合成生物学相关文章
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当前共找到 3737 篇文献，本页显示第 1781 - 1800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1781 | 2024-10-24 |
No two clones are alike: characterization of heterologous subpopulations in a transgenic cell line of the model diatom Phaeodactylum tricornutum
2024-Oct-21, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02559-y
PMID:39428506
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研究论文 | 研究了转基因硅藻Phaeodactylum tricornutum中异源亚群的特征 | 揭示了克隆传播培养物中不同亚群之间的遗传和转录组差异 | NA | 研究硅藻表达系统中的异质性，以促进合成生物学应用 | 转基因硅藻Phaeodactylum tricornutum中的异源亚群 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | 来自单个外共轭菌落的多个亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 1782 | 2024-10-24 |
High-Speed Imaging of Giant Unilamellar Vesicle Formation in cDICE
2024-Oct-15, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c04825
PMID:39431092
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研究论文 | 研究使用高速显微镜实时观察cDICE方法中巨型单层囊泡（GUVs）的形成过程 | 开发了高速显微镜设置，实时可视化GUV形成过程，揭示了复杂的液滴形成机制 | 液滴形成的起源部分仍不清楚，蛋白质对GUV形成的影响机制需进一步研究 | 深入理解cDICE方法中GUV形成的物理原理，并开发更可靠高效的GUV生产方法 | 巨型单层囊泡（GUVs）的形成过程及其在cDICE方法中的应用 | 生物物理学 | NA | 高速显微镜 | NA | 图像 | 涉及>30 μm大小的液滴和部分15 μm大小的卫星液滴 | NA | NA | NA | NA |
| 1783 | 2024-10-24 |
CryptKeeper: a negative design tool for reducing unintentional gene expression in bacteria
2024-Sep-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.05.611466
PMID:39282447
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研究论文 | 介绍了一种名为CryptKeeper的软件工具，用于减少细菌中无意基因表达 | 开发了一种新的软件工具CryptKeeper，能够可视化预测细菌基因表达信号并估计DNA序列可能的翻译负担 | NA | 开发一种工具来减少细菌中无意基因表达，从而避免实验中的遗传不稳定性和信号干扰 | 细菌中的基因表达信号和翻译负担 | 分子生物学 | NA | NA | NA | DNA序列 | 涉及多个已发表的例子，包括真核病毒感染克隆和单个蛋白质 | NA | NA | NA | NA |
| 1784 | 2024-10-24 |
Characterization and Degradation of Triphenylmethane Dyes and Their Leuco-Derivatives by Heterologously Expressed Laccase From Coprinus cinerea
2024-Sep, Cell biochemistry and function
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/cbf.4127
PMID:39420654
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研究论文 | 研究通过合成生物学方法优化了来自Coprinus cinerea的漆酶基因Lcc1，并在Pichia pastoris中异源表达，评估了其对三苯甲烷染料及其无色衍生物的降解能力 | 通过合成生物学方法优化了漆酶基因Lcc1，并在Pichia pastoris中成功表达，展示了其对三苯甲烷染料的高效降解能力 | 研究主要集中在实验室条件下漆酶的表达和降解能力，未涉及实际环境中的应用效果 | 优化漆酶基因的表达，研究其对有机污染物的降解能力，为环境修复提供新方案 | Coprinus cinerea的漆酶基因Lcc1及其对三苯甲烷染料的降解 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | 酶活性数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1785 | 2024-10-24 |
Measuring the burden of hundreds of BioBricks defines an evolutionary limit on constructability in synthetic biology
2024-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.08.588465
PMID:38645188
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研究论文 | 研究了301个BioBricks在高拷贝质粒上对宿主细胞生长速率的影响 | 首次系统测量了大量BioBricks对宿主细胞生长速率的负担，并开发了一个交互式网络工具用于合成生物学教育 | 研究仅限于高拷贝质粒上的BioBricks，未涵盖其他类型的DNA序列 | 探讨合成生物学中工程化DNA对宿主细胞生长速率的影响及其进化限制 | 301个BioBricks及其对宿主细胞生长速率的影响 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 301个BioBricks | NA | NA | NA | NA |
| 1786 | 2024-10-21 |
Intelligent guide RNA: dual toehold switches for modulating luciferase in the presence of trigger RNA
2024-Oct-17, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06988-8
PMID:39420075
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研究论文 | 开发了一种智能引导RNA系统，通过双足开关机制在触发RNA存在下调节荧光素酶活性 | 引入了一种新的智能引导RNA系统，结合了RNA感应平台和CRISPR/Cas9功能，实现了对特定触发RNA的识别和基因活性的精确调控 | NA | 开发一种能够根据特定细胞环境条件调节基因活性的智能引导RNA系统 | 智能引导RNA系统及其在特定触发RNA存在下的功能 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1787 | 2024-10-21 |
Plant synthetic genomics: Big lessons from the little yeast
2024-Oct-17, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2024.08.001
PMID:39214084
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研究论文 | 本文探讨了利用酵母合成基因组学的经验来推动植物合成基因组学的发展 | 利用酵母和苔藓植物的相似性，提出了将酵母合成基因组学的技术应用于植物合成基因组学的新方法 | 植物基因组的复杂性仍然是主要挑战 | 探索将酵母合成基因组学的经验应用于植物合成基因组学的可能性 | 酵母和苔藓植物 Physcomitrium patens | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1788 | 2024-10-21 |
Diagnosis and mitigation of the systemic impact of genome reduction in Escherichia coli DGF-298
2024-Oct-16, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00873-24
PMID:39207109
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研究论文 | 研究了基因组简化对大肠杆菌DGF-298的影响，并通过重建代谢模型和适应性实验室进化来减轻这些影响 | 通过系统级方法和适应性实验室进化相结合，修复和优化基因组工程菌株 | NA | 研究基因组简化对大肠杆菌DGF-298的系统性影响并提出缓解措施 | 大肠杆菌DGF-298及其基因组简化后的代谢和表达调控 | 系统生物学 | NA | 代谢模型重建、iModulon-based转录组分析、适应性实验室进化 | 代谢模型 | 转录组数据 | 单一菌株DGF-298 | NA | NA | NA | NA |
| 1789 | 2024-10-21 |
Microalgae biofuels: illuminating the path to a sustainable future amidst challenges and opportunities
2024-Jan-23, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02461-0
PMID:38254224
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综述 | 本文综述了过去十年微藻生物燃料生产的研究成果，探讨了该行业面临的机遇和挑战 | 利用合成生物学减少转基因微藻的风险，提高其生物燃料生产的经济可行性 | 转基因微藻的大规模户外栽培存在风险，限制了其可行性 | 探讨微藻生物燃料在能源转型中的重要性及其大规模生产的可行性 | 微藻的选择、改造和培养 | NA | NA | 组学技术、基因编辑 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1790 | 2024-10-21 |
Engineering strategies for enhanced heterologous protein production by Saccharomyces cerevisiae
2024-Jan-22, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02299-z
PMID:38247006
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综述 | 本文综述了利用酿酒酵母生产异源蛋白的工程策略 | 总结了最新的异源蛋白产量提高的技术进展，包括蛋白质超表达系统、蛋白质分泌工程、糖基化途径工程和系统代谢工程 | 构建一个通用的酵母底盘用于高效蛋白质生产仍然是一个挑战 | 探讨提高酿酒酵母异源蛋白产量的策略 | 酿酒酵母及其异源蛋白生产 | 生物工程 | NA | 合成生物学工具和代谢工程策略 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1791 | 2024-10-21 |
Cell surface sculpting using logic-gated protein actuators
2023-Dec-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.18.572113
PMID:38187604
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研究论文 | 本文介绍了一种基于邻近门控蛋白剪接的自主决策蛋白质装置，能够在细胞表面执行多种布尔逻辑操作 | 开发了一种可编程的分子系统，能够整合多个细胞表面特征，将目标输入转换为用户定义的输出 | NA | 探索细胞表面特征的差异，开发可编程的分子系统用于选择性靶向特定细胞 | 细胞表面特征和蛋白质装置 | 合成生物学 | NA | 邻近门控蛋白剪接 | NA | 蛋白质 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1792 | 2024-10-21 |
Cell-free expression of RuBisCO for ATP production in the synthetic cells
2023, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysad016
PMID:38149045
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研究论文 | 研究在合成细胞中通过RuBisCO的细胞外表达实现ATP生产 | 首次测试了RuBisCO在细胞外表达系统中的表达及其活性介导的ATP合成 | 尚未实现完全独立的能量生产 | 探索在合成细胞中实现持续生物能量生产的可能性 | RuBisCO酶及其在细胞外表达系统中的ATP合成能力 | 合成生物学 | NA | 细胞外表达系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1793 | 2024-10-21 |
Adoptive immunotherapy for cancer or viruses
2014, Annual review of immunology
IF:26.9Q1
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研究论文 | 本文探讨了过继免疫疗法在癌症和某些慢性病毒感染治疗中的应用 | 利用合成生物学原理增强T细胞功能，显著提高临床疗效 | 主要挑战是识别肿瘤特异性靶点，以避免肿瘤外、靶点内的毒性 | 研究过继免疫疗法在癌症和病毒治疗中的临床发展 | 癌症和某些慢性病毒感染 | NA | NA | 过继免疫疗法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1794 | 2024-10-20 |
Revolutionizing Molecular Design for Innovative Therapeutic Applications through Artificial Intelligence
2024-Sep-29, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules29194626
PMID:39407556
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综述 | 本文综述了机器学习、人工智能和分子建模在计算蛋白质工程领域的最新进展及其在创新治疗应用中的革命性作用 | 本文介绍了深度学习、强化学习和迁移学习等技术在蛋白质结构预测、结合亲和力优化和酶设计方面的显著改进，以及这些创新如何简化了蛋白质工程流程 | 本文指出计算预测与实验验证之间的差距以及与AI驱动的蛋白质设计相关的伦理问题是当前面临的挑战 | 本文旨在全面概述计算方法在蛋白质工程中的当前状态和未来方向，强调其在创造下一代生物制剂和推进合成生物学方面的变革潜力 | 本文研究对象为计算蛋白质工程中的机器学习、人工智能和分子建模技术及其在生物技术和医学中的应用 | 机器学习 | NA | 深度学习、强化学习、迁移学习 | NA | 蛋白质结构 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1795 | 2024-10-20 |
Discovery of megapolipeptins by genome mining of a Burkholderiales bacteria collection
2024-Sep-13, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc03594a
PMID:39309087
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研究论文 | 本文通过基因组挖掘技术，从316株根际来源的伯克霍尔德菌属细菌中发现了新型天然产物megapolipeptins | 本文采用基因组学驱动和合成生物学辅助的方法，成功激活了原本沉默的生物合成基因簇，发现了结构独特的新型天然产物megapolipeptins | NA | 发现新型天然产物 | 根际来源的伯克霍尔德菌属细菌 | NA | NA | 基因组挖掘 | NA | 基因组数据 | 316株根际来源的伯克霍尔德菌属细菌 | NA | NA | NA | NA |
| 1796 | 2024-10-20 |
Optogenetic spatial patterning of cooperation in yeast populations
2024-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44379-5
PMID:38168087
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研究论文 | 本文利用光遗传学技术控制酵母中的SUC2蔗糖酶生产，从而塑造合作者和欺骗者细胞的空间分布 | 首次使用光遗传学方法控制酵母细胞的合作和竞争行为，并展示了合作者在其领域大小受限时从其产生的己糖中获益最大 | 研究仅限于酵母细胞，尚未应用于其他微生物生态系统 | 探索通过光遗传学方法控制微生物群落中的代谢相互作用，以改进合成生物学应用中的微生物群落工程 | 酵母细胞的合作和竞争行为 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1797 | 2024-10-20 |
Enzyme-Assisted High Throughput Sequencing of an Expanded Genetic Alphabet at Single Base Resolution
2023-Dec-21, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3678081/v1
PMID:38196584
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研究论文 | 本文介绍了一种酶辅助的高通量测序方法，用于在单碱基分辨率下测序扩展遗传字母表 | 提出了一种新的酶辅助测序方法（ESEGA），相比之前的测序方法，具有更高的转录效率和保真度 | NA | 开发一种新的测序工具，用于测序通过人工扩展遗传信息系统（AEGIS）创建的分子 | 通过AEGIS LIVE创建的6-letter DNA分子 | 生物技术 | NA | 酶辅助测序 | NA | DNA序列 | 涉及三种任务的实验，包括6-nucleotide PCR的最佳条件定义、不同DNA聚合酶的保真度评估以及AEGIS组件的功能化评估 | NA | NA | NA | NA |
| 1798 | 2024-10-20 |
The H3.3 K36M oncohistone disrupts the establishment of epigenetic memory through loss of DNA methylation
2023-Oct-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.13.562147
PMID:37873347
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研究论文 | 研究H3.3 K36M突变对表观遗传记忆和DNA甲基化的影响 | 提出了一个新的模型，解释H3K36甲基化在将H3K9me3域转化为DNA甲基化以维持稳定的表观遗传记忆中的必要性 | NA | 探讨H3.3K36M突变如何影响基因表达的动态变化 | H3.3 K36M突变对表观遗传记忆和DNA甲基化的影响 | 表观遗传学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1799 | 2024-10-20 |
Long oligodeoxynucleotides: chemical synthesis, isolation via catching-by-polymerization, verification via sequencing, and gene expression demonstration
2023, Beilstein journal of organic chemistry
IF:2.2Q2
DOI:10.3762/bjoc.19.146
PMID:38170048
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研究论文 | 本文报道了一种直接从头化学合成400个核苷酸的寡脱氧核苷酸（ODN）的方法，并通过捕获-聚合（CBP）方法从复杂的反应混合物中分离这些ODN | 本文提出了一种新的化学合成方法，能够合成包含长重复序列或稳定二级结构的基因和基因组，这是现有技术难以实现的 | NA | 开发一种新的化学合成方法，用于合成包含长重复序列或稳定二级结构的基因和基因组 | 400个核苷酸的寡脱氧核苷酸（ODN）及其在绿色荧光蛋白（GFP）基因表达中的应用 | 合成生物学 | NA | 捕获-聚合（CBP）方法、Sanger测序、Gibson组装 | NA | DNA序列 | 400个核苷酸的ODN、399和401个核苷酸的ODN、800个核苷酸的GFP基因构建体 | NA | NA | NA | NA |
| 1800 | 2024-10-19 |
Biosynthesis of Natural and Unnatural Perylenequinones for Drug Development
2024-Oct-16, ChemMedChem
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/cmdc.202400295
PMID:38943237
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综述 | 本文综述了天然和非天然苝醌的生物合成途径及其在药物开发中的应用 | 介绍了通过合成生物学策略进行结构修饰和大规模生物生产天然和非天然苝醌的最新进展 | 缺乏高效且成本效益高的方法来获得这些化合物并引入结构多样性和复杂性 | 促进苝醌类化合物在光动力疗法中的研究和应用 | 天然和非天然苝醌及其衍生物 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |