction of fungal secondary metabolites: a comprehensive review
2025-Jul-01, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04386-0
PMID:40590991
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综述 | 本文全面分析了真菌次级代谢产物的调控机制、鉴定方法及提高产量的策略 | 强调了合成生物学和AI驱动的代谢工程在可持续利用真菌生物多样性中的创新应用 | 未提及具体实验验证或案例研究的局限性 | 探讨真菌次级代谢产物的调控机制及其在医药、农业和化妆品等领域的应用 | 真菌次级代谢产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | OMICS技术、响应面方法、人工神经网络 | 人工神经网络 | NA | NA |
175 | 2025-07-19 |
Biodegradation of Neonicotinoid Insecticides Thiacloprid and Thiamethoxam by Microorganisms: Metabolic Process, Metabolic Enzymes and Toxicity Assessments of their Metabolites
2025-Jun-25, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-025-04326-7
PMID:40555881
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综述 | 本文全面探讨了微生物降解新烟碱类杀虫剂噻虫啉和噻虫嗪的代谢途径、关键酶及其代谢产物的生态毒理学效应 | 重点分析了微生物群落通过互补代谢途径协同提升降解效率的潜力,并提倡整合多组学技术、计算生物学、合成生物学和代谢工程以推进微生物生物降解策略 | 对噻虫啉和噻虫嗪的降解机制理解仍不充分 | 研究微生物降解新烟碱类杀虫剂的代谢过程及其生态毒理学影响 | 噻虫啉(THI)和噻虫嗪(THIA)及其代谢产物 | 环境微生物学 | NA | 多组学技术、计算生物学、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA |
176 | 2025-07-19 |
Expression of Fluorescence Reporters and Natural Products in Native Gut Escherichia coli
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00835
PMID:40138712
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研究论文 | 本研究利用CRAGE技术对肠道天然大肠杆菌菌株EcAZ-1和益生菌株Nissle 1917进行基因工程改造,成功表达了多种异源基因并优化了荧光蛋白的表达条件 | 首次在天然肠道大肠杆菌中成功表达多种荧光报告基因和生物活性化合物,展示了其作为合成生物学平台的潜力 | 仅测试了两种大肠杆菌菌株,结果可能无法推广到其他肠道菌株 | 开发基于天然肠道细菌的治疗应用平台 | 肠道天然大肠杆菌菌株EcAZ-1和益生菌株Nissle 1917 | 合成生物学 | NA | CRAGE技术 | NA | 基因表达数据 | 2种大肠杆菌菌株 |
177 | 2025-07-19 |
Next-generation probiotics and engineered BEVs for precision therapeutics in osteoporosis
2025, Frontiers in nutrition
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fnut.2025.1581971
PMID:40667443
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综述 | 本文综述了利用下一代益生菌和工程化细菌外膜囊泡(BEVs)进行骨质疏松精准治疗的潜力 | 提出结合工程化益生菌和BEV技术的新型治疗策略,通过靶向肠道-骨骼轴提供骨保护作用 | 标准化和安全性方面仍存在挑战 | 探索基于微生物组的干预措施在骨质疏松治疗中的应用 | 骨质疏松患者 | 精准医疗 | 骨质疏松症 | 合成生物学、工程化BEVs | NA | NA | NA |
178 | 2025-07-19 |
Iterative deep learning-design of human enhancers exploits condensed sequence grammar to achieve cell type-specificity
2024-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.599076
PMID:38915713
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研究论文 | 本文应用迭代深度学习设计具有特定细胞类型活性的合成增强子 | 利用迭代深度学习方法设计合成增强子,实现细胞类型特异性,并通过实验验证和优化提高了增强子的特异性 | 研究仅针对两种人类细胞系,可能不适用于其他细胞类型 | 解决合成生物学中如何靶向特定细胞类型基因表达的问题 | 人类细胞系中的合成增强子 | 合成生物学 | NA | 深度学习 | NA | 基因组序列数据 | 两种人类细胞系 |
179 | 2025-07-18 |
Improved biosynthesis of C4 derivatives by engineered thiolase
2025-Sep, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.05.001
PMID:40320002
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研究论文 | 本研究通过工程化改造硫解酶,开发了一种利用大肠杆菌从乙二醇等二碳底物生物合成四碳化合物的新代谢途径 | 通过定向进化改造Cupriavidus necator的β-酮酰基硫解酶B(CnBktB),显著提高了其对glycolyl-CoA和acetyl-CoA的催化效率,并开发了可直接利用PET衍生的乙二醇的上游模块 | NA | 开发可持续的生物制造路线,将PET衍生的乙二醇转化为高价值的四碳化合物 | 大肠杆菌(Escherichia coli)和Cupriavidus necator的β-酮酰基硫解酶B(CnBktB) | 合成生物学 | NA | 定向进化、代谢工程 | NA | NA | NA |
180 | 2025-07-18 |
Engineering genetic circuits for dynamic control of central metabolism
2025-Sep, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.06.007
PMID:40532756
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研究论文 | 本研究开发了一种响应丙酮酸的PdhR生物传感器系统,用于动态调控微生物细胞工厂中中心代谢的代谢流分布,以提高有价值化合物的生产性能 | 建立了PdhR生物传感器系统,能够动态调控中心代谢的代谢流分布,并通过筛选多种PdhR同源物和计算分析优化了生物传感器性能 | 大多数遗传工具具有途径或中间体特异性,限制了其在合成生物学中的广泛应用,且其在平衡细胞生长和产物形成之间的代谢流潜力尚未充分探索 | 开发能够动态调控中心代谢的遗传调控工具,以提高微生物细胞工厂中有价值化合物的生产性能 | 微生物细胞工厂中的中心代谢 | 合成生物学 | NA | 生物传感器系统、定点诱变 | NA | NA | NA |