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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-06-04 |
Heterologous expression of anaerobic reductive dehalogenases: host nanoarchitectonics and synthetic biology optimization
2026-May-29, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135019
PMID:42217801
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综述 | 综述了异源表达厌氧还原脱卤酶的研究进展,提出了宿主纳米结构与合成生物学优化策略 | 提出了宿主-酶-环境评估框架,强调辅因子供应、应激耐受性和环境适应性在异源表达中的关键作用 | 当前异源表达面临外源钴胺素依赖性和氧化折叠路径等挑战,且新宿主系统尚未充分开发 | 克服有机卤化物呼吸细菌在生物修复应用中的生长缓慢、氧敏感性和底物特异性限制 | 还原脱卤酶及其在异源宿主(如大肠杆菌和巨大芽孢杆菌)中的表达系统 | 合成生物学 | NA | 异源表达、钴胺素补救系统 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌、巨大芽孢杆菌 | NA | 环境修复、工业生物技术 |
| 162 | 2026-06-04 |
Enhancement Strategies for Bioelectrocatalytic Conversion of Organic Waste
2026-May-28, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.5c00179
PMID:42232028
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综述 | 系统综述生物电催化转化有机废弃物的基本原理、发展历程、微生物工程策略及过程优化方向 | 独特整合生物创新与过程工程进展,从分子、微生物和反应器尺度提供协同优化的整体视角,并明确连接微生物碳/电子流工程与生物反应器设计及过程耦合 | NA | 建立加速生物电催化技术工业化应用的全面路线图 | 有机废弃物的生物电催化转化过程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 微生物 | 生物电催化回路 | 环境, 工业生物技术 |
| 163 | 2026-06-04 |
Modular Biosurface Engineering of Magnetotactic Bacteria for Multimodal Synergistic Cancer Therapy
2026-May-28, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.5c00177
PMID:42232030
|
研究论文 | 介绍一种可扩展的模块化生物表面工程平台,用于功能化野生型趋磁细菌,实现多模态协同癌症治疗 | 提出模块化生物表面工程平台,实现趋磁细菌的多功能化,整合小分子、聚合物、纳米颗粒和金属有机框架等多种材料,并以AMB-1@Fe-PDA为例展示肿瘤靶向递送、免疫抑制微环境重编程、先天免疫激活与光热-化学动力学治疗的协同机制 | 临床转化前需进一步评估长期生物安全性和有效性,以及规模化生产的可行性 | 开发一种可规模化、模块化的趋磁细菌生物表面工程平台,用于癌症治疗 | 趋磁细菌(AMB-1菌株) | 合成生物学 | 乳腺癌 | 纳米材料修饰 | 小鼠模型 | 实验数据 | 小鼠模型中两个治疗周期,中位生存期从45天延长至67天 | NA | 趋磁细菌 | Fe-PDA涂层与趋磁细菌结合的模块化生物表面工程平台 | 医学 |
| 164 | 2026-06-04 |
Hydrazinoacetic acid is a biosynthetic precursor of the bacterially produced nitramine, N-nitroglycine
2026-May-20, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00631-26
PMID:42159495
|
research paper | 本研究揭示了细菌中硝胺天然产物N-硝基甘氨酸(NNG)的生物合成途径,发现肼基乙酸(HAA)是其关键前体,并阐明了相关基因簇及生物合成机制 | 首次阐明细菌合成硝胺类化合物N-硝基甘氨酸的完整生物合成路径,发现赖氨酸和肼基乙酸为前体,并通过基因簇重构验证了HAA的产生,同时揭示了与氮丝氨酸途径的连接 | NA | 阐明N-硝基甘氨酸的生物合成途径,探索其作为含能材料的可持续生产潜力 | 细菌中的硝胺天然产物N-硝基甘氨酸及其生物合成前体 | NA | NA | 稳定同位素标记、液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)、生物信息学分析、基因簇重构 | NA | 质谱数据、晶体结构数据 | NA | NA | 细菌 | 硝胺生物合成途径 | 材料科学、工业生物技术 |
| 165 | 2026-06-04 |
A genetic manipulation tool based on the GP35 recombinase for targeted gene editing in mycoplasmas of ruminants
2026-Apr-27, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2026.113096
PMID:42055338
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研究论文 | 基于GP35重组酶的基因编辑工具,用于反刍动物支原体的靶向基因编辑 | 首次将噬菌体SPP1的GP35重组酶应用于牛支原体,实现基于质粒的长单链DNA重组工程,达到77.78%-100%的正向编辑率,且消除了随机脱氨风险 | 目前仅针对牛支原体验证,尚未在其它反刍动物支原体中进行广泛测试,且结构保守性分析有待进一步实验证实 | 开发针对反刍动物支原体的高效基因编辑工具,以推动病原机制研究和疫苗开发 | 反刍动物支原体病菌,尤其是牛支原体 | 合成生物学 | 牛支原体病,牲畜疾病 | 重组酶介导的基因编辑 | NA | 生物序列数据 | 多个牛支原体突变株,具体数量未明确提及 | GP35重组酶 | 牛支原体,反刍动物支原体 | 基于质粒的GP35-ssDNA重组系统,用于基因插入和缺失 | 医学,农业 |
| 166 | 2026-06-04 |
Microbial medicines: Unlocking the therapeutic potential of the microbiome in cancer treatment
2026-Apr-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114720
PMID:41690480
|
综述 | 评估工程微生物作为靶向癌症治疗药物的应用潜力 | 系统总结工程微生物在肿瘤微环境靶向治疗和抗肿瘤免疫增强中的最新进展 | 仍面临个体间差异、安全性问题和监管障碍等挑战 | 探讨微生物组在癌症治疗中的治疗潜力 | 工程微生物及其对胰腺癌、乳腺癌、肺癌和结直肠癌等的作用 | 合成生物学 | 胰腺癌,乳腺癌,肺癌,结直肠癌 | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 医学 |
| 167 | 2026-06-04 |
Prolyl hydroxylase-dependent proteolysis enables the orthogonal hypoxia responses in plants
2026-Apr-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71366-3
PMID:41957032
|
研究论文 | 该研究通过工程化三组分系统,在植物中实现了氧依赖性蛋白降解,从而模拟动物缺氧响应机制 | 首次在植物中构建了基于脯氨酰羟化酶的氧依赖性蛋白降解系统,实现了植物与动物缺氧响应机制的功能性整合 | 人工系统仅部分恢复缺氧响应,且主要验证了转录调控功能,未全面测试对其他细胞过程的影响 | 利用合成生物学重新编程植物信号通路,探索植物与动物缺氧响应机制的同源性 | 拟南芥中的转录因子和报告蛋白 | 合成生物学 | NA | 蛋白降解工程、转录调控分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9(推断用于突变体构建) | 拟南芥 | 氧依赖蛋白降解系统(三组分:脯氨酰羟化酶、底物标签、泛素连接酶) | 农业、作物改良 |
| 168 | 2026-06-04 |
In Situ Synthesis of Glycosaminoglycan-Mimicking Coatings Driven by Local Pathological Microenvironment: Boosting Bladder Mucosal Regeneration and Barrier Function
2026-Apr, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202505017
PMID:41589795
|
研究论文 | 利用内源性病理微环境触发原位合成糖胺聚糖模拟涂层,促进膀胱黏膜再生和屏障功能恢复 | 首次利用内源性过氧化氢和过氧化氢酶驱动原位聚合反应,在膀胱黏膜表面构建糖胺聚糖模拟涂层,实现抗炎和屏障功能修复的协同作用 | 研究仅在啮齿动物模型中进行验证,未评估在大型动物或人类中的效果和安全性 | 开发一种利用局部病理微环境驱动的原位合成策略,用于膀胱黏膜修复和屏障功能恢复 | 膀胱黏膜损伤的大鼠模型(环磷酰胺诱导的间质性膀胱炎) | 合成生物学、生物材料 | 间质性膀胱炎 | 内源性酶驱动聚合 | NA | 组织学图像、分子表达数据 | 多个大鼠模型样本,未具体说明数量 | NA | 大鼠 | 海藻酸寡糖-聚多巴胺共聚物的原位合成路径,用于模拟糖胺聚糖涂层 | 医学 |
| 169 | 2026-06-04 |
Microbial spies and bloggers: programming cells to convert environmental information into discernible signals
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103436
PMID:41616686
|
综述 | 本文综述了利用微生物作为生物传感器将环境信息转化为可检测信号的创新技术 | 通过整合电化学、气相色谱、高光谱成像和下一代测序等新型读取方法,以及利用宏基因组数据挖掘和变构蛋白开关设计来扩展传感组件 | 大部分生物传感器在难以成像的环境(如土壤、沉积物和废水)中应用存在严重限制 | 探讨如何编程微生物细胞和群落作为传感器,以在复杂环境中实现环境信息的转化和读取 | 微生物细胞和群落的生物传感器系统 | 合成生物学 | NA | 电化学、气相色谱、高光谱成像、下一代测序 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | E. coli, S. cerevisiae, B. subtilis, mammalian cells, plants | 生物传感器、环境响应电路 | 环境监测, 农业, 工业生物技术 |
| 170 | 2026-06-04 |
Development of microbial chassis for production of fungal natural products
2026-Mar, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2025.2608895
PMID:41592899
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综述 | 综述了用于真菌天然产物生产的微生物底盘开发 | 系统评估了多种微生物底盘的特征和途径重构策略,以提高异源表达效率 | 未提供具体实验数据,仅基于现有文献进行分析 | 优化微生物底盘以更有效地生产真菌天然产物 | 真菌天然产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 异源表达 | NA | NA | NA | NA | 微生物底盘 | 代谢途径重构 | 医药 |
| 171 | 2026-06-04 |
Yeast Stress Response to Synthetic Constructs
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00715
PMID:41615018
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综述 | 本文综述了合成构建物对酵母细胞造成的胁迫及其应对策略 | 提出了胁迫感知型设计原则,并总结了新兴缓解方法如CRISPR回路重连、适应性实验室进化、合成细胞器构建和数据驱动菌株工程 | 未提供具体实验数据或定量比较,仅基于文献总结 | 理解合成构建物与酵母胁迫通路的相互作用,开发更稳健的酵母系统 | 酿酒酵母中异源构建物引起的胁迫反应 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 胁迫感知回路设计 | 工业生物技术 |
| 172 | 2026-06-04 |
A Bacteroides synthetic biology toolkit to build an in vivo malabsorption biosensor
2026-Feb-19, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.12.052
PMID:41610848
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研究论文 | 开发了一套用于多形拟杆菌的合成生物学工具包,并利用其构建了检测肠道渗透压改变的生物传感器 | 首次在拟杆菌中构建了模块化的荧光转录报告电路,并利用工程菌实现了长期非侵入性的肠道渗透压监测 | 传感器仅在泄剂诱导的渗透性腹泻小鼠模型中验证,未在自然疾病状态或人体中测试 | 开发适用于肠道共生菌的遗传工具,构建用于监测肠道微环境变化的生物传感器 | 多形拟杆菌工程菌株及其在体外和小鼠肠道中的传感性能 | 合成生物学 | 肠道疾病 | 荧光蛋白表达、DNA调控系统、质粒整合 | 报告电路(转录调控) | 单细胞荧光信号 | 小鼠模型(泄剂诱导的腹泻组与对照组) | NA | 多形拟杆菌 | 可抑制启动子、DNA调控模块、荧光转录报告电路 | 医学 |
| 173 | 2026-06-04 |
Gut microecology empowers cancer immunotherapy: commensal microbiota-mediated mechanisms and translational prospects of PD-1/PD-L1 therapy
2026-Jan-29, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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综述 | 系统探讨共生微生物群在PD-1/PD-L1免疫治疗中的调控作用及其转化前景 | 通过多机制解析肠道微生物增强PD-1/PD-L1阻断疗效,包括代谢产物重塑肿瘤微环境和激活免疫通路,并整合多组学、合成生物学及精准干预策略 | 临床研究有限,基于微生物组的个性化免疫治疗策略仍需进一步验证 | 阐明肠道微生物群通过代谢产物和免疫途径调控PD-1/PD-L1免疫治疗效果的机制,并评估粪便微生物移植和益生菌干预的转化潜力 | 肠道共生微生物与肿瘤免疫微环境的相互作用 | 机器学习 | 癌症 | 粪菌移植、益生菌干预、多组学技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 174 | 2026-06-04 |
Synthetic Biology of Plants and Microbes for Agriculture, Environment, and Future Applications
2026-Jan-28, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00687
PMID:41609588
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综述 | 本文综述了合成生物学在植物和微生物工程中的应用,以推动农业、环境及未来技术的发展 | 利用新基因组构建工具、计算机辅助设计和人工智能实现“智能植物”与微生物群落协同工程,突破传统单基因改造限制 | 未具体说明现有技术在实际应用中的生物安全风险或规模化部署的挑战 | 推动合成生物学驱动下一次农业革命,并拓展植物工程在制造、基础设施、传感和修复领域的应用 | 植物(核、叶绿体、线粒体基因组)及其相关微生物(真菌、细菌、古菌) | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 植物, 真菌, 细菌, 古菌 | 环境响应电路、形态改变电路、威胁响应电路 | 农业, 环境, 制造, 基础设施, 传感, 修复 |
| 175 | 2026-06-04 |
Yeast Biosensors for the Safety of Fermented Beverages
2026-Jan-16, Biosensors
DOI:10.3390/bios16010064
PMID:41590316
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综述 | 综述酵母生物传感器在发酵饮料安全检测中的应用与发展 | 系统总结了酵母生物传感器在发酵饮料安全检测中的优势,包括实时检测、低成本、可集成于发酵系统,以及利用酵母的GRAS特性确保安全 | 酵母生物传感器仍主要停留在实验室规模,与工业广泛应用之间存在明显差距,需进一步研究其鲁棒性、可扩展性和监管整合 | 探讨酵母生物传感器在发酵饮料生产中保障安全性和品质的潜力,推动更安全、更高质量产品的制造 | 酵母生物传感器及其在啤酒、葡萄酒、康普茶等发酵饮料中的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 酿酒酵母 | 报告系统(如荧光、颜色变化或电信号) | 食品 |
| 176 | 2026-06-04 |
Development of cell-free transcription translation
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.003
PMID:41581991
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综述 | 综述了无细胞转录翻译系统的开发历程、现状及未来发展方向 | 详细阐述了无细胞系统从最初的大肠杆菌提取物发展到涵盖多种生物来源的综合平台,并指出其在快速高效合成蛋白质、增强化学抗性和简化标记等方面的独特优势 | 存在成本高、蛋白质产量有限、缺乏复杂翻译后修饰以及提取物不稳定等挑战 | 介绍无细胞转录翻译系统的开发进展及其在合成生物学和生物制药中的应用潜力 | 无细胞转录翻译系统(TXTL) | 合成生物学 | NA | 无细胞转录翻译 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 酵母, 真核细胞 | NA | 合成生物学, 生物制药 |
| 177 | 2026-06-04 |
Advances in protein engineering
2026, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2025.11.002
PMID:42191275
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综述 | 综述蛋白质工程在医学、食品和环境等领域的最新进展,重点关注人类疾病治疗和生物医学科学 | 系统总结了蛋白质工程在CRISPR/Cas系统、高通量数据和合成生物学中的关键成就,涵盖进化、理性设计、半理性设计和混合方法等创新技术 | 讨论了蛋白质工程应用的当前挑战和伦理考量 | 回顾蛋白质工程的最新发展,强调其在人类疾病特别是癌症治疗中的变革潜力 | 蛋白质工程相关技术及其在治疗性蛋白质、抗体工程、酶合成中的应用 | 蛋白质工程 | 癌症 | 蛋白质工程、CRISPR/Cas、高通量数据 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | 医学、食品、环境、工业生物技术 |
| 178 | 2026-06-04 |
The synergy of foundation technologies and computer sciences advances microbial expression systems in biomedical genetic engineering
2026, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2025.11.007
PMID:42191273
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综述 | 基础技术与计算机科学的协同作用推动了生物医学基因工程中微生物表达系统的发展 | 系统阐述了合成生物学、CRISPR-Cas9等基因组编辑工具、下一代测序与组学技术、人工智能以及系统生物学与代谢建模等多学科技术的协同潜力,并提出克服当前障碍的策略 | 仍存在脱靶效应、代谢负担和放大生产限制等挑战 | 探讨基础生物技术与计算科学如何协同推进生物医学基因工程中微生物表达系统的进步 | 微生物表达系统 | 机器学习 | NA | 下一代测序, 组学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | NA | 医学 |
| 179 | 2026-06-04 |
Protein Design Enters the Artificial Intelligence Era: Foundations, Tools, and Emerging Paradigms
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0105
PMID:42231905
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综述 | 本文综述了人工智能在蛋白质设计领域的应用,涵盖深度学习、蛋白质语言模型和知识图谱等技术,以及它们在序列-结构-功能关系解析中的进展 | 系统总结了AI在蛋白质设计中的新范式,包括AlphaFold2的结构预测精度和Transformer模型从头序列设计,突出了计算与实验整合的趋势 | 模型可解释性不足、训练数据存在偏差以及实验验证率较低仍是主要挑战 | 分析人工智能驱动蛋白质设计的计算方法、基准指标及机器学习与实验管线的整合 | 蛋白质序列、结构和功能关系,以及相关计算工具和模型 | 机器学习 | NA | 深度学习, 蛋白质语言模型, 知识图谱, AlphaFold2, Transformer | 深度学习模型, 蛋白质语言模型, Transformer | 蛋白质序列数据, 结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医疗保健, 工业生物技术, 合成生物学 |
| 180 | 2026-06-04 |
Intratumoral microbiota: synergistic reshaping of lung cancer microenvironment via inflammation and immunity
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1653727
PMID:41613126
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综述 | 探讨瘤内微生物群通过炎症和免疫机制重塑肺癌微环境,并展望基于合成生物学的工程菌和纳米抗生素在免疫治疗中的应用 | 首次系统阐述瘤内微生物群在肺癌微环境中通过分泌代谢物、激活信号通路、招募免疫抑制细胞及上调免疫检查点分子表达来主动诱导慢性炎症并促进肿瘤进展,并评估了基于合成生物学的工程菌和靶向纳米抗生素重塑免疫微环境的潜力 | 肺组织低生物量导致测序数据易受试剂污染和批次效应影响,且常忽视真菌和病毒等非细菌成分在肿瘤生态系统中的协同作用 | 阐明瘤内微生物群影响肺癌细胞和肿瘤微环境的机制,并探索其临床转化潜力 | 瘤内微生物群及其在肺癌微环境中的作用 | 微生物组学 | 肺癌 | 高通量测序, 多组学技术 | NA | 测序数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |