合成生物学相关文章
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当前共找到 4711 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-03-23 |
GENETTA: a Network-Based Tool for the Analysis of Complex Genetic Designs
2023-12-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00333
PMID:37963232
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研究论文 | 介绍GENETTA软件工具，该工具利用图论将合成生物学设计转化为网络进行分析和操作 | 通过图论方法将复杂合成生物学设计表示为网络，支持动态可视化定制和多数据库数据整合 | NA | 开发用于分析和操作复杂合成生物学设计的网络工具 | 合成生物学设计 | 合成生物学 | NA | 图论 | NA | 设计数据 | NA | NA | NA | 交互网络和部件层次结构 | 工业生物技术 |
| 162 | 2026-03-22 |
Precision modulation of the gut microbiota-immune axis by natural products: a structure-activity relationship perspective in cancer immunotherapy
2026-Mar-20, Journal of Asian natural products research
IF:1.3Q3
DOI:10.1080/10286020.2026.2644307
PMID:41860786
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综述 | 本文从构效关系视角综述了天然产物如何通过精确调控肠道菌群-免疫轴来增强癌症免疫治疗效果 | 首次从多糖、萜类、多酚和生物碱等天然产物的特定结构决定簇出发，系统解构其如何驱动特定的微生物重塑和免疫调节结果，并提出未来结合人工智能多组学和合成生物学进行理性设计 | NA | 探讨天然产物通过调控肠道菌群-免疫轴来克服癌症免疫治疗耐药性的机制与策略 | 天然产物（多糖、萜类、多酚、生物碱）及其对肠道微生物群和宿主免疫系统的影响 | NA | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 163 | 2026-03-22 |
Advances in synthetic biology for engineering methylotrophic microbial cell factories
2026-Mar-19, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/jb.00383-25
PMID:41665342
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综述 | 本文综述了合成生物学在工程化甲基营养型微生物细胞工厂方面的最新进展，包括构建高效甲醇利用途径、优化氧化效率和氧化还原平衡等策略 | 总结了通过合成生物学和代谢工程策略提升甲醇同化效率的创新方法，如工程化甲醇脱氢酶和优化辅因子利用 | NA | 促进工业甲醇利用和可持续发展，通过理性设计高性能微生物平台 | 甲基营养型微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、适应性实验室进化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌、酿酒酵母、枯草芽孢杆菌、哺乳动物细胞、植物 | 切换开关、振荡器、逻辑门、生物传感器、代谢途径 | 工业生物技术、环境、能源 |
| 164 | 2026-03-22 |
Protein-free membrane fusion: a refined view of the delicate fusogenic properties of calcium
2026-Mar-19, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2026.03.040
PMID:41863074
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研究论文 | 本研究通过微流控捕获平台结合共聚焦显微镜，定量研究了钙离子介导的巨型单层囊泡（GUVs）膜融合过程，揭示了钙离子作为无蛋白融合剂的精细作用机制 | 首次在细胞尺度膜上系统量化钙介导的膜融合，同时测量脂质混合、内容物混合和融合结果，揭示了钙融合作用的狭窄参数空间 | 研究仅限于合成膜系统，未涉及生物膜中的天然蛋白环境 | 阐明钙离子作为无蛋白融合剂在细胞尺度膜上的融合机制与条件 | 带负电荷的巨型单层囊泡（GUVs） | 合成生物学 | NA | 微流控捕获平台、共聚焦显微镜 | NA | 显微镜图像、定量测量数据 | 数百个单囊泡 | NA | NA | NA | 合成生物学、膜重建研究 |
| 165 | 2026-03-22 |
Repurposing nuclear receptors for ligand-responsive liquid condensate formation and gene regulation
2026-01-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69099-4
PMID:41620421
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研究论文 | 本文通过重新利用核受体配体结合域和共激活因子，开发了响应激素或临床批准药物的化学诱导二聚化系统，并设计了配体响应的液-液相分离凝聚物，用于基因调控和转录放大 | 创新点包括利用内源性信号分子（如激素和药物）构建化学诱导二聚化系统，以及设计配体控制的液-液相分离凝聚物以实现可调谐的转录控制，实现高达数百倍的激活效果 | NA | 研究目的是开发与内源性生理信号整合的合成生物学工具，用于基因调控和转录控制 | 研究对象包括核受体（如TRβ、VDR、RARγ、ERβ、GR2）的配体结合域、TIF2共激活因子肽，以及相关的激素和药物配体 | 合成生物学 | NA | 化学诱导二聚化、液-液相分离 | NA | NA | NA | NA | NA | 双输入转录开关、配体响应的液-液相分离凝聚物 | 医学、基因电路、生物传感、治疗学 |
| 166 | 2026-03-22 |
Evolutionary repurposing of a metabolic thiolase complex enables antibiotic biosynthesis
2026-01-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68910-6
PMID:41617701
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研究论文 | 本研究报道了口腔链球菌中的一种三重酶复合物，该复合物通过不寻常的Friedel-Crafts C-乙酰化反应完成抗生素reutericyclin A的生物合成 | 揭示了硫解酶复合物通过关键催化残基重编程实现底物特异性转变，从原始的HMG-CoA合成功能进化获得Friedel-Crafts C-酰化新功能的罕见案例 | NA | 探究初级代谢酶如何进化获得次级代谢中的特殊功能，阐明酶功能多样化的进化机制 | 口腔链球菌来源的三重酶复合物（SmaATase），包含HMGS、ACAT和DUF35蛋白 | NA | NA | 冷冻电镜、生化表征、分子建模、进化分析 | NA | 结构数据、生化数据、进化数据 | NA | NA | 口腔链球菌（Streptococcus macacae） | NA | 合成生物学（为C-C键形成催化剂工程提供模板） |
| 167 | 2026-03-22 |
Engineering yeast for sustainable bioproduction of tryptophan-derived aromatic compounds
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag012
PMID:41770028
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综述 | 本文总结了利用酵母工程化生产色氨酸衍生芳香化合物的最新进展 | 聚焦于色氨酸作为关键前体，综述了酵母代谢工程和合成生物学工具在可持续生产芳香化合物中的应用 | NA | 实现色氨酸衍生芳香化合物在酵母中的高效、可扩展且经济可行的生物合成 | 酵母细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 聚合物、食品、饲料、化妆品、制药 |
| 168 | 2026-03-22 |
Prospects for synthetic biology in 21st century agriculture
2025-08, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.12.016
PMID:39742963
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综述 | 本文综述了21世纪农业中合成生物学的前景，重点介绍了植物合成生物学在增强粮食安全、应对气候变化和促进可持续农业方面的创新应用 | 整合先进遗传工具、计算建模和系统生物学，精准修饰植物基因组以提升产量、胁迫耐受性和养分利用效率，并结合人工智能优化设计 | 面临监管审批和公众接受度方面的挑战，且需要严格的多领域测试以确保可重复性 | 探讨合成生物学在农业中的应用潜力，以解决全球粮食安全和环境可持续性问题 | 植物基因组及其在光合效率、固氮、耐旱、病原抗性、养分利用效率、生物强化、气候韧性等关键农业性状的工程化改造 | NA | NA | 合成生物学、遗传工程、计算建模、系统生物学、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 植物 | 合成植物基因组、生物传感器、代谢途径、逻辑门、振荡器、切换开关 | 农业 |
| 169 | 2026-03-22 |
Genetic and molecular mechanisms underlying nitrogen use efficiency in maize
2025-03, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.10.007
PMID:39515641
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综述 | 本文全面综述了玉米氮素吸收、同化和再动员的遗传与分子调控机制，旨在提高氮素利用效率 | 整合了根际微生物组对氮素利用效率的影响以及植物-微生物互作机制，并倡导利用遗传多样性和合成生物学进行综合研究 | NA | 提高玉米氮素利用效率，促进可持续农业发展 | 玉米 | NA | NA | 高通量微生物组研究 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 玉米 | NA | 农业 |
| 170 | 2026-03-22 |
In-Depth Computational Analysis of Natural and Artificial Carbon Fixation Pathways
2021, Biodesign research
DOI:10.34133/2021/9898316
PMID:37849946
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研究论文 | 本文通过计算分析比较了天然和人工碳固定途径的性能，包括特定活性和产率 | 提出了两个全新的碳固定循环（还原性柠檬酰辅酶A循环和2-羟基戊二酸反向三羧酸循环），并采用综合动力学数据集和参数平衡算法进行预测 | 计算模型可能受限于数据可用性和假设，实际应用需实验验证 | 评估和比较天然与人工碳固定途径的性能，以优化工业生物技术和合成生物学应用 | 碳固定途径，包括天然和人工循环，如CBB循环、CETCH循环等 | NA | NA | 计算分析、参数平衡算法、酶成本最小化算法 | NA | 动力学和热力学数据 | NA | NA | NA | 碳固定代谢途径，包括还原性甘氨酸途径、CETCH循环等 | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 171 | 2026-03-21 |
Growth factor applications and clinical translation: advances and challenges
2026-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2026.2642893
PMID:41837883
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综述 | 本文系统综述了生长因子的分类、基础研究进展、临床应用现状，并深入分析了其在临床转化中面临的挑战及相应解决方案 | 全面整合了生长因子在神经退行性疾病、骨再生和代谢疾病中的应用现状，并系统总结了通过蛋白质工程、智能递送系统和多因子序贯释放技术等解决临床转化瓶颈的策略 | 本文为综述性文章，未提供原始实验数据，且指出生长因子疗法仍面临体内微环境复杂、大规模生产成本高和精准递送困难等固有挑战 | 旨在为加速下一代生长因子疗法的开发提供全面的路线图和技术参考 | 生长因子及其在再生医学、肿瘤学和代谢调节等领域的应用 | NA | 神经退行性疾病、骨再生、代谢疾病 | 蛋白质工程、化学修饰、细胞外囊泡平台、多因子序贯释放技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 172 | 2026-03-21 |
Biosynthesis of L-Pipecolic Acid and Its Hydroxylated Derivatives: Enzyme, Engineering, and Synthesis Method
2026-Apr, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70156
PMID:41532523
|
综述 | 本文综述了L-哌啶酸及其羟基化衍生物的生物合成进展，重点介绍了酶工程和合成生物学在可持续高效生产这些化合物中的应用 | 强调了通过酶工程和合成生物学方法实现L-哌啶酸及其羟基化衍生物的可持续生产，包括代谢工程策略、酶级联反应和脯氨酸羟化酶的蛋白质工程 | NA | 促进L-哌啶酸及其羟基化衍生物的生物合成生产，以替代传统化学合成方法 | L-哌啶酸及其羟基化衍生物（羟基哌啶酸） | 合成生物学 | NA | 酶工程、代谢工程、蛋白质工程、酶级联反应、固定化酶策略 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 医药、抗生素、天然产物 |
| 173 | 2026-03-21 |
Golgi-localized mannanases sustain hemicellulose biosynthesis
2026-Apr, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70875
PMID:41555794
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研究论文 | 本文探讨了拟南芥中MAN2和MAN5酶在维持半纤维素生物合成中的作用，通过酵母合成生物学揭示了它们与CSLA的功能互作 | 发现MAN2和MAN5酶在细胞内通过切割不溶性β-甘露聚糖为亲水性对应物，从而维持高尔基体中的半纤维素生产，这揭示了之前未知的生物合成调控机制 | 研究主要基于拟南芥模型，可能需要在其他植物或作物中进行验证以确认普遍性 | 研究β-甘露聚糖生物合成的代谢瓶颈和潜在生物合成参与者，以增强植物中β-甘露聚糖含量 | 拟南芥（Arabidopsis）的MAN2和MAN5酶，以及CSLA基因 | 植物生物学 | NA | 酵母合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 农业 |
| 174 | 2026-03-21 |
Engineered E. coli Nissle 1917 Depletes Branched-Chain Amino Acids to Suppress Colorectal Tumorigenesis
2026-Mar-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00804
PMID:41712535
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研究论文 | 本文通过工程化改造大肠杆菌Nissle 1917菌株，消耗肠道中的支链氨基酸，从而抑制结直肠癌的发生和发展 | 利用合成生物学方法改造益生菌，靶向支链氨基酸代谢，为癌症治疗提供了一种新的策略 | 研究基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证，且具体机制仍需进一步探索 | 探究工程化益生菌通过消耗支链氨基酸来抑制结直肠肿瘤发生的效果 | 结直肠癌小鼠模型及工程化大肠杆菌Nissle 1917菌株 | 合成生物学 | 结直肠癌 | 工程化菌株构建、AOM/DSS诱导的CRC小鼠模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 基因工程 | 大肠杆菌Nissle 1917 | 支链氨基酸降解或转运途径的工程化改造 | 医学 |
| 175 | 2026-03-21 |
Metabolic Engineering and Synthetic Biology-Driven Strategies to Harness Microbial Production of Adipic Acid: Current Status and Future Direction
2026-Mar-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00869
PMID:41790735
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综述 | 本文综述了利用代谢工程和合成生物学策略驱动微生物生产己二酸的现状与未来方向 | 系统梳理了己二酸生物合成的当前进展，重点讨论了提高细胞工厂转化效率的先进代谢工程策略与工具，并识别了关键挑战与知识缺口 | 工业上可行的己二酸生物合成技术仍受限于原料利用不完全、菌株转化效率低、发酵过程复杂及下游分离成本高等挑战 | 开发可持续的己二酸生物合成技术，以应对市场需求增长及传统生产带来的环境问题 | 己二酸的生物合成途径、代谢工程策略、细胞工厂构建及发酵与下游分离技术 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 生物合成途径 | 工业生物技术, 材料 |
| 176 | 2026-03-21 |
Research Progress and Prospects of Open-Chain Flavonoid Biosynthesis
2026-Mar-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00926
PMID:41810537
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综述 | 本文综述了开链黄酮类化合物的结构特征、生物合成途径、代谢工程及微生物生产策略的研究进展与前景 | 系统总结了开链黄酮类化合物这一结构独特亚类的最新研究进展，并整合了代谢组学、结构酶学和合成生物学等多学科交叉成果 | NA | 阐明开链黄酮类化合物的生物合成逻辑、催化机制及调控特征，并展望其未来研究与生物技术应用 | 开链黄酮类化合物及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢组学、结构酶学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、生物技术 |
| 177 | 2026-03-21 |
Refactoring two-component systems for tunable gene expression regulation and upgraded bacterial sensing
2026-Mar-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101504
PMID:41653915
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研究论文 | 本文通过重构双组分系统（TCSs），系统性地探索了响应调节器（RR）和组氨酸激酶（HK）作为浓度依赖性激活剂和抑制剂的功能特性，以优化基因表达调控和细菌传感性能 | 通过解耦HK表达与原生反馈回路，设计了具有可调检测阈值的超灵敏TCS传感器；利用RR作为转导器，结合单组分系统（OCS）和TCS创建了具有低检测限和高动态范围的协同传感系统（SSS）；并证明RR可作为生物低噪声放大器（LNA），显著提升多种基因编码生物传感器的性能 | 未明确提及具体限制，但暗示TCS的可编程性先前未充分探索，可能限制了合成生物学中的广泛应用 | 探索TCS的可塑性和可编程性，以定制合成电路中的基因表达调控，并提供生物传感器优化的模块化工具包 | 双组分系统（TCSs），包括响应调节器（RR）和组氨酸激酶（HK），以及单组分系统（OCS） | 合成生物学 | NA | 基因工程、生物传感技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 细菌（如大肠杆菌） | 双组分系统传感器、协同传感系统（SSS）、生物低噪声放大器（LNA） | 工业生物技术、环境监测 |
| 178 | 2026-03-21 |
Functional organization and regulatory logic of the ped gene cluster in Pseudomonas species
2026-Mar-18, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00046-26
PMID:41705821
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综述 | 本文综述了假单胞菌属中ped基因簇的功能组织、酶学功能和多层次调控机制，重点以恶臭假单胞菌KT2440和铜绿假单胞菌PAO1为例 | 整合了ped基因簇的功能与调控特征，提出了将其作为应用微生物学模块化平台的参考框架，并通过跨属比较揭示了基因簇的保守性与适应性差异 | 部分开放阅读框（如PP_2683、PP_2684、PP_2685）功能尚未明确，调控网络细节仍需进一步机制研究验证 | 阐明假单胞菌属中ped基因簇的遗传组织、酶学功能及调控逻辑，为酒精氧化研究提供基础 | 假单胞菌属（重点为恶臭假单胞菌KT2440和铜绿假单胞菌PAO1）的ped基因簇及其编码的PQQ依赖性脱氢酶 | 合成生物学 | NA | 比较基因组分析 | NA | 基因组数据与文献资料 | 假单胞菌属多个物种（以KT2440和PAO1为代表） | NA | Pseudomonas species（包括P. putida KT2440和P. aeruginosa PAO1） | 酒精氧化代谢通路（含PQQ依赖性脱氢酶、电子传递链及调控组件如YiaY脱氢酶和PP_2683组氨酸激酶） | 环境微生物学, 生物修复, 生物生产, 工业生物技术 |
| 179 | 2026-03-21 |
Biofilm engineering through c-di-GMP tuning boosts bioleaching efficiency and arsenic tolerance in Acidithiobacillus ferrooxidans
2026-Mar-18, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.02288-25
PMID:41705824
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研究论文 | 通过调控Acidithiobacillus ferrooxidans中的c-di-GMP信号增强生物膜形成、生物浸出效率和砷耐受性 | 通过靶向调控全局调控分子c-di-GMP，同时提升生物浸出效率和重金属抗性，克服了传统基因工程单次仅修饰单一性状的限制 | NA | 提高生物浸出效率和砷耐受性，以促进可持续金属生产 | Acidithiobacillus ferrooxidans（一种模型生物浸出微生物） | 合成生物学 | NA | 基因工程、转录组分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Acidithiobacillus ferrooxidans | 通过过表达diguanylate cyclase基因（如S-222、S-306、S-651）调控c-di-GMP水平，以编程生物膜基质组成 | 环境、工业生物技术 |
| 180 | 2026-03-21 |
Dynamics of genetic circuits in Pseudomonas protegens
2026-Mar-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101513
PMID:41763221
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研究论文 | 本研究开发了一种实验-理论结合的流程，用于评估土壤细菌 Pseudomonas protegens Pf-5 中的 NOT 逻辑电路，并探索其作为合成生物学新宿主的潜力 | 首次在 Pseudomonas protegens Pf-5 中评估 NOT 逻辑电路，利用数学模型推断动态原理，并设计验证了串联兼容逆变器以实现 YES 逻辑响应 | 研究主要聚焦于 NOT 逻辑电路，可能未全面评估其他电路类型或更复杂系统在 Pf-5 中的表现 | 扩展合成生物学宿主选择，评估 Pseudomonas protegens Pf-5 作为环境合成生物学新宿主的适用性 | 土壤细菌 Pseudomonas protegens Pf-5 及其中的 NOT 逻辑电路（逆变器） | 合成生物学 | NA | 遗传电路工程、数学建模 | 数学模型 | 实验数据、模型参数 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | Pseudomonas protegens Pf-5 | NOT 逻辑电路（逆变器）、串联兼容逆变器以实现 YES 逻辑响应 | 环境 |