合成生物学相关文章
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当前共找到 3249 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-06-02 |
The Application of Multiple Strategies to Enhance Methylparaben Synthesis Using the Engineered Saccharomyces cerevisiae
2025-Apr-25, Biology
DOI:10.3390/biology14050469
PMID:40427658
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研究论文 | 本研究利用工程化的酿酒酵母构建甲基对羟基苯甲酸酯（MP）的生物合成途径，并应用多种代谢工程策略突破合成过程中的瓶颈 | 通过调控内源莽草酸途径的限速步骤、增强中心碳通量及改进外源酶表达，实现了MP在酿酒酵母中的高效合成，产量达到68.59 mg/L，为目前报道的最高水平 | 研究仅在摇瓶水平进行验证，尚未进行大规模发酵或工业化生产的测试 | 开发环境友好的MP生物合成方法以替代传统化学合成工艺 | 工程化改造的酿酒酵母菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、启动子工程、基因敲除 | NA | NA | NA |
| 162 | 2025-06-02 |
Crosslinking intermodular condensation in non-ribosomal peptide biosynthesis
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08306-y
PMID:39663458
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research paper | 该研究开发了位点选择性交联探针，用于构象约束和解析非核糖体肽合成酶中载体蛋白与其伴侣酶域之间的相互作用 | 利用四嗪点击化学捕获载体蛋白底物在缩合域活性位点的缩合过程，并报告了该复合物的高分辨率冷冻电镜结构 | 研究主要关注于酪氨酸生物合成前两个模块的载体蛋白与缩合域的相互作用，可能未涵盖其他模块的类似过程 | 理解非核糖体肽合成酶的分子细节，为未来合成生物学设计提供关键信息 | 非核糖体肽合成酶中的载体蛋白及其伴侣酶域 | 生物化学 | NA | 四嗪点击化学, 冷冻电镜, X射线晶体学 | NA | 结构数据 | NA |
| 163 | 2025-06-02 |
Cleavable donor-assisted CRISPR/Cas9 system significantly improves the efficiency of large DNA insertion in Physcomitrium patens
2025-Feb, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70020
PMID:39981890
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研究论文 | 本研究开发了一种体内可切割供体辅助的CRISPR/Cas9系统，显著提高了大型DNA片段在小立碗藓中的插入效率 | 开发了含有两个Cas9核酸酶识别位点的IVC供体，能够在体内释放线性模板，从而提高大片段DNA的插入效率 | 该方法目前仅适用于能够进行原生质体转化和再生的作物 | 提高CRISPR/Cas9介导的大片段DNA插入效率 | 小立碗藓（Physcomitrium patens） | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | DNA序列数据 | 评估了两种不同的sgRNA和四种不同的DNA插入片段 |
| 164 | 2025-06-01 |
Kinetic modules are sources of concentration robustness in biochemical networks
2025-May-30, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ads7269
PMID:40435256
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research paper | 该研究探讨了动力学模块在生化网络中对浓度鲁棒性的作用，并提出了一种无需参数值即可识别这些模块的方法 | 提出了一种基于稳态反应速率耦合的动力学模块识别方法，无需参数值，并发现有序结合酶机制比随机结合更能增强代谢物浓度的鲁棒性 | 研究仅基于34个代谢网络模型，可能无法涵盖所有生化网络的复杂性 | 研究动力学模块在生化网络中的作用及其对浓度鲁棒性的影响 | 生化网络中的动力学模块和代谢物浓度 | 生物化学网络 | NA | 质量作用动力学 | NA | 代谢网络模型 | 34个代谢网络模型，涵盖26种生物 |
| 165 | 2025-06-01 |
Structural Homology Fails to Predict Secretion Efficiency in Pichia pastoris: Divergent Responses of Architecturally Similar scFvs to Multi-Parametric Genetic Engineering
2025-May-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26104922
PMID:40430062
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研究论文 | 本研究通过基因剂量优化、表达盒设计和内质网分泌途径重编程三种策略，优化了Pichia pastoris中scFv的分泌效率 | 挑战了结构同源性（63%氨基酸同一性；RMSD 0.47 Å）确保一致优化结果的假设，强调了在合成生物学中需要针对蛋白质量身定制工程策略 | 研究仅针对两种结构同源的scFv变体PR961和PR953，可能不适用于其他蛋白质 | 优化Pichia pastoris中scFv的分泌效率，以支持AI驱动的生物制剂制造 | 两种结构同源的scFv变体PR961和PR953 | 合成生物学 | NA | 基因剂量优化、表达盒设计、内质网分泌途径重编程 | NA | NA | 两种scFv变体PR961和PR953 |
| 166 | 2025-06-01 |
Multi-Omics and Functional Insights into Triterpenoid Biosynthesis Pathways in Neopicrorhiza scrophulariiflora (Pennell) D.Y.Hong
2025-May-21, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14101562
PMID:40431127
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research paper | 该研究通过转录组学和代谢组学分析，探讨了濒危植物胡黄连中三萜类化合物的生物合成途径及其关键酶编码基因的表达模式 | 鉴定了8个参与三萜类生物合成的上游氧化角鲨烯环化酶（OSCs），其中NsOSC2是一种双功能酶，能催化2,3-氧化角鲨烯转化为α-香树脂醇和β-香树脂醇 | 研究未涉及其他可能影响三萜类生物合成的环境或发育因素 | 揭示胡黄连中三萜类化合物的生物合成分子机制 | 濒危多年生草本植物胡黄连（Neopicrorhiza scrophulariiflora） | 合成生物学 | NA | 转录组学、代谢组学分析 | NA | 基因表达数据、代谢物数据 | 不同组织的胡黄连样本 |
| 167 | 2025-06-01 |
The Transformation Experiment of Frederick Griffith II: Inclusion of Cellular Heredity for the Creation of Novel Microorganisms
2025-May-15, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering12050532
PMID:40428151
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research paper | 本文提出了一种改进的细菌转化实验设计（Griffith transformation experiment design 2.0），旨在实现DNA和非DNA结构及信息的有效交换，从而创造出具有显著形态/代谢表型差异的单细胞杂交微生物 | 提出了Griffith转化实验设计2.0，扩展了传统DNA转化范围，包括非DNA结构和调控信息的转移，为创造新型微生物提供了新方法 | 该方法仍处于概念阶段，实际应用效果和跨物种适用性有待验证 | 探索更高效的微生物遗传物质交换方法，创造具有新特性的杂交微生物 | 细菌细胞及其遗传物质 | 合成生物学 | NA | 细菌转化实验 | NA | NA | NA |
| 168 | 2025-06-01 |
Biosimilars Targeting Pathogens: A Comprehensive Review of Their Role in Bacterial, Fungal, Parasitic, and Viral Infections
2025-Apr-28, Pharmaceutics
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/pharmaceutics17050581
PMID:40430873
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review | 本文全面综述了生物类似物在细菌、真菌、寄生虫和病毒感染中的作用 | 讨论了生物类似物开发中的障碍及创新技术，如抗体工程、合成生物学和无细胞蛋白合成 | 未提及具体研究数据或样本量，主要基于现有文献的综述 | 探讨生物类似物在治疗感染性疾病中的潜力和挑战 | 细菌、真菌、寄生虫和病毒等病原体 | NA | infectious diseases | antibody engineering, synthetic biology, cell-free protein synthesis | NA | NA | NA |
| 169 | 2025-06-01 |
Attaining the Promise of Geminivirus-Based Vectors in Plant Genome Editing
2025-Apr-27, Viruses
DOI:10.3390/v17050631
PMID:40431643
|
综述 | 本文综述了基于双生病毒载体在植物基因组编辑中的应用及其潜力 | 探讨了双生病毒载体如何克服传统转基因技术的限制，加速基因组编辑过程 | 讨论了双生病毒载体在实际应用中面临的障碍 | 评估双生病毒载体在植物基因组编辑中的效果和潜力 | 植物基因组编辑技术 | 合成生物学 | NA | 病毒载体介导的基因编辑 | NA | NA | NA |
| 170 | 2025-06-01 |
Omics-driven onboarding of the carotenoid producing red yeast Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938
2024-Dec-28, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13379-w
PMID:39731599
|
研究论文 | 本研究利用转录组学数据从红酵母Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938中发现了组成型和光调控启动子，并开发了该生物的模块化合成生物学部件集合 | 结合系统生物学和合成生物学，开发了一种从组学到部件的流程，为非传统微生物提供了快速“入门”方法 | 许多假定的调控启动子在合成遗传背景下表现为组成型，仅有一个启动子在UV照射下显示出九倍激活 | 研究Xanthophyllomyces dendrorhous在不同光波长和氧化应激条件下的转录组学，开发其遗传工具 | 红酵母Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938 | 合成生物学 | NA | 转录组学、差异基因表达分析(DGE)、基因本体(GO)分析 | NA | 转录组数据 | 在不同光波长(红、绿、蓝、紫外)和氧化应激条件下的Xanthophyllomyces dendrorhous样本 |
| 171 | 2025-06-01 |
Development of a xylose-inducible and glucose-insensitive expression system for Parageobacillus thermoglucosidasius
2024-Oct-23, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13333-w
PMID:39441395
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研究论文 | 开发了一种木糖诱导且对葡萄糖不敏感的基因表达系统IExyl*，用于Parageobacillus thermoglucosidasius | 通过结合xylA5p启动子及其调节因子XylR，并减少葡萄糖对木糖摄取的分解代谢抑制，开发了IExyl*系统 | NA | 开发一种高效且多功能的诱导表达系统，用于菌株工程和合成生物技术应用 | Parageobacillus thermoglucosidasius DSM 2542 | 合成生物学 | NA | 基因表达调控 | NA | NA | NA |
| 172 | 2025-06-01 |
In vivo thrombin activity in the diatom Phaeodactylum tricornutum: biotechnological insights
2024-Oct-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13322-z
PMID:39377797
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research paper | 本研究通过计算机模拟分析识别了三角褐指藻中可能编码类凝血酶蛋白的序列，并通过体内实验验证了其剪切效率 | 发现三角褐指藻中存在一种新型类凝血酶蛋白酶，并验证了其在融合蛋白上的剪切效率 | NA | 探索三角褐指藻中类凝血酶序列的功能及其在生物技术中的应用 | 三角褐指藻（Phaeodactylum tricornutum） | 合成生物学 | NA | 计算机模拟分析、蛋白质结构预测、对接研究、Western blot分析 | NA | 蛋白质序列、蛋白质结构 | NA |
| 173 | 2025-06-01 |
A Simple and Effective Strategy for the Development of Robust Promoter-Centric Gene Expression Tools
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00092
PMID:39120429
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research paper | 本研究开发了一种简单有效的策略，用于构建强效的基因表达工具，通过引入额外的-35样基序和回文元件来增强启动子活性 | 通过引入额外的-35样基序和回文元件，显著增强了启动子的活性，特别是在构建的四环素诱导型基因表达系统中表现出比现有高强度启动子更强的活性 | 研究主要针对特定微生物，尚未在其他广泛微生物中验证其适用性 | 开发强效的基因表达工具，以促进菌株工程和合成生物学研究 | 启动子和基因表达系统 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
| 174 | 2025-06-01 |
Desiccated Cyanobacteria Serve As Efficient Plasmid DNA Carriers in Space Flight
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00672
PMID:39150229
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research paper | 研究探讨了使用干燥蓝藻作为质粒DNA载体在太空飞行中的有效性 | 利用天然耐干燥的蓝藻作为质粒DNA载体，无需低温或冷冻储存，安全运输至国际空间站并返回 | 仅为概念验证研究，尚未在实际太空环境中大规模应用 | 探索在资源有限的外太空环境中有效运输生物系统的方法 | 质粒DNA和蓝藻PC73102 | 合成生物学 | NA | 质粒提取和转化 | NA | 生物实验数据 | 使用蓝藻PC73102携带pSCR119质粒进行太空往返运输 |
| 175 | 2025-06-01 |
Genetic Code Expansion in Shewanella oneidensis MR-1 Allows Site-Specific Incorporation of Bioorthogonal Functional Groups into a c-Type Cytochrome
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00248
PMID:39158169
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研究论文 | 本文报道了在电活性细菌Shewanella oneidensis MR-1中开发高效方法，用于位点特异性掺入结构多样的非经典氨基酸（ncAAs）到蛋白质中 | 开发了在MR-1中位点特异性掺入ncAAs的高效方法，并证明其与内源性蛋白质合成、c型细胞色素成熟及蛋白质分泌途径兼容且正交 | NA | 扩展MR-1中设计蛋白质的化学库，以理解和调控生物系统并开发生物技术 | Shewanella oneidensis MR-1及其c型细胞色素MtrC | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展 | NA | NA | NA |
| 176 | 2025-06-01 |
GOLDBAR: A Framework for Combinatorial Biological Design
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00296
PMID:39162314
|
research paper | 介绍了一个名为GOLDBAR的组合生物学设计框架，用于优化生物设计并支持设计组合的正式比较 | GOLDBAR框架能够交叉和合并整个生物设计类别的规则，提取共同设计模式并推断新的模式 | 未明确提及框架的具体局限性 | 促进合成生物学中的自动化分析和机器学习 | 组合生物设计库和DNA组装技术 | synthetic biology | NA | DNA组装技术 | grammar-based machine learning | DNA序列数据 | NA |
| 177 | 2025-06-01 |
Synthetic Biology of Natural Products Engineering: Recent Advances Across the Discover-Design-Build-Test-Learn Cycle
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00391
PMID:39163395
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review | 本文综述了合成生物学在天然产物工程领域的最新进展，涵盖了从发现到学习的整个生物工程周期 | 强调了AI支持的基因组挖掘、酶和途径工程、化合物鉴定等计算工具的最新进展，以及新型宿主系统和提高生产水平的新技术 | NA | 探讨合成生物学在天然产物工程中的应用及其最新进展 | 天然产物工程中的基因组工程及相关技术 | 合成生物学 | NA | 基因组工程、AI支持的基因组挖掘、酶和途径工程 | NA | 基因组数据、化合物数据 | NA |
| 178 | 2025-06-01 |
Optimized CRISPR Interference System for Investigating Pseudomonas alloputida Genes Involved in Rhizosphere Microbiome Assembly
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00312
PMID:39163848
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research paper | 本文描述了一种在KT2440中优化的CRISPR干扰（CRISPRi）系统，用于研究根际微生物组组装中的基因及工业应用 | 开发了包含三种不同启动子系统和针对假单胞菌优化的dCas9的CRISPRi系统，并展示了其在根际定植细菌中的功能 | 未提及具体的技术限制或应用范围限制 | 探索根际微生物间相互作用及工业应用中的基因调控 | KT2440及其在根际微生物组中的基因 | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰（CRISPRi） | NA | NA | 未提及具体样本数量 |
| 179 | 2025-06-01 |
Engineering Microbial Consortia as Living Materials: Advances and Prospectives
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00313
PMID:39174016
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review | 本文综述了工程化微生物群落作为活体材料的设计策略、合成生物学技术及其应用前景 | 介绍了自上而下和自下而上两种设计微生物群落构成的工程化活体材料(ELMs)的策略，并总结了合成生物学技术在复杂任务中的应用 | 基于微生物群落的ELMs仍处于发展阶段，面临诸多挑战 | 探讨工程化微生物群落作为活体材料的设计方法、技术应用及未来发展 | 微生物群落及其构成的工程化活体材料 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 180 | 2025-06-01 |
MutaT7GDE: A Single Chimera for the Targeted, Balanced, Efficient, and Processive Installation of All Possible Transition Mutations In Vivo
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00316
PMID:39190860
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research paper | 该研究开发了一种名为MutaT7GDE的单一嵌合酶，能够在体内高效、平衡地安装所有可能的过渡突变 | 利用工程化的底物非特异性通用脱氨酶（GDEs）构建单一嵌合酶，简化了系统并提高了突变效率 | NA | 开发一种更高效的定向进化工具，用于目标基因的多样化 | MutaT7嵌合酶及其突变效率 | 合成生物学 | NA | 脱氨酶-T7 RNA聚合酶融合技术 | NA | NA | 四种不同的MutaT7构建体 |