合成生物学相关文章
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当前共找到 3132 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-05-10 |
Cleavable donor-assisted CRISPR/Cas9 system significantly improves the efficiency of large DNA insertion in Physcomitrium patens
2025-Feb, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70020
PMID:39981890
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研究论文 | 开发了一种可切割供体辅助的CRISPR/Cas9系统，显著提高了在苔藓植物Physcomitrium patens中大片段DNA插入的效率 | 引入了体内可切割（IVC）供体设计，通过Cas9核酸酶识别位点释放线性模板，显著提高了大片段DNA的插入效率 | 目前仅在苔藓植物中验证，对其他作物的适用性需要进一步验证 | 提高CRISPR/Cas9系统在大片段DNA插入中的效率 | 苔藓植物Physcomitrium patens | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑技术 | NA | DNA序列数据 | 使用了两种不同的sgRNA和四种不同的DNA插入片段进行验证 |
| 162 | 2025-05-10 |
Innovative applications and research advances of bacterial biosensors in medicine
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1507491
PMID:40336836
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综述 | 本文综述了细菌生物传感器在医学领域的应用和最新进展，并讨论了其研究和应用中存在的挑战和障碍 | 利用合成生物学和基因工程的突破性进展，定制具有卓越检测特性的细菌，为早期疾病诊断和治疗监测提供了强大的技术基础 | 讨论了细菌生物传感器在研究和应用中仍面临的挑战和障碍 | 探讨细菌生物传感器在医学领域的应用和研究进展 | 细菌生物传感器 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
| 163 | 2025-05-10 |
Simultaneous selection of nanobodies for accessible epitopes on immune cells in the tumor microenvironment
2023-11-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43038-z
PMID:37978291
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研究论文 | 介绍了一种名为INSPIRE-seq的新方法，用于在复杂环境中筛选纳米抗体 | 开发了INSPIRE-seq技术，能够并行富集穿透肿瘤微环境的免疫细胞结合纳米抗体 | 未提及具体样本量或实验验证的详细限制 | 开发筛选纳米抗体的新技术，用于治疗性生物制剂的靶向分子发现 | 肿瘤微环境中的免疫细胞 | 合成生物学 | 肿瘤 | NGS, 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 结构建模与对接研究 | NA | 测序数据, 图像数据 | NA |
| 164 | 2025-05-09 |
Engineered Bacteria Convert a 3-Bit Binary Code to a 3-Bit Gray Code by Multicellular Artificial-Neural-Network-Type Architecture
2025-May-07, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00145
PMID:40333022
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研究论文 | 利用基因工程细胞构建单层人工神经网络，实现3位二进制码到格雷码的转换 | 首次使用基因工程细胞构建人工神经网络实现二进制码到格雷码的转换 | 研究尚处于早期阶段，计算能力和应用范围有限 | 探索基因工程细胞在神经形态计算中的应用 | 基因工程细胞构建的人工神经网络 | 合成生物学 | NA | 基因工程技术 | ANN（人工神经网络） | 化学输入信号和荧光蛋白表达 | 五个工程细胞群体 |
| 165 | 2025-05-09 |
Biofabrication of microstructured bacterial ecosystems using chaotic bioprinting: advancing in vitro research for microbial engineering
2025-May-07, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/add568
PMID:40334674
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research paper | 该研究利用混沌3D打印技术制造具有多层微结构的水凝胶构建体，以模拟自然微生物生态系统中的空间组织 | 采用混沌3D打印技术创建微结构化的细菌共培养体系，模拟自然微生物生态系统的部分隔离现象 | 研究仅使用了三种细菌作为简化模型，可能无法完全代表复杂的人类肠道微生物群 | 推进微生物工程领域的体外研究，特别是微生物相互作用的理解 | 由鼠李糖乳杆菌、双歧杆菌和大肠杆菌组成的细菌联合体，作为人类肠道微生物群的简化模型 | 微生物工程 | NA | 混沌3D打印、荧光显微镜、菌落计数、定量聚合酶链反应(qPCR) | NA | 微生物生长动态数据 | 三种细菌的共培养体系 |
| 166 | 2025-05-09 |
Molecular circuits for genomic recording of cellular events
2025-May-06, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2025.04.004
PMID:40335327
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review | 本文综述了基因组记录领域的最新进展，特别是关于构建分子电路以记录细胞事件的方法 | 探讨了新兴合成生物学工具在构建多样化传感器和分子电路中的应用，以实现细胞事件的基因组记录 | 目前直接记录和重建过去细胞事件的方法仍然有限，其揭示细胞命运决定新见解的潜力尚未实现 | 开发新的传感模块和遗传电路架构，以将过去的细胞状态忠实编码到基因组DNA记录中 | 细胞事件和细胞状态 | 合成生物学 | NA | CRISPR-based genome editing | NA | genomic DNA | NA |
| 167 | 2025-05-09 |
Decoding the Minimal Translation System of the Plasmodium falciparum Apicoplast: Essential tRNA-modifying Enzymes and Their Roles in Organelle Maintenance
2025-May-06, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169156
PMID:40335414
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研究论文 | 本研究通过比较基因组学和蛋白质定位预测工具，鉴定了疟原虫顶质体中16种tRNA修饰酶，并实验验证了其中14种的定位，揭示了顶质体翻译系统依赖于一组集中在反密码子环的最小tRNA修饰 | 首次系统地鉴定了疟原虫顶质体中tRNA修饰酶的最小集合，并确定了其中6种对寄生虫生存至关重要的酶 | 研究中两种基因无法被删除，其中一种可能具有顶质体外的必需功能，另一种可能在顶质体中扮演不可或缺的角色 | 研究疟原虫顶质体中最小翻译系统的tRNA修饰酶及其在细胞器维持中的作用 | 疟原虫顶质体中的tRNA修饰酶 | 分子生物学 | 疟疾 | 比较基因组学、蛋白质定位预测、基因敲除 | NA | 基因组数据、蛋白质定位数据 | 16种预测的tRNA修饰酶，其中14种被实验验证 |
| 168 | 2025-05-09 |
Elucidation and de novo reconstitution of glyceollin biosynthesis
2025-May-05, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.04.003
PMID:40211535
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研究论文 | 本研究揭示了glyceollins的完整生物合成途径，并通过合成生物学和代谢工程在酵母中实现了其从简单碳源的生产 | 发现了glyceollins生物合成途径中未表征的还原酶基因和五个P450酶，首次实现了glyceollins在微生物宿主中的从头合成 | NA | 阐明glyceollins的生物合成途径并实现其可持续生产 | 大豆中的glyceollins化合物 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达、体外酶表征、酵母喂养研究 | NA | NA | NA |
| 169 | 2025-05-09 |
Engineering a newly identified alcohol dehydrogenase from Sphingobium Sp. for efficient utilization of nicotinamide cofactors biomimetics
2025-May-05, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-025-00870-z
PMID:40325297
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研究论文 | 本研究鉴定了一种来自Sphingobium sp. SYK-6的醇脱氢酶(SpADH2)，并对其进行了半理性工程改造，以提高其对合成烟酰胺辅因子仿生物(NCBs)的利用效率 | 首次报道了一种能够利用全合成NCBs的天然ADH，并通过工程改造显著提高了其催化效率和辅因子特异性 | NA | 开发能够高效利用低成本NCBs的氧化还原酶 | 来自Sphingobium sp. SYK-6的醇脱氢酶(SpADH2) | 合成生物学 | NA | 半理性工程改造 | NA | 酶活性数据 | 野生型SpADH2及其变体(H43L, A290I, H43L/A290I) |
| 170 | 2025-05-09 |
Rewiring heme biosynthesis for improved pollutant degradation by Shewanella oneidensis
2025-May-03, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2025.121777
PMID:40324620
|
研究论文 | 通过改造希瓦氏菌的血红素生物合成途径，提高其降解污染物的能力 | 采用模块化合成生物学方法，设计四个功能模块以重定向代谢途径，显著提高血红素水平，从而增强电子传递效率和污染物降解能力 | 研究仅针对希瓦氏菌，未在其他电活性微生物中验证 | 解决电活性微生物中细胞外电子传递速率慢的问题，提高生物电化学系统的应用潜力 | 希瓦氏菌 | 合成生物学 | NA | 模块化合成生物学方法 | NA | 实验数据 | NA |
| 171 | 2025-05-09 |
Directed evolution of hydroxylase XcP4H for enhanced 5-HTP production in engineered probiotics to treat depression
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142250
PMID:40113000
|
研究论文 | 通过定向进化技术增强工程益生菌中羟化酶XcP4H的活性，以促进5-HTP的生产，用于治疗抑郁症 | 采用基于遗传密码扩展的高通量筛选方法对XcP4H进行定向进化，显著提高了5-HTP的产量，并通过分子动力学模拟揭示了其机制 | 研究主要在小鼠模型中进行，尚未进行人体临床试验 | 解决5-HTP的药代动力学限制，开发一种新型的抑郁症治疗方法 | 羟化酶XcP4H和工程益生菌Escherichia coli Nissle 1917 (EcN) | 合成生物学 | 抑郁症 | 定向进化、分子动态模拟、高通量筛选 | NA | NA | 小鼠模型 |
| 172 | 2025-05-09 |
Revolutionizing immunotherapy: The next frontier in CAR T-cell engineering
2025-Apr-28, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.104751
PMID:40306469
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review | 本文综述了嵌合抗原受体（CAR）T细胞疗法的发展历程及其在癌症治疗中的应用 | 探讨了从第一代到第五代CAR T细胞的设计进展及其在增强T细胞激活、持久性和疗效方面的关键改进 | 在实体瘤治疗中仍面临免疫抑制性肿瘤微环境和抗原异质性的挑战 | 探索CAR T细胞疗法在癌症治疗中的潜力及其未来发展方向 | CAR T细胞疗法及其在癌症治疗中的应用 | 免疫疗法 | 癌症 | CAR T细胞工程 | NA | NA | NA |
| 173 | 2025-05-09 |
A novel NAC36-MYB18-TAT2 model regulates the synthesis of phenolic acid in Salvia miltiorrhiza Bunge
2025-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.140987
PMID:39952526
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研究论文 | 本文揭示了丹参中酚酸合成的NAC36-MYB18-TAT2分子模型调控机制 | 首次报道了SmTAT2在丹参酚酸代谢途径中的生物学功能及调控机制，并揭示了NAC36-MYB18-TAT2分子模型的作用 | NA | 研究丹参中酚酸合成的分子调控机制 | 丹参（Salvia miltiorrhiza Bunge）中的酚酸代谢途径 | 合成生物学 | NA | 转基因实验（过表达和CRISPR/Cas9）、分子互作技术（酵母单杂交、双荧光素酶报告基因检测和EMSA） | NAC36-MYB18-TAT2分子模型 | 分子生物学数据 | NA |
| 174 | 2025-05-09 |
Metabolite-Responsive Control of Transcription by Phase Separation-Based Synthetic Organelles
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00633
PMID:39954260
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research paper | 该研究通过基于液-液相分离的合成细胞器，将代谢信号转化为基因转录调控 | 利用液-液相分离技术构建合成细胞器，实现代谢信号对基因转录的可逆和剂量依赖性调控 | 研究仅针对丙酮酸代谢信号，未验证其他代谢物的适用性 | 开发具有生命感知和适应能力的合成生物材料 | 基于PdhR阻遏蛋白和液-液相分离的合成细胞器系统 | synthetic biology | NA | liquid-liquid phase separation, genetic engineering | NA | NA | NA |
| 175 | 2025-05-09 |
Advancing cellulose utilization and engineering consolidated bioprocessing yeasts: current state and perspectives
2025-Feb-13, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-025-13426-0
PMID:39939397
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综述 | 本文综述了利用酿酒酵母进行纤维素酶表达的策略，以及通过现代合成生物学工具优化CBP酵母菌株的最新进展 | 总结了纤维素酶在酵母中表达的策略，并探讨了如何通过现代合成生物学工具优化CBP酵母菌株 | 目前报道的一步法纤维素底物转化为乙醇的滴度和生产率远低于工业要求 | 探讨如何通过工程化酵母菌株实现木质纤维素生物质的高效生物转化 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 合成生物学 | NA | 纤维素酶表达系统、合成生物学工具 | NA | NA | NA |
| 176 | 2025-05-09 |
Analysis of the Alkaline Resistance Mechanism of Halomonas alkalicola CICC 11012 s by Proteomics and Metabolomics
2025-Feb-13, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-024-04056-2
PMID:39945829
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研究论文 | 通过蛋白质组学和代谢组学分析嗜碱菌Halomonas alkalicola CICC 11012s的耐碱机制 | 首次结合蛋白质组学和代谢组学技术研究嗜碱菌的耐碱分子机制，并利用CRISPR技术构建突变体验证tonb基因在耐碱机制中的重要作用 | 研究仅针对Halomonas alkalicola CICC 11012s菌株，未涉及其他嗜碱菌的比较分析 | 探索嗜碱菌对碱性胁迫的响应分子机制 | 嗜碱菌Halomonas alkalicola CICC 11012s及其CRISPR突变体 | 合成生物学 | NA | 蛋白质组学, 代谢组学, CRISPR | NA | 蛋白质组数据, 代谢组数据 | 野生型菌株和CRISPR突变体菌株 |
| 177 | 2025-05-09 |
Oligonucleotide subsets selection by single nucleotide resolution barcode identification
2025-Feb-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56856-0
PMID:39939320
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研究论文 | 介绍了一种利用序列特异性循环核苷酸合成和模板寡核苷酸阻断的寡核苷酸子集选择方法 | 无需引物进行选择性杂交，能够用少于五个核苷酸的条形码长度编码和选择数百个子集 | NA | 解决复杂寡核苷酸库中子集选择的问题 | 寡核苷酸库 | 合成生物学 | NA | 序列特异性循环核苷酸合成 | NA | NA | NA |
| 178 | 2025-05-09 |
A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules
2025-Feb-12, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2025.01.002
PMID:39947133
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meta-analysis | 通过对炎症性肠病(IBD)患者肠道微生物组中小分子生物合成基因簇(BGCs)的荟萃分析，发现了与克罗恩病(CD)显著相关的两个梭菌来源的BGCs，并鉴定了六种脂肪酸酰胺作为这些BGCs的产物 | 首次鉴定了与克罗恩病相关的微生物组来源小分子，并揭示了这些分子通过破坏肠道通透性加剧疾病的机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本中的验证仍需进一步研究 | 探索肠道微生物组在炎症性肠病发病机制中的作用 | 炎症性肠病患者的肠道微生物组 | 微生物组学 | 炎症性肠病 | 宏基因组测序，合成生物学 | NA | 宏基因组数据 | IBD患者和健康对照的肠道微生物组样本 |
| 179 | 2025-05-09 |
Efficient Site-Directed Mutagenesis Mediated by Primer Pairs with 3'-Overhangs
2025-Feb, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70104
PMID:39945594
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研究论文 | 提出了一种优化的定点诱变方案，利用具有3'端突出部分的引物对提高诱变效率和降低错误率 | 通过部分互补的引物对设计显著提高诱变效率，平均效率达到约50%，部分情况下接近100%的理想阈值 | 未明确说明该方法在不同基因长度或复杂结构区域的适用性 | 开发更高效可靠的定点诱变方法 | 质粒DNA | 分子生物学 | NA | 定点诱变技术 | NA | NA | 每次诱变反应仅需分析3个菌落 |
| 180 | 2025-05-09 |
The Establishment of Artificial RNA Cascade Circuits for Gene Regulation Based on Doxycycline-Induced Pre-mRNA Alternative Splicing
2025-Jan-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26031163
PMID:39940931
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研究论文 | 本研究开发了一种基于多西环素诱导的前mRNA选择性剪接的人工RNA级联电路，用于基因调控 | 通过改变开关中的适配体2碱基对，意外获得了具有完全相反调控功能的'开启开关'CTM和'关闭开关'C2ITetR>4A，并将其与L7Ae/k-turn模块整合，创建了内含子剪接的双开关RNA级联系统 | NA | 为哺乳动物合成生物学提供有价值的工具，实现基因表达的精确预测和动态调控 | 人工嵌合内含子模块、RNA核糖开关、TetR适配体 | 合成生物学 | NA | 前mRNA选择性剪接 | NA | NA | NA |