合成生物学相关文章
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当前共找到 3211 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-05-29 |
Improving Bacillus subtilis as Biological Chassis Performance by the CRISPR Genetic Toolkit
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00844
PMID:40040244
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review | 本文讨论了利用CRISPR基因工具包提高枯草芽孢杆菌作为生物底盘性能的最新进展 | 介绍了CRISPR技术在枯草芽孢杆菌中的应用，包括基因编辑、转录调控和酶调节等方面的最新进展 | 未提及具体实验数据或样本量，可能缺乏实证支持 | 提高枯草芽孢杆菌作为工业底盘菌的性能，使其能与传统工业微生物如大肠杆菌和酵母相媲美 | 枯草芽孢杆菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | NA |
| 162 | 2025-05-29 |
Synthetic Biology Strategies for the Production of Natural Colorants and Their Non-Natural Derivatives
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00799
PMID:40066730
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review | 本文综述了合成生物学策略在天然色素及其非天然衍生物生产中的应用 | 讨论了通过合成生物学方法提高天然色素产量及扩展其非天然衍生物颜色谱的策略 | 天然色素的稳定性、颜色谱有限以及从自然资源中提取的低产量问题尚未完全解决 | 探索利用合成生物学方法生产天然色素及其非天然衍生物的策略 | 天然色素及其非天然衍生物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
| 163 | 2025-05-29 |
A Nitrate/Nitrite Biosensor Designed with an Antiterminator for In Vivo Diagnosis of Colitis Based on Bacteroides thetaiotaomicron
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00602
PMID:39801064
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research paper | 本研究开发了一种基于Bacteroides thetaiotaomicron的抗终止微生物全细胞生物传感器，用于检测小鼠结肠炎 | 利用抗终止元件设计硝酸盐/亚硝酸盐诱导型启动子，优化了生物传感器对炎症环境中硝酸盐和亚硝酸盐的敏感性和特异性响应 | 研究仅在小鼠模型中进行初步评估，尚未在人体中进行验证 | 开发一种基于Bacteroides thetaiotaomicron的生物传感器，用于体内诊断结肠炎 | Bacteroides thetaiotaomicron和小鼠溃疡性结肠炎模型 | 合成生物学 | 结肠炎 | 合成生物学技术、微生物全细胞生物传感器 | 微生物全细胞生物传感器(MWCB) | 生物传感器响应数据 | 化学诱导的小鼠溃疡性结肠炎模型 |
| 164 | 2025-05-29 |
Construction and Characterization of MoClo-Compatible Vectors for Modular Protein Expression in E. coli
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00564
PMID:39801078
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研究论文 | 本研究构建并表征了与MoClo兼容的低拷贝和中拷贝载体，扩展了现有的MoClo工具包，用于在大肠杆菌中实现模块化蛋白质表达 | 扩展了现有的MoClo工具包，增加了低拷贝(p15A)和中拷贝(pBR322)载体，实现了蛋白质表达范围覆盖500倍的荧光输出差异 | 研究仅限于大肠杆菌系统，未在其他宿主中验证载体的适用性 | 开发兼容MoClo的载体系统，优化蛋白质表达水平 | 大肠杆菌中的蛋白质表达 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆, MoClo技术 | NA | DNA构建体, 荧光输出数据 | NA |
| 165 | 2025-05-29 |
Microbial Production of Ectoine: A Review
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00490
PMID:39834017
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review | 本文综述了微生物生产四氢嘧啶的策略，包括野生菌株筛选、突变育种和模型菌株的代谢工程 | 综述了利用合成生物学和代谢工程技术替代传统嗜盐细菌生产四氢嘧啶的方法，提高产量且环保 | NA | 探讨更经济高效的四氢嘧啶生产方法以满足市场需求 | 四氢嘧啶及其微生物生产 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 166 | 2025-05-29 |
Do the Shuffle: Expanding the Synthetic Biology Toolkit for Shufflon-like Recombination Systems
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00790
PMID:39869770
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研究论文 | 本文研究了天然DNA倒位系统在合成生物学中的应用，特别是Shufflon倒位酶（SI）的改进和扩展 | 鉴定了14个先前未经测试的SI基因及其位点，并开发了一种基于单分子测序的测定方法，以量化这些酶的倒位速率并确定正交SI/位点对 | 研究中仅使用了公开数据库中的SI基因，可能未涵盖所有潜在的SI基因 | 扩展合成生物学工具箱，改进Shufflon倒位酶的应用 | Shufflon倒位酶（SI）基因及其识别位点 | 合成生物学 | NA | 单分子测序 | NA | DNA序列数据 | 14个SI基因 |
| 167 | 2025-05-29 |
Cell-Free Systems to Mimic and Expand Metabolism
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00729
PMID:39878226
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research paper | 该文章探讨了无细胞合成生物学在代谢和遗传程序中的应用及其扩展潜力 | 将无细胞系统用于原型化代谢路径和设计新型反应网络，以探索非自然化学反应和替代代谢路径 | 目前仅探索了无细胞系统中代谢可能性的一小部分，且主要依赖模式生物的提取物 | 理解和工程化基于生物的化学转化 | 无细胞系统及其在代谢和遗传程序中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 168 | 2025-05-29 |
Considerations for Domestication of Novel Strains of Filamentous Fungi
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00672
PMID:39883596
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综述 | 本文探讨了丝状真菌作为生物技术资源的潜力及其驯化新菌株的考虑因素 | 综述了利用合成生物学和系统生物学工具开发丝状真菌作为微生物细胞工厂的新方法 | 未提及具体实验数据或案例研究 | 探讨丝状真菌在生物技术应用中的潜力和挑战 | 丝状真菌 | 生物技术 | NA | 合成生物学、系统生物学 | NA | NA | NA |
| 169 | 2025-05-29 |
Characterization of Rationally Designed CRISPR/Cas9-Based DNA Methyltransferases with Distinct Methyltransferase and Gene Silencing Activities in Human Cell Lines and Primary Human T Cells
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00569
PMID:39898483
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研究论文 | 本文描述了通过合理设计CRISPR/Cas9基础的DNA甲基转移酶，在人类细胞系和原代人类T细胞中实现不同的甲基化和基因沉默活性 | 通过突变DNMT3A的催化核心，稳定了dCas9-DNMT3A/3L融合蛋白在Jurkat T细胞中的表达，同时保持了DNA甲基化和基因沉默性能 | 研究主要局限于细胞系和原代T细胞，可能限制了在其他细胞类型中的适用性 | 扩展表观遗传编辑工具包，为工程化dCas基础的DNMTs在原代哺乳动物细胞类型中的应用提供路线图 | 人类细胞系和原代人类T细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, DNA甲基化 | dCas9-DNMT3A/3L | 基因表达和DNA甲基化数据 | 多种人类细胞系和供体来源的人类T细胞 |
| 170 | 2025-05-29 |
DRIMS: A Synthetic Biology Platform that Enables Deletion, Replacement, Insertion, Mutagenesis, and Synthesis of DNA
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00649
PMID:39902634
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研究论文 | 介绍了一种名为DRIMS的合成生物学平台，该平台能够高效地进行DNA的删除、替换、插入、突变和合成 | DRIMS平台通过PCR技术实现DNA的多种修改和合成，无需依赖recA重组途径，且操作简单、成本低、速度快 | 未提及平台在大规模或复杂DNA序列处理中的表现 | 开发一种高效、简单、经济的DNA修改和合成平台，以加速合成生物学领域的发展及治疗策略的开发 | DNA序列 | 合成生物学 | 癌症 | PCR | NA | DNA序列数据 | 进行了多种DNA修改和合成实验，包括4次删除、64次替换、4次嵌合抗原受体组件替换、51次人工microRNA插入、5种点突变及8段DNA序列合成 |
| 171 | 2025-05-29 |
BioTRY: A Comprehensive Knowledge Base for Titer, Rate, and Yield of Biosynthesis
2025-01-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00347
PMID:39423319
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research paper | 介绍BioTRY，一个包含生物合成滴度、速率和产量(TRY)数据的综合知识库 | BioTRY是首个可用的生物合成TRY原始研究数据库，包含超过52,000条TRY条目 | 未明确提及具体局限性 | 评估发酵过程的经济可行性，为研究人员和决策者提供生物合成发展现状的参考 | 生物合成过程中的滴度、速率和产量(TRY)数据 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 生物合成TRY数据 | >5,000种生化物质和>3,800种菌株，包含52,000条TRY条目 |
| 172 | 2025-05-29 |
CRISPR/Cas-Based Gene Editing Tools for Large DNA Fragment Integration
2025-01-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00632
PMID:39680738
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综述 | 本文综述了过去五年中用于整合大片段DNA的方法，特别关注新兴的CRISPR相关技术 | 重点讨论了同源定向修复（HDR）及新兴的CRISPR转座酶和CRISPR重组酶策略，这些技术有望革新复杂疾病的基因治疗 | 现有技术在整合大片段基因时面临效率低下、脱靶效应和高成本等问题 | 开发高效工具，以精确插入千碱基大小的DNA片段到哺乳动物基因组中，支持基因工程、基因治疗和合成生物学应用 | 大片段DNA的整合技术 | 基因编辑 | 遗传病 | CRISPR/Cas, HDR, CRISPR-transposase, CRISPR-recombinase | NA | NA | NA |
| 173 | 2025-05-29 |
Biological Switches: Past and Future Milestones of Transcription Factor-Based Biosensors
2025-01-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00689
PMID:39709556
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综述 | 本文回顾了转录因子生物传感器的发展历程，分析了从基础研究到工程策略的关键里程碑，并探讨了未来的前景和挑战 | 全面梳理了转录因子生物传感器从基础研究到工程应用的发展历程，并提出了未来研究方向 | 未深入探讨具体技术细节和实施难点 | 回顾转录因子生物传感器的发展历程，分析关键里程碑，并探讨未来前景 | 转录因子生物传感器 | 合成生物学 | NA | 高通量分析工具、DNA随机化策略、正向工程、高级蛋白质工程工作流程 | NA | NA | NA |
| 174 | 2025-05-29 |
Fine-Tuning Genetic Circuits via Host Context and RBS Modulation
2025-01-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00551
PMID:39754601
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research paper | 该研究通过改变核糖体结合位点组成和宿主环境，探索了遗传开关的设计空间，并展示了如何通过这两种方式的结合来精细调节开关的性能 | 首次将宿主环境作为遗传电路设计的重要变量进行系统探索，并展示了其与核糖体结合位点调制相结合在性能调节上的潜力 | 仅测试了9种核糖体结合位点组合和3种宿主环境，样本量相对有限 | 探索遗传开关设计中宿主环境和核糖体结合位点调制对性能的影响 | 遗传开关（toggle switch） | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计 | NA | 生物性能指标数据 | 27种电路变体（9种核糖体结合位点×3种宿主环境） |
| 175 | 2025-05-29 |
ATP Regeneration from Pyruvate in the PURE System
2025-01-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00697
PMID:39754602
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研究论文 | 本研究通过整合基于丙酮酸氧化酶、乙酸激酶和过氧化氢酶的ATP再生系统，扩展了PURE系统的功能 | 提出了一种新的ATP再生途径，能够独立或与现有肌酸系统结合使用，显著提高蛋白质合成效率 | 需要高初始浓度的磷酸盐缓冲液（约10 mM） | 工程化改造PURE系统以提高其蛋白质合成能力 | PURE系统及其ATP再生机制 | 合成生物学 | NA | 细胞游离蛋白质合成系统 | NA | 生化实验数据 | 多批次自制PURE系统及商业PURExpress系统 |
| 176 | 2025-05-29 |
Long-Term Protein Synthesis with PURE in a Mesoscale Dialysis System
2025-01-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00618
PMID:39757539
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研究论文 | 本研究开发了一种易于组装的中尺度透析系统，用于延长无细胞系统中的蛋白质合成时间和提高产量 | 利用商业可用组件构建的中尺度透析系统，实现了PURE无细胞系统中蛋白质合成的长期稳定性和高产量 | 未提及系统在大规模生产中的应用效果 | 解决无细胞系统（特别是PURE系统）反应寿命短和产量低的问题 | PURE无细胞系统和GFP蛋白质合成 | 合成生物学 | NA | 透析技术 | NA | 实验数据 | 未明确说明样本数量 |
| 177 | 2025-05-29 |
Identification of acidic stress-responsive genes and acid tolerance engineering in Synechococcus elongatus PCC 7942
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12984-5
PMID:38204133
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研究论文 | 本研究通过RNA测序比较转录组分析，在模型蓝藻Synechococcus elongatus PCC 7942中鉴定了酸性应激响应基因，并通过基因敲除和过表达实验验证了这些基因在酸耐受性中的作用 | 鉴定了六个参与酸性应激响应的基因，并通过过表达chlL和chlN基因成功提高了S. elongatus PCC 7942的酸耐受性 | 研究仅针对S. elongatus PCC 7942，未在其他蓝藻中进行验证 | 探究蓝藻的酸应激响应机制并提高其酸耐受性 | Synechococcus elongatus PCC 7942蓝藻 | 合成生物学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 178 | 2025-05-29 |
Regulation of genes encoding polysaccharide-degrading enzymes in Penicillium
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12892-8
PMID:38170318
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综述 | 本文综述了青霉菌中多糖降解酶(PPDE)的分布、功能、生物合成调控机制及高产PPDE菌株的分子育种研究进展 | 总结了青霉菌PPDE的最新研究进展，包括其分布、功能、调控机制及分子育种策略 | 作为小型综述，可能未涵盖该领域所有相关研究 | 促进通过代谢工程和合成生物学开发真菌PPDE生产，推动PPDE工业生物精炼应用 | 青霉菌(特别是草酸青霉)及其产生的植物多糖降解酶(PPDE) | 合成生物学 | NA | 分子育种、代谢工程 | NA | NA | NA |
| 179 | 2025-05-29 |
Microbial host engineering for sustainable isobutanol production from renewable resources
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12821-9
PMID:38175234
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综述 | 本文综述了利用基因工程技术改造微生物宿主以提高可再生资源生产异丁醇的策略和合成生物学方法 | 总结了近年来通过基因工程改造天然和非天然微生物宿主以提高异丁醇产量的策略 | 讨论了工程化微生物宿主面临的挑战，如底物范围有限、溶剂耐受性低等问题 | 提高可再生资源生产生物燃料异丁醇的效率 | 微生物宿主 | 合成生物学 | NA | 基因工程技术 | NA | NA | NA |
| 180 | 2025-05-29 |
Minimisation of metabolic networks defines a new functional class of genes
2024-10-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52816-2
PMID:39482321
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研究论文 | 该研究通过构建最小代谢网络（MMNs）定义了一类新的功能基因——网络效率决定因子（NEDs） | 提出了一种新的计算方法来构建最小代谢网络，并定义了一类新的功能基因NEDs | 研究仅基于计算机模拟，尚未进行实验验证 | 理解代谢网络的起源并提高生物技术过程的效率 | 基因组尺度的代谢模型中的基因 | 合成生物学 | NA | 计算机模拟方法 | NA | 基因组数据 | NA |